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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 861 | 2025-12-03 |
Expanding the frontiers of microbial biosynthesis with synthetic microbial communities
2025-Dec, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2025.103351
PMID:40886452
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综述 | 本文综述了合成微生物群落在微生物合成领域的最新进展,讨论了其优势、功能,并提出了一个设计框架,重点关注通过微生物相互作用进行种群控制 | 通过理性途径分区和明确的微生物相互作用,合成微生物群落缓解了单一培养的局限性,如代谢负担、途径抑制和副产物积累,从而扩展了微生物生物合成的前沿 | NA | 探讨合成微生物群落在微生物生物合成中的应用,以扩展其前沿 | 合成微生物群落 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 微生物 | NA | 工业生物技术 |
| 862 | 2025-12-03 |
Microbial biomolecular condensates: from conserved principles to synthetic biology opportunities
2025-Dec, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2025.102677
PMID:41086652
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综述 | 本文综述了微生物生物分子凝聚体的普遍存在性、保守的物理原理及其在合成生物学中的应用潜力 | 将生物分子凝聚体视为一种广泛存在于微生物界的模块化区室化策略,并探讨了其保守的物理原理如何通过进化力量适应不同的细胞需求,为合成生物学中可编程凝聚体的设计提供了新视角 | NA | 探讨微生物生物分子凝聚体的运作原理及其在合成生物学中的应用机会 | 微生物生物分子凝聚体 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 可编程凝聚体 | 合成生物学 |
| 863 | 2025-12-03 |
Architects of plant immunity: Structure-informed strategies for engineering plant nucleotide-binding leucine-rich repeat receptors
2025-Nov-30, Current opinion in plant biology
IF:8.3Q1
DOI:10.1016/j.pbi.2025.102828
PMID:41325717
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综述 | 本文综述了基于结构信息工程化植物NLR受体以增强植物免疫系统的策略 | 结合分子结构理解和合成生物学工具,开发了针对NLR受体的工程化方法,如整合域工程和LRR表面重塑,以扩展病原体识别能力 | NA | 工程化植物核苷酸结合富含亮氨酸重复序列(NLR)受体,以增强植物对病原体的免疫反应 | 植物NLR受体及其结构 | 合成生物学 | 植物病害 | 结构建模、合成生物学工具 | NA | 结构数据 | NA | NA | 植物 | NA | 农业 |
| 864 | 2025-12-03 |
Perspectives on Synthetic Protein Circuits in Mammalian Cells
2024-Dec, Current opinion in biomedical engineering
IF:4.7Q2
DOI:10.1016/j.cobme.2024.100555
PMID:39372446
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综述 | 本文综述了哺乳动物细胞中合成蛋白质电路的设计原理、工具及其在生物医学领域的应用前景 | 系统梳理了基于蛋白质翻译后修饰(如蛋白水解和磷酸化)的合成生物学工具包,并提出了从工具开发到临床前应用的转化框架 | NA | 探讨合成蛋白质电路在哺乳动物细胞工程化中的应用潜力与设计策略 | 哺乳动物细胞中的合成蛋白质电路 | 合成生物学 | 癌症 | 蛋白质工程、翻译后修饰调控 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN | 哺乳动物细胞 | 基于蛋白水解、磷酸化或可编程结合的合成蛋白质电路,用于重编程细胞行为 | 医学 |
| 865 | 2025-12-02 |
Artificial cells with liquid-liquid phase separation-regulated cell-free protein synthesis
2025-Nov-25, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2511283122
PMID:41269793
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研究论文 | 本文通过液-液相分离调控无细胞蛋白质合成,构建了具有可控蛋白质表达的人工细胞 | 利用含多价关联基团的工程聚合物,通过液-液相分离诱导蛋白质聚集,实现无细胞蛋白质合成活性的可逆调控和精确时间控制 | 未明确提及具体限制,但暗示在工程化人工细胞调控蛋白质表达方面仍存在显著局限 | 开发能够调控蛋白质表达的人工细胞,并探索其在生物医学应用中的潜力 | 人工细胞、无细胞蛋白质合成系统、工程聚合物、微流控平台制备的巨型单层囊泡 | 合成生物学 | 肝损伤 | 液-液相分离、微流控技术、无细胞蛋白质合成 | NA | 实验数据 | 使用胆管结扎小鼠模型进行体内研究 | NA | NA | 基于液-液相分离的蛋白质聚集调控机制,用于可控反应过程 | 医学 |
| 866 | 2025-12-02 |
The International Risk Governance Council: Reflections on a 20-Year Experiment in Support of Improved Risk Governance
2025-Nov, Risk analysis : an official publication of the Society for Risk Analysis
IF:3.0Q1
DOI:10.1111/risa.70117
PMID:41047369
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评论 | 本文回顾了国际风险治理理事会(IRGC)20年的历史、活动及其在多个新兴风险领域的工作成果 | 通过六个案例研究(如太阳辐射管理、合成生物学等)系统总结了IRGC在风险治理方面的贡献,并强调了中立召集机构的重要性 | NA | 评估IRGC作为风险治理支持机构的历史作用与影响 | 国际风险治理理事会(IRGC)及其在多个风险领域的治理活动 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 867 | 2025-12-02 |
Label-free high-throughput live-cell sorting of genome-wide random mutagenesis libraries for metabolic traits by Raman flow cytometry
2025-Jun-03, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2503641122
PMID:40445753
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研究论文 | 本文介绍了一种基于正介电泳诱导确定性横向位移的拉曼激活细胞分选技术,用于无标记高通量分选基因组范围随机诱变库中的代谢性状细胞 | 开发了pDEP-DLD-RACS技术,首次实现了对快速移动单细胞的高精度、高通量、长时稳定分选,并直接应用于基因组范围诱变库的代谢性状筛选 | NA | 开发一种无标记、非侵入性的高通量细胞分选平台,用于筛选代谢性状 | 色素和油脂生产酵母细胞,以及基因组范围随机诱变库中的突变体 | 合成生物学 | NA | 拉曼流式细胞术,正介电泳诱导确定性横向位移 | NA | 拉曼光谱数据 | 基因组范围随机诱变库中超过10个物种的突变体 | NA | 酵母 | NA | 工业生物技术 |
| 868 | 2025-12-01 |
Autonomous Bioluminescence Systems: From Molecular Mechanisms to Emerging Applications
2025-Nov-24, JACS Au
IF:8.5Q1
DOI:10.1021/jacsau.5c01072
PMID:41311942
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综述 | 本文综述了自主生物发光系统的分子机制、蛋白质工程策略及其在实时无创成像中的新兴应用 | 系统比较了细菌和真菌自主生物发光系统的优劣,并提出通过AI引导诱变和代谢途径优化等策略解决现有挑战 | 细菌生物发光系统存在量子产率低的问题,真菌生物发光系统受底物可用性限制 | 评估自主生物发光系统的发展现状并展望下一代系统的设计目标 | 细菌和真菌自主生物发光系统 | 合成生物学 | NA | AI引导诱变, 蛋白质设计, 代谢途径优化 | NA | NA | NA | NA | 细菌, 真菌 | 自主生物发光系统(整合荧光素酶与完整底物生物合成途径) | 生物医学研究, 环境监测, 合成生物学 |
| 869 | 2025-12-01 |
MeJA Elicitation on Flavonoid Biosynthesis and Gene Expression in the Hairy Roots of Glycyrrhiza glabra L
2025-Nov-18, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes16111387
PMID:41300839
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研究论文 | 本研究通过建立甘草毛状根培养系统,探究茉莉酸甲酯对黄酮类化合物生物合成及基因表达的影响 | 首次在甘草毛状根系统中结合代谢工程与基因工程技术,通过MeJA诱导和UGT基因过表达显著提高黄酮类化合物含量 | 研究仅针对特定黄酮类化合物,其他活性成分的变化未全面评估;功能基因研究仍需进一步验证 | 提高甘草中黄酮类活性成分的生物合成效率 | 甘草毛状根及其黄酮类化合物 | 合成生物学 | NA | 转录组分析、qRT-PCR、悬浮培养 | NA | 基因表达数据、代谢物含量数据 | 28天悬浮培养的毛状根样本 | 代谢工程、基因工程 | 甘草毛状根 | 黄酮类生物合成途径 | 医药 |
| 870 | 2025-11-30 |
From Biocontrol to Synthesis: Innovative Progress of Paenibacillus in Mechanism Analysis, Gene Editing and Platform Construction
2025-Nov-10, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms262210886
PMID:41303372
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综述 | 本文综述了类芽孢杆菌从生物防治到合成生物学的创新进展,包括机制解析、基因编辑和平台构建 | 系统总结了类芽孢杆菌多种生物防治机制的协同作用及其对环境因素的响应,并探讨了其在合成生物学平台构建中的创新应用 | NA | 探讨类芽孢杆菌在生物防治和合成生物学领域的应用潜力与发展前景 | 类芽孢杆菌及其生物合成机制 | 合成生物学 | NA | 基因编辑、合成生物学策略 | NA | NA | NA | NA | 类芽孢杆菌 | NA | 农业,工业生物技术 |
| 871 | 2025-12-01 |
Phage Therapy for Acinetobacter baumannii Infections: A Review on Advances in Classification, Applications, and Translational Roadblocks
2025-Nov-08, Antibiotics (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/antibiotics14111134
PMID:41301629
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综述 | 本文系统综述了噬菌体疗法在治疗鲍曼不动杆菌感染领域的最新进展,包括分类学更新、治疗策略优化和临床转化挑战 | 基于全基因组系统发育的现代分类学将大多数噬菌体重新分类为Caudoviricetes纲,揭示了与宿主趋向性和生物学特性相关的独特进化支;通过尾丝重组和CRISPR/Cas介导的溶原性消除等基因工程方法扩展宿主范围 | 工程噬菌体的遗传稳定性需要进一步验证;宿主谱有限、缺乏临床转化标准和滞后的监管框架仍是当前挑战 | 总结噬菌体疗法在治疗碳青霉烯类耐药鲍曼不动杆菌感染领域的研究进展和转化障碍 | 鲍曼不动杆菌噬菌体及其治疗应用 | NA | 细菌感染 | 全基因组系统发育分析、基因工程、CRISPR/Cas、宏基因组挖掘 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 鲍曼不动杆菌 | NA | 医学 |
| 872 | 2025-12-01 |
Key Challenges in Plant Microbiome Research in the Next Decade
2025-Nov-07, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms13112546
PMID:41304231
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综述 | 本文系统分析植物微生物组研究面临的关键挑战并提出未来十年的发展路线图 | 提出整合实验与计算策略的路线图,强调合成生物学、多组学工具和人工智能在工程化植物-微生物互作中的应用前景 | 未涉及具体实验数据验证,主要基于现有研究现状的分析与展望 | 推动植物微生物组研究向田间规模应用转化,建立具有气候适应性和资源高效性的农业系统 | 植物微生物组 | NA | NA | 多组学数据整合、测序技术、人工智能 | NA | 多组学数据 | NA | 合成生物学 | 植物 | 植物-微生物互作工程化 | 农业 |
| 873 | 2025-12-01 |
Probiotic Potential of Traditional and Emerging Microbial Strains in Functional Foods: From Characterization to Applications and Health Benefits
2025-Nov-02, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms13112521
PMID:41304207
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综述 | 本文综述了传统和新兴益生菌菌株在功能性食品中的潜力,涵盖表征方法、作用机制、技术限制和健康益处 | 重点关注具有新功能特性的新兴微生物候选菌株,并强调通过组学技术和合成生物学解决现有挑战 | 缺乏长期临床验证、菌株特异性研究不足、个性化应用存在空白以及消费者沟通不充分 | 评估传统和新兴益生菌菌株在功能性食品中的应用潜力和健康效益 | 传统和新兴益生菌微生物菌株 | NA | NA | 组学技术、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 食品, 医药 |
| 874 | 2025-12-01 |
A Rapid, High-Throughput Method for the Construction of Mutagenesis Libraries
2025-Oct-25, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom15111511
PMID:41301429
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研究论文 | 开发了一种基于芯片寡核苷酸合成的高通量、精确控制的诱变文库构建方法 | 利用芯片寡核苷酸合成技术实现精确控制的诱变文库构建,达到93.75%的突变覆盖率 | 存在寡核苷酸合成错误和嵌合序列形成等技术因素影响文库质量 | 开发高效、可扩展、精确控制的诱变文库构建策略 | 诱变文库构建方法 | 合成生物学 | NA | 芯片寡核苷酸合成,PCR | NA | DNA序列数据 | 评估了5种聚合酶 | 芯片寡核苷酸合成 | NA | 琥珀密码子扫描诱变文库 | 工业生物技术 |
| 875 | 2025-12-01 |
Metabolic Engineering of Yeasts for the Production of the Triterpene Squalene: Current Status and Future Prospective
2025-Oct-22, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms13112422
PMID:41304107
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综述 | 系统总结酵母生产角鲨烯的代谢工程策略及下游衍生物应用 | 整合系统代谢工程与合成生物学工具提出经济可行角鲨烯生物制造的路线图 | 微生物平台实现工业化可行滴度仍存在未解决挑战 | 推进酵母菌株工程实现经济可行角鲨烯生物制造 | 酵母底盘细胞及其角鲨烯生物合成途径 | 代谢工程 | NA | 代谢工程、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 酵母 | 甲羟戊酸途径角鲨烯生物合成途径及其下游衍生物合成途径 | 医药、营养保健品、化妆品 |
| 876 | 2025-12-01 |
Optimizing nitrogen use efficiency in forest plantations: mechanistic insights from Arabidopsis, crops, and natural forestry ecosystems
2025, Forestry research
DOI:10.48130/forres-0025-0029
PMID:41312404
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综述 | 本文综述了森林人工林氮素利用效率的优化策略,通过整合拟南芥、作物和天然林生态系统的氮利用机制提出改进方案 | 首次系统整合三大系统的氮利用机制,并提出利用关键调控基因和合成生物学方法定向增强森林人工林氮素利用效率的创新思路 | 主要基于理论分析和现有研究综述,缺乏实际田间试验验证 | 提高森林人工林的氮素利用效率 | 森林人工林(如杨树和桉树)、拟南芥、作物和天然森林生态系统 | 植物生理学与林业科学 | NA | 合成生物学、基因调控 | NA | 文献资料与理论分析 | NA | NA | NA | NA | 农业、林业 |
| 877 | 2025-11-30 |
Microorganism delivery of cancer vaccines
2025-Dec-10, Journal of controlled release : official journal of the Controlled Release Society
IF:10.5Q1
DOI:10.1016/j.jconrel.2025.114288
PMID:41045964
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综述 | 本文综述了微生物癌症疫苗通过利用细菌和病毒靶向肿瘤区域、增强免疫原性的机制及其在癌症免疫治疗中的应用 | 系统阐述微生物疫苗靶向肿瘤机制,并重点介绍合成生物学技术在精准表达肿瘤抗原和免疫检查点抑制剂方面的最新进展 | NA | 探讨微生物癌症疫苗作为变革性免疫治疗策略的潜力 | 细菌疫苗、病毒疫苗和病毒样颗粒等微生物载体 | 合成生物学 | 癌症 | 合成生物学技术 | NA | NA | NA | NA | 细菌, 病毒 | 肿瘤抗原表达系统, 免疫检查点抑制剂表达系统 | 医学 |
| 878 | 2025-11-30 |
Efficient site-specific integration of kilobase-length DNA fragments in plant cells via Kp03 recombinase
2025-Nov-25, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116508
PMID:41187057
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研究论文 | 本研究评估了Kp03重组酶在植物细胞中实现大片段DNA定点整合的效率 | 首次证明Kp03重组酶能在植物细胞中高效整合长达27.3 kb的DNA片段,并确定仅需15-bp attB序列即可实现整合 | 研究主要基于瞬时原生质体实验和愈伤组织,尚未在完整植株中验证整合效率 | 开发植物基因组工程中大片段DNA定点整合的新方法 | 水稻和拟南芥的细胞及愈伤组织 | 合成生物学 | NA | 重组酶介导的整合、基因组编辑 | NA | 分子生物学实验数据 | 水稻和拟南芥原生质体及愈伤组织(具体数量未明确说明) | Kp03重组酶, NM-PE基因组编辑系统 | 水稻, 拟南芥 | 基于attB-attP重组系统的DNA整合平台 | 农业, 工业生物技术 |
| 879 | 2025-11-30 |
Analog epigenetic memory revealed by targeted chromatin editing
2025-Nov-12, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2025.100985
PMID:40930103
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研究论文 | 本研究通过靶向染色质编辑揭示了表观遗传记忆的模拟特性,证明染色质修饰可维持不同水平的基因表达 | 首次发现DNA甲基化梯度可对应维持不同水平的基因表达,揭示了模拟表观遗传记忆的存在机制 | 未明确说明实验使用的具体细胞类型和样本规模 | 探索染色质修饰如何维持不同基因表达状态及其记忆机制 | 染色质修饰状态与基因表达动态关系 | 合成生物学 | NA | 靶向染色质编辑、DNA甲基化分析 | 染色质修饰模型 | 基因表达动态数据 | NA | 基因组报告系统、表观遗传效应器 | NA | 表观遗传记忆系统 | 合成生物学 |
| 880 | 2025-11-30 |
Genetic Surfaceome E. coli Reprogramming Enables Selective Water Oxidation
2025-Nov, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202508100
PMID:40817601
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研究论文 | 通过合成生物学方法重构大肠杆菌表面组,实现选择性水氧化催化 | 开发了合成操纵子系统,通过正交诱导控制和密码子优化表达,在微生物表面展示真菌胆红素氧化酶并实现活性重构 | NA | 设计可再生微生物平台用于选择性催化和人工光合作用 | 大肠杆菌表面展示的胆红素氧化酶系统 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、基因工程、生物电催化 | NA | NA | NA | 合成操纵子、IPTG诱导系统、冰核蛋白锚定 | 大肠杆菌 | 合成操纵子系统,包含正交IPTG诱导控制、密码子优化表达和表面蛋白展示 | 能源、环境 |