合成生物学相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['synthetic biology']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价9.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 4700 篇文献，本页显示第 861 - 880 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 861 | 2025-12-25 |
Exploring lipid diversity and minimalism to define membrane requirements for synthetic cells
2025-Dec, FEBS letters
IF:3.0Q3
DOI:10.1002/1873-3468.70131
PMID:40787853
|
综述 | 本文探讨了构建模拟生物细胞基本功能的合成细胞时，脂质多样性与简约性在定义膜需求方面的作用 | 对比了自下而上和自上而下两种构建合成细胞的方法，并强调了膜蛋白与其周围脂质环境之间关键相互作用的重要性 | NA | 定义自繁殖合成细胞所需的最小脂质组要求 | 合成细胞的脂质膜 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学, 生物技术, 环境科学 |
| 862 | 2025-12-25 |
Engineered bacteria for cancer therapy: Advancements, challenges, and future directions
2025-Nov-17, Chinese medical journal
IF:7.5Q1
DOI:10.1097/CM9.0000000000003807
PMID:41243447
|
综述 | 本文综述了工程化细菌在癌症治疗中的最新进展、挑战与未来方向 | 系统总结了利用合成生物学和基因工程改造细菌，使其靶向肿瘤微环境并作为局部递送治疗药物的创新平台，以及与传统疗法结合的协同策略 | NA | 探讨工程化细菌在癌症治疗中的应用潜力与发展方向 | 工程化细菌及其在癌症治疗中的设计与应用 | 合成生物学 | 癌症 | 基因工程、合成生物学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick | 细菌 | 生物传感器、逻辑门、代谢通路 | 医学 |
| 863 | 2025-12-25 |
PIONEER: A Periplasmic Display Platform for Synthetic Biology-Based Screening of Genetically Encoded Protein Regulators
2025-Nov-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.26.684622
PMID:41280029
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为PIONEER的模块化平台，用于在酵母周质空间展示肽、蛋白质和纳米抗体，以直接研究膜蛋白功能 | 通过优化分泌信号和展示支架，实现了稳定的配体保留和强大的自分泌信号传导，能够通过信号传导而非单纯结合来评估配体活性，这是功能优先筛选的关键进展 | 尽管已在GPCRs上得到验证，但平台对其他膜蛋白和可溶性蛋白的适用性仍需进一步测试 | 开发一种用于合成生物学筛选的周质展示平台，以研究基因编码的蛋白质调节剂 | 肽、蛋白质、纳米抗体以及人类G蛋白偶联受体（GPCRs） | 合成生物学 | NA | 周质展示技术、自分泌信号传导 | NA | NA | NA | NA | 酵母 | 膜蛋白功能筛选平台 | 医学、工业生物技术 |
| 864 | 2025-12-25 |
An alternative view on the ethics of synthetic biology: an Indian Hindu perspective
2025, Global bioethics = Problemi di bioetica
DOI:10.1080/11287462.2025.2518798
PMID:41425232
|
评论 | 本文从印度教哲学的非二元世界观出发，重新审视合成生物学的伦理问题，提出一种强调互联性、责任感和对所有生命形式尊重的伦理框架 | 首次将印度教哲学的非二元世界观应用于合成生物学的伦理讨论，突破了传统二元对立（如自然/人工、人类/机器）的伦理框架限制 | NA | 为合成生物学的伦理讨论提供一种非二元、更全面包容的哲学视角 | 合成生物学的伦理框架 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学, 农业, 环境 |
| 865 | 2025-12-24 |
Structure prediction and engineering of de novo proteins
2026-Jan-01, Biochimica et biophysica acta. Proteins and proteomics
DOI:10.1016/j.bbapap.2025.141100
PMID:40962101
|
综述 | 本文综述了从头蛋白质的定义、历史、功能意义及研究方法，涵盖自然进化与合成设计两类 | 强调自然进化过程与理性蛋白质工程之间的日益融合，突显其在生物学发现和人类创新中的重要性 | NA | 概述从头蛋白质的研究领域，包括其结构预测与工程应用 | 从头蛋白质，包括自然进化与合成设计两类 | 合成生物学 | NA | 计算与实验方法 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 866 | 2025-12-24 |
A high-throughput heterologous expression platform for plant synthetic biology based on Arabidopsis suspension cells
2025-Dec-23, Journal of experimental botany
IF:5.6Q1
DOI:10.1093/jxb/eraf545
PMID:41432110
|
研究论文 | 本文开发了一种基于拟南芥悬浮细胞的高通量异源表达平台，用于植物合成生物学 | 建立了一种无需特殊设备或耗材的高通量瞬时和稳定转化系统，可快速生成大量转基因细胞并表达多个堆叠基因 | NA | 开发高效异源表达平台以促进植物合成生物学，特别是复杂多基因途径的工程化 | 拟南芥悬浮细胞 | 合成生物学 | NA | 植物细胞包渗入法 | NA | NA | NA | NA | 拟南芥悬浮细胞 | 氮酶铁钼辅因子成熟酶NifB模块组件（NifU、NifS、FdxN和NifB）的多基因表达途径 | 农业, 工业生物技术 |
| 867 | 2025-12-24 |
A Novel Salicylaldehyde Dehydrogenase from Alpine Soil Metagenome Reveals a Unique Catalytic Mechanism
2025-Dec, Applied biochemistry and biotechnology
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s12010-025-05445-4
PMID:41182549
|
研究论文 | 本研究从高山土壤宏基因组中发现并全面表征了一种新型水杨醛脱氢酶（SALD），揭示了其独特的催化机制和生态意义 | 首次实验表征了Alphaproteobacterial来源的SALD，发现其形成独特的进化分支，并提出了涉及ASN-137等残基的非经典催化配置模型 | 高浓度金属和溶剂会抑制酶活性，且对脂肪醛的催化效率较低 | 探索高山土壤宏基因组中新型酶的催化机制及其生态和生物技术应用 | 从高山土壤宏基因组中获得的SALD酶 | NA | NA | 宏基因组学、系统发育分析、动力学分析、差示扫描荧光法、结构比对和分子对接 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 生物修复、合成生物学 |
| 868 | 2025-12-24 |
Research progress on gut microbiota in colorectal cancer immunotherapy
2025-Nov, Biochimica et biophysica acta. Reviews on cancer
DOI:10.1016/j.bbcan.2025.189476
PMID:41130540
|
综述 | 本文系统综述了肠道菌群及其代谢微环境在调节结直肠癌免疫检查点抑制剂疗效中的关键研究进展 | 聚焦于肠道菌群及其代谢产物如何影响免疫检查点抑制剂疗效，并探讨了基于微生物组的靶向干预策略，如益生菌/益生元组合、优化的抗生素使用时机、改进的粪菌移植方案以及基于合成生物学的工程菌疗法 | NA | 为开发新型个性化结直肠癌免疫治疗策略提供理论基础，重点是通过调节微生物组来优化免疫检查点抑制剂的治疗效果 | 结直肠癌患者、肠道菌群及其代谢产物 | NA | 结直肠癌 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | 医学 |
| 869 | 2025-12-24 |
MULTIMODAL CELL CONTEXT INSTRUCTION TUNING FOR CONDITIONAL DNA REGULATORY SEQUENCE GENERATION WITH LARGE LANGUAGE MODELS
2025-Sep, Proceedings. International Conference on Image Processing
DOI:10.1109/icip55913.2025.11084625
PMID:41426347
|
研究论文 | 提出了一种名为Leonine的新型框架，通过多模态细胞上下文指令调优，利用大型语言模型生成条件性DNA调控序列 | 将增强子序列设计重新定义为细胞上下文中的多模态问答任务，整合DNA序列、启动子序列、基因表达谱和细胞类型信息 | NA | 设计具有细胞类型特异性的生物合理调控序列，特别是增强子 | DNA调控序列（增强子） | 合成生物学 | NA | 大型语言模型（LLMs） | LLM | DNA序列、启动子序列、基因表达谱、细胞类型信息 | 超过150万个细胞类型特异性启动子-增强子对 | NA | NA | 增强子设计 | 医学 |
| 870 | 2025-12-24 |
Promiscuity of an Alcohol-Dependent Hemiterpene Pathway for the In Vivo Production of a Non-Natural Alkylated Tryptophan Derivative
2025-04-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00865
PMID:40134314
|
研究论文 | 本研究揭示了人工酒精依赖性半萜（ADH）途径中PhoN酶和芳香族异戊二烯基转移酶的广泛底物特异性，并成功在体内合成了非天然烷基化色氨酸衍生物 | 首次将ADH模块与异戊二烯基转移酶的底物宽泛性相结合，实现了非天然烷基化色氨酸衍生物的体内生物合成 | 未明确说明该途径的产率、规模化生产可行性及对其他下游酶普适性的系统验证 | 拓展异戊二烯类天然产物的结构多样性，推动合成生物学在萜类化合物生物合成中的应用 | 人工酒精依赖性半萜（ADH）途径中的PhoN酶、IPK激酶及芳香族异戊二烯基转移酶 | 合成生物学 | NA | 酶促反应、体内生物合成 | NA | 酶学特性数据、代谢产物分析数据 | NA | Gibson Assembly, BioBrick | 大肠杆菌（E. coli） | 人工酒精依赖性半萜（ADH）代谢途径，包含PhoN磷酸酶、IPK激酶和芳香族异戊二烯基转移酶模块 | 工业生物技术 |
| 871 | 2025-12-24 |
Derepression of transposable elements in mouse prefrontal cortex disrupts social behavior
2025-Apr-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.31.646358
PMID:40236017
|
研究论文 | 本研究采用合成生物学方法，通过改造TRIM28蛋白在小鼠前额叶皮层中的功能，探究其对社交行为的影响 | 首次通过合成生物学手段在活体小鼠中逆转TRIM28的转录调控功能，揭示其通过稳定转座元件调控免疫基因表达以维持社交行为的新机制 | 研究主要关注前额叶皮层，未全面评估其他脑区的影响；实验对象仅限于小鼠，人类相关性有待验证 | 探究TRIM28-KZFP相互作用在调控转座元件和免疫基因表达中对小鼠社交行为的影响 | 雄性和雌性小鼠的前额叶皮层及TRIM28蛋白功能 | 合成生物学 | NA | RNA测序、病毒介导的基因递送 | NA | 基因表达数据、行为数据 | 雄性和雌性小鼠（具体数量未明确） | 病毒载体系统 | 小鼠 | 通过替换TRIM28的转录抑制域为激活域VP64-p65-Rta，或删除调控域，构建功能逆转的TRIM28变体 | 医学 |
| 872 | 2025-12-24 |
Biological Switches: Past and Future Milestones of Transcription Factor-Based Biosensors
2025-01-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00689
PMID:39709556
|
综述 | 本文回顾了转录因子生物传感器从1960年代至今的发展历程，包括基础研究和工程策略的关键里程碑，并探讨了未来前景、挑战和未开发机遇 | 系统分析了转录因子生物传感器在基础知识和工程策略上的历史演变，并整合了多学科方法如高通量工具和计算学习来扩展其应用 | NA | 回顾转录因子生物传感器的发展历史，分析其工程策略，并讨论未来研究方向 | 转录因子生物传感器，包括其DNA和蛋白质层面的设计与应用 | 合成生物学 | NA | 高通量分析工具、DNA随机化策略、正向工程、高级蛋白质工程工作流程 | NA | NA | NA | NA | NA | 转录因子生物传感器，基于原核生物转录调控机制 | 生物技术 |
| 873 | 2025-12-23 |
Construction of an mKate-based fluorescent protein reporting system in Limosilactobacillus reuteri
2026-Jan, Journal of microbiological methods
IF:1.7Q4
DOI:10.1016/j.mimet.2025.107347
PMID:41314353
|
研究论文 | 本文在罗伊氏乳杆菌中建立了一个高效的遗传转化系统，并构建了基于mKate的红色荧光蛋白报告系统 | 通过优化转化协议，首次在罗伊氏乳杆菌中实现了高效的遗传转化，并成功构建了mKate荧光报告系统，为实时监测细菌定位和基因表达提供了新工具 | NA | 开发适用于罗伊氏乳杆菌的合成生物学工具，以支持实时监测细菌行为和基因表达 | 罗伊氏乳杆菌 | 合成生物学 | NA | 遗传转化优化、荧光蛋白报告系统构建 | NA | NA | NA | NA | 罗伊氏乳杆菌 | mKate红色荧光蛋白报告系统 | 工业生物技术 |
| 874 | 2025-12-23 |
The Road to Sustainable Soy Sauce Production and Consumption
2026-Jan, Comprehensive reviews in food science and food safety
IF:12.0Q1
DOI:10.1111/1541-4337.70352
PMID:41355608
|
综述 | 本文通过系统综述分析了酱油生产与消费的趋势，重点关注工艺优化、微生物发酵、安全性、废物管理和新兴分析技术五个关键领域，并提出了一个连接可持续性核心支柱的整合框架 | 提出了一个将五个关键主题领域（工艺优化、微生物发酵、安全、废物管理、分析技术）与可持续性核心支柱（环境、经济、社会、技术、营养）相连接的整合框架，为未来研究、政策制定和工业实践提供指导 | 整合传统方法与新兴技术（如精准发酵）仍面临微生物菌株不兼容、可扩展性问题以及保持文化真实性和感官属性的挑战 | 审查酱油生产与消费的趋势，并探讨如何通过技术进步实现可持续的酱油生产与消费 | 酱油的生产工艺、微生物发酵过程、相关分析技术及可持续性实践 | NA | NA | 宏基因组学、合成生物学、酶工程、多组学方法（代谢组学、基因组学、转录组学）、光谱学、基于传感器的系统 | NA | NA | 基于181篇同行评审文章 | NA | NA | NA | 食品, 工业生物技术 |
| 875 | 2025-12-23 |
Chromoproteins: visible tools for advancing synthetic biology
2025-Nov-26, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.10.020
PMID:41309430
|
综述 | 本文全面概述了基于色蛋白的研究进展，包括其理化特性、分类、工程策略和应用 | 强调色蛋白作为可见工具在合成生物学中的独特优势，如裸眼可见性、广泛表达和可调性 | NA | 推动合成生物学中可见色蛋白报告基因的发展，提供更易访问和模块化的平台 | 色蛋白及其变体 | 合成生物学 | NA | 基因工程 | NA | NA | NA | NA | 原核和真核系统 | NA | 合成生物学研究与应用 |
| 876 | 2025-12-23 |
codonGPT: reinforcement learning on a generative language model enables scalable mRNA design
2025-Nov-26, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf1345
PMID:41416521
|
研究论文 | 本文开发了首个专门针对mRNA序列的生成式语言模型codonGPT，并结合强化学习实现了可扩展的mRNA设计优化 | 首次将强化学习与生物语言模型结合用于mRNA设计，提出了创新的推理时掩码方法以约束同义序列，并构建了首个基于模型生物mRNA序列的生成式语言模型 | 模型训练数据仅包含338,417条模型生物mRNA序列，可能未覆盖所有生物多样性；方法在HLA-A和ACTB等示例基因中验证，需进一步扩展应用范围 | 开发可扩展的mRNA设计方法，用于治疗、合成生物学和蛋白质工程 | mRNA序列设计优化 | 自然语言处理 | NA | 强化学习、生成式语言模型 | GPT类生成模型 | mRNA序列数据 | 338,417条模型生物mRNA序列 | NA | NA | NA | 医学、合成生物学、蛋白质工程 |
| 877 | 2025-12-23 |
Overexpression of REDUCED WALL ACETYLATION C increases xylan acetylation and biomass recalcitrance in Populus
2023-12-30, Plant physiology
IF:6.5Q1
DOI:10.1093/plphys/kiad377
PMID:37399189
|
研究论文 | 本研究通过过表达PtRWA-C基因，揭示了其在杨树木质生物质中增加木聚糖乙酰化、木质素含量和S/G比例，从而降低糖化效率的作用，并发现其受HRD转录因子调控 | 首次在杨树中证明PtRWA-C过表达对木聚糖乙酰化和生物质抗降解性的影响，并识别HRD作为其直接调控因子 | 未涉及PtRWA-C在其他植物物种中的功能验证或大规模田间试验 | 探究PtRWA-C基因在木聚糖乙酰化和生物质糖化效率中的功能及调控机制 | 毛果杨（Populus trichocarpa）的PtRWA-C基因及其对次级细胞壁特性的影响 | 合成生物学 | NA | 基因共表达网络分析、表达数量性状位点（eQTL）分析、启动子结合实验 | NA | 基因表达数据、生物化学分析数据 | 未明确指定样本数量，但基于杨树转基因材料 | 基因过表达 | 毛果杨（Populus trichocarpa） | NA | 能源、工业生物技术 |
| 878 | 2025-12-23 |
Transcription factor module NLP-NIGT1 fine-tunes NITRATE TRANSPORTER2.1 expression
2023-11-22, Plant physiology
IF:6.5Q1
DOI:10.1093/plphys/kiad458
PMID:37595050
|
研究论文 | 本研究通过实验和数学模型揭示了转录因子模块NLP-NIGT1如何精细调控拟南芥高亲和硝酸盐转运蛋白NRT2.1的表达 | 结合微孔板实时检测和常微分方程建模两种方法，首次系统阐明了NIGT1在宽浓度硝酸盐条件下稳定NRT2.1表达振幅的作用机制 | 模型参数基于特定实验条件，在更复杂的体内环境或不同植物物种中的普适性有待验证 | 解析植物硝酸盐转运蛋白NRT2.1受多转录因子复杂调控的分子机制 | 拟南芥（Arabidopsis thaliana）的NRT2.1基因及其调控转录因子NLP和NIGT1 | 植物分子生物学 | NA | 微孔板实时启动子活性检测、常微分方程（ODE）数学模型 | 常微分方程模型 | 基因表达时序数据、启动子活性动态数据 | NA | NA | 拟南芥（Arabidopsis thaliana） | NLP-NIGT1前馈调控环路 | 农业 |
| 879 | 2025-12-22 |
CRISPR as a next-generation environmental biosurveillance tool for air, land, and water
2025-Dec-19, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.11.014
PMID:41421891
|
综述 | 本文综述了基于CRISPR的环境生物监测技术（CRISPR-eBx）作为下一代前沿生物监测解决方案的潜力，涵盖其在空气、土地和水体中的应用 | 将CRISPR技术与计算科学、合成生物学和生物监测交叉融合，提出了一个战略路线图，以推动CRISPR-eBx成为便携、特异、灵敏且成本效益高的下一代环境监测平台 | 在部署CRISPR-eBx用于新型生物/基因靶标和环境来源时，仍存在关键挑战需要解决 | 探讨CRISPR-eBx作为下一代环境生物监测工具的应用前景和战略发展 | 环境核酸中的生物体，包括病原体、入侵物种和濒危物种 | 合成生物学 | NA | CRISPR技术 | NA | 环境核酸 | NA | CRISPR-Cas9 | NA | 生物传感器 | 环境 |
| 880 | 2025-12-22 |
Engineered Peptide Scrambling for Enhanced Drug Delivery to Resistant Breast Cancer Cells via Small Extracellular Vesicles
2025-Dec-15, ACS applied bio materials
IF:4.6Q2
DOI:10.1021/acsabm.5c00582
PMID:41321158
|
研究论文 | 本研究开发了一种通过工程化肽序列扰乱来增强小细胞外囊泡靶向药物递送至耐药乳腺癌细胞的方法 | 利用双报告平台定量评估肿瘤归巢肽功能化小细胞外囊泡的结合，并通过氨基酸序列扰乱设计增强结合能力的肽变体，结合机械刺激提高药物负载效率 | 方法主要基于体外细胞实验，尚未进行体内验证；技术对小细胞外囊泡表面靶向部分的表征仍有限制 | 优化肿瘤靶向药物递送，克服耐药性 | 乳腺癌细胞（MDA-MB-231）和HEK293FT细胞 | 合成生物学 | 乳腺癌 | 生物发光测定、荧光显微镜、小细胞外囊泡工程 | NA | 体外细胞实验数据 | 24种扰乱变体肽在MDA-MB-231细胞中评估 | 细胞外囊泡表面功能化 | HEK293FT细胞 | 肿瘤归巢肽功能化的小细胞外囊泡作为靶向药物递送系统 | 医学 |