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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 861 | 2026-04-04 |
RNA triplet repeats: improved algorithms for structure prediction and interactions
2025-Dec-10, Algorithms for molecular biology : AMB
IF:1.5Q3
DOI:10.1186/s13015-025-00292-8
PMID:41372930
|
研究论文 | 本文研究了由三核苷酸重复序列组成的RNA的最小自由能二级结构,并改进了计算最小自由能和配分函数的算法,同时设计了用于RNA-RNA相互作用的新算法 | 改进了计算RNA三核苷酸重复序列最小自由能和配分函数的算法,并将RNA-RNA相互作用的计算复杂度从阶乘时间优化至指数时间,提出了基于碱基集的相互作用多项式时间算法 | 在TR情况下存在计算复杂性,但通过参数化算法部分解决,未提及实验验证或实际应用限制 | 提高RNA三核苷酸重复序列结构预测和相互作用的计算效率与准确性 | 由三核苷酸重复序列组成的RNA及其相互作用 | 计算生物学 | NA | 最小自由能计算、配分函数计算、RNA-RNA相互作用算法 | NA | RNA序列数据 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 |
| 862 | 2026-04-03 |
Biological reduction of Fenton sludge: Electron transfer mechanisms, regulatory strategies, and prospects
2026-Jun, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2026.134424
PMID:41833913
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综述 | 本文综述了Fenton污泥生物还原中的电子转移机制、调控策略及未来前景,强调其在资源回收中的应用潜力 | 聚焦于多机制动态耦合的电子转移网络框架,并详细探讨了环境条件对各机制的动态响应及增强协同作用的调控策略 | NA | 探讨Fenton污泥生物还原的资源回收策略,以促进高效利用和生物铁还原的多样化发展 | Fenton污泥及其生物还原过程,特别是铁还原细菌和电子转移机制 | 环境生物技术 | NA | 系统生物学、合成生物学、微生物电化学技术 | NA | NA | NA | 基因工程 | NA | NA | 环境 |
| 863 | 2026-04-03 |
Advances in the construction and biological applications of DNA condensates
2026-Apr-02, Nanoscale
IF:5.8Q1
DOI:10.1039/d5nr05322f
PMID:41758048
|
综述 | 本文综述了通过液-液相分离构建DNA凝聚物的策略及其在仿生细胞器、生物传感、细胞调控和药物递送等领域的生物应用 | 利用DNA的可编程性、多样相互作用模式和易化学修饰特性,构建具有多刺激响应性和可编程生化微环境的人工凝聚物,并展望了与光遗传学、单分子技术和机器学习结合的智能多组分系统 | 时空控制有限、易受核酸酶降解和免疫原性等问题,限制了其在活体系统中的转化应用 | 探讨DNA凝聚物的构建方法及其在合成生物学和精准医学中的生物应用 | DNA凝聚物及其在细胞环境中的功能模拟与应用 | 合成生物学 | NA | 液-液相分离(LLPS)、序列驱动自组装、聚合物或蛋白质介导的凝聚 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 864 | 2026-04-03 |
Peimine: A comprehensive review of its botanical distribution, biosynthesis, pharmacological effects and pharmacokinetics
2026-Apr, Fitoterapia
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.fitote.2026.107140
PMID:41692275
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综述 | 本文全面综述了贝母素(PM)的植物分布、生物合成途径、药理作用及药代动力学研究进展 | 系统整合了PM的物种特异性分布规律与多靶点药理机制,并指出合成生物学在PM生产中的应用前景 | PM的口服生物利用度较低且药代动力学特征尚未完全明确,限制了其临床转化潜力 | 总结PM的最新研究进展,为其合理开发与利用提供科学依据 | 贝母属植物(如浙贝母、平贝母、湖北贝母)中提取的甾体生物碱贝母素(PM) | NA | 呼吸系统疾病、癌症 | 基因组学、酶学表征、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医药 |
| 865 | 2026-04-03 |
Constructing cellulosomes to enhance lignocellulose degradation and biotechnological applications: A review
2026-Apr, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2026.151467
PMID:41856184
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综述 | 本文综述了天然和工程化纤维素小体的最新进展,强调其结构多样性、协同机制及工业应用,以增强木质纤维素降解和生物技术应用 | 介绍了'设计者纤维素小体'作为模块化平台,通过合成支架设计、宿主优化和操作子工程,提升催化协同性、热稳定性及整合生物加工,并探索了双对接模块、三方对接相互作用和糖基化增强稳定性等新概念 | NA | 开发高效木质纤维素生物加工策略,以促进可持续和可再生能源来源 | 纤维素小体,包括天然来源(如梭菌属、瘤胃球菌属和拟杆菌属)和工程化系统 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成支架设计, 操作子工程 | 酿酒酵母, 枯草芽孢杆菌, 马克斯克鲁维酵母 | 设计者纤维素小体作为模块化平台,整合酶复合物以增强降解效率 | 能源, 工业生物技术 |
| 866 | 2026-04-03 |
The rise and future of peptide-based antimicrobials
2026-Mar, Journal of microbiology (Seoul, Korea)
DOI:10.71150/jm.2510002
PMID:41736369
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综述 | 本文综述了基于肽的抗菌药物作为应对抗菌素耐药性的适应性有效替代方案的兴起与未来发展 | 系统整合了肽类抗生素从发现、优化到应用的最新进展,并强调了人工智能、合成生物学和现代递送技术等新兴策略在重塑其设计与生产中的作用 | NA | 概述肽类抗生素的研究进展,探讨其作为应对抗菌素耐药性新疗法的潜力 | 肽类抗生素 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医药 |
| 867 | 2026-04-03 |
Emerging synthetic biology-assisted technologies for overcoming antibiotic resistance: CRISPR-Cas, bacteriophage, microbiome, and metabolic engineering-based solutions
2026-Mar, Journal of microbiology (Seoul, Korea)
DOI:10.71150/jm.2512002
PMID:41923586
|
综述 | 本文全面综述了合成生物学辅助技术(包括CRISPR-Cas系统、噬菌体工程、微生物组工程和代谢工程驱动的抗生素发现)在克服抗生素耐药性方面的最新进展 | 提出了一个精准抗菌新范式,能够选择性靶向耐药菌同时维持微生物组稳态,并为限制耐药性传播和开发下一代疗法提供了新方向 | NA | 探讨合成生物学辅助技术如何克服抗生素耐药性这一全球健康挑战 | 抗生素耐药性、耐药病原体、耐药基因的水平转移机制 | 合成生物学 | 感染性疾病 | CRISPR-Cas系统、噬菌体工程、微生物组工程、代谢工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas | 细菌、噬菌体、微生物组 | NA | 医学 |
| 868 | 2026-04-03 |
Understanding, inhibiting, and engineering membrane transporters with high-throughput mutational screens
2025-Apr-17, Cell chemical biology
IF:6.6Q1
DOI:10.1016/j.chembiol.2025.03.003
PMID:40168989
|
综述 | 本文介绍了利用高通量突变筛选方法来理解、抑制和改造膜转运蛋白的原理、方法及其应用潜力 | 系统阐述了高通量筛选方法在解析多特异性膜转运蛋白分子机制中的独特优势,并提出了其在药物研发和合成生物学中的创新应用方向 | NA | 探讨高通量遗传筛选方法在膜转运蛋白研究中的应用潜力 | 多特异性膜转运蛋白 | 合成生物学 | NA | 高通量突变筛选 | NA | 遗传变异数据 | NA | NA | NA | NA | 医学, 工业生物技术 |
| 869 | 2026-04-03 |
Emulating nonribosomal peptides with ribosomal biosynthetic strategies
2023-Jan-04, RSC chemical biology
IF:4.2Q2
DOI:10.1039/d2cb00169a
PMID:36685251
|
综述 | 本文综述了通过核糖体生物合成策略模拟非核糖体肽的研究进展,比较了两者的结构特征,并强调了合成生物学在核糖体途径工程中的应用 | 揭示了非核糖体肽中曾被认为独特的结构特征也存在于核糖体合成肽中,并利用核糖体途径的简化性和修饰酶的多功能性进行工程化设计 | NA | 探讨如何通过核糖体生物合成策略模拟非核糖体肽,以生产具有增强生物活性的类似物 | 非核糖体肽和核糖体合成并翻译后修饰的肽 | 合成生物学 | NA | 核糖体生物合成、翻译后修饰 | NA | NA | NA | 核糖体途径工程 | NA | NA | 医药 |
| 870 | 2026-04-03 |
Multifunctional SEVA shuttle vectors for actinomycetes and Gram-negative bacteria
2020-06, MicrobiologyOpen
IF:3.9Q2
DOI:10.1002/mbo3.1024
PMID:32170856
|
研究论文 | 本研究开发了23种遵循SEVA标准架构的多功能穿梭载体,用于放线菌和革兰氏阴性菌的基因工程 | 开发了结合革兰氏阴性菌和放线菌(特别是链霉菌)复制起点的多功能SEVA穿梭载体,并引入了新的安普霉素抗性选择标记 | 未明确说明载体在所有放线菌物种中的通用性测试范围,也未讨论长期遗传稳定性 | 扩大链霉菌及其他放线菌的遗传工具库,促进其作为合成生物学通用底盘的应用 | 链霉菌属(特别是Streptomyces albus J1074)及其他放线菌 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | SEVA (Standard European Vector Architecture), Gibson Assembly | Streptomyces albus J1074, Escherichia coli, 放线菌, 革兰氏阴性菌 | 穿梭载体(含整合型、低拷贝数、中高拷贝数复制起点),异源表达系统(用于GFP和芹菜素生产) | 工业生物技术 |
| 871 | 2026-04-02 |
Advances in Ene-Reductase Engineering: Dynamic Structure, Catalytic System Innovation, and Green Application Prospects
2026-Apr-01, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c14585
PMID:41873156
|
综述 | 本文综述了烯还原酶(ERs)的动态结构调控、定向进化、固定化技术及其在药物合成和环境修复中的应用 | 重点阐述了构象变化对催化选择性的影响、光酶协同系统以及AI辅助设计,并展望了低成本固定化、连续流工艺和多场耦合催化系统等新兴方向 | NA | 总结烯还原酶的研究进展,并为未来研究提供理论参考 | 烯还原酶(ERs) | 合成生物学 | NA | 定向进化、固定化技术、AI辅助设计 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 药物合成, 环境修复 |
| 872 | 2026-04-02 |
Oncolytic Virotherapy for Solid Tumors: Clinical Advances and Future Directions
2026-04, Surgical oncology clinics of North America
IF:2.4Q2
DOI:10.1016/j.soc.2025.10.011
PMID:41903995
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综述 | 本文综述了溶瘤病毒疗法治疗实体瘤的生物学基础、临床应用、组合疗法、新一代病毒平台的发展以及临床转化面临的主要障碍和应对策略 | 系统性地概述了溶瘤病毒疗法的最新临床进展、新兴组合策略以及基于合成生物学和免疫肿瘤学发展的下一代病毒平台,并指出了克服临床转化障碍的新兴策略 | NA | 总结溶瘤病毒疗法在实体瘤治疗中的现状、挑战与未来发展方向 | 溶瘤病毒及其在实体瘤治疗中的应用 | NA | 实体瘤 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 873 | 2026-04-02 |
RNP-Based Control Systems for Genetic Circuits in Synthetic Biology Beyond CRISPR
2022, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-2421-0_1
PMID:35666436
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综述 | 本文综述了基于核糖核蛋白(RNP)的遗传电路控制系统在合成生物学中的应用,并提供了系统选择标准 | 系统性地回顾了CRISPR之外的工程化RNP控制系统,并提出了针对不同生物过程的优化选择框架 | 作为综述文章,未涉及原始实验数据,且未来应用部分基于推测 | 评估和总结工程化RNP控制系统在合成生物学中的发展现状与应用潜力 | 核糖核蛋白(RNP)复合物及其工程化控制系统 | 合成生物学 | NA | 工程化RNP系统设计 | NA | NA | NA | CRISPR, 其他RNP工程工具 | 原核生物, 真核生物 | 遗传电路控制, 生物传感器, 逻辑门 | 工业生物技术, 医学, 环境, 农业 |
| 874 | 2026-04-01 |
A general strategy to enhance aptamer affinity by suppressing dissociation through symmetric assembly
2026-Mar-19, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag268
PMID:41873762
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研究论文 | 本文提出了一种通过对称组装抑制解离来增强适体亲和力的通用策略 | 采用对称引导的组装方法,通过快速再结合实现动力学协同性,显著降低解离速率常数 | NA | 增强适体亲和力以克服快速靶标解离的限制 | 针对SARS-CoV-2刺突蛋白、VEGF165和心脏肌钙蛋白I的适体 | 合成生物学 | NA | 对称组装方法 | NA | NA | NA | NA | NA | 三价柔性组装体 | 诊断、治疗、合成生物学 |
| 875 | 2026-04-01 |
Aptamer- and Ribozyme-Engineered sgRNAs for Conditional Control of CRISPR/Cas9 Function
2026-Mar-09, Frontiers in bioscience (Landmark edition)
DOI:10.31083/FBL47300
PMID:41914300
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综述 | 本文综述了通过将功能性核酸元件(如适配体、核酶和适配酶)整合到sgRNA特定结构区域中,开发条件响应性CRISPR/Cas9系统的设计策略与应用 | 通过工程化sgRNA实现CRISPR/Cas9系统的条件响应性控制,使其能响应小分子、蛋白质和内源性代谢物等多种分子信号 | 当前系统在特异性、效率和适用性方面仍面临挑战,需要进一步改进 | 开发条件响应性CRISPR/Cas9系统,用于合成生物学、疾病建模和治疗开发 | 工程化的单导RNA(sgRNA)和CRISPR/Cas9系统 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9系统,功能性核酸元件整合 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 原核细胞,真核细胞 | 条件响应性基因编辑、激活、抑制和成像系统 | 医学 |
| 876 | 2026-03-31 |
Evolution and Impact of Imine Reductases (IREDs) Research: A Knowledge Mapping Approach
2026-Mar, Molecular biotechnology
IF:2.4Q3
DOI:10.1007/s12033-025-01421-9
PMID:40172741
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研究论文 | 本研究使用文献计量和知识图谱方法,探索了亚胺还原酶(IREDs)的研究格局和演变历程 | 首次通过文献计量分析提供了IRED研究的可视化表示,揭示了研究趋势和新兴主题 | 研究基于已发表的文献数据,可能未涵盖所有未发表或正在进行的研究,且分析范围限于2010年至2024年 | 探索IREDs的研究景观和演变,以提供对该领域的全面评估 | 亚胺还原酶(IREDs)及其在合成手性胺中的应用 | 合成生物学 | NA | 文献计量分析、知识图谱方法(如CiteSpace、VOSviewer、Pajek、Scimago Graphica) | NA | 文本数据(研究文章和综述) | 239篇研究文章和综述 | NA | NA | NA | 医药 |
| 877 | 2026-03-31 |
Recent Advances in Multiple Strategies for the Biosynthesis of Sesquiterpenols
2025-05-03, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom15050664
PMID:40427558
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综述 | 本文综述了利用微生物系统异源合成倍半萜醇的最新合成生物学策略与进展 | 系统总结了包括适应性倍半萜醇合酶筛选与表达、合成途径调控、细胞内区室化表达策略以及应对萜类化合物毒性的耐受性策略在内的多种创新方法 | NA | 推进倍半萜醇生物合成研究,以克服其工业化应用面临的产量低、成本高等挑战 | 倍半萜醇化合物及其微生物合成系统 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 微生物系统 | 倍半萜醇生物合成途径 | 制药, 食品, 化妆品 |
| 878 | 2026-03-31 |
Assembly of functional microbial ecosystems: from molecular circuits to communities
2024-11-23, FEMS microbiology reviews
IF:10.1Q1
DOI:10.1093/femsre/fuae026
PMID:39496507
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综述 | 本文综述了从分子电路到群落的功能性微生物生态系统组装,包括交叉通讯和正交调控模块,并提出了一个全面的设计-构建-测试-学习框架 | 系统总结了基于不同调控电路协调微生物生态系统的策略,提出了一个更全面的微生物群落组装框架,整合了遗传电路、通讯工具和工程应用 | NA | 解密、模拟或重建微生物群落,以促进基于联盟的应用 | 微生物生态系统,包括微生物群落及其相互作用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 交叉通讯和正交调控模块,涉及代谢物、转录、翻译和翻译后水平 | 工业生物技术, 环境, 农业, 医学 |
| 879 | 2026-03-31 |
Engineered Platforms for Maturing Pluripotent Stem Cell-Derived Liver Cells for Disease Modeling
2023, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2023.01.013
PMID:36738860
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综述 | 本文综述了用于促进多能干细胞来源肝细胞成熟以进行疾病建模的工程化平台的设计、特征及应用 | 系统总结了多种先进技术(如蛋白质微图案化、3D生物打印、微流控装置和合成生物学)在提升肝细胞样细胞成熟度方面的创新应用 | 未提供具体实验数据验证各平台效果,主要基于现有文献进行归纳分析 | 开发更成熟的人类肝细胞体外模型,用于疾病机制研究、药物开发和细胞治疗 | 人多能干细胞(包括诱导多能干细胞和胚胎干细胞)分化产生的肝细胞样细胞 | 合成生物学与组织工程 | 肝脏疾病(包括病毒性肝炎、脂肪肝、疟疾、单基因疾病和药物性肝损伤等) | 蛋白质微图案化、3D生物打印、微流控技术、合成生物学 | NA | NA | NA | 合成生物学工具(未具体说明) | 人类多能干细胞 | 通过遗传修饰加速和增强肝细胞样细胞成熟的合成生物学回路 | 医学(疾病建模、药物开发、细胞治疗) |
| 880 | 2026-03-30 |
A Rapid, High-Throughput Method for the Construction of Mutagenesis Libraries
2025-10-25, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom15111511
PMID:41301429
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研究论文 | 本文开发了一种基于芯片寡核苷酸合成的高通量、精确控制突变库构建方法,用于大规模功能筛选 | 利用芯片寡核苷酸合成技术实现高通量、精确控制的突变库构建,突变覆盖率达93.75%,并评估了多种聚合酶以优化文库质量 | 未映射读数的分析揭示了寡核苷酸合成错误和嵌合序列形成等技术因素,需改进PCR条件和加强寡核苷酸合成质量控制 | 开发一种高效、可扩展、精确控制的突变库构建策略,以支持高通量功能研究 | 以模型系统构建全长度琥珀密码子扫描突变库 | 合成生物学 | NA | 芯片寡核苷酸合成、PCR、突变库构建 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术 |