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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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861 | 2025-05-24 |
Evolution of interorganismal strigolactone biosynthesis in seed plants
2025-Jan-17, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.adp0779
PMID:39818909
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research paper | 该研究探讨了种子植物中跨生物体独脚金内酯(SLs)的生物合成进化 | 揭示了CYP722A在非经典SLs生物合成中的关键作用,并提出了16-OH-CLA作为经典SLs进化中的代谢中间体 | 未涉及所有种子植物种类,可能无法全面代表SLs的进化路径 | 研究独脚金内酯的生物合成进化及其功能分化 | 种子植物中的独脚金内酯及其生物合成酶 | 植物分子生物学 | NA | 合成生物学 | NA | 生化数据 | 多种开花植物的地上部分 |
862 | 2025-05-23 |
Advances in metabolic engineering for enhanced acetyl-CoA availability in yeast
2025-Jun, Critical reviews in biotechnology
IF:8.1Q1
DOI:10.1080/07388551.2024.2399542
PMID:39266266
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review | 本文总结了酵母中乙酰辅酶A及其衍生物生物合成途径和代谢工程方法的最新进展 | 强调了通过代谢工程策略调控乙酰辅酶A合成以创建更有效的微生物细胞工厂的新见解 | NA | 提高酵母中乙酰辅酶A的可用性以促进其衍生物的高效合成 | 酵母中的乙酰辅酶A及其衍生物 | 合成生物学 | NA | 代谢工程 | NA | NA | NA |
863 | 2025-05-23 |
Astaxanthin biosynthesis for functional food development and space missions
2025-Jun, Critical reviews in biotechnology
IF:8.1Q1
DOI:10.1080/07388551.2024.2410364
PMID:39428346
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review | 本文综述了虾青素(AXT)的生物合成及其在功能性食品开发和太空任务中的应用 | 探讨了合成生物学和细胞工厂策略在虾青素工业生产中的应用,并提出了其在太空探索中的潜在用途 | 未提及具体实验数据或案例研究来支持合成生物学策略的有效性 | 研究虾青素的生物合成及其在工业和太空任务中的应用 | 虾青素(AXT)及其在不同底盘生物中的表达 | 合成生物学 | 心血管疾病 | 合成生物学、基因工程 | NA | NA | NA |
864 | 2025-05-23 |
Perturbation-response analysis of in silico metabolic dynamics revealed hard-coded responsiveness in the cofactors and network sparsity
2025-May-20, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.98800
PMID:40390360
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研究论文 | 通过计算机模拟分析细菌代谢动力学对外部扰动的响应,揭示了代谢网络中辅因子和网络稀疏性的硬编码响应特性 | 发现三种不同动力学模型在非线性状态下对扰动表现出一致的强响应,并识别出腺苷辅因子和网络结构是影响代谢系统响应性的关键因素 | 研究基于计算机模拟,需要进一步实验验证 | 发展定量稳态理论,理解生化系统在扰动下的动力学特性 | 细菌中心碳代谢的动力学模型 | 计算系统生物学 | NA | 动力学模型模拟 | 非线性动力学模型 | 计算机模拟数据 | 三种不同的动力学模型 |
865 | 2025-05-23 |
Targeted high-level production of chuangxinmycin and its halogenated derivatives with antitubercular activity
2025-May-19, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-025-02740-x
PMID:40390016
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研究论文 | 该研究通过合成生物学技术实现了创新霉素及其卤化衍生物的高效定向生产,并评估了其抗结核活性 | 首次通过生物合成而非化学合成获得创新霉素衍生物,并首次报道卤化去甲创新霉素衍生物,实现了实验室水平的最高产量 | 未提及临床前或临床试验数据,活性测试仅限于体外实验 | 开发新型抗结核药物候选物 | 创新霉素及其衍生物 | 合成生物学 | 结核病 | 异源表达、激活子过表达、启动子优化、发酵培养基筛选、HR-MS、HR-MS/MS、NMR | NA | 化学分析数据、生物活性数据 | 11种卤化创新霉素衍生物(其中6种纯化鉴定) |
866 | 2025-05-23 |
Synthetic Biology-Based Engineering Cells for Drug Delivery
2025-Apr, Exploration (Beijing, China)
DOI:10.1002/EXP.20240095
PMID:40395752
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综述 | 本文综述了基于合成生物学的工程细胞在药物递送中的新兴应用 | 探讨了合成生物学与纳米技术在药物递送中的前沿融合,强调了工程细胞的模块化、标准化和智能化发展趋势 | 未提及具体实验数据或临床验证结果 | 推动先进药物递送系统的构建 | 合成生物学工程细胞 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、纳米技术 | NA | NA | NA |
867 | 2025-05-23 |
Synthetic biology design principles enable efficient bioproduction of Heparosan with low molecular weight and low polydispersion index for the biomedical industry
2025, Synthetic biology (Oxford, England)
DOI:10.1093/synbio/ysaf006
PMID:40396182
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研究论文 | 本文提出了一种利用合成生物学原理精确控制细菌中肝素糖生物合成的新方法,旨在生产低分子量和低分散指数的肝素糖 | 设计了一种生物分子控制器,通过生物传感器检测肝素糖前体,精确调控肝素糖生物合成过程 | NA | 开发一种能够精确控制肝素糖生物合成的方法,以生产具有特定性能的肝素糖材料 | 肝素糖的生物合成过程 | 合成生物学 | NA | 合成生物学设计原理 | NA | NA | NA |
868 | 2025-05-23 |
Oriented triplex DNA as a synthetic receptor for transmembrane signal transduction
2024-11-12, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-53960-5
PMID:39532841
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研究论文 | 本文介绍了一种使用定向胆固醇标记的三链DNA作为合成受体,通过H介导的构象变化实现跨膜信号转导的人工信号转导系统 | 利用三链DNA的构象变化模拟天然G蛋白偶联受体的功能动态,实现了跨膜信号转导的多功能应用 | NA | 开发合成生物学中跨膜信号转导的人工系统 | 胆固醇标记的三链DNA和脂质双层膜 | 合成生物学 | NA | 荧光共振能量转移(FRET)、选择性光裂解、催化信号放大 | NA | NA | NA |
869 | 2025-05-22 |
Transcriptomic functional characterization of recombinant adeno-associated virus producing cell line adapted to suspension-growth
2025-May-21, Biotechnology progress
IF:2.5Q3
DOI:10.1002/btpr.70042
PMID:40396307
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研究论文 | 本文通过合成生物学方法生成适应悬浮生长的HEK293细胞系,用于重组腺相关病毒(rAAV)的可扩展生产 | 开发了能够在无血清悬浮培养基中生长的GX6Bs细胞系,并研究了其转录组变化对rAAV产量的影响 | 悬浮培养的GX6Bs细胞病毒滴度显著降低,即使恢复贴壁培养条件,产量也只能恢复到GX6B的25%-50% | 开发可扩展的rAAV生产技术 | 重组腺相关病毒(rAAV)生产细胞系 | 合成生物学 | NA | 转录组分析 | NA | 转录组数据 | GX6B和GX6Bs细胞系 |
870 | 2025-05-22 |
The Advancement of Peptides Derived From Kitasatospora
2025-May, Chemistry & biodiversity
IF:2.3Q3
DOI:10.1002/cbdv.202402999
PMID:39737746
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综述 | 本文综述了Kitasatospora来源的肽类天然产物的研究进展,包括两种研究策略及其相关酶学和生物合成知识 | 提出了基于Kitasatospora的两种肽类天然产物研究策略,并总结了相关生物合成酶的最新发现 | 未提及具体实验数据或案例研究的局限性 | 探讨Kitasatospora来源的肽类天然产物的研究方法和生物合成机制 | Kitasatospora属放线菌及其产生的肽类天然产物 | 天然产物化学 | NA | 基因组分析、生物信息学工具、序列相似性网络构建 | NA | 基因组数据、酶学数据 | NA |
871 | 2025-05-22 |
Hydrogels as promising platforms for engineered living bacteria-mediated therapeutic systems
2022-Dec, Materials today. Bio
DOI:10.1016/j.mtbio.2022.100435
PMID:36164505
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综述 | 本文综述了水凝胶作为工程化活菌介导治疗系统的平台设计策略及其在不同疾病治疗中的最新进展 | 探讨了水凝胶在活菌治疗中的创新应用,包括其可调节的物理化学性质、良好的生物活性以及对不稳定载荷的优异保护能力 | 讨论了当前水凝胶基活菌治疗策略面临的挑战和未来发展的局限性 | 旨在总结水凝胶在工程化活菌介导治疗系统中的应用及其在多种疾病治疗中的潜力 | 工程化活菌和水凝胶作为治疗系统的平台 | 生物医学工程 | 消化系统健康、皮肤真菌感染、伤口愈合、疫苗、癌症 | NA | NA | NA | NA |
872 | 2025-05-21 |
Microbial secondary metabolites: advancements to accelerate discovery towards application
2025-Jun, Nature reviews. Microbiology
DOI:10.1038/s41579-024-01141-y
PMID:39824928
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review | 本文综述了微生物次级代谢产物的研究进展及其在人类健康和农业等领域的应用潜力 | 探讨了基因组测序技术揭示的次级代谢产物生物合成能力的新领域,以及预测工具和分子生物学技术在发现新代谢物和理解生物合成酶学中的应用 | NA | 加速发现微生物次级代谢产物的新生物化学、功能和应用 | 微生物次级代谢产物及其生物合成基因簇(BGCs) | 生物技术 | NA | 基因组测序、生物合成基因簇预测工具、分子生物学和合成生物学工具 | NA | 基因组数据、代谢物数据 | NA |
873 | 2025-05-21 |
Integrated metabolome and transcriptome analyses revealed key cytochrome P450 genes involved in the biosynthesis of oleanane-type saponins in Hedera helix L
2025-Jun, Plant physiology and biochemistry : PPB
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.plaphy.2025.109818
PMID:40147328
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研究论文 | 本研究通过整合代谢组和转录组分析,揭示了常春藤中参与齐墩果烷型皂苷生物合成的关键细胞色素P450基因 | 首次鉴定了常春藤中参与齐墩果烷型三萜骨架修饰的CYP450基因,并验证了其功能 | 研究仅聚焦于CYP450基因在齐墩果烷型三萜生物合成中的功能,未涉及其他代谢途径 | 解析常春藤中齐墩果烷型皂苷的生物合成途径 | 常春藤(Hedera helix L.)及其代谢产物 | 植物代谢工程 | NA | 转录组测序、代谢组分析、RT-qPCR、体外和体内功能验证 | NA | 基因表达数据、代谢物数据 | NA |
874 | 2025-05-21 |
A generalizable approach for programming protease-responsive conformationally inhibited artificial transcriptional factors
2025-May-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-59828-6
PMID:40382329
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research paper | 本文提出了一种蛋白酶响应性构象抑制系统(PRCIS),用于设计可编程的人工转录因子(ATF)以构建正交和可组合的转录调控工具 | 通过分子内连接将ATF的自由DNA结合域与受限二聚化区域相连,实现转录结合的构象失活,并在蛋白酶切割连接后恢复DNA结合功能 | NA | 开发一种通用的蛋白酶响应性构象抑制系统,用于合成生物学中的基因调控 | 人工转录因子(ATF)和蛋白酶 | 合成生物学 | NA | 蛋白酶响应性构象抑制系统(PRCIS) | NA | NA | NA |
875 | 2025-05-21 |
Transforming non-conventional yeasts into key players in biotechnology: advances in synthetic biology applications
2025, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2025.1600187
PMID:40384783
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review | 本文综述了非传统酵母在合成生物学应用中的最新进展,重点关注新的遗传构建块、基因组编辑工具和代谢途径工程的发展 | 利用合成生物学技术开发新的遗传构建块、基因组编辑工具和代谢途径工程,以充分挖掘非传统酵母的生物技术潜力 | 非传统酵母的潜力尚未被充分探索,存在技术挑战和应用限制 | 探讨非传统酵母在生物技术中的应用潜力及其在可持续生物制造中的角色 | 非传统酵母 | 合成生物学 | NA | 基因组编辑、代谢途径工程 | NA | NA | NA |
876 | 2025-05-21 |
New-to-nature CO2-dependent acetyl-CoA assimilation enabled by an engineered B12-dependent acyl-CoA mutase
2024-11-26, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-53762-9
PMID:39592584
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研究论文 | 本研究开发了一种新型的Lcm模块,实现了乙酰辅酶A到丙酮酸的高效转化,并在过程中固定CO2而非释放 | 开发了一种新型的Lcm模块,首次实现了乙酰辅酶A到丙酮酸的直接转化,并在过程中固定CO2,而非释放 | 目前仅进行了体外验证,尚未在体内大规模应用中验证其效果 | 开发一种新型的乙酰辅酶A同化途径,以提高碳利用效率 | 乙酰辅酶A和丙酮酸的代谢途径 | 合成生物学 | NA | 定向超突变和适应性进化 | NA | NA | NA |
877 | 2025-05-21 |
The de novo design and synthesis of yeast chromosome XIII facilitates investigations on aging
2024-11-22, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-54130-3
PMID:39578428
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research paper | 该研究通过设计和合成酵母染色体XIII,探索了其在衰老研究中的应用 | 成功构建了884 Kb的合成酵母染色体XIII,并利用SCRaMbLE系统获得20个寿命延长的菌株,揭示了rRNA相关转录因子RRN9上调对寿命的积极影响 | 研究主要基于酵母模型,结果在高等生物中的适用性尚待验证 | 研究酵母衰老的分子机制 | 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae) | 合成生物学 | NA | SCRaMbLE系统 | NA | 基因组数据、转录组数据 | 20个SCRaMbLEd synXIII菌株 |
878 | 2025-05-20 |
Ultrasound-responsive mammalian cell synthetic biology
2025-May-16, IEEE transactions on ultrasonics, ferroelectrics, and frequency control
DOI:10.1109/TUFFC.2025.3570813
PMID:40378033
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综述 | 本文综述了超声遗传学在合成生物学中的最新进展及其作为非侵入性精确控制细胞和分子过程工具的潜力 | 结合超声波与基因工程效应器,克服了组织穿透性和侵入性的限制,扩展了超声在生物系统中的应用 | 参数标准化和基础机制理解方面的挑战 | 探讨超声遗传学在研究和治疗应用中的潜力 | 哺乳动物细胞和分子过程 | 合成生物学 | NA | 超声波、基因工程、声学造影剂(如微泡和气体囊泡) | NA | NA | NA |
879 | 2025-05-20 |
Self-authenticating genomic materials in Escherichia coli via advanced genome signatures
2025-May-16, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-08171-z
PMID:40379889
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研究论文 | 介绍了一种名为'基因组签名'的生物化学稳定且防篡改的DNA标记系统,用于创建自我认证的基因组 | 利用Golomb-ruler衍生的Genome-Comb技术,显著提高了错误纠正和数据编码能力,能够在活体大肠杆菌中记录450万核苷酸的基因组 | NA | 提高合成基因组材料的真实性和完整性,以促进科学知识的进步和生物安全性的增强 | 大肠杆菌的基因组 | 合成生物学 | NA | Genome Signature技术 | NA | DNA序列数据 | 450万核苷酸的基因组 |
880 | 2025-05-20 |
Combinatorial metabolic engineering of Yarrowia lipolytica for high-level production of the plant-derived diterpenoid sclareol
2025-May-16, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-025-02744-7
PMID:40380140
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研究论文 | 通过组合代谢工程改造Yarrowia lipolytica,实现植物源二萜醇sclareol的高效生产 | 通过整合LPPS和SCS基因、优化蛋白融合与多拷贝基因整合、增强GGPP前体供应及调控甲羟戊酸途径,显著提高了sclareol产量 | 研究仅在摇瓶条件下进行,未涉及大规模发酵验证 | 开发可持续的sclareol微生物合成方法 | Yarrowia lipolytica酵母菌株 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、基因整合与过表达 | NA | NA | NA |