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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 881 | 2026-06-10 |
Microalgae-Based Semiartificial Photosynthesis: Strategies, Applications, and Future Prospects
2026-Jun-09, Environmental science & technology
IF:10.8Q1
DOI:10.1021/acs.est.6c01166
PMID:42203637
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综述 | 综述微藻基半人工光合作用系统的策略、应用与未来前景 | 通过将活体藻细胞与工程化非生物组件结合,无需体外重建光合作用,系统性地优化光子利用、电子传递、二氧化碳浓度和环境鲁棒性 | 生物-非生物界面的能量耦合、缺乏标准化性能指标、长期稳定性不足以及纳米材料的可持续性问题 | 探讨微藻基半人工光合系统在太阳能燃料生产、生物制造、环境修复和生物混合微机器人等领域的应用及未来发展方向 | 微藻光合作用与半人工光合系统 | 数字生物学 | NA | 半人工光合作用 | NA | NA | NA | NA | 微藻 | NA | 能源, 环境, 工业生物技术 |
| 882 | 2026-06-10 |
The impact of fertilization on the health of paddy soil: pathways and prospects for fertility regulation based on microbial communities
2026-Jun-09, Crop health
DOI:10.1007/s44297-026-00078-3
PMID:42262665
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综述 | 本文综述了施肥对水稻土健康的影响,并从微生物群落角度探讨了培育肥力的途径与前景 | 揭示了水稻土厌氧环境下有机质周转缓慢及土壤有机碳稳定的独特机制,并提出了基于合成生物学、材料工程和数据驱动智能决策系统的未来研究方向 | 缺乏对施肥阈值与微生物群落动态关系的定量分析,且未涵盖不同水稻种植系统的实证数据 | 探讨施肥对水稻土肥力和微生物群落的影响,以及通过微生物介导的碳固存机制实现智能绿色高产水稻种植的途径 | 水稻土中的微生物群落及土壤有机碳动态 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学, 材料工程, 智能决策系统 | 水稻 | NA | 农业, 环境 |
| 883 | 2026-06-10 |
Engineered Bacteria as living detectors of tumor DNA: A new diagnostic frontier
2026-Apr-15, Clinica chimica acta; international journal of clinical chemistry
DOI:10.1016/j.cca.2026.120914
PMID:41724454
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综述 | 探讨工程改造细菌作为活体传感器直接检测肿瘤DNA的最新进展 | 利用自然感受态和水平基因转移结合CRISPR-Cas工具,使工程菌能区分肿瘤与野生型DNA并产生可观测的报道输出 | 存在生物安全性、定植效率和检测灵敏度限制等问题 | 开发用于临床癌症诊断的工程细菌生物传感器及其与治疗递送系统的整合 | 肿瘤DNA、KRAS突变、工程改造细菌(多种细菌物种)、结直肠癌和胃肠癌等实体肿瘤 | 合成生物学 | 癌症(结直肠癌、胃肠癌等) | CRISPR-Cas系统、同源重组、多重CRISPR系统、安全回路 | NA | DNA序列 | 包括体外检测、类器官模型、小鼠模型和非侵入性粪便样本 | CRISPR-Cas9, TALEN | 多种细菌物种(如大肠杆菌等) | 遗传回路、逻辑门、生物传感器、安全回路 | 医学 |
| 884 | 2026-06-10 |
Systems-level understanding of plant immune networks through single-cell and spatial omics
2026-Apr, Current opinion in plant biology
IF:8.3Q1
DOI:10.1016/j.pbi.2026.102870
PMID:41719893
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综述 | 从系统层面对植物免疫网络进行整合性概述,涵盖受体激活、基因调控回路、蛋白互作中心和染色质动力学如何共同影响免疫结果 | 整合了单细胞和空间组学揭示的免疫激活异质性,并讨论了系统和合成生物学方法在作物持久广谱抗病工程中的应用前景 | 未提及具体的实验验证或技术局限性 | 综合理解植物免疫网络中的受体激活、基因调控、蛋白互作和染色质动力学如何影响免疫结果 | 植物免疫网络中的传感器NLR、帮助者NLR、PRIMER细胞、旁观者细胞等 | 机器学习 | 植物病害 | 单细胞组学、空间组学、蛋白质组学、互作组学 | NA | 单细胞转录组、空间转录组、蛋白质组、染色质数据 | NA | NA | 作物 | NA | 农业 |
| 885 | 2026-06-10 |
Super-enhancer-mediated transcriptional regulation of gene clusters in plants
2026-Apr, Current opinion in plant biology
IF:8.3Q1
DOI:10.1016/j.pbi.2026.102871
PMID:41719895
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综述 | 探讨超级增强子在植物基因簇转录调控中的核心作用 | 揭示了超级增强子通过拓扑关联域协调同源基因簇和生物合成基因簇中基因共表达的机制,并指出其可通过染色质可及性数据预测 | 主要基于拟南芥研究,对其他植物物种的普遍性仍需验证 | 阐明植物中超级增强子调控基因簇共表达的机制及其在合成生物学和作物改良中的应用潜力 | 植物同源基因簇和生物合成基因簇中的基因表达调控 | 分子生物学 | NA | CRISPR-Cas, T-DNA插入, 染色质可及性测序 | NA | 染色质可及性数据 | NA | CRISPR-Cas9, T-DNA插入 | 拟南芥 | 超级增强子调控的基因簇共表达回路 | 合成生物学, 代谢工程, 作物改良 |
| 886 | 2026-06-10 |
Engineered E. coli Nissle 1917 Depletes Branched-Chain Amino Acids to Suppress Colorectal Tumorigenesis
2026-Mar-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00804
PMID:41712535
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研究论文 | 工程化大肠杆菌Nissle 1917通过消耗支链氨基酸抑制结直肠肿瘤发生 | 利用合成生物学方法工程化益生菌,通过靶向支链氨基酸分解代谢来抑制结直肠癌进展,提供了一种新的癌症治疗策略 | 研究仅在AOM/DSS诱导的CRC小鼠模型和氨基酸饮食条件下进行,缺乏在人体中的验证 | 探究工程化益生菌通过消耗肠道支链氨基酸抑制结直肠癌的作用机制 | 工程化的大肠杆菌Nissle 1917菌株(ECN-Deg和ECN-Tra)以及AOM/DSS诱导的结直肠癌小鼠模型 | 合成生物学 | 结直肠癌 | NA | NA | NA | 使用AOM/DSS诱导的结直肠癌小鼠模型,具体样本数量未提及 | NA | 大肠杆菌 Nissle 1917 | 支链氨基酸分解代谢通路 | 医学 |
| 887 | 2026-06-10 |
Green Biosynthesis of Terpenoid-Derived Flavor and Fragrance Compounds: Advances and Strategic Perspectives
2026-Mar-04, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c08719
PMID:41718042
|
综述 | 系统总结了利用绿色生物合成方法生产萜类来源的香精香料化合物的最新进展与战略前景 | 聚焦低成本底物和微生物细胞工厂的宿主选择,并系统论述酶改造、动态途径调控、细胞区室化和提高萜类耐受性等关键工程策略 | NA | 为萜类化合物的可持续生产提供关键见解和指导方针 | 萜类及其衍生物 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 微生物(多种宿主菌株) | 微生物细胞工厂中的萜类生物合成途径 | 食品,日化用品 |
| 888 | 2026-06-09 |
Leveraging the bacteria for enhanced cancer immunotherapy: from a perspective of synthetic biology
2026-Dec-31, Cancer biology & therapy
IF:4.4Q2
DOI:10.1080/15384047.2026.2683171
PMID:42240055
|
review | 综述了合成生物学在细菌介导的癌症免疫治疗中的最新进展,重点介绍工程细菌如何激活免疫系统及实现肿瘤靶向的策略 | 系统总结了利用合成生物学改造细菌以表达免疫治疗剂、增强肿瘤靶向性及直接递送治疗载荷的创新策略,并探讨了缺氧响应启动子、细菌群集运动和细胞外囊泡等前沿技术 | 未提及该领域的未来挑战或当前研究的局限性 | 回顾合成生物学在细菌癌症免疫治疗中的研究进展,聚焦免疫激活机制与工程策略 | 工程化细菌作为癌症免疫治疗剂 | 合成生物学 | 癌症 | NA | NA | NA | NA | NA | 细菌 | 表达免疫治疗剂的合成回路、缺氧响应启动子、细菌群集运动工程 | 医学 |
| 889 | 2026-06-09 |
Bacterial conjugation and its deployment for diverse biotechnology applications
2026-Sep, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108894
PMID:41956307
|
review | 综述细菌接合在合成生物学中的应用,包括基因回路传递、代谢工程、微生物底盘识别和生物修复等 | 系统阐述了接合机制在合成生物学中的重新利用,以及结合多种合成生物学策略扩展研究空间的新方法 | 未讨论接合传递的效率限制及潜在的生物安全问题 | 总结细菌接合在合成生物学中的最新进展,并为研究人员提供利用接合传递的实用指南 | 细菌接合系统及其在合成生物学中的应用 | 合成生物学 | NA | 细菌接合 | NA | NA | NA | 接合系统 | 多种微生物(供体菌和靶标菌) | 遗传回路、代谢通路 | 生物技术, 环境修复, 微生物工程 |
| 890 | 2026-06-09 |
Random mutagenesis platform for accelerated genome evolution (RAMPAGE) of Pichia pastoris
2026-Sep, Engineering microbiology
DOI:10.1016/j.engmic.2026.100269
PMID:42256413
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研究论文 | 开发了一种用于毕赤酵母的随机诱变加速基因组进化平台RAMPAGE | 首次建立适用于毕赤酵母的连续全基因组进化平台,实现高效表型进化并揭示耐受性相关基因 | NA | 开发加速毕赤酵母基因组进化的随机诱变平台,提升其在极端工业条件下的适应性 | 毕赤酵母菌株 | 合成生物学 | NA | 全基因组重测序 | NA | 基因组序列 | 经进化筛选的毕赤酵母菌株 | 随机诱变 | 毕赤酵母 | 连续基因组进化系统 | 工业生物技术 |
| 891 | 2026-06-09 |
Integrative frameworks for plastic biodegradation in insect-microbiome systems: mechanistic insights, emerging multi-omics and enzyme engineering perspectives
2026-Jun-08, Biodegradation
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s10532-026-10316-8
PMID:42257753
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综述 | 该综述整合了昆虫-微生物组系统中塑料生物降解的机制、多组学和酶工程研究进展 | 通过分析宿主与肠道微生物的协同作用,提出了昆虫幼虫中塑料降解的多步骤模型,并总结了酶工程与合成生物学策略的潜在应用 | 多组学数据主要提供相关性证据,特定酶功能的直接实验验证仍然有限 | 理解昆虫-微生物组系统中塑料降解的复杂机制,并指导酶基可持续塑料废物管理策略的开发 | 昆虫幼虫(如蜡螟)及其肠道微生物组 | 环境科学、合成生物学 | NA | 多组学(宏基因组学、宏转录组学、代谢组学)、酶工程、合成生物学 | NA | NA | NA | 酶工程、合成生物学 | 昆虫幼虫(蜡螟科等) | 多步降解通路(包括机械破碎、氧化修饰、微生物解聚和中间代谢处理) | 环境、工业生物技术 |
| 892 | 2026-06-09 |
Insights into the Fucoidan and Mannitol Biosynthetic Pathways in the Brown Seaweed Padina Tetrastromatica Based on Draft Genome and Transcriptome Analysis
2026-Jun-04, Marine biotechnology (New York, N.Y.)
DOI:10.1007/s10126-026-10649-8
PMID:42240916
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研究论文 | 本研究通过基因组和转录组分析揭示了褐藻Padina tetrastromatica中岩藻多糖和甘露醇生物合成途径 | 首次对P. tetrastromatica进行互补基因组和转录组组装,鉴定了参与岩藻多糖和甘露醇生物合成的关键酶编码基因,为褐藻功能性糖类代谢提供了分子框架 | 基因组覆盖度不足20%,限制了完整基因组的获取 | 阐明褐藻中岩藻多糖和甘露醇的生物合成分子机制,为未来代谢工程和合成生物学应用奠定基础 | 褐藻Padina tetrastromatica | 生物信息学 | NA | NGS, 转录组测序, 基因组组装 | NA | 基因组序列, 转录本序列 | 单个褐藻样本(Padina tetrastromatica) | NA | NA | NA | 工业生物技术, 合成生物学 |
| 893 | 2026-06-09 |
Unlocking plant abiotic stress resilience through biostimulants and omics-driven innovations
2026-Jun, Journal of integrative plant biology
IF:9.3Q1
DOI:10.1111/jipb.70205
PMID:41782210
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综述 | 探讨生物刺激素与组学驱动创新在提升植物非生物胁迫适应性中的作用 | 整合生物刺激素技术、小RNA、肽和激素作为新兴分子调节因子,以及AI驱动的早期预警系统,为合理设计生物刺激素提供路线图 | 未明确讨论生物刺激素在实际应用中的规模化挑战或潜在生态影响 | 阐明生物刺激素增强植物非生物胁迫耐受性的机制,并构建气候适应性农业的路线图 | 植物(作物)及其对干旱、温度、盐分、涝渍和重金属等胁迫的响应 | 计算机视觉 | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 | 植物 | 生物刺激素代谢途径设计 | 农业 |
| 894 | 2026-06-09 |
A yeast-based platform for etoposide production via yatein bioconversion
2026-Jun, Metabolic engineering communications
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.mec.2026.e00280
PMID:42255528
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研究论文 | 建立基于酵母的依托泊苷生产平台,通过亚铁素生物转化实现可持续生产 | 首次在酵母中重构完整的亚铁素到(-)-4'-去甲基表鬼臼毒素的异源途径,结合途径重构、基因拷贝数优化和辅酶匹配性改造,并成功将生物生产与下游半合成转化衔接 | 依赖植物资源提供前体亚铁素,且酵母生产效率和规模化仍需进一步优化 | 开发依托泊苷中间体的可持续生物制造路径,替代传统植物提取方法 | 酿酒酵母细胞工厂、鬼臼类植物中的亚铁素前体 | 合成生物学 | 固体肿瘤、血液恶性肿瘤 | 途径重构、基因拷贝数优化、辅酶匹配性改造、发酵工程 | NA | NA | NA | NA | 酿酒酵母 | 亚铁素到(-)-4'-去甲基表鬼臼毒素的异源代谢途径 | 医药 |
| 895 | 2026-06-09 |
Protein coacervation-driven active forces power protocell dynamics
2026-Apr-07, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-71593-8
PMID:41946707
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研究论文 | 开发一种温度响应的弹性蛋白原细胞模型,展示蛋白质凝聚驱动的主动力生成及力学放大机制 | 首次证明蛋白质凝聚物可以独立于ATP驱动马达产生主动力,并通过交联弹性蛋白膜放大皮牛级力量以实现大规模机械工作 | 未明确讨论模型在生物体内环境中的稳定性和长期应用潜力 | 探索蛋白质液-液相分离凝聚物作为主动力发生器的力学协调与缩放机制 | 温度响应的弹性蛋白原细胞模型中的蛋白质凝聚动力学 | 合成生物学 | NA | 液-液相分离、弹性蛋白交联 | 数学模型 | 实验数据与模拟数据 | NA | NA | NA | 温度调控收缩性与力捕获的蛋白质凝聚回路 | 合成生物学、生物材料、下一代软体机器人 |
| 896 | 2026-06-09 |
Application of Biotechnology in Marine-Derived Fermented Foods: Technological Evolution and Future Prospects
2026-03, Comprehensive reviews in food science and food safety
IF:12.0Q1
DOI:10.1111/1541-4337.70422
PMID:41693674
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综述 | 综述现代生物技术在海洋源发酵食品中的应用,包括技术演进和未来展望 | 系统总结了微生物组学、多组学分析、合成生物学、基因组编辑、精准发酵、测序技术和智能发酵控制等现代生物技术在海洋发酵食品中的研究轨迹和应用进展,并比较了新型生物技术与传统发酵技术的差异 | 讨论了生物技术在海洋源发酵食品中应用的挑战和局限性 | 评估现代生物技术在海洋源发酵食品风味和品质精准调控、营养价值定向提升及安全性改善方面的关键作用 | 海洋源发酵食品(包括鱼类、甲壳类、贝类和大型藻类等海洋生物资源) | 机器学习 | NA | 微生物组学、多组学分析、合成生物学、基因组编辑、精准发酵、测序技术、智能发酵控制 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly | 鱼类、甲壳类、贝类、大型藻类 | 代谢通路、生物传感器 | 食品、工业生物技术 |
| 897 | 2026-06-08 |
Recent advances and challenges in the biomanufacturing of L-homoserine as a versatile C4 platform chemical
2026-Sep, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108880
PMID:41921584
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综述 | 综述L-高丝氨酸作为通用C4平台化学品在生物制造中的最新进展与挑战 | 系统整合了L-高丝氨酸细胞工厂的代谢工程策略,并总结了其高价值衍生物的生物合成途径,强调L-高丝氨酸多功能化平台的应用潜力 | 目前缺乏涵盖整合代谢工程策略的系统性综述 | 总结构建高效L-高丝氨酸细胞工厂的进展,讨论技术障碍与新兴机遇,为开发稳健的微生物制造平台提供战略路线图 | L-高丝氨酸及其下游衍生物 | 合成生物学 | NA | 代谢工程 | NA | NA | NA | NA | 大肠杆菌, 谷氨酸棒杆菌 | L-高丝氨酸生物合成途径 | 工业生物技术 |
| 898 | 2026-06-08 |
From modular engineering to practical applications: Advances in GPCR-based yeast biosensors
2026-Sep, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108909
PMID:42035967
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综述 | 系统梳理了基于GPCR的酵母生物传感器从模块化工程到实际应用的研究进展 | 通过模块化框架分析传感、转导和输出核心模块的工程策略,并强调人工智能与合成生物学整合的未来方向 | 未明确讨论当前传感器在复杂环境中的稳定性和可重复性限制 | 总结GPCR酵母生物传感器的工程优化方法及应用扩展 | 基于GPCR的酵母生物传感器 | 合成生物学 | 不适用 | GPCR信号转导 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 酿酒酵母 | 模块化传感器电路(传感模块-GPCRs、转导模块-酵母信号网络、输出模块-报告系统) | 医学、环境、农业、工业生物技术 |
| 899 | 2026-06-08 |
Biological valorization of non-food feedstocks: A critical review
2026-Sep, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108918
PMID:42128207
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综述 | 全面评述非食物原料的生物转化,涵盖原料特性、转化路径、废物升级及技术经济评估 | 系统梳理非食物原料特性与生物转化途径间的机制联系,并整合合成生物学和多组学驱动的前沿转化技术与废物升级策略 | 未详细讨论不同转化路线在工业放大中的具体工程障碍 | 阐明非食物原料生物转化的挑战与进展,为可持续生物炼制提供战略指导 | 非食物原料(如木质纤维素、有机废弃物等)及其生物转化系统 | 工业生物技术 | NA | 厌氧消化、堆肥、合成生物学驱动发酵、多组学分析 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick | E. coli, S. cerevisiae, B. subtilis, 哺乳动物细胞, 植物 | 代谢途径工程、逻辑门、生物传感器 | 环境, 能源, 材料, 食品, 工业生物技术 |
| 900 | 2026-06-08 |
Genetic toolbox development for engineering Bacteroides and other bacterial species
2026-Apr, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2026.102709
PMID:41643388
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综述 | 介绍非模式细菌物种合成生物学工具箱的开发策略,重点以拟杆菌属为例 | 系统总结了针对非模式共生菌和益生菌的基因工程工具开发方法,填补了该领域系统性指导的空白 | 未提供具体实验验证数据,主要基于文献总结和策略建议 | 为跨学科研究人员开发非模式细菌的遗传操作工具提供方法论框架 | 非模式细菌菌株,特别是拟杆菌属 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 拟杆菌属、大肠杆菌、非模式细菌 | NA | 医学 |