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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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881 | 2024-11-11 |
Chemical Communication between Giant Vesicles and Gated Nanoparticles for Strip-Based Sensing
2024-Nov-06, Nano letters
IF:9.6Q1
DOI:10.1021/acs.nanolett.4c04022
PMID:39442006
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研究论文 | 本文展示了如何利用微纳米颗粒之间的化学通信来设计传感系统 | 首次将巨型单层囊泡和门控介孔纳米颗粒结合,用于基于试纸条的传感系统,并展示了信号放大和在实际样本中的应用 | NA | 开发基于微纳米颗粒化学通信的传感系统 | 巨型单层囊泡和门控介孔纳米颗粒 | 纳米技术 | NA | NA | NA | NA | NA |
882 | 2024-11-11 |
The elimination of two restriction enzyme genes allows for electroporation-based transformation and CRISPR-Cas9-based base editing in the non-competent Gram-negative bacterium Acinetobacter sp. Tol 5
2024-06-18, Applied and environmental microbiology
IF:3.9Q2
DOI:10.1128/aem.00400-24
PMID:38722179
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研究论文 | 本研究通过删除两种限制性酶基因,实现了非竞争性革兰氏阴性菌Acinetobacter sp. Tol 5的电穿孔转化和CRISPR-Cas9基础编辑 | 首次在Acinetobacter sp. Tol 5中实现了高效的电穿孔转化和CRISPR-Cas9基础编辑,为环境分离菌的基因改造提供了新策略 | NA | 开发环境分离菌Acinetobacter sp. Tol 5的基因改造方法,以促进其在合成生物学中的应用 | Acinetobacter sp. Tol 5菌株及其基因改造 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9基础编辑 | NA | DNA | NA |
883 | 2024-11-11 |
Trading acyls and swapping sugars: metabolic innovations in Solanum trichomes
2024-Mar-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.06.05.542877
PMID:37333341
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研究论文 | 研究了茄科植物毛状体中特殊的代谢产物——保护性酰基糖的多样性和进化 | 发现了八种具有肌醇或肌醇糖苷核心和羟基酰基链的不寻常结构,并鉴定了一种功能上分化的AcylSugar AcylTransferase 3-Like 1酶 | 仅分析了茄科植物中一小部分物种的酰基糖多样性 | 深入了解茄科植物中酰基糖的化学多样性及其进化和功能 | 茄科植物中的酰基糖及其相关的AcylTransferase酶 | NA | NA | 液相色谱-质谱分析 | NA | 代谢物 | 31个茄科植物物种 |
884 | 2024-11-10 |
Synthetic Biology-Driven Microbial Therapeutics for Disease Treatment
2024-Oct-28, Journal of microbiology and biotechnology
IF:2.5Q3
DOI:10.4014/jmb.2407.07004
PMID:39233526
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综述 | 本文综述了合成生物学驱动的微生物疗法在疾病治疗中的应用 | 利用合成生物学技术,通过基因编码的生物传感器和动态调控工具,设计微生物疗法,实现精准靶向和调控,提高治疗效果和安全性 | NA | 探讨合成生物学驱动的微生物疗法在多种疾病治疗中的创新策略和最新进展 | 微生物疗法在胃肠道疾病、癌症、代谢疾病、感染和其他疾病中的应用 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
885 | 2024-11-10 |
Omic-driven strategies to unveil microbiome potential for biodegradation of plastics: a review
2024-Oct-21, Archives of microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00203-024-04165-3
PMID:39432094
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综述 | 本文综述了基于组学的策略在揭示微生物群落降解塑料潜力方面的应用 | 本文探讨了组学技术在塑料降解研究中的应用,并讨论了基于组学方法在识别新型塑料降解微生物、酶和代谢途径方面的关键发现、挑战和未来前景 | NA | 探讨组学技术在塑料降解研究中的应用,并讨论未来的发展方向 | 微生物群落与塑料的相互关系,以及参与塑料降解过程的基因和酶的作用 | 生物技术 | NA | 组学技术(基因组学、转录组学和蛋白质组学) | NA | NA | NA |
886 | 2024-11-09 |
Elucidating the metabolic roles of isoflavone synthase-mediated protein-protein interactions in yeast
2024-Oct-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.24.620109
PMID:39484494
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研究论文 | 本文通过酵母合成生物学方法,研究了大豆来源的异黄酮合酶(GmIFS2)与其他酶在异黄酮代谢中的蛋白质-蛋白质相互作用(PPIs)的代谢作用 | 开发了一种酵母合成生物学方法来阐明异黄酮合酶介导的蛋白质-蛋白质相互作用在异黄酮代谢中的作用,并鉴定了两种新的异黄酮甲基转移酶 | NA | 阐明异黄酮合酶介导的蛋白质-蛋白质相互作用在酵母中的代谢作用 | 大豆来源的异黄酮合酶(GmIFS2)与其他酶在异黄酮代谢中的蛋白质-蛋白质相互作用 | 代谢生物学 | NA | 酵母合成生物学 | NA | NA | NA |
887 | 2024-11-09 |
Bioorthogonal Reactions in Bioimaging
2024-Feb-24, Topics in current chemistry (Cham)
DOI:10.1007/s41061-024-00452-1
PMID:38400853
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研究论文 | 本文讨论了生物正交化学工具在生物成像中的最新进展,特别是荧光探针设计和标记方案在细胞内/体内多色和/或超分辨率成像中的应用 | 本文介绍了生物正交化学工具与合成生物学方法的智能结合,以及新型探针设计在超分辨率显微镜中的应用 | NA | 探讨生物正交化学工具在生物成像中的应用,特别是荧光探针设计和标记方案的最新进展 | 生物分子在原生环境中的可视化以及更复杂的生物分子过程的成像辅助理解 | 生物化学 | NA | 生物正交化学 | NA | NA | NA |
888 | 2024-11-09 |
Glucuronidated Flavonoids in Neurological Protection: Structural Analysis and Approaches for Chemical and Biological Synthesis
2017-Sep-06, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.7b02633
PMID:28789524
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研究论文 | 本文探讨了植物和哺乳动物细胞中葡萄糖醛酸转移酶催化黄酮类等多酚类物质的葡萄糖醛酸化过程,并介绍了葡萄糖醛酸化黄酮类化合物的结构分析和化学生物合成方法 | 本文介绍了葡萄糖醛酸化黄酮类化合物的最新分析和合成方法,包括标准有机合成、半合成、酶合成和利用异源酶在微生物平台生物中的合成生物学方法 | 许多这些化合物在商业上不可获得 | 研究植物提取物如何影响认知健康和心理弹性的机制 | 葡萄糖醛酸化黄酮类化合物及其在神经保护中的作用 | NA | NA | 葡萄糖醛酸转移酶 | NA | NA | NA |
889 | 2024-11-09 |
Bottom-up construction of in vitro switchable memories
2012-Nov-20, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.1212069109
PMID:23112180
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研究论文 | 本文通过基于基本DNA生物化学的动态反应网络的合理组装,再现了细胞中用于长期记忆存储的双稳态反应网络功能 | 本文提出了一种在体外构建简化动态模拟的方法,而不是像合成生物学那样在体内重构基因系统 | NA | 研究动态反应网络中的拓扑/功能关系 | 体外可切换记忆的构建 | NA | NA | DNA生物化学 | NA | NA | NA |
890 | 2024-11-08 |
Decoding biology with massively parallel reporter assays and machine learning
2024-Oct-16, Genes & development
IF:7.5Q1
DOI:10.1101/gad.351800.124
PMID:39362779
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综述 | 本文综述了大规模并行报告基因分析(MPRA)与机器学习结合在解码基因表达调控中的应用 | 结合MPRA和机器学习模型,能够量化序列变异对基因表达的影响,并预测训练数据集外的序列 | NA | 探讨MPRA与机器学习在基因表达调控中的应用 | 基因表达调控中的序列变异 | 机器学习 | NA | 大规模并行报告基因分析(MPRA) | 机器学习模型 | 序列数据 | NA |
891 | 2024-11-08 |
Microbial Therapeutics in Oncology: A Comprehensive Review of Bacterial Role in Cancer Treatment
2024-Oct, Cureus
DOI:10.7759/cureus.70920
PMID:39502977
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综述 | 本文综述了细菌在癌症治疗中的潜在应用 | 探讨了细菌疗法在癌症治疗中的独特优势,如选择性靶向和定植于肿瘤的缺氧和坏死区域 | 讨论了细菌疗法面临的挑战,如安全性问题、免疫逃避和精确靶向的需求 | 旨在全面回顾细菌在癌症治疗中的作用,并探讨其潜在机制和临床应用 | 细菌疗法在癌症治疗中的应用及其机制 | NA | 癌症 | 基因工程和合成生物学 | NA | NA | NA |
892 | 2024-11-07 |
Photodynamic therapy: An emerging therapeutic modality in dentistry
2024-Nov-15, Bioorganic & medicinal chemistry
IF:3.3Q1
DOI:10.1016/j.bmc.2024.117962
PMID:39442490
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综述 | 本文综述了光动力疗法(PDT)在牙科中的应用及其原理 | PDT具有选择性靶向、广谱抗菌效果、无耐药性发展及其与其他治疗方法的协同效应等独特优势 | PDT面临光敏剂输送、光穿透、氧气可用性及标准化协议需求等挑战 | 探讨PDT在牙科中的应用及其未来发展前景 | 牙周病、根管治疗、口腔癌、牙种植和龋齿等牙科疾病 | NA | 口腔癌 | 光动力疗法(PDT) | NA | NA | NA |
893 | 2024-11-07 |
A size filter at the Golgi regulates apical membrane protein sorting
2024-Oct, Nature cell biology
IF:17.3Q1
DOI:10.1038/s41556-024-01500-0
PMID:39237743
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研究论文 | 研究探讨了高尔基体中的尺寸过滤器如何调控顶膜蛋白的分类 | 首次揭示了高尔基体中的尺寸过滤器对具有小细胞质尾部的顶膜蛋白分类的促进作用 | 研究仅限于Crb3、Ace2和Muc1三种代表性顶膜蛋白,可能无法全面代表所有顶膜蛋白的情况 | 探究顶膜蛋白在高尔基体中的分类机制 | Crb3、Ace2和Muc1三种顶膜蛋白及其细胞质尾部 | NA | NA | 合成生物学方法 | NA | 蛋白质 | 三种代表性顶膜蛋白 |
894 | 2024-11-07 |
Assessing the transcriptional landscape of Pseudomonas phage 201ϕ2-1: Uncovering the small regulatory details of a giant phage
2024-10, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.70037
PMID:39460739
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研究论文 | 研究了巨型噬菌体201ϕ2-1的转录组结构,揭示了其调控机制 | 发现了201ϕ2-1中高度保守的小RNA,并重新分类了其宿主基因组 | NA | 深入理解噬菌体-宿主感染过程及其在噬菌体工程和生物技术应用中的重要性 | 巨型噬菌体201ϕ2-1及其宿主Pseudomonas atacamensis | NA | NA | ONT-cappable-sequencing | NA | RNA序列 | 67个启动子和132个终止子,代表92个转录单元 |
895 | 2024-11-07 |
Red-Shifting B12-Dependent Photoreceptor Protein via Optical Coupling for Inducible Living Materials
2024-Sep-06, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202411105
PMID:39239776
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研究论文 | 本文介绍了一种通过光学耦合将B12依赖性光感受蛋白CarH的光响应从绿光转移到红/远红光的通用策略 | 通过硫醇-马来酰亚胺点击化学将含有半胱氨酸的CarH突变体标记为捕获红光的荧光团SulfoCyanine5 (Cy5),从而使光感受蛋白获得对红光的敏感性 | NA | 开发一种新的方法来扩展B12依赖性光感受蛋白在光遗传学和活体材料中的应用 | B12依赖性光感受蛋白CarH及其在活体材料中的应用 | 生物材料合成 | NA | 硫醇-马来酰亚胺点击化学 | NA | 蛋白质 | 涉及酵母细胞的基因工程改造 |
896 | 2024-11-07 |
Whispering-Gallery Mode Optoplasmonic Microcavities: From Advanced Single-Molecule Sensors and Microlasers to Applications in Synthetic Biology
2024-Mar-20, ACS photonics
IF:6.5Q1
DOI:10.1021/acsphotonics.3c01570
PMID:38523742
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研究论文 | 本文探讨了光子等离子体微腔在单分子传感、酶热力学和动力学研究、热光子等离子体传感以及合成生物学中的应用 | 引入等离子体纳米棒增强WGM微腔的倏逝场,实现单分子级别的检测 | NA | 探讨光子等离子体WGM传感在单分子检测和合成生物学中的应用前景 | 单分子蛋白质、构象变化和原子离子 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
897 | 2024-11-07 |
Cell reprogramming design by transfer learning of functional transcriptional networks
2024-Mar-07, ArXiv
PMID:38495570
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研究论文 | 本文开发了一种基于转录组数据的迁移学习方法,用于控制细胞行为并设计新的疾病治疗方法 | 通过预训练的转录组数据生成功能网络动力学模型,并将其迁移到特定的重编程目标,创新性地结合了基因扰动的转录反应来最小化初始状态和目标状态之间的转录差异 | 研究主要基于已有的微阵列和RNA测序数据,未涉及实际的细胞实验 | 开发一种基于迁移学习的方法,用于理性设计基于基因扰动和药物反应的新疾病治疗方法 | 人类细胞命运相关的转录组数据和基因扰动反应 | 机器学习 | NA | 迁移学习 | NA | 转录组数据 | 超过9,000个微阵列数据和10,000个RNA测序数据,涵盖54种细胞类型和227种独特扰动 |
898 | 2024-11-07 |
Biofuser: a multi-source data fusion platform for fusing the data of fermentation process devices
2024, Frontiers in digital health
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fdgth.2024.1390622
PMID:39498098
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研究论文 | 介绍了一个名为Biofuser的多源数据融合平台,用于整合发酵过程设备的异构数据 | 开发了一个多源数据融合平台Biofuser,能够整合不同来源和格式的发酵过程数据,并支持数据可视化、模型构建和自动过程控制 | 未提及具体的技术局限性 | 提高发酵过程优化技术的效率,促进合成生物学成果的工业化 | 发酵过程设备产生的多源异构数据 | 生物工程 | NA | 数据融合 | NA | 多源异构数据 | 未提及具体样本数量 |
899 | 2024-11-06 |
Development of a green Komagataella phaffii cell factory for sustainable production of plant-derived sesquiterpene (-)-α-bisabolol
2025, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2024.09.006
PMID:39493337
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研究论文 | 研究开发了一种绿色酵母细胞工厂,用于可持续生产植物来源的倍半萜(-)-α-红没药醇 | 通过plmDCA算法设计了(-)-α-红没药醇合成酶BOS的六个突变位点,其中F324Y突变表现出优异性能,产品产量提高了73% | NA | 开发可持续生产植物来源倍半萜(-)-α-红没药醇的酵母细胞工厂 | (-)-α-红没药醇的合成酶BOS及其突变体 | 生物工程 | NA | 合成生物学策略 | NA | NA | NA |
900 | 2024-11-06 |
CRISPR/Cas12a-based genome editing for cyanophage of Anabeana sp
2025, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2024.09.011
PMID:39493338
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研究论文 | 开发了一种基于CRISPR/Cas12a的简便方法,用于高效编辑蓝细菌噬菌体基因组 | 首次成功应用CRISPR/Cas12a技术编辑蓝细菌噬菌体基因组,并生成了具有不同抑制蓝细菌生长能力的突变体 | 研究仅限于特定蓝细菌噬菌体和基因,未涵盖所有蓝细菌噬菌体种类 | 开发一种高效的方法来编辑蓝细菌噬菌体基因组,以控制蓝细菌水华 | 蓝细菌噬菌体A-1(L)和A-4(L)的基因组 | 基因编辑 | NA | CRISPR/Cas12a | NA | 基因组 | 两个蓝细菌噬菌体A-1(L)和A-4(L) |