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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 881 | 2025-10-05 |
Living Fiber Dispersions from Mycelium as a New Sustainable Platform for Advanced Materials
2025-Jun, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202418464
PMID:39998258
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研究论文 | 提出一种从菌丝体生成活纤维分散体的可持续方法,结合生物聚合物纤维的材料形成特性和活材料的高度动态特性 | 首次开发出结合生物聚合物纤维优异材料形成特性和活材料动态特性的活纤维分散体平台 | NA | 开发可持续的先进智能材料制造平台 | 菌丝体活纤维分散体 | 材料科学 | NA | 液体培养、机械解纤 | NA | 材料性能数据 | NA | 合成生物学 | 菌丝体 | NA | 材料,工业生物技术 |
| 882 | 2025-10-05 |
Redesigning and rethinking genetic circuits: the potential of transcriptional rewiring in filamentous fungi
2025-Jun, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2025.103301
PMID:40179610
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综述 | 探讨丝状真菌中基因调控网络操作工具及其在转录重编程和代谢工程中的应用潜力 | 系统阐述丝状真菌中响应物理信号(光/温度)的顺式元件应用,实现前所未有的时空精准基因表达控制 | NA | 探索丝状真菌基因调控网络重编程在合成生物学中的潜力 | 丝状真菌(以粗糙脉孢菌为例)的基因调控网络 | 合成生物学 | NA | 转录重编程、启动子工程、模块化工具包 | NA | NA | NA | NA | 丝状真菌, 粗糙脉孢菌 | 生物传感器、代谢通路、昼夜节律振荡器 | 工业生物技术, 基础研究 |
| 883 | 2025-10-05 |
Catalytic mechanism and engineering of aromatic prenyltransferase: A review
2025-Jun, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.144214
PMID:40379159
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综述 | 系统总结芳香异戊二烯基转移酶的催化机制与工程化研究进展 | 提出整合人工智能和深度学习的创新工程方法开发高性能生物催化剂 | 催化活性欠佳、底物特异性窄、多酶级联系统和固定化技术存在局限 | 指导芳香异戊二烯基转移酶在合成生物学和药物创新中的工程化与规模化应用 | 芳香异戊二烯基转移酶及其催化的异戊二烯化反应 | 合成生物学 | NA | 蛋白质工程、异源表达、人工智能、深度学习 | NA | NA | NA | NA | 多种微生物宿主 | NA | 工业生物技术, 医药 |
| 884 | 2025-10-05 |
Protocol for the generation and purification of minicells from Lactiplantibacillus plantarum
2025-May, Journal of microbiology (Seoul, Korea)
DOI:10.71150/jm.2412002
PMID:40468658
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研究论文 | 本文开发了从植物乳杆菌生成和纯化微细胞的实验方案 | 首次在植物乳杆菌中通过删除minD基因成功构建微细胞生产平台,拓展了微细胞技术在非模式益生菌中的应用 | NA | 建立从益生菌植物乳杆菌生产微细胞的技术方案 | 植物乳杆菌微细胞 | 合成生物学 | NA | 质粒介导的同源重组、差异离心、过滤、药物处理、显微镜检查、流式细胞术 | NA | NA | NA | 同源重组 | 植物乳杆菌 | 通过删除minD基因破坏细胞分裂形成球形微细胞 | 医药 |
| 885 | 2025-10-05 |
Plant-based secondary metabolites as natural remedies: a comprehensive review on terpenes and their therapeutic applications
2025, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2025.1587215
PMID:40458805
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综述 | 本文全面综述了植物来源的萜类化合物及其治疗应用 | 系统阐述萜类化合物的生物化学特性、植物化学性质及其在代谢疾病中的药理活性 | 对特定生物活性物质的作用机制理解尚不完整 | 阐明萜类化合物在代谢疾病中的生物化学特性和药理活性 | 植物来源的萜类化合物 | 天然产物研究 | 代谢疾病 | 代谢工程、合成生物学 | NA | 文献数据 | NA | NA | NA | NA | 医药、化妆品、营养保健品 |
| 886 | 2025-10-05 |
Rewiring native post-transcriptional global regulators to achieve designer, multi-layered genetic circuits
2024-10-09, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-52976-1
PMID:39384772
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研究论文 | 通过重编程大肠杆菌碳储存调控网络,开发了可实现复杂转录后控制的多层遗传电路 | 利用天然Csr网络相互作用构建转录后逻辑门,实现了在三种工业相关细菌中的跨物种移植 | NA | 开发可编程的转录后调控工具以实现复杂细菌调控 | 大肠杆菌碳储存调控网络及其在工业细菌中的应用 | 合成生物学 | NA | RNA-蛋白质相互作用工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌 | 缓冲门、非门、双向调节器、布尔逻辑门(或门、或非门、与门、与非门)和脉冲发生电路 | 工业生物技术 |
| 887 | 2025-10-05 |
A single mutation in the core domain of the lac repressor reduces leakiness
2013-Jul-08, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/1475-2859-12-67
PMID:23834731
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研究论文 | 通过单点突变改造lac阻遏蛋白核心结构域,显著降低其泄漏表达 | 首次发现色氨酸220位点突变为苯丙氨酸可产生泄漏表达降低10倍的功能性阻遏蛋白 | NA | 开发泄漏表达更低的lac阻遏蛋白变体用于合成生物学应用 | lac阻遏蛋白及其W220F突变体 | 合成生物学 | NA | 饱和突变、热位移分析、GFP荧光检测 | NA | 蛋白质表达数据、细胞活力数据 | NA | 定点突变 | 大肠杆菌 | lac操纵子调控系统、蛋白质表达开关 | 工业生物技术、医学 |
| 888 | 2025-10-05 |
Super-robust synthetic microorganism can get chlorine resistance in advance and transfer their inserted DNA sequence in genome to indigenous bacteria in water
2025-Aug-01, Water research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.watres.2025.123594
PMID:40188791
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研究论文 | 本研究揭示了基因编辑超级鲁棒合成微生物在水环境中能够转移基因组插入序列给本土细菌并表现出更强的氯抗性 | 首次发现超级鲁棒合成微生物能将基因组插入DNA序列转移给水体本土细菌,并阐明其通过减少细胞膜损伤、维持呼吸活性和DNA修复系统来获得氯抗性的机制 | 研究主要关注表面水环境,未涉及其他环境介质或长期生态影响评估 | 探究超级鲁棒合成微生物在水环境中的归趋及其对人类健康的环境风险 | 基因编辑超级鲁棒合成微生物和水中本土细菌 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas基因编辑 | NA | 实验数据 | NA | CRISPR-Cas | 合成微生物 | 基因组插入序列 | 环境 |
| 889 | 2025-10-05 |
Bridging chemistry and biology for light-driven new-to-nature enantioselective photoenzymatic catalysis
2025-Jun-03, Chemical Society reviews
IF:40.4Q1
DOI:10.1039/d4cs00561a
PMID:40351234
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教程综述 | 本文系统介绍光驱动酶催化这一新兴交叉领域,重点阐述其对非天然对映选择性反应的应用前景 | 融合光激发的高反应性与生物催化的卓越选择性,开创非天然酶促反应新范式 | 未涉及具体实验数据验证,主要进行理论框架梳理 | 推动可持续不对称合成发展 | 光酶催化反应体系 | 合成生物学 | NA | 酶工程、光催化 | NA | 文献综述 | NA | 酶工程 | NA | NA | 工业生物技术 |
| 890 | 2025-10-05 |
Fusions of Catalytically Inactive RusA to FokI Nuclease Coupled with PNA Enable Programmable Site-Specific Double-Stranded DNA Breaks
2025-May-27, ACS omega
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsomega.4c11282
PMID:40454070
|
研究论文 | 开发了一种结合PNA序列特异性结合能力和FokI核酸酶催化效率的PC-FIRA系统,用于实现程序化位点特异性DNA双链断裂 | 将催化失活的RusA与FokI核酸酶融合,并与PNA偶联,克服了现有位点特异性核酸酶的引导依赖性和脱靶效应限制 | 需要优化反应条件(温度、缓冲液组成、离子浓度和切割时间)并进行适用性验证 | 开发新型程序化位点特异性DNA双链断裂系统 | DNA分子(包括Holliday连接体、线性和环状DNA) | 合成生物学 | NA | PNA(肽核酸)技术、核酸酶融合技术 | NA | 分子生物学实验数据 | 多种DNA结构测试 | PNA, FokI核酸酶, RusA解离酶 | NA | NA | 生物技术, 医学, 农业, 合成生物学 |
| 891 | 2025-10-05 |
Developing a multi-modular assembled prime editing (mPE) system improved precise multi-base insertion efficiency in dicots
2025-May, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2024.06.021
PMID:38942381
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研究论文 | 开发了一种多模块组装型Prime Editing系统,显著提高了双子叶植物中精确多碱基插入的编辑效率 | 首次在双子叶植物中开发了多模块组装型Prime Editing系统,相比原始PE2系统编辑效率提升1.3-1288.5倍,特别在多碱基插入方面平均提升197.9倍 | 研究主要局限于模式植物拟南芥和本氏烟草,尚未在其他双子叶植物中验证 | 解决Prime Editing在双子叶植物中编辑效率低的问题,开发系统性改进方案 | 双子叶模式植物拟南芥和本氏烟草 | 植物合成生物学 | NA | Prime Editing, 农杆菌介导转化, 深度扩增子测序 | NA | 基因组测序数据 | 大规模转化实验,测序数据量20-50万条clean reads | CRISPR-Cas9, Prime Editing | 拟南芥, 本氏烟草 | 多模块组装型Prime Editing系统,采用pol II策略表达pegRNA,将PE系统拆分为多个模块 | 农业, 植物育种 |
| 892 | 2025-10-05 |
Exploring potential biosafety implications in DNA information storage
2025-Apr, Biosafety and health
IF:3.5Q1
DOI:10.1016/j.bsheal.2025.03.006
PMID:40453469
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研究论文 | 本研究评估了五种DNA信息存储编码方法在生物安全方面的潜在风险 | 首次系统评估DNA信息存储编码方法与自然生物DNA序列的相似性,揭示不同编码方法产生的生物安全风险差异 | 仅分析了五种代表性编码方法,未涵盖所有DNA存储编码策略 | 评估DNA信息存储技术的生物安全风险 | 五种DNA存储编码方法(Church、Goldman、DNA Fountain、Grass和MT编码)产生的序列 | 合成生物学 | NA | Kraken2分类分析、BLASTn比对分析 | NA | DNA序列数据 | 五种编码方法产生的代表性DNA序列 | NA | NA | NA | 数据存储 |
| 893 | 2025-10-05 |
A cell-free biosensor signal amplification circuit with polymerase strand recycling
2025-Jun, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/s41589-024-01816-w
PMID:39806069
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研究论文 | 开发了一种基于聚合酶链回收(PSR)的无细胞生物传感器信号放大电路 | 利用T7 RNA聚合酶脱靶转录在DNA链置换电路中回收核酸输入,实现了高特异性等温扩增 | NA | 扩展无细胞生物传感能力,提高生物传感器灵敏度 | 核酸靶标和小分子检测 | 合成生物学 | NA | DNA链置换,等温扩增,转录因子- DNA/配体结合双平衡模型 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 无细胞系统 | 聚合酶链回收(PSR)电路,变构转录因子生物传感器接口电路 | 生物技术 |
| 894 | 2025-06-03 |
Correction to "Synthetic Biology-Based Bacterial Extracellular Vesicles Displaying BMP-2 and CXCR4 to Ameliorate Osteoporosis"
2025-Jun, Journal of extracellular vesicles
IF:15.5Q1
DOI:10.1002/jev2.70095
PMID:40452467
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 895 | 2025-10-05 |
Regulatory Components for Bacterial Cell-Free Systems Engineering
2024-12-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00574
PMID:39509282
|
综述 | 本文全面概述了细菌无细胞系统中使用的天然和工程化调控组件及其应用 | 系统总结了无细胞系统中调控组件的功能复杂性增长需求,涵盖天然和工程化两类调控组件 | NA | 为细菌无细胞系统工程提供调控组件的全面概述 | 细菌无细胞系统中的调控组件 | 合成生物学 | NA | 无细胞系统 | NA | NA | NA | NA | 细菌 | 调控网络、基因电路 | 诊断工具开发、代谢工程 |
| 896 | 2025-10-05 |
Modulating Microbial Materials - Engineering Bacterial Cellulose with Synthetic Biology
2024-12-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00615
PMID:39509658
|
综述 | 探讨合成生物学如何推动细菌纤维素基生物材料的发展及其在工程活性材料中的应用 | 将合成生物学与细菌纤维素材料相结合,开发具有编程生物功能的新型工程活性材料 | NA | 研究合成生物学在细菌纤维素材料工程化中的应用潜力 | 细菌纤维素及其衍生的工程活性材料 | 合成生物学 | NA | 3D生物打印 | NA | NA | NA | NA | 细菌 | 生物传感器、响应系统 | 生物医学, 材料科学, 工业生物技术 |
| 897 | 2025-10-05 |
Engineering an αCD206-synNotch Receptor: Insights into the Development of Novel Synthetic Receptors
2024-12-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00149
PMID:39555579
|
研究论文 | 本研究开发了一种靶向CD206巨噬细胞的αCD206-synNotch合成受体,用于研究肿瘤微环境中癌细胞与巨噬细胞的相互作用 | 首次开发了专门靶向CD206巨噬细胞的synNotch合成受体,为研究肿瘤转移过程中的细胞间相互作用提供了新工具 | 研究中发现了该受体应用中的意外限制和注意事项 | 开发新型合成受体以研究巨噬细胞与癌细胞在肿瘤转移过程中的相互作用机制 | CD206巨噬细胞、癌细胞、小鼠转移模型 | 合成生物学 | 肿瘤转移 | synNotch受体工程、哺乳动物合成生物学 | NA | NA | NA | synNotch | 哺乳动物细胞 | 合成受体、生物传感器 | 医学 |
| 898 | 2025-10-05 |
Red Light Responsive Cre Recombinase for Bacterial Optogenetics
2024-12-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00388
PMID:39558834
|
研究论文 | 开发了一种红光诱导的Cre重组酶系统OptoCre-REDMAP,用于细菌光遗传学应用 | 首次将植物光感受器PhyA和FHY1与分裂Cre重组酶结合,创建红光响应系统,实现与蓝光系统的正交控制 | NA | 开发红光响应的光遗传学工具,改善光控基因表达的波长选择性和组织穿透性 | 细菌基因表达控制系统 | 合成生物学 | NA | 光遗传学,基因工程 | NA | NA | NA | Cre重组酶,分裂蛋白系统 | 细菌 | 红光诱导基因表达系统,DNA切除控制 | 工业生物技术 |
| 899 | 2025-10-05 |
Effect of Translation-Enhancing Nascent SKIK Peptide on the Arrest Peptides Containing Consecutive Proline
2024-12-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00221
PMID:39573840
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研究论文 | 本研究揭示了翻译增强型SKIK肽标签能够有效缓解由连续脯氨酸残基组成的核糖体阻滞肽引起的翻译停滞现象 | 首次发现SKIK肽标签与翻译延伸因子P在缓解连续脯氨酸富集蛋白的核糖体停滞中具有协同促进作用,并证明其位置邻近性对缓解效果的关键影响 | 研究主要关注特定类型的阻滞肽(WPPP和SecM AP),对其他类型阻滞肽的效果尚未验证 | 探究SKIK肽标签对核糖体阻滞肽引起的翻译停滞的缓解机制及其在蛋白质生产优化中的应用 | 含有连续脯氨酸残基的核糖体阻滞肽(SecM AP和WPPP)及其对翻译过程的影响 | 合成生物学 | NA | PURE无细胞蛋白质合成系统、体外翻译反应、动力学分析 | NA | 蛋白质产量数据、荧光蛋白表达数据、动力学数据 | 使用超折叠绿色荧光蛋白作为报告基因进行体外翻译反应分析 | NA | NA | NA | 工业生物技术 |
| 900 | 2025-10-05 |
Genetically Modifying the Protein Matrix of Macroscopic Living Materials to Control Their Structure and Rheological Properties
2024-12-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00336
PMID:39601053
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研究论文 | 本研究通过改变工程活材料中弹性蛋白样多肽的长度,探索其对材料微观结构和粘弹性行为的影响 | 首次系统研究弹性蛋白样多肽长度变化对工程活材料序列-结构-性能关系的影响,揭示了基因序列微调可显著改变材料流变特性的新设计原理 | 研究结果与其他生物复合材料模型缺乏可比性,序列-结构-性能关系较为复杂 | 阐明工程活材料的序列-结构-性能关系,探索基因序列调控对材料性能的影响 | 基于工程菌的厘米级工程活材料及其蛋白基质 | 合成生物学 | NA | 合成生物学方法 | NA | 材料性能数据、显微结构数据 | 三种不同ELP长度的工程活材料变体 | 合成生物学方法 | 工程菌 | 弹性蛋白样多肽(ELP)蛋白基质工程 | 材料 |