合成生物学相关文章
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当前共找到 3795 篇文献，本页显示第 901 - 920 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 901 | 2025-10-05 |
Engineered Stop and Go T7 RNA Polymerases
2024-12-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00627
PMID:39610115
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研究论文 | 本研究开发了可通过吲哚调控的T7 RNA聚合酶变体，实现精确的转录控制 | 首次实现了全长单亚基T7 RNA聚合酶通过内源性代谢物吲哚的严格调控，创建了新型化学诱导'停走'平台 | NA | 开发受内源性代谢物调控的精确酶活性控制系统 | T7 RNA聚合酶及其变体 | 合成生物学 | NA | 理性设计、定向进化 | NA | NA | NA | 定向进化 | 细菌 | 配体激活核酸聚合酶(LARPs)，化学诱导停走平台 | 工业生物技术 |
| 902 | 2025-10-05 |
Biosynthesis of Antimicrobial Ornithine-Containing Lacticin 481 Analogues by Use of a Combinatorial Biosynthetic Pathway in Escherichia coli
2024-12-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00650
PMID:39660664
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研究论文 | 本研究在大肠杆菌中构建组合生物合成途径，成功生产含鸟氨酸的乳酸素481类似物并评估其抗菌活性 | 利用具有宽松底物特异性的SyncM修饰酶和新型肽精氨酸酶OspR，首次在乳酸素481中同时引入鸟氨酸和(甲基)羊毛硫氨酸修饰 | 特定位点的羊毛硫氨酸和甲基羊毛硫氨酸形成可能会阻碍鸟氨酸的掺入 | 开发合成生物学策略以增强抗菌肽的化学和功能多样性 | 乳酸素481及其含鸟氨酸的类似物 | 合成生物学 | 细菌感染 | 组合生物合成、酶催化修饰 | NA | 生物活性数据 | 使用单指示菌株进行抗菌活性评估 | Gibson Assembly, iGEM | 大肠杆菌 | 组合生物合成途径，包含杂交前导肽设计、酶催化修饰系统 | 医药 |
| 903 | 2025-10-05 |
De Novo Production of the Bioactive Phenylpropanoid Artepillin C Using Membrane-Bound Prenyltransferase in Komagataella phaffii
2024-12-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00472
PMID:39530514
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研究论文 | 本研究利用膜结合异戊烯基转移酶在Komagataella phaffii中实现了生物活性苯丙素类化合物Artepillin C的从头合成 | 首次在Komagataella phaffii中实现Artepillin C的从头合成，通过增强异戊二烯底物途径和优化对香豆酸供应，产量达到目前报道的最高水平 | 对香豆酸供应在工程菌株中仍构成生产瓶颈 | 通过合成生物学方法实现Artepillin C的稳定供应 | Artepillin C生物合成途径 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、分批培养、补料分批培养 | NA | 代谢物分析数据 | NA | 代谢工程 | Komagataella phaffii | Artepillin C生物合成途径，包含对香豆酸特异性双异戊烯基转移酶AcPT1、异戊烯基二磷酸异构酶和截短型HMG-CoA还原酶 | 医药 |
| 904 | 2025-10-05 |
Macroscopic Assembly of Materials with Engineered Bacterial Spores via Coiled-Coil Interaction
2024-11-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00468
PMID:39393788
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研究论文 | 通过工程化细菌孢子的卷曲螺旋相互作用实现宏观材料的组装 | 利用合成生物学方法在孢子表面展示pH响应型自组装蛋白，实现蛋白水平的pH依赖性结合和宏观材料组装 | NA | 设计基于工程化细菌孢子的宏观组装材料 | 工程化细菌孢子及其组装材料 | 合成生物学 | NA | T7驱动表达系统 | NA | NA | NA | T7表达系统 | 细菌孢子 | 表面展示pH响应型自组装蛋白的工程化系统 | 材料 |
| 905 | 2025-10-05 |
Engineering Cyborg Pathogens through Intracellular Hydrogelation
2024-11-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00420
PMID:39413025
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研究论文 | 本研究通过细胞内水凝胶化技术将非复制但代谢活跃的Cyborg细胞方法扩展到病原细菌 | 将细胞内水凝胶化方法从实验室菌株扩展到细菌病原体，创建了新型Cyborg病原体 | 仅研究了特定病原菌株，未探索更广泛的病原体种类 | 开发具有病原特性的非复制但代谢活跃的工程化病原体用于生物医学应用 | 不同菌株的病原细菌 | 合成生物学 | NA | 细胞内水凝胶化、共聚焦显微镜、实时PCR | NA | 显微镜图像、基因表达数据 | 多种病原菌株 | 细胞内水凝胶化 | 病原细菌 | 细胞内水凝胶网络 | 医药 |
| 906 | 2025-10-05 |
Dual-Plasmid Mini-Tn5 System to Stably Integrate Multicopy of Target Genes in Escherichia coli
2024-11-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00140
PMID:39418641
|
研究论文 | 开发了一种使用双质粒mini-Tn5系统在大肠杆菌中稳定整合多拷贝目标基因的方法 | 首次采用双质粒mini-Tn5系统实现目标基因的多拷贝稳定整合，并设计了可移除抗生素抗性基因的标记系统 | 在不同菌株中整合拷贝数存在差异（RecA+菌株19拷贝，RecA-菌株5拷贝） | 开发稳定高效的多拷贝基因整合方法以提高工程微生物代谢产物产量 | 大肠杆菌菌株（MG1655和XL1-Blue MRF'） | 合成生物学 | NA | 基因整合技术 | NA | 分子生物学数据 | 多种大肠杆菌菌株 | mini-Tn5转座子系统, 双质粒系统 | 大肠杆菌 | 多拷贝基因整合系统，包含可移除抗生素抗性基因标记 | 工业生物技术 |
| 907 | 2025-10-05 |
Engineering Yarrowia lipolytica to Produce l-Malic Acid from Glycerol
2024-11-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00445
PMID:39444231
|
研究论文 | 本研究通过代谢工程和实验室进化改造耶氏酵母，使其能够利用甘油高效生产L-苹果酸 | 首次在耶氏酵母中实现L-苹果酸生产，通过过表达内源基因和异源转运蛋白，结合适应性实验室进化提高产量和耐酸性 | NA | 开发耶氏酵母作为L-苹果酸生产的微生物细胞工厂 | 耶氏酵母(Yarrowia lipolytica) | 合成生物学 | NA | 代谢工程，适应性实验室进化 | NA | NA | NA | 基因过表达，适应性进化 | 耶氏酵母(Yarrowia lipolytica) | L-苹果酸生物合成途径，包括乙醛酸循环途径(异柠檬酸裂解酶、苹果酸合酶、苹果酸脱氢酶)和苹果酸转运蛋白 | 食品工业，化学工业，制药工业 |
| 908 | 2025-10-05 |
Application of a Cell-Free Synthetic Biology Platform for the Reconstitution of Teleocidin B and UK-2A Precursor Biosynthetic Pathways
2024-11-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00560
PMID:39469830
|
研究论文 | 本研究利用植物细胞无蛋白合成系统成功重构了teleocidin B和UK-2A前体两种天然产物的生物合成途径 | 首次在无细胞系统中成功重构了结构复杂程度不同的两种天然产物生物合成途径，并发现TleA与MbtH的直接相互作用 | 未明确说明系统产量与体内系统的比较优势以及规模化应用的可行性 | 开发植物细胞无蛋白合成平台用于天然产物生物合成途径的重构与优化 | teleocidin B-3和UK-2二醇两种天然产物及其生物合成途径 | 合成生物学 | NA | 细胞无蛋白合成系统 | NA | NA | NA | BY-2系统, 小麦胚芽CFPS系统 | 烟草BY-2细胞, 小麦胚芽 | teleocidin生物合成途径, UK-2A前体生物合成途径（包含10个蛋白质的复杂途径） | 工业生物技术 |
| 909 | 2025-10-05 |
Balanced Training Sets Improve Deep Learning-Based Prediction of CRISPR sgRNA Activity
2024-11-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00542
PMID:39495623
|
研究论文 | 本研究探讨平衡训练集对基于深度学习的CRISPR sgRNA活性预测性能的影响 | 首次系统比较平衡与不平衡数据集对CRISPR sgRNA活性预测模型性能的影响，并验证通过添加合成sgRNA改善不平衡数据集能提升预测准确度 | 研究主要基于特定CRISPR-Cas系统（Cas12a和Cas9）的数据，可能不适用于其他CRISPR系统 | 提高CRISPR sgRNA活性预测的准确性 | CRISPR系统的sgRNA序列 | 机器学习 | NA | CRISPR-Cas筛选 | CNN, LLM | 序列数据 | 来自酵母和人类细胞的CRISPR筛选数据 | CRISPR-Cas9, CRISPR-Cas12a | 酵母, 人类细胞 | NA | 医学, 工业生物技术 |
| 910 | 2025-10-05 |
Enhancers: A Focus on Synthetic Biology and Correlated Gene Expression
2024-10-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00244
PMID:39276360
|
综述 | 本文聚焦合成生物学方法研究增强子功能及其与基因表达相关性的机制 | 系统阐述合成生物学方法在解析增强子功能机制中的应用，提出局部环境中多基因与增强子相互作用导致基因表达相关性的新观点 | 主要关注合成报告基因研究方法，未深入讨论天然基因组环境的完整复杂性 | 探讨增强子在基因调控中的作用机制及其与基因表达相关性的关系 | 增强子及其调控的基因表达 | 合成生物学 | NA | 合成报告基因分析，高通量报告基因检测 | NA | 基因表达数据 | NA | 合成报告基因构建 | 后生动物细胞 | 基因表达调控系统，增强子-报告基因回路 | 基础生物学研究 |
| 911 | 2025-10-05 |
Rational Design of High-Efficiency Synthetic Small Regulatory RNAs and Their Application in Robust Genetic Circuit Performance Through Tight Control of Leaky Gene Expression
2024-10-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00323
PMID:39294875
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研究论文 | 本研究开发了高效合成小RNA的理性设计策略，并通过其在遗传电路中的应用解决了基因表达泄漏问题 | 通过优化sRNA支架、mRNA结合亲和力、Hfq蛋白表达水平和mRNA二级结构等多个参数，显著提高了合成sRNA的效率 | NA | 开发高效合成小RNA的理性设计策略并应用于遗传电路性能优化 | 合成小RNA和细菌遗传电路 | 合成生物学 | NA | 合成sRNA设计 | 正反馈电路 | NA | NA | 合成sRNA | 细菌 | 正反馈电路，用于控制基因表达泄漏 | 工业生物技术, 代谢工程 |
| 912 | 2025-10-05 |
Modular Cloning Tools for Streptomyces spp. and Application to the De Novo Biosynthesis of Flavokermesic Acid
2024-10-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00412
PMID:39307986
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研究论文 | 本研究开发了适用于链霉菌的模块化克隆工具，并成功应用于黄酮红酸的全新生物合成 | 开发了首个针对链霉菌的模块化克隆系统，包含适配载体和遗传元件，能够构建完整遗传回路 | NA | 开发适用于链霉菌的合成生物学工具，实现多组分基因簇的从头组装 | 链霉菌及其天然产物生物合成途径 | 合成生物学 | NA | 模块化克隆系统、β-葡萄糖醛酸苷酶报告系统 | NA | NA | NA | MoClo | 链霉菌 | 黄酮红酸生物合成途径 | 工业生物技术 |
| 913 | 2025-10-05 |
Efficient Simulation of Viral Transduction and Propagation for Biomanufacturing
2024-10-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00227
PMID:39315883
|
研究论文 | 开发了用于优化病毒转导和扩增生物制造平台的vitraPro软件工具包 | 提出了包含多尺度模型和高效数值技术的软件工具包，可同时模拟两种病毒的感染传播过程 | 模型验证仅限于杆状病毒表达载体系统和甲型流感悬浮培养案例 | 优化基于病毒转导的生物制造平台和病毒扩增过程 | 病毒转导和传播过程 | 合成生物学 | NA | 多尺度建模、数值模拟 | 多尺度模型 | NA | NA | NA | 悬浮培养细胞 | 病毒转导系统、病毒扩增过程 | 工业生物技术 |
| 914 | 2025-10-05 |
An Automated Cell-Free Workflow for Transcription Factor Engineering
2024-10-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00471
PMID:39373325
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研究论文 | 开发了一种自动化无细胞工作流程用于转录因子工程 | 创建了基于Echo声波液体处理器的通用化无细胞基因表达工作流程，可在48小时内完成数千种转录因子变体的高通量筛选 | NA | 优化自动化无细胞基因表达工作流程以加速合成生物学设计周期 | MerR和CadR转录因子变体 | 合成生物学 | NA | 无细胞基因表达(CFE) | NA | 生物传感器响应数据 | 127个MerR变体和134个CadR变体，共3682个无细胞反应 | Echo Acoustic Liquid Handler | 无细胞系统 | 转录因子生物传感器，用于汞和镉检测 | 环境监测 |
| 915 | 2025-10-05 |
Characterizing and Engineering Rhamnose-Inducible Regulatory Systems for Dynamic Control of Metabolic Pathways in Streptomyces
2024-10-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00626
PMID:39377938
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研究论文 | 本研究表征并构建了鼠李糖诱导型调控系统，用于在链霉菌中实现代谢途径的动态控制 | 通过生物信息学分析发现鼠李糖代谢途径，构建了无泄漏表达的鼠李糖诱导型调控系统RhaREG1和RhaREG2 | NA | 开发有效的基因诱导系统用于合成生物技术应用 | 链霉菌属及其天然产物生物合成途径 | 合成生物学 | NA | 生物信息学分析，电泳迁移率变动分析(EMSA)，多序列比对 | NA | 基因组序列，蛋白质序列，启动子活性数据 | NA | 合成生物学策略 | 链霉菌 | 鼠李糖诱导型调控系统，通过将阻遏蛋白/操作子对RhaR/RhaO与组成型启动子组装构建 | 工业生物技术 |
| 916 | 2025-10-05 |
A Synthetic Biology Approach to Transgene Expression in Insects
2024-09-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00250
PMID:39198266
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研究论文 | 开发了一种系统方法来表征转基因翻译起始序列和3'非翻译区的修饰，创建了用于蚊子和昆虫基因表达调控的工具箱 | 通过系统表征TIS和3'UTR修饰，实现了跨细胞系和5'调控序列的高度可预测基因表达变化 | 主要针对蚊子和非模式昆虫物种，在其他昆虫中的应用潜力尚未完全验证 | 开发合成生物学方法调控昆虫中转基因表达水平 | 蚊子和非模式昆虫物种 | 合成生物学 | NA | 转基因技术，基因表达调控 | NA | 基因表达数据 | 多种细胞系 | 转基因方法 | 蚊子，昆虫 | 基因表达调控工具箱，包含翻译起始序列和3'非翻译区修饰 | 农业，环境 |
| 917 | 2025-10-05 |
Computational Synthetic Biology Enabled through JAX: A Showcase
2024-09-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00307
PMID:39230510
|
研究论文 | 本文展示了JAX计算框架在计算合成生物学中的应用价值 | 首次系统展示JAX在计算合成生物学中的多功能应用，包括灵活的GPU扩展、快速运行时间和自动微分等数学增强功能 | JAX在计算生物学领域仍处于探索不足的状态，应用案例有限 | 促进数学建模在合成生物学中的更广泛应用，展示现代计算框架的潜力 | 合成生物学和定向进化中的计算建模问题 | 计算生物学 | NA | 数学建模，GPU加速计算，自动微分 | 机制模型，随机模型，数据驱动模型，AI模型 | 模拟数据 | NA | NA | NA | 基因网络优化，细胞内动力学模拟 | 工业生物技术 |
| 918 | 2025-10-05 |
SeqImprove: Machine-Learning-Assisted Curation of Genetic Circuit Sequence Information
2024-09-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00392
PMID:39230953
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研究论文 | 开发了一种名为SeqImprove的机器学习辅助工具，用于改进遗传电路序列信息的整理过程 | 结合命名实体识别、实体规范化和序列匹配技术，创建了作者可审查编辑的机器可访问序列数据和元数据注释系统 | NA | 解决合成生物学中文献研究和复制记录不完整工作时面临的困难 | 遗传电路序列信息 | 机器学习 | NA | 命名实体识别, 实体规范化, 序列匹配 | NA | 序列数据, 元数据 | NA | NA | NA | 遗传电路 | 工业生物技术 |
| 919 | 2025-10-05 |
Orthogonal Serine Integrases Enable Scalable Gene Storage Cascades in Bacterial Genome
2024-09-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00505
PMID:39238421
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研究论文 | 开发基于正交丝氨酸整合酶的迭代基因组整合方法，实现细菌染色体中多基因的稳定存储 | 首次利用正交丝氨酸整合酶系统实现可扩展的基因存储级联，支持长达13 kb DNA片段的标记自由高效整合 | 未明确说明整合效率的具体量化数据和系统在不同宿主中的普适性验证 | 开发可扩展的基因组整合工具用于合成生物学应用 | 大肠杆菌MG1655菌株 | 合成生物学 | NA | 丝氨酸整合酶介导的基因组整合 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, 工程化整合载体 | 大肠杆菌 | 基因存储级联系统，多基因表达通路 | 工业生物技术, 医学 |
| 920 | 2025-10-05 |
Technologies for the discovery of G protein-coupled receptor-targeting biologics
2024-Jun, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2024.103138
PMID:38728825
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综述 | 本文综述了靶向G蛋白偶联受体的生物制剂发现技术及其发展前景 | 系统总结了最先进的GPCR靶向生物制剂工程技术，并前瞻性地指出DNA合成和合成生物学技术将推动该领域发展 | NA | 回顾GPCR靶向生物制剂发现的技术现状并展望未来发展方向 | G蛋白偶联受体及其靶向生物制剂 | 生物医药技术 | 代谢性疾病、神经系统疾病、心血管疾病 | DNA合成、展示技术、功能筛选 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医药 |