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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 921 | 2025-10-05 |
Transient infrared nanoscopy resolves the millisecond photoswitching dynamics of single lipid vesicles in water
2025-Jul-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-61341-9
PMID:40593745
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研究论文 | 本研究开发了一种无标记瞬态红外纳米显微镜技术,用于解析单个光开关脂质体在水中的毫秒级动态变化 | 首次结合散射型扫描近场光学显微镜的化学识别和高时空分辨率,实现了对单个光开关脂质体的无标记中红外成像和光谱分析 | 方法尚未在更复杂的生物环境中验证,采样时间虽快但仍可能错过某些超快动力学过程 | 开发非破坏性无标记技术研究纳米载体的生物物理化学性质 | 偶氮苯基光开关脂质体形成的单个脂质体 | 纳米光学成像 | NA | 散射型扫描近场光学显微镜,中红外成像和光谱 | NA | 红外光谱图像,动态时间序列数据 | 单个脂质体样品 | NA | NA | NA | 医学,药物递送,纳米诊疗,合成生物学 |
| 922 | 2025-10-05 |
Comprehensive datasets for RNA design, machine learning, and beyond
2025-Jul-01, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-07041-2
PMID:40594473
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研究论文 | 本研究创建了一个包含超过32万实验验证实例的综合性RNA数据集,为RNA设计和建模算法建立了新的社区基准 | 提供了首个来自实验验证来源的大规模标准化RNA设计基准数据集,包含许多对现有RNA逆向折叠工具具有挑战性的结构 | NA | 解决RNA二级结构预测和序列设计中的挑战,推动计算生物学在医学、合成生物学和生物技术领域的应用 | RNA分子及其二级结构 | 计算生物学 | NA | 机器学习 | NA | RNA序列和结构数据 | 超过320,000个实验验证实例 | NA | NA | NA | 医学,合成生物学,生物技术 |
| 923 | 2025-10-05 |
Divergent multifunctional P450s-empowered biosynthesis of bioactive tripterifordin and cryptic atiserenoids in Aconitum implies convergent evolution
2025-Jul-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-61188-0
PMID:40595667
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研究论文 | 本研究通过挖掘乌头属植物转录组发现多个萜类合酶和细胞色素P450单加氧酶,揭示了它们在三萜类化合物生物合成中的多功能催化作用 | 发现了14种功能分化的P450酶,其中8种具有多功能催化特性,能够在支架的七个不同位点进行氧化反应,并揭示了雷公藤甲素在乌头属植物中的趋同生物合成 | NA | 探究乌头属植物中P450酶如何驱动二萜类化合物的结构和功能多样化 | 乌头属植物(Aconitum carmichaelii和Aconitum coreanum)中的萜类合酶和细胞色素P450单加氧酶 | 合成生物学 | NA | 转录组挖掘、功能验证、蛋白质分析、定点突变 | NA | 转录组数据、酶活性数据 | NA | NA | 乌头属植物 | 组合生物合成途径,用于生产雷公藤甲素、冠芙二萜A和14种新型阿替瑟类化合物 | 医药 |
| 924 | 2025-10-05 |
Genetic characteristics of novel extreme alkaline-inducible promoter located in five prime upstream region of peptidyl-prolyl cis/trans isomerase from Vibrio anguillarum
2025-Jul-01, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-98559-y
PMID:40596401
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研究论文 | 本研究鉴定并表征了鳗弧菌NB10中一个新型极端碱性诱导启动子,该启动子能显著增强FK506结合蛋白型肽酰脯氨酰顺反异构酶的表达 | 发现了一个位于鳗弧菌肽酰脯氨酰顺反异构酶五端上游区域的新型极端碱性诱导启动子,在pH 10条件下能实现2.88倍的基因表达上调 | 研究目前仅在大肠杆菌中验证了启动子功能,尚未在原宿主鳗弧菌或其他微生物系统中进行广泛测试 | 鉴定和表征鳗弧菌NB10中响应极端碱性条件的启动子区域 | 鳗弧菌NB10的FK506结合蛋白型肽酰脯氨酰顺反异构酶及其上游启动子区域 | 合成生物学 | NA | 蛋白质组学分析、β-半乳糖苷酶报告基因系统 | NA | 基因表达数据、酶活性数据 | NA | 报告基因构建 | 大肠杆菌 | 碱性诱导启动子系统 | 工业生物技术 |
| 925 | 2025-10-05 |
Identification of Thermoregulatory Factors Involved in Validamycin Biosynthesis and Reconstitution of a Thermoregulated Expression System
2025-Jul, Biotechnology journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/biot.70068
PMID:40611707
|
研究论文 | 本研究在链霉菌中鉴定到参与有效霉素生物合成的温度调控因子,并重建了一个温度调控表达系统 | 首次在链霉菌中发现P启动子的温度调控机制,并成功构建了更高效的短启动子温度调控系统 | 研究仅限于两种链霉菌宿主,未在其他微生物中验证系统的普适性 | 研究链霉菌中温度调控系统在有效霉素生物合成中的作用 | 吸水链霉菌TL01和白色链霉菌J1074 | 合成生物学 | NA | DNA亲和层析,启动子工程,基因过表达 | NA | 基因表达数据,代谢产物产量数据 | 多种工程化链霉菌菌株 | 启动子工程,基因过表达 | Streptomyces albus J1074, Streptomyces hygroscopicus TL01 | 温度调控表达系统,包含改造的短启动子和调控蛋白SHJG_5852、SHJG_6392 | 工业生物技术 |
| 926 | 2025-10-05 |
Bridging BioSciences and technology: The impact of AI & GenAI in life sciences and agribusiness
2025-Jun-16, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2025.149623
PMID:40516836
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综述 | 探讨生成式人工智能在生命科学和农业综合企业中的多层面影响 | 系统阐述生成式AI在药物发现、蛋白质结构预测、作物育种及合成生物学等前沿领域的创新应用 | 未具体说明数据隐私、算法偏见和利益公平分配等伦理问题的解决方案 | 分析生成式AI与生物科学交叉融合的技术影响与发展前景 | 生成式人工智能技术在生命科学和农业领域的应用场景 | 机器学习 | NA | 生成式人工智能 | 大型语言模型(LLM) | 基因组数据、生态数据、分子数据 | NA | NA | NA | NA | 医药, 农业, 环境, 能源, 工业生物技术 |
| 927 | 2025-10-05 |
The horizontally transferred gene, CsMTAN, rewired purine traffic to build caffeine factories in tea leaves
2025-Jul-03, Journal of integrative plant biology
IF:9.3Q1
DOI:10.1111/jipb.13957
PMID:40607640
|
研究论文 | 本研究通过代谢组学和全基因组关联分析鉴定出茶树中调控嘌呤代谢的关键基因CsMTAN,并揭示其通过水平基因转移演化而来 | 首次发现CsMTAN基因通过水平基因转移进入植物基因组,并证实其F179Y突变会显著改变酶活性,从而影响茶树嘌呤代谢流向 | 研究主要基于体外酶活实验和瞬时过表达验证,缺乏稳定的转基因植物系统验证 | 解析茶树嘌呤代谢和嘌呤生物碱生物合成的遗传与分子机制 | 183个遗传多样性茶树品种的嫩叶和成熟叶 | 植物代谢组学 | NA | 代谢组学分析、全基因组关联分析(GWAS)、系统发育分析、蛋白结构建模、瞬时过表达 | NA | 代谢物数据、基因组数据 | 183个茶树品种的两种组织(嫩叶和成熟叶) | NA | 本氏烟(Nicotiana benthamiana) | NA | 农业、合成生物学 |
| 928 | 2025-10-05 |
Three-dimensional robotic structures fabricated and powered entirely with proteins
2025-Jul-02, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-025-01186-0
PMID:40604266
|
研究论文 | 开发了完全由蛋白质构成的3D打印微机器人结构,并通过肌动球蛋白皮层实现驱动 | 首次实现完全基于蛋白质的3D打印机器人结构,采用最小肌动球蛋白皮层进行驱动 | 需要生物材料专业背景,完成过程需15天时间 | 将生物分子活性组装并放大至人造设备中执行工作 | 蛋白质基3D打印结构和肌动球蛋白活性涂层 | 合成生物学 | NA | 3D打印、生物分子组装 | NA | NA | NA | NA | NA | 肌动球蛋白活性涂层系统 | 工业生物技术, 材料 |
| 929 | 2025-10-05 |
Expanding salivary biomarker detection by creating a synthetic neuraminic acid sensor via chimeragenesis
2025-Jun-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.13.598939
PMID:38915506
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研究论文 | 本研究通过合成生物学技术开发了一种用于检测口腔鳞状细胞癌唾液生物标志物的全细胞生物传感器 | 创建了新型嵌合转录因子Sphnx用于检测N-乙酰-D-神经氨酸(Neu5Ac),拓展了唾液生物标志物检测能力 | 目前仅为概念验证阶段,尚未应用于临床筛查 | 开发能够早期无创诊断口腔鳞状细胞癌的生物传感器 | N-乙酰-D-神经氨酸(Neu5Ac)唾液生物分子 | 合成生物学 | 口腔鳞状细胞癌 | 合成生物学技术、嵌合转录因子工程 | 全细胞生物传感器(WCB) | 生物分子检测数据 | NA | 嵌合转录因子工程 | 工程细菌 | 可溶性分子检测后触发可观察效应子表达的生物传感器电路 | 医学 |
| 930 | 2025-10-05 |
Bioremediation of complex organic pollutants by engineered Vibrio natriegens
2025-Jun, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-08947-7
PMID:40335686
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研究论文 | 本研究利用合成生物学技术改造Vibrio natriegens,使其能够在含盐废水和土壤中生物修复复杂有机污染物 | 开发了基于tfoX扩增效应的迭代自然转化基因组工程方法,成功将五个降解基因簇(总43kb)转入V natriegens菌株Vmax | NA | 开发能够耐受盐胁迫并降解复杂有机污染物的工程微生物 | 工程化改造的Vibrio natriegens菌株 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、基因组工程、化学合成 | NA | NA | NA | 合成生物学方法 | Vibrio natriegens, 酵母 | 插入tfoX主调控基因增强DNA摄取和整合能力,构建五个有机污染物降解基因簇 | 环境 |
| 931 | 2025-10-05 |
Advancing sustainable practices with Paenibacillus polymyxa: From soil health to medical applications and molecular engineering
2025, AIMS microbiology
IF:2.7Q3
DOI:10.3934/microbiol.2025016
PMID:40600215
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综述 | 本文全面分析了多粘类芽孢杆菌在农业、环境、医学和工业等领域的可持续应用潜力 | 强调该细菌作为蛋白质表达、代谢工程和合成生物学多功能平台的潜力,并指出针对该菌的特异性基因编辑技术开发需求 | 天然多粘类芽孢杆菌生物资源的广泛利用受到遗传操作能力和工具的限制 | 深入理解多粘类芽孢杆菌的特性、遗传资源和代谢能力,推动可持续实践发展 | 多粘类芽孢杆菌(Paenibacillus polymyxa) | 合成生物学 | NA | 遗传编辑技术、代谢工程 | NA | NA | NA | NA | 多粘类芽孢杆菌 | NA | 农业,环境,医学,工业生物技术 |
| 932 | 2025-10-05 |
Synthetic Forms Most Beautiful: Engineering Insights into Self-Organization
2025-Jul-01, Physiology (Bethesda, Md.)
DOI:10.1152/physiol.00064.2024
PMID:39938118
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综述 | 探讨合成生物学如何通过构建新生命系统来理解生物自组织的基本设计原则 | 提出将长度或时间尺度强加于生物活动是自组织的基本策略,并展示如何在合成系统中实现这一设计目标 | NA | 扩展对生命自组织设计原则的理解 | 生物自组织系统,从细胞到有机体水平 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 自组织系统设计 | 医学, 农业, 环境, 能源, 材料, 食品, 工业生物技术 |
| 933 | 2025-10-05 |
The Japan-UK Synthetic Biology Conference, Spring 2025: Strengthening Global Links to Engineer Biology
2025-Jun-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00232
PMID:40538270
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观点文章 | 总结2025年春季日本-英国合成生物学会议的核心内容,旨在加强两国在合成生物学领域的国际合作 | 通过国际会议促进合成生物学领域的全球合作网络建设,强调专业知识、国家基础设施和资金协调的共享机制 | 仅基于会议讨论内容进行分析,缺乏具体研究数据和实证支持 | 促进日本与英国在合成生物学领域的国际合作与知识交流 | 合成生物学研究社区和国际合作机制 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 会议讨论内容 | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术, 环境, 能源 |
| 934 | 2025-10-05 |
Engineering artificial microbial consortia for personalized gut microbiome modulation and disease treatment
2025-Jun, Annals of the New York Academy of Sciences
IF:4.1Q1
DOI:10.1111/nyas.15352
PMID:40320966
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综述 | 提出通过工程化人工微生物群落实现个性化肠道微生物组调控和疾病治疗的新方法 | 整合合成生物学、系统生物学和先进培养技术,设计具有特定功能的人工微生物群落 | 需要开展严格的临床试验评估安全性和长期影响 | 通过精确调控肠道微生物组治疗疾病 | 人工微生物群落和肠道微生物组 | 合成生物学 | 代谢紊乱、炎症性疾病、胃肠道感染 | 合成生物学、系统生物学、先进培养技术 | NA | NA | NA | NA | 微生物群落 | 具有治疗分子生产、免疫调节和病原菌竞争等功能的工程化群落 | 医学 |
| 935 | 2025-10-05 |
Design Principles Of Inorganic-Protein Hybrid Materials for Biomedicine
2025-Jun, Exploration (Beijing, China)
DOI:10.1002/EXP.20240182
PMID:40585774
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综述 | 本文系统综述了无机-蛋白质杂化材料在生物医学领域的设计原理、结构基础及应用前景 | 提出原位杂化材料合成新思路,从合成生物学角度分析杂化材料反应体系构建策略 | NA | 探讨无机-蛋白质杂化材料的设计原理及其在生物医学领域的应用 | 无机-蛋白质杂化材料(IPHMs) | 材料科学 | NA | 生物医学光学成像、多模式治疗 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 生物医学 |
| 936 | 2025-10-05 |
Expression of microbial lipase in filamentous fungus Aspergillus niger: a review
2024-Jul, 3 Biotech
IF:2.6Q3
DOI:10.1007/s13205-024-03998-5
PMID:38841267
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综述 | 综述了微生物脂肪酶在丝状真菌黑曲霉中表达的相关研究进展 | 整合了微生物脂肪酶的最新数据,重点讨论了通过CRISPR/Cas9基因编辑技术提高脂肪酶表达效率的策略 | NA | 提高微生物脂肪酶在黑曲霉中的表达效率 | 微生物脂肪酶及其在黑曲霉中的表达系统 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9基因编辑技术 | NA | 文献数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 黑曲霉 | 脂肪酶表达系统 | 能源,食品,日化,制药,工业生物技术 |
| 937 | 2025-10-05 |
Context-dependent redesign of robust synthetic gene circuits
2024-Jul, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2024.01.003
PMID:38320912
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综述 | 本文概述了合成基因回路与宿主细胞间环境依赖性相互作用及其对回路性能的影响,并总结了减轻这些不良效应的控制策略 | 系统总结了宿主感知和资源感知的合成基因回路设计最新进展,特别关注生长反馈和资源竞争等新兴回路-宿主相互作用机制 | NA | 理解合成基因回路与宿主细胞间的复杂关系及其对合成生物工程流程的影响 | 合成基因回路与宿主细胞的相互作用机制 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 细胞 | 合成基因回路 | 工业生物技术 |
| 938 | 2025-10-05 |
TidyTron: Reducing lab waste using validated wash-and-reuse protocols for common plasticware in Opentrons OT-2 lab robots
2024-Apr, SLAS technology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.slast.2023.08.007
PMID:37696493
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研究论文 | 开发并验证了用于Opentrons OT-2实验室机器人清洗常见塑料器件的开源协议库TidyTron,以减少实验室塑料废物 | 首次开发了使用低成本实验室机器人自动化清洗单次使用塑料器件的开源验证协议,实现了对DNA、大肠杆菌和酿酒酵母污染的有效去污 | 仅验证了特定类型的塑料器件(微量移液器吸头和微孔板)和特定污染物(DNA、E. coli、S. cerevisiae) | 通过自动化清洗和重复使用单次使用塑料器件,提高生物技术实验室的可持续性并降低重复成本 | 被DNA、大肠杆菌和酿酒酵母污染的微量移液器吸头和微孔板 | 合成生物学 | NA | qPCR, 流式细胞术, 菌落形成单位测定 | NA | 实验数据 | NA | Opentrons OT-2 | E. coli, S. cerevisiae | NA | 环境, 工业生物技术 |
| 939 | 2025-10-05 |
Expressing exogenous gene in Chlamydomonas reinhardtii chloroplast with viral replication elements
2025-Oct, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2025.132784
PMID:40490158
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研究论文 | 开发了一种基于双生病毒的莱茵衣藻叶绿体表达平台,用于提高外源基因表达效率和化合物产量 | 首次在莱茵衣藻叶绿体中应用甜菜曲顶病毒的复制机制,建立了病毒启发的表达平台,实现长期稳定高表达 | NA | 解决莱茵衣藻叶绿体合成生物学中产物产量低的问题 | 莱茵衣藻叶绿体 | 合成生物学 | NA | 病毒复制元件技术 | NA | NA | NA | 病毒复制元件 | Chlamydomonas reinhardtii(莱茵衣藻) | 病毒启发的表达平台,包含细菌类胡萝卜素生成基因 | 工业生物技术 |
| 940 | 2025-10-05 |
Reconfigurable nanomaterials folded from multicomponent chains of DNA origami voxels
2024-11-27, Science robotics
IF:26.1Q1
DOI:10.1126/scirobotics.adp2309
PMID:39602517
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研究论文 | 开发了一种基于DNA折纸体素的可重构纳米材料系统,通过可编程三维连接实现多种结构的快速重构 | 提出了模块化DNA折纸体素系统,实现了局部连接在柔性和刚性状态间的可编程切换,以及通过柔性链中间体组装提高产率的新方法 | 当前合成系统在分层组装中产率较低,在不同结构间快速高效重构仍面临挑战 | 开发可重构的DNA纳米材料组装系统 | DNA折纸体素及其组装结构 | 纳米技术 | NA | DNA折纸技术 | NA | NA | 12种独特体素原型构建50种结构 | DNA折纸 | NA | 可编程三维连接系统,柔性链中间体组装路径 | 合成生物学, 无机材料组装, 纳米医学 |