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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 921 | 2025-10-05 |
Engineering Whole-Cell Biosensors for Enhanced Detection of Environmental Antibiotics Using a Synthetic Biology Approach
2024-Jun, Indian journal of microbiology
IF:2.1Q3
DOI:10.1007/s12088-024-01259-w
PMID:39010990
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综述 | 本文综述了利用合成生物学方法改造双组分系统开发生物传感器用于环境抗生素检测 | 探索基于EMeRALD的生物传感器,通过合成生物学方法重新利用微生物双组分系统的传感模块 | NA | 开发用于环境抗生素检测的合成生物学工具 | 细菌双组分系统和EMeRALD生物传感器 | 合成生物学 | 抗生素耐药性 | 合成生物学方法 | NA | NA | NA | EMeRALD | 细菌 | 双组分调控系统合成调控回路 | 环境监测 |
| 922 | 2025-10-05 |
Synthetic biology-based bacterial extracellular vesicles displaying BMP-2 and CXCR4 to ameliorate osteoporosis
2024-Apr, Journal of extracellular vesicles
IF:15.5Q1
DOI:10.1002/jev2.12429
PMID:38576241
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研究论文 | 本研究通过合成生物学技术构建了展示BMP-2和CXCR4的细菌胞外囊泡,用于改善骨质疏松症 | 首次将骨形态发生蛋白BMP-2和趋化因子受体CXCR4与细菌胞外囊泡表面蛋白ClyA融合表达,实现一步法构建兼具骨靶向和骨形成功能的治疗系统 | 研究仅在小鼠模型中进行验证,尚未进行临床前安全性和有效性评估 | 开发基于合成生物学的骨质疏松症治疗新策略 | 骨质疏松症小鼠模型和骨髓间充质干细胞BMSCs | 合成生物学 | 骨质疏松症 | 细菌胞外囊泡工程、蛋白融合表达 | NA | 体内外实验数据 | 卵巢切除小鼠模型 | PET28a载体系统 | 大肠杆菌Nissle 1917 | ClyA-BMP-2-CXCR4融合蛋白表达系统,用于细菌胞外囊泡表面展示 | 医药 |
| 923 | 2025-10-05 |
Development of a chemically induced dissociation system via phage surface-displayed nanobody screening
2025-May-31, FEBS letters
IF:3.0Q3
DOI:10.1002/1873-3468.70084
PMID:40448527
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研究论文 | 开发了一种通过噬菌体表面展示纳米抗体筛选的化学诱导解离系统 | 首次利用噬菌体展示技术筛选出可被FDA批准小分子药物破坏的纳米抗体,建立化学诱导蛋白相互作用的解离系统 | NA | 开发能够可诱导调控蛋白质功能的后翻译化学方法 | 丙型肝炎病毒蛋白酶NS3a与纳米抗体的相互作用 | 合成生物学 | 丙型肝炎 | 噬菌体展示技术 | NA | NA | NA | 噬菌体展示 | 人类细胞 | 化学诱导解离系统 | 医学 |
| 924 | 2025-10-05 |
Recent Advances in Multiple Strategies for the Biosynthesis of Sesquiterpenols
2025-May-03, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom15050664
PMID:40427558
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综述 | 本文综述了倍半萜醇生物合成的最新合成生物学策略与进展 | 系统总结了微生物合成倍半萜醇的多种创新策略,包括酶筛选、通路调控和区室化表达 | 未提及具体实验数据验证策略效果,主要基于文献综述 | 推动倍半萜醇生物合成研究发展 | 倍半萜醇化合物 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | 文献数据 | NA | NA | 微生物系统 | 倍半萜醇合成通路 | 医药,食品,化妆品 |
| 925 | 2025-10-05 |
The Application of Multiple Strategies to Enhance Methylparaben Synthesis Using the Engineered Saccharomyces cerevisiae
2025-Apr-25, Biology
DOI:10.3390/biology14050469
PMID:40427658
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研究论文 | 本研究通过多种代谢工程策略改造酿酒酵母以增强对羟基苯甲酸甲酯的生物合成 | 通过调控内源莽草酸途径限速步骤、增强中心碳通量及改进外源酶表达等多种策略组合,实现了酿酒酵母合成对羟基苯甲酸甲酯的最高产量 | 摇瓶产量为68.59 mg/L,尚未进行大规模发酵验证 | 开发环境友好的对羟基苯甲酸甲酯生物合成方法 | 工程化酿酒酵母 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、启动子工程 | NA | NA | NA | 启动子工程 | 酿酒酵母 | 对羟基苯甲酸甲酯生物合成途径,包括莽草酸途径调控、竞争途径敲除和前体合成促进 | 工业生物技术,材料 |
| 926 | 2025-10-05 |
Crosslinking intermodular condensation in non-ribosomal peptide biosynthesis
2025-Feb, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-08306-y
PMID:39663458
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研究论文 | 本研究开发了位点选择性交联探针来解析非核糖体肽合成酶中载体蛋白与酶结构域的相互作用机制 | 首次利用四嗪点击化学捕获载体蛋白在缩合结构域活性位点的相互作用,并通过冷冻电镜获得高分辨率结构 | NA | 阐明非核糖体肽合成酶中载体蛋白与酶结构域相互作用的分子机制 | 酪酪肽生物合成途径中的载体蛋白和缩合结构域 | 结构生物学 | NA | 位点选择性交联、四嗪点击化学、冷冻电镜、X射线晶体学 | NA | 结构数据 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 |
| 927 | 2025-10-05 |
Cleavable donor-assisted CRISPR/Cas9 system significantly improves the efficiency of large DNA insertion in Physcomitrium patens
2025-Feb, The Plant journal : for cell and molecular biology
DOI:10.1111/tpj.70020
PMID:39981890
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研究论文 | 开发了一种可切割供体辅助的CRISPR/Cas9系统,显著提高了小立碗藓中大片段DNA插入的效率 | 设计了包含两个Cas9核酸酶识别位点的IVC供体,可在体内释放线性模板用于同源定向修复 | 主要在小立碗藓中验证,对其他作物的适用性需要进一步验证 | 提高CRISPR/Cas9介导的大片段DNA插入效率 | 小立碗藓(P. patens)原生质体 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9基因组编辑 | NA | NA | 评估了两种不同的sgRNA和四种不同的DNA插入片段 | CRISPR-Cas9 | 小立碗藓(Physcomitrium patens) | 同源定向修复(HDR)系统 | 农业,工业生物技术 |
| 928 | 2025-10-05 |
Kinetic modules are sources of concentration robustness in biochemical networks
2025-May-30, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.ads7269
PMID:40435256
|
研究论文 | 本文揭示了动力学模块作为生化网络中浓度鲁棒性来源的机制 | 无需参数值即可基于稳态反应速率耦合识别大规模生化网络中的动力学模块,并发现有序结合酶机制比随机结合具有更高的浓度鲁棒性 | 研究基于34个代谢网络模型,可能未覆盖所有生物系统类型 | 探索生化网络中动力学模块与浓度鲁棒性的关系 | 26个生物的34个代谢网络模型 | 系统生物学 | NA | 质量作用动力学分析 | 代谢网络模型 | 生化网络数据 | 34个代谢网络模型(来自26个生物) | NA | NA | NA | 合成生物学, 生物技术 |
| 929 | 2025-10-05 |
Structural Homology Fails to Predict Secretion Efficiency in Pichia pastoris: Divergent Responses of Architecturally Similar scFvs to Multi-Parametric Genetic Engineering
2025-May-21, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26104922
PMID:40430062
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研究论文 | 本研究通过多参数遗传工程优化毕赤酵母中scFv抗体的分泌效率,发现结构同源蛋白对优化策略存在不同响应 | 挑战了结构同源性可预测优化效果的假设,揭示了蛋白特异性阈值对遗传工程策略的影响 | 仅研究两种scFv变体,样本量有限 | 优化毕赤酵母系统中单链抗体片段的分泌效率 | 两种结构同源的scFv变体(PR961和PR953) | 合成生物学 | NA | 基因剂量优化、表达盒设计、内质网分泌通路重编程 | NA | 蛋白分泌效率数据 | 两种scFv变体 | 基因敲除、过表达 | 毕赤酵母 | 分泌通路重编程(涉及21个基因的三个功能模块) | 工业生物技术 |
| 930 | 2025-10-05 |
Multi-Omics and Functional Insights into Triterpenoid Biosynthesis Pathways in Neopicrorhiza scrophulariiflora (Pennell) D.Y.Hong
2025-May-21, Plants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/plants14101562
PMID:40431127
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研究论文 | 通过转录组学和代谢组学分析揭示胡黄连中三萜类化合物生物合成途径的关键基因与分子机制 | 首次鉴定出NsOSC2双功能酶能催化2,3-氧化角鲨烯转化为α-香树脂醇和β-香树脂醇,并建立了高效的再生系统和稳定遗传转化体系 | NA | 阐明胡黄连三萜类化合物生物合成的分子机制 | 胡黄连(Neopicrorhiza scrophulariiflora)的不同组织部位 | 合成生物学 | NA | 转录组学, 代谢组学, 遗传转化 | NA | 转录组数据, 代谢组数据 | NA | NA | 胡黄连 | 三萜类化合物生物合成途径 | 医药 |
| 931 | 2025-10-05 |
The Transformation Experiment of Frederick Griffith II: Inclusion of Cellular Heredity for the Creation of Novel Microorganisms
2025-May-15, Bioengineering (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/bioengineering12050532
PMID:40428151
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研究论文 | 提出基于格里菲斯转化实验的合成生物学新方法,用于创建具有显著表型差异的杂交微生物 | 提出格里菲斯转化实验2.0设计,能够同时交换DNA和非DNA结构与调控信息 | 目前仅限于密切相关的细菌物种,供体与受体细胞间代谢通量和周转的调控匹配仍具挑战 | 开发能够整合多种遗传信息的合成生物学方法以创建新型微生物 | 细菌细胞及其遗传物质交换机制 | 合成生物学 | NA | 细菌转化实验、水平基因转移、体细胞核移植 | NA | NA | NA | NA | 细菌 | DNA、大分子、拓扑、控制论和细胞遗传信息的整合系统 | 工业生物技术 |
| 932 | 2025-10-05 |
Biosimilars Targeting Pathogens: A Comprehensive Review of Their Role in Bacterial, Fungal, Parasitic, and Viral Infections
2025-Apr-28, Pharmaceutics
IF:4.9Q1
DOI:10.3390/pharmaceutics17050581
PMID:40430873
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综述 | 本文全面综述了生物类似物在细菌、真菌、寄生虫和病毒感染治疗中的作用及其发展前景 | 系统探讨了抗体工程、合成生物学和无细胞蛋白合成等创新技术在提升生物类似物效力和生产效率方面的潜力 | NA | 分析生物类似物在传染病治疗领域的应用价值和发展挑战 | 针对病原体的生物类似物(包括治疗性蛋白、单克隆抗体、抗菌肽等) | NA | 传染病 | 抗体工程、合成生物学、无细胞蛋白合成 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医药 |
| 933 | 2025-10-05 |
Omics-driven onboarding of the carotenoid producing red yeast Xanthophyllomyces dendrorhous CBS 6938
2024-Dec-28, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-024-13379-w
PMID:39731599
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研究论文 | 本研究通过转录组学数据开发了红酵母Xanthophyllomyces dendrorhous的合成生物学元件库 | 首次将系统生物学与合成生物学结合,创建了从组学到元件的流程,为非常规微生物快速开发遗传工具 | 许多推定的调控型启动子在合成遗传背景下表现出组成型活性 | 开发Xanthophyllomyces dendrorhous的合成生物学工具并研究其光生物学特性 | 红酵母Xanthophyllomyces dendrorhous CBS 6938 | 合成生物学 | NA | 转录组学, 差异基因表达分析, 基因本体分析, 荧光素酶检测 | NA | 转录组数据, 基因组数据 | 在不同波长光照和氧化应激条件下的X. dendrorhous样本 | 模块化克隆系统 | Xanthophyllomyces dendrorhous | 组成型和光调控启动子, 整合位点, 终止子, 选择标记, 报告基因 | 工业生物技术 |
| 934 | 2025-10-05 |
Development of a xylose-inducible and glucose-insensitive expression system for Parageobacillus thermoglucosidasius
2024-Oct-23, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-024-13333-w
PMID:39441395
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研究论文 | 本研究开发了一种木糖诱导且葡萄糖不敏感的基因表达系统IExyl*,并应用于提高Parageobacillus thermoglucosidasius的核黄素产量 | 通过组合xylA5p启动子和XylR调节因子,优化XylR表达强度并降低葡萄糖对木糖摄取的代谢物阻遏,创建了葡萄糖不敏感的木糖诱导表达系统 | NA | 开发适用于Parageobacillus thermoglucosidasius的诱导表达系统 | Parageobacillus thermoglucosidasius DSM 2542菌株 | 合成生物学 | NA | 启动子工程,代谢工程 | NA | NA | NA | 启动子工程,代谢通路重定向 | Parageobacillus thermoglucosidasius | 木糖诱导表达系统,包含xylA5p启动子和XylR转录调节因子 | 工业生物技术 |
| 935 | 2025-10-05 |
In vivo thrombin activity in the diatom Phaeodactylum tricornutum: biotechnological insights
2024-Oct-08, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-024-13322-z
PMID:39377797
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研究论文 | 本研究在三角褐指藻中鉴定并验证了具有凝血酶样活性的蛋白酶,推进了硅藻在生物技术中的应用 | 首次在三角褐指藻中发现具有凝血酶样活性的新型蛋白酶,并通过体内实验验证其切割效率 | NA | 探索三角褐指藻中凝血酶样蛋白的存在及其在生物工程中的应用潜力 | 三角褐指藻中的凝血酶样蛋白序列及其功能特性 | 合成生物学 | NA | 计算机模拟分析、蛋白质结构预测、分子对接、Western blot | NA | 基因组序列、蛋白质序列、蛋白质结构数据 | NA | NA | 三角褐指藻 | 凝血酶识别序列LVPRGS的融合蛋白构建 | 工业生物技术 |
| 936 | 2025-10-05 |
A Simple and Effective Strategy for the Development of Robust Promoter-Centric Gene Expression Tools
2024-09-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00092
PMID:39120429
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研究论文 | 本研究开发了一种通过改造启动子区域来创建稳健基因表达工具的简单有效策略 | 通过在原始启动子-35区域上游引入额外的-35样基序,并在5'-UTR区域整合回文元件,显著增强了启动子活性 | NA | 开发稳健的启动子中心基因表达工具 | 链霉菌及其基因表达系统 | 合成生物学 | NA | 启动子工程 | NA | NA | NA | 启动子改造 | 链霉菌 | 组成型和诱导型基因表达系统,包括木四环素诱导型基因表达系统 | 工业生物技术 |
| 937 | 2025-10-05 |
Desiccated Cyanobacteria Serve As Efficient Plasmid DNA Carriers in Space Flight
2024-09-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00672
PMID:39150229
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研究论文 | 本研究探索利用干燥蓝藻作为质粒DNA载体在太空飞行中的有效运输方法 | 首次利用天然耐干燥的蓝藻作为质粒DNA载体,实现无需低温储存的太空往返运输 | 仅为概念验证研究,样本规模有限,需要进一步验证不同质粒和环境的适用性 | 开发适用于太空环境的生物部件运输方法,支持太空合成生物学和生物制造 | 蓝藻菌株PC73102和pSCR119质粒 | 合成生物学 | NA | 质粒提取、细菌转化 | NA | 分子生物学数据 | 概念验证规模,具体样本数量未明确说明 | NA | 蓝藻PC73102, 大肠杆菌 | 质粒载体系统,包含卡那霉素抗性基因 | 太空生物技术 |
| 938 | 2025-10-05 |
Genetic Code Expansion in Shewanella oneidensis MR-1 Allows Site-Specific Incorporation of Bioorthogonal Functional Groups into a c-Type Cytochrome
2024-09-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00248
PMID:39158169
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研究论文 | 本研究开发了在希瓦氏菌MR-1中实现位点特异性非经典氨基酸掺入的高效方法 | 首次在电活性细菌MR-1中建立遗传密码扩展系统,实现c型细胞色素MtrC的位点特异性修饰 | NA | 扩展电活性细菌中蛋白质的化学功能多样性 | 希瓦氏菌MR-1及其c型细胞色素MtrC | 合成生物学 | NA | 遗传密码扩展技术 | NA | 蛋白质结构数据、电化学数据 | NA | 遗传密码扩展 | Shewanella oneidensis MR-1 | 非经典氨基酸掺入系统 | 工业生物技术 |
| 939 | 2025-10-05 |
GOLDBAR: A Framework for Combinatorial Biological Design
2024-09-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00296
PMID:39162314
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研究论文 | 提出名为GOLDBAR的组合生物设计框架,用于支持合成生物学中的自动化分析和机器学习 | 能够对生物设计类别进行交集和合并操作,提取共同设计模式并推断新设计,相比现有框架支持形式化设计比较 | NA | 开发支持合成生物学中组合设计形式化比较的框架 | 组合生物设计库和设计规则 | 合成生物学 | NA | DNA组装技术 | 基于文法的机器学习 | 生物设计数据 | NA | NA | NA | TetR同源转录逻辑电路、基因簇 | 工业生物技术 |
| 940 | 2025-10-05 |
Synthetic Biology of Natural Products Engineering: Recent Advances Across the Discover-Design-Build-Test-Learn Cycle
2024-09-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00391
PMID:39163395
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综述 | 本文系统总结了合成生物学在天然产物工程领域的最新进展,涵盖从发现到学习的完整生物工程周期 | 整合了AI辅助基因组挖掘、酶与途径工程、新型宿主系统等最新技术进展,并强调在工艺开发早期进行预期分析的重要性 | NA | 总结天然产物工程领域合成生物学技术的最新发展 | 天然产物生物合成工程 | 合成生物学 | NA | 基因组工程、AI辅助基因组挖掘、酶工程、途径工程 | NA | NA | NA | NA | 新型宿主系统 | 生物合成途径工程 | 医药, 工业生物技术 |