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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 921 | 2025-12-18 |
Extraction, preparation, pharmacological activities, and potential applications of ginsenosides Rk1 and Rg5
2026-Jan-30, Journal of ethnopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.jep.2025.120678
PMID:41052692
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综述 | 本文系统综述了稀有人参皂苷Rk1和Rg5的最新研究进展,涵盖其天然来源、提取加工技术、结构特征、药理机制以及在功能性食品和营养保健品中的潜在应用 | 整合了网络药理学和分子对接技术来预测Rk1和Rg5的潜在抗癌和生殖保护作用,并探讨了人工智能辅助生物转化和合成生物学等新兴技术为其大规模、高效制备提供的新途径 | 其工业化应用受到天然丰度低、结构复杂和可持续生产挑战的阻碍,未来研究需优先优化提取方案、阐明药代动力学特征并进行严格的临床试验以验证其功效 | 旨在弥合临床前研究与临床转化之间的差距,促进Rk1和Rg5在医疗保健和营养领域更广泛的应用 | 稀有人参皂苷Rk1和Rg5 | NA | 肿瘤、代谢性疾病、心血管疾病 | 网络药理学、分子对接、人工智能辅助生物转化、合成生物学 | NA | 文献数据 | NA | NA | NA | NA | 医药、功能性食品、营养保健品 |
| 922 | 2025-12-18 |
Advances and Potential of Aspergillus niger in Industrial Biomanufacturing
2025-Dec-17, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c07467
PMID:41347444
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综述 | 本文综述了黑曲霉在工业生物制造中的进展与潜力,重点关注其作为细胞工厂生产高价值代谢产物的工程策略 | 总结了利用基因编辑、基因组学和合成生物学技术增强黑曲霉作为高效细胞工厂的最新突破,并强调了共培养诱导和沉默基因簇激活等新兴方法 | NA | 概述黑曲霉在工业生物制造中的最新进展与未来潜力 | 黑曲霉及其作为细胞工厂生产代谢产物的工程策略 | 合成生物学 | NA | 基因编辑、基因组学、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 黑曲霉 | 改善碳源利用、调控代谢途径、增强转运系统、促进产物分泌的工程策略 | 食品、制药、可持续制造 |
| 923 | 2025-12-18 |
Deciphering guanidine assimilation and riboswitch-based gene regulation in cyanobacteria for synthetic biology applications
2025-Dec-09, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2519335122
PMID:41343670
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研究论文 | 本研究揭示了蓝藻中肌基的代谢途径及其核糖开关调控机制,并开发了基于肌基核糖开关的合成生物学工具 | 首次在蓝藻中系统阐明肌基通过GdmH酶的同化途径,发现并验证了肌基-I核糖开关的高亲和力结合特性,并成功将其应用于蓝藻异源基因表达的精确可调控系统 | 未完全阐明蓝藻在>1 mM肌基浓度下的其他摄取机制,且研究主要基于模式蓝藻PCC 6803,在其他蓝藻中的普适性需进一步验证 | 解析蓝藻中肌基代谢的分子机制并开发合成生物学调控工具 | 蓝藻(特别是集胞藻PCC 6803)的肌基代谢基因簇、转运系统及核糖开关 | 合成生物学 | NA | 基因敲除、启动子融合、体内基因表达调控 | NA | 分子生物学实验数据、生长表型数据 | 集胞藻PCC 6803野生型及突变株 | 核糖开关工程、启动子组合设计 | 蓝藻(集胞藻PCC 6803) | 基于肌基-I核糖开关的基因表达调控回路,实现异源基因的剂量依赖性精确控制 | 工业生物技术 |
| 924 | 2025-12-18 |
Synthetic biology approaches to generate temperature-sensitive alleles for the Sterile Insect Technique
2025-Nov-03, Insect science
IF:2.9Q1
DOI:10.1111/1744-7917.70186
PMID:41178318
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综述 | 本文综述了利用合成生物学方法开发温度敏感等位基因以改进昆虫不育技术中雄性品系培育的策略 | 提出结合CRISPR/Cas基因组编辑、理性蛋白质设计及合成生物学工具(如温度诱导型N端降解子、温度敏感内含肽)创建非转基因温度敏感品系的新范式 | 在雄性决定染色体或基因座上整合和表达外源基因的技术尚未完全成熟,需要开发更多将温度敏感表型与雌性发育关联的策略 | 开发适用于昆虫不育技术的温度敏感遗传性别品系,实现环境友好的害虫防控 | 昆虫不育技术目标物种的遗传性别品系 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas基因组编辑、蛋白质理性设计、温度诱导型N端降解子、温度敏感内含肽 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 昆虫(SIT目标物种) | 温度敏感等位基因系统、性别特异性致死/转换通路 | 农业 |
| 925 | 2025-12-18 |
Synthetic biology approaches to enhance cancer immune responses
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1698158
PMID:41394856
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综述 | 本文综述了合成生物学在增强癌症免疫应答方面的应用进展,重点介绍了基于微生物的疗法和CAR-T细胞工程的最新发展 | 整合了微生物疗法与CAR-T细胞工程,通过可编程基因电路实现布尔逻辑运算,仅在肿瘤特异性生物标志物存在时激活治疗,提供了前所未有的精准性、安全性和效力 | 临床转化面临重大障碍,包括安全性问题、免疫清除和制造复杂性 | 利用合成生物学方法增强癌症免疫应答,开发精准工程化免疫疗法 | 肿瘤免疫疗法,包括微生物疗法和CAR-T细胞 | 合成生物学 | 癌症 | 合成基因电路构建、CAR-T细胞工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 细菌、T细胞 | 逻辑门电路、布尔逻辑运算电路、生物传感器 | 医学 |
| 926 | 2025-12-18 |
Engineering bacteria for cancer immunotherapy by inhibiting IDO activity and reprogramming CD8+ T cell response
2024-Dec-24, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2412070121
PMID:39693352
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研究论文 | 本研究通过基因工程构建了一种高表达色氨酸的细菌菌株,用于抑制肿瘤中的IDO活性并重编程CD8+ T细胞反应,从而增强肿瘤免疫治疗效果 | 首次利用合成生物学方法构建了能够定植肿瘤并同时抑制IDO活性、提供色氨酸信号以激活CD8+ T细胞的工程菌株,为肿瘤免疫治疗提供了新策略 | 研究主要基于小鼠和兔的肿瘤模型,尚未进行人体临床试验,长期安全性和疗效有待进一步验证 | 开发一种基于工程细菌的肿瘤免疫治疗新方法 | 工程细菌L-Trp CB及其在肿瘤微环境中的作用 | 合成生物学 | 癌症 | 基因工程、动物模型实验 | NA | 实验数据 | 小鼠和兔的多种肿瘤模型 | 基因工程 | 细菌 | 高色氨酸表达系统 | 医学 |
| 927 | 2025-12-18 |
Using Synthetic Biology to Understand the Function of Plant Specialized Metabolites
2024-07, Annual review of plant biology
IF:21.3Q1
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综述 | 本文探讨了如何利用合成生物学技术来理解植物特异性代谢物的功能,特别是在生态和医学领域的应用 | 结合质谱代谢组学和分子生物学技术,通过合成生物学工作流程重新设计PSMs的运输、外部化、结构多样性和生产,以测试长期理论预测 | NA | 加速理解植物特异性代谢物在植物中的复杂生态角色和功能 | 植物特异性代谢物 | 合成生物学 | NA | 质谱代谢组学,分子生物学技术,合成生物学工作流程 | NA | 代谢物数据 | NA | NA | 植物 | 重新设计PSMs的运输、外部化、结构多样性和生产 | 医学,农业,环境 |
| 928 | 2025-12-17 |
Biotechnology of isopentenols production from microbial cell factories
2026-Feb, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2025.133574
PMID:41167484
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综述 | 本文综述了利用微生物细胞工厂生产异戊烯醇的生物技术,重点关注遗传、转录和翻译修饰以及培养条件优化 | 这是首篇全面涵盖微生物异戊烯醇生产所有生物技术方面的综述,包括替代酶和活体原料等创新策略 | NA | 综述微生物异戊烯醇生产的生物技术,以促进其在生物治疗、先进生物燃料和营养保健品等领域的应用 | 异戊烯醇(包括异戊烯醇和异戊二烯醇)及其在微生物细胞工厂中的生产 | NA | NA | 代谢工程、合成生物学、发酵策略 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 大肠杆菌、谷氨酸棒杆菌、需钠弧菌、枯草芽孢杆菌 | 合成途径用于从中心代谢生成异戊二烯前体(IPP和DMAPP) | 医药、农业、环境、能源、材料、食品、工业生物技术 |
| 929 | 2025-12-17 |
Metabolic Engineering of Acinetobacter baylyi ADP1 for L-Leucine Production
2026-Jan, Journal of basic microbiology
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/jobm.70075
PMID:40745981
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研究论文 | 本研究通过代谢工程改造Acinetobacter baylyi ADP1,以提高L-亮氨酸的产量 | 在ADP1中,过表达野生型leuA和ilvBN基因即可有效驱动L-亮氨酸合成,无需反馈抑制抗性突变,这不同于大肠杆菌和谷氨酸棒杆菌等经典底盘生物 | ADP1独特的葡萄糖分解代谢网络限制了其丙酮酸可用性,需要补充丙酮酸并减少碳损失以优化生产 | 评估ADP1作为合成生物学底盘在天然产物生物合成中的潜力,并优化其L-亮氨酸生产能力 | Acinetobacter baylyi ADP1菌株 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、基因过表达、基因敲除、sRNA调控系统 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | Acinetobacter baylyi ADP1 | L-亮氨酸生物合成途径改造、Entner-Doudoroff途径增强、TCA循环动态抑制系统 | 工业生物技术 |
| 930 | 2025-12-17 |
Mapping human neurodevelopment-Brain organoids meet lineage tracing
2025-Dec-16, FEBS letters
IF:3.0Q3
DOI:10.1002/1873-3468.70250
PMID:41400133
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综述 | 本文综述了脑类器官结合谱系追踪技术在研究人类神经发育中的应用现状与前景 | 整合组学技术的新型谱系追踪系统以空前分辨率解析复杂人类生物过程,为合成生物学工具在脑类器官研究中的应用创造新机遇 | 现有技术存在保真度、可扩展性和转化相关性方面的局限性,需要进一步改进 | 利用脑类器官研究人类发育过程中细胞谱系与时间进程相关的生物学过程 | 脑类器官(三维体外自组织系统) | 合成生物学 | NA | 谱系追踪系统、组学技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 931 | 2025-12-17 |
Abiotic stress-induced circular RNAs: Implications for plant stress tolerance
2025-Dec, Plant physiology and biochemistry : PPB
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.plaphy.2025.110688
PMID:41172760
|
综述 | 本文综述了非生物胁迫诱导的环状RNA在植物胁迫耐受中的作用及其潜在应用 | 系统总结了植物中环状RNA作为竞争性内源RNA调控胁迫响应的机制,并提出了工程化环状RNA作为作物改良的新方向 | 植物中环状RNA的miRNA海绵功能研究仍有限,工程化环状RNA的应用仍处于推测性阶段 | 探讨环状RNA在植物非生物胁迫响应中的功能及其在作物改良中的应用潜力 | 植物环状RNA及其在干旱、盐度、极端温度、金属毒性和营养胁迫中的作用 | 植物分子生物学 | NA | 测序技术 | NA | RNA序列数据 | 多种植物物种 | 合成生物学方法 | 植物 | 工程化环状RNA设计 | 农业 |
| 932 | 2025-12-17 |
A membrane-driven biochemical oscillator tunable by the volume to surface area ratio
2025-Nov-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.11.14.688573
PMID:41292784
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研究论文 | 本文介绍并建模了一种基于膜磷脂浓度动态变化驱动的质量守恒生化振荡器,其振荡频率可通过系统的体积与表面积比(V/A)进行调节 | 提出了一种不依赖转录翻译机制、通过膜定位维度缩减放大反应的新型生化振荡器设计,首次实现通过几何参数(V/A比)直接调控振荡特性 | 模型验证主要依赖计算模拟,需要实验体系进一步验证实际生物系统的可行性 | 开发可编程的合成生物学定时模块,探索几何传感在工程化系统中的应用潜力 | 基于内存机制启发的膜驱动生化振荡系统 | 合成生物学 | NA | 质量作用反应动力学、反应-扩散模拟、随机模拟 | 确定性振荡器模型、随机整数拷贝数模型 | 计算模拟数据 | NA | NA | 无细胞系统 | 膜定位振荡器、自组装三聚体耦合系统 | 合成生物学、生物工程 |
| 933 | 2025-12-17 |
Harnessing the ocean's pharmacy: marine bioactive compounds as next-generation therapeutics
2025-Nov, Natural product research
IF:1.9Q3
DOI:10.1080/14786419.2024.2373965
PMID:38954510
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综述 | 本文综述了海洋生物活性化合物作为下一代治疗药物的潜力、应用及挑战 | 强调海洋生物活性化合物在结构独特性和生物活性方面的突破性潜力,并指出合成生物学和代谢工程为可持续生产提供了解决方案 | 面临可持续采集和复杂提取工艺等挑战 | 探讨海洋生物活性化合物的临床潜力及其在现代医学中的应用 | 海洋生物活性化合物 | NA | 癌症、慢性疼痛、传染病 | 合成生物学、代谢工程 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医药 |
| 934 | 2025-12-16 |
CRISPR/Cas9-engineered Bacillus subtilis chassis for tailored chitooligosaccharide production from marine waste chitosan
2025-Dec-14, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-025-02881-z
PMID:41392248
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研究论文 | 本研究建立了一种可持续的生物工艺,利用CRISPR/Cas9工程化的枯草芽孢杆菌底盘,将海洋废弃物壳聚糖转化为高价值的壳寡糖 | 通过CRISPR/Cas9敲除枯草芽孢杆菌内源壳聚糖酶基因,构建工程化底盘菌株,并异源表达优化后的GH46壳聚糖酶,实现了从海洋废弃物到高价值壳寡糖的高效、环保转化 | NA | 开发一种可持续的生物工艺,将海洋废弃物壳聚糖转化为高价值的壳寡糖 | 枯草芽孢杆菌WB800N菌株、来自天蓝色链霉菌的GH46壳聚糖酶(CsnA)、海洋废弃物壳聚糖 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9基因编辑、响应面方法学、MALDI-TOF MS分析、DO-stat控制补料分批发酵 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 枯草芽孢杆菌 | 通过敲除内源壳聚糖酶基因(BsCsn)并异源表达融合了AprE信号肽的优化壳聚糖酶(CsnA),构建用于生产壳寡糖的工程化菌株 | 环境, 工业生物技术 |
| 935 | 2025-12-16 |
Degradation mechanisms and microbial remediation of micro- and nanoplastics: A comprehensive review
2025-Nov-18, Ying yong sheng tai xue bao = The journal of applied ecology
DOI:10.13287/j.1001-9332.202511.034
PMID:41392686
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综述 | 本文全面综述了微/纳塑料的生成途径、微生物降解机制,并评估了微生物修复技术的应用潜力 | 系统整合了微/纳塑料的非生物与生物降解过程,并重点探讨了基于合成生物学的降解酶系统改造与优化这一未来研究方向 | 现有微生物处理技术存在降解效率低、环境适应性差以及工程化放大困难等瓶颈 | 为微/纳塑料污染的有效控制提供技术支撑 | 微塑料和纳米塑料 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | 环境 |
| 936 | 2025-12-16 |
Synthetic multicolor antigen-stabilizable nanobody platform for intersectional labelling and functional imaging
2025-Oct-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.27.684934
PMID:41278670
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研究论文 | 本文介绍了一种合成多色抗原稳定化纳米抗体平台,用于交叉标记和功能成像 | 开发了覆盖可见光谱(450-660 nm)的抗原稳定化荧光纳米抗体工具包,通过工程化荧光蛋白和生物传感器实现通用设计,支持背景自由可视化、多色检测和选择性靶向 | NA | 开发一种合成生物学驱动的平台,用于精确研究蛋白质动力学、细胞过程和复杂生物系统 | 荧光纳米抗体、荧光蛋白、生物传感器、小鼠大脑、斑马鱼胚胎 | 合成生物学 | NA | 荧光成像、生物传感器工程 | NA | 图像数据 | NA | 合成生物学工具 | NA | 抗原稳定化荧光纳米抗体设计,包括组成型、光激活和光切换荧光蛋白,以及基于荧光蛋白的生物传感器 | 医学 |
| 937 | 2025-12-16 |
Engineered Bacteriophages: Advances in Phage Genome Redesign Strategies for Therapeutic and Environmental Applications
2025, Protein and peptide letters
IF:1.0Q4
|
综述 | 本文综述了噬菌体基因组重设计策略在治疗和环境应用中的进展 | 整合了CRISPR-Cas系统、噬菌体展示、逆转录子等多种前沿技术,展示了定制化噬菌体在扩展宿主范围、生物膜降解和靶向治疗方面的创新潜力 | 面临噬菌体抗性、免疫反应和当前工程方法的局限性等挑战 | 探索噬菌体工程化策略以应对治疗和环境可持续性挑战 | 噬菌体及其基因组重设计技术 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas系统、噬菌体展示、随机和定点诱变、逆转录子、同源重组 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas, TALEN, ZFN | 噬菌体 | 生物传感器、逻辑门 | 医药, 环境 |
| 938 | 2025-12-16 |
Reconstructing Early Microbial Life
2024-11, Annual review of microbiology
IF:8.5Q1
|
综述 | 本文综述了早期微生物生命的研究,重点探讨了古代代谢途径,并提出了一个整合微生物学、古生物学和进化合成生物学的跨学科领域框架 | 整合分子生物学、生物信息学和进化合成生物学方法,以重建早期生命的关键生物创新,特别是古代代谢途径 | 将分子遗传学、种群生物学和进化生物学方法应用于前寒武纪生物群的研究仍面临重大挑战 | 重建早期微生物生命,特别是古代代谢途径,以理解生命演化史 | 早期微生物生命,包括其代谢特征和演化过程 | NA | NA | 分子生物学、生物信息学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 939 | 2025-12-16 |
Comparison of phage-derived recombinases for genetic manipulation of Pseudomonas species
2023-12-12, Microbiology spectrum
IF:3.7Q2
DOI:10.1128/spectrum.03176-23
PMID:37882574
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研究论文 | 比较五种噬菌体衍生重组酶在三种生物技术相关假单胞菌株中的重组效率,以开发高效遗传操作工具 | 首次在三种假单胞菌株中系统测试并比较多种噬菌体衍生重组酶的重组效率,为假单胞菌属提供快速、高效的靶向突变方法 | 研究仅针对三种假单胞菌株,可能无法代表整个假单胞菌属的多样性,且未在其他非模式细菌中验证策略的普适性 | 开发适用于假单胞菌属的高效遗传操作工具,以促进其在生物降解、生物农药、生物控制和合成生物学等领域的应用 | 三种生物技术相关假单胞菌株:P. putida KT2440、P. protegens Pf-5 和 P. protegens CHA0 | 合成生物学 | NA | 噬菌体衍生重组酶介导的重组工程 | NA | NA | 三种假单胞菌株 | 噬菌体衍生重组酶 | Pseudomonas putida KT2440, Pseudomonas protegens Pf-5, Pseudomonas protegens CHA0 | NA | 环境, 农业, 工业生物技术 |
| 940 | 2025-12-15 |
Features and functional mechanisms of super-enhancers in cardiovascular disorders, cancer, autoimmune diseases and neurodegenerative disorders
2026-Feb, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2025.112252
PMID:41253192
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综述 | 本文系统综述了超级增强子在心血管疾病、癌症、自身免疫性疾病和神经退行性疾病中的特征、功能机制及治疗靶向策略 | 聚焦于液-液相分离驱动的生物分子凝聚体形成和三维染色质重组,并评估了针对超级增强子成分的创新治疗策略,如合成生物学构建体、CRISPR基因组干预、表观遗传调节剂和组合免疫疗法 | NA | 探讨超级增强子在多种疾病中的转录失调机制及潜在治疗应用 | 超级增强子及其在心血管疾病、癌症、自身免疫性疾病和神经退行性疾病中的作用 | NA | 心血管疾病、癌症、自身免疫性疾病、神经退行性疾病 | NA | NA | NA | NA | CRISPR | NA | NA | 医学 |