合成生物学相关文章
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当前共找到 3795 篇文献，本页显示第 941 - 960 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 941 | 2025-10-05 |
MutaT7GDE: A Single Chimera for the Targeted, Balanced, Efficient, and Processive Installation of All Possible Transition Mutations In Vivo
2024-09-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00316
PMID:39190860
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研究论文 | 开发了一种名为MutaT7GDE的新型嵌合酶，能够在体内高效安装所有可能的转换突变 | 首次利用底物混杂性通用脱氨酶构建单一嵌合酶，可同时靶向脱氧腺苷和脱氧胞苷进行突变 | NA | 开发更高效的定向进化工具，实现目标基因的多样化 | MutaT7嵌合酶系统 | 合成生物学 | NA | 脱氨酶-T7 RNA聚合酶融合技术 | NA | 突变分析数据 | 四种不同的MutaT7构建体 | 蛋白质工程 | NA | 脱氨酶-T7 RNA聚合酶嵌合系统 | 工业生物技术 |
| 942 | 2025-10-05 |
Integrating Deep Learning and Synthetic Biology: A Co-Design Approach for Enhancing Gene Expression via N-Terminal Coding Sequences
2024-09-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00371
PMID:39229974
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研究论文 | 提出一种深度学习与合成生物学协同设计的少样本训练工作流程，用于优化N端编码序列以增强基因表达 | 开发了结合k近邻编码、word2vec、注意力机制和时间序列网络的深度学习模型，仅需六次迭代实验即可显著提升基因表达 | 仅使用GFP作为报告蛋白验证，在其他蛋白中的应用效果需进一步验证 | 优化N端编码序列以最大化基因表达 | 绿色荧光蛋白(GFP)和N-乙酰神经氨酸合成相关基因 | 机器学习 | NA | 深度学习，基因表达优化 | 注意力机制，时间序列网络，word2vec | 基因序列数据，荧光强度数据 | 少样本训练（六次迭代实验） | NA | 大肠杆菌 | 基因表达优化系统 | 工业生物技术，医药 |
| 943 | 2025-10-05 |
Multilevel Systematic Optimization To Achieve Efficient Integrated Expression of Escherichia coli
2024-09-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00280
PMID:39262282
|
研究论文 | 通过多层级系统优化开发大肠杆菌高效整合表达系统 | 从整合位点筛选、启动子优化和T7 RNA聚合酶过表达三个层面系统优化，构建了无需抗生素和诱导剂的高效整合表达系统 | 研究仅针对大肠杆菌BL21(DE3)菌株，未在其他宿主中验证通用性 | 开发稳定高效的外源基因基因组整合表达系统 | 大肠杆菌BL21(DE3)基因组和外源基因表达元件 | 合成生物学 | NA | 基因组编辑、启动子工程、蛋白表达分析 | NA | 基因表达数据、酶活性数据 | 18个基因组整合位点、16个内源启动子 | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌 | 组成型高效整合表达系统，包含优化整合位点、Plpp-T7杂合启动子和T7 RNA聚合酶过表达模块 | 工业生物技术, 酶工程 |
| 944 | 2025-10-05 |
Evaluating the Contribution of Model Complexity in Predicting Robustness in Synthetic Genetic Circuits
2024-09-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00708
PMID:39264040
|
研究论文 | 比较五种计算模型对三种实现相同逻辑功能的遗传电路进行预测能力评估 | 首次系统比较不同复杂度模型在预测合成遗传电路鲁棒性方面的表现差异 | 研究基于仿真分析，需要实际实验验证；模型参数获取仍存在挑战 | 评估模型复杂度对合成遗传电路鲁棒性预测能力的影响 | 三种实现相同逻辑功能的遗传电路和五种计算模型 | 合成生物学 | NA | 计算建模、仿真分析 | 多种复杂度计算模型 | 仿真数据 | 五种模型对三种电路设计的分析 | NA | NA | 实现相同逻辑功能的遗传电路 | 工业生物技术 |
| 945 | 2025-10-05 |
Yeast Surface-Displayed Quenchbody as a Novel Whole-Cell Biosensor for One-Step Detection of Influenza A (H1N1) Virus
2024-09-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00317
PMID:39256183
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研究论文 | 本研究开发了一种基于酵母表面展示淬灭体的新型全细胞生物传感器，用于一步检测甲型流感（H1N1）病毒 | 首次在酵母细胞表面展示VHH基淬灭体，创建了无需分析物跨膜运输即可检测病毒颗粒的全细胞生物传感器新设计 | 检测范围有限（H1N1-HA：0.5-16 μg/mL；H1N1病毒：2.4×10至1.5×10 PFU/mL），未在真实环境样本中进行验证 | 开发能够高效检测空气传播病毒的新型全细胞生物传感器 | 甲型流感（H1N1）病毒及其血凝素蛋白H1N1-HA | 合成生物学 | 流感 | 酵母表面展示技术、VHH抗体片段筛选、淬灭体技术 | NA | 荧光信号数据 | 17个VHH抗体片段 | 酵母表面展示系统 | 酵母 | 表面展示淬灭体生物传感器 | 医学诊断,环境监测 |
| 946 | 2025-10-05 |
Ten Years of the Synthetic Biology Summer Course at Cold Spring Harbor Laboratory
2024-09-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00276
PMID:39300908
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综述 | 本文回顾了冷泉港实验室合成生物学暑期课程十年来的发展历程、课程结构和教育成果 | 首次系统总结该旗舰课程的教学模式及其对合成生物学人才培养的深远影响 | NA | 分析合成生物学教育课程的设计理念与实际成效 | 冷泉港实验室合成生物学暑期课程 | 合成生物学教育 | NA | 无细胞转录翻译、DNA构建、基因回路计算建模、基因调控工程、CRISPR技术 | NA | NA | NA | CRISPR | NA | 基因回路 | 教育 |
| 947 | 2025-10-05 |
The BioRECIPE Knowledge Representation Format
2024-08-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00096
PMID:39051984
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研究论文 | 介绍BioRECIPE知识表示格式，用于标准化和促进人类与机器在创建、验证和执行细胞内外信号传导可执行模型时的交互 | 开发了一种同时支持人类可读和机器可处理的新型知识表示格式，实现模型组件的便捷预览和修改 | NA | 为系统和合成生物学社区提供标准化的知识表示格式 | 细胞内外信号传导的可执行模型 | 合成生物学 | NA | 知识表示格式 | NA | 模型数据 | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术 |
| 948 | 2025-10-05 |
ShuffleAnalyzer: A Comprehensive Tool to Visualize DNA Shuffling
2024-08-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00251
PMID:38991172
|
研究论文 | 开发了一个名为ShuffleAnalyzer的综合性工具，用于可视化DNA改组分析结果 | 首个提供直接图形化输出的DNA改组分析工具，同时支持肽插入的分析和可视化 | NA | 开发一个用户友好的DNA改组分析可视化工具 | DNA改组产生的嵌合序列和肽插入 | 合成生物学 | NA | DNA改组技术 | NA | DNA序列数据 | NA | NA | NA | NA | 基因治疗, 合成生物学 |
| 949 | 2025-10-05 |
Designing a Novel Temperature- and Noncanonical Amino Acid-Controlled Biological Logic Gate in Escherichia coli
2024-08-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00423
PMID:39110782
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研究论文 | 本研究在大肠杆菌中设计了一种新型温度和非常规氨基酸控制的生物逻辑门 | 利用外源aaRS/tRNA对在高温下引起的温度敏感性，构建了响应BzF和低温的双输入AND逻辑门 | 对外源aaRS/tRNA对的潜在副作用了解有限 | 研究外源aaRS/tRNA对基因表达的影响并构建生物逻辑门 | 大肠杆菌DH10β Δ菌株 | 合成生物学 | NA | 遗传密码扩展技术、双杂交系统 | NA | 基因表达数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌 | AND逻辑门、利用分支酸变位酶和腺苷酸环化酶分裂亚基构建的传感系统 | 工业生物技术 |
| 950 | 2025-10-05 |
Promoting efficient synthesis and customization of sphingans based on metabolic engineering and synthetic biology strategies
2025-Sep-01, Carbohydrate polymers
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.carbpol.2025.123734
PMID:40441843
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综述 | 本文综述了基于代谢工程和合成生物学策略促进鞘聚糖高效合成与定制的方法 | 结合基因组代谢网络模型和CRISPR等高效工具调控代谢途径，通过分子量调控和可控取代基修饰实现鞘聚糖定制 | 野生型菌株研究背景不清晰及复杂合成路径等限制因素尚未完全解决 | 解决鞘聚糖生产能力受限和设计难题，实现高性能鞘聚糖的高效合成与定制 | 鞘聚糖（外多糖）及其生产菌株 | 合成生物学 | NA | 经典诱变、高通量筛选、CRISPR | 基因组代谢网络模型(GSMM) | NA | NA | CRISPR | 底盘细胞 | 代谢途径调控、分子量调控、取代基修饰 | 工业生物技术 |
| 951 | 2025-10-05 |
The bacterial symbionts of Entomopathogenic nematodes and their role in symbiosis and pathogenesis
2025-Jul, Journal of invertebrate pathology
IF:3.6Q1
DOI:10.1016/j.jip.2025.108295
PMID:40032241
|
综述 | 本文总结了昆虫病原线虫与其细菌共生体之间的共生关系，重点关注它们的适应性和利用昆虫宿主的能力，并回顾了天然产物研究的历史 | 系统总结了昆虫病原线虫-细菌共生体-昆虫三方伙伴关系的研究进展，并强调了利用合成生物学方法改进天然产物生物活性的最新方法 | NA | 研究昆虫病原线虫与其细菌共生体之间的共生关系和致病机制 | 昆虫病原线虫(Steinernema和Heterorhabditis属)及其细菌共生体(Xenorhabdus和Photorhabdus属) | 微生物学 | NA | 合成生物学方法、高通量技术 | NA | NA | NA | NA | 昆虫病原线虫、Xenorhabdus细菌、Photorhabdus细菌 | NA | 农业、生物防治 |
| 952 | 2025-10-05 |
Engineering nitrogen and carbon fixation for next-generation plants
2025-Jun, Current opinion in plant biology
IF:8.3Q1
DOI:10.1016/j.pbi.2025.102699
PMID:40056871
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综述 | 本文探讨利用合成生物学技术优化植物固氮和固碳机制以培育新一代作物 | 整合定向进化、人工智能引导的酶设计和代谢工程来优化植物固氮固碳途径，并探索在极端环境的应用潜力 | NA | 通过工程化改造提升植物氮碳获取同化能力，解决全球农业和生态可持续发展挑战 | 植物固氮固碳机制、根瘤菌等固氮微生物、作物光合作用效率 | 合成生物学 | NA | 定向进化, 人工智能引导的酶设计, 代谢工程 | NA | NA | NA | NA | 豆科作物, 非豆科作物, 根瘤菌, 固氮细菌 | 固氮途径优化, 固碳循环增强, 源-库关系调控 | 农业, 环境, 太空探索 |
| 953 | 2025-10-05 |
Recent progress on glucose dehydrogenase: multifaceted applications in industrial biocatalysis, cofactor regeneration, glucose sensors, and biofuel cells
2025-Jun, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.143842
PMID:40319965
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综述 | 本文总结了葡萄糖脱氢酶在分子工程、固定化策略及生物传感器、生物催化和生物燃料电池等领域的最新研究进展 | 重点关注通过分子工程和新型固定化技术提升酶性能，并拓展其在生物传感、生物催化和生物能源等领域的应用 | NA | 总结葡萄糖脱氢酶的最新研究进展和应用前景 | 葡萄糖脱氢酶及其应用 | 合成生物学 | NA | 分子工程、固定化技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学,工业生物技术,能源 |
| 954 | 2025-10-05 |
Towards establishing functional nitrogenase activities within plants
2025-May-28, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.04.020
PMID:40441921
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研究论文 | 探讨在植物中建立功能性固氮酶活性的挑战与前景 | 利用合成生物学和人工智能设计在非豆科植物中重构固氮酶，并探索在酵母线粒体低氧环境下工程化固氮酶 | 固氮酶的氧敏感性、金属簇组装复杂性及高能量需求尚未完全解决 | 开发具有自主固氮能力的非豆科作物以减少化肥依赖 | 固氮酶在植物体系中的功能重建 | 合成生物学 | NA | 合成生物学, 人工智能驱动设计 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌, 酵母 | 固氮酶重构, 线粒体低氧表达系统 | 农业 |
| 955 | 2025-10-05 |
Deep mutational scanning and CRISPR-engineered viruses: tools for evolutionary and functional genomics studies
2025-May-27, mSphere
IF:3.7Q2
DOI:10.1128/msphere.00508-24
PMID:40272173
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综述 | 本文综述了深度突变扫描和CRISPR基因编辑技术在病毒基因组研究中的应用 | 整合深度突变扫描与CRISPR技术，实现对病毒基因组的精准操作和功能表征 | NA | 探讨病毒进化分子机制及疫苗和治疗策略开发 | 病毒基因组和病毒蛋白 | NA | NA | 深度突变扫描, CRISPR基因编辑, 测序技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | NA | NA | 医学 |
| 956 | 2025-10-05 |
Innovations, Challenges and Future Directions of T7RNA Polymerase in Microbial Cell Factories
2025-05-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00139
PMID:40209062
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综述 | 全面探讨T7RNA聚合酶在微生物细胞工厂中的应用、挑战与未来发展方向 | 突破以往仅关注分子结构与功能的研究局限，提供T7RNAP变体的综合应用指南并强调工程化改造的最新进展 | NA | 优化微生物细胞工厂的转录系统并推动可持续生物生产 | T7RNA聚合酶及其工程化变体 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 微生物细胞工厂 | 精细调控的电路设计 | 工业生物技术 |
| 957 | 2025-10-05 |
Streamlining tRNA-Synthetase Evolution for Genetic Code Expansion and Deep Sequencing Analyses of Its Evolved Variants
2025-05-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00117
PMID:40231936
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研究论文 | 本研究开发了一种简化的定向进化系统，用于提高吡咯赖氨酰-tRNA合成酶的活性，以促进遗传密码扩展 | 开发了仅需基础实验室设备的简化定向进化系统，通过串联密码子随机化策略发现PylRS的叠加突变效应 | NA | 提高非经典氨基酸掺入效率，优化遗传密码扩展技术 | 吡咯赖氨酰-tRNA合成酶及其定向进化变体 | 合成生物学 | NA | 定向进化，深度测序，串联密码子随机化 | NA | 测序数据，酶活性数据 | 针对三种不同底物进化的PylRS变体 | 定向进化 | NA | 正交tRNA和氨基酸酰-tRNA合成酶对 | 医学，工业生物技术 |
| 958 | 2025-10-05 |
RT-EZ: A Golden Gate Assembly Toolkit for Streamlined Genetic Engineering of Rhodotorula toruloides
2025-05-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00848
PMID:40232996
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研究论文 | 开发了基于Golden Gate组装技术的RT-EZ工具包，用于简化圆红冬孢酵母的基因工程操作 | 首次开发了专门针对圆红冬孢酵母的Golden Gate组装工具包，包含双向启动子、2A肽、RFP颜色筛选等新特性，可单次组装反应构建四基因表达盒 | NA | 解决圆红冬孢酵母因高GC含量和缺乏复制型质粒导致的基因操作困难 | 圆红冬孢酵母 | 合成生物学 | NA | Golden Gate组装 | NA | NA | NA | Golden Gate Assembly | Rhodotorula toruloides | 多基因表达盒，包含脂肪酸延伸酶和去饱和酶共表达系统 | 工业生物技术, 医药, 能源 |
| 959 | 2025-10-05 |
Genome Reduction Improves Recombinant Benzoxazole Production in Myxococcus xanthus
2025-05-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00114
PMID:40257411
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研究论文 | 本研究通过基因组缩减策略提高粘球菌中重组苯并噁唑类天然产物的产量 | 首次证明在粘球菌中连续移除生物合成基因簇可显著提高重组天然产物产量，并发现某些BGC组合删除会导致细胞不可存活 | 未明确说明具体删除了哪些BGC及其对细胞生理的全面影响 | 研究基因组缩减对粘球菌生物技术性能的影响 | 粘球菌（Myxococcus xanthus） | 合成生物学 | NA | 基因组工程 | NA | NA | NA | 基因组删除 | 粘球菌（Myxococcus xanthus） | 重组苯并噁唑生物合成途径 | 工业生物技术 |
| 960 | 2025-10-05 |
Insight into Optogenetics for Diabetes Management
2025-05-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00549
PMID:40279455
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综述 | 本文概述了光遗传学在糖尿病管理中的应用，重点探讨了通过光控技术实现胰岛素分泌的方法 | 将光遗传学作为合成生物学方法应用于糖尿病管理，实现用户通过光控远程调节激素分泌 | 需要进一步研究照射参数、红移视蛋白和宿主细胞相互作用 | 探索光遗传学在糖尿病治疗中的应用潜力 | 胰腺细胞、非胰腺细胞、小鼠模型 | 合成生物学 | 糖尿病 | 光遗传学、基因工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, 基因工程 | 小鼠、高等动物细胞 | 光敏蛋白表达系统、胰岛素分泌通路调控 | 医学 |