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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 941 | 2025-12-15 |
Forged in O2: Transition metal ions and the rise of aerobic life
2026-Feb, Journal of inorganic biochemistry
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.jinorgbio.2025.113147
PMID:41265342
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综述 | 本文综述了金属离子在需氧生命演化中的核心作用,探讨了金属蛋白如何调控和利用氧气,并连接了生物无机化学、酶学、合成生物学和微生物组科学等多个领域 | 通过整合生物无机化学、合成生物学和微生物组科学的多学科视角,系统阐述了金属离子在氧气化学中的关键角色,为理解健康代谢和氧化应激相关疾病提供了基础 | NA | 探讨金属离子在需氧生命演化及氧气化学中的核心作用,以理解健康代谢和氧化应激相关疾病 | 金属离子、金属蛋白、需氧生命系统 | 生物无机化学 | 氧化应激相关疾病 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 942 | 2025-12-15 |
Bacterial Cellulose for Sustainable Food Packaging: Production Pathways, Structural Design, and Functional Modification Strategies
2025-Nov-28, Polymers
IF:4.7Q1
DOI:10.3390/polym17233165
PMID:41374852
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综述 | 本文综述了细菌纤维素在可持续食品包装领域的生产途径、结构设计及功能改性策略 | 系统总结了通过合成生物学、绿色化学和材料工程等方法对细菌纤维素进行原位和异位功能化的最新进展,以增强其机械、阻隔、抗氧化和抗菌性能 | 面临生产成本高、发酵周期长以及监管不确定性等挑战 | 探讨细菌纤维素作为石油基塑料替代品,在可持续食品包装中的应用潜力 | 细菌纤维素及其复合材料 | 材料科学 | NA | 微生物发酵、合成生物学、绿色化学、材料工程 | NA | 文献数据 | NA | NA | Komagataeibacter属及相关菌属 | NA | 食品包装 |
| 943 | 2025-12-15 |
From pandemics to preparedness: harnessing AI, CRISPR, and synthetic biology to counter biosecurity threats
2025, Frontiers in public health
IF:3.0Q2
DOI:10.3389/fpubh.2025.1711344
PMID:41383331
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综述 | 本文综述了如何整合人工智能、CRISPR和合成生物学等新兴技术,以应对生物安全威胁并增强全球卫生安全准备 | 提出了一个整合多种前沿技术(AI、CRISPR、合成生物学、数字流行病学等)与公平政策、国际合作相结合的综合框架,以构建面向未来的弹性生物安全防御系统 | 文中提及的创新技术存在伦理、法律和公平性方面的挑战,且其大规模应用和可及性仍需解决 | 探讨如何利用新兴科技提升对生物安全威胁(包括自然暴发、实验室事故和生物恐怖主义)的预防、检测和响应能力 | 生物安全威胁及其应对技术 | NA | NA | 人工智能、下一代测序、CRISPR诊断、数字流行病学、mRNA/DNA疫苗平台、单克隆抗体、纳米抗体疗法 | NA | NA | NA | CRISPR | NA | NA | 医学 |
| 944 | 2025-12-14 |
Bacillus velezensis LoaP promotes antitermination by antagonizing NusA
2025-Dec-10, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.01429-25
PMID:41147751
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研究论文 | 本研究揭示了芽孢杆菌NusG同源蛋白LoaP通过特异性拮抗转录因子NusA来促进转录抗终止的分子机制 | 首次在革兰氏阳性细菌中解析了LoaP类NusG同源蛋白的抗终止复合物机制,证明其仅需拮抗NusA即可发挥作用,无需其他因子,这与已知的RfaH范式显著不同 | 研究主要基于体外重建实验,体内生理环境下的调控网络可能更为复杂 | 探究NusG同源蛋白LoaP在细菌转录抗终止中的分子机制 | Bacillus velezensis LoaP蛋白及其调控的difficidin抗生素合成操纵子 | 分子生物学 | NA | RNA聚合酶纯化、转录因子重建、体外转录分析 | NA | 生化实验数据 | NA | NA | Bacillus velezensis(作为研究对象的来源菌) | NA | 合成生物学、天然产物发现 |
| 945 | 2025-12-14 |
An Engineered Probiotic Consortium Based on Quorum-Sensing for Colorectal Cancer Immunotherapy
2025-Dec, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202512744
PMID:40999885
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研究论文 | 本研究设计了一种基于群体感应的工程化益生菌联合体,用于结直肠癌免疫治疗 | 开发了能够整合多种肿瘤微环境信号并通过正交群体感应系统协调多治疗载荷释放的工程化益生菌联合体 | NA | 开发用于癌症治疗的工程化活体生物治疗产品 | 工程化益生菌联合体及其在结直肠癌免疫治疗中的应用 | 合成生物学 | 结直肠癌 | 合成生物学、群体感应系统 | NA | NA | 使用hPD-L1 MC38肿瘤的人源化PD-1小鼠模型和HT-29肿瘤的人源化外周血单个核细胞小鼠模型 | 合成生物学 | 益生菌 | 正交群体感应系统,能够响应pH值、缺氧和高乳酸水平三种肿瘤微环境参数,控制乳酸消耗酶和PD-L1纳米抗体的释放 | 医学 |
| 946 | 2025-12-14 |
Investigating DNA words and their distributions across the tree of life
2025, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2025.11.040
PMID:41377119
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研究论文 | 本研究系统分析了超过22.5万个跨越生命三域及病毒基因组的k-mer频率分布,发现Zipf定律在建模k-mer分布时表现不佳,并提出截断幂律和Zipf-Mandelbrot分布作为更优的替代模型 | 首次在大规模跨物种基因组数据中系统验证Zipf定律的适用性,并提出更优的统计分布模型;开发了基于k-mer分布评估人工基因组生物学合理性的新方法 | 未深入探讨特定生物过程(如选择压力、突变偏好)对k-mer分布的具体影响机制 | 探究DNA k-mer在生命之树中的分布规律及其演化意义 | 225,000+个涵盖生命三域(细菌、古菌、真核生物)及病毒的基因组组装 | 计算生物学 | NA | k-mer频谱分析、统计建模、基因组模拟 | 截断幂律分布、Zipf-Mandelbrot分布、Heaps定律、深度生成语言模型 | 基因组序列数据 | 超过225,000个基因组组装 | NA | NA | NA | 合成生物学、进化序列分析 |
| 947 | 2025-12-14 |
Cyanobacteriochromes: A Rainbow of Photoreceptors
2024-11, Annual review of microbiology
IF:8.5Q1
|
综述 | 本文综述了蓝藻色素(CBCRs)的光谱调谐、光转换和光生物学特性,以及它们在合成生物学中的应用进展 | 探讨了CBCRs从近紫外到近红外的广泛光循环多样性,并分析了其在合成生物学中的新兴应用 | NA | 研究蓝藻色素的光感受机制及其在光生物学和合成生物学中的作用 | 蓝藻色素(CBCRs)蛋白及其相关的光感受和信号转导过程 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 蓝藻 | 光感受器系统,包括光转换和信号输出域(如组氨酸激酶双域)的调控 | 合成生物学 |
| 948 | 2025-12-13 |
In conversation with Nigel Scrutton
2021-03, The FEBS journal
DOI:10.1111/febs.15632
PMID:33373117
|
访谈 | 本文是对分子酶学和生物物理化学专家Nigel Scrutton教授的访谈,探讨了他在酶工程、合成生物学和生物制造领域的贡献及职业发展历程 | NA | NA | 分享酶催化机制基础研究如何推动生物技术和生物制造的关键进展,并探讨学术生涯发展经验 | 酶催化机制、合成生物学应用、生物制造技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 生物技术、生物制造 |
| 949 | 2025-12-13 |
Introduction to the supplement
2015-Jun-08, Vaccine
IF:4.5Q2
DOI:10.1016/j.vaccine.2015.02.072
PMID:26022560
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综述 | 本文介绍了2014年7月在意大利锡耶纳举行的“增强疫苗免疫力和价值”研讨会的背景、讨论焦点及汇编内容 | 汇集了利用免疫学、结构生物学、合成生物学和基因组学等前沿技术改进疫苗效能的突破性思路,并探讨了实现新型疫苗潜力的非技术性挑战 | NA | 探讨如何应对未来疾病目标的疫苗研发与实施挑战,提升疫苗对感染性疾病、癌症及慢性病的保护效力 | 疫苗(特别是佐剂)在儿童、成人及老年人群中的应用 | NA | 感染性疾病、癌症、慢性病 | 免疫学、结构生物学、合成生物学、基因组学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 950 | 2025-12-12 |
Living materials for gas therapy
2026-Jan, Advanced drug delivery reviews
IF:15.2Q1
DOI:10.1016/j.addr.2025.115738
PMID:41248756
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综述 | 本文系统总结了基于活体材料的气体疗法最新进展,重点按生物来源和工程设计原则分类,并讨论了其在癌症、炎症性疾病和组织再生中的治疗机制与疗效 | 提出活体材料作为气体疗法的新范式,利用工程化生物实体(如细菌、细胞、藻类)实现智能气体生成和可控释放,克服传统纳米载体的生物相容性、靶向性和响应性不足 | 生物安全性和可扩展性仍是主要挑战 | 推动精准气体医学领域发展,通过整合合成生物学和多模式治疗策略优化气体疗法 | 一氧化氮、一氧化碳、硫化氢、氢气和二氧化硫等医用气体 | NA | 癌症、炎症性疾病 | 合成生物学、基因编程、仿生工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 细菌、细胞、藻类 | 生物传感器、代谢途径、逻辑门、振荡器 | 医学 |
| 951 | 2025-12-12 |
Rooted intelligence: Integrating AI, Omics, and Synthetic biology to engineer the plant microbiome
2026-Jan, 3 Biotech
IF:2.6Q3
DOI:10.1007/s13205-025-04614-w
PMID:41376894
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综述 | 本文综述了整合组学、合成生物学和人工智能以深化对植物-微生物互作的理解并支持可持续农业的最新进展 | 提出了“根植智能”的概念,将AI、组学和合成生物学整合用于工程化设计植物微生物组,旨在理性设计下一代植物根际促生菌和合成微生物群落 | 将实验室发现转化到田间条件存在挑战,需确保工程微生物的生物安全性,并解决伦理和监管问题 | 通过跨学科技术整合,支持可持续农业并设计适应不同农业生态系统的优化微生物群落 | 植物微生物组、植物-微生物相互作用、根际微生物群落 | 合成生物学、人工智能、农业生物技术 | NA | 组学技术(包括多组学数据整合)、合成生物学、AI驱动的预测建模和实时表型分析 | 预测建模、AI驱动工具 | 多组学数据、表型数据 | NA | 合成生物学工具(用于设计微生物菌株和合成群落) | 植物根际微生物 | 设计具有增强性状(如营养溶解、胁迫耐受、病原抑制)的微生物菌株和合成群落 | 农业、环境 |
| 952 | 2025-12-12 |
Advancements in photosynthetic efficiency: Pathways, regulation, and biotechnological applications for enhancing crop productivity
2025-Dec-31, Plant signaling & behavior
IF:2.8Q2
DOI:10.1080/15592324.2025.2596483
PMID:41346023
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综述 | 本文综述了通过分子、生化和生物物理策略提高光合作用效率的最新进展,重点讨论了调控过程、基因编辑和合成生物学等生物技术应用,以增强作物生产力和气候适应性 | 系统整合了光合作用调控的关键过程与新兴生物技术(如CRISPR/Cas9和合成生物学),提出了通过优化光能利用、改造光呼吸和光保护途径以及工程化C₄和CAM性状来克服长期生化与解剖学限制的创新策略 | NA | 提高作物光合作用效率以增强农业生产力并应对未来全球粮食需求 | 光合作用过程及其调控机制,以及相关的作物改良策略 | NA | NA | 基因组编辑(特别是CRISPR/Cas9)、合成生物学、系统建模、高通量表型分析、多组学分析、计算建模 | NA | NA | NA | CRISPR/Cas9 | C₃作物、C₄作物、CAM作物 | 光合作用途径的理性重设计、C₄和CAM性状工程化、光保护与光呼吸途径改造 | 农业 |
| 953 | 2025-12-12 |
A modular two-component protein cage for spatially organized enzymatic assembly and enhanced metabolic flux
2025-Dec-10, Journal of materials chemistry. B
DOI:10.1039/d5tb01129a
PMID:41250881
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研究论文 | 本文提出了一种模块化的双组分蛋白质笼支架,用于空间组织酶组装并增强代谢通量 | 开发了首个基于正交SpyTag/SpyCatcher和SnoopTag/SnoopCatcher系统的双组分蛋白质笼支架,实现了活细胞内可编程的蛋白质共定位与组装时序控制 | 未在更复杂的代谢途径或多细胞系统中验证支架性能,长期稳定性与规模化应用潜力有待进一步研究 | 构建空间组织化的多酶组装体以增强代谢工程效率 | 双组分蛋白质笼支架I5232及其酶复合物 | 合成生物学 | NA | 蛋白质工程、正交生物共轭系统 | NA | 荧光成像数据、代谢产物定量数据 | NA | SpyTag/SpyCatcher, SnoopTag/SnoopCatcher | 活细胞(未指定具体物种) | 膜靶向肽引导的酶空间定位系统,用于构建类胡萝卜素代谢途径的底物通道 | 代谢工程、工业生物技术 |
| 954 | 2025-12-12 |
Fluoride-Triggered Protein Activation via a Genetically Encoded Tyrosine Analogue
2025-Dec-10, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.5c13604
PMID:41296558
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研究论文 | 本文提出了一种基于基因编码的氟化物响应非经典氨基酸的蛋白质激活平台,用于在活细胞中实现蛋白质活性的时空调控 | 开发了基于二甲基硫代膦酰酪氨酸(DTPY)的基因编码执行器平台,首次实现氟化物触发的蛋白质特异性激活 | NA | 开发一种通用的蛋白质活性时空调控策略 | 超折叠绿色荧光蛋白和Cre重组酶 | 合成生物学 | NA | 基因编码非经典氨基酸技术 | NA | NA | NA | 基因编码技术 | 活细胞 | 氟化物响应型蛋白质开关 | 合成生物学, 细胞工程 |
| 955 | 2025-12-12 |
Synthetic tunable promoters for flexible control of multi-gene expression in mammalian cells
2025-Dec, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2025.02.008
PMID:39938795
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研究论文 | 本研究构建了一个多样化的合成可调启动子库,用于在哺乳动物细胞中灵活控制多基因表达 | 设计了同时包含通用激活位点和特异性激活位点的合成可调启动子,结合CRISPRa系统实现多层级表达控制,并通过大规模平行报告基因检测验证了其正交性和可调性 | NA | 构建合成可调启动子库以实现哺乳动物细胞中多基因表达的灵活控制 | 合成可调启动子及其在哺乳动物细胞多基因系统中的应用 | 合成生物学 | NA | CRISPR激活系统、大规模平行报告基因检测 | NA | 基因表达数据 | 24,960个独特的非冗余启动子 | CRISPR-Cas9 | 哺乳动物细胞 | 包含通用激活位点和特异性激活位点的合成启动子,用于构建多基因表达系统 | 基因治疗、生物技术 |
| 956 | 2025-12-12 |
Receptor dimerization enables ligand discrimination through tunable response heterogeneity
2025-Dec, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1013781
PMID:41336286
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研究论文 | 本文通过数学模型探讨了配体-受体相互作用如何使细胞群体通过响应异质性编码配体身份,揭示了受体二聚化在配体识别中的新机制 | 提出了配体识别可在群体水平通过响应异质性实现的新机制,特别强调了异二聚体受体在调控群体响应异质性中的功能优势 | 研究基于数学模型,可能未完全涵盖体内复杂生物环境的影响,且主要聚焦于特定信号通路如I型干扰素通路 | 探究细胞如何通过信号通路在群体水平区分不同配体信号,以理解免疫调节和组织发育的机制 | 配体-受体相互作用、细胞群体响应异质性、二聚体受体(特别是异二聚体) | NA | NA | 数学模型 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 |
| 957 | 2025-12-12 |
Governing Synthetic Biology: A Co-Evolutionary Framework for Sustainable Innovation
2025-Nov-26, Journal of microbiology and biotechnology
IF:2.5Q3
DOI:10.4014/jmb.2508.08001
PMID:41309363
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综述 | 本文回顾了合成生物学的发展历程,分析了其面临的监管与政策挑战,并基于经合组织的框架提出了一个促进技术与制度框架共同演化的“协同演化”治理模型 | 提出了一个基于经合组织“新兴技术预见性治理框架”的“协同演化”模型,强调研发、战略情报、社会信任构建、敏捷监管和国际合作五个关键要素的协同 | 本文是一篇综述性文章,主要进行理论分析和框架构建,未涉及具体的实验验证或案例数据 | 探讨如何通过协同治理框架,使合成生物学的技术发展与社会制度、监管及公众接受度同步,以实现可持续创新 | 合成生物学领域的整体发展、监管政策框架及社会接受度 | NA | NA | NA | 协同演化模型 | NA | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术 |
| 958 | 2025-12-12 |
A stable and antibiotic-free plasmid expression system for Salmonella typhimurium VNP20009 in tumor therapy
2025-Nov-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.113863
PMID:41362775
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研究论文 | 本研究为鼠伤寒沙门氏菌VNP20009开发了一种稳定且无抗生素的质粒表达系统,用于肿瘤治疗 | 通过比较不同复制子、转录控制和稳定模块,构建了无抗生素依赖的质粒平台,利用axe/txe毒素-抗毒素系统实现质粒稳定保留,并实现超过100倍的基因表达动态调控 | 研究仅在鼠类肿瘤模型(LLC和B16F10)中测试,未涉及其他肿瘤类型或更广泛的体内环境 | 开发用于肿瘤基因治疗的稳定无抗生素质粒表达系统 | 鼠伤寒沙门氏菌VNP20009作为肿瘤靶向载体 | 合成生物学 | 肿瘤 | 质粒工程、毒素-抗毒素系统 | NA | NA | 鼠类肿瘤模型(LLC和B16F10) | Gibson Assembly, BioBrick | Salmonella typhimurium VNP20009 | 质粒表达系统,包含复制子、可调启动子-RBS组合和axe/txe毒素-抗毒素稳定模块 | 医学 |
| 959 | 2025-12-12 |
A Computational Framework for Optimal and Model Predictive Control of Stochastic Gene Regulatory Networks
2025 Nov-Dec, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBBIO.2025.3598449
PMID:40911462
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研究论文 | 本文开发了一个用于随机基因调控网络的最优和模型预测控制的计算框架,旨在高效管理分子噪声并精确调控细胞群体行为 | 通过部分积分-微分方程高效近似化学主方程,实现高计算效率、精确控制概率密度函数以微调细胞群体复杂行为,并稳健处理内在分子噪声 | NA | 为合成生物学中随机生物分子系统的精确控制提供高效计算框架 | 随机基因调控网络 | 计算生物学 | NA | 部分积分-微分方程近似、伴随优化方法 | 模型预测控制 | NA | NA | NA | NA | 诱导基因调控回路 | 合成生物学 |
| 960 | 2025-12-12 |
A comprehensive review on electrically modulated transport of soft, multiphase systems in microflow: Perspectives on drops and vesicles
2025-May, Biomicrofluidics
IF:2.6Q2
DOI:10.1063/5.0254950
PMID:40488123
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综述 | 本文全面综述了在微流控系统中,利用外部电场调控软物质多相系统(如液滴和囊泡)的传输动力学 | 系统性地探讨了电场强度、流体性质与膜特性之间的耦合作用,并强调了囊泡双层脂膜带来的独特动力学行为,为下一代微流控设备设计提供了新视角 | NA | 研究电场如何调控软物质多相系统在微流控通道中的传输行为,以优化其操控与应用 | 软物质多相系统,特别是液滴和囊泡 | NA | NA | 高精度成像、微操控、复杂计算建模 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 药物递送、合成生物学、材料制造、芯片实验室平台、生物分析工具 |