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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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961 | 2024-10-20 |
Long oligodeoxynucleotides: chemical synthesis, isolation via catching-by-polymerization, verification via sequencing, and gene expression demonstration
2023, Beilstein journal of organic chemistry
IF:2.2Q2
DOI:10.3762/bjoc.19.146
PMID:38170048
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研究论文 | 本文报道了一种直接从头化学合成400个核苷酸的寡脱氧核苷酸(ODN)的方法,并通过捕获-聚合(CBP)方法从复杂的反应混合物中分离这些ODN | 本文提出了一种新的化学合成方法,能够合成包含长重复序列或稳定二级结构的基因和基因组,这是现有技术难以实现的 | NA | 开发一种新的化学合成方法,用于合成包含长重复序列或稳定二级结构的基因和基因组 | 400个核苷酸的寡脱氧核苷酸(ODN)及其在绿色荧光蛋白(GFP)基因表达中的应用 | 合成生物学 | NA | 捕获-聚合(CBP)方法、Sanger测序、Gibson组装 | NA | DNA序列 | 400个核苷酸的ODN、399和401个核苷酸的ODN、800个核苷酸的GFP基因构建体 |
962 | 2024-10-19 |
Enhancers: A Focus on Synthetic Biology and Correlated Gene Expression
2024-Oct-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00244
PMID:39276360
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综述 | 本文综述了增强子在调控后生动物转录中的作用,并探讨了合成生物学在解析增强子功能机制中的应用 | 本文通过合成报告基因系统量化增强子生物学的动态变化,揭示了增强子在基因组环境和与其他增强子组合中的功能机制 | NA | 探讨增强子功能机制及其在基因表达调控中的作用 | 增强子及其在基因组环境中的功能 | 合成生物学 | NA | 合成报告基因 | NA | 基因表达数据 | NA |
963 | 2024-10-19 |
Rational Design of High-Efficiency Synthetic Small Regulatory RNAs and Their Application in Robust Genetic Circuit Performance Through Tight Control of Leaky Gene Expression
2024-Oct-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00323
PMID:39294875
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研究论文 | 研究通过优化合成小调控RNA(sRNA)的设计参数,提高其在基因表达调控中的效率,并应用于遗传电路的鲁棒性控制 | 开发了优化合成sRNA设计参数的策略,有效解决了基因表达泄漏问题,提高了遗传电路的可靠性 | NA | 研究提高合成sRNA效率的理性设计策略,并验证其在遗传电路中的应用 | 合成小调控RNA(sRNA)及其在遗传电路中的应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
964 | 2024-10-19 |
Modular Cloning Tools for Streptomyces spp. and Application to the De Novo Biosynthesis of Flavokermesic Acid
2024-Oct-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00412
PMID:39307986
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研究论文 | 本文介绍了一种用于链霉菌属的模块化克隆工具,并展示了其在合成黄酮霉素酸生物合成途径中的应用 | 开发了一种模块化系统(MoClo),用于链霉菌属的多组分基因簇的从头组装 | 目前受限于合成生物学工具的相对匮乏 | 开发适用于链霉菌属的合成生物学工具,并验证其在异源表达中的应用 | 链霉菌属的基因簇组装和黄酮霉素酸的生物合成 | 合成生物学 | NA | 模块化克隆(MoClo) | NA | 基因序列 | 使用了β-葡萄糖苷酸酶(GusA)报告系统进行功能验证 |
965 | 2024-10-19 |
Efficient Simulation of Viral Transduction and Propagation for Biomanufacturing
2024-Oct-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00227
PMID:39315883
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研究论文 | 本文介绍了vitraPro软件工具包,用于模拟病毒转导和传播过程,优化基于转导的生物制造平台和病毒扩增过程 | 提出了一个多尺度模型和高效的数值技术,能够模拟多达两种病毒的感染和传播过程,并考虑了病毒在裂解期或溶原期的状态 | NA | 优化基于病毒转导的生物制造平台和病毒扩增过程 | 病毒转导和传播过程 | 合成生物学 | NA | 多尺度模型 | NA | NA | NA |
966 | 2024-10-19 |
Characterizing and Engineering Rhamnose-Inducible Regulatory Systems for Dynamic Control of Metabolic Pathways in Streptomyces
2024-Oct-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00626
PMID:39377938
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研究论文 | 研究通过生物信息学分析和合成生物学策略,构建了鼠李糖诱导的调控系统,用于动态控制链霉菌中的代谢途径 | 本研究揭示了鼠李糖代谢途径的调控机制,并成功构建了鼠李糖诱导的调控系统,可广泛应用于多种链霉菌属物种 | NA | 开发有效的基因诱导系统,用于合成生物技术应用中的基因表达精细调控 | 链霉菌属物种中的鼠李糖代谢途径及其调控机制 | 合成生物学 | NA | 电泳迁移率变动分析(EMSA) | NA | 序列 | 多个链霉菌属物种 |
967 | 2024-10-19 |
Biosynthesis of Natural and Unnatural Perylenequinones for Drug Development
2024-Oct-16, ChemMedChem
IF:3.6Q2
DOI:10.1002/cmdc.202400295
PMID:38943237
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综述 | 本文综述了天然和非天然苝醌的生物合成途径及其在药物开发中的应用 | 介绍了通过合成生物学策略进行结构修饰和大规模生物生产天然和非天然苝醌的最新进展 | 缺乏高效且成本效益高的方法来获得这些化合物并引入结构多样性和复杂性 | 促进苝醌类化合物在光动力疗法中的研究和应用 | 天然和非天然苝醌及其衍生物 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
968 | 2024-10-19 |
Transcriptional memory formation: Battles between transcription factors and repressive chromatin
2024-Oct-16, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2024.09.008
PMID:39419001
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研究论文 | 本文探讨了转录因子与抑制性染色质在转录记忆形成中的相互作用 | 揭示了转录因子与抑制性染色质在巩固转录记忆中的关键相互作用 | NA | 研究转录记忆的形成机制 | 转录因子与抑制性染色质的相互作用 | NA | NA | 合成生物学方法 | NA | NA | NA |
969 | 2024-10-19 |
Templated Pluripotent Stem Cell Differentiation via Substratum-Guided Artificial Signaling
2024-Oct-14, ACS biomaterials science & engineering
IF:5.4Q2
DOI:10.1021/acsbiomaterials.4c00885
PMID:39352143
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研究论文 | 本文介绍了一种结合细胞工程和生物材料设计的平台,用于在多能干细胞中实现人工信号传导 | 该平台利用可编程生物材料,通过正交信号传导激活多能干细胞中的形态发生素生产,从而在空间受限的方式下启动形态发生程序 | NA | 探索驱动多能干细胞分化的分子机制 | 多能干细胞的分化过程 | 合成生物学 | NA | 人工信号传导 | NA | NA | NA |
970 | 2024-10-19 |
Rewiring native post-transcriptional global regulators to achieve designer, multi-layered genetic circuits
2024-Oct-09, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-52976-1
PMID:39384772
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研究论文 | 本文开发了一种通过重构大肠杆菌的碳储存调节(Csr)网络来实现复杂转录后控制的工程方法 | 通过重新设计RNA-蛋白质相互作用,创建了一个包含12个BUFFER门的遗传工具箱,并开发了Csr调节的NOT门和多层逻辑电路 | NA | 开发能够实现多样化调控结果的“拖放”调控工具 | 大肠杆菌的碳储存调节(Csr)网络 | 合成生物学 | NA | RNA-蛋白质相互作用工程 | NA | NA | 涉及三种工业相关细菌 |
971 | 2024-09-30 |
Advances in synthetic biology
2024-Oct, SLAS technology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.slast.2024.100197
PMID:39341458
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
972 | 2024-10-19 |
De Novo Synthesis of Error-Free Long Oligos
2024-Oct, Current protocols
DOI:10.1002/cpz1.70028
PMID:39422193
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研究论文 | 描述了一种合成长达401个核苷酸的寡核苷酸的方法,并通过聚合捕获法(CBP)分离和克隆测序选择无错误序列 | 提出了通过聚合捕获法(CBP)和克隆测序选择无错误序列的新方法,解决了现有技术无法解决的替换、删除和添加错误问题 | NA | 开发一种合成无错误长寡核苷酸的新方法,适用于蛋白质工程和合成生物学等领域 | 长寡核苷酸的合成、分离和无错误序列的选择 | NA | NA | 聚合捕获法(CBP)、克隆测序 | NA | NA | NA |
973 | 2024-10-19 |
Identification and Characterization of an R-M System in Paracoccus denitrifican DYTN-1 to Improve the Plasmid Conjugation Transfer Efficiency
2024-Sep-28, Journal of microbiology and biotechnology
IF:2.5Q3
DOI:10.4014/jmb.2402.02041
PMID:39155392
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研究论文 | 本文研究了Paracoccus denitrifican DYTN-1菌株中的R-M系统,并通过人工改造质粒提高其接合转移效率 | 首次鉴定并表征了DYTN-1菌株中的R-M系统,开发了质粒人工改造方法显著提高了接合转移效率 | NA | 提高DYTN-1菌株的质粒接合转移效率,增强其基因编辑能力 | Paracoccus denitrifican DYTN-1菌株及其R-M系统 | 合成生物学 | NA | 质粒人工改造 | NA | DNA | 1株菌株 |
974 | 2024-10-17 |
An integrated engineering worldview of synthetic biology education through the lens of webinar based pedagogy
2024, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2024.1431374
PMID:39411056
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研究论文 | 本文探讨了通过基于网络研讨会的教学方法,整合合成生物学教育的工程世界观 | 本文介绍了iGEM非营利组织在2020年COVID疫情期间启动的网络研讨会系列,该系列成功吸引了学生,并提供了全球可访问的教学方法 | NA | 探讨如何通过网络研讨会教学方法,促进合成生物学教育的发展 | 合成生物学教育及其教学方法 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
975 | 2024-10-19 |
LcSAO1, an Unconventional DOXB Clade 2OGD Enzyme from Ligusticum chuanxiong Catalyzes the Biosynthesis of Plant-Derived Natural Medicine Butylphthalide
2023-Dec-13, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms242417417
PMID:38139246
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研究论文 | 研究了川芎中一种非传统的DOXB Clade 2OGD酶LcSAO1在植物源天然药物丁苯酞生物合成中的作用 | 发现了LcSAO1酶在丁苯酞生物合成中的关键作用,并通过结构建模和定点突变揭示了其活性位点 | 研究主要集中在酶的鉴定和功能验证,未涉及完整的生物合成途径 | 揭示丁苯酞生物合成途径中的关键酶及其作用机制 | 川芎中的LcSAO1酶及其在丁苯酞生物合成中的作用 | 生物化学 | 中风 | 2-OGD酶分析 | NA | 转录组数据 | 多个川芎组织样本 |
976 | 2024-10-19 |
Advances in the Discovery and Engineering of Gene Targets for Carotenoid Biosynthesis in Recombinant Strains
2023-12-05, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom13121747
PMID:38136618
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综述 | 本文综述了类胡萝卜素生物合成途径及其在重组菌株中的基因靶点发现与工程化 | 本文总结了影响类胡萝卜素产量的基因靶点及其在重组菌株中的应用潜力 | NA | 探讨类胡萝卜素生物合成途径中的基因靶点及其在重组菌株中的应用 | 类胡萝卜素生物合成途径中的基因靶点 | 代谢工程 | NA | 代谢工程 | NA | 基因 | NA |
977 | 2024-10-19 |
A Synthetic Signaling Network Imitating the Action of Immune Cells in Response to Bacterial Metabolism
2023-Aug, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202301562
PMID:37156014
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研究论文 | 本文设计了一种合成信号网络,模拟免疫细胞对细菌代谢的反应 | 通过设计响应性DNA颗粒和抗生素负载脂质囊泡的协作行动,模拟了免疫细胞对病原体的捕获和失活过程 | NA | 探索合成生物学中复杂生物行为的复制 | 合成信号网络、响应性DNA颗粒、抗生素负载脂质囊泡 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
978 | 2024-10-19 |
Synthetic microbes and biocatalyst designs in Thailand
2023, Biotechnology notes (Amsterdam, Netherlands)
DOI:10.1016/j.biotno.2023.02.003
PMID:39416912
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综述 | 本文对泰国在过去十年中进行的合成生物学相关学术研究进行了批判性回顾 | 本文讨论了支持未来BCG合成生物学发展的技术领域,如酶催化、酶工程和与培养条件相关的系统生物学 | NA | 进一步推动泰国合成生物学领域的发展 | 泰国在合成生物学领域的研究,包括基因操作、代谢工程、辅因子增强以生产有价值的化学品,以及使用系统生物学分析合成细胞 | 合成生物学 | NA | 基因操作、代谢工程、酶催化、酶工程、系统生物学 | NA | NA | NA |
979 | 2024-10-19 |
Synthetic biology in Indonesia: Potential and projection in a country with mega biodiversity
2023, Biotechnology notes (Amsterdam, Netherlands)
DOI:10.1016/j.biotno.2023.02.002
PMID:39416916
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综述 | 本文概述了合成生物学在印度尼西亚的发展,特别是利用其丰富的生物多样性 | 探讨了合成生物学在解决国家问题中的潜力,并展望了其在印度尼西亚的未来发展 | 简要提及了发展过程中可能遇到的挑战 | 探讨合成生物学在印度尼西亚的潜力和未来发展 | 印度尼西亚的生物多样性和合成生物学应用 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
980 | 2024-10-19 |
SynBio Africa's story from the grassroots, the present, and the future
2023, Biotechnology notes (Amsterdam, Netherlands)
DOI:10.1016/j.biotno.2022.11.003
PMID:39416917
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研究论文 | 本文介绍了SynBio Africa的愿景及其在非洲推广合成生物技术、产品和服务的途径 | 提出了在非洲建立首个合成生物学卓越中心的建议,并设定了六个主题 | 非洲关于合成生物学及其监管政策的信息非常有限 | 推动非洲合成生物学技术的发展,促进国家发展 | 合成生物学在非洲的应用,包括生物经济、创新药物、减少污染和增加作物产量 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |