合成生物学相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
961	2024-10-21	Engineering strategies for enhanced heterologous protein production by Saccharomyces cerevisiae 2024-Jan-22, Microbial cell factories IF:4.3Q1 DOI:10.1186/s12934-024-02299-z PMID:38247006	综述	本文综述了利用酿酒酵母生产异源蛋白的工程策略	总结了最新的异源蛋白产量提高的技术进展，包括蛋白质超表达系统、蛋白质分泌工程、糖基化途径工程和系统代谢工程	构建一个通用的酵母底盘用于高效蛋白质生产仍然是一个挑战	探讨提高酿酒酵母异源蛋白产量的策略	酿酒酵母及其异源蛋白生产	生物工程	NA	合成生物学工具和代谢工程策略	NA	NA	NA
962	2024-10-21	Cell surface sculpting using logic-gated protein actuators 2023-Dec-18, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2023.12.18.572113 PMID:38187604	研究论文	本文介绍了一种基于邻近门控蛋白剪接的自主决策蛋白质装置，能够在细胞表面执行多种布尔逻辑操作	开发了一种可编程的分子系统，能够整合多个细胞表面特征，将目标输入转换为用户定义的输出	NA	探索细胞表面特征的差异，开发可编程的分子系统用于选择性靶向特定细胞	细胞表面特征和蛋白质装置	合成生物学	NA	邻近门控蛋白剪接	NA	蛋白质	NA
963	2024-10-21	Cell-free expression of RuBisCO for ATP production in the synthetic cells 2023, Synthetic biology (Oxford, England) DOI:10.1093/synbio/ysad016 PMID:38149045	研究论文	研究在合成细胞中通过RuBisCO的细胞外表达实现ATP生产	首次测试了RuBisCO在细胞外表达系统中的表达及其活性介导的ATP合成	尚未实现完全独立的能量生产	探索在合成细胞中实现持续生物能量生产的可能性	RuBisCO酶及其在细胞外表达系统中的ATP合成能力	合成生物学	NA	细胞外表达系统	NA	NA	NA
964	2024-10-21	Adoptive immunotherapy for cancer or viruses 2014, Annual review of immunology IF:26.9Q1 DOI:10.1146/annurev-immunol-032713-120136 PMID:24423116	研究论文	本文探讨了过继免疫疗法在癌症和某些慢性病毒感染治疗中的应用	利用合成生物学原理增强T细胞功能，显著提高临床疗效	主要挑战是识别肿瘤特异性靶点，以避免肿瘤外、靶点内的毒性	研究过继免疫疗法在癌症和病毒治疗中的临床发展	癌症和某些慢性病毒感染	NA	NA	过继免疫疗法	NA	NA	NA
965	2024-10-20	Revolutionizing Molecular Design for Innovative Therapeutic Applications through Artificial Intelligence 2024-Sep-29, Molecules (Basel, Switzerland) DOI:10.3390/molecules29194626 PMID:39407556	综述	本文综述了机器学习、人工智能和分子建模在计算蛋白质工程领域的最新进展及其在创新治疗应用中的革命性作用	本文介绍了深度学习、强化学习和迁移学习等技术在蛋白质结构预测、结合亲和力优化和酶设计方面的显著改进，以及这些创新如何简化了蛋白质工程流程	本文指出计算预测与实验验证之间的差距以及与AI驱动的蛋白质设计相关的伦理问题是当前面临的挑战	本文旨在全面概述计算方法在蛋白质工程中的当前状态和未来方向，强调其在创造下一代生物制剂和推进合成生物学方面的变革潜力	本文研究对象为计算蛋白质工程中的机器学习、人工智能和分子建模技术及其在生物技术和医学中的应用	机器学习	NA	深度学习、强化学习、迁移学习	NA	蛋白质结构	NA
966	2024-10-20	Discovery of megapolipeptins by genome mining of a Burkholderiales bacteria collection 2024-Sep-13, Chemical science IF:7.6Q1 DOI:10.1039/d4sc03594a PMID:39309087	研究论文	本文通过基因组挖掘技术，从316株根际来源的伯克霍尔德菌属细菌中发现了新型天然产物megapolipeptins	本文采用基因组学驱动和合成生物学辅助的方法，成功激活了原本沉默的生物合成基因簇，发现了结构独特的新型天然产物megapolipeptins	NA	发现新型天然产物	根际来源的伯克霍尔德菌属细菌	NA	NA	基因组挖掘	NA	基因组数据	316株根际来源的伯克霍尔德菌属细菌
967	2024-10-20	Optogenetic spatial patterning of cooperation in yeast populations 2024-01-02, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-023-44379-5 PMID:38168087	研究论文	本文利用光遗传学技术控制酵母中的SUC2蔗糖酶生产，从而塑造合作者和欺骗者细胞的空间分布	首次使用光遗传学方法控制酵母细胞的合作和竞争行为，并展示了合作者在其领域大小受限时从其产生的己糖中获益最大	研究仅限于酵母细胞，尚未应用于其他微生物生态系统	探索通过光遗传学方法控制微生物群落中的代谢相互作用，以改进合成生物学应用中的微生物群落工程	酵母细胞的合作和竞争行为	合成生物学	NA	光遗传学	NA	NA	NA
968	2024-10-20	Enzyme-Assisted High Throughput Sequencing of an Expanded Genetic Alphabet at Single Base Resolution 2023-Dec-21, Research square DOI:10.21203/rs.3.rs-3678081/v1 PMID:38196584	研究论文	本文介绍了一种酶辅助的高通量测序方法，用于在单碱基分辨率下测序扩展遗传字母表	提出了一种新的酶辅助测序方法（ESEGA），相比之前的测序方法，具有更高的转录效率和保真度	NA	开发一种新的测序工具，用于测序通过人工扩展遗传信息系统（AEGIS）创建的分子	通过AEGIS LIVE创建的6-letter DNA分子	生物技术	NA	酶辅助测序	NA	DNA序列	涉及三种任务的实验，包括6-nucleotide PCR的最佳条件定义、不同DNA聚合酶的保真度评估以及AEGIS组件的功能化评估
969	2024-10-20	The H3.3 K36M oncohistone disrupts the establishment of epigenetic memory through loss of DNA methylation 2023-Oct-14, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2023.10.13.562147 PMID:37873347	研究论文	研究H3.3 K36M突变对表观遗传记忆和DNA甲基化的影响	提出了一个新的模型，解释H3K36甲基化在将H3K9me3域转化为DNA甲基化以维持稳定的表观遗传记忆中的必要性	NA	探讨H3.3K36M突变如何影响基因表达的动态变化	H3.3 K36M突变对表观遗传记忆和DNA甲基化的影响	表观遗传学	NA	NA	NA	NA	NA
970	2024-10-20	Long oligodeoxynucleotides: chemical synthesis, isolation via catching-by-polymerization, verification via sequencing, and gene expression demonstration 2023, Beilstein journal of organic chemistry IF:2.2Q2 DOI:10.3762/bjoc.19.146 PMID:38170048	研究论文	本文报道了一种直接从头化学合成400个核苷酸的寡脱氧核苷酸（ODN）的方法，并通过捕获-聚合（CBP）方法从复杂的反应混合物中分离这些ODN	本文提出了一种新的化学合成方法，能够合成包含长重复序列或稳定二级结构的基因和基因组，这是现有技术难以实现的	NA	开发一种新的化学合成方法，用于合成包含长重复序列或稳定二级结构的基因和基因组	400个核苷酸的寡脱氧核苷酸（ODN）及其在绿色荧光蛋白（GFP）基因表达中的应用	合成生物学	NA	捕获-聚合（CBP）方法、Sanger测序、Gibson组装	NA	DNA序列	400个核苷酸的ODN、399和401个核苷酸的ODN、800个核苷酸的GFP基因构建体
971	2024-10-19	Enhancers: A Focus on Synthetic Biology and Correlated Gene Expression 2024-Oct-18, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.4c00244 PMID:39276360	综述	本文综述了增强子在调控后生动物转录中的作用，并探讨了合成生物学在解析增强子功能机制中的应用	本文通过合成报告基因系统量化增强子生物学的动态变化，揭示了增强子在基因组环境和与其他增强子组合中的功能机制	NA	探讨增强子功能机制及其在基因表达调控中的作用	增强子及其在基因组环境中的功能	合成生物学	NA	合成报告基因	NA	基因表达数据	NA
972	2024-10-19	Rational Design of High-Efficiency Synthetic Small Regulatory RNAs and Their Application in Robust Genetic Circuit Performance Through Tight Control of Leaky Gene Expression 2024-Oct-18, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.4c00323 PMID:39294875	研究论文	研究通过优化合成小调控RNA（sRNA）的设计参数，提高其在基因表达调控中的效率，并应用于遗传电路的鲁棒性控制	开发了优化合成sRNA设计参数的策略，有效解决了基因表达泄漏问题，提高了遗传电路的可靠性	NA	研究提高合成sRNA效率的理性设计策略，并验证其在遗传电路中的应用	合成小调控RNA（sRNA）及其在遗传电路中的应用	合成生物学	NA	NA	NA	NA	NA
973	2024-10-19	Modular Cloning Tools for Streptomyces spp. and Application to the De Novo Biosynthesis of Flavokermesic Acid 2024-Oct-18, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.4c00412 PMID:39307986	研究论文	本文介绍了一种用于链霉菌属的模块化克隆工具，并展示了其在合成黄酮霉素酸生物合成途径中的应用	开发了一种模块化系统（MoClo），用于链霉菌属的多组分基因簇的从头组装	目前受限于合成生物学工具的相对匮乏	开发适用于链霉菌属的合成生物学工具，并验证其在异源表达中的应用	链霉菌属的基因簇组装和黄酮霉素酸的生物合成	合成生物学	NA	模块化克隆（MoClo）	NA	基因序列	使用了β-葡萄糖苷酸酶（GusA）报告系统进行功能验证
974	2024-10-19	Efficient Simulation of Viral Transduction and Propagation for Biomanufacturing 2024-Oct-18, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.4c00227 PMID:39315883	研究论文	本文介绍了vitraPro软件工具包，用于模拟病毒转导和传播过程，优化基于转导的生物制造平台和病毒扩增过程	提出了一个多尺度模型和高效的数值技术，能够模拟多达两种病毒的感染和传播过程，并考虑了病毒在裂解期或溶原期的状态	NA	优化基于病毒转导的生物制造平台和病毒扩增过程	病毒转导和传播过程	合成生物学	NA	多尺度模型	NA	NA	NA
975	2024-10-19	Characterizing and Engineering Rhamnose-Inducible Regulatory Systems for Dynamic Control of Metabolic Pathways in Streptomyces 2024-Oct-18, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.4c00626 PMID:39377938	研究论文	研究通过生物信息学分析和合成生物学策略，构建了鼠李糖诱导的调控系统，用于动态控制链霉菌中的代谢途径	本研究揭示了鼠李糖代谢途径的调控机制，并成功构建了鼠李糖诱导的调控系统，可广泛应用于多种链霉菌属物种	NA	开发有效的基因诱导系统，用于合成生物技术应用中的基因表达精细调控	链霉菌属物种中的鼠李糖代谢途径及其调控机制	合成生物学	NA	电泳迁移率变动分析（EMSA）	NA	序列	多个链霉菌属物种
976	2024-10-19	Biosynthesis of Natural and Unnatural Perylenequinones for Drug Development 2024-Oct-16, ChemMedChem IF:3.6Q2 DOI:10.1002/cmdc.202400295 PMID:38943237	综述	本文综述了天然和非天然苝醌的生物合成途径及其在药物开发中的应用	介绍了通过合成生物学策略进行结构修饰和大规模生物生产天然和非天然苝醌的最新进展	缺乏高效且成本效益高的方法来获得这些化合物并引入结构多样性和复杂性	促进苝醌类化合物在光动力疗法中的研究和应用	天然和非天然苝醌及其衍生物	NA	NA	合成生物学	NA	NA	NA
977	2024-10-19	Transcriptional memory formation: Battles between transcription factors and repressive chromatin 2024-Oct-16, Cell systems IF:9.0Q1 DOI:10.1016/j.cels.2024.09.008 PMID:39419001	研究论文	本文探讨了转录因子与抑制性染色质在转录记忆形成中的相互作用	揭示了转录因子与抑制性染色质在巩固转录记忆中的关键相互作用	NA	研究转录记忆的形成机制	转录因子与抑制性染色质的相互作用	NA	NA	合成生物学方法	NA	NA	NA
978	2024-10-19	Templated Pluripotent Stem Cell Differentiation via Substratum-Guided Artificial Signaling 2024-Oct-14, ACS biomaterials science & engineering IF:5.4Q2 DOI:10.1021/acsbiomaterials.4c00885 PMID:39352143	研究论文	本文介绍了一种结合细胞工程和生物材料设计的平台，用于在多能干细胞中实现人工信号传导	该平台利用可编程生物材料，通过正交信号传导激活多能干细胞中的形态发生素生产，从而在空间受限的方式下启动形态发生程序	NA	探索驱动多能干细胞分化的分子机制	多能干细胞的分化过程	合成生物学	NA	人工信号传导	NA	NA	NA
979	2024-10-19	Rewiring native post-transcriptional global regulators to achieve designer, multi-layered genetic circuits 2024-Oct-09, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-52976-1 PMID:39384772	研究论文	本文开发了一种通过重构大肠杆菌的碳储存调节（Csr）网络来实现复杂转录后控制的工程方法	通过重新设计RNA-蛋白质相互作用，创建了一个包含12个BUFFER门的遗传工具箱，并开发了Csr调节的NOT门和多层逻辑电路	NA	开发能够实现多样化调控结果的“拖放”调控工具	大肠杆菌的碳储存调节（Csr）网络	合成生物学	NA	RNA-蛋白质相互作用工程	NA	NA	涉及三种工业相关细菌
980	2024-09-30	Advances in synthetic biology 2024-Oct, SLAS technology IF:2.5Q3 DOI:10.1016/j.slast.2024.100197 PMID:39341458	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA