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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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81 | 2025-05-01 |
ATP Regeneration from Pyruvate in the PURE System
2025-Jan-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00697
PMID:39754602
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研究论文 | 本研究通过整合基于丙酮酸氧化酶、乙酸激酶和过氧化氢酶的ATP再生系统,扩展了PURE系统的功能 | 提出了一种新的ATP再生途径,能够独立或与现有肌酸系统结合使用,显著提高蛋白质合成效率 | 需要高初始浓度的磷酸盐缓冲液(约10 mM) | 工程化改造PURE系统,提高其蛋白质合成能力 | PURE系统(无细胞蛋白质合成系统) | 合成生物学 | NA | ATP再生系统 | NA | 生物化学数据 | 多批次自制PURE系统及商业PURExpress系统 |
82 | 2025-05-01 |
Long-Term Protein Synthesis with PURE in a Mesoscale Dialysis System
2025-Jan-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00618
PMID:39757539
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研究论文 | 本研究开发了一种易于组装的中尺度透析系统,用于延长PURE无细胞系统中的蛋白质合成时间和提高产量 | 利用商业可得组件构建的简易透析系统,显著延长了PURE系统的蛋白质合成时间并提高了产量 | 需要定期更换喂养溶液,可能增加操作复杂性 | 解决PURE无细胞系统反应寿命短和产量低的问题 | PURE无细胞系统中的蛋白质合成 | 合成生物学 | NA | 透析系统 | NA | 实验数据 | NA |
83 | 2025-05-01 |
Active learning of enhancers and silencers in the developing neural retina
2025-Jan-15, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2024.12.004
PMID:39778579
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研究论文 | 本文开发了一种主动学习方法,用于训练能够区分增强子和沉默子的模型,这些模型由光感受器转录因子CRX的结合位点组成 | 采用主动学习策略结合合成生物学和不确定性采样,迭代训练模型以区分具有相同序列但功能相反的CRX位点 | 模型训练依赖于CRX结合位点的基因组数据,可能无法完全解释转录因子在不同上下文中的激活或抑制机制 | 开发能够区分增强子和沉默子的深度学习模型,以更好地理解顺式调控元件的功能 | 光感受器转录因子CRX的结合位点 | 机器学习 | NA | 主动学习、合成生物学、大规模并行报告基因检测 | 深度学习模型 | 基因组序列数据 | 几乎所有基因组中结合的CRX位点 |
84 | 2025-04-29 |
A systematic study of regulating inorganic polyphosphates production in Saccharomyces cerevisiae
2025-Sep, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2025.04.004
PMID:40291979
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研究论文 | 本文系统地研究了酵母中无机多磷酸盐生产的遗传调控机制 | 通过CRISPR/Cas9介导的过表达技术,构建了高产多磷酸盐的酵母菌株PP2,并揭示了其分子机制 | 研究仅针对Saccharomyces cerevisiae,未在其他微生物中进行验证 | 探究酵母中多磷酸盐代谢的遗传调控机制,并开发高产多磷酸盐的工程菌株 | Saccharomyces cerevisiae(酿酒酵母) | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9, qRT-PCR | NA | 基因表达数据 | 55个单基因敲除菌株 |
85 | 2025-04-29 |
Emerging ultrafast technologies in biotechnology
2025-May, 3 Biotech
IF:2.6Q3
DOI:10.1007/s13205-025-04309-2
PMID:40292246
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综述 | 本文综述了超快技术在生物技术中的变革性应用,包括实时可视化和精确操控生物分子过程 | 飞秒激光提高了基因编辑的精确度,减少了脱靶效应;超快光谱学增进了对蛋白质折叠途径、酶活性和能量转移机制的理解 | 光损伤、与复杂生物系统的整合以及伦理问题 | 探讨超快技术在生物技术中的应用及其潜力 | 生物分子过程、蛋白质折叠、酶活性、基因编辑、细胞动力学 | 生物技术 | NA | 飞秒激光、超快光谱学、泵浦探测显微镜、相干反斯托克斯拉曼散射(CARS)、阿秒光谱学 | NA | NA | NA |
86 | 2025-04-29 |
Transformative strategies for saline soil restoration: Harnessing halotolerant microorganisms and advanced technologies
2025-Apr-28, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-025-04342-6
PMID:40289223
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review | 本文综述了利用耐盐微生物和先进技术恢复盐渍土壤的创新策略 | 结合耐盐微生物与基因组编辑、合成生物学、高级组学工具及数字技术,提出了一种变革性的盐渍土壤恢复策略 | 需要未来研究协调这些技术和方法,以最大化植物-微生物相互作用 | 缓解盐分胁迫,恢复盐渍土壤,保障粮食安全 | 耐盐微生物及其与植物的协同作用 | 农业生物技术 | NA | CRISPR-Cas9, 合成生物学, 宏基因组学, 宏转录组学, 纳米技术, 机器学习, AI | NA | NA | NA |
87 | 2025-04-29 |
Edible and Medicinal Fungi as Candidate Natural Antidepressants: Mechanisms and Nutritional Implications
2025-Apr-27, Molecular nutrition & food research
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/mnfr.70080
PMID:40289452
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综述 | 本文系统综述了食用药用真菌(EMFs)的抗抑郁潜力,重点关注其生物活性成分和作用机制 | 探讨了EMFs通过调节神经递质系统、色氨酸-犬尿氨酸通路、HPA轴和神经炎症等机制发挥抗抑郁作用,并提出了利用3D食品打印和合成生物学等创新技术 | 存在标准化不足和缺乏临床验证等挑战 | 评估食用药用真菌作为天然抗抑郁剂的潜力及其营养学意义 | 食用药用真菌(如灵芝、猴头菇、茯苓和蛹虫草)及其生物活性成分 | 营养学与神经科学交叉领域 | 抑郁症 | 系统综述方法,包括人工智能建模 | NA | 文献数据 | NA |
88 | 2025-04-29 |
New Insight into Microbial Exploitation to Produce Bioactive Molecules from Agrifood and By-Products' Fermentation
2025-Apr-21, Foods (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/foods14081439
PMID:40282840
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综述 | 探讨微生物在食品及其副产品发酵中生产具有生物活性分子的最新研究 | 综述了微生物在食品工业中生产高营养价值分子的最新应用,强调了合成生物学在这一领域的战略作用 | NA | 探索微生物在食品工业中生产具有促进健康效应的营养品 | 微生物及其在食品和副产品发酵中的应用 | 食品科学 | NA | 发酵技术、合成生物学 | NA | NA | NA |
89 | 2025-04-29 |
Light-Controlled Synthetic Communication Networks via Paired Connexon Nanopores
2025-Apr-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.04.11.648033
PMID:40291719
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研究论文 | 本文通过工程化连接蛋白通道,在脂质体为基础的合成细胞中实现了光控的合成通信网络 | 设计了UV和近红外响应的连接蛋白43和32,实现了在合成细胞间的正交信号分子传递 | 研究仅展示了在合成细胞中的初步应用,尚未在真实生物系统中验证 | 模拟活细胞间的动态通信网络,推动自下而上的合成生物学发展 | 基于脂质体的合成细胞 | 合成生物学 | NA | 连接蛋白通道工程 | NA | NA | NA |
90 | 2025-04-29 |
Taxus NPF transporter involved in the uptake of 10-deacetylbaccatin III facilitates the biosynthesis of taxane compounds
2025-Apr, The Plant journal : for cell and molecular biology
DOI:10.1111/tpj.70146
PMID:40287958
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研究论文 | 该研究报道了一种紫杉属NPF型转运蛋白NPF2.1,它参与10-脱乙酰巴卡亭III的摄取,并促进紫杉烷类化合物的生物合成 | 发现了一种新的NPF型转运蛋白NPF2.1,并展示了其在酵母生物转化系统中的应用,用于发现新的紫杉醇生物合成基因 | 研究主要基于酵母模型,尚未在紫杉植物体内验证其功能 | 研究紫杉醇生物合成途径中转运蛋白的作用 | 紫杉属植物中的NPF2.1转运蛋白和10-脱乙酰巴卡亭III | 合成生物学 | 癌症 | 酵母生物转化系统 | 酵母表达系统 | 生物化学数据 | NA |
91 | 2025-04-29 |
Microbial Transcription Factor-Based Biosensors: Innovations from Design to Applications in Synthetic Biology
2025-Mar-31, Biosensors
DOI:10.3390/bios15040221
PMID:40277535
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综述 | 本文综述了基于转录因子的微生物生物传感器在合成生物学中的创新设计和应用 | 讨论了转录因子生物传感器在灵敏度、特异性和动态范围方面的最新进展,以及计算工具Cello在复杂遗传电路设计中的应用 | 未提及具体的实验验证数据或案例研究 | 探讨转录因子生物传感器在代谢工程和工业生物技术中的应用及其未来发展 | 微生物转录因子生物传感器 | 合成生物学 | NA | 转录因子生物传感器技术、计算设计工具Cello | NA | NA | NA |
92 | 2025-04-29 |
Generalized Orthogonal de Bruijn and Kautz Sequences
2025-Mar-30, Entropy (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/e27040366
PMID:40282601
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research paper | 该论文研究了广义正交de Bruijn和Kautz序列的三种实用推广情况 | 放松了每个(k+1)-序列恰好出现一次的约束,或序列本身是de Bruijn而非平衡de Bruijn序列的约束,并提供了固定权重正交de Bruijn序列数量的上下界 | 正交de Bruijn序列在编码理论文献中仍未被充分探索 | 研究广义正交de Bruijn和Kautz序列的性质和应用 | de Bruijn序列和正交de Bruijn序列 | 编码理论 | NA | NA | NA | 序列数据 | NA |
93 | 2025-04-29 |
Marine Fungal Metabolites as Potential Antidiabetic Agents: A Comprehensive Review of Their Structures and Enzyme Inhibitory Activities
2025-Mar-26, Marine drugs
IF:4.9Q1
DOI:10.3390/md23040142
PMID:40278263
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review | 本文综述了从66种海洋真菌中分离出的181种生物活性化合物对糖尿病相关酶的抑制活性 | 强调了海洋真菌代谢物作为新型抗糖尿病药物的潜力,特别是其结构新颖性和多样化的作用机制 | 未来研究需要解决产量和提取方面的挑战 | 评估海洋真菌代谢物作为抗糖尿病药物的潜力 | 181种从海洋真菌中分离的生物活性化合物 | 生物医学 | 糖尿病 | 遗传工程和合成生物学 | NA | NA | 66种海洋真菌菌株 |
94 | 2025-04-29 |
Two highly specific growth-coupled biosensor for glycolaldehyde detection across micromolar and millimolar concentrations
2025, Synthetic biology (Oxford, England)
DOI:10.1093/synbio/ysaf004
PMID:40292364
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research paper | 该研究介绍了两种用于工程化乙醛酸(GA)生物传感器的代谢方案 | 通过创建GA依赖的营养缺陷型,将菌株生长与GA依赖的必需维生素吡哆醛-5-磷酸和2-酮戊二酸的生物合成联系起来 | NA | 开发高特异性生长耦合的生物传感器,用于检测微摩尔至毫摩尔浓度的乙醛酸 | 乙醛酸(GA)及其在不同代谢途径中的产生 | 合成生物学 | NA | 代谢工程 | NA | NA | NA |
95 | 2025-04-27 |
Harnessing promoter elements to enhance gene editing in plants: perspectives and advances
2025-May, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.14533
PMID:40013512
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综述 | 本文综述了利用启动子元件增强植物基因编辑的策略与进展 | 强调了组织/器官特异性及诱导型启动子在时空特异性基因编辑中的应用潜力,并探讨了合成生物学与生物信息学工具在启动子设计与优化中的创新应用 | 未涉及具体作物品种中启动子编辑的应用案例验证 | 提升植物基因编辑的精准性、效率与特异性以应对气候变化 | 植物基因编辑中的启动子调控元件 | 合成生物学 | NA | 基因编辑(GE)、合成启动子设计、生物信息学分析 | NA | 基因组调控元件数据 | NA |
96 | 2025-04-27 |
Insight into Optogenetics for Diabetes Management
2025-Apr-25, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00549
PMID:40279455
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research paper | 本文综述了光遗传学在糖尿病管理中的应用,探讨了通过光激活工程细胞实现胰岛素分泌的技术 | 光遗传学作为一种新兴的合成生物学方法,能够通过光刺激精确控制细胞活动,为糖尿病管理提供了用户控制的激素分泌方式 | 需要进一步研究照射参数、红移视蛋白和宿主细胞相互作用,以实现光遗传学在临床上的全面应用 | 探讨光遗传学在糖尿病管理中的应用及其潜力 | 胰腺和非胰腺来源的转基因细胞 | 合成生物学 | 糖尿病 | 光遗传学 | NA | NA | 小鼠模型 |
97 | 2025-04-27 |
Human Synthetic Biology and Programmable Gene Regulation Control
2025-Apr-25, Annual review of genomics and human genetics
IF:7.7Q1
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review | 本文综述了人类合成生物学领域的最新进展,特别是可编程基因调控控制工具的开发 | 强调了多层级基因表达控制工具的发展及其在治疗应用中的潜力 | NA | 探讨人类合成生物学在基因表达控制和细胞行为操纵方面的应用 | 人类细胞及其基因调控系统 | 合成生物学 | NA | 高通量合成生物学技术 | NA | NA | NA |
98 | 2025-04-27 |
Producing multiple chemicals through biological upcycling of waste poly(ethylene terephthalate)
2025-Mar, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2024.10.018
PMID:39581772
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研究论文 | 本文描述了开发用于Rhodococcus jostii RPET菌株的遗传工具,以从废弃PET瓶中生产多种化学品 | 开发了针对非模式微生物RPET的遗传工具,包括可诱导和可滴定表达系统以及基于丝氨酸整合酶的重组工具,用于基因组编辑,实现了从废弃PET瓶中生产多种化学品 | 缺乏专门为非模式微生物设计的合成生物学工具,限制了微生物细胞工厂的开发 | 开发可持续生产多样化化学品的塑料升级回收方法 | Rhodococcus jostii RPET菌株和废弃PET瓶 | 合成生物学 | NA | 遗传工程、基因组编辑 | NA | NA | NA |
99 | 2025-04-27 |
Genetic and molecular mechanisms underlying nitrogen use efficiency in maize
2025-Mar, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2024.10.007
PMID:39515641
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综述 | 本文全面综述了玉米中氮素吸收、同化和再分配的遗传与分子调控机制,重点探讨了关键基因和代谢途径在提高氮素利用效率(NUE)中的作用 | 整合了根际微生物组对NUE的影响以及植物-微生物互作调控玉米NUE的复杂机制,并倡导利用遗传多样性和合成生物学的综合研究方法 | 未涉及具体田间试验数据验证相关分子机制的实际应用效果 | 阐明玉米氮素利用效率的遗传与分子机制,为可持续农业提供理论依据 | 玉米植株的氮素代谢过程及相关基因/蛋白 | 植物分子生物学 | NA | 高通量微生物组研究技术 | NA | 分子生物学数据 | NA |
100 | 2025-04-27 |
Synthetic Biomolecular Condensates: Phase-Separation Control, Cytomimetic Modelling and Emerging Biomedical Potential
2025-Feb-17, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202418431
PMID:39575859
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综述 | 本文综述了合成生物分子凝聚物的最新进展,包括其相分离控制、细胞模拟建模及其在生物医学中的潜在应用 | 合成凝聚物通过动态相分离控制模拟自然生物分子凝聚物的生物物理原理和动态特征,为细胞过程和复杂生物途径的调控提供了新见解 | NA | 探索合成凝聚物在合成生物学、材料科学和生物医学中的应用潜力 | 合成共聚物液滴及其在细胞模拟建模和活性材料工程中的应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |