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当前共找到 5561 篇文献，本页显示第 81 - 100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2026-08-20 |
teemi: An open-source literate programming approach for iterative design-build-test-learn cycles in bioengineering
2024-03, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1011929
PMID:38457467
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研究论文 | 开发了一个名为teemi的开源Python计算机辅助设计与分析平台，采用文学编程界面，支持合成生物学中的设计-建造-测试-学习循环，并应用于代谢途径设计的预测工程。 | 提出了一个结合文学编程的开源平台，完全符合FAIR原则，集成了模拟、数据整合与机器学习，用于预测性工程化代谢途径设计。 | 未明确提及局限性，可能包括平台对特定生物系统的适用性有限或机器学习模型的预测准确性依赖数据质量。 | 旨在通过用户友好的模拟、组织和指导，促进生物系统的工程设计，并最大化设计-建造-测试-学习循环中的学习效率。 | 生物系统，特别是酵母中生产药用生物碱关键前体的代谢途径设计。 | 合成生物学 | NA | NA | 机器学习 | 多变量数据集 | NA | NA | 酿酒酵母 | 代谢途径设计 | 工业生物技术, 医学 |
| 82 | 2026-08-19 |
SBOL converter: enabling backward compatibility for biological designs
2026-Aug-18, Journal of integrative bioinformatics
IF:1.5Q3
DOI:10.1515/jib-2026-0005
PMID:42608859
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研究论文 | 本文介绍了SBOL转换器，一种支持生物设计向后兼容的工具，可将旧版设计更新至最新SBOL版本，并支持转换为旧版本以兼容传统工具，同时整合现有SBOL工具提供统一的验证和合规检查接口。 | 首次提供SBOL不同版本间的双向转换功能，支持向后兼容及向前兼容，并集成了现有SBOL工具和多种生物格式处理能力，作为轻量级工具加速工程生物学设计工作流。 | 未提及具体限制，但可能受限于SBOL版本间特性差异和工具集成复杂度。 | 旨在促进SBOL标准的采用，通过提供转换工具，实现生物设计在不同版本间的互操作性，提高设计的可重用性和可重复性。 | 生物设计数据，包括SBOL格式（各版本）及其他格式如GenBank和FASTA。 | 合成生物学 | NA | 软件工具开发 | NA | 文本（生物设计数据） | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术 |
| 83 | 2026-08-19 |
Fluorogenic RNA Aptamer-Based Activity Quantification of T7 RNA Polymerase
2026-Aug-18, Biochemistry
IF:2.9Q3
DOI:10.1021/acs.biochem.6c00336
PMID:42610739
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研究论文 | 开发了一种基于荧光RNA适体的体外转录检测方法，用于定量T7 RNA聚合酶的活性单位 | 首次利用荧光RNA适体Broccoli作为转录报告基因，替代传统放射性标记方法，实现T7 RNA聚合酶活性的简便、定量测定 | 未提及 | 开发一种安全、简便且定量的T7 RNA聚合酶活性检测方法，以改善批间和实验室间的一致性评估 | T7 RNA聚合酶及其工程变体 | 合成生物学 | NA | 体外转录，荧光检测 | NA | 荧光信号数据 | 未提及 | NA | NA | 转录报告系统 | 生物医学研究，RNA治疗产业 |
| 84 | 2026-08-19 |
Automated synthetic cell-based screening for designed proteins with emergent functions
2026-Aug-15, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-76787-8
PMID:42603823
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研究论文 | 本文介绍了PUREdrop，一种自动化微流控平台，用于在合成细胞中封装和表达蛋白质库，以筛选具有涌现功能的工程蛋白质 | PUREdrop平台结合了微流控技术和高通量筛选，能够在数千个皮升级合成细胞中并行评估蛋白质表达动力学和复杂功能，弥补了传统筛选方法在时空分辨率和细胞样限制方面的不足 | 摘要中未明确提及局限性 | 通过设计-构建-测试-学习循环，加速功能性蛋白质的工程化筛选，特别是针对具有涌现功能如时空自组织的蛋白质 | 细菌细胞分裂蛋白FtsZ及其变体，以及FtsZ的一般蛋白调节因子 | 合成生物学 | NA | 微流控技术、时间延迟成像、计算蛋白质设计 | NA | 图像（时间延迟成像） | 数千个皮升级合成细胞，每个构建体重复多次（具体数量未在摘要中说明） | NA | 无细胞系统（体外合成细胞） | NA（针对蛋白质筛选，而非基因电路设计） | 工业生物技术、医学 |
| 85 | 2026-08-19 |
Transcriptomic functional characterization of recombinant adeno-associated virus producing cell line adapted to suspension-growth
2025 Sep-Oct, Biotechnology progress
IF:2.5Q3
DOI:10.1002/btpr.70042
PMID:40396307
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研究论文 | 本研究通过转录组分析表征了适应悬浮生长的重组腺相关病毒生产细胞系，并探讨了恢复贴壁培养条件对病毒产量的影响 | 首次对适应悬浮生长的rAAV生产细胞系进行转录组功能表征，揭示了悬浮生长条件下细胞对病毒生产响应的减弱现象，并展示了通过调整培养条件恢复产量的可行性 | 产量恢复仅达到贴壁培养的25%-50%，未能完全恢复生产水平，悬浮培养条件下的病毒产量仍显着低于贴壁培养 | 探索和优化合成生物学方法构建的rAAV生产细胞系的悬浮培养适应性，以实现可规模化的病毒生产 | 基于HEK293的rAAV生产细胞系GX6B及其悬浮适应亚系GX6Bs | 合成生物学 | NA | RNA-seq | NA | 转录组数据 | 细胞系GX6B和GX6Bs的多个培养条件下的转录组样本 | NA | HEK293细胞 | 编码AAV和腺病毒辅助元件的整合型基因元件 | 医学 |
| 86 | 2026-08-19 |
Membrane-Anchored Polyproline Provides Controlled Microdomain Formation and Permeability in Lipid Vesicles
2025-07-16, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.5c06134
PMID:40605254
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研究论文 | 本研究合成了由L-脯氨酸单体单元和磷脂引发剂组成的新型脂聚合物，通过将聚脯氨酸链锚定到膜上，实现了可逆的相分离和微域形成，从而调控膜通透性和分子释放。 | 首次将聚脯氨酸脂聚合物锚定在脂质膜上，实现温度调控的微域形成和分散，动态控制膜组成和通透性，并展示其在药物递送和合成生物学中的潜力。 | 摘要未提及具体局限性，如微域形成的效率、长期稳定性或体内应用可行性。 | 开发一种能够模拟蛋白质行为的膜锚定聚脯氨酸系统，动态调节脂质囊泡的膜微域形成和通透性，用于药物递送和合成生物学。 | 脂质囊泡及其膜上锚定的聚脯氨酸链。 | 合成生物学 | NA | 共聚焦显微镜、荧光恢复后光漂白（FRAP） | NA | 图像数据（显微镜图像） | 未指明样本数量，涉及不同膜组成和多种负载分子（合成聚合物和酶）的脂质囊泡。 | NA | NA | 温度响应性微域形成系统，通过聚脯氨酸链的相分离实现膜通透性调控。 | 药物递送、合成生物学 |
| 87 | 2026-08-19 |
Cell-Targeting Bio-Catalytic Killer Protocell for High-Order Assembly Guided Cancer Cell Inhibition
2025-06, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202500047
PMID:40270292
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研究论文 | 该文设计并构建了一种细胞靶向的生物催化杀伤性原始细胞，通过高阶组装引导癌细胞抑制 | 受细胞膜受体-配体系统启发，利用主体-客体化学自下而上构建基于多糖的原始细胞，并结合正交性和协同性肿瘤抑制机制，实现靶向癌细胞消除 | 未提及 | 开发用于靶向癌细胞消除的合成治疗性原始细胞，展示在癌症治疗中的潜力 | 多糖基原始细胞（P-somes）及癌细胞 | 合成生物学、生物工程 | 癌症 | 主体-客体化学、静电驱动自组装、催化反应级联 | NA | NA | 未提及 | NA | NA | 生物催化杀伤性原始细胞，包含GOx/Pt-AuNP催化级联，生成一氧化氮用于癌细胞抑制 | 医学 |
| 88 | 2026-08-19 |
A synthetic platform for developing recombinant adeno-associated virus type 8 producer cell lines
2025 May-Jun, Biotechnology progress
IF:2.5Q3
DOI:10.1002/btpr.70009
PMID:39968660
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研究论文 | 本文建立了一个基于合成生物学的平台，用于开发可诱导产生重组腺相关病毒血清型8（rAAV8）的稳定生产细胞系，并通过优化提高了产量。 | 该平台能够将生产细胞系的构建流程从rAAV2扩展到rAAV8，通过修改包装模块和增加VP123基因拷贝数，显著提高rAAV8的产量，达到与三质粒转染相当的水平。 | 初始细胞系的产量低于传统三质粒转染，且Cap蛋白生产和衣壳形成是限制因素。 | 开发一种稳健的合成生物学平台，用于构建不同血清型的rAAV生产细胞系，提高基因治疗用病毒载体的生产效率。 | 重组腺相关病毒血清型8（rAAV8）及其生产细胞系。 | 合成生物学 | NA | 基因组整合、质粒转染、诱导表达 | NA | 实验数据 | 4个细胞系 | 合成生物学方法（具体工具未提及） | HEK293细胞 | 包含基因组模块、复制模块和包装模块的遗传电路，用于诱导rAAV8生产。 | 医学 |
| 89 | 2026-08-19 |
Efficient expression of recombinant proteins in Bacillus subtilis using a rewired gene circuit of quorum sensing
2025 May-Jun, Biotechnology progress
IF:2.5Q3
DOI:10.1002/btpr.70007
PMID:39968680
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研究论文 | 本研究在枯草芽孢杆菌中重构了来自费氏弧菌的LuxRI群体感应系统，实现细胞密度依赖的蛋白质过表达，并通过启动子进化提高表达水平 | 首次在枯草芽孢杆菌中功能重构LuxRI群体感应系统，实现与细胞生长协调的蛋白质生产，无需化学诱导剂；通过两轮启动子进化获得活性增强的突变体，并结合强终止子进一步提升表达 | 摘要中未提及具体局限性 | 开发一种高效且无需诱导剂的枯草芽孢杆菌重组蛋白表达系统，实现细胞生长与生产协调 | 枯草芽孢杆菌（Bacillus subtilis）及源自费氏弧菌的LuxRI群体感应系统 | 合成生物学 | NA | 基因工程、启动子进化、群体感应系统重构 | NA | 基因序列 | 4个启动子突变体（P22, P47, P56, P58） | CRISPR-Cas9 | 枯草芽孢杆菌 | LuxRI群体感应基因电路，包含输出控制启动子P及强终止子TB5 | 工业生物技术 |
| 90 | 2026-08-19 |
Nucleated synthetic cells with genetically driven intercompartment communication
2024-09-03, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2404790121
PMID:39186653
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研究论文 | 本文提出一种构建具有核样区室且能进行遗传驱动的区室间通信的合成细胞的方法 | 首次实现具有明确核样区室并可进行基因编程的区室间信号传导的合成细胞，支持原位膜蛋白表达和自主化学通信 | 尚不清楚该系统的长期稳定性和在更复杂生物环境中的适用性 | 增强合成细胞的复杂性，通过功能性区室化模拟真核细胞核与细胞质间的自主信号传导 | 合成细胞及其核样区室 | 合成生物学 | NA | 区室封装、原位蛋白表达 | NA | NA | NA | NA | NA | 核与细胞质区室间的膜蛋白介导的化学通信通路 | 生物技术 |
| 91 | 2026-08-19 |
Synonymous codon substitutions modulate transcription and translation of a divergent upstream gene by modulating antisense RNA production
2024-09-03, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2405510121
PMID:39190361
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研究论文 | 本文研究了质粒编码的氯霉素乙酰转移酶基因中的同义密码子替换如何通过调节反义RNA的产生来影响上游发散的四环素抗性基因的转录和翻译 | 首次证明同义密码子替换在基因编码区深处可显著影响相邻上游基因的表达，通过长反义RNA绕过天然转录抑制机制 | 未明确说明研究的局限性，但可能涉及样本量小或机制细节未完全解析 | 探究同义密码子替换对相邻基因表达的影响及其潜在机制 | 质粒编码的氯霉素乙酰转移酶基因和上游四环素抗性基因 | 分子生物学， 合成生物学 | NA | RNA测序， 基因表达分析 | NA | 基因表达数据， RNA序列 | 九个重新编码的序列中的四个表现出显著效应 | NA | 细菌 | NA | 医学， 工业生物技术 |
| 92 | 2026-08-19 |
The technology, opportunities, and challenges of Synthetic Biological Intelligence
2023-11, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2023.108233
PMID:37558186
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综述 | 本文综述了合成生物智能（SBI）的发展技术、潜在应用及其伦理挑战，旨在为负责任的研究和应用提供伦理框架 | 首次系统梳理了合成生物智能发展中的关键技术与潜在应用，并提出结构化伦理考量框架 | 未深入探讨具体技术细节，伦理框架尚需实际验证 | 探讨合成生物智能的发展技术、机遇与挑战，并提出伦理考量框架 | 合成生物智能（SBI），包括神经培养物与数字计算集成系统 | 机器学习 | NA | 合成生物学方法（具体如细胞培养技术） | NA | 文本 | NA | NA | 神经培养物（具体宿主未明确） | NA | 医疗, 工业生物技术 |
| 93 | 2026-08-19 |
Engineered T cells for cancer therapy
2014-Sep, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-014-1568-1
PMID:24943274
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综述 | 本文综述了合成生物学在癌症治疗中应用工程化T细胞的研究进展 | 将合成生物学原理应用于癌症治疗，通过遗传工程和分子生物学创建具有增强功能的生物结构 | 未详细讨论临床转化中的具体挑战和副作用 | 探讨工程化T细胞在癌症治疗中的应用潜力 | 工程化T细胞 | 合成生物学 | 癌症 | 遗传工程 | NA | NA | NA | NA | T细胞 | NA | 医学 |
| 94 | 2026-08-18 |
Advances, challenges, and opportunities in engineering C5 and C6 sugar transporters in yeast for bio-based industrial biotechnology
2026-Sep, Critical reviews in biotechnology
IF:8.1Q1
DOI:10.1080/07388551.2026.2680416
PMID:42386498
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综述 | 本文综述了酵母中C5和C6糖转运蛋白工程化的进展、挑战和机遇，以推动生物基工业生物技术发展。 | 总结了C5糖转运的关键瓶颈，并重点介绍了理性蛋白工程、定向进化和机器学习等策略在扩展C5转运蛋白库和优化转运效率方面的最新突破。 | 未详细讨论C6糖转运的具体机制及全部工程化案例（根据摘要推断）。 | 促进酵母高效转化戊糖（D-木糖和L-阿拉伯糖），实现可持续的生物基生产。 | 酵母中的D-木糖和L-阿拉伯糖转运蛋白 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 酵母 | NA | 工业生物技术 |
| 95 | 2026-08-18 |
Fluorescent-Activating Proteins Manipulate Self-Assembly Peptides Trafficking and Intracellular Distribution
2026-Aug-17, ACS applied bio materials
IF:4.6Q2
DOI:10.1021/acsabm.6c00950
PMID:42606054
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研究论文 | 本文报道了一种结合孔雀石绿的自组装肽系统，该系统与荧光激活蛋白相互作用，能够精确调控肽在细胞内的运输和分布，从而逃避溶酶体降解 | 通过利用荧光激活蛋白的特异性结合特性，实现了对肽亚细胞定位的动态调控，具有时空控制肽聚集和分解的能力，为药物递送和合成生物学提供了新工具 | 摘要未明确提及局限性 | 开发一种能够精确调控细胞内肽运输和分布的自组装肽系统，以避免溶酶体降解并实现靶向递送 | 自组装肽与孔雀石绿的结合物及其与荧光激活蛋白的相互作用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 图像（共聚焦成像） | NA | NA | NA | 自组装肽-孔雀石绿系统与荧光激活蛋白的相互作用电路 | 药物递送、合成生物学 |
| 96 | 2026-08-18 |
Exploring rare coumarins biosynthesis by Gloeophyllum trabeum: an integrated computational genomics, molecular docking and spectroscopic approach
2026-Aug-14, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-026-05181-9
PMID:42599545
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研究论文 | 该研究通过整合计算基因组学、分子对接和波谱分析，探索了木材腐朽真菌Gloeophyllum trabeum合成罕见香豆素类化合物的能力，并鉴定出具有抗菌活性的新化合物 | 首次系统研究了Gloeophyllum trabeum合成罕见香豆素类化合物的能力，结合基因组挖掘和分子对接揭示了其生物合成基因簇，并鉴定出四种新的聚酮类化合物，其中oosponol展现出对Moraxella catarrhalis UspA1蛋白的强亲和力 | 化合物1的结构仅为初步鉴定，且所发现的化合物目前无法商业化获取，其抗菌活性机制和体内效果仍需进一步验证 | 探索Gloeophyllum trabeum合成罕见香豆素类化合物的潜力，为开发新型抗生素提供候选化合物 | Gloeophyllum trabeum真菌及其产生的香豆素类化合物 | 计算基因组学、分子对接、微生物学 | 细菌感染 | LC-MS、2-D NMR、基因组挖掘、分子对接、平板覆盖生物测定 | NA | 基因序列、光谱数据、对接评分 | 一种真菌（Gloeophyllum trabeum）及其培养滤液，对抗三种微生物（E. coli, S. cerevisiae, B. subtilis） | NA | Gloeophyllum trabeum | NA | 医学、工业生物技术 |
| 97 | 2026-08-18 |
A dual-dimensional CRISPR toolkit enables one-step high-efficiency multiplex genome editing in Komagataella phaffii
2026-Aug-13, Metabolic engineering
IF:6.8Q1
DOI:10.1016/j.ymben.2026.102525
PMID:42595042
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研究论文 | 本研究建立了高效的CRISPR工具EMGES 3.0，在Komagataella phaffii中实现一步法多重基因编辑和长片段整合，用于绿色生物制造和C1利用 | 首次在K. phaffii中实现超长片段(>16 kb)的一步整合，并达到14.8%的效率 | 超长片段整合效率相对较低，且实验在特定菌株中验证，可能需要进一步优化以广泛适用 | 提升K. phaffii的基因编辑效率和简化复杂代谢途径重构过程，以促进C1基生物经济工业化 | Komagataella phaffii菌株及其工程改造 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9 | NA | 基因编辑效率数据、代谢产物产量数据 | 本研究使用了多种基因编辑实验，但具体样本数量未在摘要中说明 | CRISPR-Cas9 | Komagataella phaffii | 双锤头核酶-sgRNA-丁型肝炎病毒核酶(dHgH)介导的sgRNA表达系统及多重基因敲除与长片段整合电路 | 工业生物技术, 绿色生物制造 |
| 98 | 2026-08-18 |
Mitochondria as programmable redox rheostats: Advancing from transplantation to bioengineered organelle therapeutics
2026-Aug-04, Redox biology
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.redox.2026.104338
PMID:42567043
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综述 | 本文综述了线粒体从移植到生物工程化细胞器治疗的转变，强调线粒体作为可编程的氧化还原变阻器在疾病治疗中的潜力 | 提出了将线粒体视为可编程治疗单元而非静态载体的新观点，整合合成生物学、纳米医学和生物材料原理进行线粒体工程改造 | 未具体说明临床试验中的挑战和解决方案，如长期安全性、免疫原性等问题 | 探讨线粒体工程化策略及其在疾病治疗中的应用前景，以及从移植到工程化治疗的转变 | 线粒体及其功能障碍相关疾病，如缺血再灌注损伤、神经退行性疾病和代谢综合征 | 合成生物学、纳米医学、生物材料 | 缺血再灌注损伤、神经退行性疾病、代谢综合征 | 线粒体移植、表面功能化、基因调控、递送平台（如融合胶囊、光热纳米刀） | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | NA | NA | 医学 |
| 99 | 2026-08-18 |
Tangled Tail of Mechanically Interlocked Peptides
2026-07-08, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.6c05395
PMID:42334221
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综述 | 本文综述了机械互锁肽（MIPs）在自然界中的发现及化学合成进展，并提出了统一命名法，以促进分子生物学与超分子化学领域的融合。 | 首次系统比较自然界存在的机械互锁生物分子与化学合成的肽基机械互锁分子，并提出统一的命名法，为跨学科研究奠定基础。 | 未提及具体实验数据或量化分析，可能缺乏对实际应用挑战的深入讨论。 | 综述机械互锁肽的研究现状，建立统一命名法，并促进生物学与化学领域的跨学科合作。 | 自然界存在的机械互锁生物分子（如连环DNA、HK97噬菌体衣壳蛋白）及化学合成的机械互锁肽。 | 化学生物学，合成生物学 | NA | NA | NA | 文本，综述数据 | NA | NA | NA | 机械互锁肽结构（如连环肽、链甲结构） | 基础研究，化学生物学 |
| 100 | 2026-08-18 |
Omics Technologies-Driven Research and Applications of Synthetic Biology
2026, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-5264-0_16
PMID:42108303
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综述 | 本文系统阐述了整合多组学、空间组学和培养组学如何为合成生物学提供全链条解决方案，涵盖功能预测、动态调控、功能验证和群落构建，并推动其在生物制造、环境修复和医疗健康等领域的应用 | 提出整合多组学、空间组学和培养组学的全链条策略，以解决合成生物学中功能稳定性差、代谢通路适应性不足和自然微生态模拟困难等关键挑战 | 未明确讨论具体实验验证或技术局限性，内容偏向概念性综述 | 探讨组学技术如何驱动合成生物学的研究与应用，实现组学与合成生物学的深度融合 | 合成生物系统，包括合成菌群、底盘菌株和自然微生态系统 | 合成生物学 | NA | 组学技术（多组学、空间组学、培养组学） | NA | 文本、组学数据 | NA | NA | NA | 代谢通路优化 | 生物制造、环境修复、医疗健康 |