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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2025-12-01 |
Autonomous Bioluminescence Systems: From Molecular Mechanisms to Emerging Applications
2025-Nov-24, JACS Au
IF:8.5Q1
DOI:10.1021/jacsau.5c01072
PMID:41311942
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综述 | 本文综述了自主生物发光系统的分子机制、蛋白质工程策略及其在实时无创成像中的新兴应用 | 系统比较了细菌和真菌自主生物发光系统的优劣,并提出通过AI引导诱变和代谢途径优化等策略解决现有挑战 | 细菌生物发光系统存在量子产率低的问题,真菌生物发光系统受底物可用性限制 | 评估自主生物发光系统的发展现状并展望下一代系统的设计目标 | 细菌和真菌自主生物发光系统 | 合成生物学 | NA | AI引导诱变, 蛋白质设计, 代谢途径优化 | NA | NA | NA | NA | 细菌, 真菌 | 自主生物发光系统(整合荧光素酶与完整底物生物合成途径) | 生物医学研究, 环境监测, 合成生物学 |
| 82 | 2025-12-01 |
MeJA Elicitation on Flavonoid Biosynthesis and Gene Expression in the Hairy Roots of Glycyrrhiza glabra L
2025-Nov-18, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes16111387
PMID:41300839
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研究论文 | 本研究通过建立甘草毛状根培养系统,探究茉莉酸甲酯对黄酮类化合物生物合成及基因表达的影响 | 首次在甘草毛状根系统中结合代谢工程与基因工程技术,通过MeJA诱导和UGT基因过表达显著提高黄酮类化合物含量 | 研究仅针对特定黄酮类化合物,其他活性成分的变化未全面评估;功能基因研究仍需进一步验证 | 提高甘草中黄酮类活性成分的生物合成效率 | 甘草毛状根及其黄酮类化合物 | 合成生物学 | NA | 转录组分析、qRT-PCR、悬浮培养 | NA | 基因表达数据、代谢物含量数据 | 28天悬浮培养的毛状根样本 | 代谢工程、基因工程 | 甘草毛状根 | 黄酮类生物合成途径 | 医药 |
| 83 | 2025-11-30 |
From Biocontrol to Synthesis: Innovative Progress of Paenibacillus in Mechanism Analysis, Gene Editing and Platform Construction
2025-Nov-10, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms262210886
PMID:41303372
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综述 | 本文综述了类芽孢杆菌从生物防治到合成生物学的创新进展,包括机制解析、基因编辑和平台构建 | 系统总结了类芽孢杆菌多种生物防治机制的协同作用及其对环境因素的响应,并探讨了其在合成生物学平台构建中的创新应用 | NA | 探讨类芽孢杆菌在生物防治和合成生物学领域的应用潜力与发展前景 | 类芽孢杆菌及其生物合成机制 | 合成生物学 | NA | 基因编辑、合成生物学策略 | NA | NA | NA | NA | 类芽孢杆菌 | NA | 农业,工业生物技术 |
| 84 | 2025-12-01 |
Phage Therapy for Acinetobacter baumannii Infections: A Review on Advances in Classification, Applications, and Translational Roadblocks
2025-Nov-08, Antibiotics (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/antibiotics14111134
PMID:41301629
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综述 | 本文系统综述了噬菌体疗法在治疗鲍曼不动杆菌感染领域的最新进展,包括分类学更新、治疗策略优化和临床转化挑战 | 基于全基因组系统发育的现代分类学将大多数噬菌体重新分类为Caudoviricetes纲,揭示了与宿主趋向性和生物学特性相关的独特进化支;通过尾丝重组和CRISPR/Cas介导的溶原性消除等基因工程方法扩展宿主范围 | 工程噬菌体的遗传稳定性需要进一步验证;宿主谱有限、缺乏临床转化标准和滞后的监管框架仍是当前挑战 | 总结噬菌体疗法在治疗碳青霉烯类耐药鲍曼不动杆菌感染领域的研究进展和转化障碍 | 鲍曼不动杆菌噬菌体及其治疗应用 | NA | 细菌感染 | 全基因组系统发育分析、基因工程、CRISPR/Cas、宏基因组挖掘 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 鲍曼不动杆菌 | NA | 医学 |
| 85 | 2025-12-01 |
Key Challenges in Plant Microbiome Research in the Next Decade
2025-Nov-07, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms13112546
PMID:41304231
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综述 | 本文系统分析植物微生物组研究面临的关键挑战并提出未来十年的发展路线图 | 提出整合实验与计算策略的路线图,强调合成生物学、多组学工具和人工智能在工程化植物-微生物互作中的应用前景 | 未涉及具体实验数据验证,主要基于现有研究现状的分析与展望 | 推动植物微生物组研究向田间规模应用转化,建立具有气候适应性和资源高效性的农业系统 | 植物微生物组 | NA | NA | 多组学数据整合、测序技术、人工智能 | NA | 多组学数据 | NA | 合成生物学 | 植物 | 植物-微生物互作工程化 | 农业 |
| 86 | 2025-12-01 |
Probiotic Potential of Traditional and Emerging Microbial Strains in Functional Foods: From Characterization to Applications and Health Benefits
2025-Nov-02, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms13112521
PMID:41304207
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综述 | 本文综述了传统和新兴益生菌菌株在功能性食品中的潜力,涵盖表征方法、作用机制、技术限制和健康益处 | 重点关注具有新功能特性的新兴微生物候选菌株,并强调通过组学技术和合成生物学解决现有挑战 | 缺乏长期临床验证、菌株特异性研究不足、个性化应用存在空白以及消费者沟通不充分 | 评估传统和新兴益生菌菌株在功能性食品中的应用潜力和健康效益 | 传统和新兴益生菌微生物菌株 | NA | NA | 组学技术、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 食品, 医药 |
| 87 | 2025-12-01 |
A Rapid, High-Throughput Method for the Construction of Mutagenesis Libraries
2025-Oct-25, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom15111511
PMID:41301429
|
研究论文 | 开发了一种基于芯片寡核苷酸合成的高通量、精确控制的诱变文库构建方法 | 利用芯片寡核苷酸合成技术实现精确控制的诱变文库构建,达到93.75%的突变覆盖率 | 存在寡核苷酸合成错误和嵌合序列形成等技术因素影响文库质量 | 开发高效、可扩展、精确控制的诱变文库构建策略 | 诱变文库构建方法 | 合成生物学 | NA | 芯片寡核苷酸合成,PCR | NA | DNA序列数据 | 评估了5种聚合酶 | 芯片寡核苷酸合成 | NA | 琥珀密码子扫描诱变文库 | 工业生物技术 |
| 88 | 2025-12-01 |
Metabolic Engineering of Yeasts for the Production of the Triterpene Squalene: Current Status and Future Prospective
2025-Oct-22, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms13112422
PMID:41304107
|
综述 | 系统总结酵母生产角鲨烯的代谢工程策略及下游衍生物应用 | 整合系统代谢工程与合成生物学工具提出经济可行角鲨烯生物制造的路线图 | 微生物平台实现工业化可行滴度仍存在未解决挑战 | 推进酵母菌株工程实现经济可行角鲨烯生物制造 | 酵母底盘细胞及其角鲨烯生物合成途径 | 代谢工程 | NA | 代谢工程、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 酵母 | 甲羟戊酸途径角鲨烯生物合成途径及其下游衍生物合成途径 | 医药、营养保健品、化妆品 |
| 89 | 2025-12-01 |
Optimizing nitrogen use efficiency in forest plantations: mechanistic insights from Arabidopsis, crops, and natural forestry ecosystems
2025, Forestry research
DOI:10.48130/forres-0025-0029
PMID:41312404
|
综述 | 本文综述了森林人工林氮素利用效率的优化策略,通过整合拟南芥、作物和天然林生态系统的氮利用机制提出改进方案 | 首次系统整合三大系统的氮利用机制,并提出利用关键调控基因和合成生物学方法定向增强森林人工林氮素利用效率的创新思路 | 主要基于理论分析和现有研究综述,缺乏实际田间试验验证 | 提高森林人工林的氮素利用效率 | 森林人工林(如杨树和桉树)、拟南芥、作物和天然森林生态系统 | 植物生理学与林业科学 | NA | 合成生物学、基因调控 | NA | 文献资料与理论分析 | NA | NA | NA | NA | 农业、林业 |
| 90 | 2025-11-30 |
Microorganism delivery of cancer vaccines
2025-Dec-10, Journal of controlled release : official journal of the Controlled Release Society
IF:10.5Q1
DOI:10.1016/j.jconrel.2025.114288
PMID:41045964
|
综述 | 本文综述了微生物癌症疫苗通过利用细菌和病毒靶向肿瘤区域、增强免疫原性的机制及其在癌症免疫治疗中的应用 | 系统阐述微生物疫苗靶向肿瘤机制,并重点介绍合成生物学技术在精准表达肿瘤抗原和免疫检查点抑制剂方面的最新进展 | NA | 探讨微生物癌症疫苗作为变革性免疫治疗策略的潜力 | 细菌疫苗、病毒疫苗和病毒样颗粒等微生物载体 | 合成生物学 | 癌症 | 合成生物学技术 | NA | NA | NA | NA | 细菌, 病毒 | 肿瘤抗原表达系统, 免疫检查点抑制剂表达系统 | 医学 |
| 91 | 2025-11-30 |
Synthetic tunable promoters for flexible control of multi-gene expression in mammalian cells
2025-Dec, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2025.02.008
PMID:39938795
|
研究论文 | 本研究构建了一个合成可调启动子库,用于在哺乳动物细胞中实现多基因表达的灵活调控 | 开发了包含通用激活位点和特异性激活位点的合成可调启动子,通过CRISPRa系统实现多层级表达控制 | NA | 构建合成可调启动子库以实现哺乳动物细胞中多基因表达的灵活控制 | 哺乳动物细胞中的多基因表达系统 | 合成生物学 | NA | CRISPR激活系统, 大规模平行报告基因检测 | NA | 基因表达数据 | 24,960个非冗余启动子 | CRISPR-Cas9 | 哺乳动物细胞 | 合成启动子设计,包含通用激活位点和特异性激活位点 | 医学, 生物技术 |
| 92 | 2025-11-30 |
Self-assembled cell-scale containers made from DNA origami membranes
2025-Nov-28, Nature materials
IF:37.2Q1
DOI:10.1038/s41563-025-02418-0
PMID:41315785
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研究论文 | 本研究报道了一种受脂质结构启发的DNA折纸单层膜自组装方法,可形成细胞尺度的囊泡和空心管状结构 | 首次实现了径向对称DNA折纸亚基的自组装,突破了传统DNA纳米技术局限于刚性笼状结构的限制 | 未提供具体应用验证数据,结构稳定性与功能整合仍需进一步研究 | 开发新型生物相容性隔室化结构,拓展自下而上合成生物学和细胞尺度软机器人技术 | DNA折纸单层膜自组装结构 | 合成生物学 | NA | DNA折纸技术,自组装技术 | NA | 结构表征数据 | NA | DNA折纸 | NA | 径向对称DNA折纸亚基自组装形成膜结构 | 生物技术,软机器人 |
| 93 | 2025-11-30 |
Efficient site-specific integration of kilobase-length DNA fragments in plant cells via Kp03 recombinase
2025-Nov-25, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116508
PMID:41187057
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研究论文 | 本研究评估了Kp03重组酶在植物细胞中实现大片段DNA定点整合的效率 | 首次证明Kp03重组酶能在植物细胞中高效整合长达27.3 kb的DNA片段,并确定仅需15-bp attB序列即可实现整合 | 研究主要基于瞬时原生质体实验和愈伤组织,尚未在完整植株中验证整合效率 | 开发植物基因组工程中大片段DNA定点整合的新方法 | 水稻和拟南芥的细胞及愈伤组织 | 合成生物学 | NA | 重组酶介导的整合、基因组编辑 | NA | 分子生物学实验数据 | 水稻和拟南芥原生质体及愈伤组织(具体数量未明确说明) | Kp03重组酶, NM-PE基因组编辑系统 | 水稻, 拟南芥 | 基于attB-attP重组系统的DNA整合平台 | 农业, 工业生物技术 |
| 94 | 2025-11-30 |
Peptide-based approaches to quorum-sensing disruption: emerging trends and applications in antimicrobial therapy
2025-Nov-23, Bioorganic & medicinal chemistry
IF:3.3Q1
DOI:10.1016/j.bmc.2025.118496
PMID:41313971
|
综述 | 本文总结了基于肽的群体感应干扰方法在抗菌治疗中的新兴趋势和应用 | 聚焦于肽类群体感应抑制剂作为非致死性抗菌策略,涵盖工程化肽和肽-纳米复合系统的设计进展 | 存在肽不稳定性、低生物利用度、脱靶效应和潜在耐药性发展等挑战 | 开发不依赖传统杀菌方法的替代性抗菌治疗策略 | 细菌群体感应系统和病原体致病性 | NA | 感染性疾病 | 肽工程、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 95 | 2025-11-30 |
Analog epigenetic memory revealed by targeted chromatin editing
2025-Nov-12, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2025.100985
PMID:40930103
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研究论文 | 本研究通过靶向染色质编辑揭示了表观遗传记忆的模拟特性,证明染色质修饰可维持不同水平的基因表达 | 首次发现DNA甲基化梯度可对应维持不同水平的基因表达,揭示了模拟表观遗传记忆的存在机制 | 未明确说明实验使用的具体细胞类型和样本规模 | 探索染色质修饰如何维持不同基因表达状态及其记忆机制 | 染色质修饰状态与基因表达动态关系 | 合成生物学 | NA | 靶向染色质编辑、DNA甲基化分析 | 染色质修饰模型 | 基因表达动态数据 | NA | 基因组报告系统、表观遗传效应器 | NA | 表观遗传记忆系统 | 合成生物学 |
| 96 | 2025-11-30 |
Genetic Surfaceome E. coli Reprogramming Enables Selective Water Oxidation
2025-Nov, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202508100
PMID:40817601
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研究论文 | 通过合成生物学方法重构大肠杆菌表面组,实现选择性水氧化催化 | 开发了合成操纵子系统,通过正交诱导控制和密码子优化表达,在微生物表面展示真菌胆红素氧化酶并实现活性重构 | NA | 设计可再生微生物平台用于选择性催化和人工光合作用 | 大肠杆菌表面展示的胆红素氧化酶系统 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、基因工程、生物电催化 | NA | NA | NA | 合成操纵子、IPTG诱导系统、冰核蛋白锚定 | 大肠杆菌 | 合成操纵子系统,包含正交IPTG诱导控制、密码子优化表达和表面蛋白展示 | 能源、环境 |
| 97 | 2025-11-29 |
Extraction, preparation, pharmacological activities, and potential applications of ginsenosides Rk1 and Rg5
2026-Jan-30, Journal of ethnopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.jep.2025.120678
PMID:41052692
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综述 | 系统总结稀有人参皂苷Rk1和Rg5的天然来源、提取工艺、药理机制及在功能性食品和保健品中的潜在应用 | 整合网络药理学和分子对接技术预测Rk1和Rg5的抗癌及生殖保护作用,并提出人工智能辅助生物转化和合成生物学等新型制备策略 | 天然丰度低、结构复杂、可持续生产挑战大,缺乏临床验证和药代动力学研究 | 弥合临床前研究与临床转化之间的差距,促进稀有人参皂苷在医疗保健和营养领域的应用 | 人参属植物(人参、西洋参、三七)中的稀有人参皂苷Rk1和Rg5 | 天然产物研究 | 肿瘤、代谢疾病、神经退行性疾病、心血管疾病 | 网络药理学、分子对接、生物转化、合成生物学 | NA | 文献数据 | NA | NA | NA | NA | 医药、功能性食品、保健品 |
| 98 | 2025-11-29 |
Recombinant collagen in regenerative medicine: Expression strategies, structural design, and translational applications
2025-Dec, Materials today. Bio
DOI:10.1016/j.mtbio.2025.102452
PMID:41293490
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综述 | 本文综述了重组胶原蛋白在再生医学中的表达策略、结构设计和临床应用 | 整合了合成生物学技术开发具有明确序列和一致质量的重组胶原蛋白系统,拓展了基于重组胶原蛋白生物材料的结构多样性和功能景观 | 在实现完全羟基化、成本效益高的大规模制造和统一监管标准方面仍面临挑战 | 开发新一代具有分子精度、功能可调性和可扩展生物制造能力的生物材料 | 重组胶原蛋白及其工程化生物材料 | 合成生物学 | 骨科疾病、皮肤损伤、角膜疾病 | 合成生物学、AI辅助序列设计、程序化分子工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly | 大肠杆菌, 酿酒酵母, 植物, 哺乳动物细胞, 转基因生物 | 三螺旋重组胶原蛋白、非螺旋明胶样蛋白、多功能融合构建体 | 医学 |
| 99 | 2025-11-29 |
High-throughput chemical genomic screening: a step-by-step workflow from plate to phenotype
2025-Nov-28, mSystems
IF:5.0Q1
DOI:10.1128/msystems.00885-25
PMID:41313179
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方法论文 | 提供从实验设计到表型分析的高通量化学生物基因组筛选完整工作流程指南 | 开发了可扩展的端到端标准化流程,整合实验、成像和计算步骤,实现跨微生物物种的高通量筛选 | NA | 建立标准化、可重复的高通量化学生物基因组筛选方法,促进基因功能与表型关联研究 | 微生物菌株库在不同化学和环境条件下的表型特征 | 系统生物学 | 抗菌素耐药性 | 高通量化学生物基因组筛选、表型分析、成像技术 | NA | 表型数据、图像数据 | NA | NA | 多种微生物物种 | NA | 医学、微生物组研究、合成生物学 |
| 100 | 2025-11-29 |
Phenotyping and Selection of Cells Using Mass Spectrometry and a Microfluidic Droplet Printer
2025-Nov-27, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.5c05032
PMID:41309380
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研究论文 | 开发了一种结合液滴电喷雾电离质谱与微流控电压介导液滴打印的系统,用于无标记表型分析和细胞筛选 | 首次将液滴电喷雾电离质谱与微流控电压介导打印技术集成,实现无标记细胞表型分析和精准筛选 | 系统操作速度限制在0.4-1.2滴/秒,可能影响超高通量应用 | 开发无标记高通量细胞表型分析和筛选技术 | 微生物细胞和工程化细胞变体 | 生物技术 | NA | 液滴电喷雾电离质谱,微流控技术 | NA | 质谱数据,图像数据 | NA | NA | 微生物细胞 | NA | 合成生物学,酶工程,工业生物技术 |