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当前共找到 5201 篇文献，本页显示第 81 - 100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2026-06-17 |
A Comprehensive Review on Metabolomics-Guided Metabolite Production in Plant Tissue Culture: Integrating Omics and Synthetic Biology for Enhanced Yields
2026-Jun-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00352
PMID:42301185
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综述 | 本文综述了通过将代谢组学与合成生物学及多组学框架相结合，将植物组织培养从试错法转变为预测性系统工程领域的进展 | 将代谢组学重新定义为决策核心层，连接代谢表型与理性通路设计、遗传干预和过程调控，形成设计-构建-测试-学习范式 | 分析覆盖率、培养稳定性和代谢可预测性方面仍存在挑战 | 将代谢组学引导的植物组织培养转变为可编程、可预测的生物制造平台，以提高高价值次生代谢产物的产量 | 植物组织培养中的次生代谢产物 | 合成生物学 | NA | 代谢组学, 合成生物学, 多组学整合 | NA | 代谢组学数据, 多组学数据 | NA | CRISPR-Cas9, 合成启动子, 模块化基因回路, 异源表达系统 | 植物细胞, 异源宿主 | 代谢通路工程, 模块化遗传回路, 生物传感器 | 医药, 工业生物技术 |
| 82 | 2026-06-17 |
Penetrating the cell wall: a review on delivering exogenous materials into plant and fungal cells via micro/nanoinjection
2026-Jun-16, Nanoscale
IF:5.8Q1
DOI:10.1039/d6nr00509h
PMID:42301729
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综述 | 系统综述微纳注射技术用于穿透植物和真菌细胞壁递送外源材料的研究进展 | 首次系统性地从探针设计与制造、自动化力反馈策略、壁穿透机制等角度整合分析微纳注射技术，并提出了标准化协议与集成系统的发展路线图 | 现有技术操作通量低、重复性差，缺乏标准化协议和集成系统，且对细胞壁穿透机制的理解尚不完善 | 全面总结微纳注射技术在穿透细胞壁递送外源材料方面的现状与挑战，并为未来发展提供路线图 | 植物细胞和真菌细胞 | 合成生物学 | NA | 微纳注射 | NA | NA | NA | 微纳注射技术 | 植物细胞, 真菌细胞 | NA | 植物科学, 微生物学, 合成生物学 |
| 83 | 2026-06-17 |
Recognition of non-standard base pairs by triplex-forming oligonucleotides containing an expanded genetic alphabet
2026-Jun-12, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-74375-4
PMID:42286010
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研究论文 | 利用扩展遗传字母表中的碱基，实现了三链形成寡核苷酸对非标准碱基对的序列特异性识别 | 通过人工扩展遗传信息系统中的碱基，将三链识别空间扩展到标准、受损或合成碱基对，在中性pH下实现纳摩尔级亲和力，突破了天然碱基对目标序列的限制和酸性条件要求 | 未提及 | 探索利用扩展遗传字母表增强三链形成寡核苷酸识别双链DNA的能力 | 三链形成寡核苷酸与含标准、受损或合成碱基对的双链DNA形成的三链复合体 | 分子生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学, 合成生物学 |
| 84 | 2026-06-17 |
Gene expression in synthetic biology: Going with the light
2026-Jun-11, Journal of biotechnology
IF:4.1Q2
DOI:10.1016/j.jbiotec.2026.06.010
PMID:42276281
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综述 | 本文综述了光诱导基因表达在合成生物学中的应用，重点关注原核生物的光响应元件和逻辑门设计 | 系统梳理了光诱导基因表达的不同元件（光响应启动子、光调节转录因子和光笼诱导剂），并探讨了光遗传学与合成生物学的交叉融合关系 | 主要聚焦于原核生物系统，对真核生物系统的比较较为有限 | 探讨光作为二元输入信号如何驱动合成生物学中基因表达逻辑回路的开发 | 光响应启动子、光调节转录因子、光笼诱导剂以及原核与真核生物的光诱导基因表达系统 | 合成生物学 | NA | 光遗传学 | NA | NA | NA | 光诱导基因表达系统 | 原核生物，真核生物 | 光控逻辑门、光诱导基因表达回路 | 生物技术 |
| 85 | 2026-06-17 |
Multilevel Metabolic Engineering of Probiotic Escherichia coli Nissle 1917 for Antibiotic-Free Production of β-Alanine
2026-Jun-10, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00228
PMID:42270566
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research paper | 对益生菌大肠杆菌Nissle 1917进行多水平代谢工程改造，实现无抗生素条件下高效生产β-丙氨酸 | 首次研究了TdcC、SstT、SdaC和RhaT转运蛋白在β-丙氨酸积累中的作用，并通过多水平的工程策略实现益生菌中β-丙氨酸的最高产量 | 未提及具体限制 | 通过多水平代谢工程策略增强益生菌大肠杆菌Nissle 1917中β-丙氨酸的生物合成 | 益生菌大肠杆菌Nissle 1917 | NA | NA | 代谢工程 | NA | NA | 5升生物反应器中的发酵实验 | 代谢工程, 异源酶引入 | 大肠杆菌Nissle 1917 (EcN) | 多水平代谢工程包括L-天冬氨酸前体供应强化、竞争途径动态调控、中心代谢重布线及转运系统改造 | 工业生物技术 |
| 86 | 2026-06-17 |
Empirical evaluation of all unique Cas9 protospacers in E. coli reveal widespread functionality and rules for gRNA design
2026-Jun-08, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag548
PMID:42258532
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研究论文 | 系统评估大肠杆菌中463,000个独特gRNA的Cas9活性，发现93%以上功能正常，仅0.3%无效 | 首次大规模实证验证大肠杆菌中几乎所有独特gRNA均具有功能性，并揭示无效gRNA的间隔区自相互作用规律，提出简单设计规则和修复方法 | 研究仅限于大肠杆菌K12 MG1655菌株，未扩展至其他细菌种类 | 评估大肠杆菌中Cas9 gRNA的特异性与功能性，解决现有研究中关于无效gRNA比例的争议 | 463,000个独特gRNA在大肠杆菌K12 MG1655基因组上的活性 | 计算生物学 | NA | CRISPR-Cas9 | NA | 序列数据 | 463,000个独特gRNA | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌 | NA | 合成生物学 |
| 87 | 2026-06-17 |
Rare functional groups and unique scaffolds in Streptomyces natural products
2026-Jun-08, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d6np00012f
PMID:42300430
|
综述 | 综述链霉菌天然产物中罕见官能团、独特骨架和非典型修饰的结构特征及其生物合成机制 | 将稀有结构特征（如罕见官能团、独特分子骨架、非典型修饰）与合成生物学应用及高效细胞工厂设计相联系 | 仅涵盖截至2025年12月的数据，可能遗漏近期文献 | 探讨链霉菌天然产物的结构多样性如何为合成生物学和药物发现提供灵感 | 链霉菌天然产物及其生物合成酶 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 链霉菌 | NA | 医学, 工业生物技术 |
| 88 | 2026-06-17 |
Inorganic nanomaterials empowering bacteria: a new paradigm for biomedical applications
2026-Jun-08, Journal of materials chemistry. B
DOI:10.1039/d6tb00687f
PMID:42301118
|
综述 | 本文综述了利用无机纳米材料增强细菌功能以构建诊疗一体化混合系统的策略 | 首次系统性地总结无机纳米材料通过表面修饰、细胞内矿化和微囊包封等策略赋予细菌新诊断和治疗能力的机制 | 当前研究仍面临生物安全性和临床转化方面的挑战 | 为开发下一代智能生物医学平台提供理论依据 | 无机纳米材料与细菌构建的功能混合系统 | 数字病理学 | 耐药菌感染、肠道菌群失调、肿瘤 | NA | NA | NA | NA | NA | 细菌 | NA | 医学 |
| 89 | 2026-06-17 |
Genetically engineered outer membrane vesicles as next-generation bionanomaterials for therapeutic and diagnostic applications
2026-Jun-04, Journal of materials chemistry. B
DOI:10.1039/d6tb00650g
PMID:42300204
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综述 | 系统概述基因工程外膜囊泡作为下一代生物纳米材料在治疗和诊断应用中的设计与转化 | 全面梳理了基因工程外膜囊泡的表面展示、货物装载和膜调控等关键工程策略，并强调合成生物学、材料科学与人工智能的整合潜力 | 临床转化面临规模制造、安全性评估和监管路径等关键挑战 | 探讨基因工程外膜囊泡作为智能精准诊疗平台的可能性 | 革兰氏阴性菌天然释放的外膜囊泡及其基因工程改造版本 | 数字病理学 | 癌症 | 基因工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 革兰氏阴性菌 | 表面展示、货物装载、膜调控 | 医学 |
| 90 | 2026-06-17 |
Synthetic biology as a game-changer for endangered medicinal orchids: biosynthesis, engineering and conservation
2026-Jun-02, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d6np00027d
PMID:42300065
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综述 | 本文综述了合成生物学如何通过模块化设计、异源重构和代谢工程等手段，推动濒危药用兰花的可持续利用与保护 | 创新性地将合成生物学引入濒危药用兰花保护领域，通过解耦供应与生态提取实现可持续生产，并整合多组学、人工智能和基因编辑加速工程化循环 | 未明确讨论合成生物学应用的潜在生态风险或大规模生产的经济可行性 | 探讨合成生物学在濒危药用兰花生物合成、工程化及保护中的变革性作用 | 濒危药用兰花及其高价值代谢物（如天麻素、石斛碱） | 合成生物学 | NA | 代谢工程、异源表达、定向进化、多组学、基因编辑、人工智能 | NA | 多组学数据 | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick | 微生物（如大肠杆菌、酿酒酵母）、植物底盘 | 生物合成途径模块化设计、振荡器、生物传感器、代谢途径 | 医药、农业、工业生物技术 |
| 91 | 2026-06-17 |
The division of vesicles requires the fission of closed membrane necks but does not require active processes
2026-Jun-02, Soft matter
IF:2.9Q2
DOI:10.1039/d6sm00283h
PMID:42300069
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研究论文 | 通过理论、实验和模拟分析，证明囊泡分裂需要闭合膜颈的裂变，但不需要主动过程 | 首次明确表明囊泡分裂不需要化学机械耦合的主动过程（如核苷酸水解），仅需闭合膜颈的形成与裂变，并提出了由自发曲率或应力不对称控制收缩力的机制 | 主要基于作者团队的研究结果，可能未涵盖所有类型的囊泡分裂机制；主动过程在自然界中的角色未被完全排除 | 阐明囊泡分裂的物理机制，并验证其是否依赖于主动过程 | 巨型囊泡和纳米囊泡的膜分裂过程 | 软物质科学、合成生物学 | NA | NA | 理论模型、计算机模拟 | 实验数据、模拟数据 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学、软物质工程 |
| 92 | 2026-06-17 |
p-Benzoyl-l-phenylalanine as a Multifunctional Noncanonical Amino Acid in Synthetic Biology: Photoprobing, Photocatalysis, and Structural Programming for Biocontainment
2026-03-16, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202525502
PMID:41664298
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综述 | 系统总结p-苯甲酰-L-苯丙氨酸作为多功能非经典氨基酸在合成生物学中用于光探测、光催化和生物防护结构编程的研究进展 | 首次全面阐述pBzF的三重态光化学特性及其在蛋白质工程中的多功能应用，包括光交联、光催化及构建人工光合系统 | 未提及实际应用中可能存在的细胞毒性、光损伤或体内转化效率限制 | 综述pBzF在合成生物学中作为光化学和结构基序的多样化应用，为构建非天然光响应催化功能蛋白提供框架 | p-苯甲酰-L-苯丙氨酸及其在蛋白质工程中的应用案例 | 合成生物学 | NA | 非经典氨基酸定向进化、遗传密码扩展 | NA | NA | NA | 非经典氨基酸定向进化 | NA | 光响应蛋白、光催化系统、人工光合系统 | 医学, 工业生物技术 |
| 93 | 2026-06-17 |
Recognition of Non-standard Base Pairs by Triplex-Forming Oligonucleotides Containing an Expanded Genetic Alphabet
2026-Feb-17, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-8652009/v1
PMID:41756467
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研究论文 | 本文利用人工扩展遗传信息系统中的核碱基，扩展了三链形成寡核苷酸对非标准碱基对的识别能力 | 首次通过人工扩展遗传信息系统中的核碱基，在三链形成寡核苷酸中实现了对含有标准、损伤或合成碱基对的双链DNA的中性pH下纳摩尔级亲和力识别，并发现了至少12种新的模块化三碱基组合 | 未提及 | 扩展三链形成寡核苷酸对双链DNA的序列特异性识别空间，克服天然核碱基在靶点序列和酸性条件上的限制 | 人工扩展遗传信息系统中的核碱基、三链形成寡核苷酸、双链DNA（含标准、损伤或合成碱基对） | 分子医学、合成生物学 | NA | 人工扩展遗传信息系统 | NA | NA | 120种三碱基组合 | NA | NA | NA | 分子医学、合成生物学、核酸纳米技术 |
| 94 | 2026-06-17 |
Transmembrane Transport of cAMP and AMP Using a Two Component Small Molecule Transport System
2026-01-22, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202524663
PMID:41367116
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研究论文 | 报道首个在生理pH下利用中性双组分系统辅助环磷酸腺苷和磷酸腺苷穿过脂质体膜转运的研究 | 首次实现中性小分子系统对环磷酸腺苷和磷酸腺苷的跨膜转运，采用磷酸基团靶向合成阴离子载体与胸腺嘧啶衍生物协同作用提高转运效率 | 仅基于脂质体模型验证，未在活细胞体系中测试，且转运机制细节尚需进一步阐明 | 开发小分子系统实现核苷酸跨膜转运，探索在药物递送和合成生物学中的应用 | 环磷酸腺苷和磷酸腺苷的跨膜转运过程 | 合成生物学 | NA | 荧光检测、磷核磁共振 | NA | 实验数据 | 未明确样本数量，涉及脂质体模型和多种小分子化合物 | NA | 脂质体（模拟膜系统） | 双组分小分子转运系统：合成阴离子载体（氟化方酰胺）与胸腺嘧啶衍生物协同作用 | 药物递送, 合成生物学 |
| 95 | 2026-06-17 |
Discovery of a Heme-Dependent Enzyme Catalyzing Nitrogen-Nitrogen Bond Formation in Kinamycin Biosynthesis
2025-12-08, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202513778
PMID:41137433
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研究论文 | 发现了在kinamycin生物合成中催化氮-氮键形成的一种新型血红素依赖酶Alp1J | 首次发现了一种属于新家族的血红素依赖酶Alp1J催化氮-氮键形成，并揭示了其与铁氧还蛋白Alp1I形成稳定复合物保护辅因子及催化活性的机制 | 未明确提及局限性 | 揭示kinamycin生物合成中氮-氮键形成的酶学机制 | Alp1J酶及其伴侣铁氧还蛋白Alp1I | NA | NA | 诱变、生物化学研究 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学、合成生物学 |
| 96 | 2026-06-17 |
Sticky enzymes: increased metabolic efficiency via substrate-dependent enzyme clustering
2025-Sep, PRX life
DOI:10.1103/99bt-4ss4
PMID:42281556
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研究论文 | 提出一种通过底物依赖性酶聚集提高代谢效率的自我组织策略 | 首次提出可通过底物可利用性调控酶的“粘性”以实现接近最优大小和间距的酶簇自我组织，从而显著提高代谢通量并降低毒性代谢物 | 主要基于数学模型研究，缺乏体内实验验证；实际细胞环境中酶粘性的变构调控机制需进一步探索 | 探索一种超越现有自然和工程酶簇范式的自我组织策略，以提高代谢效率 | 简单代谢通路中的酶簇 | 合成生物学, 代谢工程 | NA | 数学建模, 热力学约束分析 | NA | 数学模拟数据 | NA | NA | NA | 底物依赖性相分离酶簇 | 合成生物学, 代谢工程 |
| 97 | 2026-06-17 |
When good guides go bad: empirical evaluation of all unique Cas9 protospacers in E. coli reveal widespread functionality and rules for gRNA design
2025-Jul-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.23.651106
PMID:40475487
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研究论文 | 通过评估大肠杆菌中近50万个独特gRNA的活性，揭示了Cas9靶向的广泛功能性及gRNA设计规则 | 首次大规模实验评估了所有独特Cas9原型间隔序列，发现93%以上的gRNA具有功能性，并识别出非功能性gRNA的自我相互作用特征，提出了简单设计规则进行排除 | 研究仅针对大肠杆菌K12 MG1655基因组，未验证其他细菌或真核宿主中的通用性 | 解决关于Cas9 gRNA特异性的矛盾报道，为微生物合成生物学提供功能性和非功能性gRNA的全面评估及实验流程 | 大肠杆菌K12 MG1655基因组中的独特gRNA | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9, NGS | NA | DNA序列 | 近500,000个独特gRNA | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌 | Cas9靶向系统 | 工业生物技术，医药 |
| 98 | 2026-06-17 |
Sticky enzymes: increased metabolic efficiency via substrate-dependent enzyme clustering
2024-Nov-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.11.05.622105
PMID:39574612
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研究论文 | 提出底物依赖性酶聚集可增加代谢效率的数学建模研究 | 提出通过相分离酶的自组织形成近乎最优大小和间距的簇，且酶的“粘性”受局部底物可用性调节，实现按需聚集 | 主要在理论模型和计算模拟层面，缺乏实验验证实际细胞中该机制的可实现性 | 探索代谢途径中酶自发组织成高效簇的策略以提高代谢效率 | 简单代谢途径中的酶簇自组织行为 | 机器学习 | NA | 数学建模、热力学约束分析 | 数学模型 | 模拟数据 | NA | NA | NA | 底物依赖性酶聚集回路 | 合成生物学, 代谢工程 |
| 99 | 2026-06-16 |
Engineered bacteria in disease diagnosis and therapy: A synthetic biology perspective
2026-Dec, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2026.04.028
PMID:42293685
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综述 | 这篇综述从合成生物学角度总结了工程菌在疾病诊断和治疗中的应用进展 | 系统梳理了合成生物学技术（如CRISPR/Cas9、DNA组装、定向进化及人工智能集成）如何赋能工程菌作为“活体传感器”和定制化治疗载体，并讨论了提升安全性和有效性的工程策略 | 工程菌的临床转化仍面临稳定定植、免疫原性控制、大规模生产标准化及监管伦理框架等挑战 | 优化细菌功能以拓展其在诊断和精准医学中的潜力 | 工程菌 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9, DNA组装, 定向进化, 人工智能 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 细菌 | 生物传感器, 靶向药物递送, 免疫调控, 微生物组调节 | 医学 |
| 100 | 2026-06-16 |
Identification of a thermotolerant strain of Aureobasidium melanogenum DA22 and functional analysis of Spt23 as a key transcriptional regulator in high-temperature polymalic acid fermentation
2026-Oct, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2026.134956
PMID:42176819
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研究论文 | 鉴定了一株耐热菌株 Aureobasidium melanogenum DA22，并分析了转录调控因子 Spt23 在高温聚苹果酸发酵中的关键作用 | 发现并鉴定了天然耐热菌株 DA22，并过表达膜相关转录因子 SPT23 基因构建耐热微生物细胞工厂，在高温下显著提高聚苹果酸产量 | 未说明长期工业化条件下的稳定性和成本效益 | 构建耐热微生物细胞工厂，实现高温下高效有机酸生产 | 耐热菌株 Aureobasidium melanogenum DA22 及转录因子 Spt23 | 合成生物学 | NA | 过量表达、基因敲除、RT-qPCR、发酵工程 | NA | 生长曲线、发酵滴度、基因表达水平、形态观察 | 筛选120株野生型分离株，其中DA22为耐热菌株 | 过量表达、基因敲除 | Aureobasidium melanogenum | 过表达SPT23基因的合成生物学回路，用于增强耐热性和有机酸生产 | 工业生物技术 |