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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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81 | 2025-05-09 |
Challenges and limitations in using bacterial metabolites as immunomodulators
2025, Frontiers in cellular and infection microbiology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcimb.2025.1535394
PMID:39944722
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综述 | 探讨利用细菌代谢物作为免疫调节剂面临的挑战与限制 | 强调了个性化方法的重要性,并探讨了克服限制的潜在技术进步 | 细菌代谢物的生物利用度有限,存在脱靶效应,以及微生物组与代谢物之间复杂的相互作用 | 研究细菌代谢物作为免疫调节剂的临床应用潜力 | 细菌代谢物及其与免疫系统的相互作用 | 免疫学 | 免疫相关疾病 | 宏基因组学、代谢组学、合成生物学、靶向递送系统 | NA | NA | NA |
82 | 2025-05-09 |
Enhancing active ingredient biosynthesis in Chinese herbal medicine: biotechnological strategies and molecular mechanisms
2025, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.18914
PMID:39950047
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综述 | 本文综述了现代生物技术在增强中草药活性成分生物合成中的应用及其分子机制 | 整合了生物合成、分子调控、提取方法和合成生物学的多角度分析,提出了增强中草药活性成分生产的策略 | 未提及具体实验验证或案例研究,可能缺乏实际应用的详细指导 | 探索现代生物技术在中草药活性成分生物合成中的应用潜力 | 中草药的活性成分及其生物合成途径 | 生物技术 | NA | 代谢工程、合成生物学工具 | NA | NA | NA |
83 | 2025-05-09 |
A meta-analysis of the gut microbiome in inflammatory bowel disease patients identifies disease-associated small molecules
2024-Feb-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.02.07.579278
PMID:38370680
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meta-analysis | 通过多队列分析肠道微生物组中的小分子生物合成基因簇(BGCs),研究了炎症性肠病(IBD)患者与健康对照之间的差异 | 发现了一组与IBD显著相关的梭菌衍生BGCs,并通过合成生物学方法鉴定出六种脂肪酸酰胺作为这些BGCs的产物 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本的验证可能不足 | 探索肠道微生物组中小分子在IBD发病机制中的作用 | 炎症性肠病(IBD)患者和健康对照的肠道微生物组 | 微生物组学 | 炎症性肠病 | 宏基因组测序、合成生物学 | NA | 宏基因组数据 | 5,306个肠道微生物组样本(来自2,033名IBD患者和833名健康对照) |
84 | 2025-05-09 |
Concepts of a synthetic minimal cell: Information molecules, metabolic pathways, and vesicle reproduction
2024, Biophysics and physicobiology
IF:1.6Q4
DOI:10.2142/biophysico.bppb-v21.0002
PMID:38803330
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review | 本文回顾了合成最小细胞系统的概念,包括信息分子、代谢途径和囊泡繁殖,并与生物细胞进行了比较 | 提出了合成最小细胞系统,展示了递归生长和分裂周期,避免了使用生物细胞的复杂分子机制 | NA | 探索生命系统如何从非生命分子组装中产生,以及支持这一过程的物理和化学原理 | 合成最小细胞系统 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
85 | 2025-05-09 |
A simeprevir-inducible molecular switch for the control of cell and gene therapies
2023-11-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-43484-9
PMID:38012128
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research paper | 本文介绍了一种基于simeprevir的新型化学诱导二聚化(CID)模块,用于控制细胞和基因治疗中的生物过程 | 开发了一种基于已获批口服小分子simeprevir的新型CID模块,可用于控制基因表达和细胞凋亡,并在异种移植小鼠模型中展示了其诱导肿瘤细胞凋亡的能力 | 研究主要集中于体外和小鼠模型,尚未在人体中进行验证 | 开发可用于临床环境的新型分子开关系统 | 化学诱导二聚化(CID)模块及其在细胞和基因治疗中的应用 | 合成生物学 | 肿瘤 | 化学诱导二聚化技术 | 异种移植小鼠模型 | 实验数据 | 体外细胞实验和异种移植小鼠模型 |
86 | 2025-05-08 |
Making Cells as a "Nirvana Phoenix": Precise Coupling of Precursors Prior to ROS Bursts for Intracellular Synthesis of Quantum Dots
2025-May-07, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.5c02861
PMID:40259718
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research paper | 该研究开发了一种在活细胞内精确合成近红外量子点(QDs)的方法,通过控制前体的耦合和反应条件,显著提高了细胞存活率和荧光强度 | 利用细胞适应性硒代胱氨酸((Cys-Se))作为前体,结合Ag-谷胱甘肽(AgSG),在细胞内合成近红外AgSe量子点,同时抑制细胞毒性物质和ROS的爆发 | 研究未涉及大规模生产或临床应用的具体细节 | 开发一种在活细胞内高效、低毒合成荧光量子点的方法,用于细胞标记和生物成像 | 活细胞内的无机纳米晶体合成 | 合成生物学 | NA | 细胞内量子点合成技术 | NA | 荧光成像数据 | NA |
87 | 2025-05-08 |
Mapping the Edges of Mass Spectral Prediction: Evaluation of Machine Learning EIMS Prediction for Xeno Amino Acids
2025-May-07, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.5c00286
PMID:40329886
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research paper | 评估NEIMS光谱预测算法在单取代α-氨基酸上的准确性,以解决依赖实验确定签名的问题 | 评估了NEIMS算法在预测超出训练数据范围的氨基酸光谱时的准确性,并指出其不准确性无法通过物理化学差异或氨基酸的衍生化状态来解释 | 预测光谱对于超出算法训练数据的氨基酸不准确,且这些不准确性无法通过物理化学差异或衍生化状态来解释 | 评估机器学习EIMS预测算法在单取代α-氨基酸上的准确性,以扩展未知生物分子的检测能力 | 单取代α-氨基酸 | machine learning | NA | mass spectrometry | NEIMS | mass spectral data | NA |
88 | 2025-05-08 |
Automated Construction of a Yeast-Based Multigene Library via Homologous Recombination in a Biofoundry Workflow
2025-May-07, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00812
PMID:40331904
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研究论文 | 本研究开发了一种基于体内同源重组的自动化一步多基因组装方法,用于构建表达可调库 | 开发了一种自动化一步多基因组装方法,优化了穿梭载体以提高组装效率,并实现了高通量基因组装 | NA | 突破传统克隆技术的限制,简化多基因组装过程,实现高效代谢途径构建 | 酵母基于的多基因库 | 合成生物学 | NA | 体内同源重组 | NA | NA | NA |
89 | 2025-05-08 |
Responses of natural plastisphere community and zooplankton to microplastic pollution: a review on novel remediation strategies
2025-May-07, Archives of microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00203-025-04334-y
PMID:40332619
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综述 | 本文综述了微塑料污染对自然塑球群落和浮游动物的影响,并探讨了基于自然群落水平的新型修复策略 | 重点讨论了塑球群落的适应性反应、浮游动物对微塑料的摄取和表面修饰,以及基于微生物降解和生态功能的生物修复策略 | 需要进一步研究开发先进的微塑料去除技术,并更深入了解微塑料对海洋生态系统的毒性影响 | 探讨微塑料污染的修复策略及其对环境的影响 | 自然塑球群落和浮游动物 | 环境科学 | NA | DNA元条形码 | NA | 文献数据 | NA |
90 | 2025-05-08 |
Coacervates as enzymatic microreactors
2025-May-06, Chemical Society reviews
IF:40.4Q1
DOI:10.1039/d4cs01203h
PMID:40084439
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综述 | 本文综述了基于凝聚层的酶微反应器的最新进展,重点讨论了凝聚层加速酶反应的机制及其在生物催化、合成生物学和纳米技术中的潜在应用 | 探讨了凝聚层作为酶微反应器的创新应用,包括增强底物和酶浓度、稳定中间产物以及提供分子拥挤环境 | 讨论了在凝聚层内监测反应的挑战,以及当前可用的技术如荧光技术、色谱和核磁共振光谱的局限性 | 研究凝聚层微反应器的设计及其在生物催化、合成生物学和纳米技术中的应用 | 合成聚合物、肽和核酸为基础的凝聚层系统 | 合成生物学 | NA | 荧光技术、色谱、NMR光谱 | NA | NA | NA |
91 | 2025-05-08 |
Cell-free synthetic biology for natural product biosynthesis and discovery
2025-May-06, Chemical Society reviews
IF:40.4Q1
DOI:10.1039/d4cs01198h
PMID:40104998
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综述 | 本文综述了无细胞合成生物学在天然产物生物合成和发现中的应用及其优势与局限 | 探讨了无细胞合成生物学在天然产物生物合成中的新兴应用,包括路径原型设计和新型代谢物生产 | 与全细胞或化学生产路线相比,无细胞合成生物学存在一定的局限性 | 研究无细胞合成生物学在天然产物生物合成和发现中的应用 | 天然产物及其生物合成基因簇 | 合成生物学 | NA | 无细胞合成生物学 | NA | NA | NA |
92 | 2025-05-08 |
Protein-derived cofactors: chemical innovations expanding enzyme catalysis
2025-May-06, Chemical Society reviews
IF:40.4Q1
DOI:10.1039/d4cs00981a
PMID:40151987
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review | 本文综述了蛋白质衍生辅因子的生物合成、反应性、代谢调控及其在合成生物学和生物技术中的应用 | 揭示了蛋白质衍生辅因子的多样性和扩展功能,包括远程催化和氧化还原调控的分子开关等新范式 | 对辅因子组装机制的理解仍滞后于其发现速度 | 探讨蛋白质衍生辅因子的化学创新及其对酶催化的扩展作用 | 蛋白质衍生辅因子 | 生物化学 | NA | 非经典氨基酸位点特异性掺入、结构生物学、质谱、生物物理光谱 | NA | NA | NA |
93 | 2025-05-08 |
A Robust and Orthogonal Far-Red Light Sensor for Gene Expression Control in Escherichia coli
2025-May-06, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00044
PMID:40327816
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research paper | 该研究开发了一种基于RfpABC信号系统的正交远红光传感器,用于大肠杆菌中的基因表达控制 | 首次在大肠杆菌中建立了基于RfpABC信号系统的正交远红光传感器,动态范围超过230倍 | 研究仅限于大肠杆菌,未在其他细菌中验证 | 开发用于合成生物学应用的远红光传感器 | 大肠杆菌和蓝藻中的RfpABC信号系统 | 合成生物学 | NA | 光遗传学 | NA | 基因表达数据 | NA |
94 | 2025-05-08 |
Engineering Bacillus Spores to Display Nicotine Oxidase: In Situ Specific and Sensitive Nicotine Detection
2025-May-06, ACS sensors
IF:8.2Q1
DOI:10.1021/acssensors.5c00275
PMID:40329593
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研究论文 | 本研究通过合成生物学和材料工程的结合,开发了一种新型的活体电化学生物传感器,用于高灵敏度和实时检测尼古丁 | 通过基因工程改造的NOX突变体(活性增强9.5倍且热稳定性提高)与FeSe@MHCS复合电极的结合,实现了超低检测限(0.25 nM)和优异的稳定性 | NA | 开发一种高灵敏度和实时检测尼古丁的生物传感器 | 尼古丁 | 生物传感器 | NA | 电化学阻抗谱(EIS)、差分脉冲伏安法(DPV) | NA | 电化学数据 | 血液和尿液样本 |
95 | 2025-05-08 |
Cytomimetic calcification in chemically self-regulated prototissues
2025-May-03, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-59251-x
PMID:40319022
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research paper | 该研究开发了一种能够进行协调和适应性功能的细胞模拟材料,通过共价键将碱性磷酸酶无机原细胞固定在交联有机网络上,形成类似组织的微复合材料 | 通过化学自调节机制实现原组织的内源性钙化,模拟了骨组织中成骨细胞和破骨细胞的相互作用 | NA | 开发具有协调和适应性功能的细胞模拟材料,推动自下而上的合成生物学发展 | 碱性磷酸酶无机原细胞和交联有机网络组成的微复合材料 | 合成生物学 | NA | 化学自调节机制 | NA | NA | NA |
96 | 2025-05-08 |
An acoustofluidic embedding platform for rapid multiphase microparticle injection
2025-May-03, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-59146-x
PMID:40319024
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研究论文 | 开发了一种声流体频率相关微球嵌入平台,实现从氟化油到水滴的微尺度快速微粒注入 | 首次实现了固体微粒在水相和油相之间的自由动态操控,并建立了跨相操控的理论模型和实用原则 | NA | 增强现有液滴操控技术,实现多相和跨相操作 | 水凝胶微球 | 微流控技术 | NA | 声流体技术 | 理论模型 | NA | NA |
97 | 2025-05-08 |
Metabolic Engineering of Yeast
2025-May, Annual review of biophysics
IF:10.4Q1
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综述 | 本文综述了酵母代谢工程的最新进展和前景,包括生产燃料、化学品、蛋白质和肽的酵母菌株开发 | 强调了合成生物学工具和数学建模在酵母代谢工程中的最新进展 | 未提及具体实验数据或样本量,可能缺乏具体案例支持 | 探讨酵母作为微生物细胞工厂在工业生物技术中的应用 | 酵母菌株 | 工业生物技术 | NA | 合成生物学、数学建模 | NA | NA | NA |
98 | 2025-05-08 |
Unraveling the hydroxylation and methylation mechanism in polymethoxylated flavones biosynthesis in Dracocephalum moldavica
2025-Apr, Plant physiology and biochemistry : PPB
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.plaphy.2025.109571
PMID:39919496
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研究论文 | 本研究揭示了Dracocephalum moldavica中多甲氧基黄酮(PMFs)生物合成中的羟基化和甲基化机制 | 鉴定了三种黄酮羟基化酶(DmFH1/2/3)和四种黄酮O-甲基转移酶(DmOMT1/2/3/4),并阐明了它们在PMFs生物合成中的作用 | 研究仅基于转录组数据库分析,未进行更深入的体内功能验证 | 阐明Dracocephalum moldavica中多甲氧基黄酮生物合成的羟基化和甲基化机制 | Dracocephalum moldavica植物及其多甲氧基黄酮生物合成相关酶 | 植物生物化学 | NA | 转录组分析、异源表达 | NA | 转录组数据 | NA |
99 | 2025-05-08 |
Progress on production of malic acid and succinic acid by industrially-important engineered microorganisms
2025-Apr, Journal of biotechnology
IF:4.1Q2
DOI:10.1016/j.jbiotec.2025.02.001
PMID:39923900
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综述 | 本文总结了通过代谢工程改进有机酸生物合成的最新研究进展,重点关注L-苹果酸(L-MA)和琥珀酸(SA) | 结合合成生物学和高通量筛选等新技术,探讨了代谢工程在提高有机酸产量方面的应用 | 微生物发酵的产量低和发酵周期长限制了其工业应用 | 改进有机酸的生物合成方法,提高产量和效率 | L-苹果酸(L-MA)和琥珀酸(SA) | 合成生物学 | NA | 代谢工程、合成生物学、高通量筛选 | NA | NA | NA |
100 | 2025-05-08 |
Natural, modified and conjugated carbohydrates in nucleic acids
2025-Mar-17, Chemical Society reviews
IF:40.4Q1
DOI:10.1039/d4cs00799a
PMID:39936337
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综述 | 本文综述了核酸中天然、修饰和共轭碳水化合物的研究进展,特别是在治疗应用、异源核酸(XNAs)开发及核酸病因学研究方面 | 强调了糖修饰在改善核酸性质方面的作用,特别是在治疗应用和异源核酸开发中的最新进展 | 未具体提及研究的局限性 | 探讨核酸中糖修饰的主要动机及其在治疗、生物技术和合成生物学中的应用 | 核酸中的碳水化合物修饰 | 生物化学 | NA | 核酸和碳水化合物化学、蛋白质工程、递送方法 | NA | NA | NA |