合成生物学相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
81	2025-07-10	Enhanced phenanthrene degradation by a synthetically engineered E. coli consortium utilizing the SCRaMbLE for the evolution of key genes 2025-Jul-05, Journal of hazardous materials IF:12.2Q1 DOI:10.1016/j.jhazmat.2025.139152 PMID:40628214	研究论文	本研究通过合成生物学方法构建了一个工程化大肠杆菌联合体，用于增强菲的降解效率	利用SCRaMbLE方法对关键基因进行实验室进化，显著提高了菲的降解效率	研究仅针对菲这一种多环芳烃，未测试其他PAHs的降解效果	开发高效降解多环芳烃(PAHs)的生物修复系统	工程化大肠杆菌BL21(DE3)联合体	合成生物学	NA	SCRaMbLE方法	NA	NA	三种工程化大肠杆菌菌株(SCRPHE033, SCRKA065, CRSA)
82	2025-07-10	Live-cell synthesis of biocompatible quantum dots 2025-Jul, Nature protocols IF:13.1Q1 DOI:10.1038/s41596-024-01133-5 PMID:40097832	研究论文	开发了一种在活细胞内合成生物兼容量子点的方法，并验证了其在多种细胞中的应用	通过精确的空间和时间序列耦合细胞内代谢途径，实现了量子点在活细胞内的合成，提高了生物兼容性	需要具备化学、生物学、材料科学和合成生物学专业知识的用户才能完成该流程	开发生物兼容量子点的合成方法，以扩展其在生物医学中的应用	酵母、金黄色葡萄球菌、MCF-7和MDCK细胞	合成生物学	NA	活细胞合成和准生物合成	NA	NA	酵母、金黄色葡萄球菌、MCF-7和MDCK细胞
83	2025-07-10	Application of Sensor Based on Circularly Permuted Fluorescent Protein in Molecular Biology, Metabolism, and Cellular Imaging 2025-Jul, Biotechnology journal IF:3.2Q2 DOI:10.1002/biot.70071 PMID:40630016	综述	本文综述了基于循环排列荧光蛋白（cpFP）的传感器在分子生物学、代谢和细胞成像领域的应用	探讨了通过循环排列荧光蛋白调整其对环境信号（如pH、离子浓度、电压或分子相互作用）的敏感性，并动态监测细胞内过程	未提及具体实验数据或样本量，可能缺乏实证研究支持	总结cpFP传感器的形成机制、结构动态分析与优化，及其在生物医学和合成生物学中的功能应用	循环排列荧光蛋白（cpFP）及其传感器应用	分子生物学	NA	循环排列荧光蛋白技术	NA	NA	NA
84	2025-07-10	Synthetic biology of metabolic cycles for Enhanced CO2 capture and Sequestration 2024-12, Bioorganic chemistry IF:4.5Q1 DOI:10.1016/j.bioorg.2024.107774 PMID:39260160	研究论文	本文描述了在大肠杆菌中使用改良的三羧酸循环（THETA循环）进行碳固定和氨基酸合成的研究	提出了THETA循环这一改良的三羧酸循环，用于合成生物学和碳固定，并展示了其在体内各模块的可行性及与大肠杆菌代谢网络的整合	NA	研究改良的三羧酸循环在合成生物学和碳固定中的应用	大肠杆菌	合成生物学	NA	酶优化、路径重新设计、异源表达	NA	NA	NA
85	2025-07-10	Recent progress in stimuli-responsive DNA-based logic gates: Design, working principles and biological applications 2024-Mar, Smart molecules : open access DOI:10.1002/smo.20230023 PMID:40625523	综述	本文综述了刺激响应DNA逻辑门的设计、工作原理及生物应用的最新进展	强调了由金属离子、pH、寡核苷酸、小分子、蛋白质和光触发的各种逻辑门的发展	NA	探讨刺激响应DNA逻辑门在合成生物学和纳米技术领域的应用前景	刺激响应DNA逻辑门	合成生物学	NA	NA	NA	NA	NA
86	2025-07-09	Plant-Derived Natural Products Ameliorating Hypertension via Signaling Pathways: A Review 2025-Jul-08, The American journal of Chinese medicine DOI:10.1142/S0192415X2550051X PMID:40626404	综述	本文综述了2019年至2024年间发表的具有潜在抗高血压活性的植物源天然产物，探讨了它们通过靶向氧化应激、炎症、血管重塑和神经激素途径来预防高血压发展的机制	总结了70种独特的天然产物，并将其分类为黄酮类、萜类、生物碱类和植物提取物，提出了未来研究应优先考虑具有双重抗氧化/抗炎特性的天然产物、改进的生物利用度递送系统以及整合合成生物学的跨学科方法	仅涵盖了2019年至2024年间发表的文献，可能遗漏了早期的重要研究	评估植物源天然产物在高血压治疗中的潜在应用	植物源天然产物	药理学	心血管疾病	文献综述	NA	文本	70种独特的天然产物
87	2025-07-09	Plant Cytochrome P450 Enzymes for Bioactive Metabolites Biosynthesis, Growth Regulation and Stress Adaptation 2025-Jul-07, Plant physiology IF:6.5Q1 DOI:10.1093/plphys/kiaf297 PMID:40623215	综述	本文总结了植物细胞色素P450酶（CYPs）在生物活性代谢物生物合成、生长调控和应激适应中的最新研究进展	从CYPs参与植物重要生物活性化合物生物合成及其在植物生长、发育和应激适应中的生理功能两个角度进行综述	目前数据库中记录的CYPs中仅有不到0.2%经过功能表征	增强对植物CYPs功能的理解，为生物技术育种和合成生物学领域的创新应用铺平道路	植物细胞色素P450酶（CYPs）	合成生物学	NA	NA	NA	NA	NA
88	2025-07-08	Scaling Up Postbiotics Production: A Prospective Review of Processes and Health Benefits 2025-Jul-07, Probiotics and antimicrobial proteins IF:4.4Q2 DOI:10.1007/s12602-025-10643-x PMID:40622649	综述	本文综述了后生元的生产工艺及其健康益处，探讨了优化生产的技术工具和面临的挑战	总结了优化后生元生产的工具和技术，包括Plackett-Burman设计、响应面方法(RSM)、田口方法和中心复合设计(CCD)，以及分子技术如基因工程、CRISPR-Cas9和代谢工程	工业生产规模扩大仍面临稳定性、质量、产量和一致性等挑战，高细胞密度与后生元产量之间的相关性尚需深入研究	探索后生元的生产工艺优化及其健康益处	后生元及其生产工艺	生物技术	心血管疾病	基因工程、CRISPR-Cas9、代谢工程	NA	NA	NA
89	2025-07-08	Opto-p53: A light-controllable activation of p53 signaling pathway 2025-Jul-04, Cell structure and function IF:2.0Q4 DOI:10.1247/csf.25017 PMID:40500178	研究论文	本研究开发了一种光遗传学工具Opto-p53，用于通过光控制p53信号通路	开发了光控p53信号通路的工具Opto-p53，并通过特定突变增强了光诱导p53激活的效果	未提及在体内实验中的应用效果	开发选择性激活p53的实验系统，以解析p53在细胞过程中的复杂作用	p53蛋白及其信号通路	合成生物学	肿瘤	光遗传学	Opto-p53（基于光诱导二聚化系统LID）	细胞实验数据	NA
90	2025-07-08	Regulation of the tagatose catabolic gene cluster and development of a tagatose-inducible expression system in the probiotic Escherichia coli Nissle 1917 2025-Jul-04, Microbial cell factories IF:4.3Q1 DOI:10.1186/s12934-025-02771-4 PMID:40615889	研究论文	开发了一种在益生菌大肠杆菌Nissle 1917中基于D-塔格糖的可诱导基因表达系统	利用D-塔格糖作为可代谢诱导剂，开发了新型基因表达系统，并揭示了D-塔格糖分解代谢的关键调控元件	未提及具体局限性	开发可靠的可诱导基因表达系统以扩展益生菌大肠杆菌Nissle 1917的应用	益生菌大肠杆菌Nissle 1917及其基因表达调控	合成生物学	NA	差异RNA测序和序列分析	NA	基因表达数据	NA
91	2025-07-08	FoldMark: Safeguarding Protein Structure Generative Models with Distributional and Evolutionary Watermarking 2025-Jun-04, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2024.10.23.619960 PMID:39554012	研究论文	本文介绍了FoldMark，一种基于分布和进化原理的水印策略，用于保护蛋白质生成模型	首次提出针对蛋白质生成模型的分布和进化水印策略，平衡水印容量和结构质量	未明确提及具体限制	开发一种保护AI驱动的蛋白质研究的安全措施	蛋白质生成模型	计算蛋白质科学	NA	水印技术	AlphaFold3, ESMFold, RFDiffusion, RFDiffusionAA	蛋白质结构数据	包括EGFP和CRISPR-Cas13在内的蛋白质设计案例
92	2025-07-08	Harnessing oleaginous protist Schizochytrium for docosahexaenoic acid: Current technologies in sustainable production and food applications 2025-Mar, Food research international (Ottawa, Ont.) DOI:10.1016/j.foodres.2025.115996 PMID:40032480	综述	本文综述了利用产油原生生物裂殖壶菌生产二十二碳六烯酸（DHA）的当前生物技术，包括菌株改良、发酵优化、DHA油提取策略、安全评估和稳定性维护方案以及在食品中的应用	系统总结了影响裂殖壶菌DHA生产的因素，并提出了改进菌株、优化发酵过程、提高DHA产品氧化稳定性、掩盖DHA气味缺陷以及利用合成生物学开发DHA结构脂质的新方法	裂殖壶菌DHA产品的广泛应用受到菌株性能、发酵参数、产品收获和提取策略、安全性和稳定性维护以及健康和功能特性应用限制的影响	探索裂殖壶菌DHA的生产技术并推动其在食品和健康领域的应用发展	产油海洋原生生物裂殖壶菌及其生产的二十二碳六烯酸（DHA）	生物技术	NA	菌株改良技术、发酵优化、纳米颗粒包装技术、合成生物学	NA	NA	NA
93	2025-07-07	Integrating incompatible tandem photobiocatalysis in artificial cells enables metabolic modulation of natural cells 2025-Jul-04, Science advances IF:11.7Q1 DOI:10.1126/sciadv.adu4828 PMID:40614183	研究论文	本文设计了一种光生物催化人工细胞，通过缓解酒精诱导的氧化应激来调节肝细胞代谢	通过纳米细胞器分隔不相容的模块，实现了光催化辅因子再生与生物催化酒精代谢的空间分离，提高了反应效率并保护酶免受氧化损伤	未提及具体的人工细胞在体内应用时的长期稳定性及潜在免疫反应	开发具有实际应用价值的人工细胞系统，用于调节活体细胞代谢	人工细胞与肝细胞的共培养系统	合成生物学	肝病	光催化与酶催化技术	NA	生物化学数据	未明确提及具体样本数量
94	2025-07-07	Diverse lineages and adaptations of oxygen-adapted hydrogenases 2025-Jul, Trends in biochemical sciences IF:11.6Q1 DOI:10.1016/j.tibs.2025.04.006 PMID:40436686	research paper	本文探讨了微生物中适应氧气的镍铁氢化酶的多样性和适应性	揭示了镍铁氢化酶在含氧环境中通过多种独立进化策略抵御氧气抑制的机制	未提及具体实验数据或样本量来支持这些适应性机制的普遍性	研究微生物氢化酶在含氧环境中的适应机制和进化历程	细菌和古菌中的镍铁氢化酶	微生物学	NA	NA	NA	NA	NA
95	2025-07-07	Microbial production of medium-chain-length diols: Current stage and perspectives 2025-Jul-01, Bioresource technology IF:9.7Q1 DOI:10.1016/j.biortech.2025.132932 PMID:40609762	综述	本文综述了中链长度α,ω-二醇（mcl-diols）的微生物生产现状与未来展望	提出了基于脂肪酸生物合成或反向β-氧化途径的通用生物合成路径，并探讨了合成生物学、适应性实验室进化和AI驱动酶设计等未来发展方向	仍面临微生物底盘选择与优化速度慢、限速酶活性不足以及中间体和终产物毒性等问题	开发生物基中链二醇的可持续生产方法以替代化石基工艺	中链长度α,ω-二醇（mcl-diols）	合成生物学	NA	代谢工程策略、高级蛋白质工程技术、过程优化、合成生物学、适应性实验室进化、AI驱动酶设计	NA	NA	NA
96	2025-07-06	Computational Strategies to Enhance Vitamin B12 Biosynthesis Potential of Microbes 2025-Jul-04, Current microbiology IF:2.3Q3 DOI:10.1007/s00284-025-04325-8 PMID:40615742	综述	本文综述了利用计算策略增强微生物维生素B12生物合成潜力的各种方法	讨论了CRISPR-Cas9基因组编辑、人工智能驱动的途径优化和多组学数据整合等最新进展	未提及具体实验验证或实际应用效果	提高维生素B12的微生物生物合成效率以满足全球营养和治疗需求	微生物及其代谢途径	合成生物学	NA	代谢工程、合成生物学、比较基因组学、分子对接、CRISPR-Cas9、人工智能	NA	多组学数据	NA
97	2025-07-06	Beyond nature's clock: Accelerating genomic diversity through hypermutation 2025-Jul-02, Biotechnology advances IF:12.1Q1 DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108638 PMID:40614910	review	本文系统性地探讨了超突变技术在克服自然突变率不足方面的进展及其在多个领域的应用	比较了不同超突变工具在突变范围、速率和类型等多个维度上的差异，为选择最佳诱变工具提供了指导	总结了该领域仍然存在的挑战，如高通量筛选方法的开发和AI驱动的突变结果预测模型的建立	探讨超突变技术如何弥补自然突变率的不足，以满足生物技术应用的需求	超突变技术及其在合成生物学、进化研究和工业应用中的潜在应用	synthetic biology	NA	hypermutation technologies	AI-driven predictive models	genomic data	NA
98	2025-07-06	Design and construction of light-regulated gene transcription and protein translation systems in yeast P. Pastoris 2025-Jul, Journal of advanced research IF:11.4Q1 DOI:10.1016/j.jare.2024.08.008 PMID:39117107	research paper	该研究设计和构建了在酵母P. Pastoris中光调控的基因转录和蛋白质翻译系统	通过构建光调控的转录和翻译系统，解决了传统诱导启动子在发酵安全性和表达能力上的缺陷，并避免了化学诱导剂带来的复杂性	NA	优化P. pastoris在生物技术和合成生物学中的应用	酵母P. Pastoris	合成生物学	NA	光调控基因转录和蛋白质翻译系统设计	NA	NA	NA
99	2025-07-06	Engineering biology approaches to modulate bacterial biofilms 2025-Jul, Trends in biotechnology IF:14.3Q1 DOI:10.1016/j.tibtech.2024.11.002 PMID:39643528	research paper	探讨利用工程生物学方法控制和改造细菌生物膜以实现新功能	结合合成生物学的最新进展，开发新型生物系统以应对全球性挑战	NA	研究工程生物学在细菌生物膜控制和改造中的应用	细菌生物膜	合成生物学	NA	工程生物学	NA	NA	NA
100	2025-07-06	Iterative deep learning design of human enhancers exploits condensed sequence grammar to achieve cell-type specificity 2025-Jun-04, Cell systems IF:9.0Q1 DOI:10.1016/j.cels.2025.101302 PMID:40472848	research paper	该研究应用迭代深度学习设计具有特定细胞类型活性的合成增强子	利用迭代深度学习优化模型，设计出在两种人类细胞系中具有显著差异活性的合成增强子，并通过实验验证和模型再优化提高特异性	研究仅针对两种人类细胞系，可能无法推广到其他细胞类型	解决合成生物学中如何靶向特定细胞类型进行基因表达的问题	人类细胞系中的合成增强子	synthetic biology	NA	deep learning, chromatin accessibility analysis	deep learning model	genomic sequence, chromatin accessibility data	two human cell lines