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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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81 | 2025-06-24 |
Design and construction of light-regulated gene transcription and protein translation systems in yeast P. Pastoris
2025-Jul, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2024.08.008
PMID:39117107
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研究论文 | 研究旨在设计和构建在酵母P. Pastoris中光调控的基因转录和蛋白质翻译系统 | 构建了具有优异表达能力和光敏感性的光调控基因转录和蛋白质翻译系统,包括光诱导或抑制启动子及光抑制翻译系统的设计 | 未提及系统在其他宿主中的适用性或长期稳定性 | 解决传统诱导启动子在发酵安全性和表达能力上的缺陷,优化P. pastoris在生物技术和合成生物学中的应用 | 酵母P. Pastoris | 合成生物学 | NA | 光调控系统设计、稀有密码子刹车设计 | NA | NA | 以GFP为报告基因进行测试 |
82 | 2025-06-24 |
Harnessing biotechnology for bee pollinator health
2025-Jun-21, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.05.027
PMID:40545407
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research paper | 探讨如何利用生物技术改善蜜蜂授粉健康 | 提出利用人工智能引导的组学工具、分子和生物基治疗以及合成生物学等创新方法,以增强蜜蜂种群健康 | 未提及具体实验数据或样本量,可能缺乏实证支持 | 保护蜜蜂授粉服务并确保养蜂业的未来 | 蜜蜂种群及其健康 | 生物技术 | NA | 组学工具、分子治疗、合成生物学 | 人工智能 | NA | NA |
83 | 2025-06-24 |
Metabolic engineering for microbial production of sugar acids
2025-May-13, BMC biotechnology
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12896-025-00973-7
PMID:40361067
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综述 | 本文综述了微生物生产糖酸的代谢工程方法及其应用 | 强调了代谢工程和合成生物学工具在优化微生物菌株高效生产糖酸中的关键作用 | 未提及具体实验数据或案例研究 | 探讨微生物生产糖酸的代谢工程策略及其工业应用 | C5和C6糖酸 | 微生物生物技术 | NA | 代谢工程、CRISPR-Cas、动态调控回路 | NA | NA | NA |
84 | 2025-06-24 |
Logical regulation of endogenous gene expression using programmable, multi-input processing CRISPR guide RNAs
2024-Aug-12, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae549
PMID:38943344
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研究论文 | 本研究开发了一种基于CRISPR-Cas系统的条件性gRNA调控方法,用于精确控制内源基因表达 | 设计了可编程的多输入逻辑处理gRNA,实现了高达130倍的动态范围调控,并成功应用于代谢基因和细胞骨架基因的调控 | 目前仅在Escherichia coli中验证,在其他宿主生物中的兼容性需要进一步验证 | 开发一种精确调控内源基因表达的方法 | Escherichia coli的内源基因(lacZ, malT, poxB, ftsZ, mreB) | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas系统,RNA合成生物学 | dCas9调节器 | NA | NA |
85 | 2025-06-24 |
A systematic review on the implementation of advanced and evolutionary biotechnological tools for efficient bioremediation of organophosphorus pesticides
2023-Feb, Chemosphere
IF:8.1Q1
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综述 | 本文系统回顾了利用先进和进化生物技术工具高效生物修复有机磷农药(OPP)的实施情况 | 介绍了合成生物学在OPP生物修复中的应用,包括基因操作与编辑、全细胞和酶基生物传感器系统的实施 | 未提及具体实验数据或案例研究的详细分析 | 探讨OPP生物修复的前景与挑战,比较各种生物修复技术 | 微生物、微生物酶、植物及其在OPP生物修复中的应用 | 生物技术 | NA | 合成生物学、系统生物学、生物信息学工具、结构生物学 | NA | NA | NA |
86 | 2025-06-23 |
Pollutant degradation in saline wastewater using synthetic biology
2025-Jun-21, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.06.012
PMID:40544014
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research paper | 该研究利用合成生物学技术开发了一种工程化Vibrio natriegens菌株,用于高效降解高盐环境中的复杂有机污染物 | 通过合成生物学赋予微生物新能力,开发出能在高盐环境中降解复杂有机污染物的工程菌株 | NA | 解决全球性环境挑战,如石化废水排放和海洋石油泄漏 | 高盐环境中的复杂有机污染物 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
87 | 2025-06-23 |
Three cytochrome P450 88A subfamily enzymes, CYP88A108, CYP88A164, and CYP88A222, act as β-amyrin 11-oxidases involved in triterpenoid biosynthesis in Melia azedarach L
2025-Jun-18, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.145362
PMID:40541870
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research paper | 该研究鉴定了Melia azedarach L中三个CYP88A亚家族细胞色素P450基因作为β-香树脂醇11-氧化酶参与三萜类生物合成 | 发现CYP88A亚家族酶具有双重功能,既能参与五环三萜生产也能参与柠檬苦素类生物合成,展示了植物CYP88A P450s独特的催化多功能性 | NA | 阐明Melia azedarach L中五环三萜生物合成的酶学机制 | Melia azedarach L中的三个CYP88A亚家族细胞色素P450基因(MaCYP88A108、MaCYP88A164和MaCYP88A222) | 植物生物化学 | NA | 转录组挖掘、烟草瞬时表达系统、酵母微粒体功能表征 | NA | 基因序列、酶活性数据 | NA |
88 | 2025-06-23 |
Methanol metabolism in synthetic methylotrophic microorganisms
2025-Jun-09, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108623
PMID:40499848
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review | 本文探讨了甲醇在合成甲基营养微生物中的代谢途径及其在代谢工程中的最新进展 | 重点介绍了人工甲基营养中创新的C1同化途径 | NA | 增强对甲醇代谢的理解并释放合成甲基营养菌的工业潜力 | 合成甲基营养微生物 | 合成生物学 | NA | 代谢工程 | NA | NA | NA |
89 | 2025-06-23 |
Structural prediction of potent non-coding RNAs
2025, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2025.05.002
PMID:40543912
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review | 本文综述了非编码RNA(ncRNA)的结构预测及其在基因表达、细胞信号传导和多种生物过程中的作用 | 强调了ncRNA结构预测的重要性及其在治疗策略开发中的应用,并探讨了计算方法和实验技术的进展 | 在准确建模复杂RNA结构及理解RNA折叠动态性方面仍存在挑战 | 探索ncRNA的结构特征及其功能意义,以促进其在生物医学研究中的应用 | 非编码RNA(包括microRNA、小干扰RNA和长链非编码RNA) | 生物医学研究 | NA | 计算方法和实验技术 | NA | NA | NA |
90 | 2025-06-22 |
Integrase enables synthetic intercellular logic via bacterial conjugation
2025-Jun-18, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2025.101268
PMID:40300599
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研究论文 | 本文介绍了一种通过细菌接合设计、构建和测试基于整合酶的细胞间DNA信息传递的通用策略 | 提出了基于整合酶的细胞间DNA信息传递及其通过水平基因转移调控的新方法 | NA | 推进细胞间DNA信息传递、分层信号处理以及整合酶在系统和合成生物学中的应用 | 细菌接合过程中的整合酶和DNA信息传递 | 合成生物学 | NA | 细菌接合 | NA | DNA | NA |
91 | 2025-06-22 |
A systems view of cellular heterogeneity: Unlocking the "wheel of fate"
2025-Jun-18, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2025.101300
PMID:40472847
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综述 | 本文通过系统生物学的视角,探讨细胞异质性的概念及其在干细胞研究和再生医学中的应用 | 提出一个从细胞角度概念化异质性的框架,并总结了用于捕捉异质性的系统和合成生物学工具 | 未提及具体的技术或数据限制 | 探讨细胞异质性的生物学意义及其在干细胞研究和再生医学中的应用 | 人类多能干细胞(hPSC)培养和β细胞分化 | 系统生物学 | NA | 单细胞技术 | NA | NA | NA |
92 | 2025-06-22 |
BTG13-related metalloenzymes: Atypical non-heme iron-dependent dioxygenases with unusual coordination patterns and catalytic mechanisms
2025-Mar, Engineering microbiology
DOI:10.1016/j.engmic.2024.100188
PMID:40538716
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research paper | 本文介绍了一种新型非血红素铁依赖性双加氧酶BTG13,其具有独特的配位中心和催化机制 | 发现了一种新型非血红素铁依赖性双加氧酶BTG13,具有由四个组氨酸和一个羧化赖氨酸(Kcx)组成的独特配位中心,并通过分子动力学模拟和量子化学计算揭示了其催化蒽醌C-C键断裂的非传统步骤 | NA | 研究非血红素铁依赖性双加氧酶的多样性和催化机制 | BTG13相关金属酶及其催化机制 | 生物化学 | NA | 分子动力学模拟, 量子化学计算, 系统发育分析 | NA | 生化数据 | NA |
93 | 2025-06-22 |
Parsing patterns: Emerging roles of tissue self-organization in health and disease
2024-Jun-20, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2024.05.016
PMID:38906093
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review | 探讨生物组织中自组织模式在健康和疾病中的作用 | 综述了胚胎和成体组织中自组织模式的原理和机制,并探讨其在稳态、修复和病理状态中的作用 | NA | 理解自组织模式在生物组织中的普遍性和应用 | 胚胎和成体组织 | 生物学 | 炎症性皮肤病、肿瘤 | NA | NA | NA | NA |
94 | 2025-06-21 |
Construction of a synthetic biology toolkit for the genetic manipulation in the cellulose-producing strain Kosakonia oryzendophytica
2025-Sep, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2025.05.012
PMID:40529626
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research paper | 开发了一个合成生物学工具包,用于在纤维素生产菌株Kosakonia oryzendophytica中进行遗传操作 | 构建了一个可调表达模块和精确基因组编辑能力的综合工具包,用于重编程菌株以生产具有定制特性的下一代纤维素基功能材料 | NA | 开发合成生物学平台以工程化高产细菌纤维素合成菌株 | Kosakonia oryzendophytica菌株 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9介导的无疤痕基因组编辑系统 | NA | NA | NA |
95 | 2025-06-21 |
Biomolecular Condensate-Based Artificial Organelle for Driving Compartmentalized Flux Control
2025-Jun-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00871
PMID:40339164
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研究论文 | 该研究开发了一种基于生物分子凝聚物的人工细胞器平台,用于实现模块化通路区室化以精确控制代谢通量 | 利用工程化生物分子凝聚物创建可编程人工细胞器,通过空间组织关键酶来克服代谢中间体扩散分散问题 | 目前仅在2'-岩藻糖基乳糖生物合成通路中验证了该平台的有效性 | 开发合成生物学平台以优化区室化生物合成通路的效率 | 工程化大肠杆菌中的2'-岩藻糖基乳糖生物合成通路 | 合成生物学 | NA | 蛋白质工程、代谢通路设计 | NA | 生物分子相互作用数据、代谢物浓度数据 | 工程化大肠杆菌菌株 |
96 | 2025-06-21 |
De Novo Synthesis of Friedelin in Saccharomyces cerevisiae via Combination of Metabolic and Lipid Droplet Engineering
2025-Jun-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00047
PMID:40373267
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研究论文 | 本研究通过代谢和脂滴工程的结合,在酿酒酵母中实现了friedelin的从头合成 | 首次在酿酒酵母中构建了friedelin的从头合成途径,并通过多种优化策略将产量提高了30倍 | 研究仅在摇瓶发酵规模进行,尚未进行大规模发酵验证 | 开发更高效和可持续的friedelin生产方法 | 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae) | 合成生物学 | NA | 代谢工程、脂滴工程、发酵优化 | NA | NA | Z28菌株在250 mL摇瓶发酵 |
97 | 2025-06-21 |
Bioproduction of a Large-Scale Library of Tryptamine Derivatives for Neuropsychiatric Drug Screening
2025-Jun-20, ACS chemical biology
IF:3.5Q2
DOI:10.1021/acschembio.4c00857
PMID:40375477
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研究论文 | 本研究通过微生物代谢工程和发酵技术,构建了一个大规模色胺衍生物库,用于神经精神药物的筛选 | 利用生物合成策略构建大规模化合物库,克服了传统合成化学在通量、规模和多样性上的限制,并实现了目标产物的纯化 | 部分目标化合物未被检测到,且生物发酵的产量相对较低 | 开发一种基于生物发酵的大规模药物筛选方法,用于神经精神疾病的治疗 | 色胺衍生物 | 合成生物学 | 神经精神疾病 | 微生物代谢工程、发酵技术 | NA | 化学化合物 | 344种可能的生物转化,产生279种产物,其中17种新型乙酰化衍生物进行了放大培养和纯化 |
98 | 2025-06-21 |
Genetic Toggle Switch in Plants
2025-Jun-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00777
PMID:40387045
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研究论文 | 该研究开发了一种植物基因开关,通过定量表征的转移函数和计算机模型指导组装,实现了在稳定工程植物中的预测功能 | 首次在植物中开发了可编程的基因开关,并通过计算机模型指导组件选择和电路优化 | 研究主要关注基因开关的功能验证,未全面评估植物特有属性(如环境敏感性、发育可塑性)对电路预测性的影响 | 开发可预测和可编程的植物基因设备,以利用植物独特能力于可持续人类和环境系统 | 植物基因元件和基因开关电路 | 合成生物学 | NA | 定量转移函数表征、计算机建模 | 基因调控网络模型 | 基因表达数据 | 稳定工程植物(具体数量未提及) |
99 | 2025-06-21 |
From Code to Life: The AI-Driven Revolution in Genome Editing
2025-Jun-19, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202417029
PMID:40538131
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review | 本文探讨了人工智能(AI)在基因组编辑领域的革命性作用及其应用 | AI驱动的模型提高了sgRNA设计的准确性,发现了新的Cas蛋白,并增强了基因调控网络分析 | AI驱动的基因组编辑存在数据偏见、算法透明度和意外基因修改等伦理问题 | 研究AI如何提升基因组编辑的精确性和效率 | 基因组编辑技术及其应用 | machine learning | genetic disease | CRISPR-associated systems, deep learning-based predictors, protein language models | deep learning | genomic data | NA |
100 | 2025-06-21 |
Progress and prospects in metabolic engineering approaches for isoprenoid biosynthesis in microalgae
2025-Jun-18, Biotechnology for biofuels and bioproducts
IF:3.3Q3
DOI:10.1186/s13068-025-02665-y
PMID:40533766
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综述 | 本文综述了微藻中类异戊二烯生物合成的代谢工程方法进展与前景 | 详细讨论了代谢工程和合成生物学策略在优化微藻类异戊二烯生物合成途径中的应用 | 未提及具体实验数据或样本量,可能缺乏实证支持 | 探讨微藻中类异戊二烯生物合成的代谢工程方法及其应用前景 | 微藻及其代谢途径 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、合成生物学 | NA | NA | NA |