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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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81 | 2025-06-07 |
When good guides go bad: empirical evaluation of all unique cas9 targets in E. coli reveal widespread functionality and rules for gRNA biological design
2025-May-31, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.23.651106
PMID:40475487
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研究论文 | 本文评估了近50万个独特gRNA在E. coli K12 MG1655基因组中的活性,揭示了大多数gRNA具有功能,并提出了细菌gRNA设计的简单规则 | 研究发现绝大多数独特gRNA具有功能(至少93%),而仅有0.3%无功能,并提出了基于间隔区自相互作用的gRNA设计规则 | 研究仅针对E. coli K12 MG1655基因组,未涵盖其他细菌或更复杂的生物系统 | 评估Cas9 nuclease在E. coli中的gRNA活性,解决关于gRNA特异性的争议 | E. coli K12 MG1655基因组中的近50万个独特gRNA | 合成生物学 | NA | Cas9 nuclease和gRNA设计 | NA | 基因组数据 | 近50万个独特gRNA |
82 | 2025-06-07 |
Highly flexible cell membranes are the key to efficient production of lipophilic compounds
2024-08, Journal of lipid research
IF:5.0Q1
DOI:10.1016/j.jlr.2024.100597
PMID:39029799
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综述 | 本文综述了利用膜工程技术构建高柔性细胞膜以高效生产脂溶性化合物的策略 | 总结了两种主要的细胞膜修饰方法:构建脂溶性化合物的人工储存区室和改造细胞膜结构以促进产物外流 | 未提及具体实验数据或案例研究 | 实现脂溶性化合物的高效生产 | 微生物细胞工厂 | 合成生物学 | NA | 膜工程技术 | NA | NA | NA |
83 | 2025-06-07 |
Accelerating Diverse Cell-Based Therapies Through Scalable Design
2024-Jul, Annual review of chemical and biomolecular engineering
IF:7.6Q1
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综述 | 本文综述了通过基因工程改造原代细胞和干细胞以加速多样化细胞治疗的进展 | 整合合成生物学工具和先进基因组编写技术,提出加速创新细胞治疗转化的愿景 | 未提及具体临床试验数据或治疗效果验证 | 探讨规模化设计加速多样化细胞治疗的潜力 | 原代细胞和干细胞 | 合成生物学 | NA | 转基因方法、基因组编写技术 | NA | NA | NA |
84 | 2025-06-07 |
Advancing pathogen detection for airborne diseases
2023-Jul, Fundamental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.fmre.2022.10.011
PMID:40477737
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review | 本文综述了当前用于检测空气传播病原体的先进方法,并讨论了关键挑战 | 强调了受益于微加工、纳米技术和合成生物学多学科进展的下一代技术趋势 | NA | 开发新型生物测定方法,用于早期诊断和大规模筛查 | 空气传播病原体,如SARS、禽流感和COVID-19 | 生物技术 | COVID-19, SARS, 禽流感 | 微加工、纳米技术、合成生物学 | NA | NA | NA |
85 | 2025-06-06 |
Rewiring heme biosynthesis for improved pollutant degradation by Shewanella oneidensis
2025-Aug-15, Environmental research
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.envres.2025.121777
PMID:40324620
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research paper | 该研究通过合成生物学方法改造Shewanella oneidensis的血红素合成途径,提高了其胞外电子传递效率,从而增强了有机污染物的降解能力 | 采用模块化合成生物学方法设计了四个功能模块,重新定向代谢途径以提高血红素合成和组装,显著提升了胞外电子传递效率和污染物降解能力 | NA | 提高Shewanella oneidensis的胞外电子传递效率以增强其在生物电化学系统中的应用 | Shewanella oneidensis | 合成生物学 | NA | 模块化合成生物学方法 | NA | NA | NA |
86 | 2025-06-06 |
Magnetically driven lipid vesicles for directed motion and light-triggered cargo release
2025-Jun-05, Nanoscale
IF:5.8Q1
DOI:10.1039/d5nr00942a
PMID:40396421
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研究论文 | 本研究探讨了磁性驱动的脂质囊泡在定向运动和光触发货物释放中的应用 | 开发了一种结合磁性驱动和光诱导不对称氧化的脂质囊泡系统,实现了定向运动和按需释放 | 研究仍处于概念验证阶段,尚未进行体内实验验证 | 开发具有导航控制和按需释放能力的脂质基药物递送载体 | 磁性颗粒包裹的巨型单层囊泡(magGUVs) | 合成生物学 | NA | 微流控技术、光诱导不对称氧化 | 晶格玻尔兹曼模拟框架 | 实验测量数据 | NA |
87 | 2025-06-06 |
MOSAIC: A Highly Efficient, One-Step Recombineering Approach to Plasmid Editing and Diversification
2025-Jun-05, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00657
PMID:40471122
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research paper | 介绍了一种名为MOSAIC的高效一步重组工程方法,用于质粒编辑和多样化 | 提出了一种快速、高效的质粒编辑和组合质粒库生成方法,利用单链DNA退火蛋白CspRecT,单次转化即可实现高达90%的单目标质粒编辑效率,并能生成跨越四个不同目标区域的组合质粒库 | 未提及具体的应用限制或技术瓶颈 | 开发一种简单、快速且资源高效的质粒编辑和多样化方法,用于分子和合成生物学应用 | 质粒和组合质粒库 | 合成生物学 | NA | 单链DNA退火蛋白CspRecT和Nanopore测序 | NA | DNA序列数据 | 未提及具体样本数量 |
88 | 2025-06-06 |
Harnessing flavonoids to control probiotic function: in situ application of a naringenin-responsive genetic circuit
2025-Jun-03, Microbiology spectrum
IF:3.7Q2
DOI:10.1128/spectrum.02890-24
PMID:40277392
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research paper | 该研究开发了一种基于黄酮类化合物的遗传电路,用于控制益生菌功能,并在小鼠肠道中进行了原位应用 | 首次在宿主-微生物条件下应用了黄酮类化合物响应的遗传电路,并展示了其在小鼠肠道中的功能 | 未来研究需要评估更低剂量的柚皮素及富含柚皮素的食物作为替代输入 | 通过合成生物学增强益生菌的功能,利用黄酮类化合物作为遗传电路的输入 | 益生菌Escherichia coli Nissle 1917 (EcN)和小鼠肠道 | 合成生物学 | NA | 遗传电路设计,荧光素酶报告系统 | NA | 生物发光数据 | 小鼠实验 |
89 | 2025-06-06 |
Trends in sustainable single-cell protein from non-grain feedstocks
2025-Jun-03, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.04.018
PMID:40467368
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research paper | 探讨利用非谷物原料通过微生物发酵生产可持续单细胞蛋白(SCP)的趋势和挑战 | 重点研究非谷物原料的多样化利用、多功能应用扩展以及混合生物系统的整合,特别是合成生物学突破使非谷物原料的利用范围从传统的一碳原料(如甲醇)扩展到二氧化碳 | SCP规模化生产面临菌株鲁棒性不足、基因组编辑精度不够、低密度非谷物原料物流问题以及电化学能源载体安全风险等限制 | 探索可持续蛋白质生产的替代方案,以应对全球粮食需求增长和环境危机 | 非谷物原料生产的单细胞蛋白(SCP) | 生物技术 | NA | 微生物发酵、合成生物学、基因组编辑 | NA | NA | NA |
90 | 2025-06-06 |
Engineering microbial carbon metabolism for sustainable resource utilization
2025-Jun-02, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108622
PMID:40467014
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综述 | 本文综述了通过代谢工程利用可再生碳源进行微生物生物合成化学品的研究进展 | 强调了利用多组学测序、机器学习和人工智能指导菌株工程以提高可持续碳源利用效率的前景 | 未提及具体实验验证或案例研究 | 开发绿色节能资源以替代化石燃料 | 微生物碳代谢 | 合成生物学 | NA | 多组学测序、机器学习、人工智能 | NA | NA | NA |
91 | 2025-06-06 |
Living Fiber Dispersions from Mycelium as a New Sustainable Platform for Advanced Materials
2025-Jun, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202418464
PMID:39998258
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research paper | 该研究提出了一种从菌丝体中生成活体纤维分散体的可持续方法,用于开发具有智能特性的先进材料 | 结合生物聚合物纤维的材料形成特性和活体材料的高度动态特性,提出了一种可持续的活体纤维分散体生成方法 | 未提及具体局限性 | 开发可持续的先进材料平台 | 菌丝体生成的活体纤维分散体 | advanced materials | NA | 液体培养和机械脱纤维方法 | NA | NA | NA |
92 | 2025-06-06 |
Redesigning and rethinking genetic circuits: the potential of transcriptional rewiring in filamentous fungi
2025-Jun, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2025.103301
PMID:40179610
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review | 本文探讨了丝状真菌中基因调控网络(GRN)操作的分子工具包,重点关注转录重连和启动子工程 | 利用对光和温度等物理线索敏感的顺式元件,实现了前所未有的时空精确基因表达控制 | 主要关注丝状真菌,对其他真菌类型的应用讨论较少 | 探索丝状真菌中基因调控网络的重设计和重新思考 | 丝状真菌,特别是以粗糙脉孢菌(Neurospora crassa)为模型 | 合成生物学 | NA | 转录重连,启动子工程 | NA | NA | NA |
93 | 2025-06-06 |
Glycosyltransferases in human milk oligosaccharide synthesis: structural mechanisms and rational design
2025-Jun, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2025.103315
PMID:40347686
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综述 | 本文系统分析了糖基转移酶在人类母乳寡糖合成中的结构机制与理性设计 | 结合结构生物学和深度学习算法,提出了糖基转移酶的优化策略和从头设计方法 | 未提及具体实验验证或工业应用的实际效果 | 探讨糖基转移酶在人类母乳寡糖合成中的结构机制与优化设计 | 糖基转移酶及其在人类母乳寡糖合成中的应用 | 合成生物学 | NA | 结晶学研究、深度学习算法 | NA | 结构生物学数据 | NA |
94 | 2025-06-06 |
Catalytic mechanism and engineering of aromatic prenyltransferase: A review
2025-Jun, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.144214
PMID:40379159
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review | 本文系统总结了芳香族异戊二烯基转移酶的催化机制及其工程化改造的最新进展 | 提出了整合人工智能和深度学习的创新工程方法,以开发高性能生物催化剂 | 当前面临的挑战包括催化活性不足、底物特异性狭窄以及多酶级联系统和固定化技术的限制 | 指导芳香族异戊二烯基转移酶在合成生物学和药物创新中的工程化与规模化应用 | 芳香族异戊二烯基转移酶及其工程化改造 | 合成生物学 | NA | 蛋白质工程、人工智能、深度学习 | NA | NA | NA |
95 | 2025-06-06 |
A path to perpetual chemical synthesis via photocatalytic cofactor regeneration
2025-May-23, Chemical science
IF:7.6Q1
DOI:10.1039/d5sc02770e
PMID:40453794
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Perspective | 本文探讨了通过光催化辅因子再生实现可持续化学合成的路径 | 结合光催化和生物催化的独特能力,通过辅因子穿梭实现精细化学品的持续生产 | 讨论了集成系统的现有限制以及缓解这些限制的努力 | 探索利用太阳能进行可持续化学合成的方法 | 光催化辅因子再生与自然酶循环的整合 | 化学合成 | NA | 光催化、生物催化 | NA | NA | NA |
96 | 2025-06-06 |
Protocol for the generation and purification of minicells from Lactiplantibacillus plantarum
2025-May, Journal of microbiology (Seoul, Korea)
DOI:10.71150/jm.2412002
PMID:40468658
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研究论文 | 本文介绍了一种从植物乳杆菌中生成和纯化微型细胞的方案 | 开发了在植物乳杆菌中生成微型细胞的新方法,扩展了微型细胞平台的应用范围 | 目前仅在植物乳杆菌中进行了验证,尚未在其他益生菌中测试 | 开发一种安全有效的微型细胞生产平台用于生物技术应用 | 植物乳杆菌(Lactiplantibacillus plantarum)及其微型细胞 | 合成生物学 | NA | 质粒介导的同源重组、差异离心和过滤、DAPI染色 | NA | 显微镜图像和流式细胞术数据 | NA |
97 | 2025-06-06 |
[Advances in the regulation of microbial cell metabolism and environmental adaptation]
2025-Mar-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.240937
PMID:40170316
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综述 | 本文从三个角度全面综述了细胞代谢和环境适应的调控机制及其在合成生物学中的应用 | 系统性地总结了细胞感知代谢和环境变化的机制及其应用,为合成生物学领域的创新提供了理论基础 | 缺乏对细胞代谢和环境适应调控机制的系统性综述 | 探讨细胞代谢和环境适应的调控机制及其在合成生物学中的应用 | 细胞的代谢和环境适应机制 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
98 | 2025-06-06 |
Plant-based secondary metabolites as natural remedies: a comprehensive review on terpenes and their therapeutic applications
2025, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2025.1587215
PMID:40458805
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综述 | 本文全面综述了植物次生代谢产物萜类化合物的生物化学特性、植物化学性质及其在代谢紊乱中的药理活性 | 详细阐述了萜类化合物的多样性和广泛生物活性,以及其在现代医学、制药、营养品和化妆品等领域的高价值应用 | 对特定生物活性物质的作用或作用模式理解不全面,且许多化合物在自然界中含量极低 | 阐明萜类化合物在代谢紊乱中的生物化学特性、植物化学性质和药理活性 | 萜类化合物 | NA | 代谢紊乱 | 代谢工程和合成生物学 | NA | NA | NA |
99 | 2025-06-06 |
Application of bifidobacterium in tumor therapy
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1551924
PMID:40469191
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review | 本文综述了双歧杆菌在肿瘤成像和治疗中的最新进展,探讨了其作用机制、工程策略和临床应用 | 利用双歧杆菌的厌氧特性选择性定植于肿瘤缺氧微环境,并通过合成生物学和细菌工程改造为微型机器人,用于分子成像和药物/基因递送 | 双歧杆菌的临床转化仍面临功能设计优化、治疗效果和安全性提升等挑战 | 探索双歧杆菌作为肿瘤靶向治疗载体的潜力 | 双歧杆菌(Bifidobacterium, BBM) | 肿瘤治疗 | 肿瘤 | 合成生物学、细菌工程 | NA | NA | NA |
100 | 2025-06-06 |
Rewiring native post-transcriptional global regulators to achieve designer, multi-layered genetic circuits
2024-10-09, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-52976-1
PMID:39384772
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研究论文 | 本文开发了一种通过重编程大肠杆菌的碳储存调控网络(Csr Network)来实现复杂转录后控制的方法 | 利用Csr Network的天然相互作用建立转录后逻辑门,实现复杂的细菌调控,并构建了12种BUFFER Gates和Csr调控的NOT Gate | NA | 开发可编程的转录后调控工具,用于合成生物学 | 大肠杆菌的碳储存调控网络(Csr Network) | 合成生物学 | NA | RNA-蛋白质相互作用工程 | BUFFER Gates, NOT Gate | NA | NA |