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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2026-04-21 |
Rhodo-Box: A Synthetic Biology Toolbox to Facilitate Metabolic Engineering of Rhodobacter sphaeroides
2026-Apr-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00808
PMID:41832780
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研究论文 | 本文介绍了Rhodo-Box,一个为Rhodobacter sphaeroides设计的合成生物学工具箱,旨在促进其代谢工程应用 | 开发了Rhodo-Box工具箱,通过适应和扩展Zymo-Parts模块化克隆框架,为Rhodobacter sphaeroides提供了标准化的遗传元件和半自动化克隆方法 | NA | 促进Rhodobacter sphaeroides作为可持续生物制造底盘微生物的代谢工程应用 | Rhodobacter sphaeroides(一种紫色非硫α-变形菌) | 合成生物学 | NA | 模块化克隆、半自动化克隆 | NA | NA | NA | Zymo-Parts, Gibson Assembly | Rhodobacter sphaeroides | 包括复制起点、启动子、诱导表达系统、RBS和转录终止子在内的遗传元件集合 | 工业生物技术 |
| 82 | 2026-04-21 |
Vibrio natriegens, a Promising Chassis from Strain Property to Protein Expression: A Review
2026-Apr-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00761
PMID:41886740
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综述 | 本文系统介绍了Vibrio natriegens作为合成生物学中蛋白质表达宿主的生物学特性、工程化改造及最新应用进展 | 重点关注Vibrio natriegens在蛋白质表达领域的最新研究成果,这是以往综述中较少涉及的内容 | NA | 为研究人员提供使用Vibrio natriegens进行蛋白质表达的全面概述,并推动合成生物学领域的更广泛研究 | Vibrio natriegens菌株及其在蛋白质表达中的应用 | 合成生物学 | NA | 分子生物学工具、基因组注释、代谢途径分析 | NA | NA | NA | NA | Vibrio natriegens | NA | 工业生物技术 |
| 83 | 2026-04-21 |
Multifunctional Roles and Microbial Production Bottlenecks of Ergothioneine
2026-Apr-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00735
PMID:41919719
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综述 | 本文综述了麦角硫因的多功能作用、微生物生产瓶颈、关键酶发现、代谢工程策略及其在食品、化妆品和制药行业的应用 | 系统总结了麦角硫因生物合成与分解代谢途径关键酶的最新发现,以及通过合成生物学和代谢组学实现的高效异源生产策略,包括化学酶级联催化路线达到的47.3 g/L最高产量 | 作为综述文章,未提出新的实验数据或原创性生产方法,主要基于现有文献进行总结分析 | 探讨麦角硫因的生产瓶颈、生物合成途径优化及其在多个工业领域的应用潜力 | 麦角硫因及其生物合成与分解代谢途径的关键酶 | 合成生物学 | NA | 代谢组学、代谢工程、化学酶催化级联 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 大肠杆菌、酿酒酵母 | 麦角硫因生物合成途径的异源重构与优化 | 食品、化妆品、制药 |
| 84 | 2026-04-21 |
HySimODE: A hybrid stochastic-deterministic simulation framework for multiscale models of biological systems
2026-Apr-17, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag185
PMID:41999207
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研究论文 | 介绍HySimODE框架,一种用于生物系统多尺度建模的混合随机-确定性仿真工具 | 通过机器学习分类器自动分配物种的随机或确定性机制,无需手动指定机制或重新构建模型 | NA | 为混合随机-确定性生物化学系统仿真提供自动化框架 | 生物化学ODE模型 | 计算生物学 | NA | 机器学习分类器、刚性ODE求解器 | 混合随机-确定性模型 | ODE模型 | 涵盖多种动态机制的数据集 | NA | NA | NA | 合成生物学、神经生物学 |
| 85 | 2026-04-21 |
LinkCraft: An interactive tool for the design of flexible linkers
2026-Apr-17, Journal of molecular biology
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.jmb.2026.169814
PMID:42001978
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研究论文 | 本文介绍了一个名为LinkCraft的计算工具,用于理性设计多域蛋白质中的内在无序连接子 | LinkCraft工具通过集成序列组成、电荷模式和长度等多因素,支持基于理化性质的自定义连接子序列生成和评估,推动了从以域为中心到以多模块为中心的蛋白质设计转变 | NA | 开发一个计算工具以促进多域蛋白质中内在无序连接子的理性设计 | 多域蛋白质中的内在无序连接子 | 合成生物学 | NA | 计算建模 | NA | 蛋白质序列和结构数据 | NA | NA | NA | NA | 生物技术, 合成生物学 |
| 86 | 2026-04-21 |
Post-translational modifications of silk proteins
2026-Apr-16, RSC chemical biology
IF:4.2Q2
DOI:10.1039/d6cb00012f
PMID:41822872
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综述 | 本文综述了丝蛋白的翻译后修饰(PTMs)如何赋予其化学多样性,从而调控其高级组装、水合作用和共价连接性,并探讨了这些修饰对蛋白质结构稳定性和机械性能的贡献 | 整合了蛋白质组学揭示的低丰度PTMs新发现,并强调了合成生物学和生物正交化学在程序化安装修饰以调控理化性质方面的最新进展 | NA | 为在化学生物学与材料科学交叉领域预测性设计下一代蛋白质基材料奠定基础 | 丝蛋白及其翻译后修饰 | 化学生物学与材料科学交叉领域 | NA | 蛋白质组学、合成生物学、生物正交化学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 材料 |
| 87 | 2026-04-21 |
Strategies for enhancing specificity and efficacy of oncolytic viruses in cancer treatment
2026-Apr-16, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
DOI:10.1016/j.clim.2026.110708
PMID:41999961
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综述 | 本文综述了通过工程化改造溶瘤病毒以增强其肿瘤选择性和治疗效能的策略 | 系统总结了利用转录靶向、微RNA脱靶、病毒进入重定向、多层逻辑门调控系统以及联合免疫调节剂、纳米颗粒封装、载体细胞运输等多种前沿策略来设计“智能”溶瘤病毒 | NA | 提高溶瘤病毒在癌症治疗中的特异性和疗效 | 溶瘤病毒 | NA | 癌症 | 系统与合成生物学技术 | NA | NA | NA | NA | NA | 多层逻辑门调控系统 | 医学 |
| 88 | 2026-01-26 |
A new frontier in synthetic biology: leveraging phase separation for robust gene circuits
2026-Apr-15, Science bulletin
IF:18.8Q1
DOI:10.1016/j.scib.2026.01.020
PMID:41580366
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 89 | 2026-04-21 |
Advanced materials for non-alcoholic fatty liver disease and cardiovascular disease comorbidity therapeutics
2026-Apr-07, Biomaterials
IF:12.8Q1
|
综述 | 本文从材料科学视角重新审视非酒精性脂肪肝病与心血管疾病共病,并提出一个结合病理生理学与工程原理的转化设计框架 | 提出以材料为核心的转化设计框架,将NAFLD-CVD共病的病理机制映射到器官选择性及刺激响应性治疗干预,并整合AI引导设计与合成生物学回路以实现自适应多器官控制 | NA | 为NAFLD-CVD共病开发系统性代谢重编程的精准治疗方法 | 非酒精性脂肪肝病与心血管疾病共病的病理机制及治疗平台 | NA | 非酒精性脂肪肝病, 心血管疾病 | NA | NA | NA | NA | CRISPR, 合成生物学回路 | NA | 合成生物学回路用于自适应多器官控制 | 医学 |
| 90 | 2026-04-21 |
Synthetic budding morphogenesis by optogenetic receptor tyrosine kinase signaling
2026-Apr-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.31.715459
PMID:41959406
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研究论文 | 本文提出了一种通过光遗传学控制受体酪氨酸激酶RET来调控肾脏类器官芽状分支发育的新策略 | 开发了光遗传学RET受体(optoRET),实现了无需配体的光控分支形态发生,为合成生物学在类器官设计中的应用提供了新方法 | 当前类器官的分支能力有限,文中未详细讨论长期功能或体内应用的限制 | 研究如何通过光遗传学技术控制肾脏类器官的芽状分支形态发生,以模拟哺乳动物肾脏的收集管分支网络 | 小鼠胚胎肾脏、人类干细胞衍生的肾脏类器官以及表达optoRET的上皮细胞 | 合成生物学 | NA | 光遗传学、药理学操作 | NA | NA | 未指定具体样本数量,涉及小鼠胚胎肾脏和人类干细胞衍生的肾脏类器官 | 光遗传学 | 人类干细胞、小鼠胚胎细胞 | 光遗传学RET受体(optoRET)设计,通过蓝光介导的聚类实现配体独立信号传导,模拟RET信号通路以控制分支 | 医学 |
| 91 | 2026-04-21 |
Plant prenyltransferases: Diversity, catalytic activities, mechanisms, and application in heterologous production of prenylated natural products
2026-Apr, Journal of integrative plant biology
IF:9.3Q1
DOI:10.1111/jipb.70004
PMID:40765501
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综述 | 本文全面总结了植物异戊烯基转移酶(PTs)的多样性、催化活性、机制及其在异源生产异戊烯化天然产物(PNPs)中的应用 | 系统综述了超过160种已报道的植物UbiA型PTs和代表性IDSs,填补了植物PTs功能多样性理解的不足 | NA | 推进植物异戊烯基转移酶的表征与应用,为基于异戊烯化天然产物的药物开发奠定基础 | 植物异戊烯基转移酶(PTs)和异戊烯化天然产物(PNPs) | 合成生物学 | NA | 植物基因组学、合成生物学 | NA | NA | 超过160种已报道的植物UbiA型PTs和代表性IDSs | NA | NA | NA | 医药 |
| 92 | 2026-04-21 |
In Situ Synthesis of Glycosaminoglycan-Mimicking Coatings Driven by Local Pathological Microenvironment: Boosting Bladder Mucosal Regeneration and Barrier Function
2026-Apr, Advanced healthcare materials
IF:10.0Q1
DOI:10.1002/adhm.202505017
PMID:41589795
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研究论文 | 本研究提出了一种利用膀胱局部病理微环境内源性触发物原位合成糖胺聚糖模拟涂层的新策略,以促进膀胱黏膜再生和屏障功能恢复 | 开发了首个利用内源性微环境触发物(过氧化氢和过氧化氢酶)驱动藻酸盐寡糖-聚多巴胺聚合的原位自组装系统,实现了对黏膜冲刷的强耐受性和微环境调节功能的结合 | 研究仅在动物模型中进行,尚未开展临床试验;涂层保留时间最长仅验证至三天,长期效果未知 | 开发一种能够模拟细胞间化学通讯、兼具强黏膜附着力和微环境调节功能的生物-非生物界面组装系统,用于膀胱黏膜修复 | 环磷酰胺诱导的间质性膀胱炎大鼠模型 | 合成生物学 | 间质性膀胱炎 | 原位聚合技术、组织学分析、分子分析 | NA | 组织学数据、分子表达数据、功能评估数据 | 大鼠模型(具体数量未在摘要中说明) | NA | NA | 利用内源性过氧化氢和过氧化氢酶作为触发器,驱动藻酸盐寡糖-聚多巴胺共轭物的聚合反应,形成功能性糖胺聚糖模拟涂层 | 医学 |
| 93 | 2026-04-21 |
PANoptosis as a drug discovery framework: integrating cell death architecture with clinical translation
2026-Apr, Genes and immunity
IF:5.0Q2
DOI:10.1038/s41435-026-00388-0
PMID:41776350
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综述 | 本文综述了PANoptosis作为一种整合性细胞死亡程序在分子结构、调控机制及临床转化中的最新进展,并提出了药物发现的框架 | 提出了PANoptosis作为整合凋亡、焦亡和坏死性凋亡的统一炎症死亡程序的概念,并系统阐述了其分子架构、交叉调控冗余性及新型调节因子,为治疗干预提供了新视角 | NA | 探讨PANoptosis在疾病中的作用机制,并为其作为治疗靶点提供药物发现和临床转化的框架 | PANoptosis的分子结构、调控机制及其在感染、炎症、癌症和神经退行性疾病中的角色 | NA | 感染性疾病、炎症性疾病、癌症、神经退行性疾病 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 94 | 2026-04-21 |
Hemoglobin as a Molecular Glue: Toward Potent Inhibition of HbS Polymerization in Sickle Cell Disease
2026-Apr, Advanced healthcare materials
IF:10.0Q1
DOI:10.1002/adhm.202504346
PMID:41612602
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综述 | 本文综述了利用血红蛋白作为分子胶来抑制镰状细胞病中HbS聚合的新型治疗策略 | 提出将血红蛋白本身重新用作治疗支架的分子胶范式,通过基因编辑或合成生物学设计工程化血红蛋白变体,以细胞内在的高浓度机制抑制HbS聚合 | 转化该范式面临关键挑战,包括聚合中间体的精确结构表征、红细胞内高效递送、缺氧条件下的时间调控以及免疫原性缓解 | 开发针对镰状细胞病的变革性治疗策略,以克服现有疗法的局限性 | 血红蛋白S(HbS)聚合物及镰状细胞病的分子病理机制 | NA | 镰状细胞病 | 冷冻电镜、人工智能预测建模、基因编辑、合成生物学 | NA | NA | NA | 基因编辑 | NA | NA | 医学 |
| 95 | 2026-04-21 |
Cell-in-Shell Metacells in Single-Cell Nanoencapsulation
2026-Apr, ChemPlusChem
IF:3.0Q2
DOI:10.1002/cplu.202500586
PMID:41999168
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概念报告 | 本文提出“元细胞”概念,作为一类具有动态功能、环境响应性和可编程行为的细胞-壳结构工程系统 | 首次提出“元细胞”统一概念框架,定义其三大核心功能标志(可重构性、可负载性、运动性),为单细胞纳米封装领域建立理论体系 | 作为概念性报告,未提供具体实验数据验证,实际工程化应用仍面临技术挑战 | 建立单细胞纳米封装领域的统一概念框架,推动材料科学、合成生物学与细胞工程的交叉研究 | 细胞-壳结构工程系统(元细胞) | 合成生物学 | NA | 单细胞纳米封装 | NA | NA | NA | NA | 活细胞 | 细胞-壳功能化结构(具有环境响应、载荷释放、运动控制等动态功能) | 先进治疗、微尺度机器人、交互式生物混合系统 |
| 96 | 2026-04-21 |
Dynamic Coordination: How ERF Transcription Factors Coordinate Plant Development and Adaptive Stress Responses
2026-03-19, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom16030466
PMID:41897400
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综述 | 本文综述了乙烯响应因子(ERF)转录因子在植物生长与胁迫适应平衡中的核心调控作用 | 强调了ERF-VII亚组在协调发育程序与胁迫响应中的双重角色,并探讨了利用CRISPR和合成生物学工具精准调控ERF网络以改良作物的新策略 | NA | 探讨ERF转录因子如何动态协调植物发育与适应性胁迫响应,以支持可持续农业 | 乙烯响应因子(ERF)转录因子家族,特别是ERF-VII亚组 | 植物生物学 | NA | CRISPR基因组编辑、合成生物学工具 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 植物 | NA | 农业 |
| 97 | 2026-04-21 |
Photo-Oxidative Stress in Plants: ROS Signaling, Damage Propagation, and Systems-Level Resilience
2026-Mar-15, Antioxidants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/antiox15030371
PMID:41897517
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综述 | 本文综述了植物光氧化应激中活性氧信号、损伤传播及系统级恢复力的综合框架 | 超越将ROS视为单纯毒性副产物的传统观点,将其定位为复杂互连网络中的核心枢纽,并提出了“优化网络”而非增强单一组分的未来策略 | 作为综述文章,未提供原始实验数据或具体技术验证 | 阐明植物光氧化应激的机制,并提出培育气候适应性作物的策略 | 植物(特别是农作物)的光氧化应激响应系统 | 植物生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 | 植物(农作物) | NA | 农业 |
| 98 | 2026-04-21 |
Structural modification strategies for ferritin nanoparticles and their applications in biomedicine: a narrative review
2025-Jul-31, Nanoscale
IF:5.8Q1
DOI:10.1039/d5nr01369k
PMID:40668604
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综述 | 本文系统总结了铁蛋白纳米颗粒的结构特性、天然性质潜力及关键修饰策略,以增强其功能,并讨论了其在生物医学领域的多样化应用 | 通过化学修饰、基因工程和仿生矿化等策略,克服天然铁蛋白的局限性,扩展其功能范围,特别是在精准医学、神经退行性疾病治疗和生物催化方面的应用潜力 | 仍面临生物安全性、规模化制备和临床转化方面的挑战 | 优化铁蛋白纳米颗粒的修饰策略,提高纳米递送系统的稳定性和靶向效率,并整合人工智能和合成生物学等新技术,构建高效、低毒、多功能的纳米递送系统 | 铁蛋白纳米颗粒及其修饰后的衍生物 | NA | 神经退行性疾病 | 化学修饰、基因工程、仿生矿化 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 99 | 2026-04-20 |
Unlocking non-model organisms with CRISPR-Cas: A roadmap for sustainable biotechnology
2026-Apr-17, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108890
PMID:42000334
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综述 | 本文批判性地评估了将CRISPR-Cas基因组编辑技术应用于非模式生物所面临的挑战与机遇,并提出了一个系统性解决宿主特异性障碍、技术方案及实际应用的框架 | 提出了一个系统性框架,将CRISPR-Cas应用于非模式生物,并详细探讨了宿主特异性障碍、创新解决方案(如工程化Cas变体、宿主适应性递送系统)以及无需双链断裂的编辑模式 | 作为一篇综述,它主要整合现有研究,未提供新的原始实验数据,且其实施依赖于未来工具民主化、递送系统进步和伦理治理的建立 | 评估并推动CRISPR-Cas基因组编辑在非模式生物中的应用,以解决可持续生物技术中的全球性挑战 | 非模式生物 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas基因组编辑、碱基编辑、先导编辑、CRISPR相关转座酶(CAST)、重组酶辅助工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas | 非模式生物(泛指,未指定具体物种) | NA | 农业、生物制造、环境修复、能源、工业生物技术 |
| 100 | 2026-04-20 |
Duckweeds: from fundamental biology to a sustainable plant chassis for biotechnology
2026-Apr-16, Advanced biotechnology
DOI:10.1007/s44307-026-00110-1
PMID:41989705
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综述 | 本文综述了浮萍作为可持续生物技术平台的潜力,包括其独特生物学特性、基因组解码、遗传工具开发以及在分子农业中的应用进展 | 提出浮萍作为下一代植物底盘生物,整合了其简化基因组、高效转基因表达特性与CRISPR-Cas9等现代基因编辑工具,为可持续生物制造提供了创新平台 | 需要建立整合组学数据库、通用遗传工具包和可扩展的栽培技术才能实现从概念验证到工业应用的转化 | 评估浮萍作为可持续植物底盘在生物技术领域的应用潜力 | 浮萍(Lemnaceae)及其在生物工程中的应用 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9基因编辑、遗传转化、组学分析 | NA | 基因组数据、表型数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 浮萍(Lemnaceae) | 代谢工程途径、疫苗和 therapeutic proteins 生产系统 | 农业, 环境, 工业生物技术 |