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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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81 | 2025-08-03 |
Biocatalytic enantioselective C(sp3)-H fluorination enabled by directed evolution of non-haem iron enzymes
2024-Aug, Nature synthesis
DOI:10.1038/s44160-024-00536-2
PMID:39925872
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研究论文 | 通过定向进化非血红素铁酶,实现了生物催化的对映选择性C(sp3)-H氟化反应 | 首次将植物来源的非血红素酶1-氨基环丙烷-1-羧酸氧化酶(ACCO)重新用于催化非自然的对映选择性C(sp)-H氟化反应,并通过定向进化显著提高了其活性和选择性 | 虽然实现了对映选择性C-H氟化,但该方法的底物范围和应用潜力仍需进一步验证 | 开发新的生物催化氟化反应,解决催化不对称C(sp)-H氟化这一合成化学难题 | 非血红素铁酶1-氨基环丙烷-1-羧酸氧化酶(ACCO)及其突变体 | 生物催化 | NA | 定向进化、计算研究 | NA | NA | NA |
82 | 2025-08-02 |
Engineering Plant Holobionts for Climate-Resilient Agriculture
2025-Aug-01, The ISME journal
DOI:10.1093/ismejo/wraf158
PMID:40748243
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综述 | 本文提出了一种整合微生物生态学、合成生物学和计算模型的框架,用于设计合成微生物群落(SynComs)以增强农业的气候韧性 | 引入了可编程全息生物(programmable holobiont)的概念,这是一种能够动态反馈、跨界信号传递和生态记忆的工程植物-微生物伙伴关系 | NA | 通过工程化植物全息生物(plant holobionts)来发展气候韧性农业 | 植物全息生物(植物及其微生物组的整合单元) | 合成生物学 | NA | CRISPR干扰、生物传感器电路、群体感应模块、基因组尺度代谢模型、动态通量平衡分析、机器学习 | 机器学习 | NA | NA |
83 | 2025-08-01 |
Optimization of Malonyl Coenzyme A Biosensors in a Reconstituted Cell-Free System for Detecting Acetyl-CoA Carboxylase Activity
2025-Jul-31, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00361
PMID:40742616
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研究论文 | 本文优化了一种用于检测乙酰辅酶A羧化酶(ACC)活性的丙二酰辅酶A生物传感器,在重构的无细胞蛋白质合成系统中实现了高灵敏度和精确量化 | 通过工程化T7启动子与FapO操作子之间的间隔序列,开发了具有宽检测范围(50-1500 μM)的体外丙二酰辅酶A生物传感器系统,动态范围最高提升至95.3倍(1500 μM时),并筛选了对低浓度丙二酰辅酶A敏感的FapR/FapO同源对 | NA | 优化ACC活性的检测方法,以促进代谢工程和合成生物学的发展 | 丙二酰辅酶A生物传感器和乙酰辅酶A羧化酶(ACC) | 合成生物学 | NA | 无细胞蛋白质合成系统 | NA | 生化数据 | NA |
84 | 2025-07-31 |
Development of precise genome editing and multi-copy integration tools in Hansenula polymorpha DL-1
2025-Dec, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2025.06.009
PMID:40735059
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研究论文 | 本研究开发了一种优化的合成生物学工具包,用于提高Hansenula polymorpha DL-1的基因编辑和多拷贝整合效率 | 开发了高效的CRISPR-Cas9基因组编辑系统,部分抑制NHEJ通路以提高同源重组率,并鉴定了36个中性位点用于稳定的单拷贝基因整合 | 未提及具体局限性 | 提高Hansenula polymorpha DL-1的基因编辑和多拷贝整合效率,以增强其作为微生物细胞工厂的潜力 | Hansenula polymorpha DL-1酵母 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9基因组编辑 | NA | NA | NA |
85 | 2025-07-30 |
CRISPR-Cas10-Assisted Structural Modification of Staphylococcal Kayvirus for Imaging and Biosensing Applications
2025-Jul-28, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00387
PMID:40720830
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研究论文 | 该研究利用CRISPR-Cas10辅助技术对葡萄球菌噬菌体Kayvirus进行结构修饰,用于成像和生物传感应用 | 首次报道了对葡萄球菌噬菌体结构蛋白的修饰,通过插入多组氨酸标签实现 | 未提及该方法在其他噬菌体系统中的普适性 | 开发噬菌体工程新方法,拓展其在医学和生物技术中的应用 | 葡萄球菌噬菌体812h1 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas10基因编辑、荧光显微镜、生物层干涉仪生物传感、ELISA、流式细胞术 | NA | NA | NA |
86 | 2025-07-30 |
Unlocking expanded flagellin perception through rational receptor engineering
2025-Jul-28, Nature plants
IF:15.8Q1
DOI:10.1038/s41477-025-02049-y
PMID:40721669
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research paper | 该研究通过理性受体工程解锁了对扩展鞭毛蛋白的感知能力 | 利用多样性分析、AlphaFold建模和氨基酸特性,确定了FLS2受体中实现扩展识别的关键残基,并通过合成生物学方法将扩展识别能力从QvFLS2转移到具有典型感知能力的同源物中 | NA | 增强植物对病原体的限制能力 | 植物受体激酶FLS2及其与细菌鞭毛蛋白flg22的相互作用 | 合成生物学 | NA | 多样性分析、AlphaFold建模、合成生物学 | AlphaFold | 蛋白质序列和结构数据 | 跨三个植物目的FLS2同源物 |
87 | 2025-07-30 |
Potentials of RNA biosensors in developmental biology
2025-Jul-26, Developmental biology
IF:2.5Q2
DOI:10.1016/j.ydbio.2025.07.011
PMID:40721002
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综述 | 本文探讨了RNA生物传感器在发育生物学中的潜在应用 | 强调了RNA生物传感器在实时监测RNA定位、修饰和相互作用方面的潜力,尤其是在发育生物学研究中的新兴应用 | RNA生物传感器在发育生物学中的应用尚处于起步阶段,存在未被充分探索的潜力 | 探讨RNA生物传感器在发育生物学研究中的应用及其潜力 | RNA生物传感器及其在发育生物学中的应用 | 发育生物学 | NA | 荧光RNA适配体、CRISPR-Cas系统、核糖开关、催化RNA传感器 | NA | NA | NA |
88 | 2025-07-30 |
High-Throughput 19F NMR Chiral Analysis for Screening and Directed Evolution of Imine Reductases
2025-Jul-23, ACS central science
IF:12.7Q1
DOI:10.1021/acscentsci.5c00498
PMID:40726787
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研究论文 | 本文介绍了一种基于19F NMR的高通量手性分析方法,用于筛选和定向进化亚胺还原酶 | 开发了一种高效、快速的手性分析方法,能够全面评估生物催化反应的对映选择性、立体偏好性和产率 | NA | 加速生物催化和合成生物学领域中立体化学结果的评估 | 亚胺还原酶的筛选和定向进化 | 合成生物学 | 帕金森病 | 19F NMR | NA | NMR数据 | NA |
89 | 2025-07-30 |
Unraveling the Complexity of Plant Trichomes: Models, Mechanisms, and Bioengineering Strategies
2025-Jul-21, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26147008
PMID:40725255
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综述 | 本文综述了植物毛状体的最新研究进展,重点探讨了其发育、结构和功能,特别是在关键物种中的腺毛分泌毛状体(GSTs) | 整合分子机制与新兴技术,提出了利用毛状体在可持续农业、天然产物发现和下一代生物制造中的前瞻性框架 | NA | 探讨植物毛状体的发育、结构和功能,以及其在植物合成生物学中的应用 | 植物毛状体,特别是腺毛分泌毛状体(GSTs) | 植物生物学 | NA | 模块化基因工程和代谢通道策略 | NA | NA | NA |
90 | 2025-07-30 |
The V5-Epitope Tag for Cell Engineering and Its Use in Immunohistochemistry and Quantitative Flow Cytometry
2025-Jul-20, Biology
DOI:10.3390/biology14070890
PMID:40723447
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研究论文 | 本文系统评估了V5标签及其抗体在细胞工程和免疫组织化学中的应用 | 首次系统评估了V5标签及其抗体在合成生物学应用中的性能,并改进了免疫组织化学方法 | 未提及V5标签在其他类型细胞或组织中的应用效果 | 评估V5标签及其抗体在细胞工程和免疫组织化学中的应用效果 | V5标签及其抗体(mu_SV5-Pk1和hu_SV5-Pk1) | 合成生物学 | NA | 免疫组织化学(IHC),流式细胞术 | NA | 细胞和组织样本数据 | 46例人类正常或癌变组织样本 |
91 | 2025-07-30 |
Natural CCD2 Variants and RNA Interference for Boosting Crocin Biosynthesis in Tomato
2025-Jul-12, Biology
DOI:10.3390/biology14070850
PMID:40723408
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研究论文 | 该研究通过引入不同来源的CCD2酶基因和RNA干扰技术,提高了番茄中藏红花素的生物合成水平 | 首次在番茄中表达了藏红花和Crocosmia来源的CCD2等位基因,并结合RNA干扰技术提高玉米黄质池,显著提升了番茄中藏红花素的含量 | 研究仅针对番茄进行了验证,未在其他作物中进行测试 | 通过合成生物学手段提高作物中有益类胡萝卜素衍生物的含量 | 番茄果实 | 合成生物学 | NA | RNA干扰技术、基因工程 | NA | 生物化学数据 | 转基因番茄植株 |
92 | 2025-07-30 |
Integrating chemical artificial intelligence and cognitive computing for predictive analysis of biological pathways: a case for intrinsically disordered proteins
2025-Jun, Biophysical reviews
IF:4.9Q1
DOI:10.1007/s12551-025-01286-x
PMID:40727659
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research paper | 探讨将化学人工智能与认知计算结合用于生物通路预测分析,特别是针对内在无序蛋白 | 提出将化学人工智能与认知计算结合,用于更精确的蛋白质相互作用、基因调控和代谢通路建模,以及神经形态芯片的开发 | 生物数据的复杂性和规模给整合带来挑战 | 通过整合生物分子交互与认知计算,推动蛋白质工程、药物发现、生物信息学等领域的发展 | 内在无序蛋白(IDPs)及其在大脑功能和信息处理中的作用 | 生物信息学 | NA | 化学人工智能、认知计算、机器学习、自然语言处理 | NA | 生物分子数据 | NA |
93 | 2025-07-29 |
Marine bioactives: Pioneering sustainable solutions for advanced cosmetics and therapeutics
2025-Aug, Pharmacological research
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.phrs.2025.107868
PMID:40684894
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综述 | 本文综述了海洋生物活性化合物在化妆品和药物中的应用及其可持续提取方法 | 强调了可持续提取方法如酶辅助和超临界流体提取,以及通过合成生物学和高级纯化技术提高产量和纯度 | 讨论了监管挑战和可持续性问题,但未具体说明如何解决这些挑战 | 探索海洋生物活性化合物在化妆品和药物中的应用及其可持续开发 | 海洋藻类、无脊椎动物和微生物 | 生物技术 | NA | 酶辅助提取、超临界流体提取、合成生物学、高级纯化技术 | NA | NA | NA |
94 | 2025-07-29 |
Advances and obstacles of T cell-based immunotherapy in gynecological malignancies
2025-Jul-26, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-025-02411-w
PMID:40713697
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综述 | 本文全面分析了CAR-T细胞疗法在妇科肿瘤中的进展,探讨了肿瘤-免疫相互作用的基本生物学机制、靶抗原验证的临床进展以及对抗免疫抑制肿瘤微环境的创新方法 | 整合了临床前见解与转化临床数据,建立了一个推进妇科肿瘤中过继性T细胞疗法的战略框架,强调了CAR-T技术与个性化新抗原疫苗和微环境重编程剂结合的协同潜力 | 治疗的持久性和制造一致性方面仍存在限制 | 推进妇科肿瘤中T细胞介导的免疫疗法 | 妇科癌症,包括卵巢癌、宫颈癌和子宫内膜癌 | 肿瘤免疫学 | 妇科恶性肿瘤 | CAR-T细胞疗法 | NA | 临床数据与临床前数据 | NA |
95 | 2025-07-29 |
Advancements in understanding tumor-resident bacteria and their application in cancer therapy
2025-Jul-25, Military Medical Research
IF:16.7Q1
DOI:10.1186/s40779-025-00623-1
PMID:40713785
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综述 | 本文综述了肿瘤内微生物群,特别是细胞内细菌在肿瘤演变中的独特作用及其在癌症治疗中的应用 | 探讨了细胞内细菌的来源、侵入癌细胞的机制及潜在生存策略,并讨论了靶向这些细菌的新方法,如工程化药物递送系统和合成生物学 | 综述性文章,未涉及具体实验数据或样本分析 | 探索肿瘤内微生物群在癌症发展和治疗中的作用 | 肿瘤内微生物群,特别是细胞内细菌 | 肿瘤学 | 癌症 | 下一代测序(NGS)和生物信息学 | NA | NA | NA |
96 | 2025-07-29 |
Engineered implementations of spatial computation in biological systems
2025-Jul-24, Seminars in cell & developmental biology
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.semcdb.2025.103631
PMID:40712326
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review | 本文综述了工程化生物系统中空间计算的应用及其潜力 | 探讨了超越传统单细胞逻辑系统的空间分布式和区室化框架,模拟自然现象如形态发生素梯度和细胞区室化,以实现可扩展性、鲁棒性和适应性 | NA | 探索合成生物学中空间计算的应用,以解决传统计算架构无法应对的复杂计算挑战 | 工程化生物系统中的空间计算框架 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
97 | 2025-07-29 |
Protein-glycan engineering in vaccine design: merging immune mechanisms with biotechnological innovation
2025-Jul-24, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.06.022
PMID:40713219
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review | 本文综述了蛋白质-糖基工程在疫苗设计中的应用,探讨了如何通过精确控制糖基结构来增强抗原呈递和免疫激活 | 整合了CRISPR糖基编辑、合成生物学和糖基修饰纳米颗粒等前沿生物技术,重新定义了疫苗效力 | 糖基异质性和免疫逃逸等挑战仍然存在 | 探讨蛋白质-糖基工程在疫苗设计中的应用,以提高疫苗效力 | 糖基在免疫识别中的调控作用及其在疫苗设计中的应用 | 生物技术 | NA | CRISPR糖基编辑、合成生物学、糖基修饰纳米颗粒 | NA | NA | NA |
98 | 2025-07-29 |
A Review of DNA Restriction-Free Overlapping Sequence Cloning Techniques for Synthetic Biology
2025-Jul, Biotechnology journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/biot.70084
PMID:40713804
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综述 | 本文系统总结了合成生物学中当前使用的主要无限制重叠序列克隆(RFOSC)技术,并探讨了它们的发展、效率、实用性和具体应用 | 全面评估了多种RFOSC技术,包括体外和体内方法,并提出了未来技术发展的趋势 | 未明确指出每种技术的具体限制条件或适用范围 | 总结和评估合成生物学中的DNA克隆技术 | DNA克隆技术,特别是无限制重叠序列克隆技术 | 合成生物学 | NA | Gibson Assembly, CPEC, PIPE, OEC, UDG-Cloning, In-Fusion, LIC, SLIC, TEDA, YHR, IVA, TAR, PEDA | NA | NA | NA |
99 | 2025-07-29 |
Exploring pigment-producing Streptomyces as an alternative source to synthetic pigments: diversity, biosynthesis, and biotechnological applications. A review
2025-Jun-25, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-025-04379-7
PMID:40555885
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综述 | 探讨产色素链霉菌作为合成色素替代来源的多样性、生物合成及生物技术应用 | 综述了CRISPR/Cas基因编辑技术在激活沉默生物合成基因簇以提高色素产量方面的最新进展 | 毒性评估、工业条件下色素稳定性、未探索链霉菌菌株的高通量筛选以及AI预测工具在途径优化中的整合等方面存在研究空白 | 寻找天然、环保的色素替代品以解决合成色素带来的健康和环保问题 | 产色素的链霉菌 | 生物技术 | NA | CRISPR/Cas基因编辑 | NA | NA | NA |
100 | 2025-07-29 |
Development and Recent Advances in SLIPT-PM: A Chemogenetic Platform for Manipulating Signaling at the Plasma Membrane
2025-May-21, Chembiochem : a European journal of chemical biology
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/cbic.202500327
PMID:40400158
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综述 | 本文综述了SLIPT-PM化学遗传学平台的开发、主要特点、当前应用及未来挑战,该平台用于在活细胞中操控质膜信号传导 | 开发了一种新型的化学遗传学平台SLIPT-PM,能够快速将目标蛋白从细胞质招募到质膜,并具有可控的可逆性和重复性 | 未明确提及具体限制,但提到未来挑战,可能涉及技术的进一步优化和应用扩展 | 开发并优化一种用于操控细胞信号传导网络的化学遗传学工具 | 哺乳动物细胞中的信号蛋白和脂质 | 化学生物学与合成生物学 | NA | SLIPT(自定位配体诱导蛋白转位)技术 | NA | NA | NA |