合成生物学相关文章
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当前共找到 3197 篇文献，本页显示第 81 - 100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2025-06-01 |
The BioRECIPE Knowledge Representation Format
2024-08-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00096
PMID:39051984
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research paper | 介绍了BioRECIPE知识表示格式，旨在标准化和促进人机交互，用于创建、验证、评估、管理和扩展细胞内和细胞间信号传导的可执行模型 | BioRECIPE格式能够同时支持人类用户预览和修改模型组件，同时机器可读，并兼容多种表示格式、自然语言处理工具、建模工具和数据库 | NA | 标准化和促进人机交互，用于创建、验证、评估、管理和扩展细胞内和细胞间信号传导的可执行模型 | 细胞内和细胞间信号传导的可执行模型 | systems and synthetic biology | NA | NA | NA | knowledge representation format | NA |
| 82 | 2025-06-01 |
ShuffleAnalyzer: A Comprehensive Tool to Visualize DNA Shuffling
2024-08-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00251
PMID:38991172
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research paper | 介绍了一个名为ShuffleAnalyzer的Python工具，用于可视化和分析DNA shuffling结果 | 提供直接图形化输出，支持DNA shuffling和肽插入的同步分析与可视化 | 未提及具体性能指标或与其他工具的对比 | 开发一个用户友好的工具，以简化DNA shuffling结果的分析和可视化 | DNA shuffling生成的合成DNA和肽插入 | synthetic biology | NA | DNA shuffling | NA | DNA序列数据 | NA |
| 83 | 2025-06-01 |
Designing a Novel Temperature- and Noncanonical Amino Acid-Controlled Biological Logic Gate in Escherichia coli
2024-08-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00423
PMID:39110782
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研究论文 | 本研究设计了一种新型的温度和非经典氨基酸控制的生物逻辑门 | 利用外源aaRS/tRNA对在高温下对细胞ATP的高消耗率诱导的基因表达温度敏感性，构建了一种新型的生物AND门 | 对外源aaRS/tRNA对的潜在副作用了解有限 | 探索外源aaRS/tRNA对基因表达的影响并构建新型生物逻辑门 | 大肠杆菌DH10β Δ | 合成生物学 | NA | 遗传密码扩展(GCE) | NA | NA | NA |
| 84 | 2025-05-31 |
Promoting efficient synthesis and customization of sphingans based on metabolic engineering and synthetic biology strategies
2025-Sep-01, Carbohydrate polymers
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.carbpol.2025.123734
PMID:40441843
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review | 本文综述了鞘聚糖的结构、生物合成途径及其通过代谢工程和合成生物学策略高效合成与定制的方法 | 结合代谢工程和合成生物学策略，利用基因组代谢网络模型(GSMM)和CRISPR等高效工具调控代谢途径，以及通过分子量调控和可控取代基修饰定制不同分子量的鞘聚糖 | 野生型菌株研究背景不清晰及合成路径复杂等问题仍需进一步解决 | 提高鞘聚糖的生产能力并实现其定制化设计 | 鞘聚糖及其生产菌株 | 合成生物学 | NA | 基因组代谢网络模型(GSMM)、CRISPR、高通量筛选技术 | NA | NA | NA |
| 85 | 2025-05-31 |
The bacterial symbionts of Entomopathogenic nematodes and their role in symbiosis and pathogenesis
2025-Jul, Journal of invertebrate pathology
IF:3.6Q1
DOI:10.1016/j.jip.2025.108295
PMID:40032241
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综述 | 本文总结了昆虫病原线虫与其细菌共生体之间的共生关系，以及它们在成功利用昆虫宿主方面的能力 | 强调了昆虫病原线虫与细菌共生体之间的共生关系及其在自然产物研究中的模型系统作用 | 未具体提及研究的局限性 | 探讨昆虫病原线虫与其细菌共生体之间的共生关系及其在生态学和进化生物学中的模型作用 | 昆虫病原线虫（Steinernema和Heterorhabditis）及其细菌共生体（Xenorhabdus和Photorhabdus） | 生态学与进化生物学 | NA | 合成生物学方法和高通量技术 | NA | NA | NA |
| 86 | 2025-05-31 |
Engineering nitrogen and carbon fixation for next-generation plants
2025-Jun, Current opinion in plant biology
IF:8.3Q1
DOI:10.1016/j.pbi.2025.102699
PMID:40056871
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research paper | 探讨利用合成生物学技术优化植物固氮和固碳机制，以提高农业生产力和生态可持续性 | 结合定向进化、AI引导的酶设计和代谢工程，优化固氮酶和固碳循环，并探索在极端环境下增强植物生长的策略 | 未提及具体实验验证或实际应用案例 | 提高植物氮和碳的获取与同化效率，以应对全球农业和生态挑战 | 植物固氮和固碳机制，包括氮酶、根瘤菌及非豆科作物的共生关系 | 合成生物学 | NA | 定向进化、AI引导的酶设计、代谢工程 | NA | NA | NA |
| 87 | 2025-05-31 |
Recent progress on glucose dehydrogenase: multifaceted applications in industrial biocatalysis, cofactor regeneration, glucose sensors, and biofuel cells
2025-Jun, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.143842
PMID:40319965
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综述 | 本文总结了葡萄糖脱氢酶（GDH）在工业生物催化、辅因子再生、葡萄糖传感器和生物燃料电池等多方面的应用及其最新研究进展 | 关注通过分子工程或新型固定化技术提高酶的性能，并扩展其应用领域 | NA | 总结葡萄糖脱氢酶的最新研究进展，特别是在酶分子工程、性能提升、新型固定化策略及其在生物传感器、生物催化和生物燃料电池中的最新应用 | 葡萄糖脱氢酶（GDH） | 分子生物学 | NA | 分子工程、固定化技术 | NA | NA | NA |
| 88 | 2025-05-31 |
5'-O-P-N Linkages of Phosphoramidate Nucleotides: Chemical Construction and Biological Impact
2025-May-29, Chemical record (New York, N.Y.)
DOI:10.1002/tcr.202500056
PMID:40442970
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综述 | 本文综述了5'-O-P-N磷酸酰胺核苷酸的化学构建方法及其生物学影响 | 探讨了5'-O-P-N磷酸酰胺核苷酸作为新兴核苷酸类似物的化学构建方法及其在药物设计、核苷酸酶学研究和合成生物学中的应用 | 未提及具体实验数据或样本量，主要基于文献综述 | 研究5'-O-P-N磷酸酰胺核苷酸的化学构建方法及其生物学功能 | 5'-O-P-N磷酸酰胺核苷酸 | 药物化学与生物技术 | NA | 磷酸酰胺化策略、催化方法、绿色化学技术 | NA | NA | NA |
| 89 | 2025-05-31 |
Towards establishing functional nitrogenase activities within plants
2025-May-28, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.04.020
PMID:40441921
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研究论文 | 探讨在非豆科植物中实现固氮酶功能的研究进展与挑战 | 利用合成生物学和AI驱动设计在酵母线粒体中部分重建固氮酶功能，以解决氧敏感性和能量需求问题 | 尚未完全克服能量成本和氮水平反馈调节的挑战 | 实现在非豆科植物中建立功能性固氮酶活性，以减少对氮肥的依赖 | 非豆科植物、固氮酶、酵母线粒体 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、AI驱动设计 | NA | NA | NA |
| 90 | 2025-05-31 |
Deep mutational scanning and CRISPR-engineered viruses: tools for evolutionary and functional genomics studies
2025-May-27, mSphere
IF:3.7Q2
DOI:10.1128/msphere.00508-24
PMID:40272173
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综述 | 本文综述了深度突变扫描和基于CRISPR的基因组编辑这两种方法在病毒基因组操作和功能表征中的应用 | 结合深度突变扫描和CRISPR技术，实现对病毒蛋白的全面突变和功能表征，为病毒进化和适应提供深入理解 | NA | 探讨深度突变扫描和CRISPR基因组编辑在病毒进化、功能基因组学研究中的应用及其对未来疫苗开发和治疗策略的影响 | 病毒基因组和病毒蛋白 | 合成生物学 | NA | 深度突变扫描, CRISPR基因组编辑 | NA | 基因组数据 | NA |
| 91 | 2025-05-31 |
Synergistic potential of halophytes and halophilic/halotolerant plant growth-promoting bacteria in saline soil remediation: Adaptive mechanisms, challenges, and sustainable solutions
2025-May-22, Microbiological research
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.micres.2025.128227
PMID:40440870
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综述 | 本文综述了盐生植物和嗜盐/耐盐植物生长促进细菌在盐渍土壤修复中的协同潜力及其适应性机制、挑战和可持续解决方案 | 探讨了盐生植物与嗜盐/耐盐植物生长促进细菌的协同作用及其在盐胁迫耐受中的具体适应策略，提出了多组学方法、基因工程、机器学习辅助生物信息学等先进技术的应用 | 对盐生植物与嗜盐/耐盐植物生长促进细菌的协同相互作用及其具体盐适应策略的理解仍然有限，阻碍了其在盐渍土壤修复中的应用 | 研究盐胁迫耐受机制，优化盐渍土壤修复和植物生长 | 盐生植物和嗜盐/耐盐植物生长促进细菌 | 可持续农业 | NA | 多组学方法、基因工程、机器学习辅助生物信息学、化学计量学、合成生物学 | NA | NA | NA |
| 92 | 2025-05-31 |
Expression of Fluorescence Reporters and Natural Products in Native Gut Escherichia coli
2025-05-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00835
PMID:40138712
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研究论文 | 本研究利用CRAGE技术对肠道原生大肠杆菌EcAZ-1和益生菌株EcN进行基因工程改造，成功表达多种异源基因并优化荧光蛋白表达条件，同时实现生物活性化合物的生物合成 | 首次在原生肠道大肠杆菌中应用CRAGE技术实现多基因表达及生物活性化合物合成，拓展了合成生物学在肠道菌群中的应用潜力 | 研究仅针对两种特定菌株进行验证，尚未在更广泛的肠道菌群中测试该技术的普适性 | 开发基于原生肠道大肠杆菌的合成生物学平台 | 肠道原生大肠杆菌EcAZ-1和益生菌株EcN | 合成生物学 | NA | CRAGE（底盘独立重组酶辅助基因组工程技术） | NA | 基因表达数据、荧光信号数据 | 2种工程菌株（EcAZ-1和EcN） |
| 93 | 2025-05-31 |
Innovations, Challenges and Future Directions of T7RNA Polymerase in Microbial Cell Factories
2025-05-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00139
PMID:40209062
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综述 | 本文全面探讨了T7RNA聚合酶在微生物细胞工厂中的创新、挑战及未来发展方向 | 拓宽了T7RNA聚合酶的研究范围，不仅涵盖分子结构和功能动态，还包括其在合成生物学中的应用及工程化改进 | 未提及具体实验数据或样本量，主要以理论探讨和文献综述为主 | 优化微生物细胞工厂中的转录系统，提升生物生产效率和可持续性 | T7RNA聚合酶及其变体在微生物细胞工厂中的应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 94 | 2025-05-31 |
A Portable Arsenic Sensor Integrating Bacillus megaterium with CMOS Technology
2025-05-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00895
PMID:40211918
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research paper | 该研究开发了一种基于巨大芽孢杆菌和CMOS技术的便携式砷传感器，用于实时检测水和土壤中的砷含量 | 通过合成生物学改造巨大芽孢杆菌用于砷检测，并将其与CMOS芯片集成，实现了可现场部署的砷检测技术 | 巨大芽孢杆菌的合成生物学工具包尚不完善，且传统全细胞传感器需要专业实验室设备读取输出 | 开发一种便携式砷检测传感器，用于资源有限环境中的实时砷检测 | 巨大芽孢杆菌及其孢子，CMOS芯片 | 合成生物学 | NA | 合成生物学，CMOS技术 | NA | 生物传感器数据 | NA |
| 95 | 2025-05-31 |
Streamlining tRNA-Synthetase Evolution for Genetic Code Expansion and Deep Sequencing Analyses of Its Evolved Variants
2025-05-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00117
PMID:40231936
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研究论文 | 本文介绍了一种简化的定向进化系统，用于提高吡咯赖氨酰-tRNA合成酶（PylRS）的活性，并探索其在遗传密码扩展中的应用 | 提出了一种简化的定向进化系统，仅需基础实验室设备即可实施，适合研究生操作，并通过深度测序验证了方法的效率 | 研究主要聚焦于PylRS的活性提升，未涉及其他tRNA合成酶的进化或更广泛的生物体系应用 | 提高非经典氨基酸（ncAAs）在蛋白质中的掺入效率，推动合成生物学和蛋白质工程的发展 | 吡咯赖氨酰-tRNA合成酶（PylRS）及其定向进化变体 | 合成生物学 | NA | 定向进化、深度测序 | NA | 测序数据 | 针对三种不同底物进化出的PylRS变体 |
| 96 | 2025-05-31 |
RT-EZ: A Golden Gate Assembly Toolkit for Streamlined Genetic Engineering of Rhodotorula toruloides
2025-05-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00848
PMID:40232996
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research paper | 本文介绍了RT-EZ工具包，一种基于Golden Gate组装的工具，旨在简化Rhodotorula toruloides的基因工程操作 | RT-EZ工具包引入了双向启动子、2A肽、基于RFP的颜色筛选等新特性，显著提高了载体构建的速度和效率 | NA | 解决Rhodotorula toruloides基因工程操作中的高GC含量和缺乏复制质粒的问题 | Rhodotorula toruloides酵母 | 合成生物学 | NA | Golden Gate组装 | NA | NA | NA |
| 97 | 2025-05-31 |
Genome Reduction Improves Recombinant Benzoxazole Production in Myxococcus xanthus
2025-05-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00114
PMID:40257411
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研究论文 | 本研究探讨了基因组缩减对粘球菌生物技术性能的影响，特别是对重组苯并恶唑生产的影响 | 通过连续移除生物合成基因簇（BGCs），显著提高了重组天然产物的产量，并发现某些BGCs的组合消除是不可行的 | 研究仅针对粘球菌，未涉及其他微生物，且某些BGCs的组合消除对细菌的耐受性有影响 | 研究基因组缩减对粘球菌生物技术性能的影响，以提高重组天然产物的产量 | 粘球菌（Myxococcus xanthus） | 合成生物学 | NA | 基因组缩减技术 | NA | 基因组数据 | NA |
| 98 | 2025-05-31 |
Insight into Optogenetics for Diabetes Management
2025-05-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00549
PMID:40279455
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研究论文 | 本文探讨了光遗传学在糖尿病管理中的应用及其潜力 | 光遗传学作为一种合成生物学方法，通过光激活工程细胞实现用户控制的激素分泌，为糖尿病管理提供了新的治疗策略 | 需要进一步研究照射参数、红移视蛋白和宿主细胞相互作用，以实现光遗传学在临床中的全面应用 | 探索光遗传学在糖尿病管理中的应用及其潜力 | 胰腺和非胰腺来源的转基因细胞 | 合成生物学 | 糖尿病 | 光遗传学 | NA | NA | 小鼠模型 |
| 99 | 2025-05-31 |
A Robust and Orthogonal Far-Red Light Sensor for Gene Expression Control in Escherichia coli
2025-05-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00044
PMID:40327816
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research paper | 该研究开发了一种基于RfpABC信号系统的正交远红光传感器，用于在大肠杆菌中控制基因表达 | 首次在细菌中建立了动态范围超过230倍的正交远红光传感器，并鉴定了远红光调控（FLR）基序 | 研究主要局限于大肠杆菌，未在其他细菌中验证传感器的适用性 | 开发用于合成生物学应用的远红光传感器 | 大肠杆菌和蓝藻的远红光光适应（FaRLiP）基因簇 | 合成生物学 | NA | 光遗传学 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 100 | 2025-05-31 |
Automated Construction of a Yeast-Based Multigene Library via Homologous Recombination in a Biofoundry Workflow
2025-05-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00812
PMID:40331904
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research paper | 开发了一种基于体内同源重组的自动化一步多基因组装方法，用于构建表达可调库 | 提出了一种自动化的一步多基因组装方法，优化了穿梭载体以提高组装效率，并实现了高通量基因组装 | 未提及该方法在不同生物体系中的适用性或潜在的技术挑战 | 改进基因组装方法，提高合成生物学中的并行和高通量遗传工程效率 | 酵母基于的多基因库 | synthetic biology | NA | in vivo homologous recombination | NA | genetic data | NA |