合成生物学相关文章
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当前共找到 3555 篇文献，本页显示第 81 - 100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2025-08-12 |
Deciphering and Predicting Thermal and pH Stabilities of Triplex DNA Under Multifactorial Conditions
2025-Aug-11, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202507190
PMID:40498537
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研究论文 | 本文通过开发高通量5DFRETMA方法，研究了环境与序列因素如何调控三链DNA的稳定性 | 开发了高通量5DFRETMA方法，首次预测了pH稳定性，并揭示了离子强度对三链DNA稳定性的双重影响 | NA | 揭示环境与序列因素如何调控三链DNA的稳定性，并为基因靶向治疗和合成生物学应用提供工具 | 三链DNA | 生物化学 | NA | 5D荧光共振能量转移熔解退火(5DFRETMA) | 预测模型 | 荧光数据 | 至少414组缓冲条件 |
| 82 | 2025-08-12 |
Exploring lipid diversity and minimalism to define membrane requirements for synthetic cells
2025-Aug-11, FEBS letters
IF:3.0Q3
DOI:10.1002/1873-3468.70131
PMID:40787853
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综述 | 本文探讨了合成细胞中脂质多样性与最小化，以定义膜的需求 | 对比了自下而上和自上而下的合成细胞构建方法，强调了膜蛋白与其周围脂质环境的关键相互作用 | 天然脂质膜的复杂性是构建最小系统的主要挑战 | 理解生命的基本原理并构建可应用于多个领域的合成细胞 | 合成细胞的脂质膜 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 83 | 2025-08-12 |
The growth benefits and toxicity of quinone biosynthesis are balanced by a dual regulatory mechanism and substrate limitations
2025-Aug-11, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.00887-25
PMID:40788026
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研究论文 | 本文研究了乳酸菌中醌类前体DHNA的生物合成调控机制，揭示了遗传、酶和代谢共同作用的双重调控模式 | 首次阐明MenF和MenD酶在DHNA调控中的协同作用，建立包含可逆通量和变构反馈抑制的两阶段数学模型 | 研究仅限于乳酸菌模型，未在其他微生物体系中验证调控机制的普适性 | 解析微生物调控醌类水平的分子机制，为代谢工程改造提供理论基础 | 乳酸菌中甲萘醌前体DHNA的生物合成途径 | 合成生物学 | NA | 合成生物学方法、数学建模 | 两阶段调控数学模型 | 酶活性数据、代谢物浓度数据 | NA |
| 84 | 2025-08-12 |
Enhancing the β-Oxidation-Like Pathway for the Optimal Production of the Immunosuppressant Mycophenolic Acid
2025-Aug-11, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202508826
PMID:40788096
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research paper | 该研究首次在真菌中重构了负责组装免疫抑制剂霉酚酸（MPA）的β-氧化样酶级联反应，并通过优化途径提高了MPA的产量 | 首次在真菌天然产物生物合成中建立了完整的β-氧化样酶级联反应，为利用分解代谢模块驱动合成创新提供了范例 | NA | 优化β-氧化样途径以高效生产免疫抑制剂霉酚酸（MPA） | 真菌β-氧化酶级联反应及其在霉酚酸生物合成中的作用 | 合成生物学 | NA | 体外酶测定、基因过表达 | NA | NA | NA |
| 85 | 2025-08-12 |
Intelligent Design of Microbial Carbohydrate Factories: Integrated Chassis-Tools-Strategies Frameworks
2025-Aug-11, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c05803
PMID:40788265
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review | 本文综述了合成生物学在微生物碳水化合物工厂智能设计中的集成方法 | 提出了一个多维理论框架，整合了底盘生物特性、计算与实验工具以及代谢工程策略，用于智能设计碳水化合物生物合成系统 | NA | 探索微生物生产碳水化合物的合成生物学方法 | 工业底盘生物及其碳水化合物合成途径 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、计算建模 | NA | NA | NA |
| 86 | 2025-08-12 |
KDBI-RP: Kinetic Data of RNA-Protein Interactions Database
2025-Jul-25, Journal of molecular biology
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.jmb.2025.169357
PMID:40716733
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research paper | 介绍KDBI-RP，一个专注于RNA-蛋白质相互作用动力学的数据库 | KDBI-RP是首个系统整合RNA-蛋白质相互作用动力学数据的专用数据库，填补了该领域定量数据库的空白 | NA | 为RNA生物学和RNA医学研究提供定量动力学数据资源 | RNA-蛋白质相互作用动力学数据 | 生物信息学 | NA | NA | NA | 定量动力学数据 | 3657个结合速率常数条目，3761个解离速率常数条目，175,932个平衡解离常数条目 |
| 87 | 2025-08-11 |
Molecular logic gates based on programmable self-assembly of DNA origami triangles for the detection of nucleic acid molecules
2025-Aug-09, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-15119-0
PMID:40783588
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研究论文 | 本研究开发了一种基于DNA折纸纳米结构和分子逻辑门的可编程核酸检测平台，用于动态分子计算 | 通过将DNA折纸纳米结构与分子逻辑门结合，实现了目标驱动的层次自组装，模拟布尔逻辑运算（YES、AND和OR门） | NA | 开发可编程核酸检测平台，推动动态分子计算领域的发展 | DNA折纸纳米结构和分子逻辑门 | 分子纳米技术 | 肺癌 | DNA折纸技术、原子力显微镜（AFM）、链置换技术 | NA | 核酸分子 | NA |
| 88 | 2025-08-11 |
Protocol for fabricating a reusable plate-well insert with a 3D-printed mounter and hydrogel scaffolds for 3D cell culture and functional assays
2025-Aug-07, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2025.104014
PMID:40782348
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研究论文 | 本文提出了一种用于标准24孔板的可重复使用插入件的制造协议，包括3D打印支架和水凝胶支架，用于3D细胞培养研究 | 通过3D打印支架和水凝胶支架的结合，简化了水凝胶制备和安装过程，减少了批次间差异，降低了成本，并支持合成生物学研究 | NA | 开发一种用于3D细胞培养和功能测定的可重复使用插入件的制造协议 | 标准24孔板的可重复使用插入件 | 生物医学工程 | NA | 3D打印，水凝胶支架合成，冻干，灭菌，亲水化处理 | NA | NA | NA |
| 89 | 2025-08-11 |
A Strictly Inducible and Orthogonal Dre-rox System for Precise and Markerless Genome Editing in Bacillus subtilis
2025-Jul-25, Journal of microbiology and biotechnology
IF:2.5Q3
DOI:10.4014/jmb.2505.05006
PMID:40730489
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研究论文 | 本文介绍了一种在枯草芽孢杆菌中实现精确和无标记基因组编辑的严格诱导和正交Dre-rox系统 | 开发了一种与Cre功能正交且性能相当的Dre-rox系统，通过茶碱诱导的核糖开关严格控制Dre表达，提高了重组特异性 | NA | 扩展基因组工程工具包，支持合成生物学中的分层途径工程、突变体库生成和模块化底盘开发 | 枯草芽孢杆菌 | 合成生物学 | NA | 基因组编辑 | Dre-rox系统 | 基因组数据 | NA |
| 90 | 2025-08-10 |
CRISPR.BOT an autonomous platform for streamlined genetic engineering and molecular biology applications
2025-Aug-06, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-01655-2
PMID:40770192
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研究论文 | 介绍了一种名为CRISPR.BOT的自主遗传工程平台，旨在革新分子生物学实验流程 | 开发了首个自主遗传工程平台CRISPR.BOT，实现了高效、精确的基因编辑和单细胞亚克隆，且成本大幅降低 | 未提及该平台在复杂生物系统或大规模实验中的适用性验证 | 开发一种低成本、高效的自主遗传工程平台，以革新分子生物学实验流程 | 细菌宿主、人类细胞系、SARS CoV-2病毒等微生物 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9基因编辑、慢病毒转导、质粒DNA转移 | 自主机器人平台（LEGO Mindstorms） | NA | 未明确提及具体样本数量，但涉及细菌、人类细胞系和病毒等多种研究对象 |
| 91 | 2025-08-10 |
Targeted metabolomics-guided rational refinement of cyanobacterial metabolism enables enhanced photosynthetic production of L-lysine
2025-Aug-05, Metabolic engineering
IF:6.8Q1
DOI:10.1016/j.ymben.2025.07.015
PMID:40754064
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研究论文 | 本研究通过靶向代谢组学和合成生物学方法优化蓝藻代谢，显著提高了L-赖氨酸的光合生产效率 | 结合靶向代谢组学和合成生物学方法，系统识别并缓解蓝藻中赖氨酸生物合成的限速步骤，使赖氨酸生产率提高约77% | 研究仅在蓝藻Synechococcus sp. PCC 7002中进行，未在其他蓝藻菌株中验证 | 开发碳负的赖氨酸生产途径，替代当前依赖糖发酵的工业生产方法 | 蓝藻Synechococcus sp. PCC 7002 | 合成生物学 | NA | 靶向代谢组学，合成生物学 | NA | 代谢组数据 | 工程化蓝藻菌株 |
| 92 | 2025-08-10 |
Cancer stem cells: landscape, challenges and emerging therapeutic innovations
2025-Aug-05, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-025-02360-2
PMID:40759634
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综述 | 本文综述了癌症干细胞（CSCs）的特性、挑战及新兴治疗策略的最新进展 | 整合了单细胞测序、空间转录组学和多组学分析等最新技术，探讨了CSCs的代谢可塑性及其与肿瘤微环境的相互作用，并提出了针对CSCs的精准治疗新策略 | 缺乏普遍可靠的CSCs生物标志物，以及在不影响正常干细胞的前提下靶向CSCs的挑战 | 探讨癌症干细胞的生物学特性及其在肿瘤治疗中的挑战与创新策略 | 癌症干细胞（CSCs）及其与肿瘤微环境的相互作用 | 肿瘤生物学 | 癌症 | 单细胞测序、空间转录组学、多组学整合、CRISPR功能筛选、AI驱动的多组学分析 | 3D类器官模型 | NA | NA |
| 93 | 2025-08-10 |
Genome mining of tailoring enzymes from biosynthetic gene clusters for synthetic biology: A case study with fungal methyltransferases
2025-Aug-05, Metabolic engineering
IF:6.8Q1
DOI:10.1016/j.ymben.2025.08.001
PMID:40774411
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研究论文 | 本文提出了一种高效的基因组挖掘方法，用于从真菌生物合成基因簇中挖掘修饰酶，特别是甲基转移酶，以增强天然产物的多样性和生产效率 | 利用机器学习方法优先筛选合适的甲基转移酶，成功实现了对选定化合物的修饰，为合成生物学优化天然产物生物合成提供了新工具 | 研究仅针对真菌甲基转移酶进行了测试，未涵盖其他类型的修饰酶 | 开发高效的基因组挖掘方法，以识别和利用真菌生物合成基因簇中的修饰酶 | 真菌生物合成基因簇中的甲基转移酶 | 合成生物学 | NA | 基因组挖掘、机器学习 | 机器学习 | 基因组数据 | 101,321个真菌生物合成基因簇中的16,748个推定甲基转移酶 |
| 94 | 2025-08-10 |
Framing synthetic biology as an innovation-driven market
2025-Aug, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.02.003
PMID:39984349
|
research paper | 提出一个合成生物学市场的框架，以促进对其商业潜力的共同理解 | 提出了一个区分专业合成生物学市场与更广泛产品市场的框架 | NA | 探讨合成生物学市场的商业潜力 | 合成生物学市场 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 95 | 2025-08-10 |
Large language model for knowledge synthesis and AI-enhanced biomanufacturing
2025-Aug, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.02.008
PMID:40050157
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review | 本文综述了大语言模型（LLMs）在合成生物学（SynBio）教育和研究中的进展及其在生物制造中的潜在影响 | 探讨LLMs在合成生物学信息提取、知识图谱构建及检索增强生成中的应用，并预测LLMs将革新代谢建模与工程中的设计-构建-测试-学习（DBTL）循环，推动未来生物制造中的自动驾驶实验室发展 | 需要建立LLMs的基准测试，促进可信知识合成，发展生物安全框架以防止滥用，并鼓励AI科学家、SynBio研究人员和生物过程工程师之间的合作 | 探讨LLMs在合成生物学和生物制造领域的应用及其潜在影响 | 大语言模型（LLMs）及其在合成生物学和生物制造中的应用 | 自然语言处理 | NA | NA | LLM | 非结构化数据 | NA |
| 96 | 2025-08-10 |
Pollutant degradation in saline wastewater using synthetic biology
2025-Aug, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.06.012
PMID:40544014
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research paper | 该研究利用合成生物学技术开发了一种工程化的Vibrio natriegens菌株，用于高效降解高盐环境中的复杂有机污染物 | 开发了一种能在高盐环境中高效降解复杂有机污染物的工程菌株 | NA | 解决全球紧迫的环境挑战，如石化废水排放和海洋石油泄漏 | 高盐环境中的复杂有机污染物 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
| 97 | 2025-08-10 |
Translation efficiency covariation identifies conserved coordination patterns across cell types
2025-Jul-25, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-025-02718-5
PMID:40715459
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研究论文 | 本研究通过分析人类和小鼠的核糖体分析数据集，提出了翻译效率协变（TEC）的概念，揭示了跨细胞类型的协调翻译模式 | 引入翻译效率协变（TEC）概念，发现跨细胞类型的协调翻译模式，并揭示了基因功能在翻译层面的保守性 | 研究主要基于核糖体分析数据，可能未涵盖所有翻译调控机制 | 探索基因在翻译层面的协调表达模式及其生物学意义 | 人类和小鼠的117种组织和94种细胞系的3,819个核糖体分析数据集 | 生物信息学 | NA | 核糖体分析 | NA | RNA-seq数据 | 3,819个核糖体分析数据集，来自117种人类组织和94种小鼠细胞系 |
| 98 | 2025-08-10 |
Tracing the development of CAR-T cell design: from concept to next-generation platforms
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1615212
PMID:40771804
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综述 | 本文回顾了CAR-T细胞疗法的发展历程，从早期概念到下一代平台的设计 | 探讨了CAR-T细胞疗法在受体工程、代谢重编程和免疫信号优化方面的最新进展，以及新兴基因编辑工具的应用 | CAR-T细胞疗法仍面临严重副作用、治疗反应不一致和生产成本高等挑战 | 总结CAR-T细胞疗法的发展现状和未来方向，以扩大其在多种癌症和其他疾病中的应用 | CAR-T细胞疗法及其在癌症治疗中的应用 | 癌症免疫治疗 | 血液系统恶性肿瘤 | CRISPR、碱基编辑、RNA编辑、表观基因组编辑 | NA | NA | NA |
| 99 | 2025-08-10 |
Dimensions, stability, and deformability of DOPC-cholesterol giant unilamellar vesicles formed by droplet transfer
2025, Open research Europe
DOI:10.12688/openreseurope.19149.2
PMID:40771874
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研究论文 | 研究了通过液滴转移法制备的DOPC-胆固醇巨型单层囊泡(GUVs)的尺寸、稳定性和可变形性 | 揭示了胆固醇对DOPC GUVs尺寸分布、时间稳定性和可变形性的影响，为人工细胞和微型机器人应用提供了定制GUV膜特性的方法 | 仅研究了DOPC-胆固醇系统，未考虑其他磷脂组合的影响 | 理解胆固醇对合成磷脂膜模型(如GUVs)特性的影响 | DOPC-胆固醇巨型单层囊泡(GUVs) | 合成生物学 | NA | 液滴转移法、相差显微镜、磁致变形技术 | NA | 图像数据 | 四种不同DOPC与胆固醇比例(100:0, 85:15, 71:29, 60:40)的GUVs样本 |
| 100 | 2025-08-10 |
Research Progress on the Assembly of Large DNA Fragments
2024-04-16, Chembiochem : a European journal of chemical biology
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/cbic.202400054
PMID:38477700
|
综述 | 本文综述了合成生物学中DNA组装技术的发展现状，特别是大片段DNA组装的最新进展 | 重点介绍了在大肠杆菌、枯草芽孢杆菌和酿酒酵母中组装大片段DNA的方法和挑战 | 未提及具体实验数据或样本量，可能缺乏实证支持 | 促进定制基因组的构建，修改细胞功能甚至创造人工生命 | 大肠杆菌、枯草芽孢杆菌和酿酒酵母中的大片段DNA组装 | 合成生物学 | NA | DNA组装技术 | NA | NA | NA |