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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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1001 | 2024-10-18 |
Leveraging artificial intelligence in vaccine development: A narrative review
2024-09, Journal of microbiological methods
IF:1.7Q4
DOI:10.1016/j.mimet.2024.106998
PMID:39019262
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综述 | 本文综述了人工智能在疫苗开发中的应用,重点关注抗原选择、表位预测、佐剂识别和优化策略 | 人工智能算法利用基因组数据、蛋白质结构和免疫系统相互作用,预测抗原表位、评估免疫原性并优先选择抗原进行实验 | 数据异质性、模型可解释性和监管考虑是实现人工智能在疫苗开发中全部潜力的挑战 | 探讨人工智能在疫苗开发中的作用,加速安全有效疫苗的交付 | 抗原选择、表位预测、佐剂识别和优化策略 | 机器学习 | NA | 机器学习和深度学习 | NA | 基因组数据、蛋白质结构 | NA |
1002 | 2024-10-18 |
Exploring the secrets of marine microorganisms: Unveiling secondary metabolites through metagenomics
2024-08, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.14533
PMID:39075735
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综述 | 本文综述了通过宏基因组技术揭示海洋微生物次级代谢产物的研究进展 | 强调了宏基因组学在揭示次级代谢产物中的关键作用,并探讨了长读长测序技术和计算生物学工具的发展为BGC发现带来的新可能性 | 讨论了通过宏基因组学研究这些代谢产物时存在的当前限制,并指出长读长测序技术和计算生物学工具的发展为BGC发现提供了更多可能性 | 揭示海洋微生物次级代谢产物的秘密 | 海洋微生物及其次级代谢产物 | 宏基因组学 | NA | 宏基因组技术 | NA | 基因组数据 | NA |
1003 | 2024-10-18 |
Controlling the expression of heterologous genes in Bdellovibrio bacteriovorus using synthetic biology strategies
2024-06, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.14517
PMID:38934530
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研究论文 | 本文研究了在Bdellovibrio bacteriovorus HD100中使用合成生物学策略控制异源基因表达的方法 | 首次将分层组装克隆技术Golden Standard (GS) 适应于B. bacteriovorus HD100,并结合Tn7转座子的移动元件进行染色体整合,系统地表征了一系列组成型和诱导型启动子,实现了对该细菌中异源基因表达的控制 | 缺乏适用于捕食者驯化的合成生物学工具 | 开发适用于B. bacteriovorus HD100的合成生物学工具,以实现其在微生物生物技术中的应用 | Bdellovibrio bacteriovorus HD100中的异源基因表达控制 | 合成生物学 | NA | 分层组装克隆技术Golden Standard (GS),Tn7转座子 | NA | NA | NA |
1004 | 2024-10-18 |
A microbial evolutionary approach for a sustainable future
2023-10, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.14331
PMID:37602659
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研究论文 | 本文探讨了利用微生物进化方法实现可持续发展的潜力 | 提出利用快速进化的原核生物及其在合成生物学中的可操作性,以及其在处理有机和无机化学物质方面的天然多样性,来解决社会面临的紧迫问题 | NA | 探讨如何利用微生物进化方法实现可持续发展 | 原核生物及其在可持续发展中的应用 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
1005 | 2024-10-17 |
Precision and efficacy of RNA-guided DNA integration in high-expressing muscle loci
2024-Dec-10, Molecular therapy. Nucleic acids
DOI:10.1016/j.omtn.2024.102320
PMID:39398225
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研究论文 | 研究评估了在骨骼肌中使用CRISPR-Cas9进行同源独立靶向整合(HITI)以实现高表达治疗基因的精确性和有效性 | 利用骨骼肌中的内源性启动子,通过HITI技术将报告基因或治疗基因整合到小鼠肌细胞和骨骼肌组织中,实现高水平的基因表达 | 研究主要在小鼠模型中进行,尚未在人体中验证 | 开发一种在骨骼肌中实现高表达治疗基因的长期基因替代疗法 | 骨骼肌中的肌酸激酶和肌红蛋白启动子 | 基因治疗 | NA | CRISPR-Cas9, 同源独立靶向整合(HITI) | NA | 基因组, 转录组 | 小鼠肌细胞和骨骼肌组织 |
1006 | 2024-10-17 |
Versatility of threose nucleic acids: synthesis, properties, and applications in chemical biology and biomedical advancements
2024-Oct-15, Chemical communications (Cambridge, England)
DOI:10.1039/d4cc04443f
PMID:39318271
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综述 | 本文深入探讨了α-L-苏糖核酸(TNA)的合成、性质及其在化学生物学和生物医学领域的应用 | TNA具有独特的四碳糖骨架,与天然核酸相比,具有更好的空间排列、稳定的Watson-Crick碱基配对、高结合亲和力、生物稳定性和生物相容性 | TNA研究仍面临合成方法的挑战,尤其是大规模合成和酶工程方面的改进 | 探讨TNA的潜在应用及其在化学生物学和生物医学领域的进展 | α-L-苏糖核酸(TNA)及其在分子检测、免疫治疗、基因治疗、合成生物学和分子计算等领域的应用 | 化学生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
1007 | 2024-10-17 |
A comprehensive risk assessment of microplastics in soil, water, and atmosphere: Implications for human health and environmental safety
2024-Oct-15, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2024.117154
PMID:39378647
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研究论文 | 本文对土壤、水和大气中的微塑料进行了全面的风险评估,并探讨了其对人类健康和环境安全的影响 | 提出了基于相关研究进展的微塑料风险评估方法,并建议开发新的评估模型 | 现有的风险评估模型无法很好地评估微塑料的风险 | 评估微塑料在土壤、水和大气中的风险,并提出改进的风险评估方法 | 土壤、水和大气中的微塑料 | 环境科学 | NA | 数据可视化和分析 | NA | 数据集 | 在中国收集了135组土壤、水和大气中的相关数据 |
1008 | 2024-10-17 |
Modulating bacterial function utilizing A knowledge base of transcriptional regulatory modules
2024-Oct-14, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae742
PMID:39193902
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研究论文 | 本研究介绍了一种基于iModulon的工程方法,利用机器学习定义的共调控基因组(iModulons)作为设计部件,用于调节细菌功能 | 本研究提出了一种基于iModulon的工程方法,通过识别不同背景下遗传电路所需的组件,增强了基因组工程,提高了目标选择和模块行为预测的准确性 | NA | 研究旨在通过基于iModulon的方法,系统且可预测地重新编程细胞功能,提供对复杂调控网络的精细和可适应控制 | 细菌细胞功能 | 合成生物学 | NA | 机器学习 | NA | 基因组数据 | NA |
1009 | 2024-10-17 |
Steps Toward Recapitulating Endothelium: A Perspective on the Next Generation of Hemocompatible Coatings
2024-Oct, Macromolecular bioscience
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/mabi.202400152
PMID:39072925
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评论 | 本文讨论了重现内皮细胞功能的下一代血液相容性涂层的潜力 | 提出了一种结合自下而上的合成生物学(特别是合成细胞)与被动和生物活性表面涂层的综合方法,以开发能够重现内皮细胞功能的先进生物材料 | NA | 探讨如何通过先进的涂层技术重现内皮细胞的功能,以提高血液接触医疗设备的血液相容性和性能 | 内皮细胞及其在血液接触医疗设备中的功能重现 | 生物材料 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
1010 | 2024-10-17 |
Artificial intelligence-based prediction of pathogen emergence and evolution in the world of synthetic biology
2024-10, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.70014
PMID:39364593
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综述 | 本文探讨了人工智能在预测病原体出现和进化中的应用,特别是在合成生物学领域 | 提出了将生成式AI作为溯因推理的资源,以识别新技术(如合成生物学)带来的关键问题 | 本文仅限于动物病原体,未涵盖所有病原体类型 | 探讨人工智能在监测和控制病原体进化中的潜力 | 病原体的出现和进化,特别是由合成生物学引起的新技术 | 人工智能 | NA | 生成式AI | 生成式AI | NA | NA |
1011 | 2024-10-17 |
Escherichia coli on colorectal cancer: A two-edged sword
2024-10, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.70029
PMID:39400440
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综述 | 本文创新性地提出了大肠杆菌在结直肠癌中的双刃剑理论,探讨了如何利用大肠杆菌的矛盾性质进行结直肠癌的筛查和治疗 | 提出了大肠杆菌在结直肠癌中的双刃剑理论,并探讨了其在筛查和治疗中的潜在应用 | 肠道微生物群与结直肠癌之间的关系仍不明确,应用大肠杆菌时应考虑其与其他微生物、宿主和环境因素的相互作用及其自身的变化 | 探讨大肠杆菌在结直肠癌筛查和治疗中的潜在应用 | 大肠杆菌及其在结直肠癌中的作用 | NA | 结直肠癌 | NA | NA | NA | NA |
1012 | 2024-10-17 |
Precision and efficacy of RNA-guided DNA integration in high-expressing muscle loci
2024-Mar-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.03.18.582796
PMID:38562818
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研究论文 | 研究评估了在骨骼肌中使用CRISPR-Cas9和同源独立靶向整合(HITI)技术将报告基因或治疗基因整合到高表达位点的精度和效果 | 利用骨骼肌中的内源性启动子,通过HITI技术将基因整合到高表达位点,为基因替换疗法提供了新的方法 | 研究主要在老鼠肌细胞中进行,尚未在人体中验证 | 开发一种在骨骼肌中实现高表达治疗基因的基因替换技术 | 骨骼肌中的肌酸激酶(Ckm)和肌红蛋白(Mb)启动子 | 基因治疗 | NA | CRISPR-Cas9, 同源独立靶向整合(HITI) | NA | 基因组, 转录组 | 老鼠肌细胞 |
1013 | 2024-10-17 |
Pseudomonas putida as a platform for medium-chain length α,ω-diol production: Opportunities and challenges
2024-03, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.14423
PMID:38528784
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综述 | 本文综述了利用Pseudomonas putida生产中链长度α,ω-二醇的进展,并提出了可持续生产二醇的四模块方法 | 提出了利用Pseudomonas putida作为微生物平台生产中链长度α,ω-二醇的四模块方法 | 尽管取得了进展,但仍存在挑战,如中间产物的毒性等问题 | 探讨利用Pseudomonas putida作为微生物细胞工厂生产中链长度α,ω-二醇的机会和挑战 | Pseudomonas putida和中链长度α,ω-二醇的生产 | NA | NA | 代谢工程和合成生物学 | NA | NA | NA |
1014 | 2024-10-17 |
Microbial biotechnology and beyond: A roadmap for sustainable development and climate mitigation in the transition from fossil fuels to green chemistry
2024-03, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.14434
PMID:38465780
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研究论文 | 本文探讨了微生物技术在从化石燃料向绿色化学转型中的作用,以及其在可持续发展和气候缓解中的重要性 | 强调了微生物在维持生物循环和合成生物学工具在生产非化石燃料和化学品中的创新应用 | 面临非食品残渣和废物的可用性、成本效益的生物处理厂建设、发酵液中产品回收以及剩余木质素利用等挑战 | 推动从化石燃料向绿色化学的转型,实现可持续发展和气候缓解 | 微生物技术、合成生物学工具、非化石燃料和化学品生产 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
1015 | 2024-10-17 |
On the ever-growing functional versatility of the CRISPR-Cas13 system
2024-02, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.14418
PMID:38381083
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研究论文 | 本文讨论了CRISPR-Cas13系统的功能多样性 | CRISPR-Cas13系统被重新用于解码和工程化基因表达程序,具有RNA沉默、RNA编辑、RNA追踪、核酸检测和翻译调控等多种功能 | NA | 探讨CRISPR-Cas13系统的功能多样性及其在系统生物学和合成生物学领域的应用 | CRISPR-Cas13系统及其功能 | NA | NA | CRISPR-Cas13 | NA | NA | NA |
1016 | 2024-10-17 |
Dynamic RNA synthetic biology: new principles, practices and potential
2023-01, RNA biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1080/15476286.2023.2269508
PMID:38044595
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综述 | 本文综述了动态RNA合成生物学在分子、电路和细胞尺度上的最新进展及其在环境、人类健康和生物生产等社会规模应用中的潜力 | 本文介绍了动态RNA折叠和功能的核心概念,并讨论了将这些概念纳入的最新技术,如工程化核开关、核酶、RNA折纸、RNA链置换电路、生物材料、生物分子凝聚物、细胞外囊泡和合成细胞 | NA | 探讨动态RNA合成生物学在不同尺度上的应用及其对RNA生物技术的影响 | 动态RNA系统在分子、电路和细胞尺度上的设计和应用 | 合成生物学 | NA | RNA工程技术 | NA | NA | NA |
1017 | 2024-10-16 |
Flanking Sequence Cotranscriptionally Regulates Twister Ribozyme Activity
2024-01-02, Biochemistry
IF:2.9Q3
DOI:10.1021/acs.biochem.3c00506
PMID:38134329
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研究论文 | 研究了侧翼序列对Twister核酶活性的共转录调控 | 首次展示了侧翼序列对Twister核酶活性的调控机制,并提出了“ribozymogens”的概念 | 研究仅限于水稻中的Twister核酶,且样本数量有限 | 探讨侧翼序列对Twister核酶活性的调控机制 | 水稻中的Twister核酶及其侧翼序列 | NA | NA | RNA-seq、结构探针、共转录切割实验 | NA | RNA序列 | 选择了几种水稻中的Twister核酶进行研究 |
1018 | 2024-10-16 |
Protein engineering in the computational age: An open source framework for exploring mutational landscapes in silico
2023-Dec, Engineering biology
DOI:10.1049/enb2.12028
PMID:38094241
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研究论文 | 本文介绍了在计算时代下蛋白质工程的发展,并提出了一个开源框架InFinity 1.0,用于探索蛋白质突变景观的计算模拟 | 提出了InFinity 1.0框架,旨在提高蛋白质工程的可用性和可访问性 | 目前蛋白质工程项目所需的专门知识仍集中在少数专业人士手中,且iGEM竞赛的资源和时间限制阻碍了复杂项目的进展 | 开发一个计算框架,以提高蛋白质工程的可用性和可访问性 | 蛋白质工程及其在药物发现和工业生物技术中的应用 | 生物信息学 | NA | 计算工具和高通量筛选技术 | NA | NA | NA |
1019 | 2024-10-16 |
Israel and the global synthetic biology ecosystem
2023-Dec, Engineering biology
DOI:10.1049/enb2.12027
PMID:38094240
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综述 | 本文概述了以色列在合成生物学领域的活动,包括历史背景、当前策略、前景和相关发展 | NA | NA | 提供以色列合成生物学领域的概述 | 以色列的合成生物学生态系统 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
1020 | 2024-10-15 |
Cellular Site-Specific Incorporation of Noncanonical Amino Acids in Synthetic Biology
2024-Sep-25, Chemical reviews
IF:51.4Q1
DOI:10.1021/acs.chemrev.3c00938
PMID:39207844
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综述 | 本文综述了在合成生物学中通过遗传密码扩展(GCE)方法将非经典氨基酸(ncAAs)定点引入细胞的技术进展及其主要应用 | 本文探讨了通过非经典密码子添加扩展遗传密码、创建半自主和自主生物体、设计调控元件以及操纵和扩展肽天然产物生物合成途径等创新方法 | 本文未具体提及研究中的局限性 | 探讨遗传密码扩展(GCE)方法在合成生物学中定点引入非经典氨基酸(ncAAs)的技术进展及其未来发展前景 | 非经典氨基酸(ncAAs)的定点细胞引入及其在合成生物学中的应用 | 合成生物学 | NA | 遗传密码扩展(GCE) | NA | NA | NA |