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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1001 | 2025-12-06 |
Targeting and tracking mRNA lipid nanoparticles at the particle, transcript and protein level
2025-Oct, Nature biomedical engineering
IF:26.8Q1
DOI:10.1038/s41551-025-01511-8
PMID:41102346
|
综述 | 本文综述了用于监测RNA负载脂质纳米颗粒体内行为的现有及新兴技术,并讨论了改善组织与细胞靶向的策略,以扩展该技术的应用范围 | 系统整合了脂质纳米颗粒化学修饰、生物工程及合成生物学方法(如利用microRNA靶位点)来调控mRNA递送与表达,并探讨了通过修饰编码蛋白来控制有效载荷的稳定性与亚细胞定位 | NA | 扩展RNA负载脂质纳米颗粒在非肝脏疾病治疗中的应用,并加速其临床转化 | RNA负载脂质纳米颗粒 | NA | NA | 脂质纳米颗粒技术、合成生物学方法、microRNA靶向技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 1002 | 2025-12-06 |
The AML immune paradox: decoding escape pathways and pioneering checkpoint, vaccine, and combination strategies
2025-Jul-09, Clinical and experimental medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10238-025-01795-9
PMID:40634759
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综述 | 本文综述了急性髓系白血病(AML)免疫治疗的机制、挑战与未来方向,重点探讨了免疫检查点抑制剂和疫苗策略 | 系统解码AML的免疫逃逸途径,并整合检查点阻断、疫苗及联合策略等新兴免疫疗法,提出通过单细胞基因组学、人工智能和合成生物学识别新靶点及改善患者分层 | 面临肿瘤微环境异质性、耐药性白血病干细胞、治疗毒性(如贫血、细胞因子释放综合征)、克隆进化导致的复发以及缺乏预测性生物标志物等挑战 | 评估AML免疫治疗的机制、挑战与未来方向,旨在改善临床疗效 | 急性髓系白血病(AML)及其免疫抑制性肿瘤微环境 | NA | 急性髓系白血病 | 单细胞基因组学、人工智能、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 1003 | 2025-12-06 |
[Improvement of the Approval System for the Development and Experimentation of Living Modified Organisms in Synthetic Biology]
2023-Aug-17, Jugan geon-gang gwa jilbyeong
DOI:10.56786/PHWR.2023.16.32.3
PMID:41334470
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研究论文 | 本文探讨了合成生物学中活体修饰生物体(LMOs)的开发和实验审批系统的现状,并提出改进方案以平衡安全与科研活力 | 提出一个旨在确保LMO研究安全同时促进相关研究活力的国家审批系统改进计划 | NA | 探索合成生物学相关LMOs的法律法规现状,识别LMO开发和实验趋势,并提出审批系统改进方案 | 活体修饰生物体(LMOs)的开发和实验审批系统 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术 |
| 1004 | 2025-12-06 |
Engineering longevity-design of a synthetic gene oscillator to slow cellular aging
2023-04-28, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.add7631
PMID:37104589
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研究论文 | 本文设计了一种合成基因振荡器,通过重编程酵母细胞的内源性切换开关,创建了自主遗传时钟,以减缓细胞衰老过程 | 首次将合成生物学方法应用于工程化长寿,通过构建基因振荡器来延迟细胞衰老的承诺,连接了基因网络架构与细胞寿命 | 研究基于酵母细胞模型,尚未在更复杂生物体中验证;可能未全面考虑所有衰老相关因素 | 工程化细胞长寿,通过合成基因网络设计来减缓衰老过程 | 酵母细胞 | 合成生物学 | 衰老相关疾病 | 基因网络设计、合成生物学技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 酵母细胞 | 合成基因振荡器,基于内源性切换开关重编程,产生核仁与线粒体衰老过程之间的持续振荡 | 医学 |
| 1005 | 2025-12-05 |
Marine-derived natural products as anti-osteoporosis agents
2026-Jan-15, European journal of medicinal chemistry
IF:6.0Q1
DOI:10.1016/j.ejmech.2025.118284
PMID:41138334
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综述 | 本文系统总结了152种具有抗骨质疏松活性的海洋天然产物,并探讨了其生物合成途径、全合成策略及临床转化挑战 | 首次系统梳理海洋来源(主要为海洋真菌)的抗骨质疏松天然产物,并整合基因组挖掘与合成生物学等新兴技术推动临床转化 | 未涉及具体临床实验数据,转化路径中的药效学与毒理学评估仍需深入 | 加速海洋天然产物在骨质疏松治疗领域的药物开发 | 海洋来源的天然产物(以聚酮类和萜类为主) | NA | 骨质疏松症 | 基因组挖掘、合成生物学 | NA | 文献数据、化合物结构信息 | 152种海洋天然产物 | NA | 海洋真菌 | NA | 医药 |
| 1006 | 2025-12-05 |
Integrative Multi-Omics and Artificial Intelligence: A New Paradigm for Systems Biology
2025-Dec, Omics : a journal of integrative biology
IF:2.2Q3
DOI:10.1177/15578100251392371
PMID:41203247
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综述 | 本文综述了整合多组学与人工智能在系统生物学中的应用,强调其在癌症生物学、微生物工程和合成生物学中的原理、方法及案例 | 提出整合多组学与人工智能作为系统生物学的新范式,克服高维度、异质性和上下文限制的挑战 | 存在数据异质性和可解释性等当前限制 | 评估多组学整合的原理、方法及应用,以推动生物系统预测模型和生物技术应用 | 基因组、转录组、蛋白质组和代谢组等多组学数据 | 系统生物学 | 癌症 | 高通量组学技术、单细胞组学 | 机器学习 | 多组学数据 | NA | NA | NA | NA | 医学、工业生物技术 |
| 1007 | 2025-12-05 |
Plant-derived peptides: From identification to agronomic applications
2025-Dec-01, Molecular plant
IF:17.1Q1
DOI:10.1016/j.molp.2025.11.004
PMID:41243283
|
综述 | 本文综述了植物源肽作为生物农药和生物刺激剂的潜力,并提出了一个整合肽鉴定、分子设计、生物制造和生态评估的框架 | 提出结合人工智能、纳米技术和合成生物学等新兴技术,以克服植物源肽商业化中的瓶颈 | 商业化受限,包括多样性探索不足、生产成本高、生态风险评估不完整和应用场景未定义 | 探索植物源肽作为环保型生物农药和生物刺激剂在农业中的应用潜力 | 植物源肽及其在农业中的鉴定、设计和应用 | 农业生物技术 | NA | 人工智能、纳米技术、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 农业 |
| 1008 | 2025-12-05 |
PyFuRNAce: an integrated design engine for RNA origami
2025-Dec-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-66290-x
PMID:41326357
|
研究论文 | 介绍了一个名为pyFuRNAce的开源、基于Python的RNA纳米结构设计软件包,专注于共转录RNA折纸设计 | 开发了首个将RNA折纸完整工作流程(从基序定义到序列生成)集成到单一用户友好平台的集成设计引擎 | NA | 开发用户友好的RNA纳米结构设计工具以推动RNA纳米技术发展 | RNA纳米结构,特别是共转录RNA折纸 | 合成生物学 | NA | 原子力显微镜,共聚焦荧光成像 | NA | NA | NA | NA | NA | RNA折纸纳米结构(包括自组装RNA丝、RNA液滴和大型共转录RNA折纸) | 医学,生物技术,合成生物学 |
| 1009 | 2025-12-05 |
Modeling of Phage-Mediated CRISPRi System to Inhibit Antibiotic Resistances in Bacteria
2025-Jul, Annual International Conference of the IEEE Engineering in Medicine and Biology Society. IEEE Engineering in Medicine and Biology Society. Annual International Conference
DOI:10.1109/EMBC58623.2025.11253443
PMID:41337296
|
研究论文 | 本文提出了一种基于工程化噬菌体递送CRISPR干扰系统以抑制细菌抗生素耐药性的创新策略,并开发了数学模型来模拟其动态过程 | 利用工程化噬菌体递送CRISPRi系统来精确沉默耐药基因,并结合数学模型评估系统性能及长期疗效潜力 | NA | 开发合成生物学方法以对抗抗菌素耐药性 | 抗生素耐药性病原体 | 合成生物学 | 细菌感染 | CRISPR干扰系统 | 数学模型 | 模拟数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 细菌 | CRISPRi递送系统 | 医学 |
| 1010 | 2025-12-05 |
Strength in diversity: unlocking the full potential of engineered living materials with multistrain collaboration
2025-Jan-14, FEMS microbiology reviews
IF:10.1Q1
DOI:10.1093/femsre/fuaf055
PMID:41206547
|
研究论文 | 本文探讨了工程活材料中多菌株协作的潜力,以提升其功能和适用性 | 提出利用多菌株协作来克服单菌株在代谢负担和工程化方面的限制,从而扩展ELMs的功能 | 多菌株ELMs技术尚处于早期阶段,具体应用和稳定性有待进一步研究 | 研究如何通过多菌株协作优化工程活材料的设计和性能 | 工程活材料,特别是包含细菌、真菌、植物或藻类等生物的材料 | 合成生物学与材料科学交叉领域 | NA | 合成生物学技术 | NA | NA | NA | NA | 细菌、真菌、植物、藻类 | 多菌株协作系统,旨在实现自组装、驱动和动态交互等功能 | 医疗保健、建筑、农业 |
| 1011 | 2025-12-05 |
Dynamic processes of fate decision in inducible bistable systems
2024-12-03, Biophysical journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1016/j.bpj.2024.10.015
PMID:39478343
|
研究论文 | 本文通过数学建模研究了诱导型双稳态系统中基因调控网络对细胞命运决定的动态过程的影响 | 揭示了基因调控步骤的延迟和外部诱导时间尺度对命运决定动态轨迹的偏差作用,并提出了稳态参数决定命运决定景观而动态过程形成新的瞬态分布的观点 | NA | 研究诱导型双稳态系统中细胞命运决定的动态过程 | 基因调控网络和细胞命运决定过程 | 系统生物学 | NA | 数学建模 | 常微分方程 | NA | NA | NA | NA | 诱导型双稳态系统 | 合成生物学 |
| 1012 | 2025-12-04 |
Darkfield illumination enhancing artificial-intelligence-assisted digital microfluidics for on-site pathogen detection
2026-Jan-08, Analytica chimica acta
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.aca.2025.344831
PMID:41330666
|
研究论文 | 本研究提出了一种集成暗场照明的数字微流控平台,通过人工智能辅助增强液滴检测性能,用于现场病原体检测 | 开发了具有可切换双模式光学系统的ITO-DMF平台,利用暗场成像显著提升液滴对比度,优化AI驱动的液滴识别和特征提取 | NA | 提高数字微流控系统中基于人工智能的液滴识别精度,实现自动化病原体检测 | 数字微流控平台中的液滴,以及临床样本中的肺炎支原体 | 计算机视觉 | 肺炎 | 暗场成像,荧光成像,qPCR | 深度学习模型 | 图像 | 临床样本 | NA | NA | NA | 医学 |
| 1013 | 2025-12-04 |
Engineered Commensals as Next-Generation Drug Delivery Agents for Nose-to-Brain Therapeutics in Neurological Disorders
2025-Dec-03, ACS chemical neuroscience
IF:4.1Q2
DOI:10.1021/acschemneuro.5c00874
PMID:41268975
|
综述 | 本文探讨了利用合成生物学和材料工程开发的工程化共生菌作为鼻-脑给药系统,用于治疗中枢神经系统疾病 | 提出将工程化共生菌与鼻内给药途径相结合,绕过血脑屏障,实现中枢神经系统药物的靶向递送 | NA | 开发一种基于工程化共生菌的鼻-脑给药系统,以改善中枢神经系统疾病的治疗 | 中枢神经系统疾病(如阿尔茨海默病、帕金森病、中风、胶质瘤) | 合成生物学 | 神经系统疾病 | 合成生物学、材料工程 | NA | NA | NA | NA | 哺乳动物细胞、细菌、病毒 | 疾病靶向迁移、局部治疗生产、适应性递送、免疫激活、代谢调节 | 医学 |
| 1014 | 2025-12-04 |
A deep dive into plant metabolomics: Milestones, technologies, and translational impact
2025-Nov-26, Plant physiology
IF:6.5Q1
DOI:10.1093/plphys/kiaf408
PMID:40991682
|
综述 | 本文综述了植物代谢组学的发展历程、技术进展及其在植物生物学和农业应用中的翻译影响 | 总结了超过500个开源计算工具,并探讨了成像质谱、单细胞代谢组学、AI驱动的代谢物识别等新兴技术 | NA | 评估植物代谢组学在功能基因组学、作物改良和合成生物学中的作用 | 植物代谢组学数据、工具和应用 | NA | NA | 代谢组学、成像质谱、单细胞代谢组学、转录组-代谢组联合分析 | NA | 代谢组学数据集 | NA | NA | NA | NA | 农业、医学、生物技术 |
| 1015 | 2025-12-04 |
Intergenerational justice, the impending sixth mass extinction, reproduction and advanced biotechnologies, and humanity's future
2025, Cambridge prisms. Extinction
DOI:10.1017/ext.2025.10005
PMID:41322091
|
综述 | 本文探讨了代际正义、第六次大规模灭绝威胁以及生殖与先进生物技术在物种保护和生物圈可持续性中的作用 | 提出将生殖生物技术和合成生物学应用于物种复活、遗传多样性保存及生物圈管理,作为应对灭绝危机的新策略 | 伦理和法律框架仍在演变中,涉及基因工程、超人类主义和古代物种复活等问题 | 研究如何利用先进生物技术促进物种保护、遗传多样性维护和生物圈可持续性,以支持代际正义 | 濒危物种、遗传多样性、生物圈可持续性以及人类和动物健康 | NA | NA | 基因工程、合成生物学、野生动物生物库 | NA | NA | 超过3000种极度濒危的陆地/淡水物种 | NA | NA | NA | 环境、医学、农业 |
| 1016 | 2025-12-04 |
Genetic engineering frontiers in cell manipulation-based tissue engineering: A comprehensive review
2025, BioImpacts : BI
IF:2.2Q3
DOI:10.34172/bi.30973
PMID:41322390
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综述 | 本文综述了基于细胞操作的基因工程前沿技术在组织工程中的应用,探讨了其变革潜力 | 整合CRISPR-Cas9、TALENs和合成生物学等先进基因工程技术,结合3D生物打印、微流控和智能生物材料,推动复杂组织构建 | 存在长期遗传稳定性、可扩展性和脱靶效应等挑战,以及伦理和监管问题 | 探索基因工程在细胞操作组织工程中的前沿应用,以应对功能性组织替代的需求 | 软骨、骨骼、心脏、神经、皮肤和血管等多种工程化组织 | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALENs, 合成生物学, 碱基编辑, 合成遗传电路 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 哺乳动物细胞 | 合成遗传电路 | 医学 |
| 1017 | 2025-12-03 |
Revolutionizing recombinant protein production in prokaryotic platforms - Methodologies and advances
2026-Feb, Enzyme and microbial technology
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.enzmictec.2025.110778
PMID:41207077
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综述 | 本文综述了原核系统中重组蛋白生产的传统和新兴策略,包括遗传工程和合成生物学的最新进展 | 强调了新兴策略如改进的表达载体、工程化宿主、高通量筛选平台,以及融合标签、密码子偏好消除、启动子和RBS工程、伴侣蛋白辅助折叠等优化方法 | NA | 优化重组蛋白在原核系统中的表达,以满足各领域日益增长的需求 | 重组蛋白在原核平台的生产 | NA | NA | 遗传工程、合成生物学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 大肠杆菌、枯草芽孢杆菌等原核生物 | 生物传感器、代谢途径 | 医学、农业、环境、能源、材料、食品、工业生物技术 |
| 1018 | 2025-12-03 |
Microplastics and microbial interactions in marine environments: A critical review on biogeochemical cycling and ecological impacts
2026-Jan, Marine pollution bulletin
IF:5.3Q1
DOI:10.1016/j.marpolbul.2025.118891
PMID:41166776
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综述 | 本文通过文献计量分析和机制综述,系统探讨了海洋环境中微塑料与微生物之间的双向相互作用及其对生物地球化学循环和生态的影响 | 整合了文献计量分析(2015-2025)与机制综述,系统性地阐述了微塑料与微生物的双向相互作用及其对海洋生物地球化学循环的级联效应 | 在将分子水平机制与生态系统尺度结果(尤其是在深海和沉积物生境中)联系起来方面仍存在关键空白 | 研究海洋微塑料污染及其与微生物的相互作用对生物地球化学循环和生态系统的影响 | 海洋环境中的微塑料和微生物 | NA | NA | 文献计量分析,多组学技术,沉积物微生物学 | NA | 文献数据 | NA | 合成生物学 | NA | NA | 环境 |
| 1019 | 2025-12-03 |
Versatile Applications of CRISPR-Based Programmable T-DNA Integration in Plants
2025-Dec, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70353
PMID:40905066
|
研究论文 | 本文探索了CRISPR辅助的靶向T-DNA整合技术在植物中的应用,旨在提高转基因表达的精确性和效率 | 开发了CRISTTIN技术,利用CRISPR诱导的双链断裂实现精确T-DNA插入,相比传统Cas9,优化了基因功能研究和转基因表达控制 | NA | 研究植物中靶向T-DNA整合策略,以克服随机整合的缺点,提升转基因表达的精确性和应用范围 | 拟南芥和水稻 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9, Agrobacterium介导的T-DNA整合 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 拟南芥, 水稻 | 靶向T-DNA整合系统,用于基因敲除、原位互补、报告基因插入和转录增强 | 农业, 合成生物学 |
| 1020 | 2025-12-03 |
From marsh to market: taming Vibrio natriegens for sustainable bioproduction
2025-Dec, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2025.103353
PMID:40945411
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综述 | 本文探讨了利用已知最快生长的细菌——Vibrio natriegens作为生物技术底盘,开发可持续生物生产的过程 | 提出采用系统生物技术方法,结合菌株与工艺工程,指导Vibrio natriegens的理性优化,以实现可扩展的新一代生物制造 | 目前仍存在重要限制,特别是在实现高产品产量和处理难降解底物方面 | 开发Vibrio natriegens作为可持续生物生产的底盘微生物 | Vibrio natriegens细菌及其在生物生产中的应用 | 合成生物学 | NA | 基因组工程、合成生物学工具、系统水平分析 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly | Vibrio natriegens | 生物传感器、代谢途径 | 工业生物技术、能源、环境 |