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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
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1001 | 2025-10-05 |
[Intelligent design of transcription factor-based biosensors]
2025-Mar-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.240603
PMID:40170310
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综述 | 本文系统总结了计算模拟和人工智能辅助的转录因子生物传感器工程与优化研究进展 | 整合蛋白质结构预测、配体结合模拟和机器学习突变数据构建数学模型来预测调控蛋白响应 | NA | 促进新型生物传感器的开发与应用 | 转录因子生物传感器 | 合成生物学 | NA | 蛋白质结构预测、配体结合模拟、机器学习 | 数学模型 | 突变数据 | NA | NA | NA | 转录因子生物传感器 | 代谢工程, 合成生物学, 代谢物监测 |
1002 | 2025-10-05 |
[Optimization of fermentation processes in intelligent biomanufacturing: on online monitoring, artificial intelligence, and digital twin technologies]
2025-Mar-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.250032
PMID:40170318
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综述 | 系统总结发酵过程中在线监测技术、人工智能优化策略和数字孪生应用的最新进展 | 整合实时传感数据与多尺度模型,提出基于智能感知和数字孪生的闭环控制系统新范式 | NA | 实现发酵过程的精确优化和高效放大 | 发酵过程的实时传感与智能控制 | 工业生物技术 | NA | 在线活细胞传感器、光谱分析、废气分析 | 人工神经网络、支持向量机 | 实时传感器数据、多尺度模型数据 | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术 |
1003 | 2025-10-05 |
DNA/RNA hybrids avoid channel gating that leads to the continued packaging of numerous hybrids into the phi29 protein shell
2025-Mar-20, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf242
PMID:40193705
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研究论文 | 本研究揭示了phi29 DNA包装马达对RNA/DNA杂交链和双链DNA包装效率差异的分子机制 | 首次发现RNA/DNA杂交链能避免通道门控机制,实现比双链DNA更高效的包装 | 通道门控的具体分子机制仍需进一步阐明 | 探究病毒DNA包装马达对不同核酸链类型的包装机制差异 | phi29噬菌体DNA包装马达系统 | 结构生物学 | NA | 单通道电生理学、蔗糖梯度超速离心、单孔电导测定 | NA | 电生理数据、离心分离数据 | NA | NA | phi29噬菌体 | NA | 基因/RNAi递送、基因治疗、合成生物学、纳米技术、单颗粒传感 |
1004 | 2025-10-05 |
Self-organized spatial targeting of contractile actomyosin rings for synthetic cell division
2024-11-29, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-54807-9
PMID:39614082
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研究论文 | 本研究通过将肌动球蛋白环与细菌MinDE蛋白系统在GUVs中结合重构,实现了合成细胞自组织分裂的空间靶向控制 | 首次将细菌MinDE空间定位系统与真核细胞肌动球蛋白收缩系统相结合,实现了自组织的赤道面肌动球蛋白环组装 | 目前仅观察到囊泡中部变形和出泡现象,尚未实现完整的囊泡分裂 | 开发合成细胞自分裂的最小功能模块 | 巨型单层囊泡(GUVs)中的肌动球蛋白环和MinDE蛋白系统 | 合成生物学 | NA | 体外重构技术 | NA | 显微镜图像 | NA | NA | NA | 肌动球蛋白收缩环与MinDE空间振荡系统组合 | 合成生物学, 基础研究 |
1005 | 2025-10-05 |
Biosynthesis of plant hemostatic dencichine in Escherichia coli
2022-09-19, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-33255-3
PMID:36123371
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研究论文 | 本研究通过设计人工生物合成途径,在大肠杆菌中实现了植物源性止血物质三七素的全合成 | 采用逆向生物合成方法设计非天然生物合成途径,通过引入28个同义稀有密码子显著提高了三七素合酶的溶解度 | NA | 实现三七素的异源生物合成 | 三七素及其前体L-2,3-二氨基丙酸和草酰辅酶A | 合成生物学 | NA | 逆向生物合成、代谢工程、密码子优化 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly | 大肠杆菌 | 三七素生物合成途径,包括前体合成模块和产物合成模块 | 医药 |
1006 | 2025-10-05 |
Machine learning-led semi-automated medium optimization reveals salt as key for flaviolin production in Pseudomonas putida
2025-Apr-18, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-08039-2
PMID:40251395
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研究论文 | 本研究开发了一种基于机器学习的半自动化培养基优化方法,显著提高了恶臭假单胞菌中黄青霉素的产量 | 开发了分子和宿主无关的主动学习培养基优化流程,通过可解释AI技术意外发现盐浓度是影响黄青霉素生产的关键因素 | NA | 通过机器学习和自动化技术优化微生物发酵培养基,提高目标化学品的产量和产率 | 恶臭假单胞菌KT2440菌株的黄青霉素生产 | 机器学习 | NA | 主动学习、可解释人工智能 | 机器学习 | 发酵过程数据 | 三个不同的黄青霉素生产实验批次 | DBTL循环 | 恶臭假单胞菌 | NA | 工业生物技术 |
1007 | 2025-10-05 |
Long-Term Yeast Cultivation Coupled with In Situ Extraction for High Triterpenoid Production
2025-Apr-02, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c00273
PMID:40129278
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研究论文 | 本研究通过结合长期酵母培养与原位提取技术,显著提高了工程酵母中人参皂苷的产量和分泌效率 | 将长期酵母培养与原位提取技术相结合,实现了3.4 g/L的高产量人参皂苷生产,且酵母可重复使用10次 | NA | 提高三萜类化合物(人参皂苷)的生产效率和工业化潜力 | 工程酵母生产的人参皂苷 | 合成生物学 | NA | 酵母培养、原位提取 | NA | NA | NA | 合成生物学技术 | 酵母 | 三萜类化合物合成途径 | 医药、工业生物技术 |
1008 | 2025-10-05 |
Advances in synthesizing plant-derived isoflavones and their precursors with multiple pharmacological activities using engineered yeasts
2025-Mar-29, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-025-02692-2
PMID:40155940
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综述 | 本文综述了利用工程化酵母合成具有多种药理活性的植物源异黄酮及其前体的研究进展 | 系统总结了合成生物学和先进生物技术策略在环境友好型异黄酮生产中的应用 | NA | 探讨通过工程化酵母可持续高效生产异黄酮的技术方法 | 植物源异黄酮(如大豆苷元和金雀异黄素)及其生物合成途径 | 合成生物学 | NA | 合成生物学技术 | NA | NA | NA | NA | 酵母 | 异黄酮生物合成途径 | 食品,制药,化妆品 |
1009 | 2025-10-05 |
TTLOC: A Tn5 transposase-based approach to localize T-DNA integration sites
2025-Mar-28, Plant physiology
IF:6.5Q1
DOI:10.1093/plphys/kiaf102
PMID:40131780
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研究论文 | 开发了一种基于Tn5转座酶的T-DNA整合位点定位方法TTLOC | 使用特殊接头组装的Tn5转座酶进行基因组DNA片段化,实现低成本、高通量的T-DNA整合位点检测 | NA | 开发快速检测T-DNA整合位点的技术以促进作物育种和植物合成生物学 | 转基因拟南芥、水稻、大豆、番茄、马铃薯和小麦 | 植物合成生物学 | NA | Tn5转座酶介导的片段化、下一代测序 | NA | 基因组DNA序列数据 | 65个转基因拟南芥系和多种转基因作物 | Tn5转座酶 | 拟南芥, 水稻, 大豆, 番茄, 马铃薯, 小麦 | T-DNA整合位点定位 | 农业, 工业生物技术 |
1010 | 2025-10-05 |
CAR-T therapy dilemma and innovative design strategies for next generation
2025-Mar-27, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-025-07454-x
PMID:40148310
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综述 | 本文综述了CAR-T细胞疗法面临的困境及基于多学科策略的下一代创新设计方法 | 系统总结了克服CAR-T疗法困境的多学科创新技术,包括合成生物学开关、生物支架、纳米材料等 | NA | 解决CAR-T细胞疗法在肿瘤免疫治疗中面临的疗效限制问题 | CAR-T细胞疗法及其改进策略 | 合成生物学 | 血液肿瘤 | CRISPR筛选 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | T细胞 | ON/OFF开关 | 医学 |
1011 | 2025-10-05 |
Last Decade Insights in Exploiting Marine Microorganisms as Sources of New Bioactive Natural Products
2025-Mar-07, Marine drugs
IF:4.9Q1
DOI:10.3390/md23030116
PMID:40137302
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综述 | 回顾过去十年海洋微生物作为生物活性天然产物来源的研究进展 | 总结了基因组学、代谢组学和生物信息学技术创新推动的新发现,以及通过创新分离培养方法获得的稀有海洋微生物新代谢产物 | NA | 开发利用海洋微生物来源的新型生物活性天然产物 | 海洋细菌、真菌和微藻 | 天然产物发现 | NA | 基因组学、代谢组学、生物信息学、合成生物学、代谢工程 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医药、农业、环境、能源、材料、食品、工业生物技术 |
1012 | 2025-10-05 |
Applied photosynthesis: An idea whose time has come
2025-01-01, Biochimica et biophysica acta. Bioenergetics
DOI:10.1016/j.bbabio.2024.149525
PMID:39571881
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综述 | 本文介绍生物混合能源系统的最新研究进展,重点讨论如何利用光合作用机制开发环保高效的太阳能技术替代方案 | 将合成生物学与纳米材料工程相结合,开发新型生物混合设备用于太阳能转化和可持续能源生产 | NA | 探索光合作用在可再生能源技术中的应用,开发高效可持续的能源生产方案 | 蓝细菌、藻类、紫色细菌和古细菌等光合生物及其工程化蛋白质和光合复合物 | 合成生物学 | NA | 蛋白质工程、纳米材料制造 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 蓝细菌, 藻类, 紫色细菌, 古细菌 | 光合作用机制、光吸收系统、能量转化系统 | 能源 |
1013 | 2025-10-05 |
Analysis of rRNA processing and translation in mammalian cells using a synthetic 18S rRNA expression system
2012-Sep, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gks530
PMID:22718970
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研究论文 | 开发了一种用于哺乳动物18S rRNA的合成表达系统,用于研究rRNA加工和翻译功能 | 首次建立了哺乳动物18S rRNA表达系统,通过插入序列标签和筛选抗性突变实现功能分析 | NA | 研究高等真核生物核糖体RNA的加工、组装和功能 | 小鼠18S rRNA及其侧翼序列 | 合成生物学 | NA | 杂交分析、突变筛选、转染技术 | NA | 分子生物学数据 | NA | 合成生物学工具 | 哺乳动物细胞 | 18S rRNA合成表达系统,包含序列标签和抗性突变 | 基础研究,合成生物学 |
1014 | 2025-10-05 |
Extracellular Bacterial Production of DNA Hydrogels-Toward Engineered Living Materials
2025-May, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202502199
PMID:40143682
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研究论文 | 本研究首次利用希瓦氏菌开发了能够生产DNA水凝胶的工程活材料系统 | 首次在活细菌环境中实现DNA水凝胶的原位生产,开发了基于SpyCatcher/SpyTag技术的可诱导细胞表面锚定系统 | 研究仅展示了初步概念验证,系统稳定性和规模化生产能力仍需进一步验证 | 开发基于DNA水凝胶的工程活材料系统 | 希瓦氏菌(Shewanella oneidensis)及其工程改造菌株 | 合成生物学 | NA | SpyCatcher/SpyTag技术,生物电化学系统 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9(推断用于基因编辑),SpyCatcher/SpyTag系统 | 希瓦氏菌(Shewanella oneidensis) | 细胞表面锚定系统,DNA水凝胶生产途径 | 材料,工业生物技术 |
1015 | 2025-10-05 |
A pectin acetyl-transferase facilitates secondary plasmodesmata formation and RNA silencing movement between plant cells
2025-May, The Plant journal : for cell and molecular biology
DOI:10.1111/tpj.70194
PMID:40353833
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研究论文 | 本研究通过正向遗传筛选发现果胶乙酰转移酶调控植物细胞间次级胞间连丝形成,从而影响RNA沉默信号在细胞间的移动 | 首次揭示果胶乙酰转移酶通过调控细胞壁特性影响次级胞间连丝形成,为解释RNA沉默信号移动的语境性和方向性提供了机制性框架 | 研究主要基于拟南芥模型,在根部细胞中观察到的现象与叶片不同,暗示可能存在组织特异性机制 | 探究植物细胞间RNA沉默信号移动的分子机制和调控因素 | 拟南芥、人工miRNA、小干扰RNA、胞间连丝 | 植物分子生物学 | NA | 正向遗传筛选、原子力显微镜、抗体标记 | NA | 遗传数据、显微镜图像、生物化学数据 | NA | NA | 拟南芥 | NA | 农业 |
1016 | 2025-10-05 |
Phase Separation-Mediated Multienzyme Assembly In Vivo
2025-Apr-02, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.4c09585
PMID:40107849
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研究论文 | 本研究开发了一种基于相分离蛋白RGGRGG和ReverseTag/ReverseCatcher标签系统的多酶组装策略,显著提高了番茄红素的生物合成效率 | 首次将相分离蛋白RGGRGG与ReverseTag/ReverseCatcher标签系统整合,实现了多酶复合物的体内组装和催化效率的显著提升 | NA | 开发高效的多酶组装催化系统 | 相分离蛋白RGGRGG、ReverseTag/ReverseCatcher标签系统、番茄红素生物合成途径中的六种酶 | 合成生物学 | NA | 粗粒度模拟、酶固定化技术 | NA | 模拟数据、实验数据 | NA | ReverseTag/ReverseCatcher系统 | 细胞系统 | 多酶复合物组装系统,通过相分离形成酶凝聚体 | 工业生物技术 |
1017 | 2025-10-05 |
Engineering scutellarin biosynthesis in Artemisia annua
2025-Mar-21, Plant cell reports
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s00299-025-03471-4
PMID:40116969
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研究论文 | 通过在青蒿中补充缺失酶并优化黄酮6羟化酶,成功实现了野黄芩苷的异源合成 | 首次在青蒿中鉴定出野黄芩苷的两个关键前体,并通过引入来自短葶飞蓬和黄芩的高活性酶基因实现高效异源合成 | NA | 利用合成生物学方法在青蒿中生产稀缺药物野黄芩苷 | 青蒿植物和野黄芩苷生物合成途径 | 合成生物学 | 脑血管疾病,心血管疾病 | 基因工程,异源表达 | NA | NA | NA | 基因共表达 | 青蒿 | 野黄芩苷生物合成途径,包含黄酮合酶II、黄酮-7-O-葡萄糖醛酸基转移酶和黄酮-6-羟化酶 | 医药 |
1018 | 2025-10-05 |
A mediator-free sonogenetic switch for therapeutic protein expression in mammalian cells
2025-Mar-20, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf191
PMID:40114374
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研究论文 | 开发了一种名为SUPER的无介质超声基因开关,可在哺乳动物细胞中实现非侵入性、时空精确的蛋白质表达调控 | 首次实现无需介质、直接利用超声诱导活性氧激活KEAP1/NRF2通路的基因表达调控系统 | 目前仅在动物模型中进行验证,尚未进行人体临床试验 | 开发非侵入性、时空精确的基因表达调控技术用于细胞和基因治疗 | 哺乳动物细胞(包括人间充质干细胞系)和1型糖尿病小鼠模型 | 合成生物学 | 糖尿病 | 超声刺激技术、基因工程 | KEAP1/NRF2信号通路调控系统 | 基因表达数据、血糖水平数据 | 1型糖尿病小鼠模型 | 基因电路设计 | 哺乳动物细胞 | 基于KEAP1/NRF2/ARE的超声响应基因开关,包含合成抗氧化反应元件启动子 | 医学 |
1019 | 2025-10-05 |
AI-driven high-throughput droplet screening of cell-free gene expression
2025-Mar-19, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-58139-0
PMID:40108186
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研究论文 | 开发了一种名为DropAI的AI驱动高通量液滴筛选方法,用于优化无细胞基因表达系统 | 结合微流控液滴技术与机器学习模型,实现了对无细胞系统组成的高通量筛选和优化,并通过迁移学习成功应用于不同宿主系统 | NA | 优化无细胞基因表达系统的组成,降低成本并提高产量 | 无细胞基因表达系统 | 合成生物学 | NA | 微流控技术、荧光颜色编码系统、机器学习 | 机器学习模型 | 荧光信号数据、化学组合数据 | 12种不同蛋白质 | NA | 大肠杆菌、枯草芽孢杆菌 | 无细胞基因表达系统 | 工业生物技术 |
1020 | 2025-10-05 |
Exploring the potential of plant astrobiology: adapting flora for extra-terrestrial habitats: a review
2025-Mar, Biologia futura
IF:1.8Q3
DOI:10.1007/s42977-024-00245-z
PMID:39302628
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综述 | 探讨植物在外太空环境中适应机制及其在太空任务中维持生命支持系统的潜力 | 将植物学与天体生物学结合,系统研究植物在低重力、高辐射等极端太空环境下的适应机制 | NA | 评估植物在太空环境中维持生命支持系统的可行性 | 地球植物及其在太空环境中的适应性 | 天体生物学 | NA | 基因修饰、合成生物学技术 | NA | NA | NA | NA | 植物 | NA | 太空探索 |