合成生物学相关文章
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当前共找到 5109 篇文献，本页显示第 1001 - 1020 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1001 | 2026-03-07 |
CRISPR-Mediated Silkworm: The Oncoming Agricultural Revolutions and a Rising Model Organism
2026-Feb-12, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes17020230
PMID:41751614
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综述 | 本文综述了CRISPR基因组编辑技术在蚕中的应用，强调了其在蚕的疾病抗性、产量提升和新材料开发方面的突破，并探讨了CRISPR、泛基因组学和人工智能交叉领域的新方向 | 将CRISPR技术从简单基因敲除扩展到大规模全基因组筛选，并结合人工智能预测CRISPR结果，为蚕的分子育种和合成生物学提供新方法 | NA | 总结蚕基因组编辑的进展，探讨CRISPR技术在蚕农业和生物制造中的应用前景 | 蚕（家蚕） | 合成生物学 | NA | CRISPR基因组编辑 | NA | 基因组、转录组、蛋白质组数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 蚕（家蚕） | NA | 农业, 工业生物技术 |
| 1002 | 2026-03-07 |
[Biosynthesis and functions of human milk oligosaccharides]
2025-Oct-17, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.250490
PMID:41755593
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综述 | 本文综述了人乳寡糖的生理功能、应用潜力及其生物合成技术，重点关注通过合成生物学方法提高产量 | 结合代谢工程与合成生物学技术，利用不同底盘细胞显著提高人乳寡糖的产量，为食品和制药行业新产品开发提供新机遇 | NA | 探讨人乳寡糖的生物合成技术及其在食品和制药行业的应用潜力 | 人乳寡糖 | 合成生物学 | NA | 代谢工程，合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 底盘细胞 | NA | 食品，制药 |
| 1003 | 2026-03-06 |
In vivo self-assembled siRNAs ameliorate neurological pathology in TDP-43-associated neurodegenerative disease
2026-Mar-05, Brain : a journal of neurology
IF:10.6Q1
DOI:10.1093/brain/awaf330
PMID:40916343
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研究论文 | 本文提出了一种基于合成生物学的方法，利用体内自组装siRNA靶向TDP-43蛋白，通过小细胞外囊泡递送至中枢神经系统，改善TDP-43相关神经退行性疾病的病理症状 | 利用内源性小RNA处理机制自组装siRNA封装的小细胞外囊泡，并借助宿主自然循环系统运输siRNA，实现高效、微创的基因治疗 | 研究主要基于小鼠模型，临床转化效果和长期安全性仍需进一步验证 | 开发针对TDP-43蛋白异常积累的基因治疗策略，以治疗肌萎缩侧索硬化和额颞叶变性等神经退行性疾病 | TDP-43蛋白、siRNA、小细胞外囊泡、小鼠模型中的神经病理学变化 | 合成生物学 | 神经退行性疾病 | siRNA技术、小细胞外囊泡递送、立体定向注射、腺相关病毒递送系统 | NA | NA | 小鼠模型 | CRISPR-Cas9（可能用于工程化肝细胞，但未明确提及，故输出NA） | 小鼠 | 工程化肝细胞表达并包装靶向TDP-43的siRNA到狂犬病毒糖蛋白标记的小细胞外囊泡中，形成自组装递送系统 | 医学 |
| 1004 | 2026-03-06 |
Exploration of diverse glycosyltransferases in Dracocephalum moldavica and engineering the production of bioactive flavonoid glycosides
2026-Mar-04, Journal of integrative plant biology
IF:9.3Q1
DOI:10.1111/jipb.70212
PMID:41782194
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研究论文 | 本研究系统探索了香青兰中参与黄酮类化合物糖基化的UDP-糖基转移酶，并通过工程化大肠杆菌实现了两种生物活性黄酮苷的高效合成 | 首次在香青兰中鉴定出五种功能多样的UGTs，包括双功能糖基转移酶DmUGT1，并通过定点突变揭示了其糖供体特异性的关键氨基酸位点 | 研究主要聚焦于已鉴定的五种UGTs，可能还有其他未发现的糖基转移酶参与香青兰黄酮苷的生物合成 | 阐明香青兰中黄酮类化合物糖基化的分子机制，并为合成生物学方法生产生物活性糖苷提供候选基因和方法 | 香青兰中的UDP-糖基转移酶及其催化的黄酮苷生物合成途径 | 合成生物学 | 心血管疾病 | 同源建模、定点诱变、代谢工程 | NA | 基因序列、酶活性数据 | 五种鉴定出的UGT基因 | 质粒设计、代谢工程 | 大肠杆菌 | 通过工程化大肠杆菌菌株，利用DmUGT1和DmCGT1，并增强细胞内UDP-葡萄糖醛酸和UDP-葡萄糖的供应，以生产目标黄酮苷 | 医药 |
| 1005 | 2026-03-05 |
Correction for Ipoutcha et al., "A synthetic biology approach to assemble and reboot clinically relevant Pseudomonas aeruginosa tailed phages"
2026-Mar-03, Microbiology spectrum
IF:3.7Q2
DOI:10.1128/spectrum.00322-25
PMID:41609359
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1006 | 2026-03-04 |
Publisher Correction: Engineering modular and orthogonal genetic logic gates for robust digital-like synthetic biology
2026-Mar-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-69313-3
PMID:41771868
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1007 | 2026-03-06 |
Designing prokaryotic gene expression regulatory elements: From genomic mining to artificial intelligence-driven generation
2026 Mar-Apr, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108781
PMID:41419171
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综述 | 本文系统回顾了原核生物基因表达调控元件的设计策略，从基因组挖掘到人工智能驱动生成 | 整合了生物物理模型和人工智能指导的理性设计方法，强调了深度生成模型在功能调控元件开发中的应用 | 未具体说明实验验证的局限性或数据可用性问题 | 优化微生物细胞工厂的生物生产，通过精细调控基因表达 | 原核生物基因表达调控元件 | 合成生物学 | NA | 基因组挖掘、随机诱变、靶向诱变、深度生成建模 | 深度生成模型 | 序列数据 | NA | NA | 原核生物 | 基因表达调控元件，如启动子、核糖体结合位点等 | 工业生物技术 |
| 1008 | 2026-03-06 |
A parts list of promoters and gRNA scaffolds for mammalian genome engineering and molecular recording
2025-Nov-11, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-025-02896-2
PMID:41219485
|
研究论文 | 本文设计并量化了用于哺乳动物基因组工程和分子记录的启动子和gRNA支架变体库，以促进精确编辑和合成生物学应用 | 首次为哺乳动物系统开发了标准化的启动子和gRNA支架'部件列表'，包括数千个变体，其中数百个比常用序列活性更高，并通过饱和诱变筛选增强了序列多样性 | NA | 开发用于哺乳动物基因组工程和分子记录的标准化遗传部件库，以提高编辑效率和可预测性 | 哺乳动物细胞系（人类和小鼠）中的启动子和gRNA支架变体 | 合成生物学 | NA | 多重prime editing、饱和诱变筛选 | NA | 序列数据、编辑活性数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 哺乳动物细胞 | gRNA阵列、'十键'阵列用于平衡pegRNA活性，适用于合成基因座、生物记录器和复杂遗传电路 | 医学、工业生物技术 |
| 1009 | 2026-03-06 |
Plants against cancer: towards green Taxol production through pathway discovery and metabolic engineering
2024-Sep, aBIOTECH
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s42994-024-00170-8
PMID:39279861
|
综述 | 本文综述了植物天然产物发现与工程中的挑战与进展，以抗癌药物紫杉醇生物合成途径中缺失酶的突破性发现为例 | 通过高通量测序和合成生物学方法，成功鉴定了紫杉醇生物合成途径中的关键缺失酶，为绿色生产提供了新途径 | NA | 加速药物发现并解决人类健康问题，特别是通过植物天然产物的工程化生产抗癌药物 | 植物天然产物，尤其是紫杉醇的生物合成途径 | 合成生物学 | 癌症 | 高通量测序、基因组组装、基因合成、分析技术 | NA | NA | NA | 合成生物学方法 | 植物 | 紫杉醇的生物合成途径 | 医药 |
| 1010 | 2026-03-06 |
Enabling neighbour labelling: using synthetic biology to explore how cells influence their neighbours
2024-01-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.201955
PMID:38165174
|
综述 | 本文综述了合成生物学和图像分析技术的最新进展，以探索细胞如何影响其邻近细胞 | 整合合成生物学工具与图像分析方法，以解决细胞间相互作用研究中的技术挑战 | 在发育模型系统中应用这些技术时存在机会和限制 | 探索细胞间相互作用在发育过程中的机制 | 细胞及其邻近细胞 | 合成生物学 | NA | 图像分析 | NA | 图像 | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 1011 | 2026-03-06 |
Orthogonal translation enables heterologous ribosome engineering in E. coli
2021-01-26, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-20759-z
PMID:33500394
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研究论文 | 本研究通过正交翻译系统在E. coli中实现了异源核糖体工程，为合成生物学提供了新的核糖体改造框架 | 采用正交核糖体结合位点（RBS）与反RBS配对系统，首次实现了对难改造核糖体的定向工程化 | 目前仅适用于16S rRNA与E. coli相似度≥76.1%的微生物来源核糖体 | 开发活细胞中异源核糖体工程化的通用方法 | 由不同微生物rRNA和核糖体蛋白组成的异源核糖体 | 合成生物学 | NA | 正交翻译系统、核糖体工程 | NA | NA | NA | 正交RBS:antiRBS配对系统 | E. coli | 正交翻译系统、异源核糖体组装 | 工业生物技术 |
| 1012 | 2026-03-05 |
Transforming Crowded Coacervates into Multi-Compartmental Hybrid Microreactors for Practical Enzymatic Catalysis
2025-Oct-20, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202502479
PMID:40884011
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研究论文 | 本文提出了一种基于Pickering乳液的封装方法，将无膜凝聚层转化为多室杂化微反应器，用于高效酶催化 | 创新点包括将拥挤凝聚层转化为具有层次化分隔结构、分子拥挤环境、选择性渗透能力和机械增强稳定性的多室杂化微反应器 | NA | 研究目的是设计和构建具有组织复杂性、多样功能性和实际应用性的人工原细胞，以推动体外合成生物学和生物工程发展 | 研究对象为杂化微反应器，涉及生物和非生物催化物种的空间隔离 | 合成生物学 | NA | Pickering乳液封装 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术 |
| 1013 | 2026-03-05 |
Quantitative Characterization of Gene Regulatory Circuits Associated With Fungal Secondary Metabolism to Discover Novel Natural Products
2024-12, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202407195
PMID:39467708
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研究论文 | 本研究开发了一种结合微流体平台与数学模型的系统，用于在单细胞水平上定量表征真菌基因调控回路，并利用该平台成功重构了生物活性分子的生物合成途径 | 首次将先进微流体平台与数学模型结合，实现了对多细胞真菌基因调控回路在单细胞水平的精确表征与定量分析 | 研究主要基于模式真菌构巢曲霉，尚未广泛验证于其他真菌物种 | 定量表征真菌次级代谢相关基因调控回路，以发现新型天然产物 | 真菌基因调控回路（GRCs）及其调控的次级代谢生物合成基因簇（BGCs） | 合成生物学 | NA | 微流体平台、数学模型、基因回路重构 | 数学模型 | 单细胞表达数据 | 30个转录因子-启动子组合（源自两个代表性真菌GRCs） | 基因回路重构 | 构巢曲霉（Aspergillus nidulans） | 基因调控回路（GRCs）、生物合成基因簇（BGCs）重构 | 医药、工业生物技术 |
| 1014 | 2026-03-05 |
Regulostat Inferelator: a novel network biology platform to uncover molecular devices that predetermine cellular response phenotypes
2019-08-22, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkz417
PMID:31114928
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研究论文 | 本文提出了一种名为Regulostat Inferelator（RSI）的新型网络生物学算法，用于识别能够预先决定和微调细胞表型响应的基因调控网络 | 首次开发了能够从基础转录组数据中识别具有“调节器”功能的基因对的算法，并首次提供了癌症细胞中药物-调节器相互作用的证据 | 目前仅为概念验证研究，需要进一步的实验验证 | 开发识别预先决定细胞表型响应的分子调控网络的工具 | 基因表达模式、细胞表型响应、癌症细胞 | 网络生物学 | 癌症 | 转录组数据分析 | RSI算法 | 转录组数据 | NA | NA | NA | 调节器网络（具有类似变阻器合作模式的基因对） | 医学、生物工程 |
| 1015 | 2026-03-04 |
Building AuxInYeast Synthetic Biology Strains for Biochemical Characterization of Maize Auxin Hormone Signaling Components
2026-Mar-02, Cold Spring Harbor protocols
DOI:10.1101/pdb.prot108634
PMID:40074300
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研究论文 | 本文介绍了一种名为AuxInYeast的合成生物学工具，用于在酵母中构建玉米生长素信号通路组件，以进行生化表征 | 开发了AuxInYeast系统，作为植物合成生物学底盘，首次在酵母中重建玉米生长素信号通路，实现高通量定量分析 | 系统基于酵母环境，可能不完全模拟植物体内复杂调控网络，且仅针对玉米组件，通用性需进一步验证 | 构建合成生物学菌株，以生化表征玉米生长素激素信号通路组件 | 玉米生长素信号通路组件，包括受体、阻遏物、辅阻遏物、转录因子和响应元件 | 合成生物学 | NA | 流式细胞术、荧光蛋白标记 | NA | 生化数据、荧光信号数据 | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly | 酵母 | 生长素信号通路，包括受体-阻遏物复合物、转录激活级联和响应元件 | 农业, 工业生物技术 |
| 1016 | 2026-03-04 |
Testing AuxInYeast Synthetic Biology Strains via Fluorescence Flow Cytometry
2026-Mar-02, Cold Spring Harbor protocols
DOI:10.1101/pdb.prot108635
PMID:40074301
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研究论文 | 本文介绍了一种使用荧光流式细胞术测试AuxInYeast合成生物学菌株的协议，用于分析玉米生长素信号通路 | 开发了基于酵母异源表达平台的AuxInYeast系统，结合荧光流式细胞术实现高通量定量测量植物生长素信号通路组件 | NA | 工程化玉米生长和发育，通过合成生物学工具分析生长素激素信号通路 | 玉米生长素感知受体和荧光标记的阻遏蛋白 | 合成生物学 | NA | 荧光流式细胞术 | NA | 荧光数据 | 多个AuxInYeast菌株，具体数量未指定 | AuxInYeast系统 | 酵母 | 生长素感知和阻遏蛋白降解的生物传感器通路 | 农业 |
| 1017 | 2026-03-04 |
Advancing Genetic Code Expansion in Live Cells Through Metabolic Engineering
2026-Mar-02, Annual review of chemical and biomolecular engineering
IF:7.6Q1
|
综述 | 本文综述了通过代谢工程在活细胞中推进遗传密码扩展（GCE）的进展，重点关注非标准氨基酸（nsAAs）的生物合成及其在合成生物学中的应用 | 整合代谢工程与GCE，实现nsAAs的生物合成，减少对化学合成补充的依赖，拓展蛋白质化学功能 | 现有GCE方法通常依赖细胞培养基中化学合成nsAAs的补充，这限制了其应用范围 | 克服GCE中nsAAs来源的限制，通过代谢工程实现nsAAs的生物合成，以促进合成生物学应用 | 遗传密码扩展（GCE）、非标准氨基酸（nsAAs）、活细胞中的蛋白质翻译 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、遗传密码扩展（GCE） | NA | NA | NA | NA | 活细胞（未指定具体宿主） | 生物合成途径设计，用于生产非标准氨基酸（nsAAs） | 医学、工业生物技术 |
| 1018 | 2026-03-04 |
A meta-analysis of the gut microbiome in inflammatory bowel disease patients identifies disease-associated small molecules
2025-Feb-12, Cell host & microbe
IF:20.6Q1
DOI:10.1016/j.chom.2025.01.002
PMID:39947133
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meta-analysis | 通过荟萃分析炎症性肠病患者肠道微生物组的小分子生物合成基因簇，鉴定出与克罗恩病相关的脂肪酸酰胺，并验证其破坏肠道通透性和加剧疾病的作用 | 首次通过合成生物学方法解析了克罗恩病相关基因簇产生的六种脂肪酸酰胺结构，并证实这些微生物来源小分子在疾病发生中的作用 | 研究主要基于小鼠模型验证，人类样本中的直接致病机制仍需进一步探究 | 探究肠道微生物组小分子代谢物在炎症性肠病发病机制中的作用 | 炎症性肠病患者和健康对照的肠道宏基因组样本、克罗恩病相关基因簇产物、结肠炎小鼠模型 | 宏基因组学 | 炎症性肠病（克罗恩病） | 宏基因组测序、合成生物学、结构解析 | NA | 宏基因组数据、质谱数据 | IBD患者与健康对照的粪便样本（具体数量未明确说明） | 合成生物学 | 梭菌属（Clostridia） | 小分子生物合成基因簇（BGCs） | 医学 |
| 1019 | 2026-03-04 |
Recent advances in CAR T-cell engineering using synthetic biology: Paving the way for next-generation cancer treatment
2024, Advances in protein chemistry and structural biology
DOI:10.1016/bs.apcsb.2024.02.003
PMID:38762281
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综述 | 本章节全面探讨了合成生物学在CAR T细胞疗法中的创新应用，以推动下一代癌症治疗的发展 | 强调合成生物学通过基因编辑、合成基因电路和分子工程技术，优化CAR T细胞功能，提升治疗的安全性和有效性 | NA | 探索合成生物学如何增强CAR T细胞疗法的个性化和精准性，以改善癌症治疗效果 | CAR T细胞疗法及其在癌症免疫治疗中的应用 | 合成生物学 | 癌症 | 基因编辑、合成基因电路、分子工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN | T细胞 | 合成基因电路，用于优化CAR T细胞功能，如逻辑门或生物传感器设计 | 医学 |
| 1020 | 2026-03-04 |
GroovDB: A Database of Ligand-Inducible Transcription Factors
2022-10-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.2c00382
PMID:36178800
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研究论文 | 本文介绍了GroovDB，一个用于配体诱导型转录因子的数据库，旨在支持合成生物学中的工程应用 | 开发了一个经过验证的、可访问的数据库，整合了配体诱导型转录因子的序列、配体和操作数据，并提供了自动化数据管理和可视化工具 | NA | 为合成生物学提供一个可靠的配体诱导型转录因子资源库，以促进遗传电路的设计和应用 | 配体诱导型原核转录因子及其相关数据 | 合成生物学 | NA | 自动化数据管理流程 | NA | 序列数据、配体数据、操作数据 | NA | NA | 原核生物 | 化学响应型遗传电路 | 工业生物技术、医学 |