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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1021 | 2025-10-05 |
Removing redundancy of the NCN codons in vitro for maximal sense codon reassignment
2025-May-21, Chemical science
IF:7.6Q1
DOI:10.1039/d4sc06740a
PMID:40271033
|
研究论文 | 本研究通过消除NCN密码子冗余,在体外实现了最大程度的义密码子重新分配 | 提出了评估密码子重新分配潜力的通用方法,并将16个NCN密码子分配给10种不同氨基酸,使编码潜力增加一倍以上 | 研究目前仅限于体外系统,尚未在活体生物中验证 | 打破61个义密码子与20种氨基酸之间的简并性,实现遗传密码的最大化扩展 | NCN密码子家族(编码丝氨酸、脯氨酸、苏氨酸和丙氨酸的16个密码子)和对应的11种tRNA | 合成生物学 | NA | mRNA展示技术 | NA | NA | NA | NA | NA | 遗传密码重新分配系统 | 合成生物学, 蛋白质功能研究, 肽库构建 |
| 1022 | 2025-10-05 |
Quantum-inspired logic for advanced Transcriptional Programming
2025-May-10, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf440
PMID:40396492
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研究论文 | 本研究开发了一种基于量子计算原理的新型转录编程平台技术,用于构建压缩型多输入/输出遗传电路 | 首次将量子计算原理应用于合成生物学,开发了双向启动子和合成转录因子调控的压缩遗传电路,实现了1输入2输出的量子比特和泡利-X逻辑门 | NA | 提高生物系统决策操作的复杂性同时减少底盘细胞的代谢负担 | 合成遗传电路和量子启发的逻辑操作 | 合成生物学 | NA | 转录编程、遗传电路工程 | NA | NA | NA | 重组酶系统 | 底盘细胞 | 量子比特逻辑门、泡利-X逻辑门、费曼门、托佛利门、双向启动子调控的压缩遗传电路 | 生物计算 |
| 1023 | 2025-10-05 |
Evolution of interorganismal strigolactone biosynthesis in seed plants
2025-Jan-17, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.adp0779
PMID:39818909
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研究论文 | 本研究通过合成生物学方法揭示了CYP722A在独脚金内酯生物合成进化中的关键作用 | 发现CYP722A是CYP722C的进化前体,能将CLA转化为非经典独脚金内酯16-OH-CLA,并证明其植物激素功能 | NA | 探究种子植物中独脚金内酯生物合成的进化机制 | 独脚金内酯生物合成途径中的细胞色素P450酶CYP722A和CYP722C | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | 独脚金内酯生物合成途径 | 农业 |
| 1024 | 2025-10-05 |
Advances in metabolic engineering for enhanced acetyl-CoA availability in yeast
2025-Jun, Critical reviews in biotechnology
IF:8.1Q1
DOI:10.1080/07388551.2024.2399542
PMID:39266266
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综述 | 总结了酵母中乙酰-CoA及其衍生物生物合成途径与代谢工程策略的最新进展 | 重点关注不同细胞器中代谢通量增强、前体CoA合成优化、底物利用改进及蛋白质乙酰化水平调控等代谢工程新策略 | NA | 通过代谢工程策略提高酵母中乙酰-CoA的可用性以促进生物制造 | 酿酒酵母和毕赤酵母中的乙酰-CoA代谢途径 | 合成生物学 | NA | 代谢工程 | NA | NA | NA | NA | 酿酒酵母, 毕赤酵母 | 乙酰-CoA生物合成途径 | 工业生物技术 |
| 1025 | 2025-10-05 |
Astaxanthin biosynthesis for functional food development and space missions
2025-Jun, Critical reviews in biotechnology
IF:8.1Q1
DOI:10.1080/07388551.2024.2410364
PMID:39428346
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综述 | 本文综述了虾青素的生物合成策略及其在功能性食品开发和太空任务中的应用前景 | 系统比较不同天然来源虾青素的质差异,评估不同底盘生物中虾青素表达的上游程序,并探索基于合成生物学和细胞工厂的工业化生产策略 | NA | 为虾青素的高效精准基因工程提供理论基础,推动虾青素及其他生物代谢物的生物制造研究 | 虾青素的生物合成途径、不同天然来源的虾青素、微藻底盘生物 | 合成生物学 | 心血管疾病 | 基因工程、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 微藻、植物、微生物 | 虾青素生物合成途径 | 食品,医药,化妆品,水产养殖,太空探索 |
| 1026 | 2025-10-05 |
Perturbation-response analysis of in silico metabolic dynamics revealed hard-coded responsiveness in the cofactors and network sparsity
2025-May-20, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.98800
PMID:40390360
|
研究论文 | 通过动力学模型分析细菌代谢对外部扰动的响应特性 | 发现代谢动力学中存在的硬编码响应特性,揭示腺苷辅因子和网络稀疏性对代谢响应的重要影响 | 基于计算机模拟研究,需要实验验证 | 理解生化系统在扰动下的动态特性,发展稳态的定量理论 | 细菌中心碳代谢 | 计算系统生物学 | NA | 动力学模型,数值模拟 | 非线性动力学模型 | 模拟数据 | 三个不同的动力学模型 | NA | 细菌 | NA | 合成生物学,生物工程 |
| 1027 | 2025-10-05 |
Targeted high-level production of chuangxinmycin and its halogenated derivatives with antitubercular activity
2025-May-19, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-025-02740-x
PMID:40390016
|
研究论文 | 通过合成生物学技术实现创新霉素及其卤化衍生物的高效定向生物合成 | 首次通过生物合成而非化学合成获得创新霉素衍生物,首次报道卤化去甲创新霉素衍生物,实现了创新霉素和去甲创新霉素的最高实验室产量 | 未明确说明发酵规模和生产稳定性等工程化挑战 | 开发新型抗结核药物候选物 | 创新霉素及其衍生物 | 合成生物学 | 结核病 | 异源表达、启动子优化、发酵培养基筛选、前体定向生物合成 | NA | NA | 11种卤化衍生物(其中6种纯化鉴定) | NA | 放线菌 | 创新霉素生物合成途径 | 医药 |
| 1028 | 2025-10-05 |
Synthetic Biology-Based Engineering Cells for Drug Delivery
2025-Apr, Exploration (Beijing, China)
DOI:10.1002/EXP.20240095
PMID:40395752
|
综述 | 本文综述了基于合成生物学的工程化细胞在药物递送领域的新兴应用 | 聚焦合成生物学与纳米技术交叉融合的前沿进展,提出工程化细胞向模块化、标准化和智能化发展的新方向 | NA | 探讨合成生物学策略在生物药物递送系统开发中的应用 | 基于合成生物学的工程化细胞 | 合成生物学 | NA | 合成生物学技术 | NA | NA | NA | NA | 工程化细胞 | NA | 医药 |
| 1029 | 2025-10-05 |
Synthetic biology design principles enable efficient bioproduction of Heparosan with low molecular weight and low polydispersion index for the biomedical industry
2025, Synthetic biology (Oxford, England)
DOI:10.1093/synbio/ysaf006
PMID:40396182
|
研究论文 | 利用合成生物学原理设计生物分子控制器,在细菌中精确调控肝素糖的生物合成 | 开发了基于生物传感器的生物分子控制器,能够检测肝素糖前体并精细调控聚合过程 | NA | 实现低分子量和低多分散指数的肝素糖的精确生物合成 | 肝素糖生物合成途径 | 合成生物学 | NA | 生物传感器技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌Nissle 1917 | 生物分子控制器,包含前体检测生物传感器和基因表达调控系统 | 医药 |
| 1030 | 2025-10-05 |
Oriented triplex DNA as a synthetic receptor for transmembrane signal transduction
2024-11-12, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-53960-5
PMID:39532841
|
研究论文 | 开发了一种基于定向三链DNA的人工跨膜信号转导系统 | 首次使用胆固醇标记的定向三链DNA作为合成受体,通过pH驱动的构象变化实现跨膜信号转导 | NA | 构建模拟天然GPCR功能的人工信号转导系统 | 三链DNA合成受体和脂质双层膜 | 合成生物学 | NA | 荧光共振能量转移(FRET)、光切割、信号放大 | NA | NA | NA | DNA纳米技术 | NA | 三链DNA构象开关、逻辑门调制、信号放大回路 | 生物传感、细胞信号调控、靶向药物递送 |
| 1031 | 2025-10-05 |
The Advancement of Peptides Derived From Kitasatospora
2025-May, Chemistry & biodiversity
IF:2.3Q3
DOI:10.1002/cbdv.202402999
PMID:39737746
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综述 | 本文综述了北里孢菌属来源肽类天然产物的研究策略、结构特征及生物合成机制 | 系统归纳了北里孢菌肽类研究的两种策略(天然产物优先和酶优先方法)及其在扩展合成生物学生物催化工具箱方面的潜力 | NA | 总结北里孢菌属来源肽类天然产物的研究进展和生物合成知识 | 北里孢菌属放线菌及其产生的肽类天然产物 | 合成生物学 | NA | 基因组分析、生物信息学工具、序列相似性网络 | NA | 文本 | NA | NA | 放线菌 | NA | 医药 |
| 1032 | 2025-10-05 |
Hydrogels as promising platforms for engineered living bacteria-mediated therapeutic systems
2022-Dec, Materials today. Bio
DOI:10.1016/j.mtbio.2022.100435
PMID:36164505
|
综述 | 本文总结了水凝胶作为工程化活菌治疗系统递送平台的设计策略与应用进展 | 系统阐述水凝胶在活菌介导治疗中的平台作用,整合合成生物学与生物材料科学的交叉创新 | 未涉及具体临床转化挑战的量化分析 | 探讨水凝胶作为活菌治疗递送平台的开发策略与应用前景 | 基于水凝胶的工程化细菌治疗系统 | 合成生物学与生物材料 | 消化系统疾病,皮肤真菌感染,伤口愈合,疫苗,癌症 | NA | NA | 文献综述数据 | NA | NA | 工程化细菌 | NA | 医药 |
| 1033 | 2025-10-05 |
Microbial secondary metabolites: advancements to accelerate discovery towards application
2025-Jun, Nature reviews. Microbiology
DOI:10.1038/s41579-024-01141-y
PMID:39824928
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综述 | 本文综述了微生物次级代谢产物的研究进展及其在生物经济中的应用潜力 | 整合基因组测序、生物信息预测工具与合成生物学技术,加速新型次级代谢产物的发现 | NA | 推动微生物次级代谢产物从基础研究到实际应用的转化 | 微生物次级代谢产物及其生物合成基因簇 | 合成生物学 | NA | 基因组测序、生物信息学分析、细胞/无细胞表达系统 | NA | 基因组数据、代谢组数据 | NA | 合成生物学工具 | 微生物 | 生物合成基因簇及其调控通路 | 医药, 农业, 工业生物技术 |
| 1034 | 2025-10-05 |
Integrated metabolome and transcriptome analyses revealed key cytochrome P450 genes involved in the biosynthesis of oleanane-type saponins in Hedera helix L
2025-Jun, Plant physiology and biochemistry : PPB
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.plaphy.2025.109818
PMID:40147328
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研究论文 | 本研究通过整合代谢组和转录组分析,揭示了常春藤中参与齐墩果烷型皂苷生物合成的关键细胞色素P450基因 | 首次系统鉴定并功能验证了常春藤中CYP716和CYP72家族的6个P450基因在齐墩果烷型三萜皂苷生物合成中的关键作用 | 对常春藤的研究仍较浅,特别是五环三萜骨架修饰阶段CYP450基因的功能表征尚不充分 | 阐明常春藤中齐墩果烷型皂苷生物合成的分子机制 | 常春藤(Hedera helix L.)及其三萜皂苷成分 | 植物代谢工程 | 咳嗽和上呼吸道疾病 | 转录组分析、代谢组分析、RT-qPCR、体外和体内验证 | NA | 转录组数据、代谢组数据 | NA | 代谢工程 | 常春藤 | 齐墩果烷型三萜皂苷生物合成途径 | 医药, 农业, 工业生物技术 |
| 1035 | 2025-10-05 |
A generalizable approach for programming protease-responsive conformationally inhibited artificial transcriptional factors
2025-May-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-59828-6
PMID:40382329
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研究论文 | 本研究开发了一种蛋白酶响应构象抑制系统(PRCIS),用于编程人工转录因子的条件性激活 | 通过分子内连接将DNA结合域与二聚化区域偶联实现构象失活,经蛋白酶切割后恢复功能,可适配多种ATF和蛋白酶 | NA | 开发可编程的蛋白酶响应型人工转录因子调控系统 | 人工转录因子(ATF)和蛋白酶响应系统 | 合成生物学 | NA | 蛋白质工程、基因电路设计 | NA | NA | NA | NA | NA | 构象抑制系统、三重正交蛋白酶响应平台、双正交化学诱导平台、布尔逻辑运算 | 医学、工业生物技术 |
| 1036 | 2025-10-05 |
Transforming non-conventional yeasts into key players in biotechnology: advances in synthetic biology applications
2025, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2025.1600187
PMID:40384783
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综述 | 本文综述了合成生物学技术在开发非常规酵母生物技术应用方面的最新进展 | 系统总结了非常规酵母合成生物学工具开发的最新突破,包括新型遗传元件、基因组编辑工具和代谢通路工程 | NA | 探讨如何利用合成生物学技术开发非常规酵母在生物制造领域的应用潜力 | 非常规酵母菌种 | 合成生物学 | NA | 基因组编辑、代谢通路工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 非常规酵母 | 代谢通路工程、遗传回路设计 | 工业生物技术,能源,环境 |
| 1037 | 2025-10-05 |
New-to-nature CO2-dependent acetyl-CoA assimilation enabled by an engineered B12-dependent acyl-CoA mutase
2024-11-26, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-53762-9
PMID:39592584
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研究论文 | 本研究开发了一种新型的二氧化碳依赖性乙酰-CoA同化途径Lcm模块 | 创建了自然界不存在的新型CO2固定途径,利用工程化B12依赖性酰基-CoA变位酶实现乙酰-CoA向丙酮酸的直接转化 | 目前仅在体外验证了完整的Lcm模块功能,体内应用效果需进一步验证 | 开发高效的乙酰-CoA同化途径以解决碳损失问题 | 乙酰-CoA代谢途径和工程化酶系统 | 合成生物学 | NA | 定向超突变、适应性进化、体外验证 | NA | 酶活性数据、代谢途径分析数据 | NA | 定向进化 | 大肠杆菌 | Lcm代谢模块,包含3-羟基丙酰-CoA向乳酰-CoA转化的新型酶促反应 | 工业生物技术 |
| 1038 | 2025-10-05 |
The de novo design and synthesis of yeast chromosome XIII facilitates investigations on aging
2024-11-22, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-54130-3
PMID:39578428
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研究论文 | 通过人工设计和合成酵母染色体XIII,研究其对衰老过程的影响 | 首次成功构建884 Kb的合成酵母染色体XIII,并利用SCRaMbLE系统实现可诱导的全基因组重排 | 研究仅针对酵母染色体XIII,未涉及其他染色体或更复杂的生物系统 | 探索合成染色体在衰老研究中的应用 | 酿酒酵母合成染色体XIII | 合成生物学 | 衰老相关疾病 | 染色体合成技术,SCRaMbLE系统,转录组分析 | NA | 基因组数据,转录组数据 | 20个SCRaMbLEd synXIII菌株 | SCRaMbLE | 酿酒酵母 | 合成染色体设计,可诱导基因组重排系统 | 医学,基础研究 |
| 1039 | 2025-10-05 |
Ultrasound-responsive mammalian cell synthetic biology
2025-May-16, IEEE transactions on ultrasonics, ferroelectrics, and frequency control
DOI:10.1109/TUFFC.2025.3570813
PMID:40378033
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综述 | 本文综述了超声响应哺乳动物细胞合成生物学的最新进展,重点介绍了声遗传学在非侵入性细胞控制中的应用 | 将超声波与基因工程效应器结合,克服了组织穿透性和侵入性的限制,实现了对细胞和分子过程的非侵入精确控制 | 参数标准化不足和对潜在机制理解不充分 | 开发超声响应合成生物学工具用于研究和治疗应用 | 哺乳动物细胞和分子过程 | 合成生物学 | NA | 声遗传学 | NA | NA | NA | 基因工程 | 哺乳动物细胞 | 超声响应遗传电路 | 医学 |
| 1040 | 2025-10-05 |
Self-authenticating genomic materials in Escherichia coli via advanced genome signatures
2025-May-16, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-08171-z
PMID:40379889
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研究论文 | 开发了一种基于基因组特征的DNA标记系统,用于创建自认证基因组 | 提出基于Golomb标尺的基因组梳状结构,能在有限密码子内高效映射大量核苷酸序列,显著提高错误校正和数据编码能力 | NA | 开发能够确保合成基因组材料真实性和完整性的DNA标记系统 | 大肠杆菌基因组 | 合成生物学 | NA | 基因组编辑 | NA | 基因组序列数据 | 450万核苷酸基因组 | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌 | 基因组签名系统,基于密码子顺序的数据编码 | 工业生物技术 |