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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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1021 | 2024-10-17 |
On the ever-growing functional versatility of the CRISPR-Cas13 system
2024-02, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.14418
PMID:38381083
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研究论文 | 本文讨论了CRISPR-Cas13系统的功能多样性 | CRISPR-Cas13系统被重新用于解码和工程化基因表达程序,具有RNA沉默、RNA编辑、RNA追踪、核酸检测和翻译调控等多种功能 | NA | 探讨CRISPR-Cas13系统的功能多样性及其在系统生物学和合成生物学领域的应用 | CRISPR-Cas13系统及其功能 | NA | NA | CRISPR-Cas13 | NA | NA | NA |
1022 | 2024-10-17 |
Dynamic RNA synthetic biology: new principles, practices and potential
2023-01, RNA biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1080/15476286.2023.2269508
PMID:38044595
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综述 | 本文综述了动态RNA合成生物学在分子、电路和细胞尺度上的最新进展及其在环境、人类健康和生物生产等社会规模应用中的潜力 | 本文介绍了动态RNA折叠和功能的核心概念,并讨论了将这些概念纳入的最新技术,如工程化核开关、核酶、RNA折纸、RNA链置换电路、生物材料、生物分子凝聚物、细胞外囊泡和合成细胞 | NA | 探讨动态RNA合成生物学在不同尺度上的应用及其对RNA生物技术的影响 | 动态RNA系统在分子、电路和细胞尺度上的设计和应用 | 合成生物学 | NA | RNA工程技术 | NA | NA | NA |
1023 | 2024-10-16 |
Flanking Sequence Cotranscriptionally Regulates Twister Ribozyme Activity
2024-01-02, Biochemistry
IF:2.9Q3
DOI:10.1021/acs.biochem.3c00506
PMID:38134329
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研究论文 | 研究了侧翼序列对Twister核酶活性的共转录调控 | 首次展示了侧翼序列对Twister核酶活性的调控机制,并提出了“ribozymogens”的概念 | 研究仅限于水稻中的Twister核酶,且样本数量有限 | 探讨侧翼序列对Twister核酶活性的调控机制 | 水稻中的Twister核酶及其侧翼序列 | NA | NA | RNA-seq、结构探针、共转录切割实验 | NA | RNA序列 | 选择了几种水稻中的Twister核酶进行研究 |
1024 | 2024-10-16 |
Protein engineering in the computational age: An open source framework for exploring mutational landscapes in silico
2023-Dec, Engineering biology
DOI:10.1049/enb2.12028
PMID:38094241
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研究论文 | 本文介绍了在计算时代下蛋白质工程的发展,并提出了一个开源框架InFinity 1.0,用于探索蛋白质突变景观的计算模拟 | 提出了InFinity 1.0框架,旨在提高蛋白质工程的可用性和可访问性 | 目前蛋白质工程项目所需的专门知识仍集中在少数专业人士手中,且iGEM竞赛的资源和时间限制阻碍了复杂项目的进展 | 开发一个计算框架,以提高蛋白质工程的可用性和可访问性 | 蛋白质工程及其在药物发现和工业生物技术中的应用 | 生物信息学 | NA | 计算工具和高通量筛选技术 | NA | NA | NA |
1025 | 2024-10-16 |
Israel and the global synthetic biology ecosystem
2023-Dec, Engineering biology
DOI:10.1049/enb2.12027
PMID:38094240
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综述 | 本文概述了以色列在合成生物学领域的活动,包括历史背景、当前策略、前景和相关发展 | NA | NA | 提供以色列合成生物学领域的概述 | 以色列的合成生物学生态系统 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
1026 | 2024-10-15 |
Cellular Site-Specific Incorporation of Noncanonical Amino Acids in Synthetic Biology
2024-Sep-25, Chemical reviews
IF:51.4Q1
DOI:10.1021/acs.chemrev.3c00938
PMID:39207844
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综述 | 本文综述了在合成生物学中通过遗传密码扩展(GCE)方法将非经典氨基酸(ncAAs)定点引入细胞的技术进展及其主要应用 | 本文探讨了通过非经典密码子添加扩展遗传密码、创建半自主和自主生物体、设计调控元件以及操纵和扩展肽天然产物生物合成途径等创新方法 | 本文未具体提及研究中的局限性 | 探讨遗传密码扩展(GCE)方法在合成生物学中定点引入非经典氨基酸(ncAAs)的技术进展及其未来发展前景 | 非经典氨基酸(ncAAs)的定点细胞引入及其在合成生物学中的应用 | 合成生物学 | NA | 遗传密码扩展(GCE) | NA | NA | NA |
1027 | 2024-10-15 |
Toward the bioactive potential of myricitrin in food production: state-of-the-art green extraction and trends in biosynthesis
2024, Critical reviews in food science and nutrition
IF:7.3Q1
DOI:10.1080/10408398.2023.2227262
PMID:37395263
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综述 | 本文综述了蜜柑素在食品生产中的生物活性潜力,包括其绿色提取技术和生物合成趋势 | 本文介绍了创新的绿色提取技术和基于合成生物学的生物合成方法,为蜜柑素的大规模生产提供了新视角 | 蜜柑素的低产量、高成本以及从植物资源中提取带来的环境破坏限制了其实际应用 | 探讨蜜柑素的健康益处及其作用机制,为其应用提供理论基础 | 蜜柑素的生物活性、提取技术和生物合成方法 | NA | NA | 绿色提取技术、合成生物学 | NA | NA | NA |
1028 | 2024-10-15 |
Improved production of Taxol® precursors in S. cerevisiae using combinatorial in silico design and metabolic engineering
2023-Nov-29, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-023-02251-7
PMID:38031061
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研究论文 | 本研究利用计算机设计算法和代谢工程技术,在酵母基因组尺度模型上预测基因组修饰,以提高工程化酿酒酵母细胞中紫杉醇前体的生产 | 通过计算机设计算法和湿实验筛选,成功提高了工程化酿酒酵母菌株中紫杉醇前体taxadiene的产量 | NA | 通过系统生物学和合成生物学工具,设计高效的微生物细胞工厂,以合成高价值产品 | 工程化酿酒酵母细胞中紫杉醇前体的生产 | 代谢工程 | NA | 基于约束的重建与分析(COBRA)方法 | NA | 基因组数据 | 17种基因组修饰,包括9个基因敲除和8个基因过表达 |
1029 | 2024-10-15 |
Design and deep learning of synthetic B-cell-specific promoters
2023-Nov-27, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkad930
PMID:37889080
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研究论文 | 本文设计并合成了23,640个B细胞特异性启动子,并通过深度学习模型预测其转录强度 | 本文首次将合成生物学与深度学习结合,用于解码和重编DNA调控语法,并设计了大量B细胞特异性启动子 | NA | 解码B细胞特异性转录调控机制,并为B细胞工程提供大量非相似启动子 | B细胞特异性启动子及其在免疫球蛋白V基因转录中的作用 | 合成生物学 | NA | MPRA(大规模并行报告分析) | 深度学习模型 | DNA序列 | 23,640个合成的B细胞特异性启动子 |
1030 | 2024-10-15 |
Rise of synthetic yeast: Charting courses to new applications
2023-Nov-08, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2023.100438
PMID:38020966
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研究论文 | 本文探讨了合成酵母的兴起及其在生物技术中的新应用 | 本文介绍了合成生物学和基因组工程的最新进展,特别是Sc2.0联盟提供的工具和工程细胞平台,开启了定制生物学的新时代 | 尽管取得了显著进展,但仍存在一些障碍,限制了工程真核细胞的更广泛应用 | 探讨合成酵母在生物技术中的应用潜力 | 酵母作为真核生物的研究和工业用途 | 生物技术 | NA | 基因组工程 | NA | NA | NA |
1031 | 2024-10-15 |
Context-dependent neocentromere activity in synthetic yeast chromosome VIII
2023-Nov-08, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2023.100437
PMID:38020969
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研究论文 | 本文描述了在合成酵母染色体VIII中,通过重新定位原生着丝粒序列到染色体不同位置,研究了着丝粒功能的最小序列及其上下文依赖性 | 发现118 bp的CEN序列在异位位置不足以维持染色体稳定性,而包含约500 bp的着丝粒近端周边着丝粒区域的扩展序列则显著改善了染色体稳定性 | NA | 研究合成酵母染色体VIII中的着丝粒功能及其上下文依赖性 | 酵母染色体VIII的着丝粒序列及其功能 | 合成生物学 | NA | 基因组工程 | NA | 基因组序列 | NA |
1032 | 2024-08-07 |
Special issue: reproducibility in synthetic biology
2023, Synthetic biology (Oxford, England)
DOI:10.1093/synbio/ysad015
PMID:38022745
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
1033 | 2024-10-15 |
Artificial intelligence-driven systems engineering for next-generation plant-derived biopharmaceuticals
2023, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2023.1252166
PMID:38034587
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综述 | 本文综述了利用人工智能驱动的系统工程方法,结合机器学习和深度学习算法,优化植物系统中重组生物制药的生产 | 本文提出通过人工智能的多方法干预,克服植物系统中重组蛋白表达的障碍,显著提高产量和稳定性 | 本文未详细讨论具体的实验验证和实际应用案例 | 探讨如何利用人工智能优化植物系统中重组生物制药的生产 | 重组生物制药,包括抗原、抗体、激素、细胞因子、单链可变片段和肽 | 生物技术 | NA | 人工智能算法 | 神经网络、支持向量机、线性回归、高斯过程和回归器集成 | 蛋白质结构数据 | NA |
1034 | 2024-10-14 |
Enhancing fatty acid and omega-3 production in Schizochytrium sp. using developed safe-harboring expression system
2024-Oct-10, Journal of biological engineering
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13036-024-00447-y
PMID:39390586
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研究论文 | 开发了一种安全的转基因表达系统,用于增强Schizochytrium sp.中的脂肪酸和omega-3的生产 | 成功建立了一种稳健的同源重组系统,并确定了可靠的安全港基因整合位点,显著提高了DHA的生产 | NA | 开发和应用基因工程工具以增强脂质生产,促进工业生产 | Schizochytrium sp.中的脂肪酸和omega-3的生产 | 合成生物学 | NA | 同源重组 | NA | NA | NA |
1035 | 2024-10-14 |
Achievements and perspectives of synthetic biology in botanical insecticides
2024-Oct, Journal of cellular physiology
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/jcp.30888
PMID:36183373
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综述 | 本文综述了合成生物学在植物源杀虫剂异源生产中的最新进展、挑战和可行策略 | 探讨了通过合成生物学解决植物源杀虫剂生产中当前问题的潜力 | 许多植物源杀虫剂的生物合成途径尚未完全阐明,且这些生物合成酶在新宿主中的低效性和细胞毒性问题仍待解决 | 总结植物源杀虫剂异源生产的最新进展,分析当前挑战,并讨论可行生产策略 | 植物源杀虫剂的生物合成途径、酶工程、宿主工程和细胞毒性工程 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
1036 | 2024-10-14 |
Phylogenetic analysis and functional characterization of norcoclaurine synthase involved in benzylisoquinoline alkaloids biosynthesis in Stephania tetrandra
2024-Oct, Journal of cellular physiology
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/jcp.31065
PMID:37357496
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研究论文 | 本文对Stephania tetrandra中的norcoclaurine synthase(NCS)进行了系统发育分析和功能表征,该酶参与苯基异喹啉生物碱(BIAs)的生物合成 | 首次在Menispermaceae科植物中鉴定并功能表征了NCS基因,并将其整合到工程酵母中以生产norcoclaurine | NA | 研究NCS基因在苯基异喹啉生物碱生物合成中的作用及其系统发育关系 | Stephania tetrandra中的NCS基因及其功能 | 生物化学 | NA | 酶学分析 | NA | 基因序列 | 两个功能性StNCS基因 |
1037 | 2024-10-14 |
Transforming vaccinology
2024-Sep-19, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2024.07.021
PMID:39303685
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review | 本文回顾了过去两个世纪疫苗学领域的关键创新,并展望了未来疫苗技术的变革 | 本文介绍了逆转疫苗学、合成生物学和基于结构的疫苗设计等技术革命,以及mRNA疫苗和新型佐剂的发展对疫苗开发的影响 | NA | 探讨疫苗学领域的历史创新和未来技术变革 | 疫苗学领域的关键创新和技术进步 | NA | NA | 逆转疫苗学、合成生物学、基于结构的疫苗设计 | NA | NA | NA |
1038 | 2024-10-14 |
Module-Based Polyketide Synthase Engineering for de Novo Polyketide Biosynthesis
2023-11-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00282
PMID:37871264
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研究论文 | 本文探讨了基于模块的聚酮合酶工程在从头合成聚酮化合物中的应用 | 提出了新的模块边界设计原则,并利用最新的结构建模和合成生物学工具加速聚酮合酶工程 | 目前仍处于研究初期,基于现有工程努力的设计原则的普遍性尚不明确 | 探索聚酮合酶工程的新方法,以提高从头合成聚酮化合物的效率 | 聚酮合酶的模块边界和功能 | 合成生物学 | NA | 结构建模和合成生物学 | NA | NA | NA |
1039 | 2024-10-14 |
Adapting enzymes to improve their functionality in plants: why and how
2023-10-31, Biochemical Society transactions
IF:3.8Q2
DOI:10.1042/BST20230532
PMID:37787016
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综述 | 本文综述了通过合成生物学方法改进植物中酶功能的策略,特别是连续定向进化系统在提高酶与植物细胞环境兼容性方面的应用 | 本文介绍了连续定向进化系统在改进植物中非天然酶功能方面的应用,特别是酵母OrthoRep系统的适用性 | 本文主要集中在理论和方法的综述,缺乏具体的实验数据和案例分析 | 探讨如何通过合成生物学方法改进植物中酶的功能,以提高作物产量和品质 | 植物中的酶功能及其在作物改良中的应用 | 合成生物学 | NA | 连续定向进化 | NA | NA | NA |
1040 | 2024-10-14 |
A Floating Mold Technique for the Programmed Assembly of Protocells into Protocellular Materials Capable of Non-Equilibrium Biochemical Sensing
2021-Jun, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202100340
PMID:33960013
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研究论文 | 本文介绍了一种新的浮动模具技术,用于制造毫米至厘米尺寸的任意形状的细胞材料,并展示了其在外部环境刺激下的非平衡时空传感行为 | 该技术克服了当前原组织工程中的大部分挑战,能够生成具有非平衡时空传感行为的二维周期性细胞材料阵列 | NA | 开发一种新的技术,用于制造具有自组装和非平衡生物化学传感能力的宏观细胞材料 | 浮动模具技术、细胞材料、非平衡时空传感行为 | 合成生物学 | NA | 浮动模具技术 | NA | NA | NA |