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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1041 | 2026-03-02 |
Achievements and perspectives of synthetic biology in botanical insecticides
2024-10, Journal of cellular physiology
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/jcp.30888
PMID:36183373
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综述 | 本文综述了合成生物学在植物源杀虫剂异源生产中的最新进展、当前挑战及可行策略 | 系统总结了植物源杀虫剂异源生产面临的挑战,并聚焦于阐明生物合成途径、酶工程、宿主工程和细胞毒性工程等策略进行深入讨论 | 许多植物源杀虫剂的生物合成途径尚未完全阐明,且其细胞毒性和在新宿主中酶的低效率仍是异源生产的挑战 | 探讨合成生物学在解决植物源杀虫剂生产问题中的应用前景 | 植物源杀虫剂 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、酶工程、宿主工程 | NA | NA | NA | NA | 新宿主(具体未指定) | 生物合成途径 | 农业 |
| 1042 | 2026-03-02 |
Phylogenetic analysis and functional characterization of norcoclaurine synthase involved in benzylisoquinoline alkaloids biosynthesis in Stephania tetrandra
2024-10, Journal of cellular physiology
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/jcp.31065
PMID:37357496
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研究论文 | 本研究从防己科植物粉防己中分离并功能表征了去甲乌药碱合酶(NCS),揭示了其在苄基异喹啉生物碱生物合成中的作用,并成功在工程酵母中实现去甲乌药碱的生产 | 首次在防己科植物中鉴定并功能表征NCS基因,填补了该科植物中NCS基因研究的空白,并通过系统发育分析揭示了NCS的进化关系和结构功能关联 | 研究主要基于体外酶活性和酵母工程,未在植物体内验证NCS功能,且样本来源仅限于粉防己,可能缺乏对其他防己科植物的普适性分析 | 探究粉防己中NCS基因在苄基异喹啉生物碱生物合成中的功能,并利用合成生物学方法在酵母中生产去甲乌药碱 | 粉防己(Stephania tetrandra)中的去甲乌药碱合酶(NCS)基因 | 合成生物学 | NA | 系统发育分析、体外酶活性测定、酵母工程 | NA | 基因序列、酶活性数据 | 从粉防己中分离的NCS基因 | 酵母工程 | 酵母 | 将功能表征的StNCS基因整合到工程酵母中,构建去甲乌药碱生物合成途径 | 医药 |
| 1043 | 2026-03-01 |
"Lys-Leu" Motif Empowers Expedient OaAEP1-Catalyzed Generation of N‑Terminal Cysteine Recombinant Proteins for Bioconjugation and Semisynthesis
2026-Feb-23, JACS Au
IF:8.5Q1
DOI:10.1021/jacsau.5c01395
PMID:41755832
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研究论文 | 本研究报道了一种基于“Lys-Leu”基序辅助的AEP1酶催化切割方法,用于高效生成N端半胱氨酸重组蛋白,以用于生物偶联和半合成应用 | 该方法显著提高了P2'位所有20种天然氨基酸的切割效率,兼容多种底物(包括难处理的包涵体蛋白),并实现了一步法原位生成与功能化 | NA | 开发一种高效、通用的位点特异性蛋白质修饰平台 | N端半胱氨酸重组蛋白 | 合成生物学与化学生物学 | NA | AEP1酶催化切割 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学(活细胞成像、治疗开发) |
| 1044 | 2026-03-01 |
Exploring structural, functional, evolutionary, and genetic characteristics of sugar transporters in maize and their roles in abiotic stress tolerance
2026, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0342990
PMID:41746965
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研究论文 | 本文通过生物信息学分析鉴定了玉米中的60个糖转运蛋白,并研究了它们在非生物胁迫耐受性中的潜在作用 | 首次在玉米中系统鉴定和表征糖转运蛋白家族,并通过干湿实验结合的方法揭示了它们在非生物胁迫响应中的调控机制 | 研究主要基于生物信息学预测和初步实验验证,需要进一步的体内功能验证来确认转运蛋白的具体作用机制 | 探索玉米糖转运蛋白的结构、功能和进化特征,及其在非生物胁迫耐受性中的作用 | 玉米糖转运蛋白家族 | 生物信息学 | NA | RNA-Seq, qRT-PCR, 系统发育分析, 共表达分析, 分子对接 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 蛋白质序列数据 | 60个玉米糖转运蛋白 | NA | 玉米 | NA | 农业 |
| 1045 | 2026-03-01 |
Vesicle constriction by rings of Janus nanoparticles and aggregates of curved proteins
2019-Aug-23, Nanotechnology
IF:2.9Q2
DOI:10.1088/1361-6528/ab1ed5
PMID:31048566
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研究论文 | 本文研究了Janus纳米颗粒环和弯曲蛋白质聚集体对囊泡的机械收缩作用,通过模拟和实验揭示了膜收缩的机制 | 首次报道了Janus纳米颗粒环和弯曲蛋白质聚集体作为合成纳米结构模拟收缩蛋白和支架蛋白,诱导囊泡自发收缩,并揭示了高度弯曲F-BAR结构域在细胞分裂中的重要作用 | 研究基于模拟和理论模型,可能未完全覆盖实际生物系统中的复杂动态因素,且实验验证部分未在摘要中详细说明 | 探究膜收缩和分裂的机制,设计膜收缩纳米结构以应用于合成生物学 | 囊泡、Janus纳米颗粒环、弯曲蛋白质聚集体(如DNA折纸支架) | 合成生物学 | NA | Monte Carlo模拟、模拟退火、弹性膜模型 | NA | 模拟数据 | NA | DNA折纸 | NA | NA | 合成生物学 |
| 1046 | 2026-02-28 |
Preparation strategies and biomedical applications of DNA hydrogels
2026-Feb-25, Chemical science
IF:7.6Q1
DOI:10.1039/d5sc08190d
PMID:41657654
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综述 | 本文总结了DNA水凝胶的制备策略及其在细胞培养、药物递送和组织工程等生物医学领域的应用进展 | 系统性地将DNA纳米技术与合成生物学相结合,利用DNA作为结构框架或交联剂构建具有生物组织相似性的三维网络结构,并突出其高生物相容性、可编程响应性和特异性识别功能 | 讨论了DNA水凝胶发展当前面临的挑战,但未在摘要中具体说明 | 总结DNA水凝胶的制备策略,分析其应用优势,并展望未来研究方向 | DNA水凝胶 | 材料科学 | NA | DNA纳米技术、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 生物医学 |
| 1047 | 2026-02-28 |
Synthetic gene circuits that selectively target RAS-driven cancers
2026-Feb-24, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.104320
PMID:41733988
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研究论文 | 本文提出了一种合成基因电路,通过整合多个RAS传感器来选择性靶向RAS驱动的癌症细胞,表达治疗性蛋白 | 结合多个RAS传感器以提高癌症选择性,实现前所未有的突变RAS细胞特异性输出蛋白表达 | NA | 开发针对RAS驱动癌症的新型合成基因电路治疗策略 | RAS驱动的癌症细胞 | 合成生物学 | 癌症 | 合成基因电路设计 | NA | NA | NA | NA | 哺乳动物细胞 | 整合多个RAS传感器的合成基因电路,用于选择性表达治疗性蛋白 | 医学 |
| 1048 | 2026-02-28 |
Research progress and applications of reverse genetics systems for infectious bronchitis virus
2026-Feb, Poultry science
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.psj.2025.106312
PMID:41447763
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综述 | 本文系统回顾了传染性支气管炎病毒反向遗传学系统的发展、应用与挑战,并展望了未来整合CRISPR/Cas9等技术的方向 | 全面梳理了多种反向遗传学平台(如痘病毒支持系统、体外连接转录等)在IBV研究中的应用,并探讨了其作为多病原疫苗载体的潜力 | 存在技术障碍、安全考虑和知识缺口,具体限制未在摘要中详细说明 | 研究传染性支气管炎病毒的反向遗传学技术,以推动病原研究、疫苗设计和抗病毒靶点发现 | 传染性支气管炎病毒 | NA | NA | 反向遗传学,包括痘病毒支持系统、体外连接转录、靶向RNA重组、细菌人工染色体克隆、转化相关重组、环状聚合酶延伸反应 | NA | NA | NA | CRISPR/Cas9 | NA | NA | 医学(疫苗开发、抗病毒研究) |
| 1049 | 2026-02-28 |
Microbiome-driven resistance in cervical cancer therapy: from mechanistic dissection to clinical translation
2025-Dec-29, Expert reviews in molecular medicine
IF:4.5Q2
DOI:10.1017/erm.2025.10029
PMID:41457383
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综述 | 本文综述了微生物组在宫颈癌治疗耐药性中的作用,从机制解析到临床转化的最新进展 | 系统性地将阴道微生物群失调与宫颈癌治疗耐药性联系起来,并提出了基于微生物组的干预策略,包括合成生物学驱动的精准微生物组疗法 | NA | 探讨微生物组如何驱动宫颈癌治疗耐药性,并评估基于微生物组的干预策略的临床转化潜力 | 宫颈癌患者及其相关的阴道微生物组 | NA | 宫颈癌 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 | 工程细菌 | NA | 医学 |
| 1050 | 2026-02-28 |
STAGE: A compact and versatile TnpB-based genome editing toolkit for Streptomyces
2025-Sep-02, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2509146122
PMID:40857323
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研究论文 | 本研究开发了一种基于TnpB的紧凑型基因组编辑工具包STAGE,用于链霉菌的高效、精确基因编辑 | 首次在链霉菌中建立了基于ISDra2 TnpB的基因组编辑平台,其效应蛋白大小仅为Cas9的三分之一,并开发了单碱基编辑和多重编辑系统,通过AI辅助蛋白质工程将编辑效率提升至近100% | NA | 开发适用于链霉菌的高效、精确基因组编辑工具 | 链霉菌(Streptomyces) | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas系统、TnpB辅助基因组编辑、AI辅助蛋白质工程 | NA | NA | 两种工业重要链霉菌菌株 | CRISPR-Cas, TnpB | 链霉菌(Streptomyces) | 基因组编辑平台、单碱基编辑系统(C·G-to-T·A)、多重编辑系统 | 工业生物技术 |
| 1051 | 2026-02-28 |
Potential and Optimization of Mammalian Splice Riboswitches for the Regulation of Exon Skipping-Dependent Gene Expression and Isoform Switching within the ALOX5 Gene
2025-03-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00731
PMID:40011207
|
研究论文 | 本研究探讨了合成核糖开关在哺乳动物细胞中通过控制选择性剪接来调控基因表达的潜力,特别是在ALOX5基因中的应用 | 提出了通过基因特异性内含子和外显子序列的上下文适应来优化核糖开关功能,并开发了能够切换5-LO野生型与缺失外显子13的异构体表达的新型核糖开关剪接概念 | 合成核糖开关在真核系统中控制基因表达的功能通常限于特定基因或细胞类型 | 研究合成核糖开关在调控哺乳动物细胞中基因表达和异构体切换的潜力与优化方法 | 人工花生四烯酸5-脂氧合酶基因(ALOX5)在HEK293细胞中的表达调控 | 合成生物学 | NA | 选择性剪接调控、核糖开关技术 | NA | 基因表达数据 | 使用HEK293细胞系 | 合成核糖开关、基因编辑 | 哺乳动物细胞(HEK293) | 四环素核糖开关控制的盒式外显子系统,用于调控选择性剪接和异构体切换 | 医学、合成生物学 |
| 1052 | 2026-02-28 |
Synthetic Lipid Biology
2025-Feb-26, Chemical reviews
IF:51.4Q1
DOI:10.1021/acs.chemrev.4c00761
PMID:39805091
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综述 | 本文正式提出“合成脂质生物学”这一新兴领域,整合化学、生物学、物理学和工程学方法,以合成和操纵脂质及生物膜来理解其复杂性质与功能 | 首次将跨学科研究系统化为“合成脂质生物学”框架,强调通过构建与分析脂质及膜系统来深化理解,类比合成生物学的核心理念 | NA | 通过合成、编辑和检测脂质及生物膜,揭示其性质、行为和功能,以应对脂质生物学复杂性 | 脂质分子、生物膜及其与蛋白质的相互作用 | 合成生物学 | NA | 化学合成、化学酶法合成、光遗传学、蛋白质工程、生物正交化学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1053 | 2026-02-27 |
InsiliCoil: An Integrated Software Suite for Coiled Coil Design, Prediction, and Therapeutic Engineering
2026-Feb-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00678
PMID:41370672
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研究论文 | 本文介绍了一个名为InsiliCoil的集成软件套件,用于卷曲螺旋的设计、预测和治疗性工程 | 将预测建模、选择性肽抑制剂发现和正交相互作用组设计统一到一个单一的可访问框架中,提供比基于结构的方法快几个数量级的通量 | NA | 开发一个用于控制螺旋介导的蛋白质-蛋白质相互作用的综合平台,以加速治疗发现和可编程生物系统的理性工程 | 卷曲螺旋(CCs)作为合成生物学中的模块化、可编程构建块以及治疗靶点 | 合成生物学 | NA | 预测建模、高通量筛选、计算设计 | NA | 蛋白质序列和结构数据 | NA | InsiliCoil软件套件 | NA | 正交卷曲螺旋网络,用于合成生物电路和生物材料 | 医学, 工业生物技术 |
| 1054 | 2026-02-27 |
Slowpoke: An Automated Golden Gate Cloning Workflow for Opentrons OT-2 and Flex
2026-Feb-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00629
PMID:41642882
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研究论文 | 本文介绍了一个名为Slowpoke的自动化Golden Gate克隆工作流程,专为Opentrons OT-2和Flex液体处理平台设计 | 开发了一个用户友好、灵活且开源的自动化Golden Gate克隆工作流程,并配有免费的图形用户界面,简化了协议生成过程 | 工作流程仍需用户干预菌落挑取和平板转移步骤 | 开发一个标准化、高通量且无错误的DNA组装自动化解决方案 | Golden Gate克隆工作流程的自动化 | 合成生物学 | NA | Golden Gate克隆 | NA | NA | 使用MoClo酵母工具包和SubtiToolKit进行验证,涉及多个组装组合 | Golden Gate Assembly | 酵母, 枯草芽孢杆菌 | NA | 工业生物技术 |
| 1055 | 2026-02-27 |
Advances and Future Perspectives of Synechocystis sp. as a Microbial Cell Factory for Biomanufacturing
2025-Nov, Biotechnology journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/biot.70162
PMID:41311002
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综述 | 本文综述了集胞藻作为微生物细胞工厂在生物制造中的最新进展、面临的挑战及未来研究方向 | 整合了生物信息学概述与合成生物学应用的最新进展,并提出了规模化、工业化及组学策略整合的未来方向 | NA | 推动蓝藻在工业生物技术中的应用,促进可持续、低碳、高效的生物生产系统发展 | 集胞藻 | 工业生物技术 | NA | 组学策略 | NA | NA | NA | 合成生物学设计 | 集胞藻 | NA | 工业生物技术 |
| 1056 | 2026-02-27 |
Computation-driven redesign of an NRPS-like carboxylic acid reductase improves activity and selectivity
2024-11-29, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adp6775
PMID:39612335
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研究论文 | 本文通过计算驱动重新设计非核糖体肽合成酶样羧酸还原酶的腺苷化结构域,以提高其催化活性和选择性 | 采用基于近似机制的几何标准和Rosetta能量评分,对CARs的“守门员”腺苷化结构域进行重新设计,实现了高达101倍的催化效率提升和86倍的底物特异性增强 | NA | 提高非核糖体肽合成酶样羧酸还原酶的催化效率和底物选择性 | 羧酸还原酶(CARs)的腺苷化结构域 | 合成生物学 | NA | 计算重新设计、Rosetta能量评分 | NA | NA | NA | Rosetta | NA | NA | 工业生物技术 |
| 1057 | 2026-02-27 |
Data-Driven Design of Triple-Targeted Protein Nanoprobes for Multiplexed Imaging of Cancer Lymphatic Metastasis
2024-09, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202405877
PMID:38889909
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研究论文 | 本文介绍了一种通过数据驱动设计和合成生物学组装策略开发的三靶向蛋白质纳米探针,用于癌症淋巴转移的多重成像 | 利用机器学习生物信息学分析结合患者组织检查,识别出CXCR4、TfR1和VEGFR3三个靶点组合,并设计出能特异性结合所有三个靶点的铁蛋白纳米笼探针,实现了对高度异质性淋巴转移的多重成像 | NA | 开发用于癌症淋巴转移成像的靶向纳米探针 | 癌症淋巴转移的异质性靶点及成像 | 数字病理学 | 胃癌 | 机器学习生物信息学分析、合成生物学组装 | NA | 组织样本数据、成像数据 | 19个新鲜切除的人类胃癌标本及患者淋巴组织 | 合成生物学方法 | NA | 基于基因工程铁蛋白亚基自组装的纳米笼探针 | 医学 |
| 1058 | 2026-02-26 |
Lactic Acid Bacteria Bacteriocins: Classification, Biosynthesis, Health Benefits, and Strategies for Enhanced Efficacy
2026-Feb-25, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c14047
PMID:41700423
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综述 | 本文综述了乳酸菌细菌素的分类、生物合成、健康益处及增强效能的策略 | 提供了更新的细菌素分类(I-III类),并分析了产量影响因素和增强效能的策略,如代谢工程和合成生物学 | 产量优化和临床转化方面仍存在挑战 | 综述乳酸菌细菌素的研究进展,以指导其治疗开发和规模化生产 | 乳酸菌细菌素 | NA | 感染和癌症 | NA | NA | NA | NA | 代谢工程, 合成生物学 | 乳酸菌 | NA | 食品, 生物医学 |
| 1059 | 2026-02-26 |
Precision Fermentation Processes for Producing Novel Foods and Its Sustainable Applications
2026-Feb, Journal of basic microbiology
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/jobm.70160
PMID:41735245
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综述 | 本文对精准发酵技术在可持续食品生产中的应用进行了系统综述,整合了微生物菌株设计、生物工艺工程、技术经济可行性、环境绩效和监管准备度等多个方面 | 提供了一个整合微生物菌株设计、生物工艺工程、技术经济可行性、环境绩效和监管准备度的统一框架,弥补了以往仅关注产品或特定生物的综述的不足 | 面临高资本和能源成本、放大效率低、下游处理复杂、消费者接受度以及监管不确定性等挑战 | 评估精准发酵技术在可持续食品生产中的应用、技术经济可行性和环境影响 | 精准发酵过程及其在食品生产中的应用 | NA | NA | 精准发酵、代谢途径工程 | NA | 文献数据 | 37项符合纳入标准的研究(包括实验室研究、工业案例研究、技术经济分析和生命周期评估) | 合成生物学 | 微生物宿主 | 代谢途径工程 | 食品, 工业生物技术 |
| 1060 | 2026-02-26 |
Structure and encapsulation of carbonic anhydrase within the α-carboxysome
2025-Nov-18, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2523723122
PMID:41223214
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研究论文 | 本研究解析了α-羧化体内部碳酸酐酶的结构及其封装机制 | 首次揭示了CsoSCA的六聚体三聚体结构,证明其封装不依赖锌离子和连接蛋白CsoS2,并阐明了其在羧化体内部连接Rubisco与外壳的桥梁作用 | 研究主要基于合成微型外壳和细菌模型,体内完整羧化体的动态组装过程仍需进一步验证 | 阐明α-羧化体中碳酸酐酶的结构特征及其在微区室内的封装机制 | 化能自养细菌Halothiobacillus neapolitanus的α-羧化体碳酸酐酶CsoSCA | 结构生物学 | NA | 分子结构解析、合成微型外壳技术 | NA | 结构数据、生化实验数据 | NA | 合成生物学技术 | Halothiobacillus neapolitanus(化能自养细菌) | 羧化体微区室封装系统(包含Rubisco和碳酸酐酶的半透性蛋白质外壳) | 合成生物学、生物技术 |