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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1061 | 2026-05-28 |
Charting the path for L-tyrosine derivatives: from engineering strategies to microbial cell factories
2026-May-27, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d5np00091b
PMID:41873744
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综述 | 系统总结了利用微生物细胞工厂生产L-酪氨酸及其衍生物的工程策略 | 聚焦酪醇、对香豆酸和左旋多巴三大关键节点,综述近五年在酶、代谢和细胞水平上的前沿工程策略 | 未深入探讨工业放大中的工艺瓶颈和成本问题 | 为加速L-酪氨酸衍生物的绿色生物制造提供战略路线图 | L-酪氨酸及其衍生物(酪醇、对香豆酸、左旋多巴) | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 大肠杆菌, 酵母 | 代谢通路 | 食品, 医药, 化工 |
| 1062 | 2026-05-28 |
Bioethics-in-Science : An Invitation
2026-May-27, Journal of bioethical inquiry
IF:1.8Q3
DOI:10.1007/s11673-025-10533-5
PMID:42201630
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研究论文 | 提出“科学中的生物伦理学”概念,探讨将生物伦理探究直接融入科学实践的方法论途径 | 重新定义伦理与科学关系,将科学实践视为内在地承载价值,并开发具体方法(如伦理笔记本、协作研讨会、概念映射)实现持续伦理反思而非外部评估 | 跨学科边界挑战与操作实践中的困难分析 | 为生物伦理探究提供超越科学边缘位置、积极参与知识生产规范维度的新路径 | 合成生物学、神经多样性研究、蛋白质组学案例 | 生物伦理学 | NA | NA | NA | 案例研究 | 三个案例(合成生物学、神经多样性、蛋白质组学) | NA | NA | NA | NA |
| 1063 | 2026-05-28 |
Synthetic biology-driven bioinspired delivery systems for RNA therapeutics in neural repair
2026-May-14, Neural regeneration research
IF:5.9Q1
DOI:10.4103/NRR.NRR-D-25-01801
PMID:42199149
|
综述 | 综述基于合成生物学的仿生递送系统在RNA神经修复治疗中的应用 | 提出了将RNA递送转化为可编程生物机器的系统工程框架,融入设计-构建-测试-学习循环和人工智能辅助工具 | 未详细说明具体实验验证结果和定量比较分析 | 探讨合成生物学在神经修复中RNA治疗递送系统的前沿应用与挑战 | 基于合成生物学的仿生递送系统、RNA疗法、神经修复 | 机器学习 | 神经系统疾病 | NA | NA | 文本 | NA | NA | NA | 生物电路、递送系统、可编程生物机器 | 医学 |
| 1064 | 2026-05-28 |
Engineering the Liquid-to-Solid Transition of Biomolecular Condensates: Molecular Mechanisms, Control Strategies, and Applications
2026-May, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.73582
PMID:42070290
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综述 | 系统综述了生物分子凝聚体液-固转变的分子机制、工程调控策略及其在合成生物学中的应用 | 首次将液-固转变作为设计原则整合到系统化学和合成生物学中 | 当前对液-固转变的时空控制仍面临挑战,需进一步探索其在实际生物系统中的可靠性 | 阐明液-固转变的分子语法及工程策略,推动其在合成生物学中的应用 | 生物分子凝聚体的液-固转变过程 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 液-固转变调控回路 | 医学,系统化学,合成生物学 |
| 1065 | 2026-05-28 |
Assetizing Diversity: Microbial Culture Collections in an Age of Biotechnology, Biodiversity, and Speculative Value Generation (1972-2022)
2026-Mar, Journal of the history of biology
IF:0.7Q2
DOI:10.1007/s10739-026-09853-y
PMID:42118395
|
综述 | 追溯1972至2022年微生物资源保藏中心的历史,探讨微生物多样性保护与生物技术价值化的演变 | 将微生物价值资产化进程与全球微生物公地圈占联系起来,分析保藏中心在生物技术产业全球化中的双重角色 | 未解决全球异地保护基础设施分布不均及微生物价值生成的不对称问题,遗漏2010年名古屋议定书后的实质性进展 | 揭示微生物资源从公共物品向资产化转变的过程及其对保护、商业和全球治理的影响 | 欧洲、美洲、亚洲的微生物培养物保藏中心及世界培养物保藏联合会 | 数字病理学 | NA | 测序技术、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 微生物 | NA | 工业生物技术、农业、环境 |
| 1066 | 2026-05-28 |
Engineering Spatial Control of Bacterial Organelles
2025-Sep-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.09.22.677801
PMID:41040230
|
研究论文 | 本文展示了一个双蛋白系统McdAB可被重新编程以实现对细菌多种细胞器的空间控制 | 首次证明McdAB系统可以重新编程以控制所有已知类型的细菌细胞器(包括类囊体、包囊体、生物分子凝聚体和膜结合细胞器)的空间组织,为合成生物学建立了新的设计原理 | 未明确说明局限性 | 研究细菌细胞器的空间组织是否可以被工程化控制 | McdAB双蛋白系统和细菌细胞器(羧酶体、包囊体、生物分子凝聚体、膜结合细胞器) | 合成生物学 | NA | 异源表达、蛋白重新编程 | NA | NA | NA | NA | 大肠杆菌 | McdAB系统用于细胞器空间定位调控 | 工业生物技术 |
| 1067 | 2026-05-28 |
A quantitative autonomous bioluminescence reporter system with a wide dynamic range for Plant Synthetic Biology
2024-01, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.14146
PMID:37882352
|
研究论文 | 提出了一种基于自发光真菌生物发光循环的定量报告系统,用于植物合成生物学中的基因表达测量 | 首次利用Neonothopanus nambi真菌全生物发光循环构建自维持报告系统,无需外源供应荧光素酶底物,并通过设置HispS基因作为转录入口点显著提高动态范围 | 未明确说明,但可能包括植物中自发光系统的长期稳定性和组织特异性表达等潜在问题 | 开发低成本、高通量的植物基因表达定量报告系统,以优化合成基因回路 | 本氏烟草(N. benthamiana)和拟南芥(推测) | 植物合成生物学 | NA | 自主生物发光报告系统 | NA | 发光和荧光数据 | 涉及多种合成基因回路,包括植物激素传感器和光遗传传感器等,具体样本数量未明确 | NA | 本氏烟草(N. benthamiana) | 自发光报告回路(NeoLuc/eGFP系统),包括激素传感器、光遗传传感器和化学/光双开关 | 农业、工业生物技术 |
| 1068 | 2026-05-28 |
Precision engineering of biological function with large-scale measurements and machine learning
2023, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0283548
PMID:36989327
|
研究论文 | 结合大规模测量和机器学习,提出了两种精确设计遗传传感器的方法:计算机模拟选择和机器学习前向工程 | 首次将计算机模拟选择与机器学习相结合,实现遗传传感器剂量响应的定量精确工程,包括多目标优化和反向剂量响应工程 | NA | 开发定量精确工程生物功能的方法,特别是遗传传感器的编程响应 | 遗传传感器及其DNA序列 | 机器学习 | NA | 大规模基因型-表型数据集分析 | 机器学习模型 | 序列数据 | 大规模基因型-表型数据集 | NA | NA | 遗传传感器(剂量响应电路) | 工业生物技术 |
| 1069 | 2026-05-27 |
Engineering quorum sensing: new directions for antimicrobial therapy
2026-May-26, Trends in microbiology
IF:14.0Q1
DOI:10.1016/j.tim.2026.05.006
PMID:42185145
|
综述 | 探讨群体感应工程在抗菌治疗中的应用,包括干扰QS信号和工程化微生物 | 将合成生物学工具与QS机制结合,推动从基础微生物学向转化生物技术的转变 | NA | 探索QS和QS干扰在工程化群体感应回路中的应用,并将其转化为治疗微生物等应用 | 病原微生物中的群体感应机制 | NA | 感染性疾病 | 群体感应干扰, 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 微生物 | 群体感应回路(如干扰QS信号、检测和消除病原体) | 医学 |
| 1070 | 2026-05-27 |
Molecular mechanisms of plant thermal response: from signal transduction and epigenetic regulation to signaling integration
2026-Mar-27, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2026.03.018
PMID:41903742
|
综述 | 综述植物对中度和急性热胁迫响应分子机制的最新进展,重点关注表观遗传调控与信号网络的整合 | 整合了光信号、昼夜节律和激素信号通路交叉调控的转录因子PIF4与HSFA1s,以及组蛋白变体H2A.Z动力学和siRNA依赖的跨代表观遗传热记忆机制 | 温度感知、HSFA1s激活动态及胁迫信号整合等根本问题尚未解决 | 揭示植物热适应机制,为气候智能型作物提供理论基础和分子育种策略 | 植物热响应信号转导与表观遗传调控 | 数字病理学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 植物 | NA | 农业 |
| 1071 | 2026-05-27 |
Mind Everywhere: A Framework for Conceptualizing Goal-Directedness in Biology and Other Domains-Part Two
2026-Feb-25, Biological theory
IF:1.9Q1
DOI:10.1007/s13752-025-00524-5
PMID:42183020
|
评论文章 | 提出一个基于心智概念的框架来概念化生物学及其他领域的目标导向性 | 从新兴领域“多元智能”出发,强调经验可检验性、新能力发现的丰产性、术语的操作化以及人类目标导向性与单细胞起源的连续性,为生物学的目的论提供新的心智化方法 | 文章未明确讨论其框架在具体实验中可能遇到的实践挑战或局限性 | 发展一种受心智概念启发的生物学目的论方法,以更好地理解系统如何工作并指导实验和应用 | 生物系统(包括进化、工程或混合系统)的目标导向性、智能、认知和意向性 | 机器学习 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学、生物工程 |
| 1072 | 2026-05-27 |
Mind Everywhere: A Framework for Conceptualizing Goal-Directedness in Biology and Other Domains-Part One
2026-Feb-01, Biological theory
IF:1.9Q1
DOI:10.1007/s13752-025-00523-6
PMID:42183019
|
研究论文 | 提出一个框架来概念化生物及其他领域中的目标导向性,强调经验可检验性、新能力的发现、术语操作化以及人类目标导向性与单细胞起源的连续性 | 从多元智能领域出发,反对生物学中对目标导向性的最小化倾向,倡导用心理概念如智能、认知和意向性来理解生物学中的目的论,并强调经验可检验性和研究工具的操作化 | 可能面临传统还原论者的反对,且框架的经验验证和实际应用仍需进一步证据 | 建立一种基于心理概念的目标导向性框架,以更好地理解生命系统中的智能和目标导向行为,推动哲学思考及生物医学和生物工程应用 | 生物系统中的目标导向性,包括形态发生、合成生物学和生物电网络等领域中细胞行为的协调 | 生物信息学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 生物医学, 生物工程 |
| 1073 | 2026-05-27 |
New frontiers and applications of cell-free systems
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2025.10.002
PMID:41581983
|
综述 | 该文章概述了无细胞系统及其在合成生物学中的应用 | 强调了无细胞系统在消除细胞膜屏障、实现高通量蛋白质合成、非规范氨基酸掺入、生物传感、药物发现和代谢工程中的创新应用 | 未明确提及局限性 | 突出无细胞系统的基础及其在生物技术和工业中的快速、适应性解决方案 | 无细胞系统及其应用案例 | 合成生物学 | NA | 无细胞系统 | NA | NA | NA | NA | 原核生物、真核生物 | NA | 生物技术, 生物医学, 环境可持续性 |
| 1074 | 2026-05-27 |
Cell-free systems for low-cost diagnostics
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2025.08.005
PMID:41581986
|
综述 | 全面概述基于无细胞系统的低成本诊断技术的原理、设计方法和突破 | 系统性地总结了无细胞诊断平台在资源贫乏环境中的应用,包括大肠杆菌裂解液、小麦胚芽提取物和PURE系统,并融合合成生物学基因回路、CRISPR-Cas工具和RNA适体以提高诊断灵敏度和特异性 | 试剂稳定性、可扩展性和监管问题仍是主要挑战 | 阐明无细胞系统在低成本诊断中的潜力,推动即时诊断和全球健康改善 | 基于无细胞表达的诊断平台 | 数字病理学 | 未提及 | 无细胞表达,CRISPR-Cas,RNA适体 | 未提及 | 未提及 | 未提及 | CRISPR-Cas | 大肠杆菌,小麦,纯化系统 | 基因回路,生物传感器 | 医学 |
| 1075 | 2026-05-27 |
Protocol for preparation of cell-free system
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2025.09.002
PMID:41581988
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研究论文 | 提供无细胞蛋白合成系统的制备方案,包括细胞提取物制备、反应优化及蛋白质表征方法 | 详细阐述了从宿主菌选择、机械裂解到能量离子平衡优化的完整流程,并整合了常见瓶颈的解决方案,为无细胞系统在合成生物学和诊断领域的应用提供了可复现的标准化方法 | 未涉及大规模生产中的成本控制问题,且对复杂蛋白质(如膜蛋白)的合成效率优化讨论有限 | 建立高效制备无细胞蛋白合成系统的标准化协议,并展望其与机器学习结合的未来应用 | 无细胞蛋白合成系统(细胞提取物、反应体系优化及蛋白质功能分析) | 合成生物学 | NA | 无细胞蛋白合成 | NA | 实验数据(蛋白质表达与功能分析) | NA | NA | 大肠杆菌 | 无细胞表达反应体系(代谢通路) | 合成生物学,诊断,生物制造,食品,医疗 |
| 1076 | 2026-05-27 |
Cell free systems for biodesign
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2025.08.010
PMID:41581989
|
综述 | 综述无细胞系统在合成生物学中的应用和进展 | 强调了无细胞系统在快速原型构建、与人工智能和微流控技术集成以及实现去中心化、可编程生物技术方面的范式转变 | 仍面临试剂成本高、批次差异大和可扩展性有限等挑战 | 系统阐述无细胞系统在合成生物学中的变革性作用及其未来发展方向 | 无细胞系统技术及其应用场景 | 合成生物学 | NA | 无细胞系统 | NA | NA | NA | 无细胞系统, PURE系统 | NA | 基因回路, 代谢途径, 生物传感器 | 医学, 环境, 工业生物技术 |
| 1077 | 2026-05-27 |
Approaches to deorphanize secretome: Classical, computational, and next generation strategies to reveal ligand-receptor networks
2026, EXO : beyond the cell
DOI:10.70401/EXO.2026.0008
PMID:42181609
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综述 | 综述当前用于解析分泌蛋白配体-受体网络的经典、计算和下一代策略 | 系统总结并比较了生化、遗传筛选和AI驱动计算三种去孤儿化策略的优势与局限,并提出了未来发展方向 | 未详细讨论每种技术的具体实施细节和实验验证案例 | 推动分泌蛋白去孤儿化从经典方法向可扩展、上下文感知框架的转变,以解码器官间通信 | 分泌蛋白及其未知受体 | 机器学习 | NA | 亲和纯化-质谱、交联受体捕获、RNA干扰、CRISPR、AI蛋白结构建模 | AI蛋白结构模型 | 蛋白质组学数据、空间转录组数据 | NA | CRISPR | NA | NA | 医学 |
| 1078 | 2026-05-27 |
Suppression of amber stop codons impairs pathogenicity in Salmonella
2025-02, FEBS letters
IF:3.0Q3
DOI:10.1002/1873-3468.15075
PMID:39666825
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研究论文 | 研究表明抑制琥珀终止密码子会减弱沙门氏菌的致病性 | 首次揭示终止密码子抑制对细菌致病性的影响具有选择性,仅琥珀密码子抑制影响沙门氏菌毒力 | 未详细阐明琥珀抑制如何调控HilD活性的具体分子机制 | 探究终止密码子抑制对细菌致病性的影响及其机制 | 沙门氏菌的毒力基因表达及巨噬细胞感染过程 | 微生物学 | 沙门氏菌感染 | NA | NA | NA | NA | NA | 沙门氏菌 | NA | 医学 |
| 1079 | 2026-05-27 |
Structural prediction of potent non-coding RNAs
2025, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2025.05.002
PMID:40543912
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综述 | 探讨非编码RNA的结构预测及其在生物学和医学中的重要性 | 融合计算方法和实验技术,提升RNA结构预测准确度,并探讨多组学数据整合与伦理考量 | 复杂RNA结构建模和RNA折叠动态特性理解仍存在挑战 | 提高非编码RNA结构预测能力,推动其在诊断和治疗中的应用 | 非编码RNA,包括microRNA、siRNA和长链非编码RNA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学, 药物发现, 生物标志物, 合成生物学 |
| 1080 | 2026-05-27 |
The effect of pseudoknot base pairing on cotranscriptional structural switching of the fluoride riboswitch
2024-May-08, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae231
PMID:38567721
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研究论文 | 本研究通过实验和模拟揭示假结碱基配对对氟化物核糖开关共转录结构转换的影响 | 首次系统阐明单一摆动碱基对在氟化物核糖开关功能中的关键作用,并利用全原子分子动力学模拟可视化结构转换过程 | 未具体说明其他离子或环境条件对核糖开关功能的影响,且仅限于两种温度变体 | 探究RNA序列变化如何影响共转录折叠过程中的动态构象变化 | 中温性和嗜热性氟化物核糖开关变体 | 机器学习 | NA | 体外转录, 细胞基因表达分析, 全原子分子动力学模拟 | NA | DNA序列, RNA结构数据, 实验数据 | 多种中温性和嗜热性氟化物核糖开关变体, 具体数量未提供 | NA | 大肠杆菌, 水生栖热菌 | 氟化物核糖开关(含假结适体域和下游终止子表达平台) | 医学, 工业生物技术 |