本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['synthetic biology']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价9.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1061 | 2026-02-25 |
Toehold-VISTA: A machine learning approach to decipher programmable RNA sensor-target interactions
2025-Aug-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.08.12.669990
PMID:40832290
|
研究论文 | 本文提出了一种名为Toehold-VISTA的机器学习框架,用于快速设计高性能RNA传感器,并成功应用于针对SARS-CoV-2 RNA的传感器设计 | 结合生物物理建模与机器学习(PLS-DA框架),通过高通量实验数据训练预测模型,实现了对RNA传感器性能关键决定因素的捕捉与优化设计 | NA | 加速RNA传感器的设计与工程化,解决传统设计方法耗时长的挑战 | RNA传感器(以toehold switches为模型)与靶标RNA(如SARS-CoV-2 RNA)的相互作用 | 机器学习 | NA | 高通量实验测量、序列-结构特征提取、生物物理建模 | PLS-DA(偏最小二乘判别分析) | RNA序列与结构数据 | NA | NA | NA | RNA传感器(toehold switches) | 生物技术、诊断应用 |
| 1062 | 2026-02-24 |
Construction and analysis of a cell factory for terpenoid biosynthesis in Pichia pastoris via metabolic engineering and metabolomics
2026-Mar, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2025.08.015
PMID:41725898
|
研究论文 | 本研究通过代谢工程和代谢组学方法,在毕赤酵母中构建并分析了一个用于萜类化合物生物合成的通用细胞工厂 | 开发了一种“即插即用”的细胞工厂,通过增强MVA途径表达和减少分支途径分流策略,实现了多种萜类化合物的高效合成,并利用系统生物学分析揭示了关键蛋白拷贝数增加对精氨酸等代谢途径的影响 | 菌株的鲁棒性和紧密调控的代谢网络限制了理性代谢工程改造的潜力 | 构建高效的微生物细胞工厂以实现萜类化合物的大规模生产 | 毕赤酵母作为宿主细胞,用于生产β-榄香烯、β-法尼烯、(+)-瓦伦烯、(-)-α-红没药醇等萜类化合物 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、代谢组学、系统生物学分析 | NA | 代谢物数据 | 不同工程菌株 | 代谢工程 | 毕赤酵母 | 增强MVA途径表达和减少分支途径分流的通用萜类化合物生物合成细胞工厂 | 医药、保健品、香料 |
| 1063 | 2026-02-24 |
Harnessing endophytes and Multi-Omics for sustainable Colchicine biosynthesis
2026-Feb-18, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-026-04790-8
PMID:41706338
|
综述 | 本文综述了利用内生菌和多组学技术促进濒危药用植物Gloriosa superba可持续生产秋水仙碱的系统性策略 | 提出将内生菌生物学与多组学技术、合成生物学整合的系统级合成框架,将秋水仙碱生物合成重新定义为植物-微生物协同代谢网络 | NA | 开发可持续、可扩展的秋水仙碱生产方法,同时支持Gloriosa superba的保护 | Gloriosa superba(植物)、其相关的内生真菌和细菌 | 合成生物学 | 痛风、关节炎、癌症、炎症性疾病 | 多组学分析(转录组学、蛋白质组学、代谢组学)、CRISPR基因组编辑 | NA | NA | NA | CRISPR | 异源微生物宿主 | 秋水仙碱合成途径重建 | 医药 |
| 1064 | 2026-02-24 |
T Cell Receptor Co-Stimulation Through Magnetogenetic Tools: A Platform for Wireless Rewiring of Cellular Signaling
2026-Feb-17, ACS omega
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsomega.5c10000
PMID:41726657
|
研究论文 | 本文介绍了一种用于T细胞受体共刺激的磁遗传学平台,利用磁场实现T细胞的无创激活 | 开发了一种无线、磁控的磁遗传学工具,作为TCR信号的可调共刺激器,结合抗原刺激增强T细胞激活 | NA | 探索合成生物学策略以控制细胞功能,用于治疗应用,特别是免疫细胞行为的精确调控 | HEK293细胞、Jurkat细胞和原代人T细胞 | 合成生物学 | NA | 钙成像、qPCR、蛋白质组学分析 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | HEK293, Jurkat, 原代人T细胞 | 磁遗传学平台,涉及工程化TRPV1、TRPV4和电磁感知基因(EPG)构建体 | 医学 |
| 1065 | 2026-02-24 |
Genome Position Does Not Impact Transgene Expression Efficiency in the Ancient Red Alga Cyanidioschyzon merolae
2026-Jan-31, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.31.703004
PMID:41659391
|
研究论文 | 本研究在嗜热嗜酸红藻Cyanidioschyzon merolae中建立了高通量核基因组工程框架,并验证了基因组位置对转基因表达效率无显著影响 | 首次通过实验验证了C. merolae中40个基因间位点作为中性整合位点,并建立了机器人辅助的高通量转化方法 | 研究仅针对C. merolae这一特定藻类物种,结论在其他生物中的普适性尚未验证 | 系统研究基因组位置对转基因表达的影响,建立合成生物学底盘生物的基因组工程平台 | 嗜热嗜酸红藻Cyanidioschyzon merolae | 合成生物学 | NA | 生物信息学基因组分析、液体处理机器人技术、异源蛋白和代谢产物检测 | NA | 基因组数据、蛋白质表达数据、代谢产物数据 | 40个基因间位点(覆盖16条染色体),验证了38个位点 | 同源重组 | Cyanidioschyzon merolae(嗜热嗜酸红藻) | 异源异戊二烯合酶表达系统 | 工业生物技术 |
| 1066 | 2026-02-24 |
Synthetic transcription factors establish the function of nine amino acid transactivation domains of Komagataella phaffii Mxr1
2025-03, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2025.108211
PMID:39855340
|
研究论文 | 本研究通过构建合成转录因子,系统表征了Komagataella phaffii中Mxr1转录因子的九个氨基酸反式激活结构域(9aaTADs)的功能与机制 | 首次在K. phaffii锌指转录因子中全面鉴定21个推测的9aaTADs,发现其中10个具有功能,并揭示其通过Gcn5介导的组蛋白乙酰化机制激活转录 | 研究主要基于Δmxr1突变株的体外功能验证,体内生理环境下的调控网络及与其他转录因子的相互作用尚未完全阐明 | 探究K. phaffii中Mxr1转录因子的9aaTADs结构域的功能特性与分子机制 | Komagataella phaffii(巴斯德毕赤酵母)的Mxr1转录因子及其9aaTADs结构域 | 合成生物学 | NA | 合成转录因子构建、基因敲除株功能互补、靶基因转录激活分析 | NA | 分子生物学实验数据 | 21个推测的9aaTADs结构域(包括TAD A-V) | 合成生物学设计(合成转录因子构建) | Komagataella phaffii(巴斯德毕赤酵母) | 由Mxr1ZF DNA结合域与串联9aaTADs组成的合成转录因子系统 | 工业生物技术 |
| 1067 | 2026-02-23 |
Exosome precision engineering: A comprehensive method for targeted gene and drug delivery
2026-Apr, Pathology, research and practice
DOI:10.1016/j.prp.2026.156369
PMID:41619536
|
综述 | 本文综述了外泌体精准工程作为靶向基因和药物递送载体的最新方法、进展与挑战 | 整合了合成生物学与外泌体工程的最新策略,包括表面靶向修饰、先进装载技术(如远程装载、刺激响应系统)以及用于递送CRISPR/Cas9的基因工程方法 | 面临大规模生产、免疫安全性以及监管审批等挑战 | 探讨工程化外泌体作为多功能平台在精准医疗和疾病治疗中的应用潜力 | 外泌体(作为药物和基因递送载体) | 合成生物学 | 癌症 | CRISPR/Cas9,远程装载,刺激响应系统 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 哺乳动物细胞 | 生物传感器(通过表面配体、抗体或肽实现靶向),刺激响应递送系统 | 医学 |
| 1068 | 2026-02-23 |
Bio-Oil from Phototrophic Microorganisms: Innovative Technologies and Strategies
2026-Jan-26, Biotech (Basel (Switzerland))
DOI:10.3390/biotech15010011
PMID:41718349
|
综述 | 本文综述了利用光养微生物生产生物油的技术与策略,重点讨论了热化学转化技术和生物优化方法的进展 | 强调将先进热化学转化技术与定向生物优化策略有效结合,是实现光养微生物规模化生产生物油的最有前景途径 | NA | 探讨利用光养微生物生产液体生物燃料的可行技术与策略,以支持低碳能源系统转型 | 光养微生物(特别是微藻)及其生物油生产 | NA | NA | 水热液化、快速热解、催化提质(加氢脱氧等)、菌株优化、胁迫诱导、共培养、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 光养微生物(微藻) | NA | 能源 |
| 1069 | 2026-02-22 |
Design and Modeling of Biosensor-Driven Encapsulation Systems for Systemic Delivery of Bacterial Cancer Therapy
2026-Feb-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00598
PMID:41528100
|
研究论文 | 本文设计并建模了用于细菌癌症疗法系统递送的生物传感器驱动的封装系统 | 开发了基于群体感应或酸感应的生物传感器驱动封装系统,可自主控制细菌荚膜多糖表达以改善药代动力学特性,并首次建立了双状态药代动力学模型来模拟活体治疗剂的动态行为 | 未在临床环境中验证,模型基于假设参数,需要进一步实验验证 | 改进细菌癌症疗法的系统递送安全性和有效性 | 工程化大肠杆菌Nissle 1917 | 合成生物学 | 癌症 | 基因工程、药代动力学建模 | 双状态药代动力学模型 | 实验数据、模拟数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌 | 生物传感器驱动的基因回路,包含群体感应和酸感应模块,用于自主控制荚膜多糖表达 | 医学 |
| 1070 | 2026-02-22 |
Conformation-programmed DNA computing
2026-Feb-20, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aec8383
PMID:41706864
|
研究论文 | 本文提出了一种基于构象编程的DNA计算框架,通过整合序列可编程性与构象动力学实现多级信号处理 | 首次将序列可编程性与构象动态信号整合于DNA计算中,通过多聚胸腺嘧啶环实现构象信号编码与放大,并构建了可区分7-15个核苷酸环长的构象感知DNA神经网络 | 未明确说明系统在复杂生物环境中的稳定性与长期运行效果 | 开发能够整合序列与构象维度的自适应DNA计算系统 | DNA分子网络与构象信号处理机制 | 合成生物学 | NA | DNA计算、构象编程、催化发夹组装 | DNA神经网络 | 分子构象信号 | NA | DNA自组装 | NA | 变构DNA计算框架、催化发夹组装系统、microRNA响应型基因调控回路 | 医学、合成生物学 |
| 1071 | 2026-02-22 |
Xeno-nucleic acids support formation of Ag(I)-mediated duplexes and silver nanoclusters
2026-Feb-05, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag132
PMID:41705510
|
研究论文 | 本文研究了异源核酸(XNAs)在银离子介导下形成双链结构的能力及其对银纳米簇的光学性质调控作用 | 首次系统探索了不同骨架化学的XNAs与银离子的相互作用,揭示了骨架化学(而非仅碱基序列)可作为调控核酸-银纳米簇性质的新工具 | 未深入探讨XNAs-银纳米簇在生物体系中的实际应用性能,且未与其他金属离子进行系统性比较 | 探索异源核酸在金属介导的核酸结构和纳米材料领域的性质与应用潜力 | 具有不同骨架化学的异源核酸(XNAs)、银离子、银纳米簇 | 合成生物学、纳米材料 | NA | 圆二色光谱、质谱分析 | NA | 光谱数据、质谱数据 | 多种不同骨架组成的XNAs样本 | NA | NA | NA | 材料、纳米技术 |
| 1072 | 2026-02-22 |
Recent advances in the synthesis and application of biomolecular condensates
2025-02, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2025.108188
PMID:39814227
|
综述 | 本文综述了通过相分离驱动的合成生物分子凝聚体(SBMCs)的最新进展,包括其构建原理、调控方法以及在基础与应用研究中的潜力 | 利用合成生物学方法从头合成生物分子凝聚体,并系统阐述其内在构建原理、调控方法及在染色体结构、疾病机制、生物制造等领域的应用 | 对生物分子凝聚体的内部组织和外部调控机制的理解仍处于早期阶段,未来在生物材料、生物技术和生物医学领域仍面临机遇与挑战 | 探讨合成生物分子凝聚体的构建方法、调控机制及其在基础科学与应用研究中的潜力 | 合成生物分子凝聚体(SBMCs) | 合成生物学 | 肿瘤发生、衰老 | 相分离、合成生物学方法 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 生物材料、生物技术、生物医学、药物递送、人工细胞设计、生物制造 |
| 1073 | 2026-02-21 |
Advancing Fast-Track Genome Engineering in Bacillus subtilis Phages
2026-Feb-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00727
PMID:41538882
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为QuickPhage的快速、精确且成本效益高的噬菌体基因组工程方法,利用CRISPR-Cas9作为反选择系统,在Bacillus subtilis噬菌体SPP1中实现高效基因编辑 | 开发了QuickPhage方法,使用短至40个核苷酸的同源修复片段进行高效基因组编辑,能在一天内完成精确编辑,并成功应用于必需和非必需基因的删除及报告基因的插入 | NA | 加速噬菌体生物学研究、新功能发现和创新基因工程工具的开发 | Bacillus subtilis的模型裂解性siphovirus噬菌体SPP1 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | Bacillus subtilis | 使用诱导系统合成调控蛋白质生产(如GFP),实现高达400倍的诱导水平 | 医学, 工业生物技术 |
| 1074 | 2026-02-21 |
Miniaturized CRISPR: Ultra Compact Systems for In Vivo Delivery and Portable Diagnostics
2026-Feb-19, Annals of biomedical engineering
IF:3.0Q3
DOI:10.1007/s10439-026-04046-4
PMID:41712125
|
综述 | 本文综述了小型化CRISPR系统(如Cas12f、CasX和迷你Cas9)在体内基因编辑和便携式诊断中的应用进展 | 总结了超紧凑CRISPR系统如何通过降低分子量和简化结构,克服传统SpCas9的递送和尺寸限制,并探讨AI辅助蛋白质设计和合成生物学带来的未来机遇 | NA | 综述小型化CRISPR系统在基因治疗和便携诊断中的进展与挑战 | 紧凑型Cas蛋白、引导RNA优化和小型化递送载体 | 合成生物学 | NA | CRISPR基因编辑 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Cas12f, CasX | 哺乳动物细胞 | NA | 医学 |
| 1075 | 2026-02-21 |
From fermentation to function: a critical review of lactic acid bacteria redesign for functional foods and precision nutrition
2026-Feb-19, Critical reviews in food science and nutrition
IF:7.3Q1
DOI:10.1080/10408398.2026.2631641
PMID:41712255
|
综述 | 本文全面综述了合成生物学、基因组编辑和人工智能如何推动乳酸菌从传统食品应用向功能性食品和精准营养领域发展 | 系统整合了CRISPR菌株改良、微流控高通量筛选、AI增强的精准设计以及连接微生物组特征与特定乳酸菌功能的个性化营养框架等创新策略 | 面临全球监管差异、基因工程乳酸菌的伦理问题、先进发酵技术规模化相关的技术挑战以及消费者接受度等重大障碍 | 探讨乳酸菌在提升发酵食品质量(包括质地、风味和营养益处)方面的贡献,并推动其在功能性食品和精准营养中的创新应用 | 乳酸菌 | 合成生物学与精准营养 | NA | CRISPR、微流控高通量筛选、人工智能、多组学平台 | NA | NA | NA | CRISPR | 乳酸菌 | NA | 食品, 工业生物技术 |
| 1076 | 2026-02-21 |
Generative AI for synthetic biology: Designing biological parts, circuits, and genomes
2026-Feb-18, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2026.101533
PMID:41713401
|
综述 | 本文探讨了生成式人工智能与合成生物学的融合,重点关注其在生物部件、电路和基因组设计中的应用 | 利用生成式AI实现数据驱动的新型生物设计,具有可预测功能和上下文感知精度,标志着生物设计方法的根本性转变 | NA | 分析生成式AI如何推动合成生物学进入可预测、可编程系统的新时代 | 生物分子元件、遗传电路和基因组 | 合成生物学 | NA | 生成式人工智能 | NA | NA | NA | NA | NA | 逻辑门、生物传感器、代谢途径等 | 医学、农业、环境、能源、材料、食品、工业生物技术 |
| 1077 | 2026-02-21 |
What problem do you hope bioengineering or synthetic biology approaches will enable us to tackle in the next decade?
2026-Feb-18, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2026.101539
PMID:41713402
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1078 | 2026-02-21 |
Electron-Mediator-Free Microfluidic Photocatalytic Coenzyme Regeneration with 100% Conversion Efficiency within 126 S
2026-Feb, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202513720
PMID:41201076
|
研究论文 | 本文设计了一种无电子介体的微流控光催化平台,用于高效再生辅酶NAD(P)H,实现了126秒内100%的转化效率和优异的生物活性选择性 | 开发了无电子介体的微流控光催化平台,通过直接电子-质子耦合机制,在超短时间内实现辅酶的高效、高选择性再生,并展现出卓越的长期运行稳定性 | NA | 开发高效、稳定的光催化辅酶再生系统,以推动生物催化、合成生物学和可再生能源领域的应用 | 辅酶NAD(P)H的再生 | NA | NA | 微流控技术、光催化 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 生物催化, 合成生物学, 可再生能源 |
| 1079 | 2026-02-21 |
Traceless Regulation of Genetic Circuitry
2026-Feb, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202519848
PMID:41454732
|
综述 | 本文综述了无痕物理诱导基因开关在合成生物学中的应用、挑战与前景 | 强调无痕物理信号(如光、热、声、磁、电和机械力)作为基因开关调控手段,相比化学诱导具有更高特异性、时空分辨率、灵活性和生物电子接口兼容性 | NA | 探讨物理诱导无痕基因开关在合成遗传电路调控中的影响、挑战及未来发展方向 | 物理诱导基因开关及其在合成生物学系统中的应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成遗传电路,包括基因开关作为调控元件 | 医学, 农业, 能源, 工业生物技术 |
| 1080 | 2026-02-21 |
pH-Responsive Biomineralized Probiotic for Self-Amplifying Mucosal Vaccination: Gut-Engineered Antigen Factories Drive Targeted Cervical Tumor Regression
2026-Feb, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202510404
PMID:41482692
|
研究论文 | 本文开发了一种口服生物杂交疫苗,利用pH响应性生物矿化枯草芽孢杆菌建立肠道抗原工厂,以持续产生HPV16 E7抗原,用于宫颈癌免疫治疗 | 通过pH响应性生物矿化技术增强益生菌的胃酸抗性和肠道滞留能力,实现持续抗原生产,并首次将合成生物学与刺激响应生物材料结合,开创自复制黏膜部署系统用于精准癌症免疫治疗 | 研究基于TC-1小鼠模型,尚未在人类临床试验中验证,且长期安全性和免疫持久性需进一步评估 | 开发一种口服疫苗以增强宫颈癌免疫治疗效果,通过持续抗原暴露驱动靶向肿瘤消退 | HPV16 E7抗原、枯草芽孢杆菌、TC-1肿瘤模型小鼠 | 合成生物学 | 宫颈癌 | 生物矿化技术、免疫学分析 | NA | 实验数据 | TC-1小鼠模型 | 合成生物学 | 枯草芽孢杆菌 | 肠道抗原工厂设计,用于持续HPV16 E7抗原生产 | 医学 |