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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1121 | 2026-02-15 |
AistSeq: An in-house easy-to-purify Tn5-based plasmid sequencing platform using a compact benchtop sequencer
2025, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2025.1673510
PMID:41676073
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研究论文 | 本研究开发了一种基于Tn5转座酶的简易纯化质粒测序平台AistSeq,利用紧凑型台式测序仪进行质粒序列验证 | 发现添加大分子可溶性标签对纯化非必需,仅需His10标签和蛋白A融合即可生产活性Tn5转座酶,并整合了基于外切酶的基因组DNA消化和iSeq100数据分析流程 | NA | 开发实验室规模的简化质粒测序工作流程 | 质粒序列验证 | 合成生物学 | NA | 下一代测序(NGS)、Tn5转座酶纯化、外切酶消化 | NA | DNA序列数据 | NA | Tn5转座酶 | NA | NA | 工业生物技术 |
| 1122 | 2026-02-15 |
Functional predictability of universal gene circuits in diverse microbial hosts
2024-Jun, Quantitative biology (Beijing, China)
DOI:10.1002/qub2.41
PMID:41676371
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研究论文 | 本研究系统表征了两种转录调控模块在三种非模式微生物中的跨物种通用性,并基于宿主非特异性参数成功预测了电路行为 | 揭示了两种基因调控模块在不同微生物宿主中电路活动的线性关系,并利用宿主非特异性参数实现了对合成生物电路行为的定量预测 | 仅测试了三种非模式微生物,可能无法完全代表所有微生物宿主的多样性 | 探索合成生物电路在多样化微生物宿主中的功能可预测性和通用性 | T7 RNA聚合酶激活模块和阻遏模块在非模式微生物中的行为 | 合成生物学 | NA | 转录调控模块表征、参数化模型拟合 | 参数化模型、组合模型 | 基因电路活动数据 | 三种非模式微生物 | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly | 非模式微生物(具体未指定) | 遗传NOT门、带通滤波器电路 | 工业生物技术、环境 |
| 1123 | 2026-02-15 |
Constructing efficient bacterial cell factories to enable one-carbon utilization based on quantitative biology: A review
2024-Mar, Quantitative biology (Beijing, China)
DOI:10.1002/qub2.31
PMID:41676019
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综述 | 本文综述了基于定量生物学方法,特别是同位素代谢通量分析,用于理解和优化天然及合成C1利用细菌的代谢网络,以构建高效C1细胞工厂的研究进展 | 整合定量生物学与合成生物学,通过迭代循环(理解-设计-构建-测试-学习)来增强C1生物制造,并利用先进定量分析指导代谢网络重编程以提高碳转化效率 | NA | 构建高效细菌细胞工厂以实现基于C1原料的生物制造,支持碳中性和可持续经济系统 | 天然C1利用细菌(如利用甲烷、甲醇或甲酸盐)和合成C1细菌(非C1利用细菌工程化改造) | 合成生物学 | NA | RNA测序技术、质谱分析、同位素代谢通量分析 | NA | 代谢通量数据、基因表达数据 | NA | NA | 天然C1利用细菌、非C1利用细菌(工程化改造) | 代谢网络重编程、中心甲基营养代谢工程 | 能源、工业生物技术 |
| 1124 | 2026-02-15 |
Theoretical perspective on synthetic man-made life: Learning from the origin of life
2023-Dec, Quantitative biology (Beijing, China)
DOI:10.1002/qub2.22
PMID:41675531
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综述 | 本文回顾了人造生命领域的两种主要研究方法,并提出了基于生命起源过程的第三种可能途径 | 提出了“从生命起源出发的自下而上”新方法,该方法模拟生命起源过程,旨在建立自催化化学反应网络和定向进化系统 | 文中承认该领域仍缺乏定量数学模型和工具的应用,且所提新方法尚属理论构想 | 探讨人造生命的理论构建方法,促进合成生物学与生命起源研究领域的交流 | 人造生命的理论模型与构建方法 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 自催化化学反应网络 | 基础研究 |
| 1125 | 2026-02-15 |
From qualitative to quantitative: the state of the art and challenges for plant synthetic biology
2023-Sep, Quantitative biology (Beijing, China)
DOI:10.15302/J-QB-022-0326
PMID:41675245
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综述 | 本文综述了植物合成生物学从定性到定量的研究现状、面临的挑战及成功案例 | 强调了植物合成生物学向定量和可预测性研究转型的必要性,并指出该领域仍处于早期阶段 | 植物合成生物学面临工具不足和定量研究挑战,目前主要局限于模式植物 | 探讨植物合成生物学的研究现状、挑战及未来发展方向 | 植物合成生物学领域,特别是模式植物 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 模式植物 | NA | 农业 |
| 1126 | 2026-02-14 |
Decoding life: A detailed examination of program collection
2026-Feb, Bio Systems
DOI:10.1016/j.biosystems.2026.105693
PMID:41500378
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综述 | 本文提出并详细阐述了“生命是程序的集合”这一理论,认为生命是由遗传、代谢、发育和神经认知等程序构成的复杂有序系统 | 将生命系统抽象为多层次程序集合的理论框架,整合了哲学思想与多学科科学证据,为理解生命本质提供了新的跨学科范式 | 面临“意识难题”等哲学挑战以及合成生物学应用中的伦理争议 | 构建一个统一的理论框架来解释生命的本质、结构与运作机制 | 生命系统(包括其遗传、代谢、发育和神经认知等组成部分) | NA | NA | 单细胞组学、人工智能建模 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学、生物技术 |
| 1127 | 2026-02-14 |
Engineered probiotics that sequester arsenite in a mouse gastrointestinal system
2026-Jan-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.16.699961
PMID:41648437
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研究论文 | 本研究开发了一种基于合成生物学的工程化益生菌,用于在小鼠胃肠道中检测和隔离砷离子,以减少其系统性吸收 | 创新点包括设计了一个砷离子响应的遗传切换开关,能激活螯合剂表达并在生物静态条件下维持生产,同时自动在细胞分裂时关闭以降低代谢负担和提高生物安全性,并改造了砷离子结合蛋白以消除DNA结合活性,保留高亲和力金属结合,适合细胞内隔离 | NA | 研究目的是开发一种策略,防止饮食中的砷离子在消化过程中进入人体,以减少长期健康风险 | 研究对象是工程化的益生菌菌株,用于在小鼠胃肠道系统中隔离砷离子 | 合成生物学 | 癌症、器官功能障碍、神经系统疾病 | 合成生物学方法 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌 | 砷离子响应的遗传切换开关,用于激活螯合剂表达,并设计了一个非毒性螯合剂用于细胞内隔离 | 医学 |
| 1128 | 2026-02-14 |
Bacteriophages as Therapeutic and Biotechnological Agents: Host Interactions, Immune Modulation, and Engineering Strategies
2025-Dec, PHAGE (New Rochelle, N.Y.)
DOI:10.1177/26416549251384321
PMID:41685372
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综述 | 本文综述了噬菌体作为治疗和生物技术工具的最新进展,重点探讨了其与宿主(细菌和真核细胞)的相互作用、免疫调节功能及工程化策略 | 系统整合了噬菌体穿越血脑屏障等组织渗透机制、免疫调节功能与CRISPR抗菌等前沿工程技术的交叉应用 | 作为综述文章,未涉及原始实验数据验证,且部分新兴工程技术的临床转化潜力仍需进一步评估 | 探讨噬菌体在抗感染治疗和生物技术领域的应用潜力及作用机制 | 噬菌体及其与细菌宿主、真核宿主(包括哺乳动物组织)的相互作用 | 合成生物学 | 多重耐药菌感染 | CRISPR基因编辑、群体感应干扰技术 | NA | 文献综述数据 | NA | CRISPR-Cas系统 | 细菌(噬菌体天然宿主)、哺乳动物细胞 | 非裂解性质粒系统、群体感应干扰回路 | 医学、工业生物技术 |
| 1129 | 2026-02-14 |
Spatial Control of CAR T Cell Activation Using Tumor-Homing Polymers
2025-Feb-12, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.4c15442
PMID:39902740
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研究论文 | 开发了一种名为IMPACT的新框架,通过聚合物介导的空间控制方法,实现CAR-T细胞在肿瘤微环境中的特异性激活 | 首次将合成生物学与生物材料方法结合,创建了聚合物介导的IF-THEN门控CAR-T细胞系统,实现解剖学水平的空间控制 | 目前仅在小鼠肿瘤模型中进行了验证,尚未在人体临床试验中测试 | 提高CAR-T细胞疗法的特异性,减少脱靶毒性 | CAR-T细胞、肿瘤归巢聚合物、小鼠肿瘤模型 | 合成生物学 | 肿瘤 | 合成生物学方法、生物材料工程 | NA | 实验数据 | 小鼠肿瘤模型 | 合成生物学 | T细胞 | IF-THEN门控电路:当工程化细胞与肿瘤定位聚合物结合(IF条件)后,驱动特定蛋白在肿瘤内选择性表达(THEN条件) | 医学 |
| 1130 | 2026-02-13 |
Synthetic germ granules reveal a direct role of Vasa/DDX4 in RNA localization and translational activation
2026-Feb-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.02.01.703065
PMID:41676510
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研究论文 | 本研究通过合成方法从头生成生殖颗粒,揭示了Vasa/DDX4在RNA定位和翻译激活中的直接作用 | 开发了一种合成方法从头生成生殖颗粒,首次证明Vasa/DDX4是连接RNA招募与局部翻译激活的核心因子,且其他DEAD-box解旋酶无法替代 | NA | 探究生殖颗粒中RNA定位和翻译激活的分子机制 | 生殖颗粒、Vasa/DDX4蛋白、内源性生殖颗粒mRNA(如Nanos) | 合成生物学 | NA | 合成方法、正交RNA锚定方法、急性耗竭实验 | NA | NA | NA | PopTag-based scaffold、Gibson Assembly | Caulobacter(衍生)、活体生物 | 合成生殖颗粒、基于Oskar的RNA结合域与Vasa解旋酶的两组分模块 | 医学、基础生物学研究 |
| 1131 | 2026-02-13 |
Synthetic biology for phytohormone production
2026-Feb, Current opinion in chemical biology
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.cbpa.2025.102649
PMID:41456574
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综述 | 本文批判性地评估了合成生物学方法在植物激素生产中的应用,重点关注生长素、赤霉素和水杨酸这三种对农业至关重要的化合物 | 利用合成生物学方法为植物激素生产提供可持续的替代方案,克服传统生产中的优化和提取难题 | NA | 探索合成生物学在植物激素可持续生产中的应用,以替代农用化学品 | 植物激素,特别是生长素、赤霉素和水杨酸 | 合成生物学 | NA | 合成生物学方法 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 农业 |
| 1132 | 2026-02-13 |
Small RNAs, big potential: Engineering microRNA-based synthetic gene circuits
2026-Feb, Current opinion in chemical biology
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.cbpa.2026.102652
PMID:41621146
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综述 | 本文综述了基于microRNA的合成基因电路工程,探讨了其在疾病诊断和治疗中的应用潜力 | 介绍了CRISPR关联的miRNA响应系统和iFFL架构等最新创新,将应用从被动传感转向治疗干预 | 存在泄漏、细胞资源限制和递送挑战等局限性 | 工程化基于miRNA的合成基因电路,用于传感和解释内源性miRNA水平 | microRNA及其在合成生物学中的工程应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | CRISPR | NA | miR-OFF系统、miR-ON架构、基于逻辑的分类器、分层调控策略、iFFL架构 | 医学 |
| 1133 | 2026-02-13 |
Digital Twins are a Key Enabling Technology for Personalized Medicine
2026-Jan-14, Bulletin of mathematical biology
IF:2.0Q3
DOI:10.1007/s11538-025-01589-w
PMID:41530522
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观点文章 | 本文探讨了数字孪生作为个性化医疗的关键使能技术,强调其在健康管理中的潜力 | 从学术和商业视角分析数字孪生技术,并扩展到生态、生物技术等跨领域应用 | NA | 强调数字孪生技术对数学建模社区的机遇及其在个性化医疗中的作用 | 数字孪生技术及其在人类生物学和健康管理中的应用 | NA | NA | NA | 计算模型 | NA | NA | NA | NA | NA | 医疗, 生态, 生物技术, 农业, 合成生物学 |
| 1134 | 2026-02-13 |
Application of synthetic biology strategies to promote biosynthesis of fatty acids and their derivatives
2024, Advances in applied microbiology
DOI:10.1016/bs.aambs.2024.05.002
PMID:39059844
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综述 | 本文综述了合成生物学策略在促进脂肪酸及其衍生物生物合成中的应用,包括代谢途径、酶工程及生产优化策略 | 系统总结了通过酶理性设计、碳代谢通量调控、辅因子平衡和代谢途径设计等合成生物学策略提升脂肪酸及其衍生物产量的最新研究进展 | NA | 探讨利用合成生物学策略提高脂肪酸及其衍生物的生物合成效率,以满足工业生产和应用需求 | 脂肪酸及其衍生物,包括饱和脂肪酸(中链和长链脂肪酸)、生物活性脂肪酸(多不饱和脂肪酸、氧脂素、醚脂)及其衍生物 | NA | NA | 微生物催化、酶催化、代谢工程、酶工程 | NA | NA | NA | NA | 微生物 | 代谢途径设计 | 医药、生物燃料、农药、工业生物技术 |
| 1135 | 2026-02-13 |
Following the organism to map synthetic genomics
2022, Biotechnology notes (Amsterdam, Netherlands)
DOI:10.1016/j.biotno.2022.07.001
PMID:39416453
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研究论文 | 本文提出了一种基于工程生物体角色的启发式标签系统,以理解合成基因组学领域的多样性和未来方向 | 通过关注工程生物体的角色,为合成基因组学项目提供了一种新的分类和组织方法,强调负责任的研究和创新 | NA | 探索合成基因组学领域的多样性,并促进负责任的研究和创新,以构建可持续的未来关系 | 合成基因组学项目和工程生物体 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术 |
| 1136 | 2026-02-12 |
Over-Expression of a Phycocyanin-Interferon Fusion and Differential Cleaving Efficiency in Cyanobacteria (Synechocystis sp. PCC 6803)
2026-Mar, Biotechnology and bioengineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/bit.70126
PMID:41388596
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研究论文 | 本研究利用蓝藻Synechocystis sp. PCC 6803作为宿主,过表达藻蓝蛋白-人干扰素α-2融合蛋白,并比较TEV和HRV蛋白酶在切割融合蛋白中的效率 | 首次在蓝藻中稳定过表达功能性人干扰素α-2作为藻蓝蛋白融合体,并系统比较TEV和HRV蛋白酶在蓝藻系统中的切割效率,发现HRV蛋白酶优于TEV及其他近期测试的蛋白酶 | 研究仅针对特定蓝藻宿主和融合蛋白设计,未评估其他光合生物或不同融合策略的适用性,且切割效率可能受表达条件影响 | 开发蓝藻作为低成本重组蛋白生产平台,优化融合蛋白切割技术以提高蛋白分离效率 | 蓝藻Synechocystis sp. PCC 6803、藻蓝蛋白-人干扰素α-2融合蛋白、TEV和HRV蛋白酶切割位点 | 合成生物学 | NA | 重组蛋白表达、融合蛋白构建、蛋白酶切割分析 | NA | 实验数据 | 使用蓝藻Synechocystis sp. PCC 6803作为宿主,涉及不同蛋白酶切割位点的构建体 | 融合蛋白构建、蛋白酶切割系统 | 蓝藻Synechocystis sp. PCC 6803 | 藻蓝蛋白CpcB β-亚基与人干扰素α-2的融合蛋白,包含TEV或HRV蛋白酶切割位点 | 工业生物技术、医药 |
| 1137 | 2026-02-12 |
Light force-powered cellular medical micromachines
2026, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2026.1746261
PMID:41658983
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综述 | 本文系统综述了光力驱动的细胞微机器(包括趋化细菌、光合微藻、红细胞、免疫细胞和亚细胞结构)的设计策略及其在靶向药物递送、微创手术和免疫治疗中的应用 | 提出将天然生物细胞与可编程光镊技术相结合,克服传统人工合成材料微机器在生物安全性和深部组织疗效方面的限制 | 存在组织穿透深度有限、光毒性管理以及操作智能化不足等关键挑战 | 探讨光力驱动的细胞微机器在精准医疗中的应用潜力与发展方向 | 趋化细菌、光合微藻、红细胞、免疫细胞和亚细胞结构 | 生物医学工程 | NA | 光镊技术、光子技术 | NA | NA | NA | NA | 细菌、微藻、人类红细胞、免疫细胞 | NA | 医学 |
| 1138 | 2026-02-11 |
Self-assembling protein cages: from coiled-coil module to machine learning-driven de novo design of next-generation biomaterials
2026-Feb-09, Materials advances
IF:5.2Q2
DOI:10.1039/d5ma00792e
PMID:41446439
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综述 | 本文综述了基于卷曲螺旋或其他模块化蛋白结构域的工程化蛋白笼设计策略、功能化及其定制化应用前景 | 结合模块化蛋白设计、相互作用表面计算设计及基于机器学习的生成式蛋白设计,推动蛋白笼设计的革命性进展 | NA | 探讨自组装蛋白纳米笼的理性设计及其在合成生物学、生物技术和生物医学中的应用 | 自组装蛋白纳米笼 | 机器学习 | NA | 机器学习驱动的生成式蛋白设计 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学, 生物技术, 生物医学 |
| 1139 | 2026-02-11 |
Recent advances of engineered bacteria for therapeutic applications
2026-Feb-04, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2025.11.013
PMID:41234015
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综述 | 本文系统回顾了工程化细菌在治疗应用中的最新进展,重点关注其在疾病干预中的多功能生物治疗平台作用 | 通过合成生物学方法,结合计算建模和模块化基因电路设计,克服了细菌固有的功能限制,提高了治疗的时空精度、生物安全性和可扩展性 | NA | 探讨工程化细菌作为治疗策略的发展、测试及其在肿瘤治疗和代谢紊乱管理中的应用 | 工程化细菌系统 | 合成生物学 | 肿瘤、代谢紊乱 | 合成生物学、基因工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 细菌 | 模块化基因电路设计,如生物传感器、逻辑门 | 医学 |
| 1140 | 2026-02-11 |
Microbial Systems Enhancing CAR-Based Therapies: A Synthetic Biology Paradigm for Next-Generation Cancer Immunotherapy
2025-Dec-27, Current microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00284-025-04679-z
PMID:41454921
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综述 | 本文系统综述了利用合成生物学方法改造微生物系统,以解决CAR免疫疗法在实体瘤应用中面临的挑战 | 提出将工程化益生菌株作为可编程工厂,用于合成抗原、递送共刺激域和调节肿瘤微环境,并通过CRISPR/Cas工程化遗传电路实现治疗载荷的精确时空控制 | 临床转化的主要障碍包括生物防护挑战、对肿瘤归巢特异性的机制理解不完整以及安全性验证要求 | 评估微生物系统作为创新平台,以解决CAR免疫疗法在实体瘤应用中的局限性,并推动临床转化 | 工程化微生物系统(如大肠杆菌Nissle 1917)及其在CAR-T细胞疗法中的应用 | 合成生物学 | 癌症 | CRISPR/Cas, 合成生物学方法 | NA | 文献数据(389篇同行评审研究) | NA | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌 | 遗传电路,用于精确时空控制治疗载荷 | 医学 |