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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1121 | 2025-11-14 |
Biotransformation of Pesticides across Biological Systems: Molecular Mechanisms, Omics Insights, and Biotechnological Advances for Environmental Sustainability
2025-Nov-04, ACS omega
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsomega.5c06484
PMID:41210834
|
综述 | 全面探讨农药在不同生物系统中的生物转化机制、关键酶类、环境影响因素及生物技术应用 | 整合组学技术和合成生物学最新进展,系统分析农药生物转化产物的环境归趋 | 存在未解决的科学问题和技术挑战,部分转化产物的环境行为尚不明确 | 阐明农药生物转化机制以减轻化学污染,促进环境可持续发展 | 有机磷、有机氯和三嗪类农药在微生物、植物和动物系统中的生物转化过程 | 环境生物技术 | NA | 组学技术(omics)、合成生物学 | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | 微生物、植物、动物 | 增强降解能力的工程化设计 | 环境、农业 |
| 1122 | 2025-11-14 |
Towards establishing functional nitrogenase activities within plants
2025-Nov, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.04.020
PMID:40441921
|
研究论文 | 本文探讨在非豆科植物中建立功能性固氮酶活性的挑战与前景 | 利用合成生物学和人工智能设计,在大肠杆菌和酵母线粒体中实现部分固氮酶重构,并通过低氧环境规避氧敏感性限制 | 尚未完全解决能量需求高和氮水平反馈调节的问题 | 开发具有自主固氮能力的非豆科作物以减少化肥依赖 | 固氮酶在非豆科植物中的功能表达 | 合成生物学 | NA | 合成生物学技术、人工智能辅助设计 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌, 酿酒酵母 | 固氮酶代谢通路重构 | 农业, 环境 |
| 1123 | 2025-11-14 |
Leveraging gene editing to combat methane emissions in ruminant agriculture
2025-Nov, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.05.020
PMID:40518326
|
综述 | 探讨利用CRISPR基因编辑技术降低反刍动物甲烷排放的研究进展与挑战 | 提出通过同时编辑饲料作物和瘤胃产甲烷古菌基因组来减少甲烷排放的创新策略 | 存在递送方法、基因靶向特异性、生态影响和监管接受度等方面的挑战 | 开发可持续农业中减少反刍动物甲烷排放的有效解决方案 | 反刍动物、饲料作物、瘤胃产甲烷古菌 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas基因编辑 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 饲料作物, 产甲烷古菌 | 产甲烷途径干扰、脂质和次级代谢物合成途径增强 | 农业, 环境 |
| 1124 | 2025-11-14 |
Development of an intron-optimized dual base editor enables enhanced echinocandin B tolerance and regulatory circuit optimization in Aspergillus nidulans
2025-Nov, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.147955
PMID:41016690
|
研究论文 | 开发了一种内含子优化的双碱基编辑器,用于增强构巢曲霉中棘球白素B的耐受性并优化调控回路 | 采用真菌内含子策略阻断大肠杆菌中的翻译,开发了PAM-less SpRY-CABE系统,实现了高效双碱基编辑 | NA | 解决棘球白素B生产中的调控机制理解不足和产物抑制问题 | 构巢曲霉及其棘球白素B生物合成途径 | 合成生物学 | NA | 双碱基编辑(CABE)、启动子诱变、发酵优化 | NA | 基因序列、表达数据、代谢产物数据 | NA | CRISPR-Cas9, 双碱基编辑器 | 构巢曲霉, 大肠杆菌 | 调控回路优化、启动子工程、β-1,3-葡聚糖合成酶进化 | 工业生物技术, 医药 |
| 1125 | 2025-11-14 |
Classifying Convergences in the Light of Horizontal Gene Transfer: Epaktovars and Xenotypes
2025-Oct-29, Molecular biology and evolution
IF:11.0Q1
DOI:10.1093/molbev/msaf279
PMID:41152006
|
perspective | 提出新的分类概念来描述非树状进化模式的生物体 | 引入epaktovars和xenotypes两个互补概念,为描述水平基因转移导致的进化模式提供新框架 | 概念性论文,缺乏实证数据验证 | 澄清和统一描述非树状进化生物体的术语 | 具有水平基因转移特征的生物体 | 进化生物学 | NA | NA | NA | 概念分析 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学, 灭绝物种重建 |
| 1126 | 2025-11-14 |
Biparental plastid inheritance and its implications in plastid genome engineering
2025-Oct-10, Plant cell reports
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s00299-025-03631-6
PMID:41073605
|
综述 | 本文综述了植物质体双亲遗传的机制及其在质体基因组工程中的应用潜力 | 系统探讨了通过调控遗传和环境因素将母系质体遗传转变为双亲遗传的机制,及其在植物适应性和质体工程中的重要意义 | 质体双亲遗传机制相对研究不足,许多具体分子机制尚不明确 | 探讨质体遗传模式(特别是双亲遗传)的机制、进化意义及在植物工程中的应用 | 植物质体(叶绿体)和线粒体的遗传模式 | 植物遗传学 | NA | 质体基因组工程 | NA | 文献综述数据 | 约20%的被子植物表现出双亲质体遗传 | NA | 被子植物 | NA | 农业,合成生物学 |
| 1127 | 2025-11-14 |
Engineering microorganisms for enhanced tolerance to toxic end-products and intermediates
2025-Jan-14, FEMS microbiology reviews
IF:10.1Q1
DOI:10.1093/femsre/fuaf053
PMID:41137716
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综述 | 系统概述通过合成生物学策略增强微生物对有毒终产物和中间体耐受性的方法 | 全面总结细胞包膜工程、胞内组分工程和胞外工程等多元化的耐受性增强策略 | NA | 促进有毒终产物和中间体微生物生产的工业转化和商业化 | 微生物细胞工厂 | 合成生物学 | NA | 合成生物学策略 | NA | NA | NA | NA | 微生物 | NA | 工业生物技术 |
| 1128 | 2025-11-14 |
Biotechnological advancements enabling cannabinoid biosynthesis in engineered fungi: a mini review
2025, Frontiers in fungal biology
IF:2.1Q3
DOI:10.3389/ffunb.2025.1660661
PMID:41209486
|
综述 | 本文综述了通过合成生物学和代谢工程技术在工程真菌中生物合成大麻素的最新进展 | 利用工程真菌作为大麻素生物合成的替代生产平台,克服传统植物提取的限制 | 面临产物毒性、代谢负担和监管考虑等持续挑战 | 探索大麻素微生物生物合成的生物技术进展 | 工程真菌中的大麻素生物合成途径 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9基因组编辑、代谢工程、途径重建 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 真菌 | 大麻素生物合成途径 | 医药、保健品、工业生物技术 |
| 1129 | 2025-11-14 |
Prokaryotic homeostasis - a solution to thrive and survive
2025, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2025.1704789
PMID:41209587
|
综述 | 本文探讨原核生物通过复杂调控机制维持细胞内稳态的能力及其科学应用价值 | 系统性地将细菌确立为单细胞稳态研究的理想模型,并阐明其稳态调控网络在合成生物学和抗菌治疗中的转化潜力 | 未涉及具体实验验证或定量分析,主要为理论框架梳理 | 解析细菌维持内外环境稳态的分子机制及其应用意义 | 原核生物(细菌)的稳态调控系统 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 细菌 | 稳态调控网络(包括转录网络、第二信使系统、DNA拓扑结构调控) | 医学, 工业生物技术 |
| 1130 | 2025-11-12 |
A Comprehensive Review on Engineering Lactic Acid Bacteria: Emerging Genetic Tools and Synthetic Biology Strategies
2025-Nov-10, Biotechnology and applied biochemistry
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/bab.70079
PMID:41215480
|
综述 | 本文系统综述了乳酸菌基因工程和合成生物学策略的最新进展及其在食品、医药和环境领域的应用 | 整合了CRISPR-Cas系统等新兴基因编辑工具和合成生物学方法在乳酸菌工程化中的应用前景 | 存在质粒不稳定性、代谢负担和监管障碍等技术挑战 | 探讨通过基因工程和合成生物学策略增强乳酸菌功能性的方法 | 乳酸菌(如乳酸杆菌和乳酸球菌)的基因组结构和代谢特性 | 合成生物学 | NA | 电穿孔、接合转移、CRISPR-Cas系统、基因电路、核糖开关、生物传感器 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas | 乳酸菌, Lactobacillus, Lactococcus | 基因电路、生物传感器、代谢途径优化 | 食品, 医药, 环境, 工业生物技术, 农业 |
| 1131 | 2025-11-11 |
Characterization of recombinase activity across cellular growth phases
2025-Aug-25, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-17024-y
PMID:40855116
|
研究论文 | 研究细菌生长阶段如何影响重组酶Bxb1介导的DNA修饰效率 | 首次系统揭示静止期重组酶活性特征及诱导时机对重组效率的优化作用 | 仅使用大肠杆菌和Bxb1重组酶作为模型系统 | 探索细菌生长阶段对重组酶活性的影响机制 | 大肠杆菌和丝氨酸重组酶Bxb1 | 合成生物学 | NA | 遗传工程系统、重组效率定量分析 | NA | 分子生物学实验数据 | NA | 遗传工程系统 | 大肠杆菌 | 重组酶介导的DNA修饰系统 | 生物医学研究, 基因治疗, 合成生物学 |
| 1132 | 2025-11-09 |
Enhancing the β-Oxidation-Like Pathway for the Optimal Production of the Immunosuppressant Mycophenolic Acid
2025-Nov, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202508826
PMID:40788096
|
研究论文 | 本研究通过重构真菌β-氧化样酶级联反应,优化了免疫抑制剂霉酚酸的生产途径 | 首次在真菌天然产物生物合成中实现了完整β-氧化样酶级联反应的功能重构 | 研究仅针对特定真菌菌株,未验证在其他宿主中的普适性 | 优化免疫抑制剂霉酚酸的生物合成途径 | 短密青霉菌NRRL864及其β-氧化酶系统 | 合成生物学 | 免疫抑制治疗 | 体外酶活性测定、途径工程 | NA | 酶活性数据、代谢产物产量数据 | NA | 途径优化、基因过表达 | 短密青霉菌 | β-氧化样代谢途径,包含氧化、脱氢、水合、还原、异构化和逆克莱森缩合反应 | 医药 |
| 1133 | 2025-11-09 |
[Application and prospects of synthetic biology in the genetic improvement of rice]
2025-Oct-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.250347
PMID:41203287
|
综述 | 系统总结合成生物学在水稻遗传改良中的应用进展与突破成果 | 通过模块化、标准化和系统化方法实现精准基因组和代谢途径工程,有效克服传统育种周期长和性状改良能力受限的局限性 | NA | 探讨合成生物学在水稻遗传改良中的应用前景 | 水稻遗传改良 | 合成生物学 | NA | 基因组编辑、遗传电路设计、代谢工程、人工智能 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 水稻 | 遗传电路设计、代谢途径工程 | 农业 |
| 1134 | 2025-11-09 |
Biophysical and structural studies on transketolases
2025, Methods in enzymology
DOI:10.1016/bs.mie.2025.07.011
PMID:41203347
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研究论文 | 本文介绍了转酮醇酶的生物物理和结构研究协议,包括活性分析、催化机制和结构研究方法 | 提供了一套全面的转酮醇酶研究工具包,整合了稳态动力学、辅因子结合、催化中间体检测和快速动力学研究等多种光谱和生物物理技术 | NA | 深入理解转酮醇酶的机制和结构,促进其在酶学、合成生物学和药物开发等领域的应用 | 转酮醇酶及其催化机制 | 酶学 | 癌症、代谢疾病、神经退行性疾病 | 稳态动力学、辅因子结合研究、催化中间体检测、快速动力学研究、光谱技术、生物物理技术 | NA | 生物物理数据、结构数据 | NA | NA | NA | NA | 药物开发、生物催化、合成生物学 |
| 1135 | 2025-11-08 |
Boosting microalgae-based carbon sequestration with the artificial CO2 concentration system
2025-Dec, Critical reviews in biotechnology
IF:8.1Q1
DOI:10.1080/07388551.2025.2498464
PMID:40374568
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综述 | 本文综述了微藻人工CO2封存技术的现状,重点探讨了CO2耐受物种筛选、培养优化、反应器设计及合成生物学应用 | 系统整合了微藻固碳技术的光反应与暗反应优化策略,并引入合成生物学手段提升CO2溶解与生物固定效率 | 未涉及具体实验数据验证,主要基于文献综述的理论分析 | 推动微藻基CO2封存技术发展,应对全球变暖挑战 | 微藻光合微生物及其碳封存系统 | 环境生物技术 | NA | 合成生物学、生命周期评估、技术经济分析 | NA | 文献数据 | NA | 合成生物学工具 | 微藻 | CO2生物固定代谢通路 | 环境,能源 |
| 1136 | 2025-11-08 |
A comprehensive review of genomic-scale genetic engineering as a strategy to improve bacterial productivity
2025-Nov, Microbiology (Reading, England)
DOI:10.1099/mic.0.001628
PMID:41182907
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综述 | 本文系统回顾了基因组规模遗传工程作为提高细菌生产力的策略发展历程 | 首次整合多种基因组工程方法,提供统一视角来总结细菌基因组工程工具的历史里程碑和实际应用 | CRISPR/Cas等工具仍需持续改进才能完全成熟 | 总结基因组工程工具在提高细菌生产力方面的发展和应用 | 细菌基因组工程工具 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas, 随机诱变, 多重化策略 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 细菌 | NA | 工业生物技术 |
| 1137 | 2025-11-08 |
De novo-designed minibinders expand the synthetic biology sensing repertoire
2024-Aug-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.01.12.575267
PMID:38293112
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研究论文 | 本研究探索了从头设计的微型结合蛋白在合成生物学传感工具中的广泛应用潜力 | 首次系统验证微型结合蛋白可适配多种细胞工程工具,相比传统抗体具有独特表位靶向能力和更快生产周期 | 研究主要聚焦于SARS-CoV-2 Spike蛋白和EGFR靶点,尚未验证对其他抗原的普适性 | 拓展合成生物学中抗原传感工具的种类和性能 | 微型结合蛋白及其在合成受体中的应用 | 合成生物学 | COVID-19, 癌症 | 蛋白质从头设计, 细胞工程 | NA | 实验数据 | NA | synNotch, SNIPR, CAR | 哺乳动物细胞, T细胞 | 合成受体, 抗原传感器, 嵌合抗原受体 | 医学, 治疗性细胞工程 |
| 1138 | 2025-11-07 |
Microplastic pollution in rice systems: Impacts, mechanisms and green remediation strategies
2025-Nov-10, The Science of the total environment
DOI:10.1016/j.scitotenv.2025.180734
PMID:41124903
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综述 | 本文系统综述了稻田系统中微塑料污染的来源、分布、影响机制及绿色修复策略 | 首次全面整合了稻田微塑料污染的多维度影响机制,并系统提出了涵盖植物修复、生物修复和生物技术干预的综合性绿色修复方案 | 许多生物修复方法在控制环境中表现良好,但在实际田间条件下面临应用挑战 | 评估稻田微塑料污染的影响机制并探索绿色修复策略 | 稻田系统中的微塑料污染 | 环境科学 | NA | NA | NA | 文献综述数据 | NA | 合成生物学, 酶封装技术 | 细菌, 真菌, 藻类, 土壤大型动物 | 生物降解通路, 生物传感器 | 农业, 环境 |
| 1139 | 2025-11-07 |
Leveraging synthetic biology for the commercialization of renewable fuels and chemicals aligning sustainable development goals
2025-Nov-05, Preparative biochemistry & biotechnology
IF:2.0Q3
DOI:10.1080/10826068.2025.2578270
PMID:41191734
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综述 | 探讨合成生物学在生物燃料和绿色化学品生产中的作用,重点关注可再生能源开发应用 | 利用DNA建模、代谢工程和微生物发酵等合成生物学创新方法优化生物燃料生产,特别是来自非粮原料 | 存在生物安全、知识产权和监管方面的挑战,以及合成生物学可能被滥用于生物安全和生物剽窃的担忧 | 研究合成生物学在可再生燃料和化学品商业化中的应用,以支持可持续发展目标 | 工程微生物、木质纤维素生物质、生物燃料和生物化学品 | NA | NA | DNA建模、代谢工程、微生物发酵 | NA | NA | NA | NA | 工程微生物 | 代谢途径工程 | 能源, 环境 |
| 1140 | 2025-11-07 |
A minimal SufB2C2 complex functions as a [4Fe-4S] cluster scaffold in methanogenic archaea
2025-Nov-04, Microbiology spectrum
IF:3.7Q2
DOI:10.1128/spectrum.02134-25
PMID:41060016
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研究论文 | 本研究揭示了产甲烷古菌中由SufB和SufC组成的最小SUF系统作为[4Fe-4S]簇支架的功能机制 | 发现仅由两个蛋白组成的最小SUF系统,揭示SufC是主要簇结合组分,代表铁硫簇生物合成的祖先形式 | NA | 阐明专性厌氧古菌中铁硫簇的生物合成机制 | 产甲烷古菌中的SufB和SufC蛋白复合物 | 生物化学 | NA | 突变分析、进化比较、蛋白相互作用研究 | NA | 生物化学数据 | NA | NA | 产甲烷古菌 | NA | 合成生物学 |