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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1121 | 2026-02-17 |
Phage Therapy in Plant Disease Management: 110 Years of History, Current Challenges, and Future Trends
2026-Jan-24, Plants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/plants15030368
PMID:41681534
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综述 | 本文回顾了噬菌体疗法在植物病害管理中110年的发展历史,分析了当前面临的挑战,并探讨了未来的发展趋势 | 全面梳理了噬菌体疗法在植物病害管理领域的完整历史脉络,并前瞻性地讨论了合成生物学、先进递送系统与人工智能等前沿技术的整合潜力 | NA | 回顾噬菌体疗法在植物病害管理领域的发展历程,并展望其未来趋势 | 噬菌体及其在植物病害管理中的应用 | NA | 植物病害 | 噬菌体疗法 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 农业 |
| 1122 | 2026-02-17 |
Integrating chemical artificial intelligence and cognitive computing for predictive analysis of biological pathways: a case for intrinsically disordered proteins
2025-Jun, Biophysical reviews
IF:4.9Q1
DOI:10.1007/s12551-025-01286-x
PMID:40727659
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研究论文 | 本文探讨了将化学人工智能与认知计算相结合,用于生物通路预测分析,特别是针对内在无序蛋白的应用 | 提出通过化学人工智能整合生物分子相互作用到认知计算中,以模拟人类思维过程并增强决策,为蛋白质工程和药物发现等领域提供新方法 | 生物数据复杂性和规模大,整合生物过程与认知计算仍面临挑战 | 旨在连接认知计算与生物知识,以开发更精确的蛋白质相互作用、基因调控和代谢通路模型,促进个性化治疗和早期疾病检测 | 内在无序蛋白及其在大脑功能和信息处理中的关键作用 | 生物信息学 | NA | 机器学习、自然语言处理、语音识别 | 认知计算模型 | 生物数据 | NA | NA | NA | NA | 医学、蛋白质工程、药物发现、合成生物学、非传统计算 |
| 1123 | 2026-02-16 |
LINC00973/DTX3L Axis Promotes Non-Small Cell Lung Cancer Progression and Serves as a Therapeutic Target
2026-Feb, Smart medicine
DOI:10.1002/smmd.70029
PMID:41684454
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研究论文 | 本研究揭示了长链非编码RNA LINC00973在非小细胞肺癌中通过稳定DTX3L蛋白并激活AKT信号通路促进肿瘤进展的机制,并开发了基于外泌体递送siRNA的靶向治疗策略 | 首次发现LINC00973/DTX3L轴在非小细胞肺癌中的致癌作用,并创新性地采用RGD修饰外泌体和合成生物学策略实现靶向治疗 | 未明确LINC00973在肺癌亚型中的特异性表达差异,临床前模型的长期安全性尚未验证 | 探究LINC00973在非小细胞肺癌中的生物学功能及治疗靶点价值 | 非小细胞肺癌组织样本、肺癌细胞系、小鼠肿瘤模型 | 肿瘤生物学 | 肺癌 | 高通量测序、功能获得/缺失实验、外泌体递送技术、合成生物学 | NA | RNA测序数据、临床病理数据、体内外实验数据 | 配对的NSCLC肿瘤组织与癌旁组织样本(具体数量未说明) | 合成生物学技术 | 小鼠模型、肝脏细胞(用于外泌体生产) | 基于肝脏生产携带靶向siRNA外泌体的合成生物学系统 | 医学 |
| 1124 | 2026-02-16 |
Membrane and proteome allocation constraints in Escherichia coli models during overflow metabolism
2026-Jan-23, Biophysical journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1016/j.bpj.2026.01.028
PMID:41580894
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研究论文 | 本研究开发了膜相关约束通量平衡分析模型,以探究大肠杆菌在溢流代谢中膜资源分配的关键作用 | 引入了可调节的膜蛋白质量约束,首次在基因组尺度模型中整合膜分配限制,提高了溢流代谢预测的准确性 | 模型可能未涵盖所有膜相关生物物理因素,且主要基于大肠杆菌,在其他微生物中的普适性有待验证 | 探究膜资源分配如何与整体蛋白质组限制共同调控细菌生理和溢流代谢 | 大肠杆菌的代谢策略和膜蛋白表达 | 代谢工程 | NA | 通量平衡分析 | MAFBA | 基因组尺度代谢模型数据 | NA | NA | 大肠杆菌 | NA | 工业生物技术 |
| 1125 | 2026-02-15 |
Synergistic defense in cotton: Lignin-mediated barriers and JA/ET signaling pathways against Verticillium wilt
2026-Mar, Plant science : an international journal of experimental plant biology
IF:4.2Q1
DOI:10.1016/j.plantsci.2025.112943
PMID:41407016
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综述 | 本文综述了棉花通过木质素物理屏障与JA/ET信号通路协同防御黄萎病的机制 | 揭示了木质素介导的物理屏障与JA/ET信号通路的协同防御机制,并识别了关键调控因子GhBLH7-D06、GhKWL1和GbTCP20 | 不同棉花品种中通路的贡献度存在争议,且环境调控机制尚不明确 | 阐明棉花对黄萎病的协同防御机制,为开发持久广谱的抗病策略提供理论基础 | 棉花(Gossypium spp.)及其与黄萎病菌(Verticillium dahliae)的互作 | 植物病理学/合成生物学 | 植物病害(黄萎病) | 多组学分析(multi-omics) | NA | NA | NA | CRISPR | 棉花 | JA/ET信号通路与苯丙烷类代谢途径的协同调控网络 | 农业 |
| 1126 | 2026-02-15 |
The emerging impact of CRISPR and gene editing on global crop improvement
2026-Feb-14, Transgenic research
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s11248-026-00484-x
PMID:41688767
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综述 | 本文全面评述了CRISPR基因编辑技术对全球作物改良的影响、机制、应用及未来潜力 | 系统总结了CRISPR技术从基础机制到多样化编辑工具(如碱基编辑、先导编辑、表观基因组编辑)的发展,并探讨了其与合成生物学、人工智能等前沿技术融合的前景 | 存在脱靶效应、监管障碍、伦理问题及公众接受度等挑战 | 探讨CRISPR基因编辑技术在全球作物改良中的应用与影响 | 植物(作物) | NA | NA | CRISPR-Cas9, 碱基编辑, 先导编辑, 表观基因组编辑 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 细菌, 古菌, 植物 | NA | 农业 |
| 1127 | 2026-02-15 |
Beer yeast breeding in the era of innovation: advances and applications for modern brewing
2025-Dec-16, Biotechnology letters
IF:2.0Q3
DOI:10.1007/s10529-025-03681-6
PMID:41400895
|
综述 | 本文系统回顾了现代啤酒酵母育种策略,重点讨论了组学、适应性进化和CRISPR基因组编辑等创新技术在酵母菌株开发中的应用与进展 | 强调了多维策略、高通量筛选平台以及合成生物学与计算模型协同整合在实现精准菌株优化中的重要性,并展望了未来菌株增强技术的发展趋势 | NA | 探讨现代生物技术背景下啤酒酵母育种的最新进展与应用,以满足啤酒行业对定制化风味和品质的多样化市场需求 | 啤酒酵母(酿酒酵母) | NA | NA | 组学技术、适应性进化、CRISPR基因组编辑 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 酿酒酵母 | NA | 食品工业、工业生物技术 |
| 1128 | 2026-02-15 |
AistSeq: An in-house easy-to-purify Tn5-based plasmid sequencing platform using a compact benchtop sequencer
2025, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2025.1673510
PMID:41676073
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于Tn5转座酶的简易纯化质粒测序平台AistSeq,利用紧凑型台式测序仪进行质粒序列验证 | 发现添加大分子可溶性标签对纯化非必需,仅需His10标签和蛋白A融合即可生产活性Tn5转座酶,并整合了基于外切酶的基因组DNA消化和iSeq100数据分析流程 | NA | 开发实验室规模的简化质粒测序工作流程 | 质粒序列验证 | 合成生物学 | NA | 下一代测序(NGS)、Tn5转座酶纯化、外切酶消化 | NA | DNA序列数据 | NA | Tn5转座酶 | NA | NA | 工业生物技术 |
| 1129 | 2026-02-15 |
Functional predictability of universal gene circuits in diverse microbial hosts
2024-Jun, Quantitative biology (Beijing, China)
DOI:10.1002/qub2.41
PMID:41676371
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研究论文 | 本研究系统表征了两种转录调控模块在三种非模式微生物中的跨物种通用性,并基于宿主非特异性参数成功预测了电路行为 | 揭示了两种基因调控模块在不同微生物宿主中电路活动的线性关系,并利用宿主非特异性参数实现了对合成生物电路行为的定量预测 | 仅测试了三种非模式微生物,可能无法完全代表所有微生物宿主的多样性 | 探索合成生物电路在多样化微生物宿主中的功能可预测性和通用性 | T7 RNA聚合酶激活模块和阻遏模块在非模式微生物中的行为 | 合成生物学 | NA | 转录调控模块表征、参数化模型拟合 | 参数化模型、组合模型 | 基因电路活动数据 | 三种非模式微生物 | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly | 非模式微生物(具体未指定) | 遗传NOT门、带通滤波器电路 | 工业生物技术、环境 |
| 1130 | 2026-02-15 |
Constructing efficient bacterial cell factories to enable one-carbon utilization based on quantitative biology: A review
2024-Mar, Quantitative biology (Beijing, China)
DOI:10.1002/qub2.31
PMID:41676019
|
综述 | 本文综述了基于定量生物学方法,特别是同位素代谢通量分析,用于理解和优化天然及合成C1利用细菌的代谢网络,以构建高效C1细胞工厂的研究进展 | 整合定量生物学与合成生物学,通过迭代循环(理解-设计-构建-测试-学习)来增强C1生物制造,并利用先进定量分析指导代谢网络重编程以提高碳转化效率 | NA | 构建高效细菌细胞工厂以实现基于C1原料的生物制造,支持碳中性和可持续经济系统 | 天然C1利用细菌(如利用甲烷、甲醇或甲酸盐)和合成C1细菌(非C1利用细菌工程化改造) | 合成生物学 | NA | RNA测序技术、质谱分析、同位素代谢通量分析 | NA | 代谢通量数据、基因表达数据 | NA | NA | 天然C1利用细菌、非C1利用细菌(工程化改造) | 代谢网络重编程、中心甲基营养代谢工程 | 能源、工业生物技术 |
| 1131 | 2026-02-15 |
Theoretical perspective on synthetic man-made life: Learning from the origin of life
2023-Dec, Quantitative biology (Beijing, China)
DOI:10.1002/qub2.22
PMID:41675531
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综述 | 本文回顾了人造生命领域的两种主要研究方法,并提出了基于生命起源过程的第三种可能途径 | 提出了“从生命起源出发的自下而上”新方法,该方法模拟生命起源过程,旨在建立自催化化学反应网络和定向进化系统 | 文中承认该领域仍缺乏定量数学模型和工具的应用,且所提新方法尚属理论构想 | 探讨人造生命的理论构建方法,促进合成生物学与生命起源研究领域的交流 | 人造生命的理论模型与构建方法 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 自催化化学反应网络 | 基础研究 |
| 1132 | 2026-02-15 |
From qualitative to quantitative: the state of the art and challenges for plant synthetic biology
2023-Sep, Quantitative biology (Beijing, China)
DOI:10.15302/J-QB-022-0326
PMID:41675245
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综述 | 本文综述了植物合成生物学从定性到定量的研究现状、面临的挑战及成功案例 | 强调了植物合成生物学向定量和可预测性研究转型的必要性,并指出该领域仍处于早期阶段 | 植物合成生物学面临工具不足和定量研究挑战,目前主要局限于模式植物 | 探讨植物合成生物学的研究现状、挑战及未来发展方向 | 植物合成生物学领域,特别是模式植物 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 模式植物 | NA | 农业 |
| 1133 | 2026-02-14 |
Decoding life: A detailed examination of program collection
2026-Feb, Bio Systems
DOI:10.1016/j.biosystems.2026.105693
PMID:41500378
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综述 | 本文提出并详细阐述了“生命是程序的集合”这一理论,认为生命是由遗传、代谢、发育和神经认知等程序构成的复杂有序系统 | 将生命系统抽象为多层次程序集合的理论框架,整合了哲学思想与多学科科学证据,为理解生命本质提供了新的跨学科范式 | 面临“意识难题”等哲学挑战以及合成生物学应用中的伦理争议 | 构建一个统一的理论框架来解释生命的本质、结构与运作机制 | 生命系统(包括其遗传、代谢、发育和神经认知等组成部分) | NA | NA | 单细胞组学、人工智能建模 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学、生物技术 |
| 1134 | 2026-02-14 |
Engineered probiotics that sequester arsenite in a mouse gastrointestinal system
2026-Jan-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.16.699961
PMID:41648437
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研究论文 | 本研究开发了一种基于合成生物学的工程化益生菌,用于在小鼠胃肠道中检测和隔离砷离子,以减少其系统性吸收 | 创新点包括设计了一个砷离子响应的遗传切换开关,能激活螯合剂表达并在生物静态条件下维持生产,同时自动在细胞分裂时关闭以降低代谢负担和提高生物安全性,并改造了砷离子结合蛋白以消除DNA结合活性,保留高亲和力金属结合,适合细胞内隔离 | NA | 研究目的是开发一种策略,防止饮食中的砷离子在消化过程中进入人体,以减少长期健康风险 | 研究对象是工程化的益生菌菌株,用于在小鼠胃肠道系统中隔离砷离子 | 合成生物学 | 癌症、器官功能障碍、神经系统疾病 | 合成生物学方法 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌 | 砷离子响应的遗传切换开关,用于激活螯合剂表达,并设计了一个非毒性螯合剂用于细胞内隔离 | 医学 |
| 1135 | 2026-02-14 |
Bacteriophages as Therapeutic and Biotechnological Agents: Host Interactions, Immune Modulation, and Engineering Strategies
2025-Dec, PHAGE (New Rochelle, N.Y.)
DOI:10.1177/26416549251384321
PMID:41685372
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综述 | 本文综述了噬菌体作为治疗和生物技术工具的最新进展,重点探讨了其与宿主(细菌和真核细胞)的相互作用、免疫调节功能及工程化策略 | 系统整合了噬菌体穿越血脑屏障等组织渗透机制、免疫调节功能与CRISPR抗菌等前沿工程技术的交叉应用 | 作为综述文章,未涉及原始实验数据验证,且部分新兴工程技术的临床转化潜力仍需进一步评估 | 探讨噬菌体在抗感染治疗和生物技术领域的应用潜力及作用机制 | 噬菌体及其与细菌宿主、真核宿主(包括哺乳动物组织)的相互作用 | 合成生物学 | 多重耐药菌感染 | CRISPR基因编辑、群体感应干扰技术 | NA | 文献综述数据 | NA | CRISPR-Cas系统 | 细菌(噬菌体天然宿主)、哺乳动物细胞 | 非裂解性质粒系统、群体感应干扰回路 | 医学、工业生物技术 |
| 1136 | 2026-02-14 |
Spatial Control of CAR T Cell Activation Using Tumor-Homing Polymers
2025-Feb-12, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.4c15442
PMID:39902740
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研究论文 | 开发了一种名为IMPACT的新框架,通过聚合物介导的空间控制方法,实现CAR-T细胞在肿瘤微环境中的特异性激活 | 首次将合成生物学与生物材料方法结合,创建了聚合物介导的IF-THEN门控CAR-T细胞系统,实现解剖学水平的空间控制 | 目前仅在小鼠肿瘤模型中进行了验证,尚未在人体临床试验中测试 | 提高CAR-T细胞疗法的特异性,减少脱靶毒性 | CAR-T细胞、肿瘤归巢聚合物、小鼠肿瘤模型 | 合成生物学 | 肿瘤 | 合成生物学方法、生物材料工程 | NA | 实验数据 | 小鼠肿瘤模型 | 合成生物学 | T细胞 | IF-THEN门控电路:当工程化细胞与肿瘤定位聚合物结合(IF条件)后,驱动特定蛋白在肿瘤内选择性表达(THEN条件) | 医学 |
| 1137 | 2026-02-13 |
Synthetic germ granules reveal a direct role of Vasa/DDX4 in RNA localization and translational activation
2026-Feb-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.02.01.703065
PMID:41676510
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研究论文 | 本研究通过合成方法从头生成生殖颗粒,揭示了Vasa/DDX4在RNA定位和翻译激活中的直接作用 | 开发了一种合成方法从头生成生殖颗粒,首次证明Vasa/DDX4是连接RNA招募与局部翻译激活的核心因子,且其他DEAD-box解旋酶无法替代 | NA | 探究生殖颗粒中RNA定位和翻译激活的分子机制 | 生殖颗粒、Vasa/DDX4蛋白、内源性生殖颗粒mRNA(如Nanos) | 合成生物学 | NA | 合成方法、正交RNA锚定方法、急性耗竭实验 | NA | NA | NA | PopTag-based scaffold、Gibson Assembly | Caulobacter(衍生)、活体生物 | 合成生殖颗粒、基于Oskar的RNA结合域与Vasa解旋酶的两组分模块 | 医学、基础生物学研究 |
| 1138 | 2026-02-13 |
Synthetic biology for phytohormone production
2026-Feb, Current opinion in chemical biology
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.cbpa.2025.102649
PMID:41456574
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综述 | 本文批判性地评估了合成生物学方法在植物激素生产中的应用,重点关注生长素、赤霉素和水杨酸这三种对农业至关重要的化合物 | 利用合成生物学方法为植物激素生产提供可持续的替代方案,克服传统生产中的优化和提取难题 | NA | 探索合成生物学在植物激素可持续生产中的应用,以替代农用化学品 | 植物激素,特别是生长素、赤霉素和水杨酸 | 合成生物学 | NA | 合成生物学方法 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 农业 |
| 1139 | 2026-02-13 |
Small RNAs, big potential: Engineering microRNA-based synthetic gene circuits
2026-Feb, Current opinion in chemical biology
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.cbpa.2026.102652
PMID:41621146
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综述 | 本文综述了基于microRNA的合成基因电路工程,探讨了其在疾病诊断和治疗中的应用潜力 | 介绍了CRISPR关联的miRNA响应系统和iFFL架构等最新创新,将应用从被动传感转向治疗干预 | 存在泄漏、细胞资源限制和递送挑战等局限性 | 工程化基于miRNA的合成基因电路,用于传感和解释内源性miRNA水平 | microRNA及其在合成生物学中的工程应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | CRISPR | NA | miR-OFF系统、miR-ON架构、基于逻辑的分类器、分层调控策略、iFFL架构 | 医学 |
| 1140 | 2026-02-13 |
Digital Twins are a Key Enabling Technology for Personalized Medicine
2026-Jan-14, Bulletin of mathematical biology
IF:2.0Q3
DOI:10.1007/s11538-025-01589-w
PMID:41530522
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观点文章 | 本文探讨了数字孪生作为个性化医疗的关键使能技术,强调其在健康管理中的潜力 | 从学术和商业视角分析数字孪生技术,并扩展到生态、生物技术等跨领域应用 | NA | 强调数字孪生技术对数学建模社区的机遇及其在个性化医疗中的作用 | 数字孪生技术及其在人类生物学和健康管理中的应用 | NA | NA | NA | 计算模型 | NA | NA | NA | NA | NA | 医疗, 生态, 生物技术, 农业, 合成生物学 |