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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
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1121 | 2025-10-05 |
A synthetic chronogenetic gene circuit for programmed circadian drug delivery
2025-Feb-07, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-56584-5
PMID:39920119
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研究论文 | 开发了一种基于合成生物学的时序遗传基因回路,用于实现程序化昼夜节律药物递送 | 首次结合合成生物学和组织工程开发了称为'时序遗传学'的昼夜节律基因回路,能够根据生物钟基因Per2的表达节律程序化释放治疗药物 | 目前仅在体外和动物模型中验证,尚未进行人体临床试验 | 开发基于细胞的时间遗传疗法,用于昼夜节律医学的各种应用 | 类风湿关节炎和其他炎症性疾病 | 合成生物学 | 类风湿关节炎 | 合成生物学、组织工程 | NA | NA | NA | 基因回路设计 | 诱导多能干细胞 | 基于核心时钟基因Period2启动子的时序遗传基因回路,可程序化表达治疗性转基因 | 医学 |
1122 | 2025-10-05 |
The evolution of sequences and spatial conformation in vertebrate chromosomes
2025-Feb, Yi chuan = Hereditas
DOI:10.16288/j.yczz.24-212
PMID:39924699
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综述 | 本文综述了脊椎动物染色体序列与空间构象的进化历程,重点关注染色体重排在物种形成中的作用及其分子机制 | 整合高通量测序技术揭示跨物种染色体进化规律,并探讨合成生物学为染色体进化研究带来的新机遇 | NA | 系统阐述脊椎动物染色体的进化模式与机制 | 脊椎动物染色体 | 基因组学 | 癌症 | 高通量测序, 荧光原位杂交(FISH) | NA | 基因组序列数据 | NA | NA | NA | NA | 基础研究 |
1123 | 2025-10-05 |
Model-guided gene circuit design for engineering genetically stable cell populations in diverse applications
2025-Feb, Journal of the Royal Society, Interface
DOI:10.1098/rsif.2024.0602
PMID:39933591
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研究论文 | 开发了一种独立于特定基因电路设计的生物分子控制器,用于维持工程细胞群体的遗传稳定性 | 设计了一种不依赖于突变合成基因身份的生物分子控制器,可通用应用于多种合成电路而无需重新设计 | 研究主要基于建模和仿真分析,需要进一步的实验验证 | 解决合成生物学中工程细胞群体遗传稳定性的关键挑战 | 工程细胞群体和合成基因电路 | 合成生物学 | NA | 资源感知细胞建模 | 生物分子控制器模型 | 仿真数据 | NA | NA | 工程细胞 | 通用型生物分子控制器,可抑制突变细胞生长 | 工业生物技术, 医药 |
1124 | 2025-10-05 |
[Function of flavoprotein monooxygenases in natural product biosynthesis]
2025-Jan, Zhongguo Zhong yao za zhi = Zhongguo zhongyao zazhi = China journal of Chinese materia medica
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综述 | 系统综述黄素蛋白单加氧酶在天然产物生物合成中的分类、催化机制及应用潜力 | 首次系统分析植物Class B FPMOs三个亚家族的催化特征及其在天然产物合成中的调控作用 | 主要聚焦植物Class B FPMOs,未全面涵盖其他生物来源的FPMOs | 阐明黄素蛋白单加氧酶在天然产物生物合成中的功能机制与应用前景 | 植物Class B FPMOs及其三个亚家族(FMO、BVMO、NMO) | 合成生物学 | NA | NA | NA | 文献数据 | NA | NA | 植物 | 天然产物生物合成途径(生长素、靛蓝、氰苷等) | 农业,植物保护,天然产物生物合成,合成生物学 |
1125 | 2025-10-05 |
A molecular proximity sensor based on an engineered, dual-component guide RNA
2024-Aug-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.08.14.553235
PMID:37645782
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研究论文 | 开发了一种基于工程化双组分引导RNA的分子邻近传感器,将蛋白质-蛋白质邻近性转化为功能性CRISPR-Cas9基因编辑活性 | 通过工程化crRNA:tracrRNA相互作用,首次实现将蛋白质-蛋白质相互作用和化学诱导二聚化作为CRISPR基因编辑的触发机制 | 研究目前仅在人类细胞中进行验证,尚未在其他生物系统中测试 | 开发可编程的合成分子电路,将分子事件与基因组编辑连接起来 | 蛋白质-蛋白质相互作用、化学诱导二聚化、RNA传感器 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9、prime editing、base editing、ADAR-based RNA sensing | NA | 分子生物学数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 人类细胞 | 双组分引导RNA系统、分子邻近传感器、可编程输入输出电路 | 医学、工业生物技术 |
1126 | 2025-10-05 |
Resurrecting ancestral antibiotics: unveiling the origins of modern lipid II targeting glycopeptides
2023-11-29, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-43451-4
PMID:38030603
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研究论文 | 本研究通过计算技术和合成生物学方法复活了靶向脂质II的糖肽类抗生素的祖先分子,揭示了其进化历程 | 结合计算预测与合成生物学技术首次复活了糖肽类抗生素的祖先分子,揭示了该类抗生素的进化路径 | NA | 理解自然界如何围绕共同作用机制进化抗生素,特别是靶向脂质II的糖肽类抗生素 | 糖肽类抗生素(以替考拉宁和万古霉素为代表)及其祖先分子paleomycin | 合成生物学 | 细菌感染 | 计算技术,合成生物学技术,非核糖体肽合成酶分析 | NA | NA | NA | 合成生物学技术 | NA | NA | 医药 |
1127 | 2025-10-05 |
The key role of cytochrome P450s in the biosynthesis of plant derived natural products
2025-May, Plant physiology and biochemistry : PPB
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.plaphy.2025.109695
PMID:40015195
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综述 | 概述细胞色素P450在植物天然产物生物合成中的关键作用及其在合成生物学中的研究进展 | 重点聚焦细胞色素P450酶在关键催化步骤中的核心作用,并整合天然产物生物合成与合成生物学的最新研究进展 | NA | 探讨细胞色素P450在植物天然产物生物合成途径中的功能与作用机制 | 植物来源的天然产物(萜类、生物碱、黄酮类、甾体皂苷等)及其生物合成途径 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医药 |
1128 | 2025-10-05 |
Future-proofing ornamental plants: Cutting-edge strategies for drought resistance and sustainability
2025 May-Jun, Physiologia plantarum
IF:5.4Q1
DOI:10.1111/ppl.70255
PMID:40325615
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综述 | 本文综述了观赏植物抗旱性研究的最新进展,探讨了提高观赏植物抗旱性和可持续性的前沿策略 | 整合了表观遗传工程、合成生物学和高通量表型分析等前沿技术,提出了增强观赏植物抗旱性的创新方法 | NA | 开发抗旱观赏植物品种,提高观赏园艺的可持续性 | 观赏植物 | NA | NA | CRISPR/Cas9、合成生物学、数字表型分析、多组学方法 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 观赏植物 | NA | 农业, 环境 |
1129 | 2025-10-05 |
Robust and highly efficient transformation method for a minimal mycoplasma cell
2025-Mar-20, Journal of bacteriology
IF:2.7Q3
DOI:10.1128/jb.00415-24
PMID:39903184
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研究论文 | 开发了一种针对最小支原体细胞JCVI-syn3B的稳健高效转化方法 | 首次系统研究最小细胞JCVI-syn3B的生长状态与转化效率关系,发现指数生长早期具有最高转化效率,并建立了冷冻保存转化就绪细胞的方法 | NA | 开发高效的最小支原体细胞转化方法 | 最小支原体细胞JCVI-syn3B | 合成生物学 | NA | 细胞转化技术 | NA | 实验数据 | NA | NA | 支原体JCVI-syn3B | NA | 生物技术研究 |
1130 | 2025-10-05 |
A new flavor of synthetic yeast communities sees the light
2025-Mar-12, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.02008-23
PMID:39912663
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综述 | 本文综述了利用合成生物学和光遗传学技术构建人工酵母群落的最新进展 | 重点介绍了利用光遗传学在群落水平上通过光刺激调控酵母表型的新方法 | NA | 探索合成微生物群落用于研究自然系统复杂性和生物相互作用的潜力 | 人工酵母群落 | 合成生物学 | NA | 光遗传学 | NA | NA | NA | NA | 酵母 | 细胞通讯设计、生物传感器、逻辑运算 | 代谢工程、生物传感、模式形成 |
1131 | 2025-10-05 |
Innovative logic "AND" gate gene circuits for bladder cancer treatment: preclinical study
2025-Mar-01, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000002270
PMID:39903549
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研究论文 | 本研究开发了一种用于膀胱癌治疗的逻辑“与”门双靶点基因电路,通过整合多个信号实现对膀胱癌细胞信号通路的全面重编程 | 设计了逻辑“与”门双靶点基因电路,能够同时识别多个癌症特异性生物标志物,实现更精准的癌细胞靶向治疗 | 目前仍处于临床前研究阶段,尚未进行人体试验 | 开发针对膀胱癌的精准基因治疗策略 | 膀胱癌细胞 | 合成生物学 | 膀胱癌 | 生物信息学分析,基因电路工程 | NA | 基因表达数据 | NA | 合成生物学方法 | 膀胱癌细胞 | 逻辑“与”门双靶点基因电路,仅在多个癌症特异性生物标志物异常表达时激活 | 医学 |
1132 | 2025-10-05 |
Spatial Control of CAR T Cell Activation Using Tumor-Homing Polymers
2025-Feb-12, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.4c15442
PMID:39902740
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研究论文 | 开发了一种名为IMPACT的新型框架,通过聚合物介导实现CAR-T细胞在肿瘤部位的空间特异性激活 | 首次将合成生物学与生物材料方法结合,创建了具有IF-THEN逻辑门控的CAR-T细胞系统,实现解剖学层面的精准控制 | 目前仅在鼠类肿瘤模型中验证,尚未进行人体临床试验 | 提高CAR-T细胞疗法的特异性,减少脱靶毒性 | 工程化CAR-T细胞和肿瘤归巢聚合物 | 合成生物学 | 肿瘤 | 合成生物学、生物材料工程 | IF-THEN逻辑门控系统 | 实验数据 | 鼠类肿瘤模型 | 合成生物学方法 | T细胞 | IF-THEN逻辑门控电路:当CAR-T细胞与肿瘤定位聚合物结合时,驱动特定蛋白在肿瘤内选择性表达 | 医学 |
1133 | 2025-10-05 |
Innovations and challenges in collagen and gelatin production through precision fermentation
2025-Feb-06, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-025-04276-z
PMID:39910024
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综述 | 本文全面概述了通过精密发酵技术生产胶原蛋白和明胶的方法及其在食品领域的应用 | 系统探讨了精密发酵技术作为传统动物源生产替代方案的创新潜力,重点关注重组技术、合成生物学和生物工艺优化的最新进展 | NA | 分析精密发酵技术在胶原蛋白和明胶生产中的创新与挑战 | 重组胶原蛋白和明胶的生产技术 | NA | NA | 精密发酵、重组技术、合成生物学、生物工艺优化 | NA | NA | NA | NA | 基因工程微生物 | NA | 食品, 化妆品, 医疗保健, 制药 |
1134 | 2025-10-05 |
An inorganic mineral-based protocell with prebiotic radiation fitness
2023-12-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-43272-5
PMID:38052788
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研究论文 | 提出一种基于无机矿物共凝聚液滴的辐射耐受原始细胞模型 | 首次构建具有辐射耐受性的分区化原始细胞模型,利用非酶抗氧化系统实现辐射防护 | 尚未验证在真实远古地球环境中的长期适应性 | 研究原始细胞在极端前生物辐射条件下的生存适应性 | 基于多聚磷酸盐-锰和聚磷酸盐-三肽的共凝聚液滴系统 | 合成生物学 | NA | 共凝聚液滴组装技术 | 原始细胞模型 | 实验数据 | NA | NA | NA | 分区化原始细胞结构,包含辐射保护外层和核样凝聚物内层 | 合成生物学, 药物递送系统 |
1135 | 2025-10-05 |
Living therapeutics: Precision diagnosis and therapy with engineered bacteria
2025-Oct, Biomaterials
IF:12.8Q1
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综述 | 本文综述了工程化细菌在癌症精准诊疗中的最新进展与应用前景 | 系统整合合成生物学与化学工程技术,开发具有增强可控性、靶向递送和降低毒性的细菌治疗平台 | 未涉及具体临床实验数据,主要聚焦技术原理与理论框架 | 推动工程化细菌疗法在精准肿瘤学领域的发展 | 经过基因工程和化学修饰的细菌平台 | 合成生物学 | 癌症 | 基因工程、化学修饰 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly, BioBrick | 工程化细菌 | 靶向递送系统、免疫激活回路、肿瘤微环境调节通路 | 医学 |
1136 | 2025-10-05 |
Synthetic biology of Fusarium for the sustainable production of valuable bioproducts
2025 Jul-Aug, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108579
PMID:40222460
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综述 | 本文综述了如何利用合成生物学技术优化镰刀菌属作为可持续生物制品生产平台 | 整合CRISPR/Cas9、RNA干扰和合成启动子等先进工程工具,结合系统生物学方法提升镰刀菌代谢工程精度 | 代谢瓶颈、调控复杂性和菌株稳定性仍是工业级应用的主要障碍 | 开发镰刀菌作为环境友好型生物生产系统的潜力 | 镰刀菌属真菌 | 合成生物学 | NA | 二代测序、组学技术、CRISPR/Cas9、RNA干扰 | NA | 基因组数据、代谢组数据 | NA | CRISPR-Cas9, RNA干扰, 合成启动子 | 镰刀菌 | 代谢通路工程 | 能源, 医药, 工业生物技术 |
1137 | 2025-10-05 |
Semantical and geometrical protein encoding toward enhanced bioactivity and thermostability
2025-May-02, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.98033
PMID:40314227
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研究论文 | 提出一种整合蛋白质序列和几何信息的预训练框架,用于预测蛋白质变体的功能效应和热稳定性 | 开发了同时编码蛋白质序列和三维几何结构的新型预训练框架,能够更全面地捕捉蛋白质折叠稳定性、分子相互作用和生物功能等关键信息 | NA | 提高蛋白质变体效应预测的准确性和全面性,促进高效的蛋白质工程 | 蛋白质序列和三维结构 | 机器学习 | NA | 深度学习 | 预训练框架 | 蛋白质序列和结构数据 | 超过300个深度突变扫描实验 | NA | NA | NA | 工业生物技术 |
1138 | 2025-10-05 |
Construction of P450 scaffold biocatalysts for the biodegradation of five chloroanilines
2025-May-05, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2025.137305
PMID:39854990
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研究论文 | 本研究通过工程化改造P450BM3单加氧酶活性位点,开发了能高效降解五种氯苯胺类污染物的人工生物催化剂 | 首次通过将保守苏氨酸268突变为天冬氨酸,成功诱导P450BM3产生过加氧酶活性,无需NAD(P)H或双功能小分子即可实现高效催化 | NA | 开发高效降解氯苯胺类环境污染物的生物催化剂 | 五种氯苯胺类化合物(4-氯苯胺、2-氯苯胺、2,4-二氯苯胺、3,4-二氯苯胺和3,5-二氯苯胺) | 合成生物学 | NA | 蛋白质工程、UPLC-MS分析 | NA | 酶活性数据、质谱数据 | 五种氯苯胺化合物 | 定点突变 | NA | NA | 环境 |
1139 | 2025-10-05 |
Carbon cycle of polyhydroxyalkanoates (CCP): Biosynthesis and biodegradation
2025-Mar-15, Environmental research
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.envres.2025.120904
PMID:39842755
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综述 | 本文介绍了聚羟基脂肪酸酯的碳循环概念,包括其生物合成途径、碳转化过程及在不同环境中的降解机制 | 首次提出聚羟基脂肪酸酯碳循环(CCP)概念,系统阐述芳香族单体生物合成途径及多环境降解过程 | PHA生产成本效益控制仍存挑战,降解产物再利用技术不成熟,对PHA合成与降解碳途径认识有限 | 深入理解PHA作为生物材料的可持续利用价值,推动绿色低碳发展 | 聚羟基脂肪酸酯(PHAs)及其降解产物 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | 文献数据 | NA | NA | 微生物 | 芳香族单体生物合成途径 | 环境保护, 生物医药 |
1140 | 2025-10-05 |
Rational multienzyme architecture design with iMARS
2025-Mar-06, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2024.12.029
PMID:39855196
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研究论文 | 开发了一种名为iMARS的标准化框架,用于快速设计最优多酶空间结构 | 通过整合高通量活性测试和结构分析,首次实现了可预测性能的多酶结构工程 | NA | 研究多酶空间结构对催化效率的影响并开发优化设计方法 | 多酶复合物和人工融合酶 | 合成生物学 | NA | 高通量活性测试、结构分析 | NA | 酶活性数据、结构数据 | NA | iGEM | NA | 多酶级联反应系统、代谢通路 | 工业生物技术, 环境, 材料 |