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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
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1141 | 2025-10-05 |
Construction and characterization of a mutant library for the P23 constitutive promoter in lactic acid bacteria
2025-Mar, Journal of biotechnology
IF:4.1Q2
DOI:10.1016/j.jbiotec.2025.01.015
PMID:39848497
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研究论文 | 本研究通过随机诱变构建了乳酸菌P23组成型启动子的突变体库,并评估了其在基因表达调控中的应用潜力 | 首次通过随机诱变构建了具有显著活性差异的P23启动子突变体库,并验证了其在乳酸菌中的特异性 | 突变体库仅包含247个突变体,可能未覆盖所有可能的突变类型 | 丰富乳酸菌启动子库资源,为代谢工程和合成生物学应用提供工具 | 乳酸菌P23组成型启动子及其突变体 | 合成生物学 | NA | 易错PCR、dNTP类似物随机诱变、高通量筛选 | NA | 荧光强度、酶活性数据 | 247个启动子突变体 | NA | Streptococcus thermophilus, Lactobacillus plantarum, Lactococcus lactis, Escherichia coli | 组成型启动子突变库 | 工业生物技术 |
1142 | 2025-10-05 |
Advances in magnetic nanoparticles for molecular medicine
2025-Feb-13, Chemical communications (Cambridge, England)
DOI:10.1039/d4cc05167j
PMID:39846549
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综述 | 本文综述了磁性纳米颗粒在分子医学中的最新进展,包括传统临床应用及其在基因组编辑和合成生物学等新兴领域的整合 | 磁性纳米颗粒通过外部磁场实现对生物过程的精确远程控制,为基因组编辑和细胞治疗等新兴领域开辟了新途径 | NA | 总结磁性纳米颗粒的临床应用并探索其在分子医学中的整合,以启发新一代疾病治疗平台的开发 | 磁性纳米颗粒及其在分子医学中的应用 | 纳米医学 | NA | 磁性纳米颗粒技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
1143 | 2025-10-05 |
Towards microbial consortia in fermented foods for metabolic engineering and synthetic biology
2025-Feb, Food research international (Ottawa, Ont.)
DOI:10.1016/j.foodres.2025.115677
PMID:39849795
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综述 | 本文综述发酵食品中微生物群落相互作用机制及其在代谢工程和合成生物学中的应用前景 | 系统阐述发酵食品中微生物相互作用机制,并提出将新型发酵剂与天然微生物群落结合开发功能性发酵食品的新视角 | NA | 探讨发酵食品中微生物相互作用机制及其在代谢工程和合成生物学中的应用潜力 | 发酵食品中的微生物群落及其相互作用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 细菌, 酵母 | NA | 食品, 工业生物技术 |
1144 | 2025-10-05 |
[Research progress in the design and application of whole-cell biosensors for antibiotics]
2025-Jan-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.240400
PMID:39855682
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综述 | 本文全面总结了抗生素全细胞生物传感器的研究进展,包括其设计原理和应用 | 对抗生素全细胞生物传感器进行了系统分类(特异性与通用型),并详细阐述了两类传感器的设计原理 | NA | 为其他抗生素全细胞生物传感器的构建和应用提供参考 | 抗生素全细胞生物传感器 | 合成生物学 | NA | 全细胞生物传感技术 | NA | NA | NA | NA | 微生物细胞 | 生物传感器,能将抗生素信号转换为可读信号 | 环境监测,药物发现,食品安全 |
1145 | 2025-10-05 |
[Effects of exogenous additives on growth and high-value bioproducts accumulation of microalgae]
2025-Jan-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.240335
PMID:39855687
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综述 | 综述外源添加剂对微藻生长和高价值生物产物积累的影响及其分子机制 | 系统梳理了外源添加剂在微藻生物合成中的应用类型、作用效果和分子机制,填补了该领域分类总结的空白 | 对添加剂类型、应用、靶向菌株和分子机制的分类总结不够全面 | 为研究人员利用合成生物学方法开发合适的细胞底盘和利用微藻进行工业生产提供信息 | 微藻 | 合成生物学 | NA | 表型筛选 | NA | NA | NA | NA | 微藻 | NA | 能源, 食品和药物, 环境保护 |
1146 | 2025-10-05 |
[Regulatory roles of DGAT and PDAT genes in plant oil synthesis]
2025-Jan-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.240376
PMID:39855689
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综述 | 本文系统综述了DGAT和PDAT基因在植物油脂合成中的调控作用及分子机制 | 全面总结DGAT和PDAT在植物油脂合成中的生物学功能及其在合成生物学背景下的应用前景 | NA | 深入理解植物油脂合成的分子机制并提高油料作物的品质和产量 | DGAT和PDAT基因及其在植物油脂合成中的调控作用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 植物 | 油脂合成代谢通路 | 农业 |
1147 | 2025-10-05 |
[Enzymatic MBH reaction catalyzed by an artificial enzyme designed with the introduction of an unnatural tertiary amine cofactor]
2025-Jan-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.240223
PMID:39855701
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研究论文 | 本研究通过将非天然辅因子DMAP引入蛋白质骨架,成功构建了能催化不对称MBH反应的人工酶 | 首次通过点击化学策略将DMAP辅因子引入蛋白质骨架构建人工酶,实现了非天然MBH反应的不对称催化 | 对映选择性较低(38%),催化效率有待进一步提升 | 开发新型人工酶并拓展非天然生物催化反应 | 人工酶催化体系 | 合成生物学 | NA | 点击化学策略 | NA | NA | NA | 点击化学 | NA | 人工酶设计,以DMAP辅因子为催化中心 | 工业生物技术 |
1148 | 2025-10-05 |
[An efficient assembly method for a viral genome based on T7 endonuclease Ⅰ-mediated error correction]
2025-Jan-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.240302
PMID:39855702
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研究论文 | 本研究开发了一种基于T7核酸内切酶Ⅰ介导纠错的高效病毒基因组组装方法 | 通过合理拆分10kb病毒基因组并利用T7核酸内切酶Ⅰ进行多阶段纠错,显著降低错误率至0.36错误/kb | NA | 优化基因合成流程,降低错误率并简化合成步骤 | 约10kb的病毒基因组 | 合成生物学 | NA | 两步PCR、T7核酸内切酶Ⅰ纠错、测序 | NA | DNA序列数据 | NA | T7核酸内切酶Ⅰ | NA | NA | 工业生物技术 |
1149 | 2025-10-05 |
Recent advances in engineering non-native microorganisms for poly(3-hydroxybutyrate) production
2025-Jan-24, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-025-04261-6
PMID:39849243
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综述 | 本文综述了利用代谢工程和合成生物学技术改造非天然微生物生产聚(3-羟基丁酸酯)的最新进展 | 全面总结了所有用于PHB生物合成的非天然微生物宿主,并讨论了通过辅因子工程、代谢途径重构和细胞形态工程等不同代谢工程方法增强PHB生产 | 需要进一步的基因工程方法使非天然微生物宿主更适合大规模PHB生产 | 提高非天然微生物生产聚(3-羟基丁酸酯)的能力 | 非天然微生物宿主 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、合成生物学 | NA | NA | NA | CRISPR/Cas9 | 大肠杆菌 | PHB生物合成途径 | 医药, 生物医药 |
1150 | 2025-10-05 |
BAC-browser: the tool for synthetic biology
2025-Jan-23, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-025-06049-9
PMID:39849360
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研究论文 | 开发了用于合成基因组学的图形界面程序BAC-browser v.2.1,帮助非生物信息学用户设计核酸序列和组装DNA序列 | 提供了集成多种功能的图形界面工具,包括从氨基酸序列生成核酸序列、限制性位点可视化、GC分析和DNA序列组装工具 | NA | 开发合成基因组学专用软件工具 | DNA序列设计和组装工具 | 合成生物学 | NA | DNA序列设计、寡核苷酸组装、热力学比对 | NA | 核酸序列、氨基酸序列 | NA | BAC-browser | NA | NA | 合成生物学 |
1151 | 2025-10-05 |
Physiology-informed use of Cupriavidus necator in biomanufacturing: a review of advances and challenges
2025-Jan-22, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-025-02643-x
PMID:39844200
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综述 | 本文综述了利用贪铜菌进行生物制造的生理学基础研究进展与挑战 | 提出基于生理学特征的贪铜菌工程化策略,强调代谢专业化、自养发酵优化和专用合成生物学工具开发 | 现有工具和应用常忽视贪铜菌独特的生理学和代谢特征 | 推动基于贪铜菌的可持续生物制造技术发展 | 贪铜菌(Cupriavidus necator)及其在生物制造中的应用 | NA | NA | 合成生物学、代谢工程、发酵技术 | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | Cupriavidus necator | 天然聚-3-羟基丁酸酯合成途径 | 工业生物技术, 环境 |
1152 | 2025-10-05 |
Development of a Komagataella phaffii cell factory for sustainable production of ( +)-valencene
2025-Jan-21, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-025-02649-5
PMID:39838465
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研究论文 | 本研究开发了一种利用Komagataella phaffii微生物细胞工厂可持续生产(+)-缬草烯的方法 | 首次在K. phaffii中通过CRISPR/Cas9系统引入(+)-缬草烯合酶,并通过多种代谢工程策略将产量提高82倍 | 研究仅在摇瓶水平进行验证,尚未进行大规模发酵优化 | 开发可持续生产(+)-缬草烯的微生物细胞工厂 | Komagataella phaffii工程菌株及其(+)-缬草烯生产能力 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9基因编辑、代谢工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | Komagataella phaffii | 萜类化合物生物合成途径,包括MVA途径关键基因IDI1、tHMG1、ERG12、ERG19的过表达,ERG9启动子删除,法尼基焦磷酸合酶与(+)-缬草烯合酶融合蛋白 | 食品,饮料,化妆品 |
1153 | 2025-10-05 |
Recent trends and advances in chloroplast engineering and transformation methods
2025, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2025.1526578
PMID:40313723
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综述 | 本文全面总结了叶绿体工程和转化方法的新兴技术,重点讨论了现代转化载体构建所需的合成生物学要素 | 聚焦叶绿体工程中的新兴技术和合成生物学方法,探讨多基因表达技术突破 | 该技术目前主要局限于模式物种,尚未实现商业化应用,需要扩展到更多重要农作物 | 总结叶绿体转化技术进展,探讨其在农业和医药领域的应用潜力 | 叶绿体基因组和转质体植物 | 合成生物学 | NA | 叶绿体转化技术 | NA | NA | NA | NA | 植物 | 多基因表达系统 | 农业, 医药 |
1154 | 2025-10-05 |
Enhancing the physiological characteristics of chimeric antigen receptor natural killer cells by synthetic biology
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1592121
PMID:40313937
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综述 | 本文综述了合成生物学在增强嵌合抗原受体自然杀伤细胞生理特性方面的最新进展 | 探讨了自然杀伤细胞与合成生物学工具包的协同作用,为开发能应对实体瘤挑战的新一代CAR-NK疗法提供路线图 | NA | 通过合成生物学方法增强CAR-NK细胞的生理特性,改善其在免疫抑制肿瘤微环境中的持久性和功能 | 嵌合抗原受体自然杀伤细胞 | 合成生物学 | 实体瘤 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
1155 | 2025-10-05 |
Machine learning reveals novel compound for the improved production of chitooligosaccharides in Escherichia coli
2025-May-25, New biotechnology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.nbt.2025.01.005
PMID:39827984
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研究论文 | 本研究利用机器学习模型和特征重要性分析,发现铁元素能显著提高大肠杆菌中壳寡糖的产量 | 首次将机器学习与特征分析相结合,从复杂代谢通路中识别出能提高壳寡糖产量的新化合物——铁 | 工程步骤可能无法带来足够改进,且代谢瓶颈可能隐藏在数百个代谢反应中 | 优化壳寡糖的生物合成途径,提高其在大肠杆菌中的产量 | 壳寡糖(COS)的生物合成途径 | 机器学习 | NA | 机器学习模型,特征重要性分析 | NA | 代谢生产数据 | 工程化转录调控因子库 | NA | 大肠杆菌 | 壳寡糖生物合成途径 | 工业生物技术 |
1156 | 2025-10-05 |
Creating a Halotolerant Degrader for Efficient Mineralization of p-Nitrophenol-Substituted Organophosphorus Pesticides in High-Saline Wastewater
2025-Apr, Biotechnology and bioengineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/bit.28923
PMID:39821562
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研究论文 | 本研究通过合成生物学方法构建了一种耐盐工程菌J9U-MP,用于高效降解高盐废水中的对硝基酚取代有机磷农药 | 首次将有机磷农药降解途径与血红蛋白基因整合至耐盐底盘菌,实现了高盐环境下农药的完全矿化 | 研究仅针对特定有机磷农药,未验证对其他污染物的降解能力 | 开发适用于高盐废水处理的生物强化技术 | 对硝基酚取代有机磷农药(如甲基对硫磷)及其降解中间体 | 环境生物技术 | NA | 基因工程、RT-PCR、气相色谱、稳定同位素分析 | NA | 基因表达数据、降解效率数据、稳定性数据 | 工程菌J9U-MP在60g/L NaCl废水中的降解实验 | 基因组整合 | Halomonas cupida J9 | 包含mpd/pnpABCDEF七个基因的异源降解途径,以及VHb和GFP基因 | 环境 |
1157 | 2025-10-05 |
Next-generation metabolic models informed by biomolecular simulations
2025-Apr, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2025.103259
PMID:39827498
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综述 | 探讨如何将生物分子模拟与机器学习预测整合到代谢模型中,推动结构引导的合成生物学应用 | 首次系统提出将生物分子模拟与机器学习预测整合到代谢建模框架中,开创结构引导合成生物学新范式 | NA | 优化/理解代谢途径以改善蛋白质和小分子产品的生物生产 | 从微生物到人类的各种生物体的细胞代谢 | 计算生物学 | NA | 生物分子模拟、机器学习、通量平衡分析 | NA | NA | NA | NA | 微生物 | 代谢途径优化 | 健康,环境,能源,可持续性 |
1158 | 2025-10-05 |
Advances in designed bionanomolecular assemblies for biotechnological and biomedical applications
2025-Apr, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2024.103256
PMID:39827499
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综述 | 本文综述了蛋白质工程在生物纳米分子组装体设计方面的最新进展及其在生物技术和生物医学领域的应用 | 整合人工智能工具(AlphaFold、RFDiffusion、ProteinMPNN)显著提升了从头设计的可扩展性和成功率 | NA | 探讨蛋白质工程在功能性治疗和生物技术应用中的生物纳米分子组装体设计进展 | 有限组装体(纳米笼、卷曲螺旋结构)和扩展组装体(丝状结构、2D/3D晶格) | 合成生物学 | NA | 蛋白质工程、人工智能辅助设计 | AlphaFold、RFDiffusion、ProteinMPNN | NA | NA | NA | NA | 分子封装结构、功能蛋白域展示结构、细胞支架工程 | 生物技术, 生物医学, 材料科学 |
1159 | 2025-10-05 |
Using synthetic biology to express nitrogenase biosynthesis pathway in rice and to overcome barriers of nitrogenase instability in plant cytosol
2025-Apr, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2024.12.002
PMID:39818476
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研究论文 | 通过合成生物学方法将固氮酶生物合成途径导入水稻,并克服植物细胞质中固氮酶不稳定的障碍 | 首次成功将包含13个基因的固氮酶生物合成途径导入水稻,并鉴定出NifH-S18是导致蛋白降解的关键残基,获得了具有Fe蛋白活性且抗植物内切蛋白酶切割的NifH变体 | NA | 在谷物中实现生物固氮以减少化学氮肥使用 | 转基因水稻植株 | 合成生物学 | NA | 多基因载体转化、有性杂交、基因组测序分析 | NA | 基因组测序数据、蛋白质表达数据 | 两个F杂交水稻品系L12-13和L8-17 | 多基因载体 | 水稻 | 固氮酶生物合成途径(包含nifB、nifH、nifD、nifK、nifE、nifN、nifX、hesA、nifV、nifS、nifU、groES、groEL共13个基因) | 农业 |
1160 | 2025-10-05 |
Artificial intelligence driven innovations in biochemistry: A review of emerging research frontiers
2025-Mar-07, Biomolecules & biomedicine
DOI:10.17305/bb.2024.11537
PMID:39819459
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综述 | 本文综述了人工智能在生物化学领域的创新应用,重点关注数据分析、分子建模、酶工程和代谢通路研究 | 系统评估了AI在生物化学中的新兴研究前沿,包括蛋白质结构预测工具AlphaFold的应用以及AI在个性化医疗和合成生物学中的潜力 | 面临数据质量、模型可解释性和伦理问题等挑战 | 探索人工智能在生物化学领域的当前和潜在应用 | 生物化学研究中的复杂数据集、分子相互作用和药物发现过程 | 机器学习 | NA | 机器学习算法、自然语言处理、AI分子建模 | NA | 文献数据、分子数据、生物化学数据 | NA | NA | NA | NA | 医学、工业生物技术 |