合成生物学相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
1161	2024-09-23	At-home, cell-free synthetic biology education modules for transcriptional regulation and environmental water quality monitoring 2023-Jan-09, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2023.01.09.523248 PMID:36711593	研究论文	开发了四个稳定的无细胞生物传感教育模块，用于转录调控和环境水质监测	开发了无需专业实验室设备或研究人员监督的稳定无细胞生物传感教育模块，适用于家庭和课堂使用	NA	解决合成生物学领域中STEM从业者培训的不足，提供易于使用的教育模块	K-12教师和130名高中学生	合成生物学	NA	无细胞生物传感技术	NA	NA	130名高中学生
1162	2024-09-23	Structural Basis of Substrate Promiscuity and Catalysis by the Reverse Prenyltransferase N-Dimethylallyl-l-tryptophan Synthase from Fusarium fujikuroi 2022-09-20, Biochemistry IF:2.9Q3 DOI:10.1021/acs.biochem.2c00350 PMID:36084241	研究论文	研究了来自Fusarium fujikuroi的反向异戊烯基转移酶N-二甲基烯丙基-L-色氨酸合酶（DMATS1）的底物多样性和催化机制	揭示了DMATS1酶具有广泛的底物特异性，能够利用不同的异戊烯供体和受体进行正向和反向异戊烯化反应，并催化C-N和C-O键形成反应	NA	阐明DMATS1酶的结构基础及其在底物多样性和催化中的作用	DMATS1酶及其与L-色氨酸或L-酪氨酸以及非活性硫代二磷酸类似物的复合物	NA	NA	晶体结构分析	NA	晶体结构	NA
1163	2024-09-23	Engineering the next generation of cell-based therapeutics 2022-09, Nature reviews. Drug discovery DOI:10.1038/s41573-022-00476-6 PMID:35637318	研究论文	本文探讨了下一代细胞疗法的工程化方法及其在治疗难治性疾病中的潜力	本文介绍了通过基因组和表观基因组编辑、合成生物学和生物材料的使用等下一代工程方法来解决细胞疗法面临的挑战	本文未详细讨论具体的临床试验结果或实际应用案例	探讨如何通过工程化方法克服细胞疗法的局限性，推动其广泛应用和商业化	细胞疗法在治疗难治性疾病中的应用及其面临的挑战	NA	NA	基因组编辑、表观基因组编辑、合成生物学	NA	NA	NA
1164	2024-09-23	Synthetic gene circuits for preventing disruption of the circadian clock due to interleukin-1-induced inflammation 2022-05-27, Science advances IF:11.7Q1 DOI:10.1126/sciadv.abj8892 PMID:35613259	研究论文	本文研究了通过合成基因电路防止白细胞介素-1诱导的炎症对生物钟的破坏	开发了能够抵抗炎症影响的基因工程软骨，保护生物钟节律	NA	研究如何通过合成生物学和组织工程技术保护生物钟免受炎症影响	小鼠诱导多能干细胞（miPSCs）衍生的基因工程软骨	合成生物学	骨关节炎	合成生物学	NA	软骨组织	小鼠诱导多能干细胞（miPSCs）衍生的基因工程软骨
1165	2024-09-23	Parameterized Computational Framework for the Description and Design of Genetic Circuits of Morphogenesis Based on Contact-Dependent Signaling and Changes in Cell-Cell Adhesion 2022-04-15, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.0c00369 PMID:35363477	研究论文	本文构建了一个参数化的计算框架，用于描述和设计基于接触依赖信号传导和细胞间粘附变化的形态发生遗传电路	提出了一个参数化的计算框架，能够预测发育轨迹并推荐新的网络实现，以形成之前未报告的四层结构	模型目前仅限于特定的细胞系统和分子工具，未来需要扩展以包括其他形式的通信或效应器	开发一个计算框架，用于设计和预测基于接触依赖信号传导和细胞间粘附变化的形态发生遗传电路	基于接触依赖信号传导和细胞间粘附变化的形态发生遗传电路	合成生物学	NA	计算建模	参数化模型	细胞间通信网络和细胞粘附数据	使用了一组可用的结果（训练集）和测试集数据
1166	2024-09-23	Modular design of synthetic receptors for programmed gene regulation in cell therapies 2022-04-14, Cell IF:45.5Q1 DOI:10.1016/j.cell.2022.03.023 PMID:35427499	研究论文	本文介绍了一种用于细胞疗法中编程基因调控的合成受体的模块化设计	开发了一种名为合成跨膜蛋白水解受体（SNIPRs）的新型受体，具有可调节的感应和转录响应能力	NA	开发适用于临床转化的可定制转录受体	合成受体在治疗细胞中的自主控制功能	合成生物学	NA	跨膜蛋白水解调控	NA	NA	NA
1167	2024-09-23	Material Engineering in Gut Microbiome and Human Health 2022, Research (Washington, D.C.) DOI:10.34133/2022/9804014 PMID:35958108	review	本文综述了材料工程在肠道微生物组与人类健康研究中的关键作用	本文首次将肠道微生物组与材料研究两个领域结合起来进行全面综述	NA	旨在加速肠道微生物组研究工具的开发及针对肠道微生物组的疗法研究	肠道微生物组及其在人类健康中的作用	NA	NA	NA	NA	NA	NA
1168	2024-09-22	MutaT7GDE: A Single Chimera for the Targeted, Balanced, Efficient, and Processive Installation of All Possible Transition Mutations In Vivo 2024-Sep-20, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.4c00316 PMID:39190860	研究论文	本文介绍了一种名为MutaT7GDE的单融合酶系统，用于在体内靶向、平衡、高效和连续地安装所有可能的转换突变	本文利用新设计的底物非特异性广义脱氨酶（GDE），建立了一个基于单一融合酶的简化系统，能够靶向脱氧腺苷和脱氧胞苷，实现更高效的突变安装	NA	开发一种新的合成生物学工具，用于在实验室进化过程中多样化目标基因	MutaT7融合蛋白及其在靶向突变中的应用	合成生物学	NA	脱氨酶-T7 RNA聚合酶融合技术	NA	基因序列	四种不同的MutaT7构建体
1169	2024-09-22	Integrating Deep Learning and Synthetic Biology: A Co-Design Approach for Enhancing Gene Expression via N-Terminal Coding Sequences 2024-Sep-20, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.4c00371 PMID:39229974	研究论文	本文介绍了一种结合深度学习和合成生物学的协同设计方法，用于通过N端编码序列优化基因表达	提出了一种新的深度学习/合成生物学协同设计流程，用于N端编码序列的优化，能够在有限训练数据下显著提高基因表达	仅在绿色荧光蛋白和N-乙酰神经氨酸的表达中进行了验证，尚未在更广泛的基因和生物系统中进行测试	开发一种高效的方法来优化N端编码序列，以提高基因表达	N端编码序列和基因表达	合成生物学	NA	深度学习	时间序列网络	序列数据	六个迭代实验
1170	2024-09-22	SeqImprove: Machine-Learning-Assisted Curation of Genetic Circuit Sequence Information 2024-Sep-20, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.4c00392 PMID:39230953	研究论文	开发了一种名为SeqImprove的机器学习辅助工具，用于基因电路序列信息的整理	SeqImprove利用命名实体识别、实体归一化和序列匹配技术，自动生成机器可访问的序列数据和元数据注释，简化了作者提交序列数据的过程	NA	解决合成生物学中因文献研究和复制不完整记录工作而导致的进度和实用性受限问题	基因电路序列信息	机器学习	NA	命名实体识别、实体归一化、序列匹配	NA	序列数据	NA
1171	2024-09-22	Orthogonal Serine Integrases Enable Scalable Gene Storage Cascades in Bacterial Genome 2024-Sep-20, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.4c00505 PMID:39238421	研究论文	介绍了一种利用正交丝氨酸整合酶在细菌基因组中实现可扩展基因存储级联的方法	首次提出了一种利用正交丝氨酸整合酶实现多基因稳定存储的方法，并展示了其在合成生物学中的应用潜力	NA	开发一种可扩展的基因存储工具，用于在细菌基因组中稳定存储异源DNA	利用正交丝氨酸整合酶在MG1655细菌染色体中稳定存储多个异源基因	合成生物学	NA	正交丝氨酸整合酶（TP901-1, Bxb1, PhiC31）	NA	DNA片段	MG1655细菌株
1172	2024-09-22	ReCARving the future: bridging CAR T-cell therapy gaps with synthetic biology, engineering, and economic insights 2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2024.1432799 PMID:39301026	综述	本文综述了CAR T细胞疗法在血液恶性肿瘤治疗中的革命性进展，并探讨了其在更广泛肿瘤应用中面临的挑战和最新解决方案	本文介绍了CAR T细胞工程、新型抗原靶向策略、递送和肿瘤微环境持久性改进等方面的创新，以及异基因CAR T细胞作为现成疗法的开发	本文未提供具体的技术细节或实验数据，主要集中在综述和讨论现有研究进展	探讨CAR T细胞疗法在癌症治疗中的未来发展方向，并提出增强其安全性、有效性和可及性的策略	CAR T细胞疗法在血液恶性肿瘤和实体瘤中的应用及其面临的挑战	NA	血液恶性肿瘤	CAR T细胞疗法	NA	NA	NA
1173	2024-09-22	Dynamic Gene Expression Mitigates Mutational Escape in Lysis-Driven Bacteria Cancer Therapy 2024, Biodesign research DOI:10.34133/bdr.0049 PMID:39301524	研究论文	研究了工程细菌在肿瘤治疗中的应用，特别是通过动态基因表达策略优化治疗效果	提出了动态基因表达策略，通过短时间重复诱导基因表达，减轻突变逃逸的影响，从而提高治疗细菌的持久性和治疗效果	研究主要集中在实验室条件下，尚未在临床环境中验证	优化工程细菌在肿瘤治疗中的应用，提高治疗效果和持久性	非致病性细菌表达的Perfringolysin O毒素及其动态表达策略	生物工程	癌症	分子动力学	数学模型	基因序列数据	NA
1174	2024-09-21	A Simple and Effective Strategy for the Development of Robust Promoter-Centric Gene Expression Tools 2024-Sep-20, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.4c00092 PMID:39120429	研究论文	本文介绍了一种简单有效的策略，用于开发基于启动子的基因表达工具	通过在启动子的原始-35区域上游引入额外的-35样基序，并结合在5'-UTR区域整合回文-元素，生成了一系列强效的组成型和诱导型基因表达工具	NA	开发强效的基因表达工具，以推动菌株工程和合成生物学研究	基因表达工具的开发和优化	合成生物学	NA	基因工程	NA	基因序列	NA
1175	2024-09-21	GOLDBAR: A Framework for Combinatorial Biological Design 2024-Sep-20, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.4c00296 PMID:39162314	研究论文	本文介绍了一种名为GOLDBAR的组合设计框架，用于支持合成生物学中的组合生物设计	GOLDBAR框架允许合成生物学家交叉和合并整个生物设计类别的规则，以提取共同的设计基序并推断新的设计	NA	开发一种支持生物设计组合的框架，以促进自动化分析和机器学习	TetR同源转录逻辑电路的设计空间、部分基因簇的组装以及rebeccamycin的生物合成	合成生物学	NA	组合设计	NA	生物设计规则	NA
1176	2024-09-21	Multilevel Systematic Optimization To Achieve Efficient Integrated Expression of Escherichia coli 2024-Sep-20, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.4c00280 PMID:39262282	研究论文	本文系统优化了大肠杆菌基因组整合表达系统，通过筛选最佳整合位点、评估内源启动子并结合T7启动子，以及过量表达T7 RNA聚合酶，实现了高效稳定的异源基因表达	开发了一种名为CEIES_Ecoli的稳定高效基因表达系统，无需抗生素或诱导剂，适用于合成生物学和酶工程等领域	NA	优化大肠杆菌基因组整合表达系统，提高异源基因的表达效率	大肠杆菌BL21 (DE3)基因组中的异源基因表达	合成生物学	NA	基因组编辑	NA	基因组数据	18个整合位点，16个内源启动子
1177	2024-09-21	Evaluating the Contribution of Model Complexity in Predicting Robustness in Synthetic Genetic Circuits 2024-Sep-20, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.3c00708 PMID:39264040	研究论文	本文比较了三种不同遗传电路实现的五种计算模型，评估其在预测合成电路性能和噪声韧性方面的相对预测能力	探讨了在缺乏特征化部件或现有设计的情况下，简单模型是否能与复杂模型得出相似结论，并评估了不同模型在分析上的优势	当需要准确量化失败概率时，使用更精确的模型需要额外的努力	评估模型复杂性在预测合成遗传电路鲁棒性中的贡献	三种不同遗传电路实现的五种计算模型	合成生物学	NA	计算建模	NA	模拟数据	五种计算模型，三种遗传电路实现
1178	2024-09-21	Yeast Surface-Displayed Quenchbody as a Novel Whole-Cell Biosensor for One-Step Detection of Influenza A (H1N1) Virus 2024-Sep-20, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.4c00317 PMID:39256183	研究论文	开发了一种基于酵母表面展示的Quenchbody新型全细胞生物传感器，用于一步检测流感A（H1N1）病毒	提出了一种新的全细胞生物传感器设计，通过在酵母细胞表面展示VHH-based quenchbody，实现对流感A（H1N1）病毒的一步检测，避免了分析物进入生物传感器细胞的需求	NA	开发一种敏感、高效且成本效益高的方法来检测空气中的病毒，以防止传染病的传播并保障人类健康	流感A（H1N1）病毒及其血凝素蛋白H1N1-HA	生物传感器	流感	酵母表面展示技术	NA	生物分子	17种VHH抗体片段
1179	2024-09-21	Exploring the potential of plant astrobiology: adapting flora for extra-terrestrial habitats: a review 2024-Sep-20, Biologia futura IF:1.8Q3 DOI:10.1007/s42977-024-00245-z PMID:39302628	综述	探讨植物天体生物学领域，研究地球植物适应外星环境的可能性及其在太空任务中的应用	结合植物学和天体生物学，探讨植物在太空和其他天体上生存和繁殖的适应机制	主要集中在理论探讨和现有研究的综述，缺乏实际实验数据	探讨植物天体生物学的潜力及其在太空探索中的应用	地球植物在外星环境中的适应性和生存机制	NA	NA	基因改造和合成生物学技术	NA	NA	NA
1180	2024-09-21	Tunable cell differentiation via reprogrammed mating-type switching 2024-Sep-17, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-52282-w PMID:39289346	研究论文	本研究通过合成生物学方法重新编程酵母的交配类型转换机制，实现可调节的细胞分化	引入了一种合成生物学方法，重新编程酵母的交配类型转换机制，用于可调节的细胞分化，促进合成微生物群落的形成和合作	NA	开发一种新的合成生物学方法，用于可调节的细胞分化和微生物群落合作	酵母的交配类型转换机制和微生物群落的合作	合成生物学	NA	遗传逻辑门工程	NA	NA	NA