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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2026-03-02 |
Phylogenetic analysis and functional characterization of norcoclaurine synthase involved in benzylisoquinoline alkaloids biosynthesis in Stephania tetrandra
2024-10, Journal of cellular physiology
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/jcp.31065
PMID:37357496
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研究论文 | 本研究从防己科植物粉防己中分离并功能表征了去甲乌药碱合酶(NCS),揭示了其在苄基异喹啉生物碱生物合成中的作用,并成功在工程酵母中实现去甲乌药碱的生产 | 首次在防己科植物中鉴定并功能表征NCS基因,填补了该科植物中NCS基因研究的空白,并通过系统发育分析揭示了NCS的进化关系和结构功能关联 | 研究主要基于体外酶活性和酵母工程,未在植物体内验证NCS功能,且样本来源仅限于粉防己,可能缺乏对其他防己科植物的普适性分析 | 探究粉防己中NCS基因在苄基异喹啉生物碱生物合成中的功能,并利用合成生物学方法在酵母中生产去甲乌药碱 | 粉防己(Stephania tetrandra)中的去甲乌药碱合酶(NCS)基因 | 合成生物学 | NA | 系统发育分析、体外酶活性测定、酵母工程 | NA | 基因序列、酶活性数据 | 从粉防己中分离的NCS基因 | 酵母工程 | 酵母 | 将功能表征的StNCS基因整合到工程酵母中,构建去甲乌药碱生物合成途径 | 医药 |
| 102 | 2026-03-01 |
Editing and synthetic applications of chloroplast genomes
2026-Feb-26, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2026.101783
PMID:41761616
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综述 | 本文综述了叶绿体基因组编辑与合成应用的最新进展,包括基因组最小化、高效编辑和代谢途径重设计 | 整合了叶绿体基因组精简、精准编辑工具和代谢途径动态调控等前沿技术,为下一代叶绿体工程铺平道路 | NA | 优化叶绿体功能,实现高价值化合物的从头生物合成和作物性状改良 | 植物和藻类的叶绿体基因组 | 合成生物学 | NA | 基因组编辑、代谢途径重设计 | NA | NA | NA | NA | 植物、藻类 | 代谢途径重设计、能量代谢动态调控 | 农业、生物技术 |
| 103 | 2026-03-01 |
"Lys-Leu" Motif Empowers Expedient OaAEP1-Catalyzed Generation of N‑Terminal Cysteine Recombinant Proteins for Bioconjugation and Semisynthesis
2026-Feb-23, JACS Au
IF:8.5Q1
DOI:10.1021/jacsau.5c01395
PMID:41755832
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研究论文 | 本研究报道了一种基于“Lys-Leu”基序辅助的AEP1酶催化切割方法,用于高效生成N端半胱氨酸重组蛋白,以用于生物偶联和半合成应用 | 该方法显著提高了P2'位所有20种天然氨基酸的切割效率,兼容多种底物(包括难处理的包涵体蛋白),并实现了一步法原位生成与功能化 | NA | 开发一种高效、通用的位点特异性蛋白质修饰平台 | N端半胱氨酸重组蛋白 | 合成生物学与化学生物学 | NA | AEP1酶催化切割 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学(活细胞成像、治疗开发) |
| 104 | 2026-03-01 |
Recognition of Non-standard Base Pairs by Triplex-Forming Oligonucleotides Containing an Expanded Genetic Alphabet
2026-Feb-17, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-8652009/v1
PMID:41756467
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研究论文 | 本文通过使用人工扩展遗传信息系统(AEGIS)的核碱基,扩展了三链形成寡核苷酸(TFOs)对双链DNA的序列特异性识别能力,实现了在pH中性条件下对标准、损伤或合成碱基对的高亲和力靶向 | 利用AEGIS核碱基系统性地评估了120种碱基三联体组合,识别出至少12种新的模块化三联体,可在pH中性条件下以纳摩尔亲和力靶向双链DNA,突破了天然核碱基的限制 | NA | 扩展三链形成寡核苷酸对双链DNA的序列特异性识别能力,以克服天然核碱基在靶向序列和pH稳定性方面的限制 | 三链形成寡核苷酸(TFOs)、双链DNA、标准/损伤/合成碱基对、AEGIS核碱基 | 合成生物学 | NA | Hoogsteen碱基配对、化学和酶法合成TFOs | NA | NA | 120种碱基三联体组合 | AEGIS(人工扩展遗传信息系统) | NA | NA | 医学、分子传感、核酸纳米技术 |
| 105 | 2026-03-01 |
Strategies for Improving Aptamer Screening Efficiency: Library Design, Awareness Innovation, and Instrument Assistance
2026, Critical reviews in analytical chemistry
IF:4.2Q1
DOI:10.1080/10408347.2024.2411244
PMID:39378058
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综述 | 本文综述了提高适配体筛选效率的策略,包括库设计、筛选意识创新和仪器辅助 | 总结了SELEX优化策略,通过合理库设计、新颖筛选意识和先进设备,将筛选轮数显著减少至<8轮,时间缩短至<3周,并提升适配体性能 | NA | 提供适配体筛选方法的实用参考,以克服SELEX在初始库盲目性、耗时和性能不足方面的挑战 | 适配体及其筛选方法,特别是SELEX技术 | 合成生物学 | NA | SELEX(指数富集的配体系统进化) | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 生物传感器、疾病治疗、合成生物学 |
| 106 | 2026-03-01 |
Exploring structural, functional, evolutionary, and genetic characteristics of sugar transporters in maize and their roles in abiotic stress tolerance
2026, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0342990
PMID:41746965
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研究论文 | 本文通过生物信息学分析鉴定了玉米中的60个糖转运蛋白,并研究了它们在非生物胁迫耐受性中的潜在作用 | 首次在玉米中系统鉴定和表征糖转运蛋白家族,并通过干湿实验结合的方法揭示了它们在非生物胁迫响应中的调控机制 | 研究主要基于生物信息学预测和初步实验验证,需要进一步的体内功能验证来确认转运蛋白的具体作用机制 | 探索玉米糖转运蛋白的结构、功能和进化特征,及其在非生物胁迫耐受性中的作用 | 玉米糖转运蛋白家族 | 生物信息学 | NA | RNA-Seq, qRT-PCR, 系统发育分析, 共表达分析, 分子对接 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 蛋白质序列数据 | 60个玉米糖转运蛋白 | NA | 玉米 | NA | 农业 |
| 107 | 2026-03-01 |
Vesicle constriction by rings of Janus nanoparticles and aggregates of curved proteins
2019-Aug-23, Nanotechnology
IF:2.9Q2
DOI:10.1088/1361-6528/ab1ed5
PMID:31048566
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研究论文 | 本文研究了Janus纳米颗粒环和弯曲蛋白质聚集体对囊泡的机械收缩作用,通过模拟和实验揭示了膜收缩的机制 | 首次报道了Janus纳米颗粒环和弯曲蛋白质聚集体作为合成纳米结构模拟收缩蛋白和支架蛋白,诱导囊泡自发收缩,并揭示了高度弯曲F-BAR结构域在细胞分裂中的重要作用 | 研究基于模拟和理论模型,可能未完全覆盖实际生物系统中的复杂动态因素,且实验验证部分未在摘要中详细说明 | 探究膜收缩和分裂的机制,设计膜收缩纳米结构以应用于合成生物学 | 囊泡、Janus纳米颗粒环、弯曲蛋白质聚集体(如DNA折纸支架) | 合成生物学 | NA | Monte Carlo模拟、模拟退火、弹性膜模型 | NA | 模拟数据 | NA | DNA折纸 | NA | NA | 合成生物学 |
| 108 | 2026-02-28 |
Preparation strategies and biomedical applications of DNA hydrogels
2026-Feb-25, Chemical science
IF:7.6Q1
DOI:10.1039/d5sc08190d
PMID:41657654
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综述 | 本文总结了DNA水凝胶的制备策略及其在细胞培养、药物递送和组织工程等生物医学领域的应用进展 | 系统性地将DNA纳米技术与合成生物学相结合,利用DNA作为结构框架或交联剂构建具有生物组织相似性的三维网络结构,并突出其高生物相容性、可编程响应性和特异性识别功能 | 讨论了DNA水凝胶发展当前面临的挑战,但未在摘要中具体说明 | 总结DNA水凝胶的制备策略,分析其应用优势,并展望未来研究方向 | DNA水凝胶 | 材料科学 | NA | DNA纳米技术、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 生物医学 |
| 109 | 2026-02-28 |
Metabolic engineering of microorganisms for the valorization of C2 feedstocks
2026-Feb-25, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2026.103457
PMID:41747573
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综述 | 本文综述了微生物代谢工程在将C2原料转化为高价值化学品和材料方面的最新进展 | 强调了合成生物学、酶工程、基因组尺度代谢模型和人工智能驱动设计的整合,以构建下一代、电气化和数字引导的C2生物精炼厂 | NA | 探索微生物代谢工程在C2原料增值化中的应用 | 微生物,包括大肠杆菌、假单胞菌属和光合宿主,以及C2原料 | NA | NA | 代谢工程、合成生物学、酶工程、基因组尺度代谢模型、人工智能驱动设计 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 大肠杆菌, 假单胞菌属, 光合宿主 | 反向β-氧化、基于醛醇缩合的碳延伸、硫胺素焦磷酸依赖性模块 | 工业生物技术, 能源, 材料 |
| 110 | 2026-02-28 |
Synthetic gene circuits that selectively target RAS-driven cancers
2026-Feb-24, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.104320
PMID:41733988
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研究论文 | 本文提出了一种合成基因电路,通过整合多个RAS传感器来选择性靶向RAS驱动的癌症细胞,表达治疗性蛋白 | 结合多个RAS传感器以提高癌症选择性,实现前所未有的突变RAS细胞特异性输出蛋白表达 | NA | 开发针对RAS驱动癌症的新型合成基因电路治疗策略 | RAS驱动的癌症细胞 | 合成生物学 | 癌症 | 合成基因电路设计 | NA | NA | NA | NA | 哺乳动物细胞 | 整合多个RAS传感器的合成基因电路,用于选择性表达治疗性蛋白 | 医学 |
| 111 | 2026-02-28 |
Bioorthogonal and synthetic biology-engineered bacterial outer membrane vesicles for enhanced photo-immunotherapy
2026-Feb-23, Acta biomaterialia
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.actbio.2026.02.044
PMID:41740694
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研究论文 | 本研究开发了一种结合生物正交化学与合成生物学工程改造的细菌外膜囊泡(OMV)平台,用于增强乳腺癌的光热免疫治疗 | 通过合成生物学改造细菌使其自主产生富含IL-2的OMV,并整合生物正交靶向(N3/DBCO系统)与光热治疗(ICG),实现了程序化免疫调节与肿瘤特异性递送的多功能协同 | 未明确说明临床前研究的动物模型具体类型及长期安全性评估数据 | 克服传统OMV在肿瘤免疫治疗中载药能力有限、肿瘤蓄积不足和快速清除的障碍 | 乳腺癌肿瘤模型 | 合成生物学 | 乳腺癌 | 合成生物学改造、电穿孔封装、代谢糖工程、生物正交化学 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 细菌(具体菌种未指明) | 通过基因工程使亲本细菌持续表达白细胞介素-2(mIL2)并富集于外膜囊泡 | 医学 |
| 112 | 2026-02-28 |
Engineered Bacteria as living detectors of tumor DNA: A new diagnostic frontier
2026-Feb-20, Clinica chimica acta; international journal of clinical chemistry
DOI:10.1016/j.cca.2026.120914
PMID:41724454
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综述 | 本文综述了利用合成生物学技术设计基因工程细菌作为生物传感器,用于原位检测肿瘤来源DNA(特别是KRAS突变)的最新进展、策略与应用前景 | 将基因工程细菌与CRISPR-Cas工具结合,利用细菌的自然感受态和水平基因转移能力,实现对肿瘤突变DNA的特异性识别与报告输出,开创了肿瘤DNA活体检测的新诊断范式 | 存在生物安全性、定植效率以及检测灵敏度限制等挑战 | 开发基于工程细菌的肿瘤DNA生物传感器,用于癌症的精准诊断与个性化治疗 | 肿瘤来源的DNA(特别是驱动癌症的KRAS突变) | 合成生物学 | 结直肠癌、胃肠道癌及其他实体瘤 | CRISPR-Cas工具、水平基因转移、同源重组 | NA | DNA序列 | NA | CRISPR-Cas | 多种细菌物种 | 用于特异性检测突变DNA序列的生物传感器电路,包含选择性靶向、整合突变序列及产生可观察报告输出的遗传回路 | 医学 |
| 113 | 2026-02-28 |
Research progress and applications of reverse genetics systems for infectious bronchitis virus
2026-Feb, Poultry science
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.psj.2025.106312
PMID:41447763
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综述 | 本文系统回顾了传染性支气管炎病毒反向遗传学系统的发展、应用与挑战,并展望了未来整合CRISPR/Cas9等技术的方向 | 全面梳理了多种反向遗传学平台(如痘病毒支持系统、体外连接转录等)在IBV研究中的应用,并探讨了其作为多病原疫苗载体的潜力 | 存在技术障碍、安全考虑和知识缺口,具体限制未在摘要中详细说明 | 研究传染性支气管炎病毒的反向遗传学技术,以推动病原研究、疫苗设计和抗病毒靶点发现 | 传染性支气管炎病毒 | NA | NA | 反向遗传学,包括痘病毒支持系统、体外连接转录、靶向RNA重组、细菌人工染色体克隆、转化相关重组、环状聚合酶延伸反应 | NA | NA | NA | CRISPR/Cas9 | NA | NA | 医学(疫苗开发、抗病毒研究) |
| 114 | 2026-02-28 |
Microbiome-driven resistance in cervical cancer therapy: from mechanistic dissection to clinical translation
2025-Dec-29, Expert reviews in molecular medicine
IF:4.5Q2
DOI:10.1017/erm.2025.10029
PMID:41457383
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综述 | 本文综述了微生物组在宫颈癌治疗耐药性中的作用,从机制解析到临床转化的最新进展 | 系统性地将阴道微生物群失调与宫颈癌治疗耐药性联系起来,并提出了基于微生物组的干预策略,包括合成生物学驱动的精准微生物组疗法 | NA | 探讨微生物组如何驱动宫颈癌治疗耐药性,并评估基于微生物组的干预策略的临床转化潜力 | 宫颈癌患者及其相关的阴道微生物组 | NA | 宫颈癌 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 | 工程细菌 | NA | 医学 |
| 115 | 2026-02-28 |
STAGE: A compact and versatile TnpB-based genome editing toolkit for Streptomyces
2025-Sep-02, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2509146122
PMID:40857323
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研究论文 | 本研究开发了一种基于TnpB的紧凑型基因组编辑工具包STAGE,用于链霉菌的高效、精确基因编辑 | 首次在链霉菌中建立了基于ISDra2 TnpB的基因组编辑平台,其效应蛋白大小仅为Cas9的三分之一,并开发了单碱基编辑和多重编辑系统,通过AI辅助蛋白质工程将编辑效率提升至近100% | NA | 开发适用于链霉菌的高效、精确基因组编辑工具 | 链霉菌(Streptomyces) | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas系统、TnpB辅助基因组编辑、AI辅助蛋白质工程 | NA | NA | 两种工业重要链霉菌菌株 | CRISPR-Cas, TnpB | 链霉菌(Streptomyces) | 基因组编辑平台、单碱基编辑系统(C·G-to-T·A)、多重编辑系统 | 工业生物技术 |
| 116 | 2026-02-28 |
Potential and Optimization of Mammalian Splice Riboswitches for the Regulation of Exon Skipping-Dependent Gene Expression and Isoform Switching within the ALOX5 Gene
2025-03-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00731
PMID:40011207
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研究论文 | 本研究探讨了合成核糖开关在哺乳动物细胞中通过控制选择性剪接来调控基因表达的潜力,特别是在ALOX5基因中的应用 | 提出了通过基因特异性内含子和外显子序列的上下文适应来优化核糖开关功能,并开发了能够切换5-LO野生型与缺失外显子13的异构体表达的新型核糖开关剪接概念 | 合成核糖开关在真核系统中控制基因表达的功能通常限于特定基因或细胞类型 | 研究合成核糖开关在调控哺乳动物细胞中基因表达和异构体切换的潜力与优化方法 | 人工花生四烯酸5-脂氧合酶基因(ALOX5)在HEK293细胞中的表达调控 | 合成生物学 | NA | 选择性剪接调控、核糖开关技术 | NA | 基因表达数据 | 使用HEK293细胞系 | 合成核糖开关、基因编辑 | 哺乳动物细胞(HEK293) | 四环素核糖开关控制的盒式外显子系统,用于调控选择性剪接和异构体切换 | 医学、合成生物学 |
| 117 | 2026-02-28 |
Synthetic Lipid Biology
2025-Feb-26, Chemical reviews
IF:51.4Q1
DOI:10.1021/acs.chemrev.4c00761
PMID:39805091
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综述 | 本文正式提出“合成脂质生物学”这一新兴领域,整合化学、生物学、物理学和工程学方法,以合成和操纵脂质及生物膜来理解其复杂性质与功能 | 首次将跨学科研究系统化为“合成脂质生物学”框架,强调通过构建与分析脂质及膜系统来深化理解,类比合成生物学的核心理念 | NA | 通过合成、编辑和检测脂质及生物膜,揭示其性质、行为和功能,以应对脂质生物学复杂性 | 脂质分子、生物膜及其与蛋白质的相互作用 | 合成生物学 | NA | 化学合成、化学酶法合成、光遗传学、蛋白质工程、生物正交化学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 118 | 2026-02-27 |
InsiliCoil: An Integrated Software Suite for Coiled Coil Design, Prediction, and Therapeutic Engineering
2026-Feb-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00678
PMID:41370672
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研究论文 | 本文介绍了一个名为InsiliCoil的集成软件套件,用于卷曲螺旋的设计、预测和治疗性工程 | 将预测建模、选择性肽抑制剂发现和正交相互作用组设计统一到一个单一的可访问框架中,提供比基于结构的方法快几个数量级的通量 | NA | 开发一个用于控制螺旋介导的蛋白质-蛋白质相互作用的综合平台,以加速治疗发现和可编程生物系统的理性工程 | 卷曲螺旋(CCs)作为合成生物学中的模块化、可编程构建块以及治疗靶点 | 合成生物学 | NA | 预测建模、高通量筛选、计算设计 | NA | 蛋白质序列和结构数据 | NA | InsiliCoil软件套件 | NA | 正交卷曲螺旋网络,用于合成生物电路和生物材料 | 医学, 工业生物技术 |
| 119 | 2026-02-27 |
Multilayer Host Engineering of Saccharomyces cerevisiae to Enhance Cricket Paralysis Virus (CrPV) Internal Ribosome Entry Site Mediated Translation
2026-Feb-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00744
PMID:41546634
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研究论文 | 本文通过多层宿主工程改造酿酒酵母,以增强蟋蟀麻痹病毒内部核糖体进入位点介导的翻译 | 提出了一种结合翻译起始、tRNA修饰和mRNA稳定性三个机制层面的宿主工程策略,显著提升CrPV IRES活性 | NA | 增强非典型翻译系统中的IRES活性,以扩展合成生物学中的RNA调控工具 | 酿酒酵母和蟋蟀麻痹病毒内部核糖体进入位点 | 合成生物学 | NA | 报告基因筛选、宿主工程改造 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 酿酒酵母 | 内部核糖体进入位点介导的翻译系统 | 工业生物技术 |
| 120 | 2026-02-27 |
The Coli Toolkit (CTK): An Extension of the Modular Yeast Toolkit for Use in E. coli
2026-Feb-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00489
PMID:41581077
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研究论文 | 本文介绍了Coli Toolkit (CTK),一个基于Golden Gate的模块化克隆系统,适用于大肠杆菌,旨在加速遗传电路的组装 | CTK通过将启动子部分细分为启动子、绝缘核酶和核糖体结合位点,提供了更灵活的转录和翻译控制,并整合了Cello库的20个NOT门作为预组装基本部件 | NA | 开发一个用于大肠杆菌的模块化克隆系统,以优化遗传电路的设计-构建-测试-学习循环 | 遗传电路和DNA组装工具 | 合成生物学 | NA | Golden Gate克隆 | NA | NA | NA | Golden Gate Assembly | E. coli | 遗传电路,包括启动子、绝缘核酶、核糖体结合位点和NOT门 | 生物技术 |