合成生物学相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['synthetic biology']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价9.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 4965 篇文献，本页显示第 101 - 120 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2026-05-11 |
Plant formins pave the way for endosymbiosis
2026-May-08, Trends in plant science
IF:17.3Q1
DOI:10.1016/j.tplants.2026.04.017
PMID:42106252
|
研究论文 | 本文揭示了formin蛋白在豆科植物根瘤菌侵染和多种植物菌根共生中协调细胞骨架重排的机制 | 发现单个formin蛋白能同时协调根瘤菌侵染和菌根形成两种不同的内共生过程，为工程化微生物进入作物提供新靶点 | 未提供具体实验数据或工程应用验证，仅基于Qiao等人研究进行概念阐述 | 阐明植物formin蛋白在有益微生物内共生中的核心作用机制 | 豆科植物和多种植物的根细胞，涉及根瘤菌和丛枝菌根真菌 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 豆科植物、多种植物 | 内共生信号通路调控模块（formin介导的细胞骨架重排途径） | 农业, 合成生物学 |
| 102 | 2026-05-11 |
Astaxanthin biomanufacturing under hierarchical constraints: Integrating synthetic biology and artificial intelligence for scalable production
2026-May-07, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108915
PMID:42105954
|
综述 | 提出一种分层约束管理的AI辅助框架，用于虾青素的可扩展生物制造 | 将虾青素生物合成重新概念化为分层约束管理问题，并提出一种层级对齐的AI辅助框架，在不同生物尺度上利用不同AI模型（如蛋白质语言模型、图学习、CNN和LLM）来协同优化生产 | 该框架是概念性的，尚未经过实验验证，且文章未讨论实际实施中的具体挑战或数据需求 | 解决虾青素可扩展生物制造中由生物复杂性导致的多尺度约束问题 | 虾青素生物合成过程中的分子、途径和系统级约束 | 合成生物学 | NA | NA | 蛋白质语言模型、图学习模型、卷积神经网络、多模态学习、大型语言模型 | 序列数据、网络拓扑数据、多组学数据 | NA | NA | NA | 虾青素生物合成途径 | 工业生物技术 |
| 103 | 2026-05-11 |
Recombinant human serum albumin-A paradigm shift: From laboratory development to industrial-scale production, and clinical translation
2026-May-03, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108914
PMID:42086096
|
review | 综述了重组人血清白蛋白从实验室开发到工业规模生产和临床转化的路径 | 提出rHSA生产平台（酵母和转基因大米）的选择不仅基于产量，而是综合考虑规模化、成本效益、监管可行性和兼容下一代纯化策略的优化集成 | 实现rHSA全部潜力面临生产规模化经济挑战、产品一致性保障，以及利用合成生物学和智能制造开发新一代多功能生物治疗药物的突破 | 综述rHSA工业化路径，验证其生物相似性和安全性，并展望其在药物递送和先进疗法中的应用 | 重组人血清白蛋白 | 生物技术 | NA | 重组蛋白生产 | NA | NA | NA | 合成生物学 | Komagataella phaffii, 转基因大米 | NA | 医学, 工业生物技术 |
| 104 | 2026-05-11 |
Synthetic biology-driven innovations in triple-negative breast cancer: Integrating engineering design with targeted therapeutics
2026-May-02, Journal of biotechnology
IF:4.1Q2
DOI:10.1016/j.jbiotec.2026.04.017
PMID:42082082
|
综述 | 综述合成生物学驱动三阴性乳腺癌治疗的创新方法，整合工程设计原理与靶向治疗策略 | 系统性地将合成生物学（包括工程化免疫细胞、基因回路、工程菌、iPSCs和CRISPR/Cas编辑）应用于TNBC的精准治疗和诊断，强调多系统协同克服肿瘤异质性和耐药性 | 未提及具体临床转化障碍、技术安全性和免疫原性问题及长期疗效评估 | 总结合成生物学在TNBC精准治疗和诊断中的最新进展，探讨其克服肿瘤异质性、增强治疗特异性和克服耐药性的潜力 | 三阴性乳腺癌及相关合成生物学技术（CAR-T细胞、合成基因回路、工程菌、iPSCs、CRISPR/Cas系统） | 数字病理学 | 乳腺癌 | 合成生物学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 人类细胞, 细菌 | 合成基因回路, 嵌合抗原受体, 肿瘤特异性递送系统 | 医学 |
| 105 | 2026-05-11 |
Deciphering GB1's Single Mutational Landscape: Insights from MuMi Analysis
2024-08-22, The journal of physical chemistry. B
DOI:10.1021/acs.jpcb.4c04916
PMID:39115184
|
研究论文 | 利用MuMi分析解读GB1蛋白单点突变景观及其对IgG-Fc结合的影响 | 提出MuMi（Mutation and Minimization）作为一种可靠且计算高效的蛋白质适应度景观预测工具，相比传统方法具有显著优势 | NA | 揭示GB1蛋白单点突变影响其与IgG-Fc结合亲和力的分子基础 | 链球菌蛋白G的C2片段（GB1）及其与人类IgG Fc域的结合 | 计算生物学 | NA | MuMi分析，分子动力学模拟（MD） | NA | 蛋白质序列与结构数据 | 所有可能的单点突变（数量未明确）及野生型GB1的2微秒分子动力学模拟 | NA | NA | NA | 药物设计，合成生物学 |
| 106 | 2026-05-11 |
Plasmid Vectors for in Vivo Selection-Free Use with the Probiotic E. coli Nissle 1917
2021-01-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.0c00466
PMID:33301298
|
研究论文 | 开发用于益生菌大肠杆菌Nissle 1917的无选择标记体内质粒载体系统 | 将天然质粒pMUT1和pMUT2改造为稳健的工程平台，结合CRISPR-Cas9系统移除天然质粒，实现无抗生素选择下的稳定维持和功能性蛋白分泌 | 未提及 | 开发用于益生菌大肠杆菌Nissle 1917的无选择标记体内质粒载体平台 | 益生菌大肠杆菌Nissle 1917及其天然质粒pMUT1和pMUT2 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9 | NA | NA | 小鼠胃肠道实验 | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌Nissle 1917 | 质粒载体含选择标记、荧光标记、温度敏感表达和curli分泌系统 | 医学 |
| 107 | 2026-05-10 |
Prediction of gene expression levels in Saccharomyces cerevisiae based on chromatin accessibility using multiple machine learning models
2026-Aug, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
|
研究论文 | 基于染色质可及性使用多种机器学习模型预测酿酒酵母基因表达水平 | 首次使用染色质可及区域的k-mer特征通过监督机器学习模型预测基因表达，并发现与mRNA剪接相关的关键基序 | NA | 从染色质可及区域预测基因表达水平 | 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)的染色质可及区域和基因表达 | 机器学习 | NA | 机器学习建模、染色质可及性分析 | 监督机器学习模型(Yeast-Gene) | 序列数据(k-mer特征) | NA | NA | 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae) | NA | 合成生物学 |
| 108 | 2026-05-10 |
Amino acids in yeast fermentation: A review of their roles from nutrients to modulators
2026-Jul-02, International journal of food microbiology
IF:5.0Q1
|
综述 | 系统综述了酵母发酵中氨基酸从营养物质到调节因子的多重作用 | 首次全面整合了氨基酸在发酵体系中作为酵母性能关键调节因子的认识，涵盖其来源、摄取机制及对风味代谢和胁迫耐受性的调控作用 | 关于非酵母属酵母和真实发酵环境异质性的研究仍存在显著知识空白 | 系统阐明氨基酸与酵母的互作机制以优化发酵品质和效率 | 酵母发酵系统中的氨基酸及其对酿酒酵母和非酿酒酵母的影响 | 微生物学 | NA | 多组学、合成生物学、生态建模 | NA | 文献数据 | NA | NA | 酿酒酵母、非酵母属酵母 | NA | 食品工业、工业生物技术 |
| 109 | 2026-05-10 |
Bioconversion of carotenoids into high-value crocins using a marine sponge carotenoid cleavage dioxygenase
2026-Jun, The New phytologist
DOI:10.1111/nph.71118
PMID:41889127
|
研究论文 | 研究发现海绵来源的类胡萝卜素裂解双加氧酶（SdCDO）能裂解番茄红素和β-胡萝卜素生成藏花素前体，实现藏花素在番茄果实中的积累 | 首次揭示海洋海绵来源的CCD酶具有意外的酶促可塑性，能够将植物类胡萝卜素代谢重定向至藏花素生物合成途径，而非预期的视黄醇生成 | 未明确探讨SdCDO在天然海绵宿主中的生理功能，且研究仅在单一种植物（番茄）中进行验证 | 探索海洋海绵中类胡萝卜素裂解双加氧酶的功能多样性及其在合成生物学和作物生物强化中的应用潜力 | 海洋海绵Suberites domuncula的类胡萝卜素裂解双加氧酶（SdCDO） | 合成生物学 | NA | 异源表达、代谢组学分析、超微结构分析、转录组学分析 | NA | 代谢物数据、转录组数据 | 大肠杆菌和番茄果实样本 | NA | 大肠杆菌, 番茄 | 藏花素生物合成途径 | 农业, 工业生物技术 |
| 110 | 2026-05-10 |
Repurposing the Diatom Periplastidial Compartment for Heterologous Terpenoid Production
2026-May-08, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00919
PMID:42101919
|
研究论文 | 系统评估硅藻细胞质、叶绿体和周质体腔（PPC）中异源萜类化合物生产的可行性，并提出PPC作为可工程化的细胞内空间 | 首次系统揭示硅藻PPC中所有主要异戊烯基磷酸前体（DMAPP、GPP、FPP、GGPP）的可及性，并证明PPC可以直接整合到真核复杂叶绿体中，为区室化萜类工程提供新框架 | 不同区室和生产类别的效率存在差异，且未提及具体的代谢工程优化策略或长期稳定性数据 | 探索硅藻区室化工程在光合萜类生产中的潜力，特别是PPC的工程化应用 | 硅藻（三角褐指藻）的细胞质、叶绿体和周质体腔（PPC） | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 三角褐指藻 | 异源萜类生物合成途径（包括半萜、单萜、倍半萜和四萜） | 工业生物技术 |
| 111 | 2026-05-10 |
Sustainable production of natural sweeteners through synthetic biology
2026-May-07, Journal of bioscience and bioengineering
IF:2.3Q3
DOI:10.1016/j.jbiosc.2026.04.001
PMID:42103513
|
综述 | 本文系统总结了利用合成生物学技术生产天然甜味剂的研究进展，涵盖甜蛋白、萜类糖苷、黄酮类等12种代表性甜味剂的代谢途径和微生物合成方法 | 通过分析不同合成方案的优缺点及当前生产核心瓶颈，结合最新研究进展，为天然甜味剂的工业优化和可持续生产提供理论支持和技术参考 | 未对每种甜味剂的具体产业化成本与规模进行详细比较分析，可能缺乏实际应用验证 | 总结合成生物学在天然甜味剂可持续生产中的应用，并为未来工业优化提供指导 | 12种代表性天然甜味剂（包括甜蛋白、萜类糖苷、黄酮类、多元醇和单糖） | 合成生物学 | NA | 代谢工程、酶工程、微生物细胞工厂构建 | NA | 综述文献数据 | NA | NA | 微生物（如大肠杆菌、酿酒酵母等，具体未明确） | 代谢途径重构（涉及天然甜味剂的生物合成通路） | 食品、医药 |
| 112 | 2026-05-10 |
Profiling Selectivity for the Shigella Virulence Factor OspF
2026-May-05, Biochemistry
IF:2.9Q3
DOI:10.1021/acs.biochem.6c00109
PMID:42018782
|
研究论文 | 本研究通过合成磷酸肽和化学蛋白质组学方法，探究了志贺氏菌毒力因子OspF的底物选择性，发现其不仅能修饰MAPK家族蛋白，还能作用于多种细胞靶标 | 首次揭示OspF对MAPK家族内部的底物选择性，并发现其修饰范围远超MAPK家族，包括Rab1A和酪蛋白激酶2β等新靶标 | 未完全阐明OspF在志贺氏菌感染中的全部功能角色，需要进一步研究 | 研究志贺氏菌毒力因子OspF的底物选择性及其在宿主细胞中的修饰靶标 | 志贺氏菌分泌的磷酸苏氨酸裂合酶OspF | 微生物学, 化学生物学 | 细菌感染性疾病 | 合成磷酸肽分析, 化学蛋白质组学, 亲核膦化学探针 | NA | 蛋白质组数据 | 细胞裂解液样本和志贺氏菌感染样本 | NA | 志贺氏菌, 宿主细胞（被感染细胞） | NA | 医学, 化学生物学, 合成生物学 |
| 113 | 2026-05-10 |
Probiotics: From natural to artificial
2026-May-04, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108916
PMID:42092720
|
综述 | 系统总结了从天然益生菌到人工益生菌的转变过程及核心技术和应用 | 全面阐述了人工智能、高通量筛选、定向进化、基因工程、无痕基因编辑和原位工程等新技术在构建高性能人工益生菌中的应用 | 讨论了生物安全性评估、监管政策、体内适应性和剂量调控等主要挑战 | 为下一代人工益生菌的研究、临床转化和产业应用提供理论路线图 | 人工益生菌 | 生物工程 | NA | NA | NA | NA | NA | 无痕基因编辑, 原位工程 | NA | NA | 医学, 农业, 环境 |
| 114 | 2026-05-07 |
Followers' Choice: The Trends Transforming Precision Medicine, Synthetic Biology, and Sustainable Microbiology
2026-May, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.70370
PMID:42087404
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 115 | 2026-05-10 |
Combination of adaptive laboratory evolution and metabolic engineering on Vibrio natriegens for efficient production of 3-hydroxypropionic acid from ethanol
2026-Apr-29, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2026.134757
PMID:42067166
|
研究论文 | 结合适应性实验室进化与代谢工程，开发能高效利用乙醇生产3-羟基丙酸的海洋弧菌工程菌株 | 首次将适应性实验室进化与代谢工程相结合，将乙醇耐受性低的海洋弧菌改造成高效生产3-羟基丙酸的工程菌，并优化启动子和添加浅蓝菌素显著提升产量 | 研究主要基于摇瓶和1L生物反应器，未评估大规模工业发酵的稳定性和经济可行性 | 利用乙醇作为非粮碳源，通过工程海洋弧菌高效生产3-羟基丙酸 | 海洋弧菌（Vibrio natriegens）工程菌株 | 合成生物学 | NA | 适应性实验室进化（ALE）、代谢工程 | NA | NA | 3.10 g/L（摇瓶）、9.94 g/L（1L反应器）的3-羟基丙酸产量 | NA | 海洋弧菌（Vibrio natriegens） | 3-羟基丙酸生物合成通路 | 工业生物技术 |
| 116 | 2026-05-10 |
Opportunities for artificial intelligence and synthetic biology in designing living drug delivery systems
2026-Apr-27, Advanced drug delivery reviews
IF:15.2Q1
DOI:10.1016/j.addr.2026.115883
PMID:42055250
|
综述 | 探讨人工智能和合成生物学在设计活体药物递送系统中的应用与机遇 | 首次系统阐述人工智能如何助力合成生物学解决活体药物递送系统中受体设计、信号处理和基因回路构建等关键挑战 | 现有传统设计-构建-测试-学习方法在解析受体、信号处理和基因调控元件方面存在困难且通量低 | 综述人工智能和合成生物学在工程化人类细胞和细菌作为活体药物递送载体方面的进展与机遇 | 人类细胞和细菌作为活体药物递送载体 | 机器学习 | NA | 合成生物学 | NA | sequence | NA | NA | 人类细胞， 细菌 | 合成基因回路 | 医学 |
| 117 | 2026-05-10 |
Subcellular localization of enzymes involved in the biosynthesis of digoxin in Digitalis lanata
2026, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2026.1703671
PMID:41884437
|
研究论文 | 本文鉴定了毛地黄中地高辛生物合成三种已知酶的亚细胞定位 | 首次揭示了地高辛生物合成途径中P450酶定位在内质网，而3HSD和P5R2定位在细胞质，并发现毛地黄P450与哺乳动物同源酶（CYP11A1）的线粒体定位不同 | 研究仅限于烟草叶片中的瞬时表达，未在毛地黄原生细胞中验证；仅覆盖三种已知酶，途径的其他未知酶尚未涉及 | 阐明地高辛生物合成途径的空间组织，为合成生物学和代谢工程提供指导 | 毛地黄中地高辛生物合成的三种酶（P450、3HSD、P5R2） | 合成生物学 | 心血管疾病 | 荧光标记与共聚焦显微镜 | NA | 图像 | 烟草叶片中的瞬时表达实验 | NA | 烟草 | 地高辛生物合成途径 | 医药 |
| 118 | 2026-05-10 |
Myxobacteria: Versatile cell factories of novel commercial enzymes for bio-manufacturing
2025-Sep, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108594
PMID:40345460
|
综述 | 综述了粘细菌作为新型商业酶多功能细胞工厂在生物制造中的应用潜力 | 系统总结了粘细菌基因组多样性和裂解酶挖掘的最新进展，强调了粘细菌作为工业细胞工厂的未充分利用潜力 | 基因工程改造困难、生长缓慢、代谢重塑和表达策略限制等挑战尚未解决 | 探讨粘细菌及其酶在农业和工业生物制造中的应用前景 | 粘细菌及其裂解酶 | 机器学习 | NA | NA | NA | 基因组数据 | NA | 合成生物学策略 | 粘细菌 | NA | 农业, 工业生物技术 |
| 119 | 2026-05-10 |
Beyond pigments and perfumes: engineering in the carotenoid and apocarotenoid spectrum, novel enzymes, and synthetic biology strategies
2025, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2025.1716709
PMID:41625067
|
综述 | 探讨类胡萝卜素与脱辅基类胡萝卜素代谢途径的工程化策略，涵盖酶工程、合成生物学工具及宿主范围，并展望未来研究方向 | 采用通路模块化视角，系统梳理从前体供应到氧化裂解的每个酶促步骤，重点突出新发现酶变体、诱变研究、融合策略及区室化方法对代谢调控的贡献 | 仅聚焦近期文献，未对工业放大和具体产量指标进行量化比较，缺乏对经济性与规模化瓶颈的深入分析 | 为推进类胡萝卜素与脱辅基类胡萝卜素生物合成提供层次化路径理解与工程策略整合 | 类胡萝卜素与脱辅基类胡萝卜素代谢途径中的酶、宿主（植物、真菌、藻类、酵母、细菌）及合成生物学工具 | NA | NA | NGS、RNA-seq、CRISPR-Cas9、Golden Gate Assembly | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Golden Gate Assembly | 植物、真菌、藻类、酵母、细菌 | 类胡萝卜素生物合成通路（前体供应→GGPP→八氢番茄红素→脱饱和/异构化→环化→羟基化→酮基化→环氧化→氧化裂解） | 医学、农业、食品、工业生物技术 |
| 120 | 2026-05-09 |
Engineering Corynebacterium glutamicum as a multifunctional biofactory for living therapeutic materials and controlled ectoine delivery
2026-Aug, Biomaterials advances
IF:5.5Q2
DOI:10.1016/j.bioadv.2026.214847
PMID:41950672
|
研究论文 | 将谷氨酸棒杆菌工程化为多功能生物工厂，用于活体治疗材料和受控的依克多因递送 | 首次将谷氨酸棒杆菌作为多功能平台开发用于活体治疗材料，整合了生物感应、报告和依克多因生产功能，并实现了在聚合物基质中的封装与受控释放 | 未明确讨论在体内环境中的长期稳定性和免疫原性等潜在挑战 | 设计和构建工程化谷氨酸棒杆菌，用于活体治疗材料的开发及相关应用 | 谷氨酸棒杆菌菌株及基于聚合物的活体材料（膜-凝胶贴片和核壳水凝胶系统） | 合成生物学 | 炎症及应激相关疾病 | 合成生物学 | NA | 生物传感数据 | NA | 合成生物学 | Corynebacterium glutamicum | 生物传感器、报告系统、依克多因合成通路 | 医学, 环境 |