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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2026-01-14 |
Predictive design of tissue-specific mammalian enhancers that function in vivo in the mouse embryo
2025-Dec-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.22.695948
PMID:41497587
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研究论文 | 本研究提出了一种基于深度学习的通用策略,用于设计在小鼠胚胎中可靠发挥功能的组织特异性增强子 | 首次将深度学习模型应用于哺乳动物活体组织的增强子设计,成功实现了在复杂调控环境下对组织特异性基因表达的程序化控制 | 研究仅在小鼠胚胎中验证了三种组织(心脏、肢体、中枢神经系统)的增强子功能,尚未扩展到更多组织类型或成年动物模型 | 开发能够预测和设计在哺乳动物活体组织中有效工作的组织特异性增强子的通用框架 | 小鼠胚胎的心脏、肢体和中枢神经系统组织 | 机器学习 | NA | 深度学习,全基因组染色质可及性分析,迁移学习 | 卷积神经网络(CNN) | 基因组序列数据,染色质可及性数据 | 使用了已验证的人类和小鼠增强子数据进行迁移学习,并设计了15个合成增强子在小鼠胚胎中进行测试 | NA | 小鼠 | 组织特异性基因表达增强子 | 功能基因组学,合成生物学,基因治疗 |
| 102 | 2026-01-14 |
Active learning-guided optimization of cell-free biosensors for lead testing in drinking water
2025-Dec-20, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-66964-6
PMID:41422091
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研究论文 | 本文开发了一种基于机器学习的细胞游离基因表达工作流程,用于优化基于变构转录因子的生物传感器,以检测饮用水中的铅污染 | 采用多目标机器学习引导的细胞游离工作流程,结合方向性标签训练模型,快速优化生物传感器的灵敏度和选择性 | NA | 优化基于变构转录因子的生物传感器,用于环境监测和人类健康中的铅污染检测 | 变构转录因子PbrR作为生物传感器,用于饮用水中的铅检测 | 合成生物学 | NA | 细胞游离基因表达、机器学习模型训练 | 机器学习模型(未指定具体类型) | 序列到功能数据 | NA | CRISPR-Cas9(隐含于定向进化中,但未明确指定),机器学习框架 | 细胞游离系统(无特定宿主生物) | 基于变构转录因子的生物传感器,用于铅检测 | 环境监测 |
| 103 | 2026-01-14 |
Cyanobacteria-Derived Extracellular Vesicles: A Novel Frontier in Drug Delivery and Therapeutics
2025-Dec-19, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27010004
PMID:41515885
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综述 | 本文综述了蓝藻来源的细胞外囊泡作为新型药物递送载体的潜力、优势、应用领域及面临的挑战 | 首次系统性地探讨蓝藻细胞外囊泡作为专用纳米载体平台的潜力,并与现有合成载体进行比较分析 | 蓝藻细胞外囊泡的大规模分离和表征仍存在挑战,其相对于现有系统的具体优势和局限性尚未被系统总结 | 探索蓝藻细胞外囊泡在药物递送和治疗应用中的潜力 | 蓝藻来源的细胞外囊泡 | NA | 癌症、神经退行性疾病、感染性疾病 | 合成生物学、基因工程 | NA | NA | NA | NA | 蓝藻 | NA | 医药 |
| 104 | 2026-01-14 |
[Building on 40 Years, Now Pioneering the Future: Preface to the 40th Anniversary Issue of the Chinese Journal of Biotechnology]
2025-Nov-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.250804
PMID:41457585
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评论 | 本文是《中国生物技术杂志》创刊40周年特刊的序言,回顾了期刊的贡献并展望了未来 | 作为40周年特刊的序言,系统总结了期刊在推动中国生物技术创新与转化方面的历史作用 | NA | 纪念期刊创刊40周年,展示生物技术领域的最新进展并展望未来发展方向 | 《中国生物技术杂志》及其40周年特刊收录的40篇文章 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学、生物制造、健康、能源、农业 |
| 105 | 2026-01-14 |
Artificial intelligence in biology and medicine
2025-Oct-17, Die Naturwissenschaften
DOI:10.1007/s00114-025-02029-4
PMID:41107683
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综述 | 本文探讨了人工智能在生物学和医学领域的角色、应用、未来趋势、挑战及伦理问题 | 系统性地综述了AI在生物学多个子领域(如基因组学、蛋白质组学、生物技术、细胞与合成生物学)及医学领域(如诊断、疫苗开发、疾病治疗)的应用,并探讨了可解释AI、生物启发模型、以及AI与机器人学、纳米技术等先进技术的协同作用 | 分析了AI面临的局限与挑战,包括伦理与法律问题、数据质量问题以及标准化的需求 | 探讨人工智能在生物学和医学领域的应用潜力、未来发展方向及其带来的机遇与风险 | 人工智能技术及其在生物学(如基因组学、蛋白质组学、生物技术、细胞生物学、合成生物学)和医学(如疾病诊断、疫苗开发、治疗,包括COVID-19)中的应用 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 106 | 2026-01-14 |
Self-Assembly of Heterogeneous Ferritin Nanocages for Tumor Uptake and Penetration
2024-05, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202309271
PMID:38368258
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研究论文 | 本文介绍了一种基于合成生物学的策略,用于制造均匀可重复的蛋白质基纳米颗粒,以精确控制纳米颗粒的异质组分,并探索了纳米颗粒配体密度与肿瘤靶向/渗透之间的相互作用 | 开发了铁蛋白组装工具箱系统,实现了在大肠杆菌中细胞内组装铁蛋白亚基/变体,从而精确控制纳米颗粒的异质组分,并首次系统研究了纳米颗粒异质性对肿瘤摄取和渗透的影响 | NA | 探索纳米颗粒异质性在生物系统中的命运决定作用,特别是配体密度对肿瘤靶向和渗透的影响 | 铁蛋白杂合纳米笼(FHn),包含人铁蛋白重链和轻链 | 合成生物学 | 肿瘤 | 合成生物学策略,铁蛋白组装工具箱系统 | NA | NA | NA | 铁蛋白组装工具箱系统 | 大肠杆菌 | 铁蛋白杂合纳米笼的组装,涉及人铁蛋白重链和轻链的异质组合 | 医学 |
| 107 | 2026-01-14 |
Light Color-Controlled pH-Adjustment of Aqueous Solutions Using Engineered Proteoliposomes
2024-04, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202307524
PMID:38342618
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研究论文 | 本文介绍了一种利用工程化蛋白脂质体通过不同颜色光控制微升尺度溶液pH值的系统 | 开发了基于光驱动质子泵(细菌视紫红质和蓝光吸收蛋白视紫红质Med12)的蛋白脂质体系统,首次实现通过光颜色精确调控pH值 | 未明确说明系统的长期稳定性、规模化应用潜力或在不同环境条件下的性能限制 | 开发微升尺度pH控制技术,用于合成生物学和微流控应用 | 工程化蛋白脂质体系统及其在溶液pH调控中的应用 | 合成生物学 | NA | 光驱动质子泵技术、计算机控制反馈系统 | NA | 实验数据 | NA | 蛋白脂质体工程 | NA | 基于细菌视紫红质和蓝光吸收蛋白视紫红质Med12的反向质子泵膜系统 | 医学、工业、研究 |
| 108 | 2026-01-13 |
Wetting-Mediated Remodeling of the Cytoskeletal Cortex by Phase-Separated Condensates in Cell-Free Reactions
2026-Jan-12, Biomacromolecules
IF:5.5Q1
DOI:10.1021/acs.biomac.5c01410
PMID:41461602
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研究论文 | 本文介绍了一种合成生物学平台,整合无细胞转录翻译反应与相分离蛋白凝聚物,以研究其与细胞骨架元素的相互作用 | 开发了合成生物学平台,首次在无细胞反应中展示了相分离凝聚物通过润湿作用重塑细胞骨架皮层,揭示了毛细驱动收缩机制 | NA | 研究膜无细胞器与细胞骨架网络的相互作用机制 | 细菌肌动蛋白同源物MreB、相分离蛋白凝聚物、水-油液滴界面 | 合成生物学 | NA | 无细胞转录翻译(TXTL)反应 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 生物物理学、生物工程 |
| 109 | 2026-01-13 |
WRKY Transcription Factors: Integral Regulators of Defence Responses to Biotic Stress in Crops
2026-Jan-12, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70542
PMID:41524271
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综述 | 本文综述了WRKY转录因子作为植物特异性免疫调控核心,在作物响应真菌、细菌、病毒病原体及虫害等生物胁迫中的关键作用 | 系统整合了WRKY转录因子在抗病抗虫中的多维度调控机制,并前瞻性地提出结合多组学、精准基因编辑、合成生物学与人工智能等技术将其转化为作物育种靶点 | NA | 阐明WRKY转录因子在作物生物胁迫防御反应中的调控网络与分子机制 | 作物中的WRKY转录因子家族 | NA | NA | 多组学分析、基因组编辑、合成生物学、基因驱动技术、人工智能 | NA | NA | NA | 精准基因组编辑、基因驱动技术 | 作物 | WRKY为中心的调控模块(包括模式触发免疫、效应触发免疫、激素信号整合、次级代谢重编程等) | 农业 |
| 110 | 2026-01-13 |
Microbial Lossen rearrangement: Promise and pitfalls in plastic bioremediation
2026-Jan-10, The Science of the total environment
DOI:10.1016/j.scitotenv.2026.181374
PMID:41520378
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综述 | 本文探讨了利用微生物Lossen重排反应进行塑料生物修复的潜力与挑战 | 将经典的有机化学反应Lossen重排改造为生物相容性反应,并在工程化大肠杆菌中利用PET废物衍生底物生物合成药物对乙酰氨基酚 | 目前仅在受控系统中可行,在自然环境中的应用仍不确定,存在技术、生态和监管限制 | 探索塑料生物修复的环境应用前景 | 工程化大肠杆菌及PET废物衍生底物 | 合成生物学 | NA | Lossen重排反应 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, iGEM | 大肠杆菌 | 生物传感器或代谢途径 | 环境, 医药 |
| 111 | 2026-01-13 |
Vanadium-dependent haloperoxidases: Recent advances and perspectives
2026-Jan-06, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108797
PMID:41506498
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综述 | 本文综述了钒依赖性卤过氧化物酶(VHPOs)的最新研究进展,包括其发现、结构功能、催化机制及在有机合成中的应用 | 系统总结了VHPOs在卤化物和底物特异性方面的最新突破,包括底物通道的识别和酶结合卤化机制的发现,挑战了传统的可扩散HOX模型 | NA | 综述钒依赖性卤过氧化物酶的研究进展及其在绿色合成中的应用潜力 | 钒依赖性卤过氧化物酶(VHPOs) | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学, 材料科学, 环境生物技术 |
| 112 | 2026-01-13 |
Overcoming the eIF2α Brake in Human Cell-Derived Translation Systems
2025-Dec-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.11.16.688697
PMID:41497621
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研究论文 | 本研究通过基因编辑和表达调控策略,克服了人源细胞无细胞翻译系统中由eIF2α磷酸化抑制的翻译瓶颈 | 系统探索了在可编辑和难编辑的人源细胞类型中,通过基因编辑eIF2α-S52A、敲除PKR激酶,以及利用piggyBac系统表达GADD34/K3L来绕过eIF2α磷酸化抑制的互补策略 | 基因编辑在某些细胞类型(如原代细胞)中不适用,表达策略可能引入额外的调控复杂性 | 提高人源细胞无细胞翻译系统的翻译效率和生产力 | 人源细胞无细胞翻译系统、eIF2α磷酸化调控机制 | 合成生物学 | NA | 基因编辑、piggyBac转座子系统、Tet诱导表达系统 | NA | NA | Expi293F悬浮细胞、诱导多能干细胞(iPSCs)、原代人成纤维细胞、心肌细胞 | CRISPR-Cas9, piggyBac | 人源细胞(Expi293F, iPSCs, 原代成纤维细胞, 心肌细胞) | Tet诱导启动子控制的GADD34/K3L表达盒,用于调控eIF2α磷酸化状态 | 医学, 工业生物技术 |
| 113 | 2026-01-13 |
The marine diatom Phaeodactylum tricornutum as a versatile bioproduction chassis: Current progress, challenges, and perspectives
2025-Nov-10, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2025.101519
PMID:40994005
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综述 | 本文综述了海洋硅藻三角褐指藻作为多功能光合底盘在可持续生物生产中的应用进展、挑战与前景 | 探讨了利用合成生物学工具优化底盘,实现从天然代谢物到异源化合物的生产,并提出了新兴改进策略 | 存在产品产量不足、生物量限制和生产成本高等挑战,阻碍工业化转化 | 评估三角褐指藻作为生物生产平台的潜力,并探讨提升其工业应用性的策略 | 海洋硅藻三角褐指藻 | 合成生物学 | NA | 转基因元件优化、CRISPR-Cas基因组编辑、高效转化系统 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas | Phaeodactylum tricornutum | NA | 工业生物技术 |
| 114 | 2026-01-13 |
Engineered Bacteria as Living Biosensors in Dermal Tattoos
2024-08, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202309509
PMID:38884139
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研究论文 | 本研究展示了将工程细菌作为活体分析工具集成到皮肤纹身中,用于实时监测生物标志物 | 首次将工程细菌作为活体生物传感器集成到皮肤纹身中,实现了对生化线索和生物物理线索的双重检测 | 研究仅在皮肤模型中进行验证,尚未进行活体动物或人体试验 | 开发基于工程细菌的活体纹身生物传感器平台 | 工程细菌、水凝胶微珠、皮肤模型 | 合成生物学 | NA | 微流控技术、RNA温度计 | NA | 荧光信号 | NA | 遗传电路 | 细菌 | 生物传感器、感应/响应功能 | 医学 |
| 115 | 2026-01-12 |
A programmable ribozyme for RNA signal transduction
2026-Jan-10, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-68175-5
PMID:41519779
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研究论文 | 本文报道了一种可编程的RNA触发激活双位点自切割核酶平台UNBAR,用于RNA信号转导 | 首次开发了可编程的RNA触发激活核酶,实现RNA的直接功能转导,具有单核苷酸特异性和模块化设计 | NA | 开发一种通用的RNA检测和功能转导平台 | microRNA、病毒RNA序列以及非编码RNA效应子如sgRNA、shRNA和适体 | 合成生物学 | NA | RNA工程、细胞游离传感、蛋白质游离扩增 | NA | RNA序列 | NA | CRISPR-Cas9 | 斑马鱼胚胎、人类细胞 | 可编程RNA触发激活双位点自切割核酶,具有模块化传感域和切割产物 | 合成生物学、诊断学、基因调控 |
| 116 | 2026-01-12 |
Design of a Multienzyme Derived from Mouse Fatty Acid Synthase for the Compartmentalized Production of 2-Pyrone Polyketides
2026-Jan-09, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202511726
PMID:41243670
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研究论文 | 本研究设计了一种基于小鼠脂肪酸合酶的多酶体系,用于在区室化环境中生产2-吡喃酮类聚酮化合物 | 通过在小鼠非还原型脂肪酸合酶的酮合酶结构域引入两个氨基酸突变,显著提升了酶活性;并利用SpyTag/SpyCatcher系统整合了4-香豆酸连接酶加载模块,实现了肉桂酸衍生物的直接活化与转移 | NA | 开发区室化生物合成平台以高效生产2-吡喃酮类聚酮化合物 | 小鼠非还原型脂肪酸合酶衍生的多酶体系及其催化的2-吡喃酮合成反应 | 合成生物学 | NA | 蛋白质工程、化学酶法平台 | NA | NA | NA | SpyTag/SpyCatcher系统 | NA | 基于非还原型脂肪酸合酶的多酶区室化合成途径,用于生产2-吡喃酮类化合物 | 医药 |
| 117 | 2026-01-12 |
Recognition of unnatural base pairs by a eukaryotic DNA polymerase enables universal sequencing of an expanded genetic alphabet
2026-Jan-05, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf1460
PMID:41505089
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研究论文 | 本文探索了人类DNA聚合酶β对非天然碱基对的高效特异性合成与延伸能力,并基于此建立了一种测序方法,用于定位含有非天然碱基的DNA | 首次系统研究了人类DNA聚合酶β对非天然碱基对的复制活性,并开发了一种通用测序方法,能够高通量测序含有多种非天然碱基的DNA | NA | 探索非天然碱基对在真核DNA复制系统中的整合潜力,并为扩展遗传字母表的DNA测序提供技术基础 | 非天然碱基对(如dNaM-dTPT3、dCNMO-dTPT3及其功能化衍生物)和含有这些碱基的DNA | 合成生物学 | NA | Sanger测序、深度测序、DNA聚合酶介导的引物延伸 | NA | DNA序列数据 | NA | NA | NA | NA | 生物技术 |
| 118 | 2026-01-12 |
Design of bacterial DNT sensors based on computational models
2026-Jan-05, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf1482
PMID:41505102
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研究论文 | 本研究通过计算模型设计并优化了基于大肠杆菌的细菌生物传感器,用于高灵敏度和特异性检测爆炸物副产物2,4-二硝基甲苯(DNT) | 整合计算建模与合成生物学技术,通过分析DNT暴露下的启动子数据生成367个新变体,显著提升了生物传感器的信号强度和响应速度 | 未明确说明传感器在复杂环境中的长期稳定性或实际现场应用的验证结果 | 开发用于环境监测的高性能DNT生物传感器 | 基于大肠杆菌的细菌生物传感器及其启动子-报告基因融合系统 | 合成生物学 | NA | 计算建模、数据分析和合成生物学技术 | NA | 启动子序列数据和生物发光信号数据 | 367个新生成的启动子变体 | 质粒构建、基因融合 | 大肠杆菌 | 基于启动子作为传感元件与微生物生物发光报告基因盒融合的生物传感器电路 | 环境监测 |
| 119 | 2026-01-12 |
A unified computational framework for quantitative design and optimization of transcriptional regulation across bacterial species
2026-Jan-05, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf1472
PMID:41505101
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研究论文 | 本文介绍了一种模块化热力学建模框架T-Pro,用于预测和优化跨细菌物种的转录调控,并通过实验验证其在多种细菌中的性能提升 | 提出了一种具有机制清晰性、可组合性和可扩展性的统一计算框架,显著提高了转录性能指标,并在仅三个设计-构建-测试-学习循环中实现优化 | NA | 开发一个计算框架以定量设计和优化跨细菌物种的转录调控 | 细菌物种(大肠杆菌、枯草芽孢杆菌和谷氨酸棒杆菌)的转录调控机制 | 合成生物学 | NA | 热力学建模 | 模块化热力学模型 | NA | 涉及三种细菌物种的实验验证 | NA | 大肠杆菌, 枯草芽孢杆菌, 谷氨酸棒杆菌 | 多物种细菌通信电路 | 工业生物技术 |
| 120 | 2026-01-12 |
DNA Origami and Its Applications in Synthetic Biology
2026-Jan, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202513357
PMID:41310154
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综述 | 本文全面概述了DNA折纸技术在合成生物学中的创新应用,包括从细胞外到细胞内的多个领域 | 强调了DNA折纸技术与无细胞合成生物学的协同作用,通过体外组装与细胞调控的结合,为人工生命系统的理性设计开辟了新途径 | NA | 概述DNA折纸技术在合成生物学各领域的创新应用及其与无细胞合成生物学的协同作用 | DNA折纸技术及其构建的纳米结构 | 合成生物学 | NA | DNA折纸技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学, 环境, 工业生物技术 |