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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2026-06-26 |
The Gut Microbiome Dependency Continuum in Drug Discovery: A Unified Pharmacology Framework Linking Clinical Drugs, Natural Products, and Engineered Microbial Therapeutics
2026-Jun-10, Biotech (Basel (Switzerland))
DOI:10.3390/biotech15020043
PMID:42346015
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综述 | 提出肠道微生物组依赖性连续谱框架,整合临床药物、天然产物和工程微生物疗法,揭示微生物组在药理学中的关键作用 | 首次提出四层肠道微生物组依赖性连续谱框架,将微生物组从被动调节剂重新定义为可编程治疗平台,系统整合药物发现中的微生物组依赖性层次 | NA | 构建统一药理学框架,阐述肠道微生物组在药物发现和治疗功能中不同深度依赖性,推动微生物组感知的药物发现和精准工程微生物疗法开发 | 肠道微生物组及其与药物的相互作用(包括粪便微生物移植、微生态制剂、代谢调节药物、天然产物和工程微生物疗法) | NA | NA | NA | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 肠道微生物组 | 可编程微生物系统、工程益生菌、微生物组响应药物递送系统、合成微生物群落 | 医学 |
| 102 | 2026-06-26 |
Advances in UDP-Glycosyltransferases from Medicinal Plants: Discovery, Catalytic Mechanism, Engineering and Biosynthetic Application
2026-Jun-10, Metabolites
IF:3.4Q2
DOI:10.3390/metabo16060402
PMID:42346382
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综述 | 系统总结了药用植物UDP-糖基转移酶的最新全球研究进展,涵盖发现、催化机制、工程改造及生物合成应用 | 首次系统整合多组学、人工智能辅助基因挖掘与蛋白质工程优化策略,构建了包括体外多酶级联、微生物细胞工厂和植物悬浮细胞培养的全谱生物制造体系框架 | 工业化放大、监管合规和临床转化是核心挑战 | 为药用植物UDP-糖基转移酶的工程应用提供完整技术框架,支持稀有天然治疗性糖苷的绿色规模化生产 | 药用植物UDP-糖基转移酶 | 机器学习 | NA | 多组学, 人工智能, 蛋白质工程 | NA | NA | NA | NA | 微生物、植物悬浮细胞 | 体外多酶级联、微生物细胞工厂、植物悬浮细胞培养系统 | 医学, 工业生物技术 |
| 103 | 2026-06-26 |
Pharmaco-microdynamics (PMD): Redefining dose, exposure, and control for living drug carriers
2026-Jun-09, Annales pharmaceutiques francaises
IF:1.0Q4
DOI:10.1016/j.pharma.2026.06.002
PMID:42264080
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综述 | 提出药效微动力学(PMD)框架,用于量化活体药物载体的剂量、暴露与控制 | 首次将药代动力学/药效学(PK/PD)框架扩展到活体药物系统,定义了功能暴露积分、定植效率等新指标,并整合药理学、微生物生态学、合成生物学等多学科原理 | 框架尚处于理论阶段,需大量实验验证;边界条件(如非复制型微生物干预)下经典PK/PD仍适用,PMD的适用范围存在局限 | 建立定量递送科学体系,重新定义活体治疗药物的暴露与控制 | 活体药物载体(如益生菌、工程微生物治疗剂、活体生物治疗产品) | 机器学习 | 苯丙酮尿症、复发性艰难梭菌感染 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 104 | 2026-06-26 |
Synthetic Mirror Bacteria as a Frontier for Chiral Synthetic Biology and Biocontainment
2026-Jun, MicrobiologyOpen
IF:3.9Q2
DOI:10.1002/mbo3.70356
PMID:42338029
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综述 | 本文综述了镜像细菌作为手性合成生物学与生物防护前沿领域的理论基础、工程策略、生物安全考量和生态影响 | 系统探讨了镜像生物学系统中分子手性反转带来的立体化学约束及工程挑战,并评估了其在生物安全与生态影响方面的独特问题 | 镜像细菌仍处于理论构建阶段,集成手性反转生物分子到自我复制细胞系统是尚未解决的重大科学挑战 | 探讨镜像细菌的分子基础、工程策略、生物安全问题及生态影响 | 镜像细菌(mirror bacteria) | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 镜像生物系统 | 生物安全, 合成生物学 |
| 105 | 2026-06-26 |
Metabolic and Synthetic Biology Strategies for Enhancing Single-Cell Protein Production in Saccharomyces cerevisiae
2026-Jun, Biotechnology journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/biot.70273
PMID:42345366
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综述 | 本文综述了利用代谢工程和合成生物学策略提高酿酒酵母单细胞蛋白产量的最新进展 | 系统总结了通过代谢和合成生物学方法增强酵母蛋白质含量和细胞生物量的策略,并强调其在可持续大规模蛋白质生产中的潜力 | 未明确指出具体研究的局限性 | 探讨如何通过代谢和合成生物学策略提高酿酒酵母单细胞蛋白产量,以应对全球粮食安全和碳中和目标 | 酿酒酵母单细胞蛋白 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、代谢工程 | NA | NA | NA | NA | 酿酒酵母 | NA | 食品、饲料、工业生物技术 |
| 106 | 2026-06-26 |
Transcriptome-Guided Identification of N-Acetyltransferases Involved in Melatonin Biosynthesis in a Streptomyces-Based Cell Factory
2026-May-27, Chembiochem : a European journal of chemical biology
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/cbic.70390
PMID:42178992
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研究论文 | 通过转录组引导挖掘,在链霉菌细胞工厂中鉴定参与褪黑素生物合成的N-乙酰转移酶,并优化产量 | 首次利用转录组引导策略在链霉菌中鉴定参与褪黑素合成的内源N-乙酰转移酶,并通过工程改造显著提高褪黑素产量 | 未提及具体局限性 | 实现微生物中褪黑素的高效生物合成 | 工程链霉菌白色亚种菌株 | 合成生物学 | NA | 转录组测序、基因工程 | NA | 基因表达数据 | NA | 基因敲除、基因过表达 | 链霉菌白色亚种 | 褪黑素从头合成途径 | 医药,工业生物技术 |
| 107 | 2026-06-26 |
Spatial Regulation of CAR Signaling Enables Logic-Gated Activity
2026-May-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.05.22.726983
PMID:42239424
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研究论文 | 设计了一种通过空间调控CAR信号实现逻辑门控活性的新型受体MANTIS | 利用细胞外受体维度差异来空间调控CAR信号,通过空间位阻和抗原顺序结合实现AND门控逻辑 | 可能涉及复杂的工程化设计及体内应用的潜在挑战 | 开发一种新型AND门控受体,使CAR T细胞更特异性识别癌细胞,减少对正常细胞的杀伤 | CAR T细胞及其对癌细胞的杀伤活性 | 合成生物学 | 癌症 | CAR技术 | NA | NA | NA | NA | T细胞 | 逻辑门控受体MANTIS | 医学 |
| 108 | 2026-06-26 |
Emerging Applications of CAR-T Cell Therapy in Overcoming Resistance and Expanding Targets in Hematologic Malignancies: Insights from Recent Research
2026-May-23, Current treatment options in oncology
IF:3.8Q2
DOI:10.1007/s11864-025-01371-z
PMID:42176091
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综述 | 总结CAR-T细胞疗法在克服血液恶性肿瘤耐药性和扩展靶点方面的最新研究进展 | 提出CRISPR增强型CAR和基于合成生物学的异体系统以提高CAR-T疗法的疗效和可及性 | 未明确说明具体局限性,但指出抗原逃逸、T细胞耗竭及在急性髓系白血病和T细胞白血病中疗效有限等问题仍存在 | 总结2015年以来的人类试验成果,重点关注近两年创新,探讨克服耐药性策略及提升安全性和可及性的方法 | 血液恶性肿瘤患者,包括B细胞急性淋巴细胞白血病、弥漫大B细胞淋巴瘤和多发性骨髓瘤 | 数字病理学 | 血液恶性肿瘤 | NA | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 哺乳动物细胞 | 多靶点CAR、下一代构建体、合成生物学异体系统 | 医学 |
| 109 | 2026-06-26 |
The interaction between the RNA aptamer Dap1 and DasR mirrors DNA operator site recognition in GntR repressors
2026-May-20, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag489
PMID:42165134
|
研究论文 | 研究RNA适配体Dap1与细菌阻遏蛋白DasR的相互作用机制,揭示其模拟DNA操纵子位点识别,并指导新型适配体设计 | 首次解析SELEX衍生适配体Dap1与GntR/HutC家族阻遏蛋白DasR的复合物晶体结构,发现RNA适配体与蛋白的相互作用高度模仿DNA-蛋白识别模式,并基于结构信息设计出靶向同源蛋白NagR的新型适配体 | 未明确提及在更广泛的阻遏蛋白家族中的适用性验证,适配体设计策略的普适性有待进一步探索 | 阐释RNA适配体与细菌阻遏蛋白的分子识别机制,推动合成生物学中新型适配体-蛋白互作对的设计 | RNA适配体Dap1及其突变体Dap1m1、GntR/HutC家族阻遏蛋白DasR和NagR | 合成生物学 | NA | 晶体结构解析、SELEX、定点突变 | NA | 结构数据、序列数据 | NA | SELEX | 细菌(未明确具体菌种) | 基因表达调控回路(基于适配体诱导的阻遏蛋白去抑制) | 合成生物学、生物技术 |
| 110 | 2026-06-26 |
Viruses that heal: harnessing bacteriophages in the era of antibiotic resistance
2026-Apr-30, Voprosy virusologii
DOI:10.36233/0507-4088-366
PMID:42187217
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综述 | 探讨噬菌体作为抗生素替代疗法在应对抗菌素耐药性中的应用 | 结合基因组学、合成生物学和靶向医学进展,系统阐述噬菌体治疗的多机制作用(如裂解酶)和基因工程新技术(如CRISPR-Cas、噬菌体重组工程和合成基因组重启) | 未详细讨论噬菌体治疗在临床推广中面临的具体监管障碍和规模化生产挑战 | 综述噬菌体生物学、多样性及其在治疗多重耐药菌感染中的应用潜力 | 噬菌体(特别是感染和破坏细菌的病毒) | 机器学习 | 抗菌素耐药性相关感染 | CRISPR-Cas, 噬菌体重组工程, 合成基因组重启 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | NA | NA | 医学, 农业, 环境, 食品, 工业生物技术 |
| 111 | 2026-06-26 |
Advances in protein engineering
2026, International review of cell and molecular biology
DOI:10.1016/bs.ircmb.2025.11.002
PMID:42191275
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综述 | 本文综述了蛋白质工程在多种医学、食品和环境领域的最新进展,重点关注人类疾病和生物医学科学中的应用 | 重点介绍了蛋白质工程在CRISPR/Cas系统、高通量数据和合成生物学中的关键成果,以及进化、理性设计、半理性设计和混合方法等创新技术 | 讨论了蛋白质工程当前面临的挑战和伦理考虑 | 综述蛋白质工程在人类疾病治疗,特别是癌症治疗中的转化潜力 | 蛋白质工程及其在疾病治疗中的应用 | 机器学习和合成生物学 | 人类疾病,特别是癌症 | 蛋白质工程、CRISPR/Cas系统、高通量数据 | NA | 高通量数据 | NA | CRISPR-Cas9 | NA | NA | 医学、食品、环境 |
| 112 | 2026-06-26 |
Microbial Ecology at the Nexus of Food Safety and Biotechnology With Ecological Mechanisms, Risks, and Emerging Innovations
2026, International journal of food science
IF:2.7Q3
DOI:10.1155/ijfo/6618960
PMID:42344006
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综述 | 综述了微生物生态学在食品安全与生物技术交叉领域的作用、生态机制、风险及新兴创新 | 将微生物生态学作为整合框架,系统连接食品安全和生物技术,并强调生态机制在两者中的应用 | 由于微生物复杂性、数据整合限制和安全考虑,将生态见解转化为可靠的工业和监管实践仍面临挑战 | 综合当前关于微生物生态学在食品安全与食品生物技术交叉领域的文献,并识别关键研究空白和未来方向 | 食品安全和食品生物技术中的微生物群落 | 微生物生态学 | NA | 高通量测序, 全基因组测序, 宏基因组学, 多组学整合 | NA | 文献 | NA | NA | NA | NA | 食品, 生物技术 |
| 113 | 2026-06-26 |
Ensemble techniques for predictive modeling of leishmanial activity via molecular fingerprints
2025-10-14, BMC medical informatics and decision making
IF:3.3Q2
DOI:10.1186/s12911-025-03041-4
PMID:41088199
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研究论文 | 利用集成学习技术基于分子指纹预测利什曼病活性 | 首次引入集成模型方法用于利什曼病药物发现,结合三种分子指纹算法和多种机器学习模型,实现了83.65%的高精度预测 | 数据集仅来自PubChem数据库,且依赖Alamar Blue法评估,可能限制化合物的多样性;模型尚未经过体外或体内实验验证 | 开发基于机器学习和化学信息学的计算方法,预测化合物抗利什曼原虫前鞭毛体的活性 | 65,057个分子(来自PubChem数据库)以及其抗利什曼原虫活性数据 | 机器学习 | 利什曼病 | 分子指纹编码(Avalon、MACCS Key、Pharmacophore)、Alamar Blue法 | 随机森林、多层感知器、梯度提升、决策树、集成模型 | 分子结构数据(SMILES符号) | 65,057个分子 | NA | NA | NA | 医学 |
| 114 | 2026-06-26 |
Multiactivity of Nanozyme Liposome Regulates the Homeostasis of Biochemical Microenvironment
2025-08-18, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202501918
PMID:40545445
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研究论文 | 开发了一种具有多酶纳米酶活性的仿生脂质体,用于调节外源植入物引起的促炎因子,从而促进组织再生 | 首次将CeO纳米颗粒与人工膜自组装形成仿生脂质体,兼具抗血液成分粘附和调节生化微环境稳态的双重功能 | NA | 设计并构建能在初始移植阶段复制天然细胞功能的治疗性脂质体,用于组织工程中的合成生物学 | 多酶纳米酶脂质体及CeO纳米颗粒 | NA | NA | 自组装 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 115 | 2026-06-26 |
Deciphering and Predicting Thermal and pH Stabilities of Triplex DNA Under Multifactorial Conditions
2025-08-11, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202507190
PMID:40498537
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研究论文 | 开发了一种高通量5D荧光共振能量转移熔解退火方法,解析多因素条件下三链DNA的热稳定性和pH稳定性 | 首次预测了不同温度和离子环境下三链DNA的pH稳定性,并揭示了离子强度对Hoogsteen氢键的双重作用机制 | 未明确提及 | 揭示环境和序列因素如何调节三链DNA稳定性,并建立预测模型 | 三链DNA结构 | 分子生物学、核酸结构生物学 | NA | 5D荧光共振能量转移熔解退火 | 预测模型 | 荧光信号、熔解温度数据 | 414组缓冲条件 | NA | NA | NA | 基因靶向治疗、合成生物学应用 |
| 116 | 2026-06-26 |
Thiotemplated Polyketide Chain Fusion and Reductive Cyclization Build the Reactive Butenolide Core of Malleicyprol
2025-07-28, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202504485
PMID:40401345
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研究论文 | 通过体外重建和突变分析,揭示了两种聚酮链通过非经典缩合结构域融合形成马来环丙醇活性丁烯内酯核心的机制 | 首次阐明硫模板介导的聚酮链头对头融合及还原环化构建丁烯内酯的非常规生物合成途径,扩展了合成生物学工具箱 | 未明确提及该反应在体内的效率或对病原菌整体毒力的定量影响 | 揭示马来环丙醇中反应性丁烯内酯核心的生物合成机制 | 类鼻疽伯克霍尔德菌群的毒力因子马来环丙醇及其生物合成酶系 | 合成生物学 | 类鼻疽伯克霍尔德菌感染 | 化学合成、体外重构、突变分析、生化测定 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9(用于突变分析) | NA | 由PKS-NRPS杂合合成酶催化的聚酮链融合及还原环化丁烯内酯形成途径 | 医学(抗毒力策略开发) |
| 117 | 2026-06-26 |
Light-Responsive DNA Droplets for Controlling Enzyme Cascade Pathways by Dynamic Phase Separation
2025-07-28, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202505316
PMID:40410127
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研究论文 | 通过光响应DNA液滴动态相分离控制酶级联途径 | 提出利用光响应DNA液滴通过液-液相分离选择性隔离酶,实现紫外光和可见光调控酶级联反应,无需改变总酶浓度 | 未提及在复杂生物环境中的稳定性和长期应用效果 | 开发光响应DNA液滴用于精确调控酶级联途径 | 光响应DNA液滴和酶级联系统(GOx、HRP、CAT和GAO、MPO、CAT) | 合成生物学 | NA | 液-液相分离 | NA | NA | NA | NA | NA | 光响应DNA液滴(Y-motif序列与偶氮苯修饰的粘性末端)和酶级联途径 | 合成生物学, 微反应器设计, 生物工程 |
| 118 | 2026-06-26 |
DNA-Based Signal Circuit for Self-Regulated Bidirectional Communication in Protocell-Living Cell Communities
2025-06-10, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202503903
PMID:40195061
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研究论文 | 设计了一种基于DNA的信号电路,用于实现原始细胞与活细胞群落中的自我调节双向通信 | 设计了包含识别、激活和反馈模块的DNA电路,使原始细胞能够通过感知和响应活细胞释放的信号,自我调节与活细胞的相互作用,并具备可再生能力,能连续与多个目标活细胞互动 | 仅描述了原理验证,未提及在复杂生物环境中的应用限制或长期稳定性问题 | 开发合成生物学工具,控制细胞间信号传递,实现原始细胞与活细胞群落中的动态信号传播调控 | 原始细胞(非生物细胞模拟物)与活细胞(目标细胞) | 合成生物学 | NA | DNA电路设计 | NA | NA | NA | DNA组装技术 | 原始细胞(非生物) | 信号电路,包含识别模块、激活模块和反馈模块,用于自我调节双向通信 | 医学(细胞疗法) |
| 119 | 2026-06-26 |
Measuring XNA polymerase fidelity in a hydrogel particle format
2025-01-24, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf038
PMID:39878216
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研究论文 | 开发了一种基于水凝胶颗粒的无纯化方法,用于测量合成人工遗传聚合物(XNA)的聚合酶保真度 | 通过在磁性水凝胶颗粒基质内进行XNA转录和逆转录步骤,避免了传统方法中耗时的聚丙烯酰胺凝胶电泳纯化步骤 | NA | 简化XNA聚合酶保真度测量流程 | XNA聚合酶 | NA | NA | 水凝胶颗粒技术, DNA/RNA合成 | NA | DNA序列数据 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 |
| 120 | 2026-06-26 |
Choreographing root architecture and rhizosphere interactions through synthetic biology
2024-02-14, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-45272-5
PMID:38355570
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综述 | 通过合成生物学方法调控根系结构及其与根际微生物的互作,以应对气候变化对农业的挑战 | 首次系统阐述将合成遗传电路从微生物扩展到多细胞植物,用于调控根系形态、分泌物及根际微生物活动的创新策略 | NA | 探索利用合成生物学工具设计气候适应型作物的根系功能及根际互作 | 植物根系及其相关微生物群落 | 合成生物学 | NA | 合成遗传电路 | NA | NA | NA | NA | 植物(多细胞物种) | 用于调控根系结构、分泌作用和根表面微生物活动的合成遗传电路 | 农业, 环境 |