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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2026-06-16 |
Xeno nucleic acids (XNAs): advances in synthesis, diagnostics, and therapeutics
2026-Sep-05, Bioorganic chemistry
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.bioorg.2026.110000
PMID:42160832
|
综述 | 全面综述异源核酸(XNA)的合成、表征及其在诊断和治疗中的应用 | 系统性地概述了多种异源核酸变体的合成方法、结构特性及临床转化潜力,强调其在分子诊断和精准医学中的变革性作用 | 当前面临可规模化合成、有效递送系统及全面结构-功能理解的挑战 | 总结异源核酸(XNA)的化学修饰、合成方法、表征技术及生物医学应用 | 锁核酸、肽核酸、己糖醇核酸、氟阿拉伯糖核酸、吗啉代寡聚体等异源核酸变体 | 分子生物学、生物技术 | NA | 磷酰胺化学法、工程聚合酶酶促合成法、热熔融分析、圆二色光谱、核磁共振、质谱、测序方法 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学(精准医学、分子诊断、治疗)、生物技术 |
| 102 | 2026-06-16 |
Deep learning unlocks sequence-divergent synthetic promoters to empower Streptomyces natural product engineering
2026-Jul, Metabolic engineering
IF:6.8Q1
DOI:10.1016/j.ymben.2026.05.009
PMID:42208848
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研究论文 | 利用深度学习设计序列发散的合成启动子,增强链霉菌天然产物工程 | 首次为链霉菌建立AI生成的启动子库,深度学习赋能设计效率、序列多样性和性能精确调控 | NA | 开发深度学习驱动的合成启动子设计方法,克服链霉菌遗传工具开发的限制,提升天然产物产量 | 链霉菌合成启动子及其对天然产物工程的影响 | 机器学习 | NA | 深度学习,深度生成模型 | NA | 序列数据 | 10亿个计算机设计的启动子序列,其中100个候选启动子经实验验证 | NA | 链霉菌 | 合成启动子文库 | 工业生物技术,医药 |
| 103 | 2026-06-16 |
Bioconjugation Strategies for Revealing the Roles of Glycerophospholipids in Cells
2026-Jun-15, Chembiochem : a European journal of chemical biology
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/cbic.70428
PMID:42287618
|
综述 | 综述了用于揭示甘油磷脂在细胞中作用的生物共轭策略 | 整合了化学全合成、生物正交化学、活细胞成像等多种跨学科方法,为脂质功能研究和治疗创新提供新路径 | 仅总结现有方法,未提出新的实验设计或突破性技术 | 探索甘油磷脂在细胞中的复杂功能及代谢机制 | 甘油磷脂及其类似物 | 合成生物学 | NA | 生物正交化学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 104 | 2026-06-16 |
Adaptive evolution of oxidosqualene cyclases driving triterpene scaffold diversification for limonoid biosynthesis in Melia toosendan
2026-Jun-15, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2026.101965
PMID:42289993
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研究论文 | 本研究通过染色体级别基因组组装和功能分析,揭示了川楝中氧化角鲨烯环化酶的适应性进化驱动柠檬苦素生物合成三萜骨架多样化的分子机制 | 首次发现川楝中OSC基因家族通过新功能化产生11种不同三萜骨架,并鉴定出4个关键氨基酸残基替换足以切换产物特异性,揭示了正向选择驱动代谢创新的分子基础 | 研究主要基于瞬时表达和系统发育分析,尚需更全面的体内功能验证和晶体结构解析,且替代途径的生理意义仍需进一步阐明 | 阐明植物中三萜骨架多样化的适应性进化分子机制 | 川楝(Melia toosendan)中的氧化角鲨烯环化酶基因家族 | 生物信息学 | NA | 染色体级别基因组组装, NGS, 瞬时表达 | NA | 基因组序列, 代谢物谱 | 1个川楝品种的基因组和14个OSC基因 | NA | 本氏烟草(Nicotiana benthamiana) | NA | 合成生物学,农业(植物源杀虫剂) |
| 105 | 2026-06-16 |
Substrate Specificity of B12-Depedent Ribonucleotide Reductases: Biotechnology and Metabolic Implications
2026-Jun-15, Chembiochem : a European journal of chemical biology
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/cbic.202500344
PMID:42290402
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研究论文 | 研究了两类热稳定性核糖核苷酸还原酶对多种天然和非天然核苷酸的底物特异性,评估其生物技术应用潜力 | 首次系统性地研究了核糖核苷酸还原酶对非经典核苷酸的底物特异性,发现酶倾向于转化带有修饰官能团的核苷碱基底物,揭示了生物技术和合成生物学应用中的潜力与限制 | 仅聚焦于两种热稳定性RNR,未涵盖其他来源或类型的RNR;对非天然核苷酸的转化效率及体内应用验证不足 | 探索核糖核苷酸还原酶的底物混杂性及其在生物技术中的应用潜力,同时增进对天然核苷酸代谢的理解 | 两种热稳定性核糖核苷酸还原酶及其对多种天然和非天然核苷酸的转化 | 合成生物学 | NA | 酶活性测定、底物特异性分析 | NA | 实验数据(酶动力学参数) | 两种热稳定性核糖核苷酸还原酶,测试了多种核苷酸底物 | NA | NA | NA | 生物技术、合成生物学 |
| 106 | 2026-06-16 |
Harnessing natural variation for photosynthetic improvement in next-generation crop breeding
2026-Jun-15, Journal of integrative plant biology
IF:9.3Q1
DOI:10.1111/jipb.70317
PMID:42290551
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综述 | 本文综述了利用自然遗传变异改善光合作用的策略,以支持下一代作物育种 | 整合自然遗传变异与合成生物学和光合遗传工程的互补方法,提出优化光合作用以提升作物产量和抗逆性的战略框架 | 未详细讨论具体田间验证结果和长期环境适应性挑战 | 探索通过自然变异和现代生物技术优化光合作用,提升作物产量潜力和气候适应性的策略 | 作物光合性状的自然遗传变异及其分子调控机制 | 农业生物技术 | NA | 光合遗传工程、合成生物学 | NA | 综述文献数据 | NA | 合成生物学 | 作物 | 光合代谢通路优化 | 农业 |
| 107 | 2026-06-16 |
A Modular PLUG-IN Photosynthetic Chassis With Tunable Thermal Control for Mammalian Systems
2026-Jun-15, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.76102
PMID:42294635
|
研究论文 | 开发一种热调控的模块化“即插即用”光合底盘,实现微藻代谢输出与细胞完整性的可编程控制 | 首次实现跨真核生物界的热调控模块化合成生物学底盘,在微藻和哺乳动物宿主中均保持功能,并耦合代谢工程与细胞壁工程实现无研磨脂质回收 | 未明确讨论热诱导系统在长期培养中的稳定性及可能的代谢负担,未评估大规模工业应用中的热控制成本 | 开发一种与哺乳动物系统兼容的热调控光合底盘,同步控制生长、生产与细胞壁重构 | 海洋微藻(Nannochloropsis oceanica)和哺乳动物宿主 | 合成生物学 | NA | 转录组学比较分析、热诱导启动子工程、基因沉默 | NA | 转录组数据 | NA | 热激活基因扩增系统、基因沉默 | Nannochloropsis oceanica, 哺乳动物细胞 | 热调控代谢模块(AtWRI1表达增强三酰甘油和EPA积累)与细胞壁模块(CesA1沉默导致细胞壁弱化)耦合 | 工业生物技术, 医药 |
| 108 | 2026-06-16 |
From fermentation to pharmabiotics: engineering kefir-derived Lactobacillus for targeted intratumoral immunotherapy in colorectal Cancer
2026-Jun-14, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2026.117032
PMID:42289150
|
综述 | 探讨将开菲尔中乳酸菌转化为工程活生物治疗药物,用于结直肠癌的靶向瘤内免疫治疗 | 提出从发酵到药物的流程,利用合成生物学改造开菲尔乳酸菌,使其能够靶向肿瘤缺氧区域并原位释放纳米抗体和细胞因子,将冷肿瘤转化为热肿瘤以增强免疫治疗 | 面临生物遏制、生产和监管等转化挑战 | 开发工程化活生物治疗药物用于结直肠癌的靶向免疫治疗 | 开菲尔中的乳酸菌菌株 | 合成生物学 | 结直肠癌 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | 乳酸菌(开菲尔来源) | 靶向肿瘤缺氧区域的生物传感器及纳米抗体和细胞因子释放电路 | 医学 |
| 109 | 2026-06-16 |
SynBio-DSP: an integrated synthetic biology platform with fed-batch fermentation and continuous downstream processing for sustainable production of thermostable cellulases
2026-Jun-14, Biotechnology for biofuels and bioproducts
IF:3.3Q3
DOI:10.1186/s13068-026-02783-1
PMID:42289753
|
研究论文 | 开发了一种整合合成生物学、机器学习引导的生物过程优化和连续下游处理的平台,用于可持续生产耐热纤维素酶 | 首次提出了QLM自诱导系统和CRISPRi介导的细胞壁弱化策略,并结合高斯过程回归和高通量微型生物反应器优化发酵,以及新型脉冲电场辅助协同裂解系统实现高效酶回收 | sfGFP融合导致比活性降低8.3%,可能需要进一步优化融合标签设计 | 通过协同优化细胞设计和工艺配置,实现可持续且经济可行的生物催化剂生产 | 枯草芽孢杆菌底盘细胞以及超耐热纤维素酶CtCel9A | 合成生物学 | NA | 合成生物学、CRISPRi、高通量发酵、响应面法、多目标优化 | 高斯过程回归、响应面法、NSGA-III算法 | 实验数据和过程参数 | NA | CRISPR-Cas9, 脉冲电场 | 枯草芽孢杆菌 | 群体感应裂解调制自诱导系统和CRISPRi介导的细胞壁弱化回路 | 工业生物技术, 能源 |
| 110 | 2026-06-16 |
Global research trends and hotspots of plant physiologically active substances: quantitative visualization analysis based on CiteSpace
2026-Jun-13, Plant biology (Stuttgart, Germany)
DOI:10.1111/plb.70219
PMID:42287740
|
综述 | 基于CiteSpace的文献计量分析,系统回顾了2000至2024年间植物生理活性物质研究的全球趋势与热点 | 首次通过定量可视化分析揭示了植物生理活性物质研究从基础分离到机制研究、功能性食品及纳米递送系统的阶段性转变,并识别了新兴热点如植物免疫调控、肠道微生物互作和分子动力学模拟 | 仅依赖Web of Science核心合集数据库,可能遗漏其他语种或非索引文献,且分析周期截至2024年,后续研究趋势未覆盖 | 系统梳理植物生理活性物质研究的全球趋势、热点演变及未来方向,指导跨学科合作与可持续开发利用 | 植物来源的生理活性物质(如植物化合物、抗氧化剂等) | 文献计量学 | NA | 文献计量分析,CiteSpace可视化 | NA | 文献数据(文本) | 8096篇文献(2000-2024年Web of Science核心合集) | NA | NA | NA | 医学,农业,工业生物技术,功能性食品 |
| 111 | 2026-06-16 |
Transplantation of encapsulated fecal microbiota: research progress and future trends
2026-Jun-13, World journal of pediatrics : WJP
IF:6.1Q1
DOI:10.1007/s12519-026-01056-z
PMID:42288685
|
综述 | 综述了封装粪便微生物群移植的研究进展与未来趋势,从经验性转移向工程化生物治疗转变 | 强调封装FMT作为活性生物治疗产品的关键制剂,推动从全群落微生物制剂向合成生物学创新的转变 | 缺乏大规模随机对照试验,尤其是儿科研究;监管定义不一致且国际指南尚未建立 | 总结封装FMT的研究进展和监管挑战,探索未来发展方向以提升标准化和个性化治疗 | 封装粪便微生物群移植的临床研究,包括成人和儿科患者 | NA | 肠道疾病,复发性艰难梭菌感染 | 封装技术 | NA | 文献和数据综合 | NA | NA | 人类肠道微生物群 | NA | 医学 |
| 112 | 2026-06-16 |
Engineering Lactobacillus for therapeutic delivery and biosensing: lessons from niche adaptation
2026-Jun-13, Future microbiology
IF:2.5Q3
DOI:10.1080/17460913.2026.2686558
PMID:42288957
|
综述 | 该文章综述了利用乳杆菌属菌株进行治疗递送和生物传感的工程化方法,及其从生态位适应性中获得的经验教训 | 总结了乳杆菌通过基因组特征、压力响应和生物膜形成实现的生态位适应性,并探讨了如何将这些特性转化为合成生物学工具以拓展其作为活体生物治疗产品和生物传感器的应用 | 在稳定性和监管方面仍存在挑战 | 综述乳杆菌工程化在治疗递送和生物传感中的应用前景 | 乳杆菌属菌株 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas | NA | NA | NA | CRISPR-Cas | 乳杆菌 | 活体治疗产品,生物传感器,基因回路 | 医学,食品安全,环境监测,诊断 |
| 113 | 2026-06-16 |
In silico identification and characterisation of putative biphenyl degradation mechanism in gut-derived Pediococcus pentosaceus
2026-Jun-11, Environmental research
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.envres.2026.125000
PMID:42276346
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研究论文 | 本研究利用计算生物学方法鉴定并表征了源自蟑螂肠道的戊糖片球菌QS-GN03_1中潜在的联苯降解机制 | 首次在戊糖片球菌中鉴定出通过水平基因转移获得且独立存在的bphC基因同源物,并通过分子对接和动力学模拟验证其功能潜力,同时发现其基因组中含有IS30家族插入序列,为合成生物学改造提供了机会 | 该菌株缺乏独立的PCB矿化能力,且预测的PPBPHCIII酶与功能验证的1EIR复合物相比结合亲和力较弱,主要是因为氢键形成较少 | 鉴定和表征戊糖片球菌中潜在的联苯降解能力,以开发用于PCB解毒的益生菌饲料添加剂 | 蟑螂肠道来源的戊糖片球菌QS-GN03_1菌株及其潜在联苯降解基因 | 机器学习 | NA | 全基因组测序,分子对接,分子动力学模拟 | NA | 基因组序列,蛋白质结构数据 | 一个戊糖片球菌菌株 | CRISPR-Cas9,合成生物学 | 戊糖片球菌 | Bph操纵子整合电路 | 农业,环境,食品 |
| 114 | 2026-06-16 |
Enhancing small-molecule-mediated translational control through multivalent RNA aptamers
2026-Jun-08, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag592
PMID:42273917
|
研究论文 | 提出一种基于多价RNA适配体的通用平台,通过剪接调控显著增强小分子介导的翻译控制 | 通过多价适配体设计,将弱适配体(如茶碱或四环素适配体)的诱导水平从不足10倍提升至超过100倍,实现超过一个数量级的改进,并实现多路复用和正交控制 | 未明确说明局限性,可能依赖特定配体-适配体对的优化 | 开发一种通用且可适应的RNA平台,扩展小分子调控蛋白表达的工具箱 | 小分子RNA开关及多价适配体设计 | 合成生物学 | NA | RNA适配体设计、替代剪接调控 | NA | NA | NA | NA | NA | 多价适配体电路,增强配体响应性蛋白表达 | 合成生物学, 医学 |
| 115 | 2026-06-16 |
Cascading recombinase memory switch for programmable and stable gene expression in Pseudomonas putida
2026-Jun-08, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag589
PMID:42268684
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研究论文 | 在恶臭假单胞菌中构建基于整合酶的级联触发开关,实现稳定可控的基因表达 | 首次在非模式细菌恶臭假单胞菌中设计并验证整合酶级联记忆开关,通过串联正交T7 RNA聚合酶系统扩展输出模块性,并应用于连续生物工艺中的催化生物膜控制 | 研究未长期评估开关在复杂工业环境中的稳定性,且当前设计依赖特定诱导物鼠李糖 | 开发可在工业相关微生物中稳定工作的遗传记忆开关,用于生物过程调控 | 恶臭假单胞菌中的基因表达开关系统 | 合成生物学 | NA | 合成生物学遗传电路设计 | NA | NA | NA | Bxb1丝氨酸整合酶 | 恶臭假单胞菌 | 级联触发开关,包含鼠李糖诱导模块、Bxb1整合酶驱动的翻转开关、正交T7 RNA聚合酶基因及PT7驱动的目标模块 | 工业生物技术 |
| 116 | 2026-06-16 |
Ultra-rapid and high-titer biomanufacturing of trehalose 6-phosphate by an in vitro synthetic biology platform
2026-Apr-27, Bioresources and bioprocessing
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s40643-026-01057-w
PMID:42043645
|
研究论文 | 利用体外合成生物学平台超快速高滴度生产海藻糖-6-磷酸 | 设计并验证了一条不含辅酶的新型最小酶途径,避免了对ATP或UDP等昂贵辅酶的依赖,实现了海藻糖-6-磷酸的高效生物制造 | 研究未涉及大规模工业应用的长期稳定性或经济可行性评估 | 开发一种可扩展且成本竞争力的体外生物制造方法用于海藻糖-6-磷酸的生产 | 海藻糖-6-磷酸的体外酶催化合成途径 | 合成生物学 | NA | 体外酶学优化、生物反应器放大 | NA | 实验数据(产量、产率等) | NA | 体外合成生物学平台 | NA | 三酶级联途径(包含麦芽糖磷酸化酶、海藻糖-6-磷酸磷酸化酶和多磷酸葡萄糖激酶) | 农业 |
| 117 | 2026-06-16 |
Decoding and exploiting intratumoral microbiota: from microenvironment modulation to clinical intervention
2026-Apr-25, Molecular biology reports
IF:2.6Q3
DOI:10.1007/s11033-026-11858-z
PMID:42033527
|
综述 | 主要探讨了瘤内菌群在调节肿瘤微环境中的作用及其作为临床干预靶点的潜力 | 系统总结了瘤内菌群通过多种机制促进肿瘤进展和影响治疗反应的研究进展,并提出了基于菌群-微环境相互作用的创新干预策略 | 瘤内菌群的时空动态变化尚未完全阐明,其与宿主细胞的机制相互作用需要进一步研究,临床转化面临安全性和有效性挑战 | 解码和利用瘤内菌群以改善肿瘤治疗 | 瘤内菌群及其与肿瘤微环境的相互作用 | 肿瘤生物学 | 多种癌症 | 空间多组学,合成生物学,纳米技术 | NA | NA | NA | 工程菌,噬菌体疗法,细菌细胞外囊泡 | NA | NA | 医学 |
| 118 | 2026-06-16 |
Progress in cell-based immunotherapies for solid tumors
2026-Apr-25, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-05092-z
PMID:42033573
|
综述 | 本文综述了基于细胞的免疫疗法在实体肿瘤治疗中的进展,包括CAR-T、NK细胞和TCR-T等疗法 | 全面分析了多种细胞免疫疗法在实体瘤应用中面临的主要障碍和未来突破方向 | 未提供具体的实验数据或比较分析,仅为文献综述 | 总结细胞免疫疗法在实体瘤中的进展、挑战和未来方向 | 实体瘤的细胞免疫疗法 | 数字病理学 | 实体瘤 | NA | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | NA | NA | 医学 |
| 119 | 2026-06-16 |
Engineering strategies for the biosynthesis of rare sugars in microbial cell factories
2026-Apr-25, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-026-04975-1
PMID:42033624
|
综述 | 系统综述利用微生物细胞工厂合成稀有糖的生物合成策略,重点关注代谢工程、酶工程和发酵过程优化 | 全面总结了多种代表性稀有糖(包括阿洛酮糖、塔格糖、阿洛糖等)的生理功能与应用,并系统梳理了多层面工程策略的整合进展 | 未对具体工程策略的定量比较和经济性评估进行深入分析 | 为稀有糖的可持续工业化生产提供工程策略指导 | 稀有糖(D-阿洛酮糖、D-塔格糖、D-阿洛糖、L-核糖、L-核酮糖和L-木酮糖) | 合成生物学 | NA | 代谢工程, 酶工程, 生物催化, 发酵优化 | NA | NA | NA | NA | 微生物细胞工厂 | 稀有糖生物合成途径 | 食品, 医药, 健康产业 |
| 120 | 2026-06-16 |
Gene Exchange Mechanisms in Natural and Engineered Probiotics Within the Human Gut Implications for Antibiotic Resistance and Metabolic Modulation
2026-Apr-22, Probiotics and antimicrobial proteins
IF:4.4Q2
DOI:10.1007/s12602-026-11029-3
PMID:42020676
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综述 | 批判性审视自然与工程益生菌在人体肠道内通过水平基因转移传播抗生素抗性及调节代谢的机制与意义 | 综合论述益生菌基因交换的双重性,既强调益生特性传递也警示抗性基因扩散风险,并提出基于情境的风险评估框架 | 未提供具体实验数据验证风险,主要基于文献综合分析 | 探讨人体肠道中自然与工程益生菌的基因交换机制及其对抗生素抗性传播和代谢调节的影响 | 人体肠道微生物组中的自然益生菌和工程益生菌 | 微生物组学、合成生物学 | NA | 宏基因组学、微生物生态学、合成生物学 | NA | 文献数据 | NA | 染色体整合、自杀开关、营养缺陷型、正交电路设计 | 肠道微生物(未特指具体宿主) | 生物遏制电路(包括自杀开关、正交电路) | 医学、农业 |