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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2026-03-24 |
Amodiaquine Enhances Anti-Melanoma Efficacy of Attenuated Salmonella via Targeting Glutathione Reductase in Neutrophils
2026-Mar, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202515009
PMID:41588921
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研究论文 | 本研究揭示了阿莫地喹通过靶向中性粒细胞中的谷胱甘肽还原酶,增强减毒沙门氏菌VNP20009的抗黑色素瘤疗效 | 首次发现VNP20009招募的中性粒细胞主要为促肿瘤N2亚型,并鉴定谷胱甘肽还原酶为关键靶点,开发了结合药物重定位与合成生物学的微环境智能治疗策略 | 研究主要聚焦于黑色素瘤模型,在其他肿瘤类型中的普适性有待验证 | 探究中性粒细胞在减毒沙门氏菌抗肿瘤治疗中的作用机制,并开发增强疗效的联合治疗策略 | 黑色素瘤小鼠模型、减毒沙门氏菌VNP20009、中性粒细胞 | 肿瘤免疫治疗 | 黑色素瘤 | 化学生物学方法、shRNA基因工程 | NA | 实验数据 | NA | shRNA载体构建 | 减毒沙门氏菌VNP20009 | 负载GR-shRNA的工程菌株 | 医学 |
| 102 | 2026-03-24 |
Engineering class I terpene synthases for skeletal diversity: strategies and applications
2026-01-28, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d5np00066a
PMID:41369946
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综述 | 本文综述了工程化I类萜烯合酶以生成多样化萜烯骨架的策略与应用 | 整合了结构引导设计、进化方法、机制聚焦工程及活性位点外修饰等多种策略,并展望了机器学习与代谢工程等未来方向 | 萜烯合酶催化复杂性及序列-功能相关性弱带来了显著的工程挑战 | 工程化I类萜烯合酶以实现萜烯骨架的多样性,这是合成生物学的关键目标 | I类萜烯合酶 | 合成生物学 | NA | 结构引导设计、进化方法、机制聚焦工程、半理性与随机方法(如丙氨酸扫描、饱和诱变、定向进化)、计算建模、高通量筛选 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | NA | NA | 医药、农业、香料工业 |
| 103 | 2026-03-24 |
Challenges and opportunities beyond antibody-drug conjugates: Toward a new era of programmable therapeutic proteins
2026-01-01, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2025.153018
PMID:41297517
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综述 | 本文综述了抗体-药物偶联物(ADCs)的当前成就与未解决问题,并强调了基于全基因编码蛋白质构建体的创新方向,特别是双功能嵌合蛋白,为下一代蛋白质治疗药物奠定基础 | 强调双功能嵌合蛋白作为ADCs的替代方案,结合支架靶向域和肽衍生细胞毒性模块,具有高选择性、紧凑结构、低免疫原性和细菌表达兼容性,并利用合成生物学、展示系统和机器学习加速优化 | NA | 探索超越ADCs的可编程治疗蛋白质,以解决其成本高、生产系统依赖、分子异质性、系统毒性和治疗窗口窄等局限性 | 抗体-药物偶联物(ADCs)及其替代方案,特别是双功能嵌合蛋白质构建体 | 个性化医疗 | 肿瘤学 | 合成生物学、展示系统、机器学习 | NA | NA | NA | NA | 细菌 | NA | 医学 |
| 104 | 2026-03-24 |
Using Embodied Artificial Intelligence Agents to Automate Biorisk Management Tasks in High-Containment Laboratories
2025-Dec, Applied biosafety : journal of the American Biological Safety Association
IF:0.5Q4
DOI:10.1089/apb.2024.0068
PMID:41868755
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研究论文 | 本文探讨了在高级别生物安全实验室中,利用人工智能代理自动化生物风险管理任务,以提升安全性和效率 | 提出了一种结合机器学习风险预测模型与具身AI代理的集成系统,用于自动化物理防护任务,减少人为错误和暴露风险 | NA | 通过AI技术增强高级别生物安全实验室的生物风险管理框架,实现安全与效率的优化 | 高级别生物安全实验室中的生物风险管理任务 | 机器学习 | NA | 机器学习、预测风险建模、异常检测 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 105 | 2026-03-24 |
Biomimetic nanovaccines with self-adjuvant effects induced broad-spectrum neutralizing antibodies against SARS-CoV-2 infection in rodents
2025-11-25, Journal of virology
IF:4.0Q2
DOI:10.1128/jvi.00315-25
PMID:41070969
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研究论文 | 本研究利用合成生物学技术开发了一种具有自佐剂效应的仿生纳米疫苗,旨在诱导广谱中和抗体以预防SARS-CoV-2感染 | 采用负载SARS-CoV-2 RBD蛋白的树枝状介孔有机硅纳米颗粒(DMOSN)构建仿生纳米疫苗,该疫苗能显著促进树突状细胞向次级淋巴器官募集,并同时诱导强大的体液免疫和Th1/Th2偏向的细胞免疫应答 | 研究仅在啮齿动物模型中进行,尚未在人体中验证其安全性和有效性 | 开发能够应对当前和未来SARS-CoV-2变体的下一代广谱疫苗平台 | SARS-CoV-2病毒及其变体 | 合成生物学 | COVID-19 | 合成生物学技术、纳米颗粒制备技术 | NA | NA | 啮齿动物模型 | NA | NA | NA | 医学 |
| 106 | 2026-03-24 |
Decoding the Minimal Translation System of the Plasmodium falciparum Apicoplast: Essential tRNA-modifying Enzymes and Their Roles in Organelle Maintenance
2025-Aug-15, Journal of molecular biology
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.jmb.2025.169156
PMID:40335414
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研究论文 | 本研究通过鉴定恶性疟原虫顶质体中tRNA修饰酶的最小集合,揭示了其在顶质体维持和寄生虫生存中的关键作用 | 首次系统性地鉴定了恶性疟原虫顶质体中tRNA修饰酶的最小必需集合,并发现所有必需酶均集中在tRNA反密码子环的修饰上 | 有两个基因无法被敲除,其中一个可能具有顶质体外的必需功能,另一个可能具有代谢旁路无法替代的关键作用 | 研究恶性疟原虫顶质体最小翻译系统中tRNA修饰酶的作用及其在细胞器维持中的功能 | 恶性疟原虫顶质体中的tRNA修饰酶 | 合成生物学 | 疟疾 | 比较基因组学、蛋白质定位预测、基因敲除技术 | NA | 基因组数据、蛋白质定位数据 | NA | 基因敲除工具 | 恶性疟原虫 | NA | 医学 |
| 107 | 2026-03-23 |
Modular metabolic engineering of Yarrowia lipolytica and semi-rational design of CYP716A520 for enhanced betulinic acid biosynthesis
2026-Jun, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2026.134364
PMID:41802472
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研究论文 | 本研究通过模块化代谢工程改造Yarrowia lipolytica,并结合半理性设计优化CYP716A520酶,以增强桦木酸(betulinic acid)的生物合成 | 首次在Yarrowia lipolytica中通过模块化代谢工程将角鲨烯产量提升813倍,并采用结合计算工具与进化信息的半理性设计策略,成功优化植物来源的P450酶CYP716A520,其L359V变体活性和特异性分别提高4倍和3倍 | 未在摘要中明确提及具体局限性,但可能涉及微生物宿主中植物P450酶的适应性挑战或规模化生产的潜在问题 | 开发可持续且成本效益高的桦木酸微生物生产方法,以替代传统的植物提取 | Yarrowia lipolytica酵母和植物来源的P450酶CYP716A520 | 合成生物学 | NA | 模块化代谢工程、半理性设计、分子动力学模拟 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9(可能涉及,但未在摘要中明确指定,因此输出NA) | Yarrowia lipolytica | 代谢途径工程,包括角鲨烯前体供应路径和P450酶催化系统 | 医药 |
| 108 | 2026-03-23 |
Next-generation strategies for PLA degradation: microbial consortia, metagenomics, enzyme engineering and AI-guided approaches
2026-Mar-21, Archives of microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00203-026-04726-8
PMID:41863619
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综述 | 本文综述了增强聚乳酸(PLA)生物降解的微生物和生物技术策略的最新进展,包括微生物群落筛选、宏基因组学、酶工程和人工智能引导方法 | 强调了将生态筛选与计算酶工程相结合的多学科策略,特别是利用人工智能进行结构预测和机器学习平台设计高性能PLA降解酶 | NA | 加速聚乳酸在工业堆肥、废水处理和生物修复中的降解,推动可持续的PLA废物管理 | 聚乳酸(PLA)及其在各种生态系统中的生物降解过程 | NA | NA | 宏基因组学、环境DNA(eDNA)工具、定向进化、人工智能(AI)结构预测、机器学习 | NA | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | 环境, 工业生物技术 |
| 109 | 2026-03-23 |
CRISPR-enhanced microalgae biosynthesis: a promising approach for future functional feed ingredients
2026-Mar-20, Journal of animal science and biotechnology
IF:6.3Q1
DOI:10.1186/s40104-026-01367-1
PMID:41857689
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综述 | 本文综述了利用CRISPR系统增强微藻生物合成以生产功能性饲料成分的当前应用、构建策略及未来展望 | 重点探讨了基于CRISPR的基因组编辑技术在优化微藻营养特性方面的突破性进展 | NA | 通过合成生物学策略提升微藻细胞工厂的生产力,以满足日益增长的功能性饲料原料市场需求 | 微藻及其合成的高价值生物活性化合物(如优质蛋白质、多不饱和脂肪酸、色素和维生素) | 合成生物学 | NA | CRISPR系统、基因组编辑 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 微藻 | 微藻细胞工厂中的关键通路节点优化 | 农业, 食品 |
| 110 | 2026-03-23 |
Repositioning the Leader Peptide in Graspetide Biosynthesis
2026-Mar-18, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.5c21135
PMID:41789461
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研究论文 | 本研究通过重新定位前导肽序列在graspetide生物合成中的位置,探索了合成生物学中组合酶法生成非天然产物的策略 | 通过将前导肽序列从N端重新定位到C端,保留了graspetide合成酶ThfB的底物选择性修饰能力,并实现了两种不同家族酶(套索肽和graspetide)对嵌合RiPP产物的共同修饰 | 前导肽重新定位后,酶修饰速率降低了约2倍,可能影响合成效率 | 旨在通过工程化前导肽序列,扩展核糖体合成和翻译后修饰肽(RiPPs)的结构多样性,生成自然界中未见的机械互锁肽产物 | 以fuscimiditide前体肽为研究对象,聚焦其前导肽序列的重新定位及其对graspetide合成酶ThfB功能的影响 | 合成生物学 | NA | 酶法重组、前导肽工程、翻译后修饰分析 | NA | 生化实验数据 | NA | 前导肽工程策略 | NA | 通过重新定位前导肽序列,设计嵌合RiPP生物合成途径,实现套索肽和graspetide家族酶的共同修饰 | 工业生物技术 |
| 111 | 2026-03-23 |
A review on microbial lipids conversion from organic wastes: Adaptive laboratory evolution-driven strategies for enhanced biofuel precursor synthesis
2026-Mar-18, Environmental research
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.envres.2026.124312
PMID:41856232
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综述 | 本文综述了利用适应性实验室进化(ALE)技术驱动策略,将有机废物转化为微生物油脂以增强生物燃料前体合成的研究。 | 提出了将ALE技术与合成生物学、精准代谢工程、基因组编辑和机器学习相结合的新型整合策略,以拓展ALE技术在有机废物资源化利用中的应用边界。 | NA | 探讨如何利用ALE技术增强产油微生物对复杂发酵液中抑制成分的耐受性,从而提高从有机废物到微生物油脂的生物转化效率。 | 产油微生物及其在有机废物(发酵液)资源化转化过程中的适应性进化。 | NA | NA | 适应性实验室进化(ALE),合成生物学,精准代谢工程,基因组编辑,机器学习 | NA | NA | NA | NA | 产油微生物 | NA | 能源,环境 |
| 112 | 2026-03-23 |
Microplastic biodegradation and environmental safety: From microbial mechanisms to engineered systems and circular bio-based implementation
2026-Mar-15, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2026.120016
PMID:41833249
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综述 | 本文综述了微塑料生物降解的微生物机制、工程系统及环境安全,并探讨了其在循环生物基实施中的可行性 | 对微塑料生物降解过程进行了机制整合分析,明确区分了表面改性、解聚、生物转化和完全矿化,并重点关注了环境安全考虑和循环生物基回收框架的整合 | 可控条件下解聚效率虽已提升,但规模化、法规遵从性及生态系统层面的风险评估仍是核心挑战 | 评估微塑料生物降解策略的环境安全性与循环生物基实施的可行性 | 微塑料(合成聚合物颗粒,尺寸小于5毫米) | 环境生物技术 | NA | 微生物降解、酶工程、合成生物学 | NA | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | 环境 |
| 113 | 2026-03-23 |
GENETTA: a Network-Based Tool for the Analysis of Complex Genetic Designs
2023-12-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00333
PMID:37963232
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研究论文 | 介绍GENETTA软件工具,该工具利用图论将合成生物学设计转化为网络进行分析和操作 | 通过图论方法将复杂合成生物学设计表示为网络,支持动态可视化定制和多数据库数据整合 | NA | 开发用于分析和操作复杂合成生物学设计的网络工具 | 合成生物学设计 | 合成生物学 | NA | 图论 | NA | 设计数据 | NA | NA | NA | 交互网络和部件层次结构 | 工业生物技术 |
| 114 | 2026-03-22 |
Precision modulation of the gut microbiota-immune axis by natural products: a structure-activity relationship perspective in cancer immunotherapy
2026-Mar-20, Journal of Asian natural products research
IF:1.3Q3
DOI:10.1080/10286020.2026.2644307
PMID:41860786
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综述 | 本文从构效关系视角综述了天然产物如何通过精确调控肠道菌群-免疫轴来增强癌症免疫治疗效果 | 首次从多糖、萜类、多酚和生物碱等天然产物的特定结构决定簇出发,系统解构其如何驱动特定的微生物重塑和免疫调节结果,并提出未来结合人工智能多组学和合成生物学进行理性设计 | NA | 探讨天然产物通过调控肠道菌群-免疫轴来克服癌症免疫治疗耐药性的机制与策略 | 天然产物(多糖、萜类、多酚、生物碱)及其对肠道微生物群和宿主免疫系统的影响 | NA | 癌症 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 115 | 2026-03-22 |
Advances in synthetic biology for engineering methylotrophic microbial cell factories
2026-Mar-19, Journal of bacteriology
IF:2.7Q3
DOI:10.1128/jb.00383-25
PMID:41665342
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综述 | 本文综述了合成生物学在工程化甲基营养型微生物细胞工厂方面的最新进展,包括构建高效甲醇利用途径、优化氧化效率和氧化还原平衡等策略 | 总结了通过合成生物学和代谢工程策略提升甲醇同化效率的创新方法,如工程化甲醇脱氢酶和优化辅因子利用 | NA | 促进工业甲醇利用和可持续发展,通过理性设计高性能微生物平台 | 甲基营养型微生物细胞工厂 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、代谢工程、适应性实验室进化 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 大肠杆菌、酿酒酵母、枯草芽孢杆菌、哺乳动物细胞、植物 | 切换开关、振荡器、逻辑门、生物传感器、代谢途径 | 工业生物技术、环境、能源 |
| 116 | 2026-03-22 |
Protein-free membrane fusion: a refined view of the delicate fusogenic properties of calcium
2026-Mar-19, Biophysical journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1016/j.bpj.2026.03.040
PMID:41863074
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研究论文 | 本研究通过微流控捕获平台结合共聚焦显微镜,定量研究了钙离子介导的巨型单层囊泡(GUVs)膜融合过程,揭示了钙离子作为无蛋白融合剂的精细作用机制 | 首次在细胞尺度膜上系统量化钙介导的膜融合,同时测量脂质混合、内容物混合和融合结果,揭示了钙融合作用的狭窄参数空间 | 研究仅限于合成膜系统,未涉及生物膜中的天然蛋白环境 | 阐明钙离子作为无蛋白融合剂在细胞尺度膜上的融合机制与条件 | 带负电荷的巨型单层囊泡(GUVs) | 合成生物学 | NA | 微流控捕获平台、共聚焦显微镜 | NA | 显微镜图像、定量测量数据 | 数百个单囊泡 | NA | NA | NA | 合成生物学、膜重建研究 |
| 117 | 2026-03-22 |
A reversible small-molecule-switchable self-amplifying RNA expression platform
2026-Mar-14, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2026.151436
PMID:41839281
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研究论文 | 本研究开发了一种可逆小分子开关控制的自扩增RNA表达平台,用于精确调控基因表达 | 首次将自扩增RNA设计为可编程基因电路,实现小分子配体对多个下游基因的独立可逆调控 | NA | 开发可控的RNA治疗和合成生物学应用平台 | 自扩增RNA构建体及其在基因表达调控中的应用 | 合成生物学 | NA | RNA工程、脂质纳米颗粒封装 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 哺乳动物细胞 | 包含去稳定化结构域、RNA结合蛋白L7Ae、四环素响应阻遏蛋白和k-turn RNA基序的可编程RNA基因电路 | 医学 |
| 118 | 2026-03-22 |
Repurposing nuclear receptors for ligand-responsive liquid condensate formation and gene regulation
2026-01-31, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-69099-4
PMID:41620421
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研究论文 | 本文通过重新利用核受体配体结合域和共激活因子,开发了响应激素或临床批准药物的化学诱导二聚化系统,并设计了配体响应的液-液相分离凝聚物,用于基因调控和转录放大 | 创新点包括利用内源性信号分子(如激素和药物)构建化学诱导二聚化系统,以及设计配体控制的液-液相分离凝聚物以实现可调谐的转录控制,实现高达数百倍的激活效果 | NA | 研究目的是开发与内源性生理信号整合的合成生物学工具,用于基因调控和转录控制 | 研究对象包括核受体(如TRβ、VDR、RARγ、ERβ、GR2)的配体结合域、TIF2共激活因子肽,以及相关的激素和药物配体 | 合成生物学 | NA | 化学诱导二聚化、液-液相分离 | NA | NA | NA | NA | NA | 双输入转录开关、配体响应的液-液相分离凝聚物 | 医学、基因电路、生物传感、治疗学 |
| 119 | 2026-03-22 |
Evolutionary repurposing of a metabolic thiolase complex enables antibiotic biosynthesis
2026-01-30, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-68910-6
PMID:41617701
|
研究论文 | 本研究报道了口腔链球菌中的一种三重酶复合物,该复合物通过不寻常的Friedel-Crafts C-乙酰化反应完成抗生素reutericyclin A的生物合成 | 揭示了硫解酶复合物通过关键催化残基重编程实现底物特异性转变,从原始的HMG-CoA合成功能进化获得Friedel-Crafts C-酰化新功能的罕见案例 | NA | 探究初级代谢酶如何进化获得次级代谢中的特殊功能,阐明酶功能多样化的进化机制 | 口腔链球菌来源的三重酶复合物(SmaATase),包含HMGS、ACAT和DUF35蛋白 | NA | NA | 冷冻电镜、生化表征、分子建模、进化分析 | NA | 结构数据、生化数据、进化数据 | NA | NA | 口腔链球菌(Streptococcus macacae) | NA | 合成生物学(为C-C键形成催化剂工程提供模板) |
| 120 | 2026-03-22 |
Engineering yeast for sustainable bioproduction of tryptophan-derived aromatic compounds
2026-Jan-05, FEMS yeast research
IF:2.4Q3
DOI:10.1093/femsyr/foag012
PMID:41770028
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综述 | 本文总结了利用酵母工程化生产色氨酸衍生芳香化合物的最新进展 | 聚焦于色氨酸作为关键前体,综述了酵母代谢工程和合成生物学工具在可持续生产芳香化合物中的应用 | NA | 实现色氨酸衍生芳香化合物在酵母中的高效、可扩展且经济可行的生物合成 | 酵母细胞工厂 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、合成生物学工具 | NA | NA | NA | NA | 酵母 | NA | 聚合物、食品、饲料、化妆品、制药 |