本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新,已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!
除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价5元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
101 | 2025-05-08 |
Development of a Cell-Free, Toehold Switch-Based Biosensor for Rapid and Sensitive Zika Virus Detection
2025-Feb-18, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.4c05808
PMID:39924741
|
研究论文 | 开发了一种基于无细胞脚趾开关技术的生物传感器,用于快速、灵敏地检测寨卡病毒 | 结合脚趾开关技术和核酸序列扩增技术(NASBA),显著提高了检测灵敏度和特异性 | 脚趾开关在检测低丰度目标时存在固有局限性 | 开发快速、灵敏的寨卡病毒诊断工具 | 寨卡病毒 | 合成生物学 | 传染病 | 脚趾开关技术, 核酸序列扩增技术(NASBA) | NA | 核酸 | NA |
102 | 2025-05-08 |
A molecular proximity sensor based on an engineered, dual-component guide RNA
2025-Feb-12, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.98110
PMID:39937081
|
research paper | 该研究提出了一种名为'P3编辑'的策略,通过工程化的双组分引导RNA将蛋白质-蛋白质接近性连接到功能性CRISPR-Cas9系统的形成 | 通过工程化crRNA:tracrRNA相互作用,将已知的蛋白质-蛋白质相互作用和化学诱导的二聚化作为激活基因编辑的触发器 | NA | 增强CRISPR基因编辑在合成分子电路中的可控性 | 人类细胞中的基因编辑 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9, 双组分引导RNA, ADAR-based RNA传感器 | NA | 分子相互作用数据 | NA |
103 | 2025-05-08 |
Study on the framework of ATP energy cycle system in Escherichia coli
2025-Feb-12, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-024-13350-9
PMID:39937288
|
研究论文 | 研究大肠杆菌中ATP能量循环系统的框架,特别是通过CRISPR-Cas9技术进行基因编辑以优化ATP合成路径 | 发现单个ppk基因(No.8)能够完成循环反应,并通过MUCICAT技术将其插入大肠杆菌基因组的不同位置和拷贝数,实现不同活性水平 | 研究仅针对大肠杆菌,未涉及其他生物体,且插入基因的难度和表达水平可能受基因组位置影响 | 开发一种快速、无标记、多位点和多拷贝的基因组编辑系统,以推动合成生物学的发展 | 大肠杆菌及其ATP合成路径中的ppk基因(No.8) | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9, MUCICAT | NA | 基因组数据 | NA |
104 | 2025-05-08 |
A synthetic chronogenetic gene circuit for programmed circadian drug delivery
2025-Feb-07, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-56584-5
PMID:39920119
|
研究论文 | 开发了一种基于合成生物学和组织工程的昼夜节律基因电路,用于程序化昼夜节律药物递送 | 结合合成生物学和组织工程技术,开发了名为“chronogenetics”的昼夜节律基因电路,能够根据核心时钟基因Period2 (Per2)的启动子表达预设的转基因 | 研究目前仅在体外和小鼠模型中验证,尚未进行人体临床试验 | 开发一种基于细胞的昼夜节律疗法,用于昼夜节律医学中的各种应用 | 诱导多能干细胞、软骨构建物 | 合成生物学、组织工程 | 类风湿性关节炎、炎症性疾病 | 合成生物学、组织工程 | NA | NA | NA |
105 | 2025-05-08 |
The evolution of sequences and spatial conformation in vertebrate chromosomes
2025-Feb, Yi chuan = Hereditas
DOI:10.16288/j.yczz.24-212
PMID:39924699
|
review | 本文综述了脊椎动物染色体的序列和空间构象的进化过程,探讨了染色体重排在物种形成中的作用、分子机制、进化模式以及性染色体作为研究染色体进化的一般范例的意义 | 利用高通量测序技术革新了对染色体变异的理解,并探讨了合成生物学为染色体进化研究带来的新机遇和挑战 | NA | 理解和研究脊椎动物染色体进化 | 脊椎动物染色体 | 基因组学 | NA | 高通量测序技术 | NA | 基因组数据 | NA |
106 | 2025-05-08 |
Model-guided gene circuit design for engineering genetically stable cell populations in diverse applications
2025-Feb, Journal of the Royal Society, Interface
DOI:10.1098/rsif.2024.0602
PMID:39933591
|
研究论文 | 本文提出了一种生物分子控制器,用于在合成生物学中维持工程细胞群体的遗传稳定性 | 开发了一种独立于突变合成基因身份的通用生物分子控制器,可广泛应用于不同合成基因电路而不需重新设计 | 未提及具体的实验验证或实际应用中的潜在问题 | 解决合成生物学中工程细胞群体遗传稳定性问题 | 工程细胞群体 | 合成生物学 | NA | 生物分子控制器设计 | 资源感知细胞模型 | 模拟数据 | NA |
107 | 2025-05-08 |
[Function of flavoprotein monooxygenases in natural product biosynthesis]
2025-Jan, Zhongguo Zhong yao za zhi = Zhongguo zhongyao zazhi = China journal of Chinese materia medica
|
综述 | 本文全面综述了黄素蛋白单加氧酶(FPMOs)在天然产物生物合成中的功能及其最新研究进展 | 系统分析了植物Class B FPMOs的分类、催化反应及机制,并总结了其在天然产物合成中的应用潜力 | 未提及具体实验数据或样本量,主要基于文献综述 | 深化对FPMOs的理解,促进其从基础研究向实际应用的转化 | 植物Class B FPMOs及其在天然产物生物合成中的作用 | 生物化学与分子生物学 | NA | NA | NA | 文献数据 | NA |
108 | 2025-05-08 |
A molecular proximity sensor based on an engineered, dual-component guide RNA
2024-Aug-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.08.14.553235
PMID:37645782
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为'P3编辑'的策略,通过工程化的双组分引导RNA将蛋白质-蛋白质接近性连接到功能性CRISPR-Cas9系统的形成 | 提出了一种将蛋白质-蛋白质接近性与CRISPR-Cas9基因组编辑功能连接的新策略,增强了基因组编辑的可控性 | NA | 开发可编程的合成分子电路,将分子事件(如蛋白质相互作用)与基因组编辑联系起来 | 人类细胞中的蛋白质-蛋白质相互作用和化学诱导的二聚化 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9, 基础编辑, 主要编辑 | NA | 分子相互作用数据 | NA |
109 | 2025-05-08 |
Resurrecting ancestral antibiotics: unveiling the origins of modern lipid II targeting glycopeptides
2023-11-29, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-43451-4
PMID:38030603
|
研究论文 | 本研究通过计算技术和合成生物学方法,揭示了脂质II靶向糖肽抗生素的祖先分子paleomycin的结构及其抗生素活性,探索了自然界如何通过进化优化这类抗生素 | 结合计算技术和合成生物学方法,成功预测并复活了脂质II靶向糖肽抗生素的祖先分子paleomycin,揭示了其结构和抗生素活性 | 研究主要依赖于计算预测和合成生物学技术,可能无法完全还原自然进化过程中的所有细节 | 探索脂质II靶向糖肽抗生素的进化起源及其优化策略 | 脂质II靶向糖肽抗生素(如teicoplanin和vancomycin)及其祖先分子paleomycin | 合成生物学 | 抗生素耐药性细菌感染 | 计算技术、合成生物学技术 | NA | NA | NA |
110 | 2025-05-07 |
Phosphorothioate-Modified Hairpin G-Triplex Reporter-Assisted Split CRISPR/Cas12a-Powered Biosensor for "Turn-On" Fluorescent Detection of Nucleic Acid and Non-Nucleic Acid Targets
2025-May-06, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.5c00140
PMID:40270429
|
research paper | 开发了一种基于CRISPR/Cas12a和硫代磷酸酯修饰的G-三链体报告基因的“开启”型荧光生物传感器,用于核酸和非核酸靶标的高灵敏度检测 | 首次探索了硫代磷酸酯修饰的G-四链体和G-三链体序列与硫黄素T结合在分裂CRISPR/Cas12a系统中产生“开启”荧光信号的新现象,并开发了相应的生物传感器 | 未提及在更复杂样本中的实际应用效果及可能的干扰因素 | 开发高灵敏度、低背景的“开启”型荧光生物传感器,用于核酸和非核酸靶标的检测 | 核酸靶标(miRNA-21)和非核酸靶标(卡那霉素) | 合成生物学传感技术 | NA | CRISPR/Cas12a系统,硫代磷酸酯修饰技术,荧光检测 | SCas12a/psHG3系统 | 荧光信号数据 | 未明确说明具体样本数量,但检测限达到100 fM(miRNA-21)和100 pM(卡那霉素) |
111 | 2025-05-07 |
Engineering plant photoreceptors towards enhancing plant productivity
2025-May-06, Plant molecular biology
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s11103-025-01591-9
PMID:40327169
|
综述 | 本文综述了植物光感受器在调节农艺重要性状中的作用、植物光感受器工程的现状、光遗传学和合成生物学的应用及其在作物改良中的实际考虑 | 探讨了通过工程化光感受器活动或光感受器途径来增强作物生产力的潜在途径,以及光遗传学工具在实时操控植物细胞反应中的应用 | 未提及具体实验数据或案例研究,主要集中于理论和技术前景的讨论 | 探索通过光感受器工程和光遗传学技术提高植物生产力的方法和潜力 | 植物光感受器及其在作物改良中的应用 | 合成生物学 | NA | 光遗传学、合成生物学 | NA | NA | NA |
112 | 2025-05-07 |
The key role of cytochrome P450s in the biosynthesis of plant derived natural products
2025-May, Plant physiology and biochemistry : PPB
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.plaphy.2025.109695
PMID:40015195
|
综述 | 本文综述了细胞色素P450在植物源性天然产物生物合成中的关键作用 | 重点探讨了细胞色素P450在天然产物下游合成途径和结构修饰中的重要作用,并总结了天然产物生物合成和合成生物学研究的最新进展 | NA | 深入了解细胞色素P450酶在天然产物合成途径中的作用,促进天然产物的开发和合成生物学研究 | 植物源性天然产物及其生物合成途径中的细胞色素P450酶 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
113 | 2025-05-07 |
Future-proofing ornamental plants: Cutting-edge strategies for drought resistance and sustainability
2025 May-Jun, Physiologia plantarum
IF:5.4Q1
DOI:10.1111/ppl.70255
PMID:40325615
|
review | 本文综述了观赏植物抗旱性研究的最新进展,探讨了干旱胁迫对植物形态、生理、生化及美学价值的影响,并介绍了CRISPR/Cas9、合成生物学和数字表型分析等前沿技术在培育抗旱观赏植物中的应用 | 整合了多组学方法、先进育种技术和数字工具,加速关键抗旱基因和性状的鉴定,并探讨了表观遗传工程、合成生物学和高通量表型分析在培育更具抗逆性和美学价值的观赏植物中的潜力 | 虽然对植物干旱胁迫响应的理解取得了显著进展,但如何将这些知识有效转化为观赏植物的实际育种策略仍存在空白 | 开发抗旱观赏植物,以应对干旱胁迫对观赏园艺的挑战,满足对美观且可持续景观日益增长的需求 | 观赏植物 | 园艺学 | NA | CRISPR/Cas9, 合成生物学, 数字表型分析, 多组学方法 | NA | NA | NA |
114 | 2025-05-07 |
QM/MM Unlocks The Catalytic Mechanism of YtfE: The Structural Reorganization of The Active Site Enables Nitrite-to-NO Conversion
2025-Apr-28, Chemistry (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/chem.202500817
PMID:40296212
|
研究论文 | 本研究通过多尺度计算方法揭示了YtfE蛋白在亚硝酸盐还原过程中的分子机制 | 揭示了活性位点的结构重组对亚硝酸盐还原机制的关键作用,特别是氢键网络和HONO中间体配位转换的影响 | 研究主要基于计算模拟,缺乏实验验证 | 阐明YtfE蛋白在亚硝酸盐还原中的催化机制 | 大肠杆菌铁中心修复蛋白(YtfE) | 计算生物学 | NA | QM/MM, QM/MM MD, QM计算 | NA | 计算模拟数据 | NA |
115 | 2025-05-07 |
Robust and highly efficient transformation method for a minimal mycoplasma cell
2025-Mar-20, Journal of bacteriology
IF:2.7Q3
DOI:10.1128/jb.00415-24
PMID:39903184
|
研究论文 | 本文报道了一种针对最小细胞JCVI-syn3B的稳健且高效的转化方法 | 开发了一种高效的转化方法,显著提高了转化效率,并减少了所需的DNA和受体细胞数量 | NA | 改进最小细胞的转化方法,以促进基因工程和生物学研究 | 最小细胞JCVI-syn3B | 合成生物学 | NA | 转化方法 | NA | NA | 小于0.2 mL的培养物,约1×10^10细胞和10 ng质粒DNA |
116 | 2025-05-07 |
A new flavor of synthetic yeast communities sees the light
2025-Mar-12, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.02008-23
PMID:39912663
|
综述 | 本文综述了利用合成生物学策略构建人工酵母群落的最新进展,特别是光遗传学在调控群落表型中的应用 | 强调了光遗传学技术在合成酵母群落中实现时空调控的创新应用 | NA | 探索合成微生物群落的构建及其在生态动力学和代谢工程中的应用 | 合成酵母群落 | 合成生物学 | NA | 光遗传学 | NA | NA | NA |
117 | 2025-05-07 |
Innovative logic "AND" gate gene circuits for bladder cancer treatment: preclinical study
2025-Mar-01, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000002270
PMID:39903549
|
research paper | 该研究开发了一种名为LAG-DTGC的合成基因电路,用于膀胱癌的精准治疗 | 创新性地设计了逻辑'AND'门双靶点基因电路,能够整合多个信号以实现膀胱癌细胞信号通路的全面重编程 | 目前仅进行了临床前研究,尚未进行人体试验 | 开发针对膀胱癌的精准、低毒治疗方法 | 膀胱癌细胞 | 合成生物学 | 膀胱癌 | 生物信息学分析 | 逻辑'AND'门双靶点基因电路(LAG-DTGC) | 基因表达数据 | NA |
118 | 2025-05-07 |
Characterization of Rationally Designed CRISPR/Cas9-Based DNA Methyltransferases with Distinct Methyltransferase and Gene Silencing Activities in Human Cell Lines and Primary Human T Cells
2025-Feb-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00569
PMID:39898483
|
研究论文 | 本研究通过合理设计CRISPR/Cas9基础的DNA甲基转移酶,探索了其在人类细胞系和原代人类T细胞中的甲基化和基因沉默活性 | 扩展了对哺乳动物DNMT3A甲基转移酶催化核心的合理设计,并测试了三种dCas9-DNMT3A/3L变体在不同人类细胞系和原代T细胞中的表现 | 研究主要局限于细胞系和原代T细胞,可能限制了在其他细胞类型或体内环境中的应用和机制理解 | 扩展表观遗传编辑的合成生物学工具包,并为工程化dCas基础的DNMT在原发性哺乳动物细胞类型中的应用提供路线图 | 人类细胞系和原代人类T细胞 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9, DNA甲基转移酶技术 | dCas9-DNMT3A/3L变体 | 基因表达和DNA甲基化数据 | 多种人类细胞系和原代人类T细胞 |
119 | 2025-05-07 |
DRIMS: A Synthetic Biology Platform that Enables Deletion, Replacement, Insertion, Mutagenesis, and Synthesis of DNA
2025-Feb-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00649
PMID:39902634
|
研究论文 | 介绍了一种名为DRIMS的合成生物学平台,能够高效地进行DNA的删除、替换、插入、突变和合成 | 开发了一种基于PCR的新型平台DRIMS,通过recA非依赖的重组途径,在单一扩增步骤中完成多种DNA修饰和合成,无需DNA模板 | 未明确说明平台在大规模或复杂DNA序列处理中的效率限制 | 加速合成生物学领域的发展及治疗方法的开发 | DNA序列的修饰与合成 | 合成生物学 | 癌症 | PCR, recA非依赖的重组途径 | NA | DNA序列 | 进行了多种DNA操作,包括4次删除、64次替换、4次嵌合抗原受体组件替换、51次人工microRNA插入、5种点突变及8段DNA合成 |
120 | 2025-05-07 |
Spatial Control of CAR T Cell Activation Using Tumor-Homing Polymers
2025-Feb-12, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.4c15442
PMID:39902740
|
research paper | 该研究开发了一种名为IMPACT的新框架,通过合成生物学和生物材料方法实现CAR T细胞的空间控制激活 | 提出了IMPACT框架,首次实现了通过聚合物介导的解剖学控制IF-THEN门控CAR T细胞 | 目前仅在鼠类肿瘤模型中进行了验证,尚未在人体中测试 | 提高CAR T细胞疗法的特异性,减少脱靶毒性 | CAR T细胞和肿瘤归巢聚合物 | 合成生物学 | 肿瘤 | 合成生物学和生物材料方法 | IF-THEN门控CAR T细胞 | NA | 鼠类肿瘤模型 |