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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2025-10-06 |
Design principles of gene circuits for longevity
2025-Oct, Trends in cell biology
IF:13.0Q1
DOI:10.1016/j.tcb.2025.02.006
PMID:40082090
|
综述 | 探讨影响寿命的基因回路设计原则,重点关注反馈回路在维持细胞稳态中的作用 | 从基因回路层面系统分析衰老机制,提出通过工程化稳定固定点或振荡来延长寿命的合成生物学策略 | 主要基于酵母模型的研究,在高等生物中的适用性需要进一步验证 | 揭示基因回路在衰老过程中的调控机制并探索延长寿命的工程化方法 | 基因调控网络和反馈回路,特别是酵母中的SIR2-HAP回路 | 合成生物学 | 衰老相关疾病 | 系统生物学、合成生物学方法 | NA | NA | NA | NA | 酵母 | 反馈回路、相互抑制通路、稳定固定点、振荡电路 | 医学 |
| 102 | 2025-10-06 |
Gene expression and protein abundance: Just how associated are these molecular traits?
2025-Sep-30, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108720
PMID:41038299
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综述 | 回顾和分类研究基因表达与蛋白质丰度关系的文献,探讨其在生物技术应用中的潜力 | 系统比较不同实验环境和细胞背景下基因表达与蛋白质丰度的相关性,整合单细胞分析最新进展和蛋白质约束代谢模型 | NA | 探讨基因表达与蛋白质丰度的关联性及其在代谢工程和合成生物学中的应用潜力 | 基因表达与蛋白质丰度的相关性研究 | 生物信息学 | NA | 转录组学、蛋白质组学、单细胞分析 | 统计模型、机制模型、机器学习、深度学习 | 组学数据 | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术 |
| 103 | 2025-10-06 |
Metabolic engineering of microorganisms for tailor-made biopolymer production: A review
2025-Sep-30, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.147922
PMID:41038478
|
综述 | 本文综述了通过微生物代谢工程生产定制生物聚合物的最新进展 | 系统比较天然与工程化微生物平台的优缺点,强调代谢工程在开发下一代生物聚合物中的关键作用 | NA | 改善生物聚合物的产量、质量和功能,支持工业创新和全球可持续发展目标 | 微生物生产的生物聚合物(如细菌纤维素、透明质酸、聚羟基脂肪酸酯、聚-γ-谷氨酸) | 合成生物学 | NA | 代谢工程、系统生物学工具(蛋白质组学、基因组学、合成生物学) | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 微生物 | NA | 食品, 医疗, 工业生物技术 |
| 104 | 2025-10-06 |
Development of an intron-optimized dual base editor enables enhanced echinocandin B tolerance and regulatory circuit optimization in Aspergillus nidulans
2025-Sep-26, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.147955
PMID:41016690
|
研究论文 | 开发内含子优化的双碱基编辑器,用于增强构巢曲霉中棘白菌素B耐受性和调控回路优化 | 采用真菌内含子策略阻断大肠杆菌中脱氨酶-nCas9融合蛋白泄露表达,开发了PAM-less SpRY-CABE系统实现高效双碱基编辑 | 未明确说明系统在其他丝状真菌中的普适性 | 解决棘白菌素B生产中的调控机制认知不足和产物抑制问题 | 构巢曲霉及其棘白菌素B生物合成途径 | 合成生物学 | NA | 双碱基编辑(C-to-T和A-to-G)、启动子诱变、原位进化 | NA | 基因序列、表达数据、代谢产物 | NA | CRISPR-Cas9, 双碱基编辑器 | 构巢曲霉, 大肠杆菌 | AniJ转录调控回路优化, β-1,3-葡聚糖合成酶(FKS1)进化 | 工业生物技术, 医药 |
| 105 | 2025-10-06 |
Sustainable production of microalgal nanoparticles through green synthesis towards cancer treatment
2025, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2025.1621876
PMID:41040414
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综述 | 本文综述了微藻纳米颗粒的绿色合成方法及其在癌症治疗中的应用机制 | 提出将合成生物学和基因工程微藻技术整合到微藻纳米颗粒的绿色合成中 | NA | 探讨微藻纳米颗粒的绿色合成及其在癌症治疗中的应用前景 | 微藻纳米颗粒 | 生物技术 | 癌症 | 绿色合成 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 微藻 | NA | 医药 |
| 106 | 2025-10-06 |
Immunomodulatory role of gut microbial metabolites: mechanistic insights and therapeutic frontiers
2025, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2025.1675065
PMID:41040871
|
综述 | 本文系统阐述肠道微生物代谢物通过信号分子调控宿主免疫的机制及治疗前景 | 整合空间代谢组学、合成生物学和纳米医学技术,提出靶向代谢物-免疫轴的新型治疗策略 | 实现个性化微生物组-免疫调控仍面临挑战,需进一步解决个体差异和时空特异性问题 | 解析肠道微生物代谢物的免疫调节机制并探索相关治疗应用 | 肠道微生物代谢物(短链脂肪酸、次级胆汁酸、色氨酸衍生物等)及其免疫调节功能 | 微生物免疫学 | 炎症性和自身免疫性疾病 | 空间代谢组学、多组学整合分析、AI预测建模 | NA | 代谢组学数据、免疫学数据 | NA | 合成生物学 | NA | NA | 医学 |
| 107 | 2025-10-06 |
Structural and functional insights into cellulosomes: masters of plant cell wall degradation
2025, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2025.1638551
PMID:41040872
|
综述 | 本文系统探讨了纤维素小体的结构和功能机制及其在植物细胞壁降解中的应用潜力 | 全面重估纤维素小体的模块化架构、动态组装机制及合成生物学驱动的生物技术应用潜力 | NA | 解析纤维素小体在植物生物质降解中的结构与功能机制 | 厌氧细菌和真菌中的纤维素小体复合酶系统 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 厌氧细菌, 真菌 | 碳水化合物结合模块, 黏连蛋白-对接蛋白相互作用机制 | 工业生物技术, 能源 |
| 108 | 2025-10-06 |
The role of Food Science and Foodomics in the implementation of One-Health
2025, Frontiers in nutrition
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fnut.2025.1662767
PMID:41041135
|
综述 | 探讨食品科学与食品组学在实现'同一健康'理念中的潜在应用 | 首次系统讨论食品科学与食品组学在推动'同一健康'发展中的多重可能性,并探索合成生物学在食品科学中的新兴潜力 | NA | 探索食品科学与食品组学如何帮助实现'同一健康'目标 | 同一健康理念、食品科学、食品组学、合成生物学 | NA | 人畜共患疾病 | 食品组学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 食品, 环境, 医学 |
| 109 | 2025-10-05 |
Synthetic biology meets diagnostics: Engineering biosensing platforms for rapid and accurate pathogen and viral detection
2025-Dec-15, Biosensors & bioelectronics
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.bios.2025.117946
PMID:40939269
|
综述 | 本文综述了合成生物学与生物传感技术结合在病原体和病毒快速精准检测诊断系统开发中的应用 | 整合CRISPR系统、argonaute蛋白和模块化遗传电路等合成生物学工具与人工智能、纳米技术相结合,开发自动化、低成本、高通量诊断系统 | NA | 推进病原体检测和体外诊断技术的发展 | 病原体和病毒检测诊断系统 | 合成生物学 | 传染病 | CRISPR系统、argonaute蛋白、模块化遗传电路、无细胞系统、纳米材料增强平台 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas | NA | 模块化遗传电路、生物传感器 | 医学, 公共卫生, 食品安全 |
| 110 | 2025-10-05 |
Pseudomonas spp. and antimicrobial resistance: unlocking new horizons with 1-hydroxyphenazine
2025-Oct-04, Folia microbiologica
IF:2.4Q3
DOI:10.1007/s12223-025-01355-4
PMID:41045408
|
综述 | 本文系统综述了1-羟基吩嗪作为新型抗菌策略在对抗耐药菌方面的潜力 | 首次全面整合1-羟基吩嗪作为病原代谢物和先导化合物的双重作用机制及应用前景 | NA | 探索新型抗菌策略以应对日益严重的抗生素耐药性问题 | 1-羟基吩嗪及其在微生物竞争和抗菌治疗中的应用 | NA | 细菌感染 | 合成生物学、代谢工程、纳米载体递送系统 | NA | 文献资料 | NA | NA | 假单胞菌属 | NA | 医学, 农业, 生物技术 |
| 111 | 2025-10-05 |
AI-directed gene fusing prolongs the evolutionary half-life of synthetic gene circuits
2025-Oct-03, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adx0796
PMID:41032600
|
研究论文 | 提出一种名为STABLES的基因融合策略,通过机器学习优化基因配对和连接设计,显著提高合成基因电路的进化稳定性 | 开发了结合机器学习预测的基因融合策略,通过将目的基因与必需内源基因连接并在中间插入“渗漏”终止密码子,同时实现选择压力和高表达 | NA | 解决合成生物学中异源基因表达随时间丢失的进化不稳定性问题 | 合成基因电路、荧光蛋白、人胰岛素原 | 合成生物学 | NA | 机器学习、生物信息学分析、生物物理特征分析 | 机器学习框架 | 生物信息学数据、生物物理特征数据 | NA | 基因融合技术 | 大肠杆菌 | 基因融合电路,包含目的基因、必需内源基因和中间渗漏终止密码子 | 工业生物技术,合成生物学 |
| 112 | 2025-10-05 |
The mechanism of thioamide formation by the YcfA-YcfC system in 6-thioguanine biosynthesis
2025-Oct-03, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-63937-7
PMID:41044055
|
研究论文 | 本研究揭示了YcfA-YcfC系统在6-硫代鸟嘌呤生物合成中形成硫酰胺键的分子机制 | 首次通过生化与结构生物学方法阐明了YcfA的七聚体组装机制及其与GTP和PLP的相互作用,并成功合成具有抗菌活性的硒代类似物 | 未在完整细胞环境中验证该系统的功能,且对YcfC的具体催化机制仍需进一步研究 | 阐明6-硫代鸟嘌呤生物合成中关键硫酰胺基团形成的分子机制 | YcfA-YcfC酶系统及其在6-硫代鸟嘌呤生物合成中的作用 | 结构生物学与生物化学 | 儿童急性淋巴细胞白血病 | 晶体结构解析、冷冻电镜(cryo-EM)、功能分析、多组学分析 | NA | 结构数据、生化数据、组学数据 | NA | NA | NA | NA | 药物开发、合成生物学 |
| 113 | 2025-10-05 |
How hard is it to encapsulate life? The general constraints on encapsulation
2025-Oct-02, Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences
DOI:10.1098/rstb.2024.0297
PMID:41035324
|
研究论文 | 本文探讨了生命系统封装面临的一般性约束条件 | 通过分析现存生物化学系统和通用自催化系统,揭示了封装生命系统的速率和体积分数限制 | 基于地球现有生物系统的分析可能不具普适性 | 研究生命系统封装的基本约束条件 | 地球现存生物化学系统、通用自催化系统 | 合成生物学 | NA | 理论建模 | NA | 理论分析 | NA | NA | NA | NA | 生命起源研究, 天体生物学, 合成生物学 |
| 114 | 2025-10-05 |
Before LUCA: unearthing the chemical roots of metabolism
2025-Oct-02, Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences
DOI:10.1098/rstb.2024.0292
PMID:41035332
|
研究论文 | 探讨从地球化学到生物化学的转变过程,通过计算方法和系统化学研究原始生化系统的演化 | 将LUCA代谢反应规则映射到前生物反应,探索非生物化学与早期生命之间的可能联系 | 连接原始地球化学与LUCA更复杂代谢能力仍存在挑战 | 研究生命起源过程中代谢系统的演化机制 | 原始生化系统、前生物反应、LUCA代谢 | 系统化学、计算生物学 | NA | 计算方法、生成模型 | 生成模型 | 化学反应数据、热力学数据 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 |
| 115 | 2025-10-05 |
Towards origins of virtual artificial life: an overview
2025-Oct-02, Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences
DOI:10.1098/rstb.2024.0298
PMID:41035322
|
综述 | 本文概述了人工生命领域特别是虚拟生命在定义、检测和起源机制方面的研究现状 | 提出了基于工程视角的人工生命定义框架,将生命系统分解为抽象需求、通用设计和具体实现机制三个层次 | 目前尚未展示出完全满足所有工程要求的虚拟人工生命系统 | 探讨人工生命特别是虚拟生命的起源机制和定义标准 | 人工生命系统,重点关注虚拟生命形式 | 人工生命 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 116 | 2025-10-05 |
Origins of life: the possible and the actual
2025-Oct-02, Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences
DOI:10.1098/rstb.2024.0281
PMID:41035333
|
综述 | 本文探讨生命起源的核心问题,包括生命形成的可能途径、必然性及多样性表现 | 整合多学科视角系统分析生命起源的理论框架与实验方法,强调原始细胞系统的关键作用 | NA | 理解生命起源的机制与约束条件 | 原始细胞系统与生命起源过程 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 117 | 2025-10-05 |
Harnessing transposable elements for plant functional genomics and genome engineering
2025-Oct, Trends in plant science
IF:17.3Q1
DOI:10.1016/j.tplants.2025.03.007
PMID:40240259
|
综述 | 本文系统阐述了植物转座元件的功能机制及其在功能基因组学和基因组工程中的前沿应用 | 整合转座元件的基础发现与前沿生物技术应用,提出将转座元件知识应用于作物育种和植物合成生物学的新视角 | NA | 系统梳理植物转座元件的综合知识与生物技术应用 | 植物转座元件 | 植物功能基因组学 | NA | 基因组工程 | NA | 基因组数据 | NA | NA | 植物 | NA | 农业, 合成生物学 |
| 118 | 2025-10-05 |
Synthetic Biology and Biomaterials Strategies to Deceive the Tumor Microenvironment in CAR-T Immunotherapy
2025-Oct, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202506429
PMID:40888234
|
综述 | 探讨合成生物学和生物材料在改善CAR-T细胞免疫疗法对抗实体瘤效果中的创新策略 | 将生物材料作为精准递送载体、人工抗原呈递细胞和高通量筛选平台,结合合成生物学电路设计增强CAR-T细胞在肿瘤微环境中的功能 | NA | 通过合成生物学和生物材料技术克服CAR-T细胞在实体瘤治疗中的局限性 | CAR-T细胞免疫疗法和肿瘤微环境 | 合成生物学 | 实体瘤 | NA | NA | NA | NA | NA | T细胞 | 合成生物学电路设计用于增强CAR-T细胞功能 | 医学 |
| 119 | 2025-10-05 |
Mutation-induced filaments of folded proteins are inert and non-toxic in a cellular system
2025-Oct, Molecular systems biology
IF:8.5Q1
DOI:10.1038/s44320-025-00144-y
PMID:40954318
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研究论文 | 本研究系统表征了由折叠蛋白质聚合形成的丝状组装体(聚集体),并揭示了其在细胞中的惰性和无毒性特征 | 首次明确定义并系统表征了区别于传统聚集体的蛋白质折叠态聚集体,开发了区分这两种组装体的细胞实验方法 | 研究仅基于特定细胞系统,尚未验证在其他生物体系中的普适性 | 探究突变诱导的折叠蛋白质丝状组装体的细胞生物学特性 | 蛋白质丝状组装体(聚集体) | 合成生物学 | NA | 定量蛋白质组学、细胞共定位分析 | NA | 蛋白质组数据、细胞成像数据 | NA | NA | 细胞系统 | NA | 合成生物学, 细胞内工程 |
| 120 | 2025-10-05 |
Technological and industrial trends in China's pharmaceutical sector
2025, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2025.1579037
PMID:41035909
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综述 | 本文综合分析中国医药行业的关键趋势,重点关注新兴技术对药物开发的影响及产业转型驱动因素 | 系统分析中国作为全球第二大医药市场的独特发展路径,整合政策环境、资本周期与技术创新的多维视角 | 未提供具体实证数据支持趋势分析,主要基于宏观观察和理论推演 | 探讨中国医药行业的技术创新与产业升级路径 | 中国医药行业的政策环境、技术发展、市场需求和产业转型 | 医药产业研究 | 慢性病、罕见病 | 精准医疗、合成生物学 | NA | 行业分析报告 | NA | NA | NA | NA | 医药 |