合成生物学相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
101	2025-08-09	Revolutionizing lignin valorization: Key advances in demethylation, methylation, and methyl metabolism 2025-Oct, Biotechnology advances IF:12.1Q1 DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108634 PMID:40588043	综述	本文系统综述了木质素生物增值中的去甲基化、甲基化和甲基代谢过程	总结了微生物木质素增值的有前景的甲基循环路线，并强调了机器学习辅助酶工程、合成生物学和代谢工程等新型先进策略	NA	促进木质素的可持续增值，推动木质素基生物经济的发展	木质素及其衍生物	生物工程	NA	机器学习辅助酶工程、合成生物学、代谢工程	NA	NA	NA
102	2025-08-09	Beyond nature's clock: Accelerating genomic diversity through hypermutation 2025-Oct, Biotechnology advances IF:12.1Q1 DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108638 PMID:40614910	综述	本文系统回顾了旨在克服自然突变率不足的高突变技术进展及其在多个领域的应用	比较了定向、多靶点和全基因组高突变工具，并提出了未来发展方向如高通量筛选方法和AI驱动的突变结果预测模型	未提及具体实验数据验证这些高突变技术的实际效果	弥合自然突变限制与生物技术需求之间的差距	高突变技术	合成生物学	NA	定向突变、多靶点突变、全基因组突变	AI-driven预测模型	NA	NA
103	2025-08-09	Yeast as C1 cell factory: Transforming methanol and Formate into high-value compounds 2025-Oct, Biotechnology advances IF:12.1Q1 DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108641 PMID:40645511	综述	本文综述了利用酵母作为C1细胞工厂，将甲醇和甲酸转化为高价值化合物的研究进展、挑战及未来展望	探讨了合成甲基营养在非甲基营养底盘中的发展，以及通过非理性基因组工程和菌株进化结合理性设计揭示隐藏的C1途径和底物耐受机制	C1气体为基础的生物工艺在工业上的应用仍存在许多未解决的技术限制，且甲酸为基础的酵母生长和生物合成研究尚处于早期阶段	研究目的是通过酵母将温室气体如二氧化碳和甲烷转化为有价值的生化物质，以实现可持续的去碳化制造工业	工业酵母及其对甲醇和甲酸的耐受和同化能力	合成生物学	NA	合成甲基营养、非理性基因组工程、菌株进化、理性设计、模块化共培养工程、过氧化物酶体耦合	NA	NA	NA
104	2025-08-09	Advances in production and application technologies of minicells: A review 2025-Oct, Biotechnology advances IF:12.1Q1 DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108648 PMID:40669734	review	本文综述了微型细胞的生产和应用技术进展，重点介绍了其形成机制、分离方法、最新应用以及未来挑战	强调了微型细胞在非传统药物递送领域的创新应用，包括解毒与耐受、富集与微反应器、分子封装与递送以及原生结构表征四大功能	讨论了微型细胞在生物技术应用中面临的挑战，但未具体说明当前技术的具体限制	探讨微型细胞在合成生物学、农业和医学领域的应用潜力	微型细胞（minicells）	合成生物学	NA	NA	NA	NA	NA
105	2025-08-09	Unlocking the algae toolbox: Cutting-edge tools for environmental and biotechnological solutions 2025-Oct, Biotechnology advances IF:12.1Q1 DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108652 PMID:40695391	review	本文综述了藻类研究中的最新工具和方法，强调了它们在推动藻类生物技术和全球可持续发展中的作用	整合了CRISPR-Cas9基因工程、高通量组学、机器学习驱动的建模和基于遥感技术的生态系统监测等前沿技术	大规模生产仍面临经济可行性和环境可持续性的挑战	探讨藻类在生物技术、环境管理和可持续产业中的应用	藻类	生物技术	NA	CRISPR-Cas9, 高通量组学, 机器学习, 遥感技术, 光学传感器, 流式细胞术, 生物传感器, 环境DNA	NA	NA	NA
106	2025-08-09	Bacteria-algae synergy in carbon sequestration: Molecular mechanisms, ecological dynamics, and biotechnological innovations 2025-Oct, Biotechnology advances IF:12.1Q1 DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108655 PMID:40701356	综述	本文综述了细菌-藻类协同作用在碳封存中的分子机制、生态动态和生物技术创新	首次将分子机制（如群体感应）、生态碳转化过程（如难降解溶解有机碳的形成）和合成生物学应用（如CRISPR工程联合体）整合到一个统一框架中，并提出了增强碳汇的新策略“微生物相互作用网络优化”	存在可扩展性挑战，包括光生物反应器中的光照限制和合成联合体的生态风险	探索细菌-藻类协同作用在碳封存中的应用，以实现碳中和	微藻（如小球藻和三角褐指藻）和大型藻类（如巨藻和海带）与细菌的联合体	合成生物学	NA	CRISPR、群体感应、水平基因转移	NA	NA	NA
107	2025-08-09	Recent advances in engineering microbial lipases for industrial applications 2025-Oct, Biotechnology advances IF:12.1Q1 DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108658 PMID:40701353	综述	本文全面回顾了脂肪酶的分类、一般特性、工业生产及应用，以及工程化脂肪酶和脂肪酶生产微生物细胞的最新进展	整合合成生物学和工程工具设计新型脂肪酶，以及利用蛋白质工程、固定化技术和人工智能工具提高脂肪酶催化性能	微生物脂肪酶存在多种同工酶，限制了其应用并需要昂贵的纯化过程	开发新型脂肪酶基生物工艺和生物产品	脂肪酶及其生产微生物细胞	合成生物学	NA	蛋白质工程、固定化技术、人工智能	NA	NA	NA
108	2025-08-09	Revolutionizing keratinase science: Biocatalytic advances, sustainable innovation, and industrial perspectives 2025-Oct, Biotechnology advances IF:12.1Q1 DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108657 PMID:40701354	综述	本文系统回顾了角蛋白酶的研究历史、分类、催化机制及其在多个领域的应用	强调了蛋白质工程、人工智能辅助酶设计和合成生物学在提升角蛋白酶性能方面的创新应用	工业生产中广泛应用的障碍包括高生产成本、酶稳定性不足和监管复杂性	推动角蛋白酶研究的发展，促进其在可持续发展和资源管理中的转化应用	角蛋白酶及其在环境修复和循环生物经济中的潜在应用	生物催化	NA	蛋白质工程、人工智能辅助酶设计、合成生物学	NA	NA	NA
109	2025-08-09	Advances in sphingan production: Biosynthesis and synthetic biology strain modification strategies based on Sphingomonas 2025-Oct, Biotechnology advances IF:12.1Q1 DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108659 PMID:40712756	综述	本文综述了鞘氨醇单胞菌属的分类现状及鞘聚糖的结构、生物合成途径、分子遗传学和基因工程研究	综合了鞘聚糖的现有研究，并提出了未来的研究方向	NA	探讨鞘氨醇单胞菌属在生物聚合物合成中的潜力及其应用	鞘氨醇单胞菌属及其产生的鞘聚糖	合成生物学	NA	基因工程	NA	NA	NA
110	2025-07-29	Bioactive metabolites and extracellular vesicles from the marine chlorophyte genus Tetraselmis: Review 2025-Oct, Biotechnology advances IF:12.1Q1 DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108662 PMID:40714169	综述	本文综述了海洋绿藻属Tetraselmis的生物活性代谢物和细胞外囊泡在生物技术和生物医学中的潜在应用	探讨了Tetraselmis物种的代谢灵活性、生物活性化合物生产及其细胞外囊泡的治疗潜力，并提出了利用人工智能和合成生物学优化培养策略的新机会	NA	探索Tetraselmis物种及其细胞外囊泡在生物技术和生物医学中的多样化应用	海洋绿藻属Tetraselmis及其细胞外囊泡	生物技术	NA	NA	NA	NA	NA
111	2025-08-09	Programmable DNA Nanocages Enable Adaptive Spatiotemporal Organization of Biomimetic Organelle Networks 2025-Aug-08, Angewandte Chemie (International ed. in English) DOI:10.1002/anie.202511909 PMID:40776809	research paper	该论文提出了一种模块化和可编程的DNA纳米笼策略，用于构建稳定且具有适应性的合成细胞器网络	利用DNA纳米笼增强囊泡稳定性，并通过逻辑门控DNA元件实现环境响应的空间组织和信号重构	当前合成细胞器缺乏天然细胞骨架蛋白的支持和动态调控，限制了自主通信网络的构建	构建具有自适应反馈调节的人工细胞器网络	细胞外囊泡（EVs）和DNA纳米结构	合成生物学	NA	回文杂交链式反应（PHCR）	NA	NA	NA
112	2025-08-09	Decoding NF-κB: nucleocytoplasmic shuttling dynamics, synthetic modulation and post-therapeutic behavior in cancer 2025-Aug-07, Molecular biology reports IF:2.6Q3 DOI:10.1007/s11033-025-10917-1 PMID:40775128	综述	本文回顾了核因子κB（NF-κB）的结构、功能及其在癌症治疗中的行为，并探讨了通过合成生物学工具调控NF-κB的潜力	探讨了NF-κB核质穿梭的时空调节和分子动力学，以及利用合成基因电路和光遗传学工具精确控制NF-κB的创新方法	NF-κB复合物的随机变异性导致单细胞水平的异质性反应，且缺乏明确的药物靶点，使其在癌细胞中的完全抑制具有挑战性和不确定性	研究NF-κB的调控机制及其在癌症治疗后的行为，以克服耐药性	核因子κB（NF-κB）及其在癌症中的调控机制	合成生物学	癌症	合成基因电路、光遗传学工具	NA	NA	NA
113	2025-08-09	CloneFast: A simple plasmid design and construction guide for labs venturing into synthetic biology 2025-Aug-06, STAR protocols IF:1.3Q4 DOI:10.1016/j.xpro.2025.104025 PMID:40773353	research paper	介绍CloneFast指南，一种简化质粒构建的方法	提出CloneFast指南，通过生物信息学设计和实验步骤优化，实现高效质粒构建	未提及具体实验验证数据或与其他方法的比较	简化质粒构建过程，提高效率和可及性	质粒设计和构建	合成生物学	NA	CompetePCR, 碘介导的切割	NA	生物信息学设计数据	NA
114	2025-08-09	Utilizing the SacB-mediated gene editing system in Komagataeibacter xylinus to explore the function of bacterial cellulose synthase 2025-Aug-05, Journal of biotechnology IF:4.1Q2 DOI:10.1016/j.jbiotec.2025.08.003 PMID:40774389	研究论文	本研究开发了一种基于SacB的基因编辑系统，用于探索细菌纤维素合酶在细菌纤维素合成和结构中的功能	开发了pK18mobsacB系统，实现了标记自由的基因编辑，效率高达83.33%，并成功应用于细菌纤维素合酶的功能研究	NA	提高细菌纤维素生产菌株的基因编辑效率，简化操作流程，实现无疤痕修饰，并探索细菌纤维素合酶的功能	Komagataeibacter xylinus CGMCC 2955及其细菌纤维素合酶	合成生物学	NA	SacB介导的基因编辑系统	NA	NA	NA
115	2025-08-09	Molecular circuits for genomic recording of cellular events 2025-Aug, Trends in genetics : TIG IF:13.6Q1 DOI:10.1016/j.tig.2025.04.004 PMID:40335327	综述	本文综述了基因组记录领域的最新进展，特别是基于CRISPR的基因组编辑技术在细胞事件记录中的应用	探讨了构建多样化传感器的新策略，并探索新兴合成生物学工具如何帮助构建用于记录多样化细胞事件的分子电路	直接记录和重建过去细胞事件的方法仍然有限，其在揭示细胞命运决定新见解方面的潜力尚未实现	开发新的传感模块和遗传电路架构，将过去的细胞状态忠实编码到基因组DNA记录中	细胞事件	合成生物学	NA	CRISPR-based genome editing	NA	基因组数据	NA
116	2025-08-09	Machine Learning Empowering Microbial Cell Factory: A Comprehensive Review 2025-Aug, Applied biochemistry and biotechnology IF:3.1Q2 DOI:10.1007/s12010-025-05260-x PMID:40397295	review	本文综述了机器学习与合成生物学在微生物细胞工厂升级中的协同作用及其在生物技术中的应用	探讨了机器学习与合成生物学结合在生物制造中的创新应用，包括化学生产、人类健康和环境修复	NA	为生物制造与人工智能交叉领域的未来研究提供有价值的指导	微生物细胞工厂	machine learning	NA	synthetic biology	NA	NA	NA
117	2025-08-09	Synthetic Biocatalysis in Erythrocyte Microreactors for Gasotransmitter H2S Production and Vessel Vasodilation 2025-Aug, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany) DOI:10.1002/smll.202502208 PMID:40451735	研究论文	本研究开发了一种能够持续产生硫化氢（H₂S）以实现治疗性血管舒张的红细胞微反应器	通过将PLP-PLys复合物封装到红细胞中，创建了一种新型微反应器，能够持续产生H₂S并有效诱导血管舒张	研究仅在体外实验中验证了微反应器的效果，尚未进行体内实验	开发一种能够模拟天然细胞执行重要代谢过程并与生物系统相互作用的治疗性微反应器	红细胞微反应器及其在H₂S产生和血管舒张中的应用	合成生物学与生物工程	心血管疾病	低渗膨胀法、荧光成像	NA	体外实验数据、荧光成像数据	体外实验使用分离的胸主动脉环
118	2025-08-09	Exploring the Application and Prospects of Synthetic Biology in Engineered Living Materials 2025-Aug, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.) DOI:10.1002/adma.202305828 PMID:37677048	综述	本文综述了合成生物学在工程活性材料（ELMs）中的应用与前景，探讨了其在环境修复、生态建筑和可持续能源等领域的潜力	全面概述了ELMs的最新研究进展和新兴设计策略，并探讨了不同种类ELMs之间的协同应用可能性	未提及具体实验数据或案例研究，主要基于文献综述	探讨合成生物学在工程活性材料中的应用及未来发展	细菌、真菌和植物衍生的工程活性材料（ELMs）	合成生物学与材料科学	NA	NA	NA	NA	NA
119	2025-08-09	Protein structure prediction and design for high-throughput computing 2025-Jul-22, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2025.07.18.665594 PMID:40777508	研究论文	本文介绍了针对高吞吐量计算的蛋白质结构预测和设计工具，并提出了容器化解决方案以优化这些工具在不同计算架构上的部署	开发了针对AlphaFold3、Chai-1、Boltz-2和RFdiffusion的容器化解决方案，并提出了OmniFold平台，优化了这些工具在GPU系统上的使用效率	这些算法的采用受到高计算需求和部署难度的影响	优化蛋白质结构预测和设计工具在高吞吐量计算环境中的部署和使用	蛋白质结构预测和设计工具（AlphaFold3、Chai-1、Boltz-2、RFdiffusion）	分子生物学	NA	机器学习、容器化技术	AlphaFold3、Chai-1、Boltz-2、RFdiffusion	蛋白质结构数据	NA
120	2025-08-08	Engineering DNA nanopores: from structural evolution to sensing and transport 2025-Oct, Materials today. Bio DOI:10.1016/j.mtbio.2025.102137 PMID:40761509	综述	本文回顾了DNA纳米孔的结构演变及其在分子传感和跨膜运输中的应用	整合了DNA纳米孔的结构演变与关键局限性分析，并突出了单分子传感和受控跨膜运输的突破	稳定性、可扩展性和噪声等问题	探讨DNA纳米孔在合成生物学和纳米医学中的优化路径	DNA纳米孔	纳米技术	NA	DNA折纸技术	NA	NA	NA