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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2026-06-05 |
Bottom-Up Synthetic Biology for Artificial Cell Design: From Scaffold Materials to Functional Integration
2026-May-25, Journal of microbiology and biotechnology
IF:2.5Q3
DOI:10.4014/jmb.2604.04021
PMID:42225276
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综述 | 回顾自下而上合成生物学在人工细胞设计中的最新进展,涵盖支架材料与功能整合 | 系统总结了五种支架材料(包括新兴的凝聚层基和混合层级隔室)及四大功能类别(级联代谢、蛋白质合成、分裂和能量生产) | 模块兼容性、操作稳定性和监管挑战等关键技术限制 | 探讨自下而上人工细胞的设计原则及其生物技术应用 | 人工细胞系统 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 人工细胞、级联代谢、蛋白质合成、分裂、能量生产模块 | 工业生物催化, 治疗性蛋白质递送, 生物传感, 生命起源研究 |
| 102 | 2026-06-05 |
Spatial Regulation of CAR Signaling Enables Logic-Gated Activity
2026-May-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.05.22.726983
PMID:42239424
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研究论文 | 设计了一种新型的AND门控嵌合抗原受体MANTIS,通过空间调控实现逻辑门控活性 | 利用细胞外受体尺寸差异来空间调控细胞内信号通路,首次通过空间位阻和去屏蔽机制实现AND门控CAR T细胞 | NA | 开发一种新型AND门控CAR T细胞,提高对癌细胞的靶向特异性,减少对正常细胞的杀伤 | 嵌合抗原受体(CAR)和T细胞 | 合成生物学,细胞工程 | 癌症 | NA | NA | NA | NA | NA | T细胞 | AND门控受体(MANTIS),包含空间位阻域和去屏蔽机制 | 医学 |
| 103 | 2026-06-05 |
Scarless one-tube genome assembly via computationally optimized uracil-DNA glycosylase reactions
2026-May-13, RSC chemical biology
IF:4.2Q2
DOI:10.1039/d5cb00317b
PMID:42238783
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研究论文 | 提出一种基于尿嘧啶-DNA糖基化酶的单管无缝基因组组装平台,用于快速构建工程化噬菌体 | 无需长同源重叠、限制性酶切位点去除、CRISPR-Cas系统或同源重组,通过尿嘧啶-DNA糖基化酶实现模块化、高效的一锅法基因组组装,并最小化二级结构形成风险 | NA | 开发一种快速、灵活的合成基因组构建方法,应用于噬菌体工程和生物传感 | T7噬菌体基因组及重组NanoLuc荧光素酶报告基因 | 合成生物学 | NA | 尿嘧啶-DNA糖基化酶反应 | NA | NA | NA | 尿嘧啶-DNA糖基化酶 | 噬菌体 (T7) | 模块化基因组组装平台 | 医学, 环境 |
| 104 | 2026-06-05 |
Phenazine-Based Synthetic Biology to Signal Between Cells and Electrodes
2026-May, Biotechnology and bioengineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/bit.70169
PMID:41653016
|
研究论文 | 开发了一种基于吩嗪的模块化系统,实现电子设备与工程菌群之间的双向氧化还原通信 | 利用商品化电极和吩嗪修饰,实现电子与生物领域之间信号接收的调控,构建了包含电子信号编码、生物信号传输、双域信号接收和可控噪声的模块化通信框架 | NA | 建立电子设备与活体系统之间无缝通信的生物电子系统 | 工程细菌群体与商用电子设备之间的氧化还原信号传递 | 合成生物学 | NA | 电化学生物传感、吩嗪生物合成调控 | NA | 信号数据 | NA | NA | 工程细菌 | 双域通信通道,包含电子信号编码、生物信号传输、双域信号接收和可控噪声模块 | 环境监测、自适应生物制造、响应式生物医学设备 |
| 105 | 2026-06-05 |
Biotechnological advances in key regulatory genes of phenylpropanoid and terpenoid biosynthesis pathways in Panax ginseng: Current insights and future prospects
2026 May-Jun, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108840
PMID:41663015
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综述 | 本文综述了人参苯丙烷类和萜类生物合成通路中关键调控基因的生物技术进展,包括基因发现、功能鉴定、基因组编辑、CRISPR调控、代谢工程和合成生物学等前沿方法 | 重点总结了基因编辑、CRISPR调控、代谢工程和合成生物学在人参代谢通路改造中的转化应用,并整合了组学策略、系统生物学模型及生物反应器与细胞培养平台 | NA | 概述人参中苯丙烷类和萜类生物合成关键调控基因的生物技术进展,为开发高活性化合物的人参品种和精准育种及工业规模生产提供理论框架 | 人参的苯丙烷类和萜类生物合成通路相关关键调控基因 | NA | NA | 基因组编辑、CRISPR调控、代谢工程、合成生物学、组学技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 人参 | NA | 医学, 工业生物技术 |
| 106 | 2026-06-05 |
Developmentally inspired synthetic kidney engineering
2026-May, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-026-03011-9
PMID:41667710
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综述 | 提出一种受发育启发的合成肾脏工程策略,利用胚胎发育过程中的空间和时间线索指导体外多尺度结构形成 | 提出'发育工程'新策略,融合合成生物学、空间模式化和组织微环境控制技术,通过引导和组织基序的链式连接实现可扩展的肾脏组织工程 | 尚处于概念蓝图阶段,缺乏实验验证和实际转化数据 | 开发可用于肾脏替代治疗的可扩展工程化组织 | 基于干细胞的肾组织 | 合成生物学 | 肾脏疾病 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | 干细胞(肾组织) | 受发育启发的组织基序(motif) | 医学 |
| 107 | 2026-06-05 |
Advances in synthetic biology for engineering methylotrophic microbial cell factories
2026-Mar-19, Journal of bacteriology
IF:2.7Q3
DOI:10.1128/jb.00383-25
PMID:41665342
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综述 | 综述了合成生物学在构建甲基营养微生物细胞工厂方面的最新进展 | 系统总结了通过构建高效甲醇利用途径、工程化甲醇脱氢酶提高氧化效率、优化辅因子利用平衡氧化还原等策略,以及缓解有毒代谢物积累和适应性实验室进化等方法,为合理设计高性能微生物平台提供了蓝图 | 未提及当前合成甲基营养菌在实际工业应用中的具体挑战和局限性 | 推动甲醇作为可持续生物制造和碳中和生产的工业应用 | 甲基营养微生物细胞工厂 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、代谢工程 | NA | NA | NA | NA | 微生物 | 甲醇利用途径、氧化还原平衡优化 | 工业生物技术、环境 |
| 108 | 2026-06-05 |
Refactoring two-component systems for tunable gene expression regulation and upgraded bacterial sensing
2026-Mar-18, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2025.101504
PMID:41653915
|
研究论文 | 重构双组分系统以实现可调控的基因表达调控和升级的细菌传感 | 解耦组氨酸激酶与天然反馈回路,实现可调检测阈值的超灵敏TCS传感器;利用响应调控因子作为转导器创建协同传感系统,兼具低检测限和高动态范围;证明响应调控因子可作为生物低噪声放大器,显著提升多种基因编码生物传感器的性能 | 未明确提及,但基于重构系统的稳定性、在复杂环境中的适应性等可能存在的限制 | 探索双组分系统的可编程性,开发模块化的生物传感器优化工具包 | 双组分系统中的响应调控因子和组氨酸激酶 | 合成生物学 | NA | 基因重构、生物传感 | NA | NA | NA | NA | 原核生物 | 协同传感系统、生物低噪声放大器 | 合成生物学、生物传感 |
| 109 | 2026-06-05 |
p-Benzoyl-l-phenylalanine as a Multifunctional Noncanonical Amino Acid in Synthetic Biology: Photoprobing, Photocatalysis, and Structural Programming for Biocontainment
2026-Mar-16, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202525502
PMID:41664298
|
综述 | 本文综述了非天然氨基酸p-苯甲酰基-l-苯丙氨酸(pBzF)在合成生物学中的多功能应用:包括光探针、光催化和为生物封闭进行结构编程 | 系统性地将pBzF定位为一种多功能的非天然氨基酸,同时具备光化学反应性、光催化能力和结构编程潜力,扩展了其在合成生物学中的应用范围 | 未明确提及局限性 | 批判性地讨论pBzF在构建具有非天然、光响应和催化功能蛋白质方面的最新进展 | 非天然氨基酸pBzF及其在蛋白质工程中的应用 | 合成生物学 | NA | 遗传编码、定向进化、光交联 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学、能源、等 |
| 110 | 2026-06-05 |
Blue food proteins-derived immunomodulatory peptides: sources, preparation, identification techniques, mechanisms, and critical challenges of commercial application
2026-Mar-01, Food research international (Ottawa, Ont.)
DOI:10.1016/j.foodres.2025.118136
PMID:41652731
|
综述 | 系统梳理蓝色食物蛋白源免疫调节肽的来源、制备技术、鉴定方法、作用机制及商业化应用挑战 | 首次全面整合免疫调节肽的海洋来源、提取纯化技术、非特异性和特异性免疫通路(如NF-κB和MAPK信号级联)及体内外免疫调节活性证据 | 面临胃肠道稳定性不足、长期安全性验证缺失及工业规模化生产障碍 | 推动免疫调节肽从功能性生物活性物质向临床免疫营养和治疗制剂转化 | 蓝色食物蛋白源免疫调节肽 | 数字病理学 | NA | 合成生物学、精密发酵、人工智能辅助肽设计 | NA | NA | NA | 合成生物学, 精密发酵 | NA | NA | 医学, 食品 |
| 111 | 2026-06-05 |
Programming Next-Generation Synthetic Biosensors by Genetic Circuit Design
2026-Mar, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202524172
PMID:41655251
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综述 | 本文综述了通过基因电路设计实现下一代合成生物传感器的研究进展,重点探讨了其传感机制、设计、应用及面临的挑战 | 系统分析了构建高性能合成生物传感器的设计原则、使能工具和工程策略,特别是全面审视了剂量-响应曲线的调谐方法,包括检测限、检测阈值、操作范围、动态范围和泄漏特性 | 合成生物传感器在实际部署和现场应用中仍面临灵敏度、特异性、速度、稳定性和生物安全性等方面的挑战 | 总结基因电路驱动的合成生物传感器的最新进展,并探索其从实验室走向实际应用的路径 | 合成生物传感器及其基因电路设计 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 基因电路 | 环境监测、疾病诊断、食品安全控制、生物生产优化 |
| 112 | 2026-06-05 |
Advances in site-specific knock-in techniques for gene editing
2026-Feb-20, Yi chuan = Hereditas
DOI:10.16288/j.yczz.25-076
PMID:41669806
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综述 | 系统总结了定点敲入技术在基因编辑中的最新进展 | 整合了位点特异性重组酶(如Bxb1整合酶)和可编程核酸酶系统(如CRISPR/Cas9)的最新进展,并比较了twinPE+Bxb1和PASTE系统的优缺点 | 实际应用中仍受脱靶活性和低效率的限制 | 提高基因敲入的精确性和效率,推动精准医学和合成生物学应用 | 位点特异性重组酶系统和可编程核酸酶系统 | 基因编辑 | NA | 位点特异性重组酶系统(Bxb1整合酶)、CRISPR/Cas9、Cas9-Bxb1整合酶系统、twinPE+Bxb1、PASTE | NA | 多组学数据 | NA | CRISPR-Cas9 | NA | NA | 精准医学、合成生物学 |
| 113 | 2026-06-05 |
Machine learning-optimized long single-stranded DNA synthesis technology empowers high-precision diagnostic-therapeutic integration in living cells
2026-Feb-05, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag131
PMID:41674382
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research paper | 通过机器学习优化的长单链DNA合成技术,实现了高纯度、均一性长单链DNA的酶促合成,并构建了用于活细胞中诊断-治疗一体化的DNA折纸-CRISPR复合物 | 首次将机器学习与酶工程结合,通过优化镁离子动力学和热调节参数,实现了长达15000核苷酸的高保真长单链DNA合成,并开发了硫醇-金固定模板的固相纯化体系,显著提升了产率和均一性 | 未明确提及 | 开发一种高纯度、可扩展的长单链DNA合成技术,并验证其在精准纳米医学、合成生物学和分子数据存储中的应用潜力 | 长单链DNA合成平台Ouroborosyn-ssDNA、phi29 DNA聚合酶、Nb.BbvCI切口酶、DNA折纸-CRISPR复合物 | synthetic biology, machine learning | 宫颈癌 | 酶促合成、机器学习优化、固相纯化、DNA折纸、CRISPR | 机器学习模型 | 序列数据、酶动力学数据 | 未明确提及 | CRISPR-Cas9 | 宫颈癌细胞 | 六螺旋束DNA折纸-CRISPR复合物(用于核仁素靶向的基因组编辑) | medicine, synthetic biology, molecular data storage |
| 114 | 2026-06-05 |
Development of a Tool for High-Efficiency, Markerless and Iterative Genome Editing in Shouchella clausii
2026-Feb, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.70287
PMID:41662148
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研究论文 | 开发了一种高效、无标记、可迭代的Shouchella clausii基因组编辑工具 | 首次在Shouchella clausii中建立基于温度敏感型穿梭载体和Golden Gate组装的基因编辑系统,实现无疤痕、可迭代的基因组修改 | 尚未在更多难操作菌株中验证,且高渗电转化协议可能对部分菌株无效 | 开发适用于Shouchella clausii的高效基因组编辑工具,推动其作为微生物底盘的应用 | Shouchella clausii DSM 8716和Bacillus subtilis 168菌株 | 合成生物学 | NA | 高渗电转化、Golden Gate组装 | NA | NA | S. clausii DSM 8716和B. subtilis 168菌株,多次实验 | Golden Gate Assembly | Shouchella clausii, Bacillus subtilis | 温度敏感型穿梭载体(pM4B522),采用pop-in/pop-out整合策略,包含壮观霉素抗性标记和红色荧光蛋白报告基因 | 医学, 工业生物技术, 环境 |
| 115 | 2026-06-05 |
Microbial-driven nature-based solutions for environmental antimicrobial resistance and emerging contaminants: mechanisms, platform trade-offs, and decision framework
2026, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2026.1804764
PMID:42238881
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综述 | 本文综述了微生物驱动的自然解决方案在应对环境抗菌素耐药性和新兴污染物中的机制、平台权衡及决策框架 | 提出了一个连接环境来源、微生物机制、平台设计和监测指标的微生物自然解决方案决策框架,并整合了微生物生态学、合成生物学和组学方法的设计思路 | 面临可扩展性、长期性能、生态风险和监管接受度方面的挑战 | 探讨微生物驱动的自然解决方案在环境抗菌素耐药性和新兴污染物缓解中的应用与决策框架 | 抗菌素耐药性和新兴污染物(包括药物、个人护理产品、微塑料和内分泌干扰物) | 机器学习 | NA | 微生物生态学、合成生物学、组学方法 | NA | NA | 2000年至2024年间发表的文献 | NA | NA | NA | 环境 |
| 116 | 2026-06-05 |
Diterpenoids in medicinal plants: structure, distribution, biological activities, biosynthesis, and bioengineering prospects
2026, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2026.1833614
PMID:42239869
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综述 | 系统总结药用植物中二萜类化合物的结构、分布、生物活性、生物合成途径及生物工程前景 | 全面整合了二萜类化合物的结构分类、功能机制与合成生物学应用,并提出了机器学习在药理学和酶工程中的未来方向 | 未深入讨论具体化合物的临床前或临床试验数据,可能缺乏实际应用案例的定量分析 | 系统梳理二萜类化合物的研究现状,为发现新活性化合物、阐明完整生物合成途径及可持续生产提供基础 | 药用植物中的二萜类化合物 | 机器学习 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学, 农业, 工业生物技术 |
| 117 | 2026-06-04 |
Semi-rational engineering of terminal deoxynucleotidyl transferase for high-efficiency enzymatic de novo DNA synthesis
2026-Sep, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2026.03.009
PMID:41938127
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研究论文 | 通过半理性工程改造末端脱氧核苷酸转移酶(TdT),实现了高效、可扩展的酶促DNA从头合成 | 通过UniProt数据库挖掘发现BtTdT并对其功能进行特性表征,结合AlphaFold3预测结构进行结构域截短和理性突变,获得显著提升3'-ONH-dNTP掺入活性的五重突变体M5 | 论文未说明该方法在长链DNA合成中的实际保真度和序列长度限制,也缺乏与现有磷酰胺酯方法的全面对比 | 开发高效、环保的酶促DNA合成技术,实现工业级DNA制造 | 末端脱氧核苷酸转移酶(TdT)及其突变体 | 生物技术 | NA | 酶促DNA合成, NGS(间接通过数据库挖掘), 计算机模拟(AlphaFold3) | AlphaFold3 | 序列数据(蛋白质序列) | 多种突变体评估(具体样本量未明确报告) | NA | NA | NA | 合成生物学, 工业生物技术 |
| 118 | 2026-06-04 |
Filamentous fungal synthetic biology: Current applications and ongoing developments
2026-Sep, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108912
PMID:42069191
|
综述 | 综述丝状真菌合成生物学在当前应用与未来发展 | 探讨丝状真菌在食品、医药、材料科学和生物修复等领域的新兴应用,并结合基因测序和计算技术促进合成生物学标准化 | 指出研究领域中的挑战和研究空白,如标准化语言创新不足 | 促进丝状真菌合成生物学在多种工程和应用领域的理解与标准化 | 丝状真菌 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 丝状真菌 | NA | 食品, 医药, 材料科学, 生物修复 |
| 119 | 2026-06-04 |
Recombinant human serum albumin-A paradigm shift: From laboratory development to industrial-scale production, and clinical translation
2026-Sep, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108914
PMID:42086096
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综述 | 本文综述了重组人血清白蛋白从实验室开发到工业规模生产及临床转化的工业化路径 | 从产量、可扩展性、成本效益、监管可行性与纯化策略兼容性综合角度,提出了酵母和转基因水稻两种主导生产平台的范式转变 | 克服生产扩大的经济挑战、确保产品一致性仍是实现其潜力的关键 | 分析重组人血清白蛋白的产业化路径及其作为多功能生物治疗平台的潜力 | 重组人血清白蛋白的工业化生产和临床转化 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 | 毕赤酵母, 转基因水稻 | NA | 医疗, 药物递送, 先进疗法 |
| 120 | 2026-06-04 |
Toward synthetic biology in mushroom-forming Agaricomycete fungi: from tools to applications
2026-Jun-03, Microbiology and molecular biology reviews : MMBR
IF:8.0Q1
DOI:10.1128/mmbr.00178-25
PMID:42233661
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综述 | 回顾了蘑菇形成菌纲(Agaricomycetes)真菌合成生物学的研究进展,并指出了限制可预测遗传工程的主要障碍以及未来优先发展方向 | 首次系统总结蘑菇生物学特有的工程约束(如复杂有性周期、异核体特性及转化过程中的菌株不稳定性),并深入分析了基因表达瓶颈(如启动子和终止子表征不足、基因组浓缩导致基因整合困难、内含子和特定序列基序的影响),同时提出了未来优先发展方向包括遗传部件跨物种评估、更先进基因编辑策略、高通量筛选方法及建立统一模型系统 | 未详细讨论具体实验案例或应用效果,主要基于已有文献综述和推理 | 推动蘑菇形成菌纲真菌合成生物学发展,使其成为可持续生物制造、设计生物材料、气候解决方案和真菌生物学机制研究的可编程平台 | 蘑菇形成菌纲(Agaricomycetes)真菌 | 合成生物学 | NA | 基因编辑 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9等基因编辑策略 | 蘑菇形成菌纲(Agaricomycetes)真菌 | NA | 可持续生物制造, 设计生物材料, 气候解决方案, 机械真菌生物学研究 |