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当前共找到 4821 篇文献，本页显示第 101 - 120 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2026-04-18 |
Growth versus Decline: Root Aging and Plant Performance
2026-Apr-16, The Plant cell
DOI:10.1093/plcell/koag115
PMID:41990352
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综述 | 本文综述了根生长与衰老的分子生理机制，并探讨了延缓根衰老以提升作物生产力的策略 | 将根生长与衰老机制联系起来，并提出利用遗传和合成生物学方法干预根衰老的创新思路 | 根衰老研究因技术挑战（如老根采样分析困难）而受限，现有知识可能不全面 | 探讨根衰老对植物性能的影响，并研究通过延缓衰老来增强作物产量和气候适应性的方法 | 植物根系，特别是作物根系 | 植物生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学方法 | 植物 | NA | 农业, 环境 |
| 102 | 2026-04-18 |
How custom polymerases are driving innovation in synthetic biology
2026-Apr-15, Current opinion in chemical biology
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.cbpa.2026.102682
PMID:41990559
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综述 | 本文综述了定制聚合酶如何推动合成生物学创新，特别是在扩展遗传信息化学边界方面的应用 | 定制聚合酶突破了天然聚合酶对DNA、RNA及其有限化学修饰类似物的限制，实现了RNA的引物延伸合成和具有非天然骨架结构的合成遗传聚合物（XNAs） | NA | 探讨定制聚合酶在合成生物学、生物技术和分子医学领域的创新驱动作用 | 定制聚合酶及其在合成生物学中的应用 | 合成生物学 | NA | 聚合酶工程 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 生物技术, 分子医学 |
| 103 | 2026-04-18 |
Negative design enables cell-free expression and folding of designed transmembrane β-barrels
2026-Apr-14, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2528772123
PMID:41950096
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研究论文 | 本研究利用无细胞表达系统研究跨膜β桶蛋白的设计与折叠，提出通过负设计策略抑制聚集倾向以改善膜组装 | 发现抑制聚集倾向中间体（通过β链局部去稳定化的“负设计”）能显著改善膜组装，即使通常认为高度去稳定的取代（如脯氨酸或暴露于双层核心的极性苏氨酸）在策略性定位时也能改善折叠 | 研究主要针对理想化的小型跨膜β桶蛋白，其发现向更复杂膜蛋白设计的普适性仍需验证 | 探究序列特征如何影响设计的跨膜β桶蛋白在合成膜中的热力学驱动组装，以推动膜蛋白的从头设计 | 设计的跨膜β桶蛋白变体 | 合成生物学 | NA | 无细胞表达系统 | NA | NA | NA | NA | NA | 跨膜β桶蛋白的合成设计 | 工业生物技术 |
| 104 | 2026-04-18 |
The horizontally transferred gene, CsMTAN, rewired purine traffic to build caffeine factories in tea leaves
2026-Apr, Journal of integrative plant biology
IF:9.3Q1
DOI:10.1111/jipb.13957
PMID:40607640
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研究论文 | 本研究通过代谢组学和基因组关联分析，揭示了茶树中水平转移基因CsMTAN如何调控嘌呤代谢和咖啡因生物合成 | 首次鉴定出CsMTAN基因通过水平转移事件进入植物基因组，并发现其F179Y突变显著影响酶活性和嘌呤代谢流量 | 研究主要基于体外酶活实验和瞬时过表达，缺乏稳定的转基因茶树验证；样本量183个虽具多样性但可能未覆盖所有自然变异 | 探究茶树嘌呤代谢和嘌呤生物碱（如咖啡因）生物合成的遗传与分子机制 | 茶树（Camellia sinensis）的183个遗传多样性种质及其叶片组织 | 植物代谢组学与合成生物学 | NA | 代谢组学分析、全基因组关联研究（GWAS）、体外酶活测定、系统发育分析、蛋白质结构建模 | NA | 代谢物数据、基因组数据 | 183个茶树种质的幼叶和成熟叶组织 | 瞬时过表达（在烟草中） | 茶树（Camellia sinensis）、本氏烟草（Nicotiana benthamiana） | NA | 农业（分子育种）、工业生物技术（合成生物学） |
| 105 | 2026-04-18 |
Design-driven optimization of low-cost reagent formulations for reproducible and high-yielding cell-free gene expression
2026-Mar-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-69605-8
PMID:41786720
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研究论文 | 本研究通过多维度确定性筛选设计，优化了无细胞基因表达系统的试剂配方，显著降低了成本并提高了蛋白质产量和可重复性 | 采用多维度确定性筛选设计从1231种配方中筛选出仅含12种组分的简化配方，实现了95%的成本降低，并首次证明该配方能从含氮碱基和核糖直接合成核苷三磷酸 | 未明确说明该配方对极端温度或pH条件的稳定性，也未涉及大规模工业化生产的详细验证 | 开发低成本、高产量且可重复的无细胞基因表达系统 | 无细胞基因表达系统的试剂配方 | 合成生物学 | NA | 多维度确定性筛选设计、无细胞基因表达 | NA | 实验数据 | 1231种不同试剂配方，测试超过20种不同蛋白质 | NA | 无细胞系统（基于细胞裂解液） | NA | 医药、工业生物技术 |
| 106 | 2026-04-18 |
Deciphering substrate promiscuity and specificity of indolethylamine N-methyltransferase family enzymes from amphibian toads
2024-12, Bioorganic chemistry
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.bioorg.2024.107950
PMID:39522428
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研究论文 | 本研究从两栖动物蟾蜍中鉴定出七种具有不同催化特性的吲哚乙胺N-甲基转移酶家族酶，并解析了其底物混杂性和特异性的分子机制 | 首次在蟾蜍中系统鉴定INMT家族酶，揭示了其底物混杂性与特异性的多样性，并通过分子对接和突变实验阐明了相关机制 | 研究主要基于体外酶学实验，未在活体系统中验证酶的功能；样本来源仅限于一种蟾蜍物种，可能缺乏普适性 | 探究INMT家族酶的底物混杂性和特异性机制，为天然产物生物合成和合成生物学应用提供基础 | 从Bufo gargarizan蟾蜍中鉴定的七种INMT家族酶（BNMT 1, 3, 4, 5, 6, 7, 11） | 合成生物学 | NA | 分子对接、定点突变、酶学活性测定 | NA | 酶学数据、分子模拟数据 | 七种酶蛋白 | NA | Bufo gargarizan（蟾蜍） | NA | 医药、工业生物技术 |
| 107 | 2026-04-17 |
Artificial allosteric protein switches with machine-learning-designed receptors
2026-Apr-15, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-026-03081-9
PMID:41986695
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研究论文 | 本文展示了利用机器学习设计的受体构建人工变构蛋白开关，用于小分子、肽和蛋白质的生物传感，并应用于逻辑门和生物电子设备 | 利用机器学习工程化的最小配体结合域作为单组分变构开关中的高效受体，无需全局构象变化，并开发了完全合成的人工变构开关 | NA | 开发人工变构蛋白开关，用于合成生物学和生物技术中的信息与能量处理 | 人工变构蛋白开关、生物传感器、逻辑门、生物电子设备 | 机器学习 | NA | 机器学习、氢/氘交换质谱、F核磁共振分析 | NA | NA | NA | NA | 大肠杆菌 | 单组分变构开关、分子内YES和AND逻辑门 | 生物技术、医学 |
| 108 | 2026-04-17 |
seq2ribo: Structure-aware integration of machine learning and simulation to predict ribosome location profiles from RNA sequences
2026-Apr-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.02.08.700508
PMID:41726975
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为seq2ribo的混合模拟与机器学习框架，用于仅基于mRNA序列预测核糖体A位点位置 | 首次结合结构感知的TASEP模拟和机器学习抛光模型，实现了仅从序列预测核糖体位置的高保真度，无需表达数据或基因组背景 | NA | 开发一种工具，用于合成生物学中的mRNA序列理性设计与优化，特别是针对mRNA疫苗等新序列设计 | mRNA序列及其对应的核糖体位置分布 | 机器学习 | NA | 核糖体分析（Ribo-seq）、RNA-seq、结构感知TASEP模拟 | 混合框架（包括sTASEP和抛光模型） | 序列数据（mRNA序列） | 多种细胞类型（iPSC、HEK293、LCL、RPE-1） | NA | NA | NA | 医学（如mRNA疫苗设计）、合成生物学 |
| 109 | 2026-04-17 |
Biodesulfurization: Back on-stage through synthetic biology and metabolic engineering approaches
2026-Apr, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2026.103449
PMID:41687421
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综述 | 本文综述了通过合成生物学和代谢工程方法复兴生物脱硫技术，重点关注4S途径及其在红球菌和革兰氏阴性菌平台中的应用 | 整合了红球菌和假单胞菌平台的最新进展，包括操作子重构、底盘设计以及过程级约束的融合，并讨论了与加氢脱硫的整合策略 | NA | 探索生物脱硫技术，以解决中馏分燃料中持久性有机硫化合物的脱除问题 | 红球菌（野生型性能、调控、系统生物学和基因工程）和革兰氏阴性菌平台（尤其是假单胞菌） | NA | NA | 合成生物学、代谢工程、系统生物学、基因工程 | NA | NA | NA | 操作子重构、底盘设计 | Rhodococcus, Pseudomonas | 4S途径（生物脱硫途径），涉及C-S键断裂而保留烃骨架 | 能源, 工业生物技术 |
| 110 | 2026-04-17 |
Engineering prime editors in Salvia miltiorrhiza for precise genome modification
2026-Apr, Journal of integrative plant biology
IF:9.3Q1
DOI:10.1111/jipb.70006
PMID:41987526
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研究论文 | 在丹参中开发了优化的Prime Editing系统，实现了碱基颠换、复杂插入和碱基替换，用于精确基因组修饰 | 在丹参中首次优化Prime Editing系统，能够进行碱基颠换、复杂插入和碱基替换，并成功应用于提高丹参酮含量 | NA | 开发在丹参中实现精确基因组修饰的Prime Editing系统，以提升生物活性成分含量 | 丹参（Salvia miltiorrhiza）的关键基因 | 合成生物学 | NA | Prime Editing | NA | NA | NA | Prime Editing | 丹参（Salvia miltiorrhiza） | NA | 医药 |
| 111 | 2026-04-17 |
Chemical Signaling and Metabolomic Crosstalk in Endophytic Fungi-Medicinal Plant Symbioses for Natural Product Discovery and Sustainable Bioproduction
2026-Feb-28, Metabolites
IF:3.4Q2
DOI:10.3390/metabo16030164
PMID:41893315
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综述 | 本文综述了药用植物内生真菌之间通过化学信号传导和代谢组学串扰驱动天然产物生物合成的多层机制，并探讨了利用这种共生智能进行可持续生物生产的策略 | 系统总结了宿主来源的化学信号（如根系分泌物和氧脂素）作为唤醒真菌沉默生物合成基因簇（BGCs）的主要触发因素，并批判性地评估了空间代谢组学（如MALDI-MSI）在揭示植物-真菌界面局部化代谢交换方面的应用 | 本文是一篇综述，未报告原始实验数据，其结论基于对过去十年文献的系统调查，可能受限于现有研究的覆盖范围和深度 | 旨在总结药用植物与内生真菌之间代谢串扰的机制，并评估利用这种共生关系进行天然产物发现和可持续生物生产的策略 | 药用植物及其相关的内生真菌 | NA | NA | 空间代谢组学（MALDI-MSI）、共培养模型、植物体内模型、结构解析 | NA | NA | NA | NA | 药用植物，内生真菌 | NA | 医药，工业生物技术 |
| 112 | 2026-04-17 |
Integrating synthetic biology to understand and engineer the heart, lung, blood, and sleep systems
2025-Dec-17, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2025.101446
PMID:41412113
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综述 | 本文综述了合成生物学在心脏、肺、血液和睡眠系统中的整合应用，以理解和工程化这些系统 | 将合成生物学从微生物扩展到人类系统，实现基因表达、细胞命运和组织组织的精确控制，并整合组学数据与AI引导的电路设计 | 包括递送、转基因稳定性和在生理相关模型中稳健的时空控制等关键挑战 | 理解并工程化心脏、肺、血液和睡眠系统 | 心脏、肺、血液和睡眠系统的细胞和组织 | 合成生物学 | NA | 基因组工程、动态基因电路、高维生物传感器、组学数据 | 系统级模型、AI引导的电路设计 | 组学数据 | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly | 人类细胞、组织 | 可调转录调节器、合成组织器、反馈电路 | 医学 |
| 113 | 2026-04-17 |
Identification and treatment of heme depletion attributed to overexpression of a lineage of evolved P450 monooxygenases
2012-Nov-20, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.1212287109
PMID:23129650
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研究论文 | 本文通过系统生物学方法分析并优化了在酿酒酵母中过表达P450单加氧酶引起的宿主应激，识别出血红素耗竭为主要应激源，并通过过表达内源性血红素生物合成途径的限速酶来缓解应激并提高酶活性 | 结合系统生物学和合成生物学方法，首次识别出P450单加氧酶过表达导致的血红素耗竭是主要宿主应激源，并证明通过工程化内源性血红素生物合成途径可以缓解应激并提升酶活性 | 研究主要聚焦于酿酒酵母中的P450单加氧酶，可能不直接适用于其他宿主或酶系统，且应激源的相互作用可能更复杂 | 分析并优化微生物中异源酶表达引起的宿主应激，以提高生物合成途径的性能 | 在酿酒酵母中过表达的一系列进化P450单加氧酶变体及其对宿主细胞的影响 | 代谢工程 | NA | 系统生物学方法、酶活性测定 | NA | 酶活性数据、应激响应模式 | 一系列进化P450单加氧酶变体 | CRISPR-Cas9, 基因过表达 | 酿酒酵母 | 内源性血红素生物合成途径的工程化 | 工业生物技术 |
| 114 | 2026-04-16 |
Comprehensive genomic analysis reveals the class II diterpene cyclases in Dodonaea viscosa
2026-Jul, Phytochemistry
IF:3.2Q2
DOI:10.1016/j.phytochem.2026.114886
PMID:41881186
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研究论文 | 本文通过基因组测序和注释，揭示了药用植物Dodonaea viscosa中二类二萜环化酶的发现与生化特性，为合成生物学规模化生产生物活性二萜类化合物提供了基础 | 首次报道了Dodonaea viscosa的核基因组草图及完整叶绿体和线粒体基因组序列，并鉴定出两个新的二类二萜环化酶DvCPS和DvKPS，催化形成labdane和clerodane二萜类生物活性化合物的前体 | NA | 阐明Dodonaea viscosa中生物活性二萜类化合物的生物合成途径，以支持通过合成生物学实现规模化生产 | 药用植物Dodonaea viscosa及其基因组序列和二萜环化酶 | 合成生物学 | NA | 基因组测序、生化表征 | NA | 基因组序列数据 | NA | NA | NA | NA | 医药 |
| 115 | 2026-04-16 |
Programmable Synthesis of DNA Networks in Giant Vesicles via Rolling Circle Amplification
2026-Apr-15, Nano letters
IF:9.6Q1
DOI:10.1021/acs.nanolett.6c00726
PMID:41919686
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研究论文 | 本文介绍了一种基于滚环扩增技术的仿生囊泡平台，可在巨型囊泡内构建DNA网络以增强结构稳定性 | 首次在合成囊泡中通过滚环扩增构建类细胞骨架的DNA网络，实现分子尺度生化活动与介观尺度机械行为的耦合 | NA | 开发具有功能调控和机械反馈能力的合成细胞 | 巨型囊泡和DNA网络结构 | 合成生物学 | NA | 滚环扩增技术 | NA | NA | NA | DNA折纸术 | NA | DNA网络结构（类细胞骨架） | 合成生物学、生物制造、仿生材料 |
| 116 | 2026-04-16 |
Current Progress of Natural Product Export by Yeast
2026-Apr-15, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c08982
PMID:41926336
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综述 | 本文综述了利用酵母（如酿酒酵母、毕赤酵母和粟酒裂殖酵母）通过减轻细胞内天然产物积累的代谢负担来增强天然产物（特别是萜类）合成的近期进展 | 聚焦于通过减轻代谢负担来提升酵母中天然产物合成的策略，包括转运蛋白过表达与工程化、膜结构改变和提取方法，总结了未来研究方向 | NA | 增强微生物细胞工厂中天然产物的合成效率，通过减轻代谢负担策略 | 酵母物种（酿酒酵母、毕赤酵母、粟酒裂殖酵母）及其在天然产物（尤其是萜类）合成中的应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 酿酒酵母, 毕赤酵母, 粟酒裂殖酵母 | NA | 工业生物技术, 医药 |
| 117 | 2026-04-16 |
Stomata as a Defence Nexus: Integrating Drought and Pathogen Stress Signalling
2026-Apr-14, Plant, cell & environment
DOI:10.1111/pce.70542
PMID:41982084
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综述 | 本文综述了植物气孔在协调病原体入侵和干旱胁迫响应中的双重防御角色，强调了在复合压力下气孔动态的协同与拮抗机制 | 将气孔视为防御中枢，整合干旱和病原体胁迫信号，揭示了复杂的信号网络交叉对话，并探讨了工程化优化气孔响应以增强作物抗逆性的前沿方向 | 未解决防御与生长之间的权衡、信号通路干扰以及组织特异性功能冗余等关键问题 | 研究气孔在整合干旱和病原体胁迫信号中的防御作用，以增强作物对气候变化的复合胁迫抗性 | 植物气孔及其在胁迫响应中的功能 | 植物生物学 | NA | 单细胞测序、合成生物学 | NA | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | 农业 |
| 118 | 2026-04-16 |
TargetGAN: A generative AI framework for designing plant core promoters with targeted activity
2026-Apr-13, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2026.101851
PMID:41981910
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研究论文 | 本研究提出了一个名为TargetGAN的深度学习框架，用于设计具有目标活性的植物核心启动子 | 首次将生成对抗网络与预训练活性预测器相结合，实现了用户自定义活性的植物核心启动子从头设计，并成功生成了超越天然启动子活性的合成启动子 | 预测活性与实验活性之间仅呈现中等相关性（PCC=0.6435），且仅对部分合成启动子进行了功能验证 | 开发一个能够设计具有目标活性植物核心启动子的生成式人工智能框架 | 植物核心启动子 | 合成生物学 | NA | STARR-seq、荧光素酶报告基因检测 | GAN | 基因序列数据 | 76,851个天然启动子用于训练，55,296个合成启动子生成，其中5,250个用于高通量验证，2,909个成功表征 | NA | 植物系统 | 具有目标活性的合成启动子设计 | 农业、工业生物技术 |
| 119 | 2026-04-16 |
Bacterial Extracellular Vesicles in Biomedical Research and Clinical Translation
2026-Apr, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.70350
PMID:41968466
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综述 | 本文综述了细菌胞外囊泡在生物医学研究和临床转化中的应用、工程化策略及面临的挑战 | 系统总结了利用分子与合成生物学技术（如基因操作、表面功能化、糖工程和模块化展示技术）对bEVs进行定向生物工程改造的最新进展，以生产具有增强安全性、稳定性、靶向精度和功能多样性的定制化bEVs | 指出bEVs技术转化仍面临可扩展性、安全性、标准化和监管框架等关键挑战 | 探讨细菌胞外囊泡在生物医学领域的应用潜力及临床转化前景 | 细菌胞外囊泡 | NA | NA | 基因操作、表面功能化、糖工程、模块化展示技术 | NA | NA | NA | NA | 细菌 | NA | 医学 |
| 120 | 2026-04-16 |
Overriding Bioprocess Perturbations With a Cell-Machine Interface for Reliable Microbial Stress-Response Control
2026-Apr, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.70329
PMID:41973552
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研究论文 | 本研究开发了一种细胞-机器接口系统（Segregostat），用于在工业生物反应器扰动条件下可靠控制微生物的应激响应 | 首次在工业生物反应器典型扰动条件下评估并验证了Segregostat系统对微生物应激响应的鲁棒控制能力 | 研究仅针对大肠杆菌和酿酒酵母两种模式生物，未在更广泛的工业菌株或复杂共培养体系中验证 | 开发在工业生物过程扰动条件下可靠控制微生物应激响应的细胞-机器接口系统 | 大肠杆菌（Escherichia coli）和酿酒酵母（Saccharomyces cerevisiae）的通用应激响应 | 合成生物学 | NA | 规模缩小生物反应器实验、自动化流式细胞术 | NA | 流式细胞术数据、生物过程参数 | NA | 细胞-机器接口 | 大肠杆菌, 酿酒酵母 | 应激响应控制系统（Segregostat） | 工业生物技术 |