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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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101 | 2025-09-20 |
Engineering Noncanonical Cofactors To Expand Cellular Functions
2025-Sep-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00473
PMID:40923492
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综述 | 本文探讨了非经典辅因子(NCCs)在合成生物学中的应用,旨在通过工程化方法扩展细胞功能 | 提出利用非经典辅因子隔离代谢途径,避免与宿主细胞内源酶共享辅因子池,从而实现独立于热力学约束的精准控制 | NA | 研究如何通过非经典辅因子工程化扩展合成生物学中的细胞功能 | 细胞代谢途径与酶系统 | 合成生物学 | NA | 工程化酶反应与代谢途径设计 | NA | NA | NA |
102 | 2025-09-20 |
Engineering of a Complex of the DNase Domain of Colicin E9 with the Immunity Protein Im9 Activated by the Protease pS273R of African Swine Fever Virus
2025-Sep-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00398
PMID:40925015
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研究论文 | 设计了一种由非洲猪瘟病毒蛋白酶激活的蛋白质开关,通过释放DNase活性降解病毒DNA | 首次将Colicin E9 DNase结构域与其抑制剂Im9与病毒蛋白酶切割位点结合,创建病毒触发的'杀伤开关' | 目前仅进行体外实验验证,尚未在活体动物模型中测试效果 | 开发针对非洲猪瘟病毒的抗病毒策略 | 非洲猪瘟病毒蛋白酶pS273R及其底物复合物 | 合成生物学 | 非洲猪瘟 | 蛋白质工程、蛋白酶切割实验、体外活性测定 | NA | 蛋白质序列、酶活性数据 | 多个Im9变体构建及优化(包括Im9-1.4变体) |
103 | 2025-09-20 |
Innovations in Yeast Synthetic Biology: Engineered Discovery Systems for Immunotherapy
2025-Sep-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00321
PMID:40802971
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综述 | 本文综述了酵母合成生物学平台在免疫治疗蛋白发现中的创新应用 | 整合高通量表面展示技术、自动化进化系统和计算设计策略,实现快速识别和工程化新型蛋白质治疗剂 | NA | 探讨酵母合成生物学在免疫治疗领域的应用与进展 | 酵母平台、免疫治疗蛋白(如纳米抗体)、免疫受体(如GPCRs、TCRs) | 合成生物学 | NA | 高通量表面展示、自动化进化系统(如OrthoRep)、计算设计 | NA | 蛋白质数据、抗原筛选数据 | NA |
104 | 2025-09-20 |
Unraveling the Constrained Cell Growth in Engineered Living Materials
2025-Sep-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00378
PMID:40808544
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研究论文 | 本研究探讨了工程活材料中空间限制对封装细胞生长和功能的动态影响 | 揭示了工程活材料中细胞生长与空间限制之间的动态相互作用,并发现了封装细胞内异常高活性氧水平和受损氧光合作用现象 | 研究主要关注蓝藻细胞,结果可能不适用于其他类型的封装细胞 | 理解和预测工程活材料中封装细胞的生长行为与功能表现 | 封装在工程活材料中的蓝藻细胞 | 合成生物学与材料科学 | NA | 细胞封装与空间限制分析 | NA | 细胞生长动力学数据、功能性能数据 | NA |
105 | 2025-09-20 |
Multiplexed Genome Editing and Transcriptional Knockdown in Yarrowia lipolytica by CRISPR-Cpf1 and an Orthogonal T7 System
2025-Sep-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00104
PMID:40810600
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研究论文 | 本研究开发了一种结合CRISPR-Cpf1和正交T7系统的工具包,用于解脂耶氏酵母中的多重基因组编辑和转录敲低 | 首次在解脂耶氏酵母中实现CRISPR-Cpf1与正交T7系统的结合,实现高达四基因的多重编辑和高效转录敲低 | 同源定向重组效率提升策略仅观察到微小改进 | 开发解脂耶氏酵母的高效基因编辑和转录调控工具 | 解脂耶氏酵母(Yarrowia lipolytica) | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cpf1, T7转录系统, 同源定向重组 | NA | 基因编辑效率数据 | 未明确说明样本数量,但实现了四基因73.3%和双基因100%的编辑效率 |
106 | 2025-09-20 |
Bioengineering of Probiotic Yeast Saccharomyces boulardii for Advanced Biotherapeutics
2025-Sep-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00236
PMID:40811432
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综述 | 本文综述了布拉酵母菌在基因修饰、代谢工程和合成生物学策略方面的最新进展,用于治疗应用 | 独特地整合了近期在遗传改造、代谢工程及合成生物学策略应用于布拉酵母菌治疗用途的进展,而早期综述主要关注其临床应用和安全性 | NA | 探讨布拉酵母菌作为工程化活体生物治疗和先进微生物组疗法底盘生物的潜力 | 布拉酵母菌(Saccharomyces boulardii) | 合成生物学 | NA | 基因修饰、代谢工程、合成生物学策略、生物传感、生物防护 | NA | NA | NA |
107 | 2025-09-20 |
Recent Advances in the Biological Synthesis of l-Tyrosine Derivatives by Genetically Engineered Microbes
2025-Sep-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00475
PMID:40833382
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综述 | 本文总结了基因工程微生物生物合成l-酪氨酸衍生物的最新进展 | 系统归纳了代谢工程、酶修饰和菌株选育等提高l-酪氨酸衍生物产量的策略 | NA | 综述l-酪氨酸衍生物微生物合成的研究进展与未来趋势 | 基因工程微生物及其合成的酪醇、左旋多巴、对香豆酸等衍生物 | 合成生物学 | NA | 微生物发酵、代谢工程、酶修饰 | NA | 文献数据 | NA |
108 | 2025-09-20 |
Progress in the Synthesis of Sterols and Related Natural Products by Manipulating the Ergosterol Biosynthetic Pathway in Saccharomyces cerevisiae
2025-Sep-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00438
PMID:40859817
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综述 | 本文系统评述了利用合成生物学方法在酿酒酵母中通过工程化麦角固醇生物合成途径生产固醇及相关天然产物的研究进展 | 通过异源途径整合和代谢通量系统性增强,实现真核平台从头合成多种高价值类固醇 | NA | 促进固醇类化合物在农业和制药工业中的应用 | 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae) | 合成生物学 | NA | 代谢工程 | NA | NA | NA |
109 | 2025-09-20 |
Microbial therapeutics for cancer: emerging strategies and biomedical applications
2025-Sep-18, Chemical communications (Cambridge, England)
DOI:10.1039/d5cc03618f
PMID:40891348
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综述 | 本文全面概述了工程微生物在癌症治疗中的设计、功能化及生物医学应用 | 聚焦基因编辑和表面修饰等前沿策略,提升微生物特异性、免疫相容性和治疗潜力 | 临床转化面临挑战,需跨学科整合 | 开发基于工程微生物的下一代癌症疗法,克服传统治疗局限 | 工程微生物及其在肿瘤微环境中的应用 | 合成生物学与纳米技术交叉领域 | 癌症 | 基因编辑、表面修饰、纳米技术整合 | NA | NA | NA |
110 | 2025-09-20 |
Pathway crosstalk enables degradation of aromatic compounds in marine Roseobacter clade bacteria
2025-Sep-17, Applied and environmental microbiology
IF:3.9Q2
DOI:10.1128/aem.00978-25
PMID:40793766
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研究论文 | 本研究揭示了海洋Roseobacter分支细菌通过途径串扰降解芳香化合物的完整代谢路径 | 发现了β-酮己二酸途径与β-氧化途径在最终硫解步骤的独特串扰机制,并建立了新型海洋平台用于系统生物学研究 | NA | 解析海洋细菌中芳香化合物的生物降解途径,推动生物修复和碳循环应用 | 海洋Roseobacter分支细菌及其芳香化合物降解代谢途径 | 合成生物学 | NA | 多组学分析、CRISPR-Cas基因组编辑 | NA | 基因组数据、代谢组数据 | NA |
111 | 2025-09-20 |
Secure biosystems design in Saccharomyces cerevisiae establishes effective biocontainment strategies and mechanisms of escape
2025-Sep-17, Applied and environmental microbiology
IF:3.9Q2
DOI:10.1128/aem.00741-25
PMID:40801494
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研究论文 | 本研究在酿酒酵母中开发并评估了一种基于RelE毒素的kill switch生物安全系统,旨在建立有效的生物封闭策略并解析逃逸机制 | 通过高分辨率分析平台系统评估了kill switch在不同菌株中的表现,首次揭示了cam-TA和RelE毒素突变驱动的逃逸机制及脱靶突变的影响 | 多拷贝整合虽显著降低逃逸频率但仍无法实现持续生物封闭,工业菌株与实验室菌株的差异响应尚未完全解析 | 开发安全可靠的基因工程微生物生物封闭策略,防止其逃逸到自然环境中 | 酿酒酵母实验室菌株和工业菌株 | 合成生物学 | NA | CRISPR介导的基因整合、基因组重测序、遗传工程 | NA | 基因组测序数据、表型数据 | 多种实验室和工业酿酒酵母菌株(具体数量未明确说明) |
112 | 2025-09-20 |
Bacteria-mediated cancer therapy (BMCT): Therapeutic applications, clinical insights, and the microbiome as an emerging hallmark of cancer
2025-Sep-17, Biomedicine & pharmacotherapy = Biomedecine & pharmacotherapie
DOI:10.1016/j.biopha.2025.118559
PMID:40967079
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综述 | 本文探讨了宿主微生物群在癌症治疗中的多面作用,包括细菌介导的癌症疗法(BMCT)的机制、应用及临床转化潜力 | 提出微生物组作为癌症的新兴标志性特征,并系统总结工程化细菌在免疫调节和联合免疫检查点抑制剂中的协同作用 | 安全性、递送特异性及监管问题尚未完全解决 | 综述细菌介导癌症疗法的机制、临床应用及微生物组在癌症治疗中的角色 | 共生及工程化细菌(如梭菌属、双歧杆菌属、李斯特菌属等)及其与肿瘤微环境的相互作用 | 肿瘤免疫学 | 癌症 | 合成生物学、精准微生物组工程、粪便微生物移植 | NA | 临床实验数据、微生物组数据 | NA(涉及多种临床试验,但未明确样本数量) |
113 | 2025-09-20 |
Synthetic Antimicrobial Peptides: Combatting Antibiotic Resistance for Sustainable Aquaculture
2025-Sep-16, Microbial pathogenesis
IF:3.3Q2
DOI:10.1016/j.micpath.2025.108029
PMID:40967516
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综述 | 本文综述了合成抗菌肽作为可持续水产养殖中抗生素替代品的必要性、设计策略及环境影响 | 整合合成生物学与计算建模方法,开发具有增强稳定性、效力和靶向抗菌作用的合成抗菌肽 | NA | 探讨合成抗菌肽作为抗生素替代品在水产养殖疾病控制中的应用 | 抗菌肽(AMPs)及其合成类似物 | 计算生物学 | 细菌感染 | 机器学习、计算工具 | NA | NA | NA |
114 | 2025-09-20 |
Structure prediction and engineering of de novo proteins
2025-Sep-15, Biochimica et biophysica acta. Proteins and proteomics
DOI:10.1016/j.bbapap.2025.141100
PMID:40962101
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综述 | 本文综述了从头蛋白质的定义、历史、功能意义及研究方法,涵盖自然进化与人工设计两类 | 强调自然进化过程与理性蛋白质工程日益融合的趋势及其在生物发现与人类创新中的重要性 | NA | 概述从头蛋白质研究领域的定义、方法及挑战 | 自然进化与人工设计的从头蛋白质 | 合成生物学 | NA | 计算与实验方法 | NA | NA | NA |
115 | 2025-09-20 |
Probiotic Bacteria as Therapeutics and Biohybrid Drug Carriers: Advances, Design Strategies, and Future Outlook
2025-Sep-15, ACS applied bio materials
IF:4.6Q2
DOI:10.1021/acsabm.5c00959
PMID:40888536
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综述 | 本文综述了益生菌作为药物递送平台的多样化策略及其在精准医疗中的应用前景 | 探讨了将益生菌整合到纳米颗粒递送系统的策略,并强调合成生物学和生物杂交涂层等前沿技术优化治疗效果的潜力 | NA | 分析益生菌作为药物载体在靶向治疗中的应用进展和未来发展方向 | 益生菌及其衍生物(如细菌幽灵、外膜囊泡等)作为药物递送平台 | 生物医学工程 | 癌症、胃肠道疾病 | 纳米技术、基因工程(质粒表达、基因组整合)、合成生物学 | NA | NA | NA |
116 | 2025-09-20 |
Cephalotaxus-Derived Homoharringtonine: Biosynthesis, Mechanism of Action, and Role in Modern Cancer Therapy
2025-Sep, Biotechnology journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/biot.70122
PMID:40970823
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综述 | 本文综述了三尖杉属植物来源的高三尖杉酯碱的生物合成、作用机制及其在现代癌症治疗中的应用 | 批判性评估了三尖杉生物碱在实体瘤中的未充分研究机制、转化障碍及创新策略,并探讨合成生物学和精准医学等未来方向 | 存在相关代谢物生物活性知识缺口,面临化学复杂性、监管障碍和毒性特征等挑战 | 评估三尖杉生物碱作为抗癌药物的潜力及其在精准肿瘤学中的应用 | 三尖杉属植物及其生物碱(如高三尖杉酯碱) | NA | 白血病、癌症 | 合成生物学、先进药物递送系统 | NA | NA | NA |
117 | 2025-09-20 |
Compartmentalized Terpenoid Production in Plants Using Agrobacterium-Mediated Transient Expression
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3658-9_2
PMID:38468080
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研究论文 | 本文介绍了利用农杆菌介导的瞬时表达技术在植物中区室化生产萜类化合物的方法 | 采用合成生物学方法在亚细胞水平区室化萜类生物合成,包括质体、细胞质和脂滴表面 | NA | 快速开发和区室化萜类生物合成途径 | 本氏烟草(Nicotiana benthamiana)中的萜类化合物生产 | 合成生物学 | NA | 农杆菌介导的瞬时表达 | NA | NA | NA |
118 | 2025-09-19 |
Engineered implementations of spatial computation in biological systems
2025-Oct, Seminars in cell & developmental biology
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.semcdb.2025.103631
PMID:40712326
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综述 | 探讨空间分布式和区室化框架在工程化生物计算中的应用,超越传统单细胞逻辑系统 | 通过模拟形态发生素梯度和细胞区室化等自然现象,实现可扩展性、鲁棒性和适应性的合成空间计算系统 | NA | 整合空间与自适应计算,解决超越传统计算架构的复杂计算挑战 | 工程化生物系统 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
119 | 2025-09-19 |
Using transcription and translation regulators to improve recombinant protein expression in CHO cells
2025-Sep-18, Acta biochimica et biophysica Sinica
IF:3.3Q1
DOI:10.3724/abbs.2025160
PMID:40963405
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综述 | 本文总结了通过转录和翻译调控因子提高CHO细胞中重组治疗蛋白表达的策略 | 整合合成生物学方法和基因组学进展,提出定制化转录因子及翻译因子的优化策略 | NA | 提高重组治疗蛋白在CHO细胞中的表达效率并降低生产成本 | 中国仓鼠卵巢(CHO)细胞 | 合成生物学 | NA | 转录因子工程、启动子设计、翻译调控 | NA | 基因组数据 | NA |
120 | 2025-09-19 |
Broad-Host-Range Synthetic Biology: Rethinking Microbial Chassis as a Design Variable
2025-Sep-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00308
PMID:40964802
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观点文章 | 本文探讨了广宿主范围合成生物学如何将微生物宿主选择重新定义为设计变量,超越传统模式生物的限制 | 提出将宿主选择作为关键设计参数,通过资源分配、代谢互作和调控串扰影响工程遗传设备行为,拓展了合成生物学的设计空间 | NA | 推动合成生物学从有限宿主向广宿主范围发展,提升工程生物系统的功能多样性和应用潜力 | 微生物宿主系统及其在遗传设计中的角色 | 合成生物学 | NA | 模块化载体、宿主无关遗传设备 | NA | NA | NA |