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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1241 | 2026-01-29 |
Temporal gene regulation enables controlled expression of gas vesicles and preserves bacterial viability
2025-Jun-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.20.660610
PMID:40667317
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研究论文 | 本研究开发了一种双诱导转录调控系统,通过时序控制气囊蛋白的组装因子和外壳蛋白的表达,以解决异源表达气囊时引起的细胞生长抑制和裂解问题 | 首次观察到气囊诱导后8-16小时细胞密度下降的现象,并设计了时序诱导策略,在维持气囊产量的同时恢复了细菌正常生长 | 研究仅在大肠杆菌中进行验证,未在其他宿主中测试该调控系统的普适性 | 优化气囊在非天然宿主中的异源表达,减少其对细胞生长的负面影响 | 气囊蛋白的组装过程及其对宿主细胞的影响 | 合成生物学 | NA | 双诱导转录调控系统、时序诱导策略 | NA | NA | NA | 双诱导转录调控系统 | 大肠杆菌 | 时序调控的基因回路,通过正交控制组装因子蛋白和外壳蛋白的表达时序与化学计量比 | 生物医学工程、合成生物学 |
| 1242 | 2026-01-29 |
β-cell heterogeneity and molecular plasticity in type 2 diabetes: multi-omics perspectives and the role of gut microbiota
2025, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2025.1698296
PMID:41584842
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综述 | 本文综述了利用多组学技术揭示2型糖尿病中β细胞异质性、分子可塑性及其与肠道微生物群相互作用的研究进展 | 整合单细胞转录组学、表观基因组学和空间转录组学等多组学视角,系统阐述了β细胞异质性、肠道微生物群调控机制及其交汇点作为潜在治疗靶点的创新框架 | 作为综述文章,主要基于现有文献进行整合分析,未提供新的原始实验数据 | 理解2型糖尿病中β细胞功能衰退的分子机制及肠道微生物群的调控作用,探索精准治疗策略 | 胰腺β细胞、肠道微生物群、胰岛内分泌细胞、免疫细胞、基质细胞 | NA | 2型糖尿病 | 单细胞转录组学、表观基因组学、空间转录组学、多组学整合分析 | NA | 转录组数据、表观遗传数据、空间基因表达数据 | NA | 合成生物学方法、基因工程 | 基因工程益生菌菌株 | 用于递送生物活性分子(如GLP-1)的工程化益生菌系统 | 医学 |
| 1243 | 2026-01-29 |
Pyrite as a catalyst for the emergence of multiphase primitive cells
2025, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2025.1747422
PMID:41586365
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研究论文 | 本研究开发了一种基于凝聚层的原始细胞模型,利用天然黄铁矿的催化活性诱导单相液滴向多相液滴转变,模拟了生命细胞的层次结构和功能 | 首次利用天然矿物的类过氧化物酶催化活性构建具有内部相分离结构的多相原始细胞,实现了寡核苷酸在亚区室中的选择性分配 | 研究在模拟前生命条件下进行,尚未验证在更复杂环境或与生物分子网络整合时的稳定性与功能性 | 探索非生命化学系统向生命系统过渡的机制,构建具有层次结构和类生命功能的原始细胞模型 | 基于单链寡核苷酸、季铵化葡聚糖和TMB的凝聚层液滴系统,以及天然黄铁矿催化剂 | 合成生物学 | NA | 凝聚层自组装、类酶催化反应 | NA | 实验观测数据 | NA | NA | NA | 基于黄铁矿催化TMB氧化驱动的相分离结构,形成具有内部TMBox/ss-oligo相和外部Q-dextran/ss-oligo相的多区室系统 | 合成生物学、生物技术 |
| 1244 | 2026-01-28 |
A comparative review of vector insertion techniques in Saccharomyces cerevisiae
2026-Feb, Journal of microbiological methods
IF:1.7Q4
DOI:10.1016/j.mimet.2025.107378
PMID:41435996
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综述 | 本文比较了酿酒酵母中三种主要的载体插入技术:体内同源重组、Cre-lox重组和CRISPR/Cas9 | 对酿酒酵母中三种主流载体插入技术进行了系统性的比较分析,突出了各自在基因组工程和合成生物学中的应用与特点 | 未涉及其他新兴或较少使用的载体插入技术,且主要基于现有文献综述,缺乏新的实验数据验证 | 比较和评估酿酒酵母中不同载体插入技术的应用、优势与局限性 | 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae) | 合成生物学 | NA | 体内同源重组、Cre-lox重组、CRISPR/Cas9 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Cre-lox | 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae) | NA | 工业生物技术 |
| 1245 | 2026-01-28 |
Classification, catalytic mechanisms, and functional characterization of non-heme diiron oxygenases: A review
2026-Feb, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2026.150277
PMID:41544786
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综述 | 本文综述了非血红素双铁加氧酶(NDOs)的分类、催化机制及其功能表征,并探讨了其在合成生物学和可持续生物制造中的应用前景 | 整合了结构生物学、光谱学、计算模型和动力学分析的最新进展,为NDOs的家族分类、催化循环和底物结合策略提供了系统的概念框架 | NA | 为非血红素双铁加氧酶的未来机理研究和蛋白质工程提供指导 | 非血红素双铁加氧酶(NDOs) | NA | NA | 结构生物学、光谱学、计算建模、动力学分析 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学、可持续生物制造 |
| 1246 | 2026-01-28 |
Probiotic and Microbial Enzymatic Mechanisms for PFAS Detoxification
2026-Jan-27, Probiotics and antimicrobial proteins
IF:4.4Q2
DOI:10.1007/s12602-026-10921-2
PMID:41591586
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综述 | 本文综述了微生物和益生菌对PFAS进行生物修复的当前进展,重点探讨了酶促机制、微生物途径以及与常规处理系统的整合 | 系统性地整合了微生物(包括益生菌)对PFAS的吸附、转化和脱氟机制,并探讨了合成生物学在工程化增强PFAS降解能力方面的最新进展 | 当前微生物途径主要通过部分转化而非完全矿化作用,常积累稳定的氟化中间体;真正的矿化受限于酶效率低、底物特异性窄以及实验室成果难以转化到复杂环境基质中 | 评估微生物和工程化益生菌方法对PFAS进行生物修复的可行性,并指出知识空白和未来发展方向 | 全氟和多氟烷基物质(PFAS) | NA | NA | 微生物生物修复、酶学研究、合成生物学 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 细菌、真菌、蓝细菌、肠道微生物群、益生菌菌株 | 具有增强PFAS摄取和降解能力的工程化微生物系统 | 环境 |
| 1247 | 2026-01-28 |
A Microbial Odyssey: Reshaping Probiotic Destinies through Advanced Delivery Technologies
2026-Jan-27, Probiotics and antimicrobial proteins
IF:4.4Q2
DOI:10.1007/s12602-026-10926-x
PMID:41591587
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综述 | 本文系统总结了益生菌递送技术的最新进展,包括多种工程策略和材料平台,并批判性地探讨了临床转化中的关键挑战 | 全面整合了靶向递送系统、基因工程益生菌、微胶囊技术和纳米载体平台等先进递送策略,并引入了智能响应系统、仿生技术和合成生物学等跨学科方法以实现精确释放和持续定植 | 临床转化面临配方稳定性、个体间差异、监管不一致性和长期安全性等关键挑战 | 优化和高质量开发益生菌递送系统,为下一代益生菌生物疗法的合理设计提供前瞻性框架 | 益生菌及其递送技术 | 合成生物学 | 代谢紊乱、炎症性疾病和神经精神疾病 | 基因工程、表面修饰、微胶囊技术、纳米载体平台 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 益生菌 | NA | 医学 |
| 1248 | 2026-01-28 |
Molecular gatekeepers: eukaryotic translation factors decoding plant-virus dynamics for resistance engineering
2026-Jan-27, Stress biology
DOI:10.1007/s44154-025-00273-2
PMID:41591594
|
综述 | 本文综述了植物病毒如何利用宿主真核翻译因子(eTFs)完成其生命周期,并探讨了通过靶向操纵这些因子来工程化植物抗病性的策略 | 提出了一个以eTF为中心的抗性育种框架,整合了分子生物学与应用策略,为开发广谱、持久且环境可持续的植物抗病毒方案提供了新视角 | NA | 阐明真核翻译因子在植物-病毒互作中的机制作用,并探索通过调控这些因子来增强植物抗病毒能力的策略 | 植物病毒、宿主真核翻译因子(如eIF4E, eIF(iso)4E, eIF4G, eEF1A, eEF1B) | 合成生物学 | 植物病毒病 | 自然等位基因挖掘、诱导诱变、TILLING/EcoTILLING、RNA干扰、CRISPR/Cas系统 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas | 植物 | NA | 农业 |
| 1249 | 2026-01-28 |
An Optimization Scheme Based on the Simulated Annealing Algorithm for In situ DNA Microarray Synthesis
2026-Jan-21, Combinatorial chemistry & high throughput screening
IF:1.6Q3
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研究论文 | 本研究将DNA微阵列原位合成建模为旅行商问题,并开发基于模拟退火算法的优化策略以提高合成效率 | 首次将DNA微阵列合成顺序优化问题转化为旅行商问题,并应用模拟退火算法显著减少合成周期 | 研究主要基于计算模拟,未涉及实际实验验证优化策略的物理合成效果 | 优化DNA微阵列原位合成的核苷酸添加顺序以提高效率和降低成本 | DNA微阵列合成过程 | 合成生物学 | NA | DNA微阵列合成 | 模拟退火算法、贪婪算法 | 序列数据 | 从10×10 nt到10000×120 nt的不同规模阵列 | NA | NA | NA | 基因编辑、药物开发、DNA数据存储 |
| 1250 | 2026-01-28 |
Photoacid-Fueled Nanopropeller for the Controllable Motion of One-Hole Colloidal Motors with On-Board ATP Supply
2026-Jan, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202506850
PMID:41014546
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研究论文 | 报道了一种能够定向运动并现场合成ATP的旋转FF-ATP酶驱动胶体马达 | 利用光酸燃料驱动的纳米推进器,通过跨膜质子动力驱动ATP酶旋转,实现可控运动与现场ATP合成,并展示出向ADP/OH梯度的趋化性 | NA | 开发集自主运动与局部能量生产于一体的仿生推进平台 | 单孔胶体马达 | 合成生物学 | NA | 分层组装、光异构化 | NA | NA | NA | NA | NA | 仿生推进平台,整合运动与能量生产功能 | 生物医学, 合成生物学 |
| 1251 | 2026-01-28 |
Synthetic biology empowers development of traditional Chinese medicine
2026-Jan, Chinese herbal medicines
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.chmed.2025.11.010
PMID:41584699
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1252 | 2026-01-28 |
Antifungal Biocontrol in Sustainable Crop Protection: Microbial Lipopeptides, Polyketides, and Plant-Derived Agents
2025-Dec-27, Journal of fungi (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/jof12010022
PMID:41590434
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综述 | 本文综述了微生物和植物来源的抗真菌生物防治剂在可持续作物保护中的应用,重点介绍了环状脂肽和聚酮类等次级代谢产物的结构、生物合成途径及作用机制 | 整合了当前关于微生物次级代谢产物(特别是环状脂肽和聚酮类)和植物来源抗真菌剂的最新知识,并强调了基因组学、代谢工程和合成生物学在加速菌株改良和新化合物发现方面的进展 | NA | 探讨抗真菌生物防治剂作为合成杀菌剂替代品在可持续作物保护中的作用 | 微生物(如芽孢杆菌属、假单胞菌属、链霉菌属)和植物产生的抗真菌次级代谢产物 | NA | NA | 基因组学、代谢工程、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 农业 |
| 1253 | 2026-01-28 |
Genetically Encoded Sensors for Monitoring Intracellular Redox Health of the Pathogenic Fungus Cryptococcus neoformans
2025-Dec-26, ACS sensors
IF:8.2Q1
DOI:10.1021/acssensors.5c01883
PMID:41273792
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研究论文 | 本研究为致病真菌新型隐球菌开发了基因编码的氧化还原传感器,用于实时监测细胞内氧化还原状态 | 首次为新型隐球菌优化设计了基因编码的氧化还原传感器,并建立了多种基于荧光的实时监测技术 | 该研究主要针对新型隐球菌,在其它真菌中的应用仍需进一步验证 | 开发用于致病真菌的氧化还原生物传感器,研究真菌毒力相关的氧化还原调控机制 | 致病真菌新型隐球菌及其氧化还原蛋白 | 合成生物学 | 真菌感染 | 基因编码传感器技术、荧光监测技术 | NA | 荧光信号数据 | NA | 基因编码传感器 | Cryptococcus neoformans | 氧化还原生物传感器 | 医学 |
| 1254 | 2026-01-27 |
Biomanufacturing polyhydroxyalkanoates from CO2: A critical review of advances, challenges, and solutions for autotrophic and hybrid systems
2026-Jan-23, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108810
PMID:41581798
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综述 | 本文系统评述了利用二氧化碳生物转化生产聚羟基脂肪酸酯的技术进展、挑战与解决方案,重点关注自养和混合系统 | 首次系统比较了直接自养与两步混合系统在CO2至PHA转化中的性能差距,并提出了基于合成生物学、反应器工程和系统集成的战略路线图 | 当前所有平台仍存在气液传质效率低、催化剂稳定性差(寿命<100小时)及下游分离能耗高等关键瓶颈,导致生产成本(3-8美元/公斤)远高于经济阈值 | 评估CO2生物转化为可生物降解聚合物PHA的技术现状,以推动气候缓解与可持续制造的融合 | 二氧化碳生物转化技术,特别是自养系统(如Cupriavidus necator)和混合系统 | 工业生物技术 | NA | 生物转化、合成生物学、反应器工程 | NA | NA | NA | 合成生物学 | Cupriavidus necator | NA | 环境, 材料, 工业生物技术 |
| 1255 | 2026-01-27 |
Specifications of Standards in Systems and Synthetic Biology
2015-Sep-04, Journal of integrative bioinformatics
IF:1.5Q3
DOI:10.2390/biecoll-jib-2015-258
PMID:26528556
|
综述 | 本文介绍了系统与合成生物学中标准化的现状、重要性以及COMBINE倡议在协调和促进相关标准发展中的作用 | 首次提出通过特刊形式为系统与合成生物学标准提供集中、可访问和可引用的发布平台,并计划每年更新以促进标准发展 | NA | 促进系统与合成生物学领域的数据、信息和模型标准化,通过特刊提供标准的统一发布平台 | 系统与合成生物学领域的标准化文档、COMBINE倡议及相关社区标准 | 系统与合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1256 | 2026-01-27 |
Synthetic Biology Open Language (SBOL) Version 2.0.0
2015-Sep-04, Journal of integrative bioinformatics
IF:1.5Q3
DOI:10.2390/biecoll-jib-2015-272
PMID:26528570
|
研究论文 | 本文详细介绍了合成生物学开放语言(SBOL)版本2.0.0,这是一个用于电子交换生物设计结构及功能信息的标准化格式 | SBOL 2.0.0引入了一个标准化的数据模型,支持对生物设计进行明确且无歧义的描述,填补了现有标准的空白 | NA | 改善合成生物学中生物设计信息的交换,以缩短开发时间、降低失败率并提高可重复性 | 合成生物学中的生物系统设计信息 | 合成生物学 | NA | NA | 数据模型 | 结构化设计信息 | NA | SBOL | NA | NA | 工业生物技术 |
| 1257 | 2026-01-26 |
Multi-gene Co-expression systems in E. coli: From single-vector designs to programmable expression platforms
2026-Jun, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2025.12.008
PMID:41574264
|
综述 | 本文综述了在大肠杆菌中实现多基因共表达的系统设计策略,从单载体构建到可编程表达平台的发展历程 | 系统性地比较了多种多基因共表达策略的机制原理、设计权衡与调控瓶颈,并探讨了整合模块化架构、表达建模与AI辅助设计的新兴可编程工具包 | NA | 为在大肠杆菌及其他微生物底盘中进行多基因系统工程的科研人员提供全面的策略路线图 | 大肠杆菌中的多基因共表达系统 | 合成生物学 | NA | 内部核糖体进入位点(IRES)、2A自切割肽、双启动子盒、多顺反子操纵子、多质粒配置 | NA | NA | NA | BioBrick, iGEM | 大肠杆菌 | 多基因共表达系统,包括逻辑门、生物传感器、代谢途径等 | 工业生物技术 |
| 1258 | 2026-01-26 |
Phage therapy in cancer treatment: Mechanisms, emerging innovations, and translational progress
2026-Feb, Critical reviews in oncology/hematology
DOI:10.1016/j.critrevonc.2025.105085
PMID:41397585
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综述 | 本文综述了噬菌体疗法在癌症治疗中的机制、新兴创新及转化进展 | 将噬菌体从传统的抗菌剂重新定位为可编程的生物系统,整合了微生物组调控、免疫激活和纳米载体介导的基因递送,并融合了AI、CRISPR和合成生物学技术 | 仍面临免疫清除、细菌耐药性和监管复杂性等挑战 | 探讨噬菌体疗法在癌症治疗中的应用潜力与转化前景 | 噬菌体及其工程化构建体在肿瘤治疗中的作用 | NA | 口腔鳞状细胞癌、结直肠癌、黑色素瘤、肝细胞癌 | CRISPR-Cas、AI驱动选择流程、合成生物学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas | NA | NA | 医学 |
| 1259 | 2026-01-26 |
Transmembrane Transport of cAMP and AMP Using a Two Component Small Molecule Transport System
2026-Jan-22, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202524663
PMID:41367116
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研究论文 | 本文报道了一种中性双组分系统,首次在生理pH下实现了cAMP和AMP跨脂质体膜的促进运输 | 首次展示了使用中性双组分系统促进cAMP和AMP跨膜运输,通过合成阴离子载体与胸腺嘧啶衍生物配对提高运输效率 | NA | 研究核苷酸跨膜运输机制,探索小分子系统在药物递送和合成生物学中的应用潜力 | cAMP和AMP核苷酸 | 合成生物学 | NA | 脂质体荧光实验、P NMR实验 | NA | 实验数据 | NA | NA | NA | NA | 药物递送, 合成生物学 |
| 1260 | 2026-01-26 |
Engineering bacteriophages for gut health: precision antimicrobials and beyond
2026-Jan-22, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-026-04038-5
PMID:41566387
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综述 | 本文综述了工程化噬菌体作为精准抗菌剂在肠道健康中的应用,涵盖合成生物学和纳米技术进展,并探讨其在炎症性肠病、结直肠癌和感染性肠炎中的治疗潜力 | 利用合成生物学和纳米技术重新设计噬菌体,增强其特异性、功能性和稳定性,作为微生物群中心疗法的多功能工具 | 面临长期稳定性、耐药性发展和规模化生产等挑战 | 探讨工程化噬菌体作为精准抗菌剂在肠道疾病治疗中的应用,以应对微生物失调、抗生素耐药性和宿主-微生物相互作用破坏 | 工程化噬菌体及其在炎症性肠病、结直肠癌和感染性肠炎中的应用 | 合成生物学 | 炎症性肠病、结直肠癌、感染性肠炎 | 合成生物学、纳米技术 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 噬菌体 | NA | 医学 |